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Task1_train_1400
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This variant lies on Chromosome 1 and affects the gene SLC6A17 (solute carrier family 6 member 17). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; Progressive essential tremor-speech impairment-facial dysmorphism-intellectual disability-abnormal behavior syndrome
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GTAAGGGCCTAGATAGGGGTATGAGATGAGGTATGATTTTGGCCCCAAGTTTGGGGTTGTGCAGGGTAAGAGGATTCAGCTCTAAGAAAGGATTGGGTCTCACAGCCTAGGCCTAGGGCAGTTGTACACTTACTGTAAACTCTTGGCCTCATCCCTCATGTTAGGGCAAATACGTGTTCCCAGGAGTTCTAGAACTAGGTCTCTCTGACTCACTCAGCATCGACCATGACCACATTGTCCTTGTCCTTGGCAAGACCCACCTCCACTAACCCACTTGGTCTGACCCTCCCTGATGCCTGGACCTGGTTTGGCAGTGGGGCTCTTTCACAGGGGCCGTCTGCTTCCTAGGAGAGCACAGGAGGGGACAGGGAGTGGGGGGAAGGACACTCCTCTGCTTCCACCTGCTGTGGGCCAGGGCTGTAAGACACTGCCACAAAGGACTCTGGCTGATTTTTGTGTCCTGGACTCCTTCGGCAGTCTGGTGATGTCCCTGTATGTTACTTTAAATGCATAAGATAAAATGTGTAGGGTTATATAAGAAACTTATTATATTGAAAAATAGCAAAATATCATTTAAAATTTGTGATATAGTAATGTATGAGCACTTTATTTTTAATGCATTGTTACAAGATCTAGCTATAGATCTAATAACAGTGGTAACTTTGAAGTAGTGATGAAAATCAGCGATGACTCAATATTTTCAATAACTGGGATGTAATATGAAAATATCTGTAATCTATTGGTGACAGTCACAGGTATTGTTAATACTACTGTGTTTGCTTGCATTCATAATATAATAGAAAGTAATGCAAGATTTTAGTTAGCGGTTATTGAGGTAAAGATGATTCTTTTGTATGCCATTCAAGCACAAGCCTGCCTGCCTTCCAGAATTCTGCTCACCCCTTGGTGAGAAACCCCTGAGTCAGGGCAGCTCTCTACCTTTGGACTCTAGAGAAGTGCACTTCTACTGCTTTTCCAGCAGGGGGAGCCTTCAGCCAGGCCAGTGTGAAAGGGCTAGGCCCCTCCCTGAACACACAAGCTGTCTATACATAAAACAGACGTGCACCTGCCCAGGGTGTGTCTGGTGGGCCCTATCATATCTCTGGATGGGGTATGATGTGACGGAATCAGAAGAGGTTAGAGGAGGACAGTAGAGCCTTCCCAGAGGCCAGCCAGACCACACACAATGAGCACTGAATGTGAAGAATAGAAGAGCCCAGGAGGGAGGGACTGGGAAACGAAGACTTTCTGGAGGAGATGGTGATGGGGGAAGAGGGAGGTGTGACTGAGGGATGCCAACTGCTGGACCCTCTGCTATGCCTGGCAGGTTCATGCAGGAGCTGACGGAGATGCTGGGCTTCCGCCCCTACCGCTTCTATTTCTACATGTGGAAGTTCGTGTCTCCACTATGCATGGCTGTGCTCACCACAGCCAGCATCATCCAGCTGGGGGTCACGCCCCCGGGCTACAGCGCCTGGATCAAGGAGGAGGTGAGGGGTGGGGCCCCAAACCCCAGGGACATTTGCATCTTCTCAGGCCTTGAATGCAACCACTGATAGGGATACACCTTTCTAGGGCAGCTGCTATGTGCCAGGCCTTGCCAGGTGCCTCACACCTAAACCGCAATCTTACAACAAGCCAAAGACAGAGGTGGCATCATCCCTGTAGCACAAACGGGGACACCGAGGCTCAGAAAGATTAATGCACTTATCCAGTCTTTCTAACCCATATTCTCTCTCCATGCCTGTGGAGTGGAATTAGTCCATTTTATAGTAGGAGAAACCACCCTAGACCCTTTCACCAAGGTGACCAGGTAAACCCCCATCCTTGGCTGTGCCTGGCCAGGATGGTGGGAGGGGAGAGGAGTGGAAGGCCATGGGTGAGGGCAGGAGAGCAGTCTTGGAGGGCCTGGGCGGGGAGGGCTGTCACAGTGCCGGCAGCAGCCCTTAAGGCAGCCCACCCGCAGGCTGCCGAGCGCTACCTGTATTTCCCCAACTGGGCCATGGCACTCCTGATCACCCTCATCGTCGTGGCGACGCTGCCCATCCCTGTGGTGTTCGTCCTGCGGCACTTCCACCTGCTCTCTGATGGCTCCAACACCCTCTCCGTGTCCTACAAGAAGGGCCGCATGATGAAGGACATCTCCAACCTGGAGGAGAACGATGAGACCCGCTTCATCCTCAGCAAGGTGCCCAGTGAGGCACCTTCCCCCATGCCCACTCACCGTTCCTATCTGGGGCCCGGCAGCACATCACCCCTGGAGACCAGCGGTAACCCCAATGGACGCTATGGGAGCGGCTACCTGCTGGCCAGCACCCCTGAGTCGGAGCTGTGACCACTGCCCAAGCCCTGCCCGCCTCTCCCCCCACGCTCAACCTGCCCACTTGTCCAGGCCTGGCCTCTTTCTTGAGGTGGCCACCAGGCCCAGGCCAGGCCCTTTGCCCAAGAAGAGAGGGTCTGCCCTGCCTCACTCCCCTCTTCAGTCCCAGTAGACTCTGCTCCCTAGCCCTGAGCAGGAGGCTGGGAGCAGCTCTGTTTCCTAATTCAGGACCCCACTCATCTAGCCCTCCAAGAGCCTCCGCCAAATTGTAGCCATGTAATTGGAACAACCCATAAGGCCTGCTTCCCAGTCCATGGGAGATTCCAAGTGGCCACTGCAGGAGTCACTCACCTCCCTCTCTCCCTGTAACTTGCCACCTGCAGTTCTTAGGGCTGTGGGGTCAGATGGTGGTGGTGAGAGGCCTTGGGGCTGGGGAAGGAGAGTGGACTTTGGCTCACTCTGCCATGAGAACAGGACACCATCCTGCCCAGCCCAGACGGGGTTGCTCCTGGTCCAAGAGGCTACCTGCTCCAAGGCGGAGGGTGGGAGCAGGTGTGCCAGGGCTCAGGGCTCAGACTTGGGAGGGCCTAGGCAGAAGCCCCAAGTTCTGTTTTCTGAGGTATGTGCTGCCCTTGGCTTCAGCATGAGCCTTGGTAGCAGAAGGTGAGGAACCTCCTCTGCCCTGGTCCCTGGGTGGAATCTTCCCATGTCCTTGGCCCTGCCTGGGGTGTGTGGTGTGTGCTCCTGCATCTTGTCTGGGAGTGCAGTGACCGGGACCAGAACCTTCCCCACCTCAATTAGGGCTTAGCCATCTCCCTGTCCCCAGCACCCCTCCCCAGCCCACAGTGGTGGCCTCTGCCTCTTTCCTGGAGAGAGAAGGACAGTGCACGGAGAGGTTTCCAGAGCACAAATTGTTGGTTCCTAGCACAAATTAGATGGTTTGGAGCACAATGGTGAAGCACACTCCCCTCCCTCCTCACCTGGGGTCCAATGTTCTGTCTAGTGGCAGCTTTTCCCCTGGAACAGGGGTCCCTGGAGTTCACAGGCTTATCCCCAGGAAGCCTCACTCCTGGGGAAAGACAGATAATTTCACTGCCCCTTTGAGCCACCACTCACTCTCCTTATTACACAAGCACAGCCGCCCAGTGTGCACATCATGTGCAGACACCTTGGAAACCTTTCCCAAGCCTTCCTGGCCCACAGTGGCCAGTGCCATAGGCAGTGCTGTGGACAGTAGAGGCTGCCAAAGGCAAGGGCTGGTCTTCAGGATGGAGGCCAGCCTGTGCAGAAGGCTGCAGCTGACAACAGCGACCCCACCTGCCATTACCTTCAGGGCCTCCTCTGGAAGAGAACCCATTCTCAGAGTGCAGCCAGGGAGGAACCTGACCCAAGAGTAAATGTCTGCAGAGAGATGGATGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGGTTGGGGAGTGGGGGTGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTTGGGGGGTGGGGGTGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGACGGATGGGGTGGGGGAAGGAAGGAAAGGAGGGAGAAAGGAGGGAATACTGGCTCCATCTTTGAGAGCTCTGGTGGGCAGGGCAGAAACAGGCCACAGTGCTCAACCCGGACACCCTCACGAAGGGTCGCAAGTCACTCTTGTGGCTCAGATTGCTCTTAGGACCTGGAGGGACAGACCAGAATCAGGGTCCCCTCCTTTACCCCTGAGTTCCTTACTGTTCCCCCAAGCCTGGGAG
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GTAAGGGCCTAGATAGGGGTATGAGATGAGGTATGATTTTGGCCCCAAGTTTGGGGTTGTGCAGGGTAAGAGGATTCAGCTCTAAGAAAGGATTGGGTCTCACAGCCTAGGCCTAGGGCAGTTGTACACTTACTGTAAACTCTTGGCCTCATCCCTCATGTTAGGGCAAATACGTGTTCCCAGGAGTTCTAGAACTAGGTCTCTCTGACTCACTCAGCATCGACCATGACCACATTGTCCTTGTCCTTGGCAAGACCCACCTCCACTAACCCACTTGGTCTGACCCTCCCTGATGCCTGGACCTGGTTTGGCAGTGGGGCTCTTTCACAGGGGCCGTCTGCTTCCTAGGAGAGCACAGGAGGGGACAGGGAGTGGGGGGAAGGACACTCCTCTGCTTCCACCTGCTGTGGGCCAGGGCTGTAAGACACTGCCACAAAGGACTCTGGCTGATTTTTGTGTCCTGGACTCCTTCGGCAGTCTGGTGATGTCCCTGTATGTTACTTTAAATGCATAAGATAAAATGTGTAGGGTTATATAAGAAACTTATTATATTGAAAAATAGCAAAATATCATTTAAAATTTGTGATATAGTAATGTATGAGCACTTTATTTTTAATGCATTGTTACAAGATCTAGCTATAGATCTAATAACAGTGGTAACTTTGAAGTAGTGATGAAAATCAGCGATGACTCAATATTTTCAATAACTGGGATGTAATATGAAAATATCTGTAATCTATTGGTGACAGTCACAGGTATTGTTAATACTACTGTGTTTGCTTGCATTCATAATATAATAGAAAGTAATGCAAGATTTTAGTTAGCGGTTATTGAGGTAAAGATGATTCTTTTGTATGCCATTCAAGCACAAGCCTGCCTGCCTTCCAGAATTCTGCTCACCCCTTGGTGAGAAACCCCTGAGTCAGGGCAGCTCTCTACCTTTGGACTCTAGAGAAGTGCACTTCTACTGCTTTTCCAGCAGGGGGAGCCTTCAGCCAGGCCAGTGTGAAAGGGCTAGGCCCCTCCCTGAACACACAAGCTGTCTATACATAAAACAGACGTGCACCTGCCCAGGGTGTGTCTGGTGGGCCCTATCATATCTCTGGATGGGGTATGATGTGACGGAATCAGAAGAGGTTAGAGGAGGACAGTAGAGCCTTCCCAGAGGCCAGCCAGACCACACACAATGAGCACTGAATGTGAAGAATAGAAGAGCCCAGGAGGGAGGGACTGGGAAACGAAGACTTTCTGGAGGAGATGGTGATGGGGGAAGAGGGAGGTGTGACTGAGGGATGCCAACTGCTGGACCCTCTGCTATGCCTGGCAGGTTCATGCAGGAGCTGACGGAGATGCTGGGCTTCCGCCCCTACCGCTTCTATTTCTACATGTGGAAGTTCGTGTCTCCACTATGCATGGCTGTGCTCACCACAGCCAGCATCATCCAGCTGGGGGTCACGCCCCCGGGCTACAGCGCCTGGATCAAGGAGGAGGTGAGGGGTGGGGCCCCAAACCCCAGGGACATTTGCATCTTCTCAGGCCTTGAATGCAACCACTGATAGGGATACACCTTTCTAGGGCAGCTGCTATGTGCCAGGCCTTGCCAGGTGCCTCACACCTAAACCGCAATCTTACAACAAGCCAAAGACAGAGGTGGCATCATCCCTGTAGCACAAACGGGGACACCGAGGCTCAGAAAGATTAATGCACTTATCCAGTCTTTCTAACCCATATTCTCTCTCCATGCCTGTGGAGTGGAATTAGTCCATTTTATAGTAGGAGAAACCACCCTAGACCCTTTCACCAAGGTGACCAGGTAAACCCCCATCCTTGGCTGTGCCTGGCCAGGATGGTGGGAGGGGAGAGGAGTGGAAGGCCATGGGTGAGGGCAGGAGAGCAGTCTTGGAGGGCCTGGGCGGGGAGGGCTGTCACAGTGCCGGCAGCAGCCCTTAAGGCAGCCCACCCGCAGGCTGCCGAGCGCTACCTGTATTTCCCCAACTGGGCCATGGCACTCCTGATCACCCTCATCGTCGTGGCGACGCTGCCCATCCGTGTGGTGTTCGTCCTGCGGCACTTCCACCTGCTCTCTGATGGCTCCAACACCCTCTCCGTGTCCTACAAGAAGGGCCGCATGATGAAGGACATCTCCAACCTGGAGGAGAACGATGAGACCCGCTTCATCCTCAGCAAGGTGCCCAGTGAGGCACCTTCCCCCATGCCCACTCACCGTTCCTATCTGGGGCCCGGCAGCACATCACCCCTGGAGACCAGCGGTAACCCCAATGGACGCTATGGGAGCGGCTACCTGCTGGCCAGCACCCCTGAGTCGGAGCTGTGACCACTGCCCAAGCCCTGCCCGCCTCTCCCCCCACGCTCAACCTGCCCACTTGTCCAGGCCTGGCCTCTTTCTTGAGGTGGCCACCAGGCCCAGGCCAGGCCCTTTGCCCAAGAAGAGAGGGTCTGCCCTGCCTCACTCCCCTCTTCAGTCCCAGTAGACTCTGCTCCCTAGCCCTGAGCAGGAGGCTGGGAGCAGCTCTGTTTCCTAATTCAGGACCCCACTCATCTAGCCCTCCAAGAGCCTCCGCCAAATTGTAGCCATGTAATTGGAACAACCCATAAGGCCTGCTTCCCAGTCCATGGGAGATTCCAAGTGGCCACTGCAGGAGTCACTCACCTCCCTCTCTCCCTGTAACTTGCCACCTGCAGTTCTTAGGGCTGTGGGGTCAGATGGTGGTGGTGAGAGGCCTTGGGGCTGGGGAAGGAGAGTGGACTTTGGCTCACTCTGCCATGAGAACAGGACACCATCCTGCCCAGCCCAGACGGGGTTGCTCCTGGTCCAAGAGGCTACCTGCTCCAAGGCGGAGGGTGGGAGCAGGTGTGCCAGGGCTCAGGGCTCAGACTTGGGAGGGCCTAGGCAGAAGCCCCAAGTTCTGTTTTCTGAGGTATGTGCTGCCCTTGGCTTCAGCATGAGCCTTGGTAGCAGAAGGTGAGGAACCTCCTCTGCCCTGGTCCCTGGGTGGAATCTTCCCATGTCCTTGGCCCTGCCTGGGGTGTGTGGTGTGTGCTCCTGCATCTTGTCTGGGAGTGCAGTGACCGGGACCAGAACCTTCCCCACCTCAATTAGGGCTTAGCCATCTCCCTGTCCCCAGCACCCCTCCCCAGCCCACAGTGGTGGCCTCTGCCTCTTTCCTGGAGAGAGAAGGACAGTGCACGGAGAGGTTTCCAGAGCACAAATTGTTGGTTCCTAGCACAAATTAGATGGTTTGGAGCACAATGGTGAAGCACACTCCCCTCCCTCCTCACCTGGGGTCCAATGTTCTGTCTAGTGGCAGCTTTTCCCCTGGAACAGGGGTCCCTGGAGTTCACAGGCTTATCCCCAGGAAGCCTCACTCCTGGGGAAAGACAGATAATTTCACTGCCCCTTTGAGCCACCACTCACTCTCCTTATTACACAAGCACAGCCGCCCAGTGTGCACATCATGTGCAGACACCTTGGAAACCTTTCCCAAGCCTTCCTGGCCCACAGTGGCCAGTGCCATAGGCAGTGCTGTGGACAGTAGAGGCTGCCAAAGGCAAGGGCTGGTCTTCAGGATGGAGGCCAGCCTGTGCAGAAGGCTGCAGCTGACAACAGCGACCCCACCTGCCATTACCTTCAGGGCCTCCTCTGGAAGAGAACCCATTCTCAGAGTGCAGCCAGGGAGGAACCTGACCCAAGAGTAAATGTCTGCAGAGAGATGGATGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGGTTGGGGAGTGGGGGTGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTTGGGGGGTGGGGGTGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGACGGATGGGGTGGGGGAAGGAAGGAAAGGAGGGAGAAAGGAGGGAATACTGGCTCCATCTTTGAGAGCTCTGGTGGGCAGGGCAGAAACAGGCCACAGTGCTCAACCCGGACACCCTCACGAAGGGTCGCAAGTCACTCTTGTGGCTCAGATTGCTCTTAGGACCTGGAGGGACAGACCAGAATCAGGGTCCCCTCCTTTACCCCTGAGTTCCTTACTGTTCCCCCAAGCCTGGGAG
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Task1_train_1401
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The following genetic variant occurs in KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2) on Chromosome 1. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
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Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 32
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CAGGACAGCTGGAACTGTGAGGGCCACAGGGCCCTTGTGCACTCAGTAAGACAAGCTTCAGCCATGGGAACTGAAGCTGCAGCACATGGAGGGCAGAAAGACAATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGC
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CAGGACAGCTGGAACTGTGAGGGCCACAGGGCCCTTGTGCACTCAGTAAGACAAGCTTCAGCCATGGGAACTGAAGCTGCAGCACATGGAGGGCAGAAAGACAATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGGCAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGC
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Task1_train_1402
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Here’s a variant in KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2) located on Chromosome 1. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 32
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GCTGGAACTGTGAGGGCCACAGGGCCCTTGTGCACTCAGTAAGACAAGCTTCAGCCATGGGAACTGAAGCTGCAGCACATGGAGGGCAGAAAGACAATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGG
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GCTGGAACTGTGAGGGCCACAGGGCCCTTGTGCACTCAGTAAGACAAGCTTCAGCCATGGGAACTGAAGCTGCAGCACATGGAGGGCAGAAAGACAATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGAACGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGG
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Task1_train_1403
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A change on Chromosome 1 affects gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; not provided
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GGCCACAGGGCCCTTGTGCACTCAGTAAGACAAGCTTCAGCCATGGGAACTGAAGCTGCAGCACATGGAGGGCAGAAAGACAATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCC
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GGCCACAGGGCCCTTGTGCACTCAGTAAGACAAGCTTCAGCCATGGGAACTGAAGCTGCAGCACATGGAGGGCAGAAAGACAATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAATTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCC
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Task1_train_1404
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Located on Chromosome 1, this mutation impacts KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; not provided
