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app.py CHANGED
@@ -1,5 +1,3 @@
1
- # Instale as dependências necessárias
2
-
3
  import os
4
  import tempfile
5
  import pydicom
@@ -20,6 +18,13 @@ def dicom_to_nifti_and_display(dicom_file):
20
  dicom_data = pydicom.dcmread(dicom_file.name)
21
  dicom_image = dicom_data.pixel_array
22
 
 
 
 
 
 
 
 
23
  # Criar um objeto NIfTI
24
  nifti_image = nib.Nifti1Image(dicom_image, affine=np.eye(4))
25
 
@@ -33,11 +38,18 @@ def dicom_to_nifti_and_display(dicom_file):
33
 
34
  # Exibir as imagens usando Matplotlib
35
  fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(10, 5))
36
- axes[0].imshow(dicom_image, cmap="gray")
 
 
37
  axes[0].set_title("Imagem DICOM Original")
38
  axes[0].axis("off")
39
 
40
- axes[1].imshow(nifti_loaded[:, :, nifti_loaded.shape[2] // 2], cmap="gray") # Slice central do NIfTI
 
 
 
 
 
41
  axes[1].set_title("Imagem NIfTI Convertida")
42
  axes[1].axis("off")
43
 
 
 
 
1
  import os
2
  import tempfile
3
  import pydicom
 
18
  dicom_data = pydicom.dcmread(dicom_file.name)
19
  dicom_image = dicom_data.pixel_array
20
 
21
+ # Verificar se a imagem é 3D e extrair o slice central
22
+ if len(dicom_image.shape) == 3:
23
+ slice_index = dicom_image.shape[0] // 2 # Slice central ao longo do eixo Z
24
+ dicom_slice = dicom_image[slice_index, :, :] # Extrair o slice
25
+ else:
26
+ dicom_slice = dicom_image # Se for 2D, use a imagem diretamente
27
+
28
  # Criar um objeto NIfTI
29
  nifti_image = nib.Nifti1Image(dicom_image, affine=np.eye(4))
30
 
 
38
 
39
  # Exibir as imagens usando Matplotlib
40
  fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(10, 5))
41
+
42
+ # Imagem DICOM (slice central)
43
+ axes[0].imshow(dicom_slice, cmap="gray")
44
  axes[0].set_title("Imagem DICOM Original")
45
  axes[0].axis("off")
46
 
47
+ # Imagem NIfTI (slice central)
48
+ if len(nifti_loaded.shape) == 3:
49
+ nifti_slice = nifti_loaded[nifti_loaded.shape[2] // 2, :, :] # Slice central ao longo do eixo Z
50
+ else:
51
+ nifti_slice = nifti_loaded
52
+ axes[1].imshow(nifti_slice, cmap="gray")
53
  axes[1].set_title("Imagem NIfTI Convertida")
54
  axes[1].axis("off")
55