Maria Tsilimos
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1 |
+
import streamlit as st
|
2 |
+
import time
|
3 |
+
import pandas as pd
|
4 |
+
import io
|
5 |
+
from transformers import pipeline
|
6 |
+
from streamlit_extras.stylable_container import stylable_container
|
7 |
+
import plotly.express as px
|
8 |
+
import zipfile
|
9 |
+
|
10 |
+
from PyPDF2 import PdfReader
|
11 |
+
import docx
|
12 |
+
|
13 |
+
|
14 |
+
import os
|
15 |
+
from comet_ml import Experiment
|
16 |
+
import re
|
17 |
+
import numpy as np
|
18 |
+
|
19 |
+
|
20 |
+
|
21 |
+
|
22 |
+
st.subheader("58-Italian Named Entity Recognition Web App", divider = "orange")
|
23 |
+
st.link_button("by nlpblogs", "https://nlpblogs.com", type = "tertiary")
|
24 |
+
|
25 |
+
expander = st.expander("**Important notes on the 58-Italian Named Entity Recognition Web App**")
|
26 |
+
expander.write('''
|
27 |
+
|
28 |
+
**Named Entities:**
|
29 |
+
This 58-Italian Named Entity Recognition Web App predicts fifty-eight (58) labels
|
30 |
+
|
31 |
+
("**INDIRIZZO**: Identifica un indirizzo fisico.