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GGGCCCTTGTGCACTCAGTAAGACAAGCTTCAGCCATGGGAACTGAAGCTGCAGCACATGGAGGGCAGAAAGACAATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACATACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCCGAGCATG
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Task1_train_1405
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Chromosome 1 houses a mutation in gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 32
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ATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCCGAGCATGGGCCTGGAGCCTTTTGAAGGAAGGAGGCAAGATGCAAAGCTCAGCAAAAGCTGGAGTCCTGGCTGTCCTCAGGAG
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ATTCTAACGTCTAGGAATCCATGGATACCGGAGTGTCTGAGGCAATGGCAGCAAACCCAGGCCCAGTGGGGTTACCAATGAGACAAATTAACCCATTAGGCCTCTTAGACAGCCAACCCACCAAGCAGTGGATTTGCTCCTGAACCTGAACTCCAGAAAATGAATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATACACACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGCTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCCGAGCATGGGCCTGGAGCCTTTTGAAGGAAGGAGGCAAGATGCAAAGCTCAGCAAAAGCTGGAGTCCTGGCTGTCCTCAGGAG
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Task1_train_1406
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Here is a genetic alteration in KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2) on Chromosome 1. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 32
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Task1_train_1407
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A variant affecting Chromosome 1, within the gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; not provided
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CACATATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCCGAGCATGGGCCTGGAGCCTTTTGAAGGAAGGAGGCAAGATGCAAAGCTCAGCAAAAGCTGGAGTCCTGGCTGTCCTCAGGAGGTGTGACGTTGCCTGGAAAAAAACAGCAGCAAGGTGGAACCAGGGCATTTGAACCAGCTGGTGCCAAGATTTAGGAGGGTCTGGCAGCTTCCCTCATGGGAGGTAACAGGCCCCCATGCCCATCCTCTATTCTGATGCCAGGCCTGAGGACTATCCCTCAGCCTCCTTGCCTCTTCTGGGCAGGCTTCCCATCAGCTTGAAGCATTTTCTCCCAGGGAGCAAGACT
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Task1_train_1408
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Gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2), found on Chromosome 1, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
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Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 32
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Task1_train_1409
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Gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2), found on Chromosome 1, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
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Pathogenic; Neurodevelopmental disorder
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TATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCCGAGCATGGGCCTGGAGCCTTTTGAAGGAAGGAGGCAAGATGCAAAGCTCAGCAAAAGCTGGAGTCCTGGCTGTCCTCAGGAGGTGTGACGTTGCCTGGAAAAAAACAGCAGCAAGGTGGAACCAGGGCATTTGAACCAGCTGGTGCCAAGATTTAGGAGGGTCTGGCAGCTTCCCTCATGGGAGGTAACAGGCCCCCATGCCCATCCTCTATTCTGATGCCAGGCCTGAGGACTATCCCTCAGCCTCCTTGCCTCTTCTGGGCAGGCTTCCCATCAGCTTGAAGCATTTTCTCCCAGGGAGCAAGACTCAGG
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Task1_train_1410
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This alteration occurs within gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2) located on Chromosome 1. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_1411
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Given this variant in gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2) on Chromosome 1, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 32
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ATGTATGTATATATATACACCCTAGTGCACATAGTCAAACACATGCATAAATTGCCCTTTGTCAAAAATATTGCATAAGCTTGTACAATGTTCAAATGCAATTTCTTTTCTATCACTAGCTAGGTAGAGGAACGCGTGAAAGAGAGATACTCGATATATATTTATATACACTGGATCCACAGACCTGCCTGTCATCAGGACCAGATGCCCTGGTCCACTGTACAGTCATGCCCGCGACTAGGTTAATTCCTAAGGTGCAGTCATGTGAGGTGTTCAGATGCTGCCTTCCCCGCTTACTCTTCTGGCTTTGCAGAGGTCTGCGTTCCTGTTTAGAAGAACAGGGATAGGTAGGCTGGGGGGCCAGAAGTTTTAGTTCCATTCCAAATAGTCTATTTTTTTTCCCCTGATGGAGGGATTTTTGCCTTCTGATGGGAAAAAAACCCCTAGTTCAAGACCATTCCAAGCCTATTAATACTCTAAATATTAACACTGTGTAGGCTACTAGGAAAATAGGTTATCTCCTGTGTTTTAAATATTGAGATTCATGCAACAAACACCCATGCAGCTCTATTGCATCACTGGTAAATTTCACTGCAGTGTCAGTGTAGCTGGGCCACATCAGTGGGAAAGCAGATGTCTGCAAACTCCAGTAAGAAACCAGACATGTTTTTGTGACCCTGGAGCCTGCAAAAATGGTGAAATCAGAGGCTTAGAGGTCTGTTGGTTTGTTAGCTTCTCCCCATAGGCCTAAGGGAACAAATGTGAAACTTGACAACTCATATTCGGTCATACTAACTGTCCCTCCCCCGGGCTTCCCTCACATCGACACTGCAGAGAAAAAGCAGAATGCAGCATTTTCCGTTATGAAACACAAGCCTCCAGAGCATCTACTTGGCAACTGCAATTCACAAACTCCAGCCTGTGACACAGAAAGTAATTCCAACACACAGGACTGTGTGTTCTTTTCAATGCAAAAATGAGTATGACCTTTTGAACAAACACCAGCTATTTAAAGCTAAGCCATGATTGTGTTCCTCTGTGAAAGGGCAGGTGGGCTCAAATAAGGTGGTGGGATGGTGGGGAGGGGAGTGCATCTCTTGGATGTTGTGTGCATTTCATTAGGAAGGAATGATGGCACTGATATGGTGCACTGTGTATGGGATATGAGGTGGCCTCAACGTGTCTATCTGAAATCCTAGCTTGATAGGTGACTCCCGTCTTTGGAAGTTCATAAGCCGGTGATGAGGATGTGCATGAAAGCCATGATAGATATTCTGTGTTCTAAATCAAAAGTCAAAAGATCAAAAGTCACTTGCACAACTATTGCTTTCCATGCAGAACCAGATACACACTGTAGAACACACTGACTACAATGCAGGCTATTATGCAACATCTGCATTAGTTCCATTGAGCTGTGAGTACGGTAATAGGTTTCAATCAGACATCAGTTAACATTTTGGTAATATTCACATAGTTTGTGTTAGCCAAGGTACAGTTGGCTGTTTTCAAGTTTTCCTCTCTAAAGTCCTCATTACTGTTATTTACACCCTCCTGGATCTCCATGTAATCAGACTTACTAATGGTAGAGGCACTTCTACTTTTCTTTAGGTCAGGGGAGGATGGGATCTTTGGACAGCTTGTCACTTGCAAGTATTGGGCCTGTTCCTCTCCCTCTGTCTCCCGGTGGTAGAAGTAGTTGAAATTGGACACAATGACAGGGACCGGTAAGGCAATAGTTAACACACCTGCAATCGCACATAGGGAACCCACTATCTTTCCCCCAATGGTAGTCGGAACCATGTCTCCATAGCCTACAGTTGTCATGGAGACGACTGCCCACCAGAAGGCATCTGGGATGCTGGGGAACTGGGACTCTCGCTCATCGGCCTCTGCAAAATACACAGCACTAGAGAAAAGGATGACCCCTATGAAGAGAAAGAATATCAGGAGGCCCAATTCTCTCATGCTGGCTTTGAGGGTCTGACCTAGAATCTGGAGACCTTTGGAGTGTCTGGACAACTTGAAAATCCTAAAGACTCTTACCAACCGGATGACACGGAGGATGGCCAGTGACATGGCCTGCTGGCCTTGCTGAGCGTCCTCTGGCTTCTCAGCCAACTCTGTCCCCAGGGTGATGAAGTAGGGGATGATGGCCACAATGTCAATGATGTTCATGATGTTGGTGAAGAAGCCGGCTTTGCTGGGACAGGCAAAGAACCTCACCAAGAATTCAAAGGAGAACCAGATGATGCAGAGTGTCTCTACAATGAAGAAAGGGTCTGTGAAGGAAGTGGACTGCTGGTACCCGATGGTGCTGTTGGAATAGGTGTGGAAGGTCACCCCACTACCATGCATGTCTTCATTCTCATCCCGGAAGATGGGCAATGTTTCCAGACAGAAGCTGACAATTGAGATCAGAATCACCATGACAGACACAATAGCTATAATCCTGGCAGGCCCTGAGCTCTCTGGGTATTCAAAGAGAAGCCACACTTGTCTCTGAAACTCATTTTCAGGCAGAGGACGCTCTTCCTCCTTGATGTAGCCTTCATCTTCCCGAAACATCTCCATCGCTTCTTCTCCCAGCTCATAAAACCGAATTTCTTCAGAGAATATATCTAAGGGCACATTCACAGGTCGCCTCAATCGGCCCCCTGACTGGTAGTAGTACAAAATGGCATCAAAGCTAGGGCGGTTCCGATCGAAAAAGTACTCATTTCGGAGGGGGTCAAAGTACCTCATTCGTTTCTTTGGGTCCCCTAAGAGGGTCTCTGGAAACTGGGCTAAGGTCTTTAGCTGGGTCTCAAACCGCAGCCCTGAGATGTTGATCACCACCCTCTCACAGCACTCGTGGTCTGCCTCTGGGTCATAGGTGTCCTGTGGGTGCCCAGGGAGGGCAGCAGCCTCGTCTGCTGGGTCTCCGGTGGCCACTGTCATAATTGGGACTGAGAGAAGCACCTCACGCTATGCCTTTCAGCTGCCTGGTGGCAGGGAGCTCAGGGTGCTGCTACTGGCCCCAGGAAGCACAGGAGCATTGGCCTGGTCTCCTGCAGGAGAGCCCCGAGAGCTCTCTGAGAGCTGGAGAGACAGCCTCGCTTGGCTGAAAGACAGAGGCAGTTATTGACATGAGGCTACTCAGCATTGGCAGCCTGACCTGGGTTGCCACTTTTTGTCTCCCATCTCTCAGCCAAGAGTTCAGACACATGATCACCACCACCACAACGACAAAGCAAAATTTACTTTCACCTTGTAACTTGTCTGGGGATCAGGGGGAGCAGGTAGCAATCTCTCCAGGAACCTCTGGAATGCCCTGCATTGGGGGAAGGTGGCTGGTACAGGCCCGCTTGTAGCACACAGGCTTCATGGAGCATAACCCCATGCTAATAGGTTAAAAGTGGACCCTCTCCCAGGTGCTGCACTAATGTCTCAGATACTCATACCCAGGGAGGTATTCATGGTTGGGGAGCTTGGGCCTGGGTCTTTCTCATTGGCCTCCACCCCAGTGATTCTACACAAGGCTGTTATTAAATGATAGATTGATTTACCTGACCAGAGACGTGAAGCTCTCTTCCTTGCAGAGCTGATCAGATGCTGCAGGAATCTGAGATGCACCAACAGGCAGCCCAACTCCTCATCACGTCTTCTCACTCGAGCTAGAAATAATGGTGAGTCATTCTGGGCAGAAGGGCAGACTCTGGGTCCTGGAGGTGAGCTCTAGGATTGGGCTGGGCTGGAGGGGCGGTGAGGTGCCTGGCCAGGGGCATGCGGGACTTGAAGACAGCCGAGCATGGGCCTGGAGCCTTTTGAAGGAAGGAGGCAAGATGCAAAGCTCAGCAAAAGCTGGAGTCCTGGCTGTCCTCAGGAGGTGTGACGTTGCCTGGAAAAAAACAGCAGCAAGGTGGAACCAGGGCATTTGAACCAGCTGGTGCCAAGATTTAGGAGGGTCTGGCAGCTTCCCTCATGGGAGGTAACAGGCCCCCATGCCCATCCTCTATTCTGATGCCAGGCCTGAGGACTATCCCTCAGCCTCCTTGCCTCTTCTGGGCAGGCTTCCCATCAGCTTGAAGCATTTTCTCCCAGGGAGCAAGACTCAGGC
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Task1_train_1412
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Chromosome 1 houses a mutation in gene KCNA2 (potassium voltage-gated channel subfamily A member 2). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 32
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Task1_train_1413
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A variant has been detected on Chromosome 1 in DRAM2 (DNA damage regulated autophagy modulator 2). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
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Pathogenic; Retinal dystrophy
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TACTTCTTTAAACACAGAAACAATTCACCTGAAAAGTTACATCACTTGTTTATGATACCAAATCACAAACAGTTAATTTTCAAAAAGGCGGGAGAGTTGCCTATGGAAAGTTCTCTTAGTCTACCTTCCTGGACTAAGAGAAGGAAGTCTGACTGAATAAATCTAATATTGTGCCTTCTTACCTGAAAATCACGAATGTAAGTCAGGAAAAAACCAAAGAAGGAAAATGACATAGACCATTCTGCTGCAGTAGTGATCATGTGAAGCACATAACCCTGAGTGATGGGAAAAAAAGAATAGTTTTGTGAAATTTCATTTAAACGATCTATATACTATGTTTCAAATAAAAAACACACAATTCTTATAAAATAATGGAGCTTCTGAAAATCAACCCTTGACTTACCAGGCATATAATATCTCTAGAATTAAAGAGCCAGCATTAGGAAATCCTCCTAAATGACACTCTATTTGTTTCACTGGGAGCGAATAAAATTTCCAATTAAATAGCTAAGATAGAACAGGATCATTTTTACTCTACAATCGAGAAATTACTATTGCCTTACCCAAAGCCATAAGATTCATAATATGCAACTAAGAAAAGTTTAACAATGCTCAGAATAAACTTAGTAAGTGCTGTGTTTACGATATTAAATAATATATGGGTTACAATTGGGAAAATCTAGTAAATTATTTCATTCATTCATTTTCACAAACATGCCCAATTTGGGGCTAATTCTTATATAAAACACCACCAAGTGGTTTGTGAAAACAGATGAACTCATTTTATTCTTTAGTATATGTTCCTCTTCCTCTATTCTCAGAGTCCCAGATGTTATATCTACATTCAGATATCCACTATATTGAATCCTAAATGCAGAGTCCATAATCAATTTCCAGATAACAAAAAGTGGGAGAAGATGTCTTTTCAATTCAGAAAACAAGTATTCAAAACATAAATGATCTCGGTTGGCTATATTATATACTATACCCACATTTAGGGGAGTCAATTTCTCAGAAAACTCTTCTGCCATCGCAATGCTCTTCATATTTTGACAATATCTACAGATCACAGGTGACAGGAGAATATGGAAGGTTCTACATAAACCCTACCATATCAAGAAAATAATTTTAATACAGAACTGATTATTCTACCAGAAGACTTTCATTGTTACTGATGAAATGAAAAACATATCAAGATCAATCAAAATAACCATCTTTAATATAAAACTAAGTTTATAGACTGTAAGTTCTTACTTTGTCCTCGGGGTTCCAATGGAGTTTCTGTTCTAAATCAGTCCCAAAATTGCCACTGTGCAAAACTGATGAGCAAGTCAGCACTATAAAAACATAAGTCAAGGAAGAATCTCAGAGACGATCTCAGAGAACAAAAATCACTTTACAGTCTAAAAGGATTACTCACACATTTATTGCTAAGGTCTAAACCCATTTTCTTAAAGACTTAATGTTACACAGCAGTGGTACTGTAAAACTAAAAATGTGCTGCTCAGAGGGTCACAACAAAATGGTTCTCACAGTCAAACCCCACCTCTTTGCTCAGAAAATTAGCAGTTCTATCATAATCTTTAACTAGATAATGGTTCTCAGAAAGGGCATTTACTCATCCCTCATTTCTTTGAAGTGAGTATGATCAGGCTCAACATTTTTGTTCCTAGCTCAATTACTGAGGCACTATGTACAATCTGAATTCCATATTTCAAATTCTTTAGTTTAGGATTGTGAACCTAAGAATCTCTCCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAAAAAGGCTTCTTATACTGCACCAATAGTGTTTACTTAAATCTTGTCATTCAATTCCTTTCCAAGTGTAGCCACATTGTACAGTGAAGGATACTGCTAAGTGCACTTACTCCACACCAGATAACCAACAACAGTCTGATCCAGAAGACTTGTTTGCCATGGATTTTGGGCTGCATTTGGTAGGAAAGGATGGTCTGAACAAACATATATAATGAGCCCATACCAAAGGTAAGCACAGCTCCACTTACATGTGCAGCAAAAAGGGTTGTTTTCTGAGAGATAGAGAGAAGAAATACGTCAATAAAAGAAACTCAGAACACATTGGCAACACAACATTTAAAAGCACAACCCAGAGATTTCAATAGGACATTCACTGAGTAGAGAAGCTCGGCCAATTCTACAAACAAATTACTTTCTGAAGTAATTTTCTCTCATAATACTCAGTTTAAACCTAAGGATTATAGTAATACCAAACTATTTCATATACCTCCACTGAAAATATAATAGGAATTATTCATTTATTATTTTCTTCATTTAATAATATGTTTACTTGGTGCCTATTAGGTGCTAGGCACTGTTCTAAATCTTCAGATCCATTAGAGAACAAAACAGGCAAAAATCCAGCTCTGAGTTTAGTAAAGGTACATAAACAATAAATATAAACTTCAGAAATAAGGAAATTCCAGTGTGTCTGATGGTGAAAAGGGTCATAGGAAAAGCATAGTGCAATAAGAAAAGATTAGGATGGACTGCAGTGCTGGGAATAGGGAGTTTCCATTTAAATTCAATTTAACTGTAAATAAAATTTAAAGACTCAAGAAATTAAAATATTCTCCCTTGGCTCTAGCTTGATTGGTTATATATAGTTACACTGCTATAAGCCAAGGAACACCAAGGATTACTGGTAATCACCAGAAGCCAGGAACAGATTCTCCCTCTGAGCCTCCAATAAGAGAATCAACCCTACCAACACCCTGATTTCAGACTTCTGGCCTCCCGAACTTTGACAGAATAAATTTCTATTCAGTCACCCAGTTTGATATTTTATTATGGCAGCACTAGAAAATTAATACAGATTTCTGCTTACTAAAGTTTTACTACTCTCCTTTGATAAATTTCGTATGAAGAAAAAAATTCCTCTAAGTAGGTAGTGAAGACACTTACCATGTAGTTATTTTTCTGAACAACATATACAAATTTGTTTTAAAAGAAATTCAATTTTTATTTTTTAAGTTAGATTTTTCAAATACCATCTTATAGCAATTATTAGGCATCTCTTTAAATGCAGGCAACCACAGCAATAAGAGAATTTTTTCCAATCCTGCATAGTCCCTTTAACCTCTCTCAATAAGTTACTAAATAATTAATGAAAGCATGTTTGTCTTAAGTACTAAGCTAGGTGCTGGAGATACAATGGTGAACGTTTCGAAACCATTGTGCTTATAATTAATAAAGAAATACATCAACTAAAAAATAAAAATAATAAATTTACAACCATGGATATAAAGGGCGTTATGGCCTACCAAACAGAGGAAACAGTATGTGAGAGGAAATTAAATAAGCTTGTCCTATTTAAGGAGCACAAAAAGGCTAGTGATATATATAATGGAGATATTAAGAAGGGGGACAATGCAAAATTAGGCTTGAAAGGTAGACATCAGCCAGATTATACAAGATCTTTGAGTTAGTTAGGCAGTTTGGTGGTTTAGCAAATTATTTTTTTCTCTCTTGAATTGTATCTCTTTTCACATAATTTTTAAACCTGTAGAACTTTAAGCAAGGACACAGGGATGCAAAATGAGATGTATATACGTTTCCAAAAGATCACTTTTACTGCAATATGAAGAAATGATTCAAGGAATGTAAGAGTGAATGCACAGGAACCATTGAGGAGGCTATGGCAGTAGTTCAGATGAGAGATGATGAAATCTAAGCTAGTTGAGAAGAAGACAGTAAGGAGGGAAGTAAAGACAGAAATGGAAAGAAGTGAATGTCTTCAAAAAATATTCAAGAAGTAAAACCATTAAGTCCTGACTCCATTTAAAACACAGTGCTAGCCTCTCTTCCAAGCCAATACCTGCAAGGGTAAAACCATTTATAGACCTGGTTTTGTAAAATTTTTCCCGTATAAATCACCTAGAGTTTGTCTCCATAAAAGAAAAGGGGGAAGTGGAGGAGGAAGCAGTGCACTCACCACTTTAATTAAGTAGTAAACGTTTACTCTGGAAAGGAAGGAGATCCTCATTAGTATAGCAGTGGGTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGGAAAGAGAATTGTTT
