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# Amino acid conversion mappings
AMINO_ACID_1TO3 = {
'A': 'ALA', 'R': 'ARG', 'N': 'ASN', 'D': 'ASP', 'C': 'CYS',
'Q': 'GLN', 'E': 'GLU', 'G': 'GLY', 'H': 'HIS', 'I': 'ILE',
'L': 'LEU', 'K': 'LYS', 'M': 'MET', 'F': 'PHE', 'P': 'PRO',
'S': 'SER', 'T': 'THR', 'W': 'TRP', 'Y': 'TYR', 'V': 'VAL'
}
AMINO_ACID_3TO1 = {
'ALA': 'A', 'ARG': 'R', 'ASN': 'N', 'ASP': 'D', 'CYS': 'C',
'GLN': 'Q', 'GLU': 'E', 'GLY': 'G', 'HIS': 'H', 'ILE': 'I',
'LEU': 'L', 'LYS': 'K', 'MET': 'M', 'PHE': 'F', 'PRO': 'P',
'SER': 'S', 'THR': 'T', 'TRP': 'W', 'TYR': 'Y', 'VAL': 'V'
}
MAX_ASA = {
'ALA': 129.0,
'ARG': 274.0,
'ASN': 195.0,
'ASP': 193.0,
'CYS': 167.0,
'GLN': 223.0,
'GLU': 225.0,
'GLY': 104.0,
'HIS': 224.0,
'ILE': 197.0,
'LEU': 201.0,
'LYS': 236.0,
'MET': 224.0,
'PHE': 240.0,
'PRO': 159.0,
'SER': 155.0,
'THR': 172.0,
'TRP': 285.0,
'TYR': 263.0,
'VAL': 174.0,
} |