File size: 1,173 Bytes
5b19c47
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
import gradio as gr
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem, rdmolfiles
import os

def smiles_to_pdb(smiles):
    mol = Chem.MolFromSmiles(smiles)
    if not mol:
        return "❌ SMILES غير صالح. تأكد من صحة الإدخال.", None
    mol = Chem.AddHs(mol)
    result = AllChem.EmbedMolecule(mol, AllChem.ETKDG())
    if result != 0:
        return "❌ فشل في توليد الشكل ثلاثي الأبعاد للجزيء.", None

    AllChem.UFFOptimizeMolecule(mol)
    pdb_filename = "drug_candidate.pdb"
    writer = rdmolfiles.PDBWriter(pdb_filename)
    writer.write(mol)
    writer.close()
    return "✅ تم توليد الملف بنجاح!", pdb_filename

title = "🧪 SMILES → PDB Generator"
description = "أدخل SMILES وسيتم توليد ملف .pdb قابل للتنزيل."

gr.Interface(
    fn=smiles_to_pdb,
    inputs=gr.Textbox(label="✏️ أدخل SMILES", placeholder="CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O"),
    outputs=[
        gr.Textbox(label="📢 الحالة"),
        gr.File(label="⬇️ تحميل ملف PDB")
    ],
    title=title,
    description=description,
    allow_flagging="never"
).launch()