|
32 |
+
|
33 |
+
**VALUTA**: Rappresenta una valuta.
|
34 |
+
|
35 |
+
**CVV**: Codice di sicurezza della carta di credito.
|
36 |
+
|
37 |
+
**NUMERO_CONTO**: Numero di un conto bancario.
|
38 |
+
|
39 |
+
**BIC**: Codice identificativo di una banca (Bank Identifier Code).
|
40 |
+
|
41 |
+
**IBAN**: Numero di conto bancario internazionale.
|
42 |
+
|
43 |
+
**STATO**: Identifica un paese o una nazione.
|
44 |
+
|
45 |
+
**NOME**: Riferito al nome di una persona.
|
46 |
+
|
47 |
+
**COGNOME**: Riferito al cognome di una persona.
|
48 |
+
|
49 |
+
**CODICE_POSTALE**: Codice postale di un'area geografica.
|
50 |
+
|
51 |
+
**IP**: Indirizzo IP di un dispositivo in rete.
|
52 |
+
|
53 |
+
**ORARIO**: Riferito a un orario specifico.
|
54 |
+
|
55 |
+
**URL**: Indirizzo web (Uniform Resource Locator).
|
56 |
+
|
57 |
+
**LUOGO**: Identifica un luogo geografico.
|
58 |
+
|
59 |
+
**IMPORTO**: Riferito a una somma di denaro.
|
60 |
+
|
61 |
+
**EMAIL**: Indirizzo di posta elettronica.
|
62 |
+
|
63 |
+
**PASSWORD**: Parola chiave per l'accesso a sistemi protetti.
|
64 |
+
|
65 |
+
**NUMERO_CARTA**: Numero di una carta di credito o debito.
|
66 |
+
|
67 |
+
**TARGA_VEICOLO**: Numero di targa di un veicolo.
|
68 |
+
|
69 |
+
**DATA_NASCITA**: Data di nascita di una persona.
|
70 |
+
|
71 |
+
**DATA_MORTE**: Data di decesso di una persona.
|
72 |
+
|
73 |
+
**RAGIONE_SOCIALE**: Nome legale di un'azienda o entità commerciale.
|
74 |
+
|
75 |
+
**ETA**: Età di una persona.
|
76 |
+
|
77 |
+
**DATA**: Riferita a una data generica.
|
78 |
+
|
79 |
+
**PROFESSIONE**: Occupazione o lavoro di una persona.
|
80 |
+
|
81 |
+
**PIN**: Numero di identificazione personale.
|
82 |
+
|
83 |
+
**NUMERO_TELEFONO**: Numero telefonico.
|
84 |
+
|
85 |
+
**FOGLIO**: Riferito a un foglio di documentazione.
|
86 |
+
|
87 |
+
**PARTICELLA**: Riferito a una particella catastale.
|
88 |
+
|
89 |
+
**CARTELLA_CLINICA**: Documentazione medica di un paziente.
|
90 |
+
|
91 |
+
**MALATTIA**: Identifica una malattia o condizione medica.
|
92 |
+
|
93 |
+
**MEDICINA**: Riferito a un farmaco o trattamento medico.
|
94 |
+
|
95 |
+
**CODICE_FISCALE**: Codice fiscale personale o aziendale.
|
96 |
+
|
97 |
+
**NUMERO_DOCUMENTO**: Numero di un documento ufficiale.
|
98 |
+
|
99 |
+
**STORIA_CLINICA**: Registro delle condizioni mediche di un paziente.
|
100 |
+
|
101 |
+
**AVV_NOTAIO**: Identifica un avvocato o notaio.
|
102 |
+
|
103 |
+
**P_IVA**: Partita IVA di un'azienda o professionista.
|
104 |
+
|
105 |
+
**LEGGE**: Riferito a una legge specifica.
|
106 |
+
|
107 |
+
**TASSO_MUTUO**: Tasso di interesse di un mutuo.
|
108 |
+
|
109 |
+
**N_SENTENZA**: Numero di una sentenza legale.
|
110 |
+
|
111 |
+
**MAPPALE**: Riferito a un mappale catastale.
|
112 |
+
|
113 |
+
**SUBALTERNO**: Riferito a un subalterno catastale.
|
114 |
+
|
115 |
+
**REGIME_PATRIMONIALE**: Stato patrimoniale in ambito legale.
|
116 |
+
|
117 |
+
**STATO_CIVILE**: Stato civile di una persona.
|
118 |
+
|
119 |
+
**BANCA**: Identifica una banca o istituto di credito.
|
120 |
+
|
121 |
+
**BRAND**: Marchio o brand commerciale.
|
122 |
+
|
123 |
+
**NUM_ASSEGNO_BANCARIO**: Numero di un assegno bancario.
|
124 |
+
|
125 |
+
**IMEI**: Numero di identificazione internazionale di un dispositivo mobile.
|
126 |
+
|
127 |
+
**N_LICENZA**: Numero di una licenza specifica.
|
128 |
+
|
129 |
+
**IPV6_1**: Indirizzo IP versione 6.
|
130 |
+
|
131 |
+
**MAC**: Indirizzo MAC di un dispositivo di rete.
|
132 |
+
|
133 |
+
**USER_AGENT**: Identifica il software usato per accedere a una rete.
|
134 |
+
|
135 |
+
**TRIBUNALE**: Identifica un tribunale specifico.
|
136 |
+
|
137 |
+
**STRENGTH**: Riferito alla forza o intensità di del medicinale.
|
138 |
+
|
139 |
+
**FREQUENZA**: Riferito alla frequenza di un trattamento medico.
|
140 |
+
|
141 |
+
**DURATION**: Durata di un evento o trattamento.
|
142 |
+
|
143 |
+
**DOSAGGIO**: Quantità di un medicinale da assumere.
|
144 |
+
|
145 |
+
**FORM**: Forma del medicinale, ad esempio compresse.")
|
146 |
+
|
147 |
+
Results are presented in an easy-to-read table, visualized in an interactive tree map, pie chart, and bar chart, and are available for download along with a Glossary of tags.
|
148 |
+
|
149 |
+
**How to Use:**
|
150 |
+
Upload your .pdf or .docx file. Then, click the 'Results' button to extract and tag entities in your text data.
|
151 |
+
|
152 |
+
**Usage Limits:**
|
153 |
+
You can request results up to 10 times.
|
154 |
+
|
155 |
+
**Customization:**
|
156 |
+
To change the app's background color to white or black, click the three-dot menu on the right-hand side of your app, go to Settings and then Choose app theme, colors and fonts.
|
157 |
+
|
158 |
+
**Technical issues:**
|
159 |
+
If your connection times out, please refresh the page or reopen the app's URL.
|
160 |
+
|
161 |
+
For any errors or inquiries, please contact us at [email protected]
|
162 |
+
|
163 |
+
''')
|
164 |
+
|
165 |
+
|
166 |
+
with st.sidebar:
|
167 |
+
container = st.container(border=True)
|
168 |
+
container.write("**Named Entity Recognition (NER)** is the task of extracting and tagging entities in text data. Entities can be persons, organizations, locations, countries, products, events etc.")