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Task1_train_1414
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Assess the clinical impact of this variant on gene DRAM2 (DNA damage regulated autophagy modulator 2), found on Chromosome 1. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; Retinal dystrophy
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CAGGTGAAATCATCTAGATTAAAACACTAGTAGTTGCTTAATCATATTTAATAATAACGTTTTAATAATTATGTTTCCTTCATCTCCCTGCCCTATGTAATTTATTTAACTTTTATAGAGAAGTTTAAGTCTCAATAGCTCAGAAACCATTCATATAATTATGATTTCCTCATATCCTTTTTGTGAATGCATAAACTGATGCAACAATTCTAAAGATACATTTGGAAATGTCAAATGAAAAATGTAGATGCCCTATTACCTATCTAGCAATCTCACTTCTAGAAATCTACCTCATATCAACATCAGTATGTAAAGTTGTATGTAATGAAACCTTCATTATAGTACTGTTTGTAACAGCCAAAAAAAAGGGAAGGAAGAATAAGTAAGCAATTTCTTTATCAACATCCTATCACTTTTTATAAATGAAACAAAATAAAAAACCCAAAAAAGTGAGAAAGAACGAGAAAAAAAGAGAAAGAGTTTTGTACATACATGATAACAAGATAAACCAAACTCTGGAAGGAAATCTACCAAACTATGAATTGTCTCTAGGGTGTAGAAACTGGAAGGTGTCAGGAAGGGATTTTTGCTTTTCATTTTTATAATCACTCTAGTATTGTTTAAAATTTGTTGTAATAATTACGTTTTGCTATTGCAATTTTAAAAAAAGAGGGTTATTATAGCTTCTTGGCCTTTTGGCTAAGATCAAGTGTAAAAAAAGAGGGTTATGAACATAGTATATGCAACTGACTACCCATTCTTCATTCGTTGTGAGATTTCAAAAATGTTATCAATAAATTTTGATACTTAATACGTCAAAAATATCTAGGCAGCATAAAAAGTAAGAGCCTAGCTTCTAGAGTCAAACTGTCCAGGTTTAATTCTTGGTTCCAACACTGAGTTATTTGCCCATGAGCAAATAACTTGACCTCCCTGGACCTCATTTCCTTCTCTCTCAAATGAGGATCATAGTTTCTACCTTATCCAGTTGTTGTAAGGATTCAACTATTTAGGACATGAAGAATGCTTAGTAAATTACTTTCTACGAGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGAAGTTCAAGACTAGCCTCACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGCGTGGTGGTGTGCGCCTGTAATTCTAGTGACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGATTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTTGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACAAAGTCAGGAGTTCAAGAGCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATGCAAAAAAAAAAAAAGAAATCAGCTGGGCGTAGTGATGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGCAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACTCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCTAGACTCCATCTCCAAAAAAAAAAAGAAAATTACTTCGTACGCAGTAAGCATATTAAGACATGTTTGTCATTTCCATTATCTTTTCATATCATTATTATTGTTTGTAGCATTTATTTTTTAATTTTAAGCGGCGAATAATTCCAATTCTATATTCTGAAACAACTTCAAATACTTACTTAGAAAACAAGGCACTAAAGAGTCACAGTTCAAGAACCAGTTCACAAACTGAATCTTATTGGGCTGTCTCTACATTTCTCTATCACAAAGAAAAAGCCAAATTCAAGTTCCTTTTTATATTCCCTTTATTGTTGTAATGCCAATGTAAAATCTGATTTTTAAAAGGTTGACATTAAATGTTGACTTCAATGTTAAAATAAGAATGAGACATAAAGAGTCTCCTATACAAAGAATACATTTCACTTACTTGATATAAGGTAAAGCCGGGTCTATATGGTGGAGTGTTACTGCAGTAATGTATGAAAATATGAAAGCAGCAGATGTCCAAATTACAAGGGCTGAAGGAAGGAAACTGAGGCCTTGCTGAAACCACCACATTTCTAACAGGTTTTCTGAAATAGAGAAAACATATTAGAAAAGATAATTCACAAGAGTTTCCTCATCCTACTTTAGCCATCCATGCCCACAGCCTTGTACTTACCACCCCAAGCTGTTTCACCTCTGAAATCATCCCTCATGCCATACCCCAATACTCGCTCTCCTTCCCTTTCTTAGTGAGCGCAACCAAGATTCACCCACGTGACAGAGCTAGAAACTTGCTTTCTTGTCCCATCTTCCCATGGAAAGTACCAAGTACTGTTTATACTACCTCCCAAATTTATTTCAAATCTACCCTTTTTCTCCATCTTCACTGTCACTACTTTACCCAAACCACCATCATCTCTTGGTCAATTATAACTTCCTAAGGGGTACCTGTGATATTGTGAAATACATATGTATTTGGTCTTCATCCCATTTCCTGGCAAAAAGCTCTTAAAACGCTTGGAATCTCCAGGGTAATAGGAGTGTCTTTTATATGCTAATAAGGCTTGCAGTCCATATAGTTTTAGGATGGGAGCTGGTCACAGGAAAGACCAAGGCATAATTAGAGGGTTGGACGTTCAGTCCTCCATCCCCAATTCCAGGAAGGCAGAGAGAGAGGATGAAACTTAAGTTGATCATGCCTGTGTAATGAGGCACCCATAAAAACCCAAATGGACTGGGTTCAGAGAGCTTCTAGATAGCCAAACATGCGGAGGTTCCTGAAGGATGGCATACCCAGAGAGGGCACAGAAGCTCCGTGCCCCTTTCCATATCCCTTGCCTTATGCATCTGGTAAATATAAGCATTTCCCTGAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAATTAATCAAACACAAGGATGGGGTAGTGAGAACCTTAGTTTATAGCCAGTCAGTTAGAAACATGGGTAAGACAACCCCAGCTGGTGATTGGTGTCAGAAGTTGGGAGGTAGTCTAGTGGGACTGAGCCCTCAACCAGTGCGATCTGATGCTATCTCTAGGTAGATACCATCAGAATTGAATTAGGGGATATCCAATTGGTGTCAGCTGGTGGAGAGAAATCTCCATACTTCTTGATGATCAGAGAAGTATTGTGTTGATTATTGAGTGAGAGAACAGGAAAAACACTTTGGGTGGTTTTTCTTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAGGCCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCACAGCTAACAGCAGCCTTGACCTCCCTGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAAGTAACGCACCACCATGCCCAGCTAACTTTATTATTTGTAGAGATGAGGTCTCATTATGTTGCCCAGGCTGGTATCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAAATTGCTGGAATTATAGGTATGAGCCACCCAGCCAGCCTAGTTTTTCTATTATTACTCAATCCTCCTCCAGTCTTGACCAAACCAATCTAGACTCCACTCTAAAACCAAAGTAATCCTTCTAACTTCAAAATACCAATCTGATCCCCTTATTCTCCTACAATGGTTTCCCCTATACCCTTAGTCTTTGCTCCTTAACGTGGTCCATAAGGTCCTTGCATTGTCTTGTCTTTACTTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTGTCACTGTGACACCCAGGCTGGACTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCGCTGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGCCACCACGTCCGGCTAATCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTCACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCTACCATGC
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Task1_train_1415
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting DRAM2 (DNA damage regulated autophagy modulator 2). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Retinal dystrophy
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AATAACGTTTTAATAATTATGTTTCCTTCATCTCCCTGCCCTATGTAATTTATTTAACTTTTATAGAGAAGTTTAAGTCTCAATAGCTCAGAAACCATTCATATAATTATGATTTCCTCATATCCTTTTTGTGAATGCATAAACTGATGCAACAATTCTAAAGATACATTTGGAAATGTCAAATGAAAAATGTAGATGCCCTATTACCTATCTAGCAATCTCACTTCTAGAAATCTACCTCATATCAACATCAGTATGTAAAGTTGTATGTAATGAAACCTTCATTATAGTACTGTTTGTAACAGCCAAAAAAAAGGGAAGGAAGAATAAGTAAGCAATTTCTTTATCAACATCCTATCACTTTTTATAAATGAAACAAAATAAAAAACCCAAAAAAGTGAGAAAGAACGAGAAAAAAAGAGAAAGAGTTTTGTACATACATGATAACAAGATAAACCAAACTCTGGAAGGAAATCTACCAAACTATGAATTGTCTCTAGGGTGTAGAAACTGGAAGGTGTCAGGAAGGGATTTTTGCTTTTCATTTTTATAATCACTCTAGTATTGTTTAAAATTTGTTGTAATAATTACGTTTTGCTATTGCAATTTTAAAAAAAGAGGGTTATTATAGCTTCTTGGCCTTTTGGCTAAGATCAAGTGTAAAAAAAGAGGGTTATGAACATAGTATATGCAACTGACTACCCATTCTTCATTCGTTGTGAGATTTCAAAAATGTTATCAATAAATTTTGATACTTAATACGTCAAAAATATCTAGGCAGCATAAAAAGTAAGAGCCTAGCTTCTAGAGTCAAACTGTCCAGGTTTAATTCTTGGTTCCAACACTGAGTTATTTGCCCATGAGCAAATAACTTGACCTCCCTGGACCTCATTTCCTTCTCTCTCAAATGAGGATCATAGTTTCTACCTTATCCAGTTGTTGTAAGGATTCAACTATTTAGGACATGAAGAATGCTTAGTAAATTACTTTCTACGAGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGAAGTTCAAGACTAGCCTCACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGCGTGGTGGTGTGCGCCTGTAATTCTAGTGACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGATTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTTGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACAAAGTCAGGAGTTCAAGAGCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATGCAAAAAAAAAAAAAGAAATCAGCTGGGCGTAGTGATGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGCAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACTCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCTAGACTCCATCTCCAAAAAAAAAAAGAAAATTACTTCGTACGCAGTAAGCATATTAAGACATGTTTGTCATTTCCATTATCTTTTCATATCATTATTATTGTTTGTAGCATTTATTTTTTAATTTTAAGCGGCGAATAATTCCAATTCTATATTCTGAAACAACTTCAAATACTTACTTAGAAAACAAGGCACTAAAGAGTCACAGTTCAAGAACCAGTTCACAAACTGAATCTTATTGGGCTGTCTCTACATTTCTCTATCACAAAGAAAAAGCCAAATTCAAGTTCCTTTTTATATTCCCTTTATTGTTGTAATGCCAATGTAAAATCTGATTTTTAAAAGGTTGACATTAAATGTTGACTTCAATGTTAAAATAAGAATGAGACATAAAGAGTCTCCTATACAAAGAATACATTTCACTTACCTGATATAAGGTAAAGCCGGGTCTATATGGTGGAGTGTTACTGCAGTAATGTATGAAAATATGAAAGCAGCAGATGTCCAAATTACAAGGGCTGAAGGAAGGAAACTGAGGCCTTGCTGAAACCACCACATTTCTAACAGGTTTTCTGAAATAGAGAAAACATATTAGAAAAGATAATTCACAAGAGTTTCCTCATCCTACTTTAGCCATCCATGCCCACAGCCTTGTACTTACCACCCCAAGCTGTTTCACCTCTGAAATCATCCCTCATGCCATACCCCAATACTCGCTCTCCTTCCCTTTCTTAGTGAGCGCAACCAAGATTCACCCACGTGACAGAGCTAGAAACTTGCTTTCTTGTCCCATCTTCCCATGGAAAGTACCAAGTACTGTTTATACTACCTCCCAAATTTATTTCAAATCTACCCTTTTTCTCCATCTTCACTGTCACTACTTTACCCAAACCACCATCATCTCTTGGTCAATTATAACTTCCTAAGGGGTACCTGTGATATTGTGAAATACATATGTATTTGGTCTTCATCCCATTTCCTGGCAAAAAGCTCTTAAAACGCTTGGAATCTCCAGGGTAATAGGAGTGTCTTTTATATGCTAATAAGGCTTGCAGTCCATATAGTTTTAGGATGGGAGCTGGTCACAGGAAAGACCAAGGCATAATTAGAGGGTTGGACGTTCAGTCCTCCATCCCCAATTCCAGGAAGGCAGAGAGAGAGGATGAAACTTAAGTTGATCATGCCTGTGTAATGAGGCACCCATAAAAACCCAAATGGACTGGGTTCAGAGAGCTTCTAGATAGCCAAACATGCGGAGGTTCCTGAAGGATGGCATACCCAGAGAGGGCACAGAAGCTCCGTGCCCCTTTCCATATCCCTTGCCTTATGCATCTGGTAAATATAAGCATTTCCCTGAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAATTAATCAAACACAAGGATGGGGTAGTGAGAACCTTAGTTTATAGCCAGTCAGTTAGAAACATGGGTAAGACAACCCCAGCTGGTGATTGGTGTCAGAAGTTGGGAGGTAGTCTAGTGGGACTGAGCCCTCAACCAGTGCGATCTGATGCTATCTCTAGGTAGATACCATCAGAATTGAATTAGGGGATATCCAATTGGTGTCAGCTGGTGGAGAGAAATCTCCATACTTCTTGATGATCAGAGAAGTATTGTGTTGATTATTGAGTGAGAGAACAGGAAAAACACTTTGGGTGGTTTTTCTTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAGGCCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCACAGCTAACAGCAGCCTTGACCTCCCTGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAAGTAACGCACCACCATGCCCAGCTAACTTTATTATTTGTAGAGATGAGGTCTCATTATGTTGCCCAGGCTGGTATCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAAATTGCTGGAATTATAGGTATGAGCCACCCAGCCAGCCTAGTTTTTCTATTATTACTCAATCCTCCTCCAGTCTTGACCAAACCAATCTAGACTCCACTCTAAAACCAAAGTAATCCTTCTAACTTCAAAATACCAATCTGATCCCCTTATTCTCCTACAATGGTTTCCCCTATACCCTTAGTCTTTGCTCCTTAACGTGGTCCATAAGGTCCTTGCATTGTCTTGTCTTTACTTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTGTCACTGTGACACCCAGGCTGGACTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCGCTGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGCCACCACGTCCGGCTAATCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTCACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCTACCATGCCCGGTCTGTCTTTACTTATCTTTCTATATTCACCTCTGGGCCATGCTTGGTT
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Task1_train_1416
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This genomic variant is located on Chromosome 1, within the KCND3 (potassium voltage-gated channel subfamily D member 3) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_1417
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The gene KCND3 (potassium voltage-gated channel subfamily D member 3) on Chromosome 1 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 19/22
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TGAGACCCCATCTCTAAAATAATAATAATAATAAATCAATTCCCAGGTGAAGTAAAGGTAGCTGTAGGAGCCACTGAGAACACAGCTGGAATGGGCTGTCACTGGTGTGTGCACAGCCGTGGGCTAGTGTGTGAGCTGAGGATTCCTGTGAACCTCACCTGCTCTGCCAGAAGCCTGTGTCAGCTCTAGCCCCTTGGGGGCAGGGCCACTAGAGGATCCCTGGCCCTTCAGGGTCTCTGGTTCCTGAATGTGGGAAGGAGATCCCAGTTTCTGTATAACAAATTTAGGCCCTATTCAAATTTGCTGCCTGACTTGAACAGGGAAAGAGGTAAGATTTCCATTTCTGGGATGACTGTCAGGGAACAGGAGGTAGGGAAACCCTGACCTTGGGTGAAGAGGTAGGAGATAGGTGTGTATGGGACACAAAGGATGACGGACAGAGCCAGAAGATAAATCTTAAGGTGGCAACTTAACAGACCAGGTCAGGATAAATAAAAGCAGAGGCAGAGGGGACAGCAGGGCAAGGAGCCAACCATAAAGGCACACAGAAGGTGATAGGCTGGAGGTGGGAACCAATTGGATTCACTACACAATTATATGTAAATTGTTATGTAATAATTATTATACATTTTGGAGCTAGCTTTCGTAACCTTTATAGCTTTGTGATGGTCGGCATACACAGATCTGTTCTGAAATTCTGGATTTCTTCCTCCATAACGACATTAACTTCCCTTTGAGCCTTTACACCCAAGGCAAGCCCTGCTACCTGGAGGTTATCCCTGCAAGCAGAAGGCCAGTAGCAGGGATTCTGTAGCAAGGAAAGAATCTGGCTGCAATGCATAGGGCCGACCACATAGTACGTGCTCAGTAAATGTTTGTGGAATAATGGATAAAAGAATAAAGTAAGGAGACAAAACCCCAAGCCTCCAAAAGCCAGTCTTTCAACAGTTCTCCTCCTGTCCGTTGTCCTCAGAAAGGCTCTGGCCATAACCCCTGGGGGCTGAGATGCTGCTGAAGGGGCACCACAGTTCAGCCCAGATCTGAAGACAATGAAAAACACCGCTTTCCCACTTCCCCAACACAGATATCCCTCTTCTGAGAGGAAACCTGGGGAAAGTCACTACCCAGGAACCTCACTGGCTAGATGCCTTAAAAATGCAAGTGAACAAGAGTTGGCTGAGTTGATGAGTTGTTCTAGAAACAAGATTGAGGGCTAGCTGGAAAAAGAGGCTTCTTTCTGAGCACCAAAGCCTTCAGACATTTTTCCTCATTGCATGGGCAAATGACCGTATTTTACCCTCTCCTGCCATTTTCAGCAGTGTGTATTGAACATAATCTAAATCTTTCCCCAGGACTGATGGTTAGTCTCCTGATCACCAACTGCAGTTGACTTCAGTGCCTTTGCCCTATGATATCTTGGAAATTCCTAAAGCCTGTTGTGCCATTTGTCCCTGAACTCAACGGCCTCAGGATGCTCTCCTTTCACAGTATTTATTTTTCTTTTCAACAAATTTATTTTTGCCACTGGGTTTTGTATAGGCTTTTATAGGATATTAAAAAGAGATTATGTTTCCTAGTAAGCTCTTGGCTGGGAGAGGGAGGAGTGCGGGGATGGCTGAGTGGCAGTGGCTGAGGGAGTGGAGGTGGAGCCAGGAGCCAAGGAAATTGCCAAAAAATGTCCAAAGGGGGATAATCAGCTTACAGATAATTGAGGGTTCAGTGCCTTTTGGAACTGACTGGGGCTGGAATTCAGGAGACTGGTGAGCAGGAAGGGACTGAAGCTACCTTACCTTGCAAAGCCAGAGGCCATCTGTGCAGTGATCCTGTGAGGAGCTCTAGTCCTGGCTCCCTGACTGGTGCTCCCCCGCATCCTTTACACTGCCCCCGCTTCCCTGCGTCTGAGGCTTACCTTTTGTGCCCTGCGTTTATCAGCTCTCTGATTCTGGTGGTAAATCCGGCTAAAGTTGGAAACAATCACAGGGACTGGCAGGGCAATGACCAGGACGCCACTCAAGGAGCAGATGGAGCCGAAGATCTTCCCTGCAATCGTCTTAGGCACCATGTCTCCGTATCTGAGAGAGGGAGAGAAACAGGGTGTAAGGGAGAGAGGGCCATTTGGGAAACAAGGCAGGCTTCCCTGCCAATCATTCACCTGTTTATTCATTCATTCATTCAGCAATTGCTTAGAGTATCTACTATGTGCCAGGTACTGTGACATGGACCTGGGGGTGAACAAGAGAGACAAGATCCTTATGTGCAGGGAGCCAACATCCTAACAAGACTGTAAACAATTAAGTGAATACATAAAAATATCATGTCTTTGTTGGTTCTACAAAGAGACTAGAGAGAGGTGCTGCATCAGGTGGTGGGAGTGTGGTCAGGAAAGGCCTCTCTGAGGAGCTAACATTTAAGCTGAGAGCTGAATGTAAAGGAGCCAGCCATGTAAAACACCTGGGGACAAGTGTGTGTGGTAGAGGAAACAGCAAGTACAGAGGCCTTGAAGTAGCAGGAAGGAGTTTGGCCTGATCTAGGAATTGTCAAAGGGTCAGCAGGACTGGACACCACAAGAGGAGGGTAAGGCAGGCAGGGGCCAGATCATGCAGCGTCTGACGGGCCATGGGGAGGAATATGGGTTTATCCCATTCAGTGAGGCGCCATGAGGAGTTTTAAGCAAAAGAGTAACAGAATCTCATTTATGATGATAACAACAAATAACAAACTCACCTATTCATGTAGATTTATAATTTACAAAGCACTTCTACATATTTACCTCACATAAGCCCCATGAACCCTGTGAACTTTGTATTCTTATCCCCATTGTACAGATGCAGGAACTGAGGCTGAGATAATTACATGGACTGCTCTCATTTGCTCAGCTGGGATTAAAAGCCACTCTTCTTGCTTTTGTCTATTTTCCAGTAGCCATAGCATCTCAGAGGAGGACCATGAGCTCTGAAGCTCAGCCCCTTAAAGCTGTGAAGCCACTTTGGAACTGTGCTGGCTCCTCTCAGAGCTTGGAGAAACTCTTTTAAGTACTTCACACCCTAGCAGCTGCCCTCTGGAACCAGGTTGGCCTGGATCCTACTCAGTCTTCGGCATGCAGGCCAGAGCCTCTGTCCCTCCAATCAATAAGATGCTTTCCACAGTGGTTAAGTGTTTAGTCTCCTCTTTATTGAGATAATTGAAAGGCCTTATTAAGCAAAGAGCTGTGATTACTCCTTCGGCTAAAGCCAGAAACACCATCTCCCCTGCCTCTGTGCCCTCTGGGTGTCTGGAGCAGAAACAAGCTTAGGATGACCAGGAATTGTTTCTGCTAAAATAGACTCAAAGTCATCTGTCCTGAGGAAACCACGGGGCTTGGGTTTCCAGAGAAGATGTGGAAGGGGATGGGGCAAGCTATTTCAGAAGTATGAACACCCAAGAACTTGGTGGAGGACATGGCAGAGGTAGACAGGTATTCGGTGAATGAATGAATGAATGATCTCACTTAAGCCTCTCAATTCCCTGTGAAGTAGGCTCCTGTTTTGAGACTGTCTTCCTTCTCCTTCAGTGTTCATGCCCTTTGCCCTGGCTCAAGATTTCCTGGACGTGCACTAGCATTAAGGCCTGTGCTAGAGCCTTCTAGATCTTTGCAGCTAGGGTTGTCTCCTCTGCCGTGGTACTCAGGAGAGGCCTCCAGGGAAGTGGTTGAGAACATGGATTCTGAATTTAGATAATGTGGGTTCAAGACTCACCCTGCTCCATAAAATAACCATATGATCTTGGGGGAATGTTACTCTGGGCCTTAGTTTCGTTGTCTGTAAAATGAAGATAATAACAGTAACCTAGATCATAATCCTATTGTGACATATACAGCTCCACAAACAATAGATACTATTACTTTTAGCTAGGCATTCTGAAAACCACAGTCTCTGTTGATGGGAAACTCTAAAAACACAGTTGGTTGTCCCAAGTTCAAATAGCCCCATTGATGAAGAAAAAGGGGCTGCCTCTGAGATATATCACCTTAGCTGGGATTTTCAGATGACACAACTGAAAGGGGGCCTGTGGGCACAGGGCTGTGGATGAAAATAAAGCATGGCAGGAGTGCAGAAGA
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Task1_train_1418
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The following genetic variant occurs in KCND3 (potassium voltage-gated channel subfamily D member 3) on Chromosome 1. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 19/22
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Task1_train_1419
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A genetic alteration is present in KCND3 (potassium voltage-gated channel subfamily D member 3) on Chromosome 1. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; not provided
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AAATTAGTTCTGCTCCTTATCAGCTACGTGACTATGGAAGTTTATATAGTCTCTCTGAGCCTCAGCTTCTGCATCTTTATAGGGTACAGAATTTTTTCCAACCTTGCAGGGCTGTTGTAAAAACTTAAAGAGATAATATATGCAAAGTTCTTAGTACACTGCTGACATATAGTAGACAATCATATGCTGTTATACTACTAATAAAAAGTAATGAGTAGGTGGCTATCACCATGCCTGTTTTCCTCCACATGGCTATCCTGAAGGATCTCTCTGATGTCATGAGTCCCATCAAGGGGCATCTGAGGGCACTGGGCAGTCAGAGCCACATCAGGAGCTTGACTAGAAGTGGAAGTGAGGTGTCTGGCCATGGGTGAGGTCCCCTTCAGGAAGGTGAAGGGATGGCTAGGGTCAGCCTAAAAGGGATAAAGACGACCTCTTGACAGCACAAGCTCTCCAGTCCATTTTATCTCCAAAATACCCCACTGTGCCAAAAAGCCCACATCTGCCACCTGAGCCAAGAGAAACAAGGTCAAATGACCAAACATTCTTACCCACTCTGGGTGAGCAGCCATTTGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTGGAGTGGGAGGAAGGGGCAGGGTGGTTCTGTCAGACAGATAAGAAGTAAAGGGAATGCCCCAATCAAATGTGGCCTTCACAAATGGATGGTGACACCCTTGCTCTTCCCCTTGCTACTCCCTCCCTCTTGTGTGTGGCAGAATGACAAATGTAATCATTTTAAAAGGTCTCGTCACCTGCTCAGTCATTCCCAATAAGCATACGCAGCACTATGGAAAAACCAACACTATTGCCTCTGGGTTTTGGCCAGGAAAAAAAAAAATCAAATCACCAGGACACCACCAACCACACTGTCAAAGACAAAATAAAAAGCTTCATGAATTCTCCATCAGCAATATAACGCTTCCTAGCCTAAGCAAATATAGACCCAGTATATGAATTGTGGAGGGATTTTGCATTAGGCTCCATGGTTTCTAATAGCTGAGGCAGAAACCCCTAAGAAATCTATGTTTCCATAAAGCCACCTTTATTGGCTATAATCCTGCTAGGGTGAAGACTGTAATCTCCTTCCTGAGCCCCCTTCCTCTGATGGAAAGCTTCACATCCCAGCATCATGAATACATTTCTGTGACCTCAGCTGGAGAGGAGACCTCGGAGAGACGGAATTACCATGACCTCACCGAGCACCTGTCCCTCCTTCTGATGATATTGCTGCTTCTGTGTCTGACCACATGATCCATTCAGACCATCTCACAGTCACCCAGGTCATTCAATCACTGACTCAGACTAAAAAGCAAGACTGATACTGCTTTAGAAAGAAAGAATAAACCACGTGCCTTACTGCGAAAAATCCAGGTTCAGAGTCACTTAGAGAAAGTCTGCTCAGAGCTACTGAACGCTTGAGTGTCTGTGGCAGCACAGGAGAAAAGCATAACAAATGGGAAAATGGCCTGCAAAATATACTACAAAGAAAAAATGCAGAAAGGATCCAAAAAGAGTGCTCTTGGTGTCTTCTGGTAATGGACATCTGAACCCTCCGAACTTCTCAACAGTCTCCTCCCTCCCCAACAACTGCCCTGACCTTCTCCCCACGCTGCCCCATATGCGCAAATGCATATACAAATGCAGACATCACCTCACCCCGAGACTTCACACGCACACAAGGCATGGCTGAAAAAAGAATTGGTGACTTAATTTTCTTAGCTCTATAAAACACATGCCCCGACCTCAAAAAGAAAACTCAATTCCCAGCAAGCTACCACCCCCAAACAGATGACTCATGGGCTTTACCCTTCGGATAGAGCAACTTCCCCTGCCCCCAACACTTGGGTAAGGGACTCCCTCCTCCTCTACCCATGGTGACACCATCCAAGGTTTCAGAGGTCATCCAGCTGCCCTCCAACCTCCGTCCTGGTTTCATCCACCAGCGCTGACTTACCCCAGTGTGGTCATGGTGACAATGGTGTACCAAAACGAGGCAGGGATGCTTGTGAACTTGCTGGCCGAGGAGCCCTTCTCGGCATAAAACATCACAGTGGCAAAGATGATGATGGCCATGGTGAGGGAGAAGAGAAGAAAGCCCAGTTCGGAGGCACAGCTCTTCAGTGTGTAGCCCAGGATCCGCAGGCCCTGGGAGTGGCGGGAAAACTTGAAGATCCTGAAGACGCGGAAGACCCGGAGCGTGACGAAGGCGCCGGACACGTCCTCGTTGTTGGTCATGACCAGACCGATGTAGTAGGGCATGATGGCCACCACGTCGATGATGCTCATGACGCTGCGGATGAAGCGGTAGCGGCTGGGAGCCGCGAAGAGCCGCAGGAGGTACTCCACGGTGAAGATCATGACGCACGCCGTGTCCAGGCAGAAGAAGGCCACCGAGTAGCGCTCCCCGCACGGCAGCTCCTTGCTGCCCGGGACCGTGCCGCACGGCACCGTCTCCACCACGTTGGTGATGACCGAGACAGCGATGAAGAAGCCAGTCACGTAGTAGAAGACCAGGGCCAGCGTGCTGGTGTGGGGGTTCTCGAAGGCCCGCCACATGGTCTGGCGGAAGCTGAGCGAGGGCATGGACTCCTGGTTGTTCTCCGAGTCGTTGTCGTCCATGAGCCGCTCGGCGTTCTCCCTCTTGCGGTCCTTGTACTCCTCGTAGCAGCAGTCCCCGATGATCTCCGGGAGGATGCCGTAGAAGGCCAGCTCGTCGTCGTAGGCAGAGATGCACTCGTAGCGCGGGTAGTGCAGCTTCCCCGTGCGGTAGAAGTTGAGCACGCAGCGGAACACCTCGGGGTCCCGGTCGAAGAAGTACTCCTTGGTGTCCTCGTTGAAGAAGAACTCCTTCTCCGTGCTGCCCAGCAGGGTGTCCGGGTAGCGCTCCAGCGTGGTCCTCCAGGTCTGGAACCTCCGCCCACTCACGTTGAGGACAATCAGCTCATCCTGCCGCTTGTTCTTGTCGGCCGGGGCCAGGGGCATGGGGCAGTTGGCCACCGGCATCCACCCGATGGCCGCAGCCCGGGCAAAAGGCAGCCAGGCCGCAACTCCGGCCGCCATGGTGACTCCAGCTCTTGGGCCGGCAGCCGCGCGGACGCTAGGCACACCAGCTTGGAGTTAGTTCAGCAAACCCTGGGAGACAGGAGGGGAGAGAGAGAAGCGGTGAGTCCATATCGACTGGCAGGTAAGAAATGGGACACAGGAAAGGATCACTGGTGAGTGAAACGGCCAAAGTCTCCAGGGCAGATTAATAAAACTGAAATCCCCACCACAGAGAGGGGACTTGATTCTTTGCCATCCAGACACTGGGAGAACACCTAGCTCCTGGAGCTCGGCAGGGTGGGATCGCCAGATGTTGCTGACTGCCTGACAAATCGTCAAGCTCCAAGAGGGCTCAAGAGCATTTGGAGGGAAGGCCTCTTTAGCAGGAAGATCTGGCAAGACGTGGGTAATAATCAGCTCTGAAAGGTTATGGCGTTATTACCAATTTAAATTGGGAGAGGGTAGATGAGTTCTCATTAAATGAATTTAAAAGTGGGATAAACATGCTAATTTTTATTTCACTCTTTCACCCACTGGGGTAATCAGGAACGGGGTGTAGATGAGTGAGATCAGGTAAACAATTCTTTCTACTCCTCCCTAGTGAGGAAGAGGCTGGGGCTGCCCAAGTCCAGAAAATTCTCTGAGATGGCAGGTGACCACCAGGATTGGTGAGGTTCTGTCCCCAACTCCCATGGAGAAGGCTCTCCCTGGCAAAGTGCTACTCTGAGGGACACTTAGCCCCTACTCCTTGCCCTAGCAACCTAGTATCAAATTTTTCCCCTCAGACCCTCAGAGCCATGATGGAAAGACGTGGGAAGGGTTGTGAGGCTGGGCAGGGTCTCTTTCCCTGCTCTGTGAAGGGCGTCTTGGCTTCTTGGTTCACCTGACTTCCATGCATCGTCTCTCTCCCTCCCCAGAAGAAGCCGATCCGCGCTCACTGCCGTCCCTAGATTCCTCTCCTCCCATCTCCATCTGCCCACCATCCATAACTCCCTCAGGTTATATAACAACA
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Task1_train_1420
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Gene KCND3 (potassium voltage-gated channel subfamily D member 3), found on Chromosome 1, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 19/22
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CAGCTACGTGACTATGGAAGTTTATATAGTCTCTCTGAGCCTCAGCTTCTGCATCTTTATAGGGTACAGAATTTTTTCCAACCTTGCAGGGCTGTTGTAAAAACTTAAAGAGATAATATATGCAAAGTTCTTAGTACACTGCTGACATATAGTAGACAATCATATGCTGTTATACTACTAATAAAAAGTAATGAGTAGGTGGCTATCACCATGCCTGTTTTCCTCCACATGGCTATCCTGAAGGATCTCTCTGATGTCATGAGTCCCATCAAGGGGCATCTGAGGGCACTGGGCAGTCAGAGCCACATCAGGAGCTTGACTAGAAGTGGAAGTGAGGTGTCTGGCCATGGGTGAGGTCCCCTTCAGGAAGGTGAAGGGATGGCTAGGGTCAGCCTAAAAGGGATAAAGACGACCTCTTGACAGCACAAGCTCTCCAGTCCATTTTATCTCCAAAATACCCCACTGTGCCAAAAAGCCCACATCTGCCACCTGAGCCAAGAGAAACAAGGTCAAATGACCAAACATTCTTACCCACTCTGGGTGAGCAGCCATTTGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTGGAGTGGGAGGAAGGGGCAGGGTGGTTCTGTCAGACAGATAAGAAGTAAAGGGAATGCCCCAATCAAATGTGGCCTTCACAAATGGATGGTGACACCCTTGCTCTTCCCCTTGCTACTCCCTCCCTCTTGTGTGTGGCAGAATGACAAATGTAATCATTTTAAAAGGTCTCGTCACCTGCTCAGTCATTCCCAATAAGCATACGCAGCACTATGGAAAAACCAACACTATTGCCTCTGGGTTTTGGCCAGGAAAAAAAAAAATCAAATCACCAGGACACCACCAACCACACTGTCAAAGACAAAATAAAAAGCTTCATGAATTCTCCATCAGCAATATAACGCTTCCTAGCCTAAGCAAATATAGACCCAGTATATGAATTGTGGAGGGATTTTGCATTAGGCTCCATGGTTTCTAATAGCTGAGGCAGAAACCCCTAAGAAATCTATGTTTCCATAAAGCCACCTTTATTGGCTATAATCCTGCTAGGGTGAAGACTGTAATCTCCTTCCTGAGCCCCCTTCCTCTGATGGAAAGCTTCACATCCCAGCATCATGAATACATTTCTGTGACCTCAGCTGGAGAGGAGACCTCGGAGAGACGGAATTACCATGACCTCACCGAGCACCTGTCCCTCCTTCTGATGATATTGCTGCTTCTGTGTCTGACCACATGATCCATTCAGACCATCTCACAGTCACCCAGGTCATTCAATCACTGACTCAGACTAAAAAGCAAGACTGATACTGCTTTAGAAAGAAAGAATAAACCACGTGCCTTACTGCGAAAAATCCAGGTTCAGAGTCACTTAGAGAAAGTCTGCTCAGAGCTACTGAACGCTTGAGTGTCTGTGGCAGCACAGGAGAAAAGCATAACAAATGGGAAAATGGCCTGCAAAATATACTACAAAGAAAAAATGCAGAAAGGATCCAAAAAGAGTGCTCTTGGTGTCTTCTGGTAATGGACATCTGAACCCTCCGAACTTCTCAACAGTCTCCTCCCTCCCCAACAACTGCCCTGACCTTCTCCCCACGCTGCCCCATATGCGCAAATGCATATACAAATGCAGACATCACCTCACCCCGAGACTTCACACGCACACAAGGCATGGCTGAAAAAAGAATTGGTGACTTAATTTTCTTAGCTCTATAAAACACATGCCCCGACCTCAAAAAGAAAACTCAATTCCCAGCAAGCTACCACCCCCAAACAGATGACTCATGGGCTTTACCCTTCGGATAGAGCAACTTCCCCTGCCCCCAACACTTGGGTAAGGGACTCCCTCCTCCTCTACCCATGGTGACACCATCCAAGGTTTCAGAGGTCATCCAGCTGCCCTCCAACCTCCGTCCTGGTTTCATCCACCAGCGCTGACTTACCCCAGTGTGGTCATGGTGACAATGGTGTACCAAAACGAGGCAGGGATGCTTGTGAACTTGCTGGCCGAGGAGCCCTTCTCGGCATAAAACATCACAGTGGCAAAGATGATGATGGCCATGGTGAGGGAGAAGAGAAGAAAGCCCAGTTCGGAGGCACAGCTCTTCAGTGTGTAGCCCAGGATCCGCAGGCCCTGGGAGTGGCGGGAAAACTTGAAGATCCTGAAGACGCGGAAGACCCGGAGCGTGACGAAGGCGCCGGACACGTCCTCGTTGTTGGTCATGACCAGACCGATGTAGTAGGGCATGATGGCCACCACGTCGATGATGCTCATGACGCTGCGGATGAAGCGGTAGCGGCTGGGAGCCGCGAAGAGCCGCAGGAGGTACTCCACGGTGAAGATCATGACGCACGCCGTGTCCAGGCAGAAGAAGGCCACCGAGTAGCGCTCCCCGCACGGCAGCTCCTTGCTGCCCGGGACCGTGCCGCACGGCACCGTCTCCACCACGTTGGTGATGACCGAGACAGCGATGAAGAAGCCAGTCACGTAGTAGAAGACCAGGGCCAGCGTGCTGGTGTGGGGGTTCTCGAAGGCCCGCCACATGGTCTGGCGGAAGCTGAGCGAGGGCATGGACTCCTGGTTGTTCTCCGAGTCGTTGTCGTCCATGAGCCGCTCGGCGTTCTCCCTCTTGCGGTCCTTGTACTCCTCGTAGCAGCAGTCCCCGATGATCTCCGGGAGGATGCCGTAGAAGGCCAGCTCGTCGTCGTAGGCAGAGATGCACTCGTAGCGCGGGTAGTGCAGCTTCCCCGTGCGGTAGAAGTTGAGCACGCAGCGGAACACCTCGGGGTCCCGGTCGAAGAAGTACTCCTTGGTGTCCTCGTTGAAGAAGAACTCCTTCTCCGTGCTGCCCAGCAGGGTGTCCGGGTAGCGCTCCAGCGTGGTCCTCCAGGTCTGGAACCTCCGCCCACTCACGTTGAGGACAATCAGCTCATCCTGCCGCTTGTTCTTGTCGGCCGGGGCCAGGGGCATGGGGCAGTTGGCCACCGGCATCCACCCGATGGCCGCAGCCCGGGCAAAAGGCAGCCAGGCCGCAACTCCGGCCGCCATGGTGACTCCAGCTCTTGGGCCGGCAGCCGCGCGGACGCTAGGCACACCAGCTTGGAGTTAGTTCAGCAAACCCTGGGAGACAGGAGGGGAGAGAGAGAAGCGGTGAGTCCATATCGACTGGCAGGTAAGAAATGGGACACAGGAAAGGATCACTGGTGAGTGAAACGGCCAAAGTCTCCAGGGCAGATTAATAAAACTGAAATCCCCACCACAGAGAGGGGACTTGATTCTTTGCCATCCAGACACTGGGAGAACACCTAGCTCCTGGAGCTCGGCAGGGTGGGATCGCCAGATGTTGCTGACTGCCTGACAAATCGTCAAGCTCCAAGAGGGCTCAAGAGCATTTGGAGGGAAGGCCTCTTTAGCAGGAAGATCTGGCAAGACGTGGGTAATAATCAGCTCTGAAAGGTTATGGCGTTATTACCAATTTAAATTGGGAGAGGGTAGATGAGTTCTCATTAAATGAATTTAAAAGTGGGATAAACATGCTAATTTTTATTTCACTCTTTCACCCACTGGGGTAATCAGGAACGGGGTGTAGATGAGTGAGATCAGGTAAACAATTCTTTCTACTCCTCCCTAGTGAGGAAGAGGCTGGGGCTGCCCAAGTCCAGAAAATTCTCTGAGATGGCAGGTGACCACCAGGATTGGTGAGGTTCTGTCCCCAACTCCCATGGAGAAGGCTCTCCCTGGCAAAGTGCTACTCTGAGGGACACTTAGCCCCTACTCCTTGCCCTAGCAACCTAGTATCAAATTTTTCCCCTCAGACCCTCAGAGCCATGATGGAAAGACGTGGGAAGGGTTGTGAGGCTGGGCAGGGTCTCTTTCCCTGCTCTGTGAAGGGCGTCTTGGCTTCTTGGTTCACCTGACTTCCATGCATCGTCTCTCTCCCTCCCCAGAAGAAGCCGATCCGCGCTCACTGCCGTCCCTAGATTCCTCTCCTCCCATCTCCATCTGCCCACCATCCATAACTCCCTCAGGTTATATAACAACACTCCTTCCCATACCAGCCTC
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CAGCTACGTGACTATGGAAGTTTATATAGTCTCTCTGAGCCTCAGCTTCTGCATCTTTATAGGGTACAGAATTTTTTCCAACCTTGCAGGGCTGTTGTAAAAACTTAAAGAGATAATATATGCAAAGTTCTTAGTACACTGCTGACATATAGTAGACAATCATATGCTGTTATACTACTAATAAAAAGTAATGAGTAGGTGGCTATCACCATGCCTGTTTTCCTCCACATGGCTATCCTGAAGGATCTCTCTGATGTCATGAGTCCCATCAAGGGGCATCTGAGGGCACTGGGCAGTCAGAGCCACATCAGGAGCTTGACTAGAAGTGGAAGTGAGGTGTCTGGCCATGGGTGAGGTCCCCTTCAGGAAGGTGAAGGGATGGCTAGGGTCAGCCTAAAAGGGATAAAGACGACCTCTTGACAGCACAAGCTCTCCAGTCCATTTTATCTCCAAAATACCCCACTGTGCCAAAAAGCCCACATCTGCCACCTGAGCCAAGAGAAACAAGGTCAAATGACCAAACATTCTTACCCACTCTGGGTGAGCAGCCATTTGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTGGAGTGGGAGGAAGGGGCAGGGTGGTTCTGTCAGACAGATAAGAAGTAAAGGGAATGCCCCAATCAAATGTGGCCTTCACAAATGGATGGTGACACCCTTGCTCTTCCCCTTGCTACTCCCTCCCTCTTGTGTGTGGCAGAATGACAAATGTAATCATTTTAAAAGGTCTCGTCACCTGCTCAGTCATTCCCAATAAGCATACGCAGCACTATGGAAAAACCAACACTATTGCCTCTGGGTTTTGGCCAGGAAAAAAAAAAATCAAATCACCAGGACACCACCAACCACACTGTCAAAGACAAAATAAAAAGCTTCATGAATTCTCCATCAGCAATATAACGCTTCCTAGCCTAAGCAAATATAGACCCAGTATATGAATTGTGGAGGGATTTTGCATTAGGCTCCATGGTTTCTAATAGCTGAGGCAGAAACCCCTAAGAAATCTATGTTTCCATAAAGCCACCTTTATTGGCTATAATCCTGCTAGGGTGAAGACTGTAATCTCCTTCCTGAGCCCCCTTCCTCTGATGGAAAGCTTCACATCCCAGCATCATGAATACATTTCTGTGACCTCAGCTGGAGAGGAGACCTCGGAGAGACGGAATTACCATGACCTCACCGAGCACCTGTCCCTCCTTCTGATGATATTGCTGCTTCTGTGTCTGACCACATGATCCATTCAGACCATCTCACAGTCACCCAGGTCATTCAATCACTGACTCAGACTAAAAAGCAAGACTGATACTGCTTTAGAAAGAAAGAATAAACCACGTGCCTTACTGCGAAAAATCCAGGTTCAGAGTCACTTAGAGAAAGTCTGCTCAGAGCTACTGAACGCTTGAGTGTCTGTGGCAGCACAGGAGAAAAGCATAACAAATGGGAAAATGGCCTGCAAAATATACTACAAAGAAAAAATGCAGAAAGGATCCAAAAAGAGTGCTCTTGGTGTCTTCTGGTAATGGACATCTGAACCCTCCGAACTTCTCAACAGTCTCCTCCCTCCCCAACAACTGCCCTGACCTTCTCCCCACGCTGCCCCATATGCGCAAATGCATATACAAATGCAGACATCACCTCACCCCGAGACTTCACACGCACACAAGGCATGGCTGAAAAAAGAATTGGTGACTTAATTTTCTTAGCTCTATAAAACACATGCCCCGACCTCAAAAAGAAAACTCAATTCCCAGCAAGCTACCACCCCCAAACAGATGACTCATGGGCTTTACCCTTCGGATAGAGCAACTTCCCCTGCCCCCAACACTTGGGTAAGGGACTCCCTCCTCCTCTACCCATGGTGACACCATCCAAGGTTTCAGAGGTCATCCAGCTGCCCTCCAACCTCCGTCCTGGTTTCATCCACCAGCGCTGACTTACCCCAGTGTGGTCATGGTGACAATGGTGTACCAAAACGAGGCAGGGATGCTTGTGAACTTGCTGGCCGAGGAGACCTTCTCGGCATAAAACATCACAGTGGCAAAGATGATGATGGCCATGGTGAGGGAGAAGAGAAGAAAGCCCAGTTCGGAGGCACAGCTCTTCAGTGTGTAGCCCAGGATCCGCAGGCCCTGGGAGTGGCGGGAAAACTTGAAGATCCTGAAGACGCGGAAGACCCGGAGCGTGACGAAGGCGCCGGACACGTCCTCGTTGTTGGTCATGACCAGACCGATGTAGTAGGGCATGATGGCCACCACGTCGATGATGCTCATGACGCTGCGGATGAAGCGGTAGCGGCTGGGAGCCGCGAAGAGCCGCAGGAGGTACTCCACGGTGAAGATCATGACGCACGCCGTGTCCAGGCAGAAGAAGGCCACCGAGTAGCGCTCCCCGCACGGCAGCTCCTTGCTGCCCGGGACCGTGCCGCACGGCACCGTCTCCACCACGTTGGTGATGACCGAGACAGCGATGAAGAAGCCAGTCACGTAGTAGAAGACCAGGGCCAGCGTGCTGGTGTGGGGGTTCTCGAAGGCCCGCCACATGGTCTGGCGGAAGCTGAGCGAGGGCATGGACTCCTGGTTGTTCTCCGAGTCGTTGTCGTCCATGAGCCGCTCGGCGTTCTCCCTCTTGCGGTCCTTGTACTCCTCGTAGCAGCAGTCCCCGATGATCTCCGGGAGGATGCCGTAGAAGGCCAGCTCGTCGTCGTAGGCAGAGATGCACTCGTAGCGCGGGTAGTGCAGCTTCCCCGTGCGGTAGAAGTTGAGCACGCAGCGGAACACCTCGGGGTCCCGGTCGAAGAAGTACTCCTTGGTGTCCTCGTTGAAGAAGAACTCCTTCTCCGTGCTGCCCAGCAGGGTGTCCGGGTAGCGCTCCAGCGTGGTCCTCCAGGTCTGGAACCTCCGCCCACTCACGTTGAGGACAATCAGCTCATCCTGCCGCTTGTTCTTGTCGGCCGGGGCCAGGGGCATGGGGCAGTTGGCCACCGGCATCCACCCGATGGCCGCAGCCCGGGCAAAAGGCAGCCAGGCCGCAACTCCGGCCGCCATGGTGACTCCAGCTCTTGGGCCGGCAGCCGCGCGGACGCTAGGCACACCAGCTTGGAGTTAGTTCAGCAAACCCTGGGAGACAGGAGGGGAGAGAGAGAAGCGGTGAGTCCATATCGACTGGCAGGTAAGAAATGGGACACAGGAAAGGATCACTGGTGAGTGAAACGGCCAAAGTCTCCAGGGCAGATTAATAAAACTGAAATCCCCACCACAGAGAGGGGACTTGATTCTTTGCCATCCAGACACTGGGAGAACACCTAGCTCCTGGAGCTCGGCAGGGTGGGATCGCCAGATGTTGCTGACTGCCTGACAAATCGTCAAGCTCCAAGAGGGCTCAAGAGCATTTGGAGGGAAGGCCTCTTTAGCAGGAAGATCTGGCAAGACGTGGGTAATAATCAGCTCTGAAAGGTTATGGCGTTATTACCAATTTAAATTGGGAGAGGGTAGATGAGTTCTCATTAAATGAATTTAAAAGTGGGATAAACATGCTAATTTTTATTTCACTCTTTCACCCACTGGGGTAATCAGGAACGGGGTGTAGATGAGTGAGATCAGGTAAACAATTCTTTCTACTCCTCCCTAGTGAGGAAGAGGCTGGGGCTGCCCAAGTCCAGAAAATTCTCTGAGATGGCAGGTGACCACCAGGATTGGTGAGGTTCTGTCCCCAACTCCCATGGAGAAGGCTCTCCCTGGCAAAGTGCTACTCTGAGGGACACTTAGCCCCTACTCCTTGCCCTAGCAACCTAGTATCAAATTTTTCCCCTCAGACCCTCAGAGCCATGATGGAAAGACGTGGGAAGGGTTGTGAGGCTGGGCAGGGTCTCTTTCCCTGCTCTGTGAAGGGCGTCTTGGCTTCTTGGTTCACCTGACTTCCATGCATCGTCTCTCTCCCTCCCCAGAAGAAGCCGATCCGCGCTCACTGCCGTCCCTAGATTCCTCTCCTCCCATCTCCATCTGCCCACCATCCATAACTCCCTCAGGTTATATAACAACACTCCTTCCCATACCAGCCTC
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Task1_train_1421
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The following genetic variant occurs in KCND3 (potassium voltage-gated channel subfamily D member 3) on Chromosome 1. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 19/22
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TTATATAGTCTCTCTGAGCCTCAGCTTCTGCATCTTTATAGGGTACAGAATTTTTTCCAACCTTGCAGGGCTGTTGTAAAAACTTAAAGAGATAATATATGCAAAGTTCTTAGTACACTGCTGACATATAGTAGACAATCATATGCTGTTATACTACTAATAAAAAGTAATGAGTAGGTGGCTATCACCATGCCTGTTTTCCTCCACATGGCTATCCTGAAGGATCTCTCTGATGTCATGAGTCCCATCAAGGGGCATCTGAGGGCACTGGGCAGTCAGAGCCACATCAGGAGCTTGACTAGAAGTGGAAGTGAGGTGTCTGGCCATGGGTGAGGTCCCCTTCAGGAAGGTGAAGGGATGGCTAGGGTCAGCCTAAAAGGGATAAAGACGACCTCTTGACAGCACAAGCTCTCCAGTCCATTTTATCTCCAAAATACCCCACTGTGCCAAAAAGCCCACATCTGCCACCTGAGCCAAGAGAAACAAGGTCAAATGACCAAACATTCTTACCCACTCTGGGTGAGCAGCCATTTGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTGGAGTGGGAGGAAGGGGCAGGGTGGTTCTGTCAGACAGATAAGAAGTAAAGGGAATGCCCCAATCAAATGTGGCCTTCACAAATGGATGGTGACACCCTTGCTCTTCCCCTTGCTACTCCCTCCCTCTTGTGTGTGGCAGAATGACAAATGTAATCATTTTAAAAGGTCTCGTCACCTGCTCAGTCATTCCCAATAAGCATACGCAGCACTATGGAAAAACCAACACTATTGCCTCTGGGTTTTGGCCAGGAAAAAAAAAAATCAAATCACCAGGACACCACCAACCACACTGTCAAAGACAAAATAAAAAGCTTCATGAATTCTCCATCAGCAATATAACGCTTCCTAGCCTAAGCAAATATAGACCCAGTATATGAATTGTGGAGGGATTTTGCATTAGGCTCCATGGTTTCTAATAGCTGAGGCAGAAACCCCTAAGAAATCTATGTTTCCATAAAGCCACCTTTATTGGCTATAATCCTGCTAGGGTGAAGACTGTAATCTCCTTCCTGAGCCCCCTTCCTCTGATGGAAAGCTTCACATCCCAGCATCATGAATACATTTCTGTGACCTCAGCTGGAGAGGAGACCTCGGAGAGACGGAATTACCATGACCTCACCGAGCACCTGTCCCTCCTTCTGATGATATTGCTGCTTCTGTGTCTGACCACATGATCCATTCAGACCATCTCACAGTCACCCAGGTCATTCAATCACTGACTCAGACTAAAAAGCAAGACTGATACTGCTTTAGAAAGAAAGAATAAACCACGTGCCTTACTGCGAAAAATCCAGGTTCAGAGTCACTTAGAGAAAGTCTGCTCAGAGCTACTGAACGCTTGAGTGTCTGTGGCAGCACAGGAGAAAAGCATAACAAATGGGAAAATGGCCTGCAAAATATACTACAAAGAAAAAATGCAGAAAGGATCCAAAAAGAGTGCTCTTGGTGTCTTCTGGTAATGGACATCTGAACCCTCCGAACTTCTCAACAGTCTCCTCCCTCCCCAACAACTGCCCTGACCTTCTCCCCACGCTGCCCCATATGCGCAAATGCATATACAAATGCAGACATCACCTCACCCCGAGACTTCACACGCACACAAGGCATGGCTGAAAAAAGAATTGGTGACTTAATTTTCTTAGCTCTATAAAACACATGCCCCGACCTCAAAAAGAAAACTCAATTCCCAGCAAGCTACCACCCCCAAACAGATGACTCATGGGCTTTACCCTTCGGATAGAGCAACTTCCCCTGCCCCCAACACTTGGGTAAGGGACTCCCTCCTCCTCTACCCATGGTGACACCATCCAAGGTTTCAGAGGTCATCCAGCTGCCCTCCAACCTCCGTCCTGGTTTCATCCACCAGCGCTGACTTACCCCAGTGTGGTCATGGTGACAATGGTGTACCAAAACGAGGCAGGGATGCTTGTGAACTTGCTGGCCGAGGAGCCCTTCTCGGCATAAAACATCACAGTGGCAAAGATGATGATGGCCATGGTGAGGGAGAAGAGAAGAAAGCCCAGTTCGGAGGCACAGCTCTTCAGTGTGTAGCCCAGGATCCGCAGGCCCTGGGAGTGGCGGGAAAACTTGAAGATCCTGAAGACGCGGAAGACCCGGAGCGTGACGAAGGCGCCGGACACGTCCTCGTTGTTGGTCATGACCAGACCGATGTAGTAGGGCATGATGGCCACCACGTCGATGATGCTCATGACGCTGCGGATGAAGCGGTAGCGGCTGGGAGCCGCGAAGAGCCGCAGGAGGTACTCCACGGTGAAGATCATGACGCACGCCGTGTCCAGGCAGAAGAAGGCCACCGAGTAGCGCTCCCCGCACGGCAGCTCCTTGCTGCCCGGGACCGTGCCGCACGGCACCGTCTCCACCACGTTGGTGATGACCGAGACAGCGATGAAGAAGCCAGTCACGTAGTAGAAGACCAGGGCCAGCGTGCTGGTGTGGGGGTTCTCGAAGGCCCGCCACATGGTCTGGCGGAAGCTGAGCGAGGGCATGGACTCCTGGTTGTTCTCCGAGTCGTTGTCGTCCATGAGCCGCTCGGCGTTCTCCCTCTTGCGGTCCTTGTACTCCTCGTAGCAGCAGTCCCCGATGATCTCCGGGAGGATGCCGTAGAAGGCCAGCTCGTCGTCGTAGGCAGAGATGCACTCGTAGCGCGGGTAGTGCAGCTTCCCCGTGCGGTAGAAGTTGAGCACGCAGCGGAACACCTCGGGGTCCCGGTCGAAGAAGTACTCCTTGGTGTCCTCGTTGAAGAAGAACTCCTTCTCCGTGCTGCCCAGCAGGGTGTCCGGGTAGCGCTCCAGCGTGGTCCTCCAGGTCTGGAACCTCCGCCCACTCACGTTGAGGACAATCAGCTCATCCTGCCGCTTGTTCTTGTCGGCCGGGGCCAGGGGCATGGGGCAGTTGGCCACCGGCATCCACCCGATGGCCGCAGCCCGGGCAAAAGGCAGCCAGGCCGCAACTCCGGCCGCCATGGTGACTCCAGCTCTTGGGCCGGCAGCCGCGCGGACGCTAGGCACACCAGCTTGGAGTTAGTTCAGCAAACCCTGGGAGACAGGAGGGGAGAGAGAGAAGCGGTGAGTCCATATCGACTGGCAGGTAAGAAATGGGACACAGGAAAGGATCACTGGTGAGTGAAACGGCCAAAGTCTCCAGGGCAGATTAATAAAACTGAAATCCCCACCACAGAGAGGGGACTTGATTCTTTGCCATCCAGACACTGGGAGAACACCTAGCTCCTGGAGCTCGGCAGGGTGGGATCGCCAGATGTTGCTGACTGCCTGACAAATCGTCAAGCTCCAAGAGGGCTCAAGAGCATTTGGAGGGAAGGCCTCTTTAGCAGGAAGATCTGGCAAGACGTGGGTAATAATCAGCTCTGAAAGGTTATGGCGTTATTACCAATTTAAATTGGGAGAGGGTAGATGAGTTCTCATTAAATGAATTTAAAAGTGGGATAAACATGCTAATTTTTATTTCACTCTTTCACCCACTGGGGTAATCAGGAACGGGGTGTAGATGAGTGAGATCAGGTAAACAATTCTTTCTACTCCTCCCTAGTGAGGAAGAGGCTGGGGCTGCCCAAGTCCAGAAAATTCTCTGAGATGGCAGGTGACCACCAGGATTGGTGAGGTTCTGTCCCCAACTCCCATGGAGAAGGCTCTCCCTGGCAAAGTGCTACTCTGAGGGACACTTAGCCCCTACTCCTTGCCCTAGCAACCTAGTATCAAATTTTTCCCCTCAGACCCTCAGAGCCATGATGGAAAGACGTGGGAAGGGTTGTGAGGCTGGGCAGGGTCTCTTTCCCTGCTCTGTGAAGGGCGTCTTGGCTTCTTGGTTCACCTGACTTCCATGCATCGTCTCTCTCCCTCCCCAGAAGAAGCCGATCCGCGCTCACTGCCGTCCCTAGATTCCTCTCCTCCCATCTCCATCTGCCCACCATCCATAACTCCCTCAGGTTATATAACAACACTCCTTCCCATACCAGCCTCTCTCACCTGGTCCCCACTCCA
