Nikitapyscript commited on
Commit
dcb5824
·
verified ·
1 Parent(s): cdac1f1

Upload README.md with huggingface_hub

Browse files
Files changed (1) hide show
  1. README.md +70 -0
README.md ADDED
@@ -0,0 +1,70 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ ---
2
+ license: apache-2.0
3
+ tags:
4
+ - medical
5
+ - segmentation
6
+ - monai
7
+ - 3d-unet
8
+ - pytorch
9
+ pipeline_tag: image-segmentation
10
+ ---
11
+
12
+ # 3D U-Net для медицинской сегментации
13
+
14
+ Эта модель представляет собой 3D U-Net, обученную на медицинских данных для задач сегментации.
15
+
16
+ ## Архитектура модели
17
+
18
+ - **Тип**: 3D U-Net (MONAI)
19
+ - **Входные каналы**: 1
20
+ - **Выходные каналы**: 2 (фон + целевой класс)
21
+ - **Каналы**: (16, 32, 64, 128, 256, 512)
22
+ - **Размер патча**: 256x256x256
23
+ - **Функция потерь**: Dice Loss
24
+
25
+ ## Использование
26
+
27
+ ```python
28
+ import torch
29
+ from monai.networks.nets import UNet
30
+ from huggingface_hub import hf_hub_download
31
+
32
+ # Загрузка модели
33
+ model = UNet(
34
+ spatial_dims=3,
35
+ in_channels=1,
36
+ out_channels=2,
37
+ channels=(16, 32, 64, 128, 256, 512),
38
+ strides=(2, 2, 2, 2, 2, 2),
39
+ num_res_units=2,
40
+ dropout=0.2
41
+ )
42
+
43
+ # Загрузка весов
44
+ model_path = hf_hub_download(repo_id="your-username/your-model-name", filename="best_metric_model.pth")
45
+ model.load_state_dict(torch.load(model_path, map_location='cpu'))
46
+ model.eval()
47
+ ```
48
+
49
+ ## Предобработка данных
50
+
51
+ Модель ожидает входные данные в следующем формате:
52
+ - Нормализация интенсивности: [-1000, 4000] -> [0, 1]
53
+ - Размер входа: (1, 256, 256, 256)
54
+ - Тип данных: torch.float32
55
+
56
+ ## Обучение
57
+
58
+ Модель была обучена с использованием:
59
+ - Оптимизатор: Adam (lr=1e-4, weight_decay=1e-5)
60
+ - Scheduler: ReduceLROnPlateau
61
+ - Аугментации: случайные отражения, повороты, изменения интенсивности
62
+ - Метрика: Dice Score
63
+
64
+ ## Требования
65
+
66
+ ```
67
+ torch
68
+ monai
69
+ numpy
70
+ ```