# Amino acid conversion mappings AMINO_ACID_1TO3 = { 'A': 'ALA', 'R': 'ARG', 'N': 'ASN', 'D': 'ASP', 'C': 'CYS', 'Q': 'GLN', 'E': 'GLU', 'G': 'GLY', 'H': 'HIS', 'I': 'ILE', 'L': 'LEU', 'K': 'LYS', 'M': 'MET', 'F': 'PHE', 'P': 'PRO', 'S': 'SER', 'T': 'THR', 'W': 'TRP', 'Y': 'TYR', 'V': 'VAL' } AMINO_ACID_3TO1 = { 'ALA': 'A', 'ARG': 'R', 'ASN': 'N', 'ASP': 'D', 'CYS': 'C', 'GLN': 'Q', 'GLU': 'E', 'GLY': 'G', 'HIS': 'H', 'ILE': 'I', 'LEU': 'L', 'LYS': 'K', 'MET': 'M', 'PHE': 'F', 'PRO': 'P', 'SER': 'S', 'THR': 'T', 'TRP': 'W', 'TYR': 'Y', 'VAL': 'V' } MAX_ASA = { 'ALA': 129.0, 'ARG': 274.0, 'ASN': 195.0, 'ASP': 193.0, 'CYS': 167.0, 'GLN': 223.0, 'GLU': 225.0, 'GLY': 104.0, 'HIS': 224.0, 'ILE': 197.0, 'LEU': 201.0, 'LYS': 236.0, 'MET': 224.0, 'PHE': 240.0, 'PRO': 159.0, 'SER': 155.0, 'THR': 172.0, 'TRP': 285.0, 'TYR': 263.0, 'VAL': 174.0, }