|
169 |
+
st.subheader("Related NLP Web Apps", divider = "orange")
|
170 |
+
st.link_button("8-Named Entity Recognition Web App", "https://nlpblogs.com/shop/named-entity-recognition-ner/8-named-entity-recognition-web-app/", type = "primary")
|
171 |
+
|
172 |
+
|
173 |
+
COMET_API_KEY = os.environ.get("COMET_API_KEY")
|
174 |
+
COMET_WORKSPACE = os.environ.get("COMET_WORKSPACE")
|
175 |
+
COMET_PROJECT_NAME = os.environ.get("COMET_PROJECT_NAME")
|
176 |
+
|
177 |
+
if COMET_API_KEY and COMET_WORKSPACE and COMET_PROJECT_NAME:
|
178 |
+
comet_initialized = True
|
179 |
+
else:
|
180 |
+
comet_initialized = False
|
181 |
+
st.warning("Comet ML not initialized. Check environment variables.")
|
182 |
+
|
183 |
+
|
184 |
+
|
185 |
+
if 'file_upload_attempts' not in st.session_state:
|
186 |
+
st.session_state['file_upload_attempts'] = 0
|
187 |
+
|
188 |
+
max_attempts = 10
|
189 |
+
|
190 |
+
|
191 |
+
upload_file = st.file_uploader("Upload your file. Accepted file formats include: .pdf, .docx", type=['pdf', 'docx'])
|
192 |
+
text = None
|
193 |
+
df = None
|
194 |
+
|
195 |
+
if upload_file is not None:
|
196 |
+
|
197 |
+
file_extension = upload_file.name.split('.')[-1].lower()
|
198 |
+
if file_extension == 'pdf':
|
199 |
+
try:
|
200 |
+
pdf_reader = PdfReader(upload_file)
|
201 |
+
text = ""
|
202 |
+
for page in pdf_reader.pages:
|
203 |
+
text += page.extract_text()
|
204 |
+
st.write("Due to security protocols, the file content is hidden.")
|
205 |
+
except Exception as e:
|
206 |
+
st.error(f"An error occurred while reading PDF: {e}")
|
207 |
+
elif file_extension == 'docx':
|
208 |
+
try:
|
209 |
+
doc = docx.Document(upload_file)
|
210 |
+
text = "\n".join([para.text for para in doc.paragraphs])
|
211 |
+
st.write("Due to security protocols, the file content is hidden.")
|
212 |
+
except Exception as e:
|
213 |
+
st.error(f"An error occurred while reading docx: {e}")
|
214 |
+
else:
|
215 |
+
st.warning("Unsupported file type.")
|
216 |
+
|
217 |
+
st.stop()
|
218 |
+
|
219 |
+
|
220 |
+
st.divider()
|
221 |
+
|
222 |
+
if st.button("Results"):
|
223 |
+
if st.session_state['file_upload_attempts'] >= max_attempts:
|
224 |
+
st.error(f"You have requested results {max_attempts} times. You have reached your daily request limit.")
|
225 |
+
st.stop()
|
226 |
+
st.session_state['file_upload_attempts'] += 1
|
227 |
+
|
228 |
+
|
229 |
+
with st.spinner("Wait for it...", show_time=True):
|
230 |
+
time.sleep(5)
|
231 |
+
model = pipeline("token-classification", model="DeepMount00/Italian_NER_XXL", aggregation_strategy = "max")
|
232 |
+
text1 = model(text)
|
233 |
+
|
234 |
+
df1 = pd.DataFrame(text1)
|
235 |
+
pattern = r'[^\w\s]'
|
236 |
+
df1['word'] = df1['word'].replace(pattern, '', regex=True)
|
237 |
+
|
238 |
+
df2 = df1.replace('', 'Unknown')
|
239 |
+
df = df2.dropna()
|
240 |
+
|
241 |
+
|
242 |
+
|
243 |
+
|
244 |
+
|
245 |
+
|
246 |
+
if comet_initialized:
|
247 |
+
experiment = Experiment(
|
248 |
+
api_key=COMET_API_KEY,
|
249 |
+
workspace=COMET_WORKSPACE,
|
250 |
+
project_name=COMET_PROJECT_NAME,
|
251 |
+
)
|
252 |
+
experiment.log_parameter("input_text", text)
|
253 |
+
experiment.log_table("predicted_entities", df)
|
254 |
+
|
255 |
+
properties = {"border": "2px solid gray", "color": "blue", "font-size": "16px"}
|
256 |
+
df_styled = df.style.set_properties(**properties)
|
257 |
+
st.dataframe(df_styled)
|
258 |
+
|
259 |
+
with st.expander("See Glossary of tags"):
|
260 |