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TTATATAGTCTCTCTGAGCCTCAGCTTCTGCATCTTTATAGGGTACAGAATTTTTTCCAACCTTGCAGGGCTGTTGTAAAAACTTAAAGAGATAATATATGCAAAGTTCTTAGTACACTGCTGACATATAGTAGACAATCATATGCTGTTATACTACTAATAAAAAGTAATGAGTAGGTGGCTATCACCATGCCTGTTTTCCTCCACATGGCTATCCTGAAGGATCTCTCTGATGTCATGAGTCCCATCAAGGGGCATCTGAGGGCACTGGGCAGTCAGAGCCACATCAGGAGCTTGACTAGAAGTGGAAGTGAGGTGTCTGGCCATGGGTGAGGTCCCCTTCAGGAAGGTGAAGGGATGGCTAGGGTCAGCCTAAAAGGGATAAAGACGACCTCTTGACAGCACAAGCTCTCCAGTCCATTTTATCTCCAAAATACCCCACTGTGCCAAAAAGCCCACATCTGCCACCTGAGCCAAGAGAAACAAGGTCAAATGACCAAACATTCTTACCCACTCTGGGTGAGCAGCCATTTGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTGGAGTGGGAGGAAGGGGCAGGGTGGTTCTGTCAGACAGATAAGAAGTAAAGGGAATGCCCCAATCAAATGTGGCCTTCACAAATGGATGGTGACACCCTTGCTCTTCCCCTTGCTACTCCCTCCCTCTTGTGTGTGGCAGAATGACAAATGTAATCATTTTAAAAGGTCTCGTCACCTGCTCAGTCATTCCCAATAAGCATACGCAGCACTATGGAAAAACCAACACTATTGCCTCTGGGTTTTGGCCAGGAAAAAAAAAAATCAAATCACCAGGACACCACCAACCACACTGTCAAAGACAAAATAAAAAGCTTCATGAATTCTCCATCAGCAATATAACGCTTCCTAGCCTAAGCAAATATAGACCCAGTATATGAATTGTGGAGGGATTTTGCATTAGGCTCCATGGTTTCTAATAGCTGAGGCAGAAACCCCTAAGAAATCTATGTTTCCATAAAGCCACCTTTATTGGCTATAATCCTGCTAGGGTGAAGACTGTAATCTCCTTCCTGAGCCCCCTTCCTCTGATGGAAAGCTTCACATCCCAGCATCATGAATACATTTCTGTGACCTCAGCTGGAGAGGAGACCTCGGAGAGACGGAATTACCATGACCTCACCGAGCACCTGTCCCTCCTTCTGATGATATTGCTGCTTCTGTGTCTGACCACATGATCCATTCAGACCATCTCACAGTCACCCAGGTCATTCAATCACTGACTCAGACTAAAAAGCAAGACTGATACTGCTTTAGAAAGAAAGAATAAACCACGTGCCTTACTGCGAAAAATCCAGGTTCAGAGTCACTTAGAGAAAGTCTGCTCAGAGCTACTGAACGCTTGAGTGTCTGTGGCAGCACAGGAGAAAAGCATAACAAATGGGAAAATGGCCTGCAAAATATACTACAAAGAAAAAATGCAGAAAGGATCCAAAAAGAGTGCTCTTGGTGTCTTCTGGTAATGGACATCTGAACCCTCCGAACTTCTCAACAGTCTCCTCCCTCCCCAACAACTGCCCTGACCTTCTCCCCACGCTGCCCCATATGCGCAAATGCATATACAAATGCAGACATCACCTCACCCCGAGACTTCACACGCACACAAGGCATGGCTGAAAAAAGAATTGGTGACTTAATTTTCTTAGCTCTATAAAACACATGCCCCGACCTCAAAAAGAAAACTCAATTCCCAGCAAGCTACCACCCCCAAACAGATGACTCATGGGCTTTACCCTTCGGATAGAGCAACTTCCCCTGCCCCCAACACTTGGGTAAGGGACTCCCTCCTCCTCTACCCATGGTGACACCATCCAAGGTTTCAGAGGTCATCCAGCTGCCCTCCAACCTCCGTCCTGGTTTCATCCACCAGCGCTGACTTACCCCAGTGTGGTCATGGTGACAATGGTGTACCAAAACGAGGCAGGGATGCTTGTGAACTTGCTGGCCGAGGAGCCCTTCTCGGCATAAAACATCTCAGTGGCAAAGATGATGATGGCCATGGTGAGGGAGAAGAGAAGAAAGCCCAGTTCGGAGGCACAGCTCTTCAGTGTGTAGCCCAGGATCCGCAGGCCCTGGGAGTGGCGGGAAAACTTGAAGATCCTGAAGACGCGGAAGACCCGGAGCGTGACGAAGGCGCCGGACACGTCCTCGTTGTTGGTCATGACCAGACCGATGTAGTAGGGCATGATGGCCACCACGTCGATGATGCTCATGACGCTGCGGATGAAGCGGTAGCGGCTGGGAGCCGCGAAGAGCCGCAGGAGGTACTCCACGGTGAAGATCATGACGCACGCCGTGTCCAGGCAGAAGAAGGCCACCGAGTAGCGCTCCCCGCACGGCAGCTCCTTGCTGCCCGGGACCGTGCCGCACGGCACCGTCTCCACCACGTTGGTGATGACCGAGACAGCGATGAAGAAGCCAGTCACGTAGTAGAAGACCAGGGCCAGCGTGCTGGTGTGGGGGTTCTCGAAGGCCCGCCACATGGTCTGGCGGAAGCTGAGCGAGGGCATGGACTCCTGGTTGTTCTCCGAGTCGTTGTCGTCCATGAGCCGCTCGGCGTTCTCCCTCTTGCGGTCCTTGTACTCCTCGTAGCAGCAGTCCCCGATGATCTCCGGGAGGATGCCGTAGAAGGCCAGCTCGTCGTCGTAGGCAGAGATGCACTCGTAGCGCGGGTAGTGCAGCTTCCCCGTGCGGTAGAAGTTGAGCACGCAGCGGAACACCTCGGGGTCCCGGTCGAAGAAGTACTCCTTGGTGTCCTCGTTGAAGAAGAACTCCTTCTCCGTGCTGCCCAGCAGGGTGTCCGGGTAGCGCTCCAGCGTGGTCCTCCAGGTCTGGAACCTCCGCCCACTCACGTTGAGGACAATCAGCTCATCCTGCCGCTTGTTCTTGTCGGCCGGGGCCAGGGGCATGGGGCAGTTGGCCACCGGCATCCACCCGATGGCCGCAGCCCGGGCAAAAGGCAGCCAGGCCGCAACTCCGGCCGCCATGGTGACTCCAGCTCTTGGGCCGGCAGCCGCGCGGACGCTAGGCACACCAGCTTGGAGTTAGTTCAGCAAACCCTGGGAGACAGGAGGGGAGAGAGAGAAGCGGTGAGTCCATATCGACTGGCAGGTAAGAAATGGGACACAGGAAAGGATCACTGGTGAGTGAAACGGCCAAAGTCTCCAGGGCAGATTAATAAAACTGAAATCCCCACCACAGAGAGGGGACTTGATTCTTTGCCATCCAGACACTGGGAGAACACCTAGCTCCTGGAGCTCGGCAGGGTGGGATCGCCAGATGTTGCTGACTGCCTGACAAATCGTCAAGCTCCAAGAGGGCTCAAGAGCATTTGGAGGGAAGGCCTCTTTAGCAGGAAGATCTGGCAAGACGTGGGTAATAATCAGCTCTGAAAGGTTATGGCGTTATTACCAATTTAAATTGGGAGAGGGTAGATGAGTTCTCATTAAATGAATTTAAAAGTGGGATAAACATGCTAATTTTTATTTCACTCTTTCACCCACTGGGGTAATCAGGAACGGGGTGTAGATGAGTGAGATCAGGTAAACAATTCTTTCTACTCCTCCCTAGTGAGGAAGAGGCTGGGGCTGCCCAAGTCCAGAAAATTCTCTGAGATGGCAGGTGACCACCAGGATTGGTGAGGTTCTGTCCCCAACTCCCATGGAGAAGGCTCTCCCTGGCAAAGTGCTACTCTGAGGGACACTTAGCCCCTACTCCTTGCCCTAGCAACCTAGTATCAAATTTTTCCCCTCAGACCCTCAGAGCCATGATGGAAAGACGTGGGAAGGGTTGTGAGGCTGGGCAGGGTCTCTTTCCCTGCTCTGTGAAGGGCGTCTTGGCTTCTTGGTTCACCTGACTTCCATGCATCGTCTCTCTCCCTCCCCAGAAGAAGCCGATCCGCGCTCACTGCCGTCCCTAGATTCCTCTCCTCCCATCTCCATCTGCCCACCATCCATAACTCCCTCAGGTTATATAACAACACTCCTTCCCATACCAGCCTCTCTCACCTGGTCCCCACTCCA
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Task1_train_1422
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Chromosome 1 houses a mutation in gene KCND3 (potassium voltage-gated channel subfamily D member 3). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 19/22
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TGCAGGGCTGTTGTAAAAACTTAAAGAGATAATATATGCAAAGTTCTTAGTACACTGCTGACATATAGTAGACAATCATATGCTGTTATACTACTAATAAAAAGTAATGAGTAGGTGGCTATCACCATGCCTGTTTTCCTCCACATGGCTATCCTGAAGGATCTCTCTGATGTCATGAGTCCCATCAAGGGGCATCTGAGGGCACTGGGCAGTCAGAGCCACATCAGGAGCTTGACTAGAAGTGGAAGTGAGGTGTCTGGCCATGGGTGAGGTCCCCTTCAGGAAGGTGAAGGGATGGCTAGGGTCAGCCTAAAAGGGATAAAGACGACCTCTTGACAGCACAAGCTCTCCAGTCCATTTTATCTCCAAAATACCCCACTGTGCCAAAAAGCCCACATCTGCCACCTGAGCCAAGAGAAACAAGGTCAAATGACCAAACATTCTTACCCACTCTGGGTGAGCAGCCATTTGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTGGAGTGGGAGGAAGGGGCAGGGTGGTTCTGTCAGACAGATAAGAAGTAAAGGGAATGCCCCAATCAAATGTGGCCTTCACAAATGGATGGTGACACCCTTGCTCTTCCCCTTGCTACTCCCTCCCTCTTGTGTGTGGCAGAATGACAAATGTAATCATTTTAAAAGGTCTCGTCACCTGCTCAGTCATTCCCAATAAGCATACGCAGCACTATGGAAAAACCAACACTATTGCCTCTGGGTTTTGGCCAGGAAAAAAAAAAATCAAATCACCAGGACACCACCAACCACACTGTCAAAGACAAAATAAAAAGCTTCATGAATTCTCCATCAGCAATATAACGCTTCCTAGCCTAAGCAAATATAGACCCAGTATATGAATTGTGGAGGGATTTTGCATTAGGCTCCATGGTTTCTAATAGCTGAGGCAGAAACCCCTAAGAAATCTATGTTTCCATAAAGCCACCTTTATTGGCTATAATCCTGCTAGGGTGAAGACTGTAATCTCCTTCCTGAGCCCCCTTCCTCTGATGGAAAGCTTCACATCCCAGCATCATGAATACATTTCTGTGACCTCAGCTGGAGAGGAGACCTCGGAGAGACGGAATTACCATGACCTCACCGAGCACCTGTCCCTCCTTCTGATGATATTGCTGCTTCTGTGTCTGACCACATGATCCATTCAGACCATCTCACAGTCACCCAGGTCATTCAATCACTGACTCAGACTAAAAAGCAAGACTGATACTGCTTTAGAAAGAAAGAATAAACCACGTGCCTTACTGCGAAAAATCCAGGTTCAGAGTCACTTAGAGAAAGTCTGCTCAGAGCTACTGAACGCTTGAGTGTCTGTGGCAGCACAGGAGAAAAGCATAACAAATGGGAAAATGGCCTGCAAAATATACTACAAAGAAAAAATGCAGAAAGGATCCAAAAAGAGTGCTCTTGGTGTCTTCTGGTAATGGACATCTGAACCCTCCGAACTTCTCAACAGTCTCCTCCCTCCCCAACAACTGCCCTGACCTTCTCCCCACGCTGCCCCATATGCGCAAATGCATATACAAATGCAGACATCACCTCACCCCGAGACTTCACACGCACACAAGGCATGGCTGAAAAAAGAATTGGTGACTTAATTTTCTTAGCTCTATAAAACACATGCCCCGACCTCAAAAAGAAAACTCAATTCCCAGCAAGCTACCACCCCCAAACAGATGACTCATGGGCTTTACCCTTCGGATAGAGCAACTTCCCCTGCCCCCAACACTTGGGTAAGGGACTCCCTCCTCCTCTACCCATGGTGACACCATCCAAGGTTTCAGAGGTCATCCAGCTGCCCTCCAACCTCCGTCCTGGTTTCATCCACCAGCGCTGACTTACCCCAGTGTGGTCATGGTGACAATGGTGTACCAAAACGAGGCAGGGATGCTTGTGAACTTGCTGGCCGAGGAGCCCTTCTCGGCATAAAACATCACAGTGGCAAAGATGATGATGGCCATGGTGAGGGAGAAGAGAAGAAAGCCCAGTTCGGAGGCATAGCTCTTCAGTGTGTAGCCCAGGATCCGCAGGCCCTGGGAGTGGCGGGAAAACTTGAAGATCCTGAAGACGCGGAAGACCCGGAGCGTGACGAAGGCGCCGGACACGTCCTCGTTGTTGGTCATGACCAGACCGATGTAGTAGGGCATGATGGCCACCACGTCGATGATGCTCATGACGCTGCGGATGAAGCGGTAGCGGCTGGGAGCCGCGAAGAGCCGCAGGAGGTACTCCACGGTGAAGATCATGACGCACGCCGTGTCCAGGCAGAAGAAGGCCACCGAGTAGCGCTCCCCGCACGGCAGCTCCTTGCTGCCCGGGACCGTGCCGCACGGCACCGTCTCCACCACGTTGGTGATGACCGAGACAGCGATGAAGAAGCCAGTCACGTAGTAGAAGACCAGGGCCAGCGTGCTGGTGTGGGGGTTCTCGAAGGCCCGCCACATGGTCTGGCGGAAGCTGAGCGAGGGCATGGACTCCTGGTTGTTCTCCGAGTCGTTGTCGTCCATGAGCCGCTCGGCGTTCTCCCTCTTGCGGTCCTTGTACTCCTCGTAGCAGCAGTCCCCGATGATCTCCGGGAGGATGCCGTAGAAGGCCAGCTCGTCGTCGTAGGCAGAGATGCACTCGTAGCGCGGGTAGTGCAGCTTCCCCGTGCGGTAGAAGTTGAGCACGCAGCGGAACACCTCGGGGTCCCGGTCGAAGAAGTACTCCTTGGTGTCCTCGTTGAAGAAGAACTCCTTCTCCGTGCTGCCCAGCAGGGTGTCCGGGTAGCGCTCCAGCGTGGTCCTCCAGGTCTGGAACCTCCGCCCACTCACGTTGAGGACAATCAGCTCATCCTGCCGCTTGTTCTTGTCGGCCGGGGCCAGGGGCATGGGGCAGTTGGCCACCGGCATCCACCCGATGGCCGCAGCCCGGGCAAAAGGCAGCCAGGCCGCAACTCCGGCCGCCATGGTGACTCCAGCTCTTGGGCCGGCAGCCGCGCGGACGCTAGGCACACCAGCTTGGAGTTAGTTCAGCAAACCCTGGGAGACAGGAGGGGAGAGAGAGAAGCGGTGAGTCCATATCGACTGGCAGGTAAGAAATGGGACACAGGAAAGGATCACTGGTGAGTGAAACGGCCAAAGTCTCCAGGGCAGATTAATAAAACTGAAATCCCCACCACAGAGAGGGGACTTGATTCTTTGCCATCCAGACACTGGGAGAACACCTAGCTCCTGGAGCTCGGCAGGGTGGGATCGCCAGATGTTGCTGACTGCCTGACAAATCGTCAAGCTCCAAGAGGGCTCAAGAGCATTTGGAGGGAAGGCCTCTTTAGCAGGAAGATCTGGCAAGACGTGGGTAATAATCAGCTCTGAAAGGTTATGGCGTTATTACCAATTTAAATTGGGAGAGGGTAGATGAGTTCTCATTAAATGAATTTAAAAGTGGGATAAACATGCTAATTTTTATTTCACTCTTTCACCCACTGGGGTAATCAGGAACGGGGTGTAGATGAGTGAGATCAGGTAAACAATTCTTTCTACTCCTCCCTAGTGAGGAAGAGGCTGGGGCTGCCCAAGTCCAGAAAATTCTCTGAGATGGCAGGTGACCACCAGGATTGGTGAGGTTCTGTCCCCAACTCCCATGGAGAAGGCTCTCCCTGGCAAAGTGCTACTCTGAGGGACACTTAGCCCCTACTCCTTGCCCTAGCAACCTAGTATCAAATTTTTCCCCTCAGACCCTCAGAGCCATGATGGAAAGACGTGGGAAGGGTTGTGAGGCTGGGCAGGGTCTCTTTCCCTGCTCTGTGAAGGGCGTCTTGGCTTCTTGGTTCACCTGACTTCCATGCATCGTCTCTCTCCCTCCCCAGAAGAAGCCGATCCGCGCTCACTGCCGTCCCTAGATTCCTCTCCTCCCATCTCCATCTGCCCACCATCCATAACTCCCTCAGGTTATATAACAACACTCCTTCCCATACCAGCCTCTCTCACCTGGTCCCCACTCCACCCTCAGAGATTTTTCCAGAGCCAGGCTACCCTGTCCCTTCACCTCTCTAAACCACACTGCAT
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Task1_train_1423
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With a mutation on Chromosome 1 in gene SLC16A1 (solute carrier family 16 member 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
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Pathogenic; Monocarboxylate transporter 1 deficiency, autosomal dominant
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AGAGAGCAGGAGGCCAGTGGTAGAAATGAGGCTGGAAGGACAGCTGGGGCCAGCCCATGCAGTGCCTTGCAAGCCACATTAGGGAATTTGCTTTTCACCCTGAAAGTAATGGGAAGCAACTGGAGAGTTTTAAGAAATCTTGAAGAGTTCTGAACTGGAGACTTCAAGGAGACTGAAGAACAGCTAGAACTGATACAGGTAGACCAGTTAGGAGGTTACAGTTAGGAGCAGCCCAAACAGGAGACAGGAGCTTTGGATAAGGGTAGTAGTTGTGATGGAGAAAAATGGGCAGATGAGAACAAGATTTAGAGCATAAAAACTCATAGAACTTAGTAACTCACTGGGTATGAGATGGAAGAAGACAGTGATCTCAAAAGGCAGCTATGGATCTTCTGTTATATACTCACTCACTCCCCAAATCAAAGTTCCTAAAGTATGAGTCACATCCAGAAGAAGGGTCAAATTATTTTTTCACTATGTGTTATGTATTGAGCTATTAATTTGAAAGATAAAGTATTCAATAACCTTCAGGAATAGTTCCCAAGTTGTAATTAATTTTCTAGCTGTATGATTTTAGCCAAGTTATTTCACCTTTTGAAGCCTCTGTTCACTTACAAAATGGGGACTTAAAACGGTCCTACCTCATATGGACTTGTGAGATACAACAGGAGATACAAAATGATAAGGACAGTCTCTGGTACACTGTGAGCTTACATGGTAGCTATTATTATACTACTGCTACTGAAATAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTTGTGTGTTTTTAAAAAATTTATGGATCAGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGACCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCGCCTGTAATCACAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGACCAAGACTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTATGTGAAATATACTTCATTTTTAAAATGAAATAATCACTAGCGCTTTAAAGATTGGGTTGTTTTTCTACATGCTTTTCTACACTAAGCACATCAGTTTTGCGATCAGAAAAAAACATATTTTAGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTTACCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACAAGTGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTAGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTATTAAAGATATAAAAATTGGCCAGGCATGGTGGCATGCATCTGTAATCCCAGCTACCGGGAGGCTGAGGCAGGGGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAGAAAAAACACTGACATTTGTAACAATATTTGATCCCCCTTTTGCCTTGATGGTTCCATTTAATTAGATTCTATATTTGAGCAATTATGCTGTGCCAAGCATTGTCCCAGCATCAAGGGTACATAAATGAGAAAGATTTATTCTTACCCAAATAGCTCACTAATGTTTGCTTTCTGTCAGCATTCCCATCTTACATGCTTGTTTTGTAATAGACCCACATTAGTAGGGAGATATACTATACCTAAAAGTGGTGGCCCCAGGAGGACAGGACAGCATTCCACAATGGTCACCAATCCCACAGCGCTGGAGAACCTCTGGGGTCCAACAAGGTCCATCAATGTTTCAAACAATACGGAGCTGAGCCACCCGAAGGCAAATCCAAAGAATCCCGCATAGACACAGAATCCAACATAGGTAGTGGATAAAGGTGCTAGCATATGACACACTCCATTTGCAACAACGGAAGCCGCAAAGAAATACTGAATTCGAGGTCTTATTGGCTTTGTGTTGGCTACAAGTCCCATAGATGGTCGGGCTACCATGTCAACAAAAGCCAGAATGGAAAGAAGGAAGGCAGACTTCTCACTAGAATAATGCTGACTCTTCCCATAACTACTAAGAAACACCAAAGGTGCAAAGAGTCCAAAAAACATGATCACATTTCCAGAGAGGTATAGCAAAAAGCCTCTGTGGGTGAATAGGGTTAAGTCCAGGAACTGATTAATTGTTTGGAAGACTGATCGTTTCTCTTGTTTAGGGTGTCTTCCAATAAGATCTGTATTTGCATCATGCAGATCTTTTTTCACACCAGATTTTCCAGCTTTCTCAAGGGATGCTTTAGACTTATCTTTCCCTGCCTTGGTTGGCTTGGGCCCGATTGGTCGCATGAGGGCTCCAGCAACACAGCAGTTTAGTAGCAAGCCCCCAAGAATTAGAAAGCTTCCTCTCCATCCAAAGATACCGAAGAAAACCTGATTGAGGGGGGCCAGAGTACAGAGGAACACAGGGCTGCCTGCCATGGCCAGTCCGTTGGCCAATGGTCGCCTCTTGTAGAAATACTTGCCAATCATGGTCAGAGCTGGATTCAAGTTGAAGGCAAGCCCAAGACCTGTGAAGACAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAAGAGGTATAAATAATGGAAGGAATAGGATATAAATCCTCATTATTAGAGGACATGTTATGTAGTGGTTTAAAGTATGACTTCTAAAACAGACATGGGTTCAAATCTCAGTATCAGTGCTTACTGGTTGCATAATCTCAGACATGTATACCCTCCTATGACTGCTTCCTAATATGTAAAACGGGCACAGGTCACTGTTGTGAGGAAGAAAAGATTTGTTAAGCACTTAGTACCCAGTGCCCAGTATGTAGTAAGCACTTAATACATGTTATTTTTATTATTGTTGTTTTTATTATTTGAAGGTGAATAACTATTTTGTCTAATCTAACAAAATCACCGGAAGGATTATTATAACCATATAAGATCATTAAGTCGACAGTAGAGATAAAACAAATTTACACTAGAAAATGCATAAGGCCAGCTGCAGTGGCTCATGTCTATAATCCCAGTGCTTTGGGAAGCCAAGGCGGCAGGATTGATTAAGGCCAGGCATTCAAGACCACCTTGGGCAGCATAGCAAGACCTGTCTCTACAAAAAGTAATTCGAAAATTAGTCAGGTATGGTAGTGTGTGCCTGCAGTCCTAGCTACTTGGGCGGCTAAAGCTGGAGTATCACTTGAGCCTAGAAGTTTGAGGCTATGGTGAGCTATGATCACACAACTGCACTCCATCCTGGGCTACAGAGAAAGAACCTGTCTCAAAAACCCAAAAACGAAAGAAATAACATATAGTACAAAATGATCCCTTCCACTATAGCACCAAAACTTAAAAACAGGCCAATTCCTAAGACTCCAATTGTGAAACTTTCCTGAGAGATCAGAGAATTTAAAATACACACAAAGTTTTGGGAAAATAAAACACAACATTGCTAAGATGCCAAGGCTCCTGAAATGAATGTACTAATTTATTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGGCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCGGCTCATTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTATTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCTGGCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTAAGCCACCGCACCCAGCCTGAATGTACTAATTTAATGCAATCCAATGAAAATGTCAGTGAATTTTACTTTCGGATTAAGGTAAATGATTCTAAAGGATACTTACAGAACAAATACAGAGCTACTAGGAAATTTTTGATGGTGCAGAGGAAAAAGTGGGACCAACCAGAACAAATTATTTAAATGGCTTTACAAAAGCTAC
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Task1_train_1424
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Assess the clinical impact of this variant on gene DCLRE1B (DNA cross-link repair 1B), found on Chromosome 1. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; Fanconi anemia complementation group C
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Task1_train_1425
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Mutation context: Chromosome 1, Gene DCLRE1B (DNA cross-link repair 1B). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Dyskeratosis congenita, autosomal recessive 8
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TGTTTCCCAAACTTGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCGGCCTCCTGAGTAGCTGAGATTACAGGCGCACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTCTAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCACGCCCCGCCTAAACTTGCCTCATCTTAAGAATCCACCTAATGTGCTGGGTGGTTCTCCAGCTCTCTCCCCACCCCACCCTTAAGTCTCCAAGAGATTAAGATCAGGAGTAAGTTTGGGAATTGCTGACTAGACTGTTTGCTGAACTCTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAAACTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGCTGAACTCTTAAATTGTACAAAGGGTGGGATGGGAAGTGGAAGGAGGAAGGGCAGATTGCTTGGGAATCCCCATTACAGCTTCTGCTCCCGGTGGCTCAGGATTTGGTCAGCTTTCCTGATTCATGTAAGGGATAGTCCCTGACCCGGGGAGGTAACGGAGAGGAGTCAGTGGTCACTGGGATGACTAACTGTTTTCTCAGGTATCTAAGCAATGGATCCAAGCCCTGGAGGTTGGTGAGAGCCATGTATTACCCCTAGATGAAATTGGACAAGAGACCATGACCGTAACCCTCCTCGATGCCAATCACTGTCCTGGTTCTGTCATGTTTCTCTTTGAAGGATATTTTGGAACCATCCTCTACACAGGTGGGCCTCTCAAGGAATCCCAGTGACTTCTCCAGACTAGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTATAGACTGGGGCCTCGCAGTGTTGCCGAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGCAATCCTCCCGCTTCAGCCTCCACAGTAGCTAGGATTATTGGCACAAGCCACCACACCTGGCAGACTTTTCTTGAGCAGCCTTAACTCAATAGAAGTCTGGAGGCGCTGGAGGCCTTCTAACTTCATCACATATGAGCATAGTGACCCCATCTCAACTGATTTCCCACTGTTTTTTTTTCCTTCTTCTTTTTGAGACGGAGTTTCACTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATTGTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATGACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTCGTATTTACTATTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGGCTCGGCCCCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCGATTTCCCACTCTTTAAGGGTCCGAACCTTGTGAAGAGTAATTGAAAAATAGGAGTAGGATGGAGACATTACAACAAAGAAACCATGCAGCTATACTGCCTAGTTCAGTGCCAGGCTACATAATAGTTTTTTCACAGACTAGTAAGCAAACGCCTGTCTATTGTTGGAGGTAGGAGAGGCTTGTCTTCTATTCTTTTGTCTCTGACCTTCTGCCCCCATGTACATATTCCTCCAGGTGATTTTCGATACACACCATCCATGCTAAAGGAGCCAGCCCTGACACTGGGGAAACAGATCCATACTTTATACCTAGACAACACCAATTGCAATCCAGCCCTGGTTCTTCCTTCCCGACAAGAAGCTGCCCACCAGATTGTCCAGCTCATTCGAAAACACCCACAACATAACATAAAGATTGGTGAGTTGTTTCCTTTCAGTTTCCTGTCACCTGTAGATAGTGAACTAGATTCTTTAAGGATTCTCACATCTTTCAGATCTTTGTGCAGTTCTCACTTTCTCCTACACTGACCACCTTATTTAAAATTGCAACCTGGCTAGGTGTGGTGGTTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGAGGGTCATTTGAGCCCAGGCGTTTGAGACCAGCTTGGGCAACATGGCAAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTTAAAAATCAGTTGGGCACGATGGTGCGTGCCTGTGGTCCCAGCTACACAGGGGACTGAGACAGGAGGATTGCCTGGGTCCAGTAGGAGGTCAAGGTTGCAGTGAGCCATGTAAGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAATAAATGAATGAATGAATGAAATAAGTAAAACTGCAACCTGCCCACCATCCCCATTCCCAACTCCTGATCATCCATACCAATTCATTTTTTTCATTTTTTTATAGCACTCATATACTATATATATTTTTAAATATGCTATTGCTTACTTGTTGTCTATCATGCACTTCCTCTGGCCCATGCACATACGCGTGCACACACACACACACACAAGCATAAACTCCTTAAGAGCATCACTGGAAATGGGAAGAGACTTTGTGTGTTTGTGGAACAGAGAAGCAGCAGTCAGTATGACAGGCACACAGTGGGCAAGGAGGCTGAAAAGGCAAGAGGGGCTGAAGTGCTGTTAAGCCATTTTGGACTTGATCCTAAACCCAACCAAGAGCTATTGAAGGATTTTAAGTAGAAGAGGGACAATATGCACTCATCACCTTGCAATATATTCTATAATTTATGTATTTATTGGACTTTTTATTGTCTGATTCCCCCTGCTAGAATGTGAATTCCACTATGGCAGTCTCTGTTTTATTATGGGTGTATCACAAATGCCTACACTAATGCCTGACACAGAAGCATTCAATATGAATGAATGAAATTTATCAGAACATAGATATTTAAGTGAGCGTTGTGCTTTAAATTAAGTATACTGAAAAAACAGGTTTGTGCTTGTTGTACTGATTATAAATAGTATAAAACATTGTTGAGGACTCTTTCTTGGAGTTGCCATTTGGAATAGTTTATGAAAATACATTTTTGTTTTATAAAATAAATAAATGTAATAGATTTGGTTCTAAATTACTTTTTTGGTTGTTTCCAAATTTGTGAGTCTACAAAAGGACAAAGACTTGCCACCATTATAAATATTTGAAAAGGACATGTCTCAACTCTGAAAGGAGTTTCAAAATGAGACTAAACAAAGGCATTGAAAAAATTATATAACTTCCAGGGTGACTACCAAATCGATTGAGAAATATCCTCTACTCTCAGGATTGCTTAGCTACTTATAAAGACCTAACCATTCTTAATATTTTAATGCAGAATTTTCTCAAAAAAGCAAAGCTGGCTAGGAGGATGCTATAGTAAGCCTTAATTAATTTTGCAAATATGTAATAAGCCTCTACCCACTAAGTACCAAGTATCCAATAGGCAGTGGGGATATAAAGATGAATAAAATATAGTCTCTGACTTGGAGGGCTCACAGTCTGGTAGGGAAGGACCTGTGGGGAGGTGGAAGTGGGAATATATATAGAGAGAAGAAAAATCCGCTCCATTTGTGCCCAAGGAGTGAGATTTTGAACCATAATCAGGAATAAAGTGGATATAAATAATATATACTTCTTTTTATGGCGTTCACAATCTGGTTGTGGATTTGAAACTTCTTCAGAAAAAGTCTGAGAACAGCTATTAAACAACATCTCCCATATCTGTTACCATAACCATTTCCCAAATTAATGTCTCCATTTCTTTCTCTGTAAGTACTATTTGGGCCCTTCAATTGAAACTTCCACTCCAGCTT
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TGTTTCCCAAACTTGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCGGCCTCCTGAGTAGCTGAGATTACAGGCGCACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTCTAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCACGCCCCGCCTAAACTTGCCTCATCTTAAGAATCCACCTAATGTGCTGGGTGGTTCTCCAGCTCTCTCCCCACCCCACCCTTAAGTCTCCAAGAGATTAAGATCAGGAGTAAGTTTGGGAATTGCTGACTAGACTGTTTGCTGAACTCTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAAACTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGCTGAACTCTTAAATTGTACAAAGGGTGGGATGGGAAGTGGAAGGAGGAAGGGCAGATTGCTTGGGAATCCCCATTACAGCTTCTGCTCCCGGTGGCTCAGGATTTGGTCAGCTTTCCTGATTCATGTAAGGGATAGTCCCTGACCCGGGGAGGTAACGGAGAGGAGTCAGTGGTCACTGGGATGACTAACTGTTTTCTCAGGTATCTAAGCAATGGATCCAAGCCCTGGAGGTTGGTGAGAGCCATGTATTACCCCTAGATGAAATTGGACAAGAGACCATGACCGTAACCCTCCTCGATGCCAATCACTGTCCTGGTTCTGTCATGTTTCTCTTTGAAGGATATTTTGGAACCATCCTCTACACAGGTGGGCCTCTCAAGGAATCCCAGTGACTTCTCCAGACTAGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTATAGACTGGGGCCTCGCAGTGTTGCCGAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGCAATCCTCCCGCTTCAGCCTCCACAGTAGCTAGGATTATTGGCACAAGCCACCACACCTGGCAGACTTTTCTTGAGCAGCCTTAACTCAATAGAAGTCTGGAGGCGCTGGAGGCCTTCTAACTTCATCACATATGAGCATAGTGACCCCATCTCAACTGATTTCCCACTGTTTTTTTTTCCTTCTTCTTTTTGAGACGGAGTTTCACTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATTGTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATGACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTCGTATTTACTATTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGGCTCGGCCCCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCGATTTCCCACTCTTTAAGGGTCCGAACCTTGTGAAGAGTAATTGAAAAATAGGAGTAGGATGGAGACATTACAACAAAGAAACCATGCAGCTATACTGCCTAGTTCAGTGCCAGGCTACATAATAGTTTTTTCACAGACTAGTAAGCAAACGCCTGTCTATTGTTGGAGGTAGGAGAGGCTTGTCTTCTATTCTTTTGTCTCTGACCTTCTGCCCCCATGTACATATTCCTCCAGGTGATTTTCGATACACACCATCCATGCTAAAGGAGCCAGCCCTGACACTGGGGAAACAGATCCATACTTCATACCTAGACAACACCAATTGCAATCCAGCCCTGGTTCTTCCTTCCCGACAAGAAGCTGCCCACCAGATTGTCCAGCTCATTCGAAAACACCCACAACATAACATAAAGATTGGTGAGTTGTTTCCTTTCAGTTTCCTGTCACCTGTAGATAGTGAACTAGATTCTTTAAGGATTCTCACATCTTTCAGATCTTTGTGCAGTTCTCACTTTCTCCTACACTGACCACCTTATTTAAAATTGCAACCTGGCTAGGTGTGGTGGTTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGAGGGTCATTTGAGCCCAGGCGTTTGAGACCAGCTTGGGCAACATGGCAAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTTAAAAATCAGTTGGGCACGATGGTGCGTGCCTGTGGTCCCAGCTACACAGGGGACTGAGACAGGAGGATTGCCTGGGTCCAGTAGGAGGTCAAGGTTGCAGTGAGCCATGTAAGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAATAAATGAATGAATGAATGAAATAAGTAAAACTGCAACCTGCCCACCATCCCCATTCCCAACTCCTGATCATCCATACCAATTCATTTTTTTCATTTTTTTATAGCACTCATATACTATATATATTTTTAAATATGCTATTGCTTACTTGTTGTCTATCATGCACTTCCTCTGGCCCATGCACATACGCGTGCACACACACACACACACAAGCATAAACTCCTTAAGAGCATCACTGGAAATGGGAAGAGACTTTGTGTGTTTGTGGAACAGAGAAGCAGCAGTCAGTATGACAGGCACACAGTGGGCAAGGAGGCTGAAAAGGCAAGAGGGGCTGAAGTGCTGTTAAGCCATTTTGGACTTGATCCTAAACCCAACCAAGAGCTATTGAAGGATTTTAAGTAGAAGAGGGACAATATGCACTCATCACCTTGCAATATATTCTATAATTTATGTATTTATTGGACTTTTTATTGTCTGATTCCCCCTGCTAGAATGTGAATTCCACTATGGCAGTCTCTGTTTTATTATGGGTGTATCACAAATGCCTACACTAATGCCTGACACAGAAGCATTCAATATGAATGAATGAAATTTATCAGAACATAGATATTTAAGTGAGCGTTGTGCTTTAAATTAAGTATACTGAAAAAACAGGTTTGTGCTTGTTGTACTGATTATAAATAGTATAAAACATTGTTGAGGACTCTTTCTTGGAGTTGCCATTTGGAATAGTTTATGAAAATACATTTTTGTTTTATAAAATAAATAAATGTAATAGATTTGGTTCTAAATTACTTTTTTGGTTGTTTCCAAATTTGTGAGTCTACAAAAGGACAAAGACTTGCCACCATTATAAATATTTGAAAAGGACATGTCTCAACTCTGAAAGGAGTTTCAAAATGAGACTAAACAAAGGCATTGAAAAAATTATATAACTTCCAGGGTGACTACCAAATCGATTGAGAAATATCCTCTACTCTCAGGATTGCTTAGCTACTTATAAAGACCTAACCATTCTTAATATTTTAATGCAGAATTTTCTCAAAAAAGCAAAGCTGGCTAGGAGGATGCTATAGTAAGCCTTAATTAATTTTGCAAATATGTAATAAGCCTCTACCCACTAAGTACCAAGTATCCAATAGGCAGTGGGGATATAAAGATGAATAAAATATAGTCTCTGACTTGGAGGGCTCACAGTCTGGTAGGGAAGGACCTGTGGGGAGGTGGAAGTGGGAATATATATAGAGAGAAGAAAAATCCGCTCCATTTGTGCCCAAGGAGTGAGATTTTGAACCATAATCAGGAATAAAGTGGATATAAATAATATATACTTCTTTTTATGGCGTTCACAATCTGGTTGTGGATTTGAAACTTCTTCAGAAAAAGTCTGAGAACAGCTATTAAACAACATCTCCCATATCTGTTACCATAACCATTTCCCAAATTAATGTCTCCATTTCTTTCTCTGTAAGTACTATTTGGGCCCTTCAATTGAAACTTCCACTCCAGCTT
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Task1_train_1426
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Chromosome 1 houses a mutation in gene DCLRE1B (DNA cross-link repair 1B). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Dyskeratosis congenita, autosomal recessive 8
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Task1_train_1427
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A genetic alteration is present in NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase) on Chromosome 1. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Non-small cell lung carcinoma
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CTGTACTGTTCAACATGGTACCTACTAGTGGCTATTGAGCATTTGGTAGTCAAGGAACTAATTTTTAAATTTTATTTAATCTTAATTAACTGTAAATAACCACATACTGCACAGTACTGTTTTAGTCTCTACCCCTGGATTACCCACAAAGTCATGTATCTGAACTACATTCCACTGGCTATTTGCAAAACTGTGCTTGATGGTAATAGCCTACATTAAGGGATAAGACAGCCTAAAGTACCTGGACCATGTCACTGTCAGGTTACTACTGATTTTTACATTAAACAAGCCTCTTTGAGGATCCATGGGAAAATTTCCTTCTAGTCCGAGCAACTTAACGGCTTTCAGCATACAGATACTGAATCTTTCAGCTGGCTACTTTCCTTTTCACAACAGTGACCAAATTTGTAGTCCACCTTTAGAAAGCCACTGGAACTTCATGCACAATCACAGAATATGCTCACTCCTAAATTTGTTTATTTTACCCTTATTTTTTTGGTCTCACTTAAGCCTATTTTTCATTAATCTTATCTTGCTCTACTATATGCATTTTCATAAGATGTTTTAAATACTCTTTGGTTTGAGCTAAGGCATATAGAAAAATGAATAAATTTCTTGTAAGAAAGAAGAAAAATGACTTCTAGAAATTCAAAAAACATTTATTAGATGCATGCCAAGTGTGGGCATTTTATTAAGTACTGCTATTACTTTTAGACAAAAAAAAAATGGGAAGTACAACAGGTTAGGAAAAGAACACTTGAATTCAGTGTTGGACCAATCTGCTTTTGAGAGCAGACATCTTCACATGGATAGAAAATAAGCCAAGACTCAAGCCTTTAGGCAGAACACTTAAGTAGCATTTACTGTGTGCCAGGCACTATTCTGAGTGATTTGCGTATTTATTAAAACTGTAATCTTCACAACTCTATGAGGTAGGTATTATTATTTCCATATTATAGGTTAGGAAAGCCACATAGCCCCTGAGTCACGTCGCTAATAAACAGAGCTAGGTTTCAATCCAGGCAGAGTTCTCATTCTTAACCATTATATTATTCTGTTTAAGAACACTGTGCTAAGAAAAAGGAGCTTTGGGTTTTTGGTCCTGGCTCTGCTACTAATAACAATCCTGACTCCAAAACCTAACAAACGACATTCTGAACTCTGTTTCTGATTCTGCAAAATAAGAATATTGTACTAGAATTTTTATGGTCCAATCTAGCTTTGAAACTTTATGGTTCTATGGACAAAGTCTATCTTTATGTTCCCTTGCTTTGTTTTCATCTTTATGGACTTCCTATTTGCTTACTCCTATCATTTTATTTTTTATTTTTTTTGGAGACAGAATCTTGCTCTGTTGATTAGGCTGGAGTGCAGCAGTGCAGTGGAGTGAGCATGCCTCGACCTCCTGAGCTCACGTGATCCTCCCACCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGCCACCATGTGTGACTAATTTTTTTATTTTTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGAAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTGACATTCCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCTTTTCCATTACATACTGAAAGATGTTTCTTGGAGATGTTTTCCTCTCTGAAATTCCTTCGTGATCTCTAATTACAACAACTCTGGTTCCAAGTCATTCCCAGTAGCAAGCTTCACTTATGTATTATCAAACTTTATAGTAACAGTATATTATGTAAAATAAATTCCAGTATTAACTTTCAGTAATTACCCTAGATTCTCAATGTCAAACAACCTAAAACCAACTCTTCCCATAATTAAAAAGCTCTATCTTCCCTAGTGTGGTAACCTCATTTCCCCATAAAGATTCAGAACACAAAGATCATCCTTTCAGAGAAAATAATGCTCCTAGTACCTGTAGAGGTTAATATCCGCAAATGACTTGCTATTATTGATGGCAAATACACAGAGGAAGCCTTCGCCTGTCCTCATGTATTGGTCTCTCATGGCACTGTACTCTTCTTGTCCAGCTGTATCCAGTATGTCCAACAAACAGGTTTCACCATCTATAACCACTTGTTTTCTGTAAGAATCCTGGGGGTGTGGAGGGTAAGGGGGCAGGGAGGGAGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTT
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Task1_train_1428
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Noonan syndrome 6
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CTGTACTGTTCAACATGGTACCTACTAGTGGCTATTGAGCATTTGGTAGTCAAGGAACTAATTTTTAAATTTTATTTAATCTTAATTAACTGTAAATAACCACATACTGCACAGTACTGTTTTAGTCTCTACCCCTGGATTACCCACAAAGTCATGTATCTGAACTACATTCCACTGGCTATTTGCAAAACTGTGCTTGATGGTAATAGCCTACATTAAGGGATAAGACAGCCTAAAGTACCTGGACCATGTCACTGTCAGGTTACTACTGATTTTTACATTAAACAAGCCTCTTTGAGGATCCATGGGAAAATTTCCTTCTAGTCCGAGCAACTTAACGGCTTTCAGCATACAGATACTGAATCTTTCAGCTGGCTACTTTCCTTTTCACAACAGTGACCAAATTTGTAGTCCACCTTTAGAAAGCCACTGGAACTTCATGCACAATCACAGAATATGCTCACTCCTAAATTTGTTTATTTTACCCTTATTTTTTTGGTCTCACTTAAGCCTATTTTTCATTAATCTTATCTTGCTCTACTATATGCATTTTCATAAGATGTTTTAAATACTCTTTGGTTTGAGCTAAGGCATATAGAAAAATGAATAAATTTCTTGTAAGAAAGAAGAAAAATGACTTCTAGAAATTCAAAAAACATTTATTAGATGCATGCCAAGTGTGGGCATTTTATTAAGTACTGCTATTACTTTTAGACAAAAAAAAAATGGGAAGTACAACAGGTTAGGAAAAGAACACTTGAATTCAGTGTTGGACCAATCTGCTTTTGAGAGCAGACATCTTCACATGGATAGAAAATAAGCCAAGACTCAAGCCTTTAGGCAGAACACTTAAGTAGCATTTACTGTGTGCCAGGCACTATTCTGAGTGATTTGCGTATTTATTAAAACTGTAATCTTCACAACTCTATGAGGTAGGTATTATTATTTCCATATTATAGGTTAGGAAAGCCACATAGCCCCTGAGTCACGTCGCTAATAAACAGAGCTAGGTTTCAATCCAGGCAGAGTTCTCATTCTTAACCATTATATTATTCTGTTTAAGAACACTGTGCTAAGAAAAAGGAGCTTTGGGTTTTTGGTCCTGGCTCTGCTACTAATAACAATCCTGACTCCAAAACCTAACAAACGACATTCTGAACTCTGTTTCTGATTCTGCAAAATAAGAATATTGTACTAGAATTTTTATGGTCCAATCTAGCTTTGAAACTTTATGGTTCTATGGACAAAGTCTATCTTTATGTTCCCTTGCTTTGTTTTCATCTTTATGGACTTCCTATTTGCTTACTCCTATCATTTTATTTTTTATTTTTTTTGGAGACAGAATCTTGCTCTGTTGATTAGGCTGGAGTGCAGCAGTGCAGTGGAGTGAGCATGCCTCGACCTCCTGAGCTCACGTGATCCTCCCACCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGCCACCATGTGTGACTAATTTTTTTATTTTTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGAAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTGACATTCCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCTTTTCCATTACATACTGAAAGATGTTTCTTGGAGATGTTTTCCTCTCTGAAATTCCTTCGTGATCTCTAATTACAACAACTCTGGTTCCAAGTCATTCCCAGTAGCAAGCTTCACTTATGTATTATCAAACTTTATAGTAACAGTATATTATGTAAAATAAATTCCAGTATTAACTTTCAGTAATTACCCTAGATTCTCAATGTCAAACAACCTAAAACCAACTCTTCCCATAATTAAAAAGCTCTATCTTCCCTAGTGTGGTAACCTCATTTCCCCATAAAGATTCAGAACACAAAGATCATCCTTTCAGAGAAAATAATGCTCCTAGTACCTGTAGAGGTTAATATCCGCAAATGACTTGCTATTATTGATGGCAAATACACAGAGGAAGCCTTCGCCTGTCCTCATGTATTGGTCTCTCATGGCACTGTACTCTTCTCGTCCAGCTGTATCCAGTATGTCCAACAAACAGGTTTCACCATCTATAACCACTTGTTTTCTGTAAGAATCCTGGGGGTGTGGAGGGTAAGGGGGCAGGGAGGGAGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTT
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Task1_train_1429
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This is a variant in NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase), located on Chromosome 1. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Large congenital melanocytic nevus
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CTGTACTGTTCAACATGGTACCTACTAGTGGCTATTGAGCATTTGGTAGTCAAGGAACTAATTTTTAAATTTTATTTAATCTTAATTAACTGTAAATAACCACATACTGCACAGTACTGTTTTAGTCTCTACCCCTGGATTACCCACAAAGTCATGTATCTGAACTACATTCCACTGGCTATTTGCAAAACTGTGCTTGATGGTAATAGCCTACATTAAGGGATAAGACAGCCTAAAGTACCTGGACCATGTCACTGTCAGGTTACTACTGATTTTTACATTAAACAAGCCTCTTTGAGGATCCATGGGAAAATTTCCTTCTAGTCCGAGCAACTTAACGGCTTTCAGCATACAGATACTGAATCTTTCAGCTGGCTACTTTCCTTTTCACAACAGTGACCAAATTTGTAGTCCACCTTTAGAAAGCCACTGGAACTTCATGCACAATCACAGAATATGCTCACTCCTAAATTTGTTTATTTTACCCTTATTTTTTTGGTCTCACTTAAGCCTATTTTTCATTAATCTTATCTTGCTCTACTATATGCATTTTCATAAGATGTTTTAAATACTCTTTGGTTTGAGCTAAGGCATATAGAAAAATGAATAAATTTCTTGTAAGAAAGAAGAAAAATGACTTCTAGAAATTCAAAAAACATTTATTAGATGCATGCCAAGTGTGGGCATTTTATTAAGTACTGCTATTACTTTTAGACAAAAAAAAAATGGGAAGTACAACAGGTTAGGAAAAGAACACTTGAATTCAGTGTTGGACCAATCTGCTTTTGAGAGCAGACATCTTCACATGGATAGAAAATAAGCCAAGACTCAAGCCTTTAGGCAGAACACTTAAGTAGCATTTACTGTGTGCCAGGCACTATTCTGAGTGATTTGCGTATTTATTAAAACTGTAATCTTCACAACTCTATGAGGTAGGTATTATTATTTCCATATTATAGGTTAGGAAAGCCACATAGCCCCTGAGTCACGTCGCTAATAAACAGAGCTAGGTTTCAATCCAGGCAGAGTTCTCATTCTTAACCATTATATTATTCTGTTTAAGAACACTGTGCTAAGAAAAAGGAGCTTTGGGTTTTTGGTCCTGGCTCTGCTACTAATAACAATCCTGACTCCAAAACCTAACAAACGACATTCTGAACTCTGTTTCTGATTCTGCAAAATAAGAATATTGTACTAGAATTTTTATGGTCCAATCTAGCTTTGAAACTTTATGGTTCTATGGACAAAGTCTATCTTTATGTTCCCTTGCTTTGTTTTCATCTTTATGGACTTCCTATTTGCTTACTCCTATCATTTTATTTTTTATTTTTTTTGGAGACAGAATCTTGCTCTGTTGATTAGGCTGGAGTGCAGCAGTGCAGTGGAGTGAGCATGCCTCGACCTCCTGAGCTCACGTGATCCTCCCACCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGCCACCATGTGTGACTAATTTTTTTATTTTTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGAAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTGACATTCCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCTTTTCCATTACATACTGAAAGATGTTTCTTGGAGATGTTTTCCTCTCTGAAATTCCTTCGTGATCTCTAATTACAACAACTCTGGTTCCAAGTCATTCCCAGTAGCAAGCTTCACTTATGTATTATCAAACTTTATAGTAACAGTATATTATGTAAAATAAATTCCAGTATTAACTTTCAGTAATTACCCTAGATTCTCAATGTCAAACAACCTAAAACCAACTCTTCCCATAATTAAAAAGCTCTATCTTCCCTAGTGTGGTAACCTCATTTCCCCATAAAGATTCAGAACACAAAGATCATCCTTTCAGAGAAAATAATGCTCCTAGTACCTGTAGAGGTTAATATCCGCAAATGACTTGCTATTATTGATGGCAAATACACAGAGGAAGCCTTCGCCTGTCCTCATGTATTGGTCTCTCATGGCACTGTACTCTTCTTGTCCAGCTGTATCCAGTATGTCCAACAAACAGGTTTCACCATCTATAACCACTTGTTTTCTGTAAGAATCCTGGGGGTGTGGAGGGTAAGGGGGCAGGGAGGGAGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTT
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Task1_train_1430
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With a mutation on Chromosome 1 in gene NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
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Pathogenic; Vascular malformation
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CTGTACTGTTCAACATGGTACCTACTAGTGGCTATTGAGCATTTGGTAGTCAAGGAACTAATTTTTAAATTTTATTTAATCTTAATTAACTGTAAATAACCACATACTGCACAGTACTGTTTTAGTCTCTACCCCTGGATTACCCACAAAGTCATGTATCTGAACTACATTCCACTGGCTATTTGCAAAACTGTGCTTGATGGTAATAGCCTACATTAAGGGATAAGACAGCCTAAAGTACCTGGACCATGTCACTGTCAGGTTACTACTGATTTTTACATTAAACAAGCCTCTTTGAGGATCCATGGGAAAATTTCCTTCTAGTCCGAGCAACTTAACGGCTTTCAGCATACAGATACTGAATCTTTCAGCTGGCTACTTTCCTTTTCACAACAGTGACCAAATTTGTAGTCCACCTTTAGAAAGCCACTGGAACTTCATGCACAATCACAGAATATGCTCACTCCTAAATTTGTTTATTTTACCCTTATTTTTTTGGTCTCACTTAAGCCTATTTTTCATTAATCTTATCTTGCTCTACTATATGCATTTTCATAAGATGTTTTAAATACTCTTTGGTTTGAGCTAAGGCATATAGAAAAATGAATAAATTTCTTGTAAGAAAGAAGAAAAATGACTTCTAGAAATTCAAAAAACATTTATTAGATGCATGCCAAGTGTGGGCATTTTATTAAGTACTGCTATTACTTTTAGACAAAAAAAAAATGGGAAGTACAACAGGTTAGGAAAAGAACACTTGAATTCAGTGTTGGACCAATCTGCTTTTGAGAGCAGACATCTTCACATGGATAGAAAATAAGCCAAGACTCAAGCCTTTAGGCAGAACACTTAAGTAGCATTTACTGTGTGCCAGGCACTATTCTGAGTGATTTGCGTATTTATTAAAACTGTAATCTTCACAACTCTATGAGGTAGGTATTATTATTTCCATATTATAGGTTAGGAAAGCCACATAGCCCCTGAGTCACGTCGCTAATAAACAGAGCTAGGTTTCAATCCAGGCAGAGTTCTCATTCTTAACCATTATATTATTCTGTTTAAGAACACTGTGCTAAGAAAAAGGAGCTTTGGGTTTTTGGTCCTGGCTCTGCTACTAATAACAATCCTGACTCCAAAACCTAACAAACGACATTCTGAACTCTGTTTCTGATTCTGCAAAATAAGAATATTGTACTAGAATTTTTATGGTCCAATCTAGCTTTGAAACTTTATGGTTCTATGGACAAAGTCTATCTTTATGTTCCCTTGCTTTGTTTTCATCTTTATGGACTTCCTATTTGCTTACTCCTATCATTTTATTTTTTATTTTTTTTGGAGACAGAATCTTGCTCTGTTGATTAGGCTGGAGTGCAGCAGTGCAGTGGAGTGAGCATGCCTCGACCTCCTGAGCTCACGTGATCCTCCCACCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGCCACCATGTGTGACTAATTTTTTTATTTTTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGAAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTGACATTCCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCTTTTCCATTACATACTGAAAGATGTTTCTTGGAGATGTTTTCCTCTCTGAAATTCCTTCGTGATCTCTAATTACAACAACTCTGGTTCCAAGTCATTCCCAGTAGCAAGCTTCACTTATGTATTATCAAACTTTATAGTAACAGTATATTATGTAAAATAAATTCCAGTATTAACTTTCAGTAATTACCCTAGATTCTCAATGTCAAACAACCTAAAACCAACTCTTCCCATAATTAAAAAGCTCTATCTTCCCTAGTGTGGTAACCTCATTTCCCCATAAAGATTCAGAACACAAAGATCATCCTTTCAGAGAAAATAATGCTCCTAGTACCTGTAGAGGTTAATATCCGCAAATGACTTGCTATTATTGATGGCAAATACACAGAGGAAGCCTTCGCCTGTCCTCATGTATTGGTCTCTCATGGCACTGTACTCTTCTCGTCCAGCTGTATCCAGTATGTCCAACAAACAGGTTTCACCATCTATAACCACTTGTTTTCTGTAAGAATCCTGGGGGTGTGGAGGGTAAGGGGGCAGGGAGGGAGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTT
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Task1_train_1431
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Given a variant located on Chromosome 1 and affecting NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Neoplasm
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CTGTACTGTTCAACATGGTACCTACTAGTGGCTATTGAGCATTTGGTAGTCAAGGAACTAATTTTTAAATTTTATTTAATCTTAATTAACTGTAAATAACCACATACTGCACAGTACTGTTTTAGTCTCTACCCCTGGATTACCCACAAAGTCATGTATCTGAACTACATTCCACTGGCTATTTGCAAAACTGTGCTTGATGGTAATAGCCTACATTAAGGGATAAGACAGCCTAAAGTACCTGGACCATGTCACTGTCAGGTTACTACTGATTTTTACATTAAACAAGCCTCTTTGAGGATCCATGGGAAAATTTCCTTCTAGTCCGAGCAACTTAACGGCTTTCAGCATACAGATACTGAATCTTTCAGCTGGCTACTTTCCTTTTCACAACAGTGACCAAATTTGTAGTCCACCTTTAGAAAGCCACTGGAACTTCATGCACAATCACAGAATATGCTCACTCCTAAATTTGTTTATTTTACCCTTATTTTTTTGGTCTCACTTAAGCCTATTTTTCATTAATCTTATCTTGCTCTACTATATGCATTTTCATAAGATGTTTTAAATACTCTTTGGTTTGAGCTAAGGCATATAGAAAAATGAATAAATTTCTTGTAAGAAAGAAGAAAAATGACTTCTAGAAATTCAAAAAACATTTATTAGATGCATGCCAAGTGTGGGCATTTTATTAAGTACTGCTATTACTTTTAGACAAAAAAAAAATGGGAAGTACAACAGGTTAGGAAAAGAACACTTGAATTCAGTGTTGGACCAATCTGCTTTTGAGAGCAGACATCTTCACATGGATAGAAAATAAGCCAAGACTCAAGCCTTTAGGCAGAACACTTAAGTAGCATTTACTGTGTGCCAGGCACTATTCTGAGTGATTTGCGTATTTATTAAAACTGTAATCTTCACAACTCTATGAGGTAGGTATTATTATTTCCATATTATAGGTTAGGAAAGCCACATAGCCCCTGAGTCACGTCGCTAATAAACAGAGCTAGGTTTCAATCCAGGCAGAGTTCTCATTCTTAACCATTATATTATTCTGTTTAAGAACACTGTGCTAAGAAAAAGGAGCTTTGGGTTTTTGGTCCTGGCTCTGCTACTAATAACAATCCTGACTCCAAAACCTAACAAACGACATTCTGAACTCTGTTTCTGATTCTGCAAAATAAGAATATTGTACTAGAATTTTTATGGTCCAATCTAGCTTTGAAACTTTATGGTTCTATGGACAAAGTCTATCTTTATGTTCCCTTGCTTTGTTTTCATCTTTATGGACTTCCTATTTGCTTACTCCTATCATTTTATTTTTTATTTTTTTTGGAGACAGAATCTTGCTCTGTTGATTAGGCTGGAGTGCAGCAGTGCAGTGGAGTGAGCATGCCTCGACCTCCTGAGCTCACGTGATCCTCCCACCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGCCACCATGTGTGACTAATTTTTTTATTTTTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGAAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTGACATTCCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCTTTTCCATTACATACTGAAAGATGTTTCTTGGAGATGTTTTCCTCTCTGAAATTCCTTCGTGATCTCTAATTACAACAACTCTGGTTCCAAGTCATTCCCAGTAGCAAGCTTCACTTATGTATTATCAAACTTTATAGTAACAGTATATTATGTAAAATAAATTCCAGTATTAACTTTCAGTAATTACCCTAGATTCTCAATGTCAAACAACCTAAAACCAACTCTTCCCATAATTAAAAAGCTCTATCTTCCCTAGTGTGGTAACCTCATTTCCCCATAAAGATTCAGAACACAAAGATCATCCTTTCAGAGAAAATAATGCTCCTAGTACCTGTAGAGGTTAATATCCGCAAATGACTTGCTATTATTGATGGCAAATACACAGAGGAