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# Instale as dependências necessárias
import os
import tempfile
import pydicom
import nibabel as nib
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import gradio as gr
def dicom_to_nifti_and_display(dicom_file):
"""
Converte um arquivo DICOM para NIfTI e exibe as imagens antes e depois da conversão.
:param dicom_file: Arquivo DICOM carregado pelo usuário.
:return: Tupla contendo a imagem DICOM original e a imagem NIfTI convertida.
"""
try:
# Ler o arquivo DICOM
dicom_data = pydicom.dcmread(dicom_file.name)
dicom_image = dicom_data.pixel_array
# Criar um objeto NIfTI
nifti_image = nib.Nifti1Image(dicom_image, affine=np.eye(4))
# Salvar temporariamente o arquivo NIfTI
with tempfile.NamedTemporaryFile(suffix=".nii", delete=False) as temp_nifti:
nib.save(nifti_image, temp_nifti.name)
nifti_path = temp_nifti.name
# Carregar o arquivo NIfTI para exibição
nifti_loaded = nib.load(nifti_path).get_fdata()
# Exibir as imagens usando Matplotlib
fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(10, 5))
axes[0].imshow(dicom_image, cmap="gray")
axes[0].set_title("Imagem DICOM Original")
axes[0].axis("off")
axes[1].imshow(nifti_loaded[:, :, nifti_loaded.shape[2] // 2], cmap="gray") # Slice central do NIfTI
axes[1].set_title("Imagem NIfTI Convertida")
axes[1].axis("off")
# Salvar a figura em um buffer temporário
with tempfile.NamedTemporaryFile(suffix=".png", delete=False) as temp_image:
plt.savefig(temp_image.name, bbox_inches="tight")
plt.close(fig)
return temp_image.name, nifti_path
except Exception as e:
raise gr.Error(f"Erro ao processar o arquivo: {e}")
# Interface Gradio
with gr.Blocks() as demo:
gr.Markdown("# Conversor DICOM para NIfTI com Visualização")
gr.Markdown("Faça upload de um arquivo DICOM, visualize a imagem original, converta para NIfTI e veja o resultado.")
with gr.Row():
input_dicom = gr.File(label="Upload de Arquivo DICOM")
output_images = gr.Image(label="Imagens DICOM e NIfTI")
output_nifti = gr.File(label="Download do Arquivo NIfTI")
convert_button = gr.Button("Converter e Visualizar")
def process_and_display(dicom_file):
image_path, nifti_path = dicom_to_nifti_and_display(dicom_file)
return image_path, nifti_path
convert_button.click(
process_and_display,
inputs=input_dicom,
outputs=[output_images, output_nifti]
)
# Executar a interface
demo.launch() |