+
st.write('''
|
261 |
+
'**word**': ['entity extracted from your text data']
|
262 |
+
|
263 |
+
'**score**': ['accuracy score; how accurately a tag has been assigned to a given entity']
|
264 |
+
|
265 |
+
'**entity_group**': ['label (tag) assigned to a given extracted entity']
|
266 |
+
|
267 |
+
'**start**': ['index of the start of the corresponding entity']
|
268 |
+
|
269 |
+
'**end**': ['index of the end of the corresponding entity']
|
270 |
+
''')
|
271 |
+
|
272 |
+
if df is not None:
|
273 |
+
fig = px.treemap(df, path=[px.Constant("all"), 'word', 'entity_group'],
|
274 |
+
values='score', color='entity_group')
|
275 |
+
fig.update_layout(margin = dict(t=50, l=25, r=25, b=25))
|
276 |
+
st.subheader("Tree map", divider = "rainbow")
|
277 |
+
st.plotly_chart(fig)
|
278 |
+
if comet_initialized:
|
279 |
+
experiment.log_figure(figure=fig, figure_name="entity_treemap")
|
280 |
+
|
281 |
+
if df is not None:
|
282 |
+
value_counts1 = df['entity_group'].value_counts()
|
283 |
+
df1 = pd.DataFrame(value_counts1)
|
284 |
+
final_df = df1.reset_index().rename(columns={"index": "entity_group"})
|
285 |
+
col1, col2 = st.columns(2)
|
286 |
+
with col1:
|
287 |
+
fig1 = px.pie(final_df, values='count', names='entity_group', hover_data=['count'], labels={'count': 'count'}, title='Percentage of predicted labels')
|
288 |
+
fig1.update_traces(textposition='inside', textinfo='percent+label')
|
289 |
+
st.subheader("Pie Chart", divider = "orange")
|
290 |
+
st.plotly_chart(fig1)
|
291 |
+
if comet_initialized:
|
292 |
+
experiment.log_figure(figure=fig1, figure_name="label_pie_chart")
|
293 |
+
with col2:
|
294 |
+
fig2 = px.bar(final_df, x="count", y="entity_group", color="entity_group", text_auto=True, title='Occurrences of predicted labels')
|
295 |
+
st.subheader("Bar Chart", divider = "orange")
|
296 |
+
st.plotly_chart(fig2)
|
297 |
+
if comet_initialized:
|
298 |
+
experiment.log_figure(figure=fig2, figure_name="label_bar_chart")
|
299 |
+
|
300 |
+
dfa = pd.DataFrame(
|
301 |
+
data={
|
302 |
+
'word': ['entity extracted from your text data'], 'score': ['accuracy score; how accurately a tag has been assigned to a given entity'], 'entity_group': ['label (tag) assigned to a given extracted entity'],
|
303 |
+
'start': ['index of the start of the corresponding entity'],
|
304 |
+
'end': ['index of the end of the corresponding entity'],
|
305 |
+
})
|
306 |
+
buf = io.BytesIO()
|
307 |
+
with zipfile.ZipFile(buf, "w") as myzip:
|
308 |
+
myzip.writestr("Summary of the results.csv", df.to_csv(index=False))
|
309 |
+
myzip.writestr("Glossary of tags.csv", dfa.to_csv(index=False))
|
310 |
+
|
311 |
+
|
312 |
+
with stylable_container(
|
313 |
+
key="download_button",
|
314 |
+
css_styles="""button { background-color: yellow; border: 1px solid black; padding: 5px; color: black; }""",
|
315 |
+
):
|
316 |
+
st.download_button(
|
317 |
+
label="Download zip file",
|
318 |
+
data=buf.getvalue(),
|
319 |
+
file_name="zip file.zip",
|
320 |
+
mime="application/zip",
|
321 |
+
)
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322 |
+
if comet_initialized:
|
323 |
+
experiment.log_asset(buf.getvalue(), file_name="downloadable_results.zip")
|
324 |
+
|
325 |
+
st.divider()
|
326 |
+
if comet_initialized:
|
327 |
+
experiment.end()
|
328 |
+
st.write(f"Number of times you requested results: {st.session_state['file_upload_attempts']}/{max_attempts}")
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