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Enzo Reis de Oliveira
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1
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2af5b7d
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app.py
CHANGED
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@@ -1,46 +1,54 @@
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import os
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import sys
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# 1) Ajusta o path para o inference do SMI-TED **antes** de importar anything
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BASE_DIR = os.path.dirname(__file__)
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INFERENCE_DIR = os.path.join(BASE_DIR, "smi-ted", "inference")
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| 7 |
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sys.path.append(INFERENCE_DIR)
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# Agora o python já sabe onde achar smi_ted_light
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import tempfile
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import pandas as pd
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import gradio as gr
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| 13 |
-
from smi_ted_light.load import load_smi_ted
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# 2) Caminho onde estão pesos e vocabulário
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MODEL_DIR = os.path.join("smi-ted", "inference", "smi_ted_light")
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model = load_smi_ted(
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folder=MODEL_DIR,
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| 20 |
ckpt_filename="smi-ted-Light_40.pt",
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| 21 |
vocab_filename="bert_vocab_curated.txt",
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)
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| 24 |
def gerar_embedding(smiles: str):
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| 25 |
smiles = smiles.strip()
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| 26 |
if not smiles:
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-
return {"erro": "digite uma sequência SMILES primeiro"}
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try:
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-
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| 30 |
-
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-
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-
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv", prefix="emb_")
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| 33 |
-
df.to_csv(tmp.name, index=False)
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| 34 |
-
tmp.close()
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| 35 |
-
return emb, tmp.name
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| 36 |
except Exception as e:
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| 37 |
-
return {"erro": str(e)}
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| 39 |
demo = gr.Interface(
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| 40 |
fn=gerar_embedding,
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| 41 |
inputs=gr.Textbox(label="SMILES", placeholder="Ex.: CCO"),
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| 42 |
-
outputs=
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| 43 |
-
title="SMI
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)
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| 45 |
if __name__ == "__main__":
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-
demo.launch(
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| 1 |
+
import os, sys
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| 2 |
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| 3 |
BASE_DIR = os.path.dirname(__file__)
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| 4 |
INFERENCE_DIR = os.path.join(BASE_DIR, "smi-ted", "inference")
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| 5 |
+
sys.path.append(INFERENCE_DIR)
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| 6 |
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| 7 |
import gradio as gr
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| 8 |
+
from smi_ted_light.load import load_smi_ted
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| 9 |
+
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| 10 |
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| 11 |
# 2) Caminho onde estão pesos e vocabulário
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| 12 |
MODEL_DIR = os.path.join("smi-ted", "inference", "smi_ted_light")
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+
# 3) Carrega o modelo SMI‑TED (Light)
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+
# Se você renomeou o .pt ou o vocab, ajuste aqui.
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| 16 |
model = load_smi_ted(
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| 17 |
folder=MODEL_DIR,
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| 18 |
ckpt_filename="smi-ted-Light_40.pt",
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| 19 |
vocab_filename="bert_vocab_curated.txt",
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| 20 |
)
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+
# 4) Função utilizada pela interface
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| 23 |
def gerar_embedding(smiles: str):
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+
"""
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+
Recebe uma string SMILES e devolve o embedding (lista de 768 floats).
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| 26 |
+
Em caso de erro, devolve um dicionário com a mensagem.
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| 27 |
+
"""
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| 28 |
smiles = smiles.strip()
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| 29 |
if not smiles:
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| 30 |
+
return {"erro": "digite uma sequência SMILES primeiro"}
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| 31 |
+
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| 32 |
try:
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| 33 |
+
# model.encode devolve tensor shape (1, 768) quando return_torch=True
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| 34 |
+
vetor_torch = model.encode(smiles, return_torch=True)[0]
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| 35 |
+
return vetor_torch.tolist() # JSON‑serializável
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except Exception as e:
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| 37 |
+
return {"erro": str(e)}
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+
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| 40 |
+
# 5) Define a interface Gradio
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| 41 |
demo = gr.Interface(
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| 42 |
fn=gerar_embedding,
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| 43 |
inputs=gr.Textbox(label="SMILES", placeholder="Ex.: CCO"),
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| 44 |
+
outputs=gr.JSON(label="Embedding (lista de floats)"),
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| 45 |
+
title="SMI‑TED Embedding Generator",
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| 46 |
+
description=(
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+
"Cole uma sequência SMILES e receba o embedding gerado pelo modelo "
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| 48 |
+
"SMI‑TED Light treinado pela IBM Research."
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| 49 |
+
),
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| 50 |
)
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| 51 |
+
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| 52 |
+
# 6) Roda localmente ou no Hugging Face Space
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| 53 |
if __name__ == "__main__":
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| 54 |
+
demo.launch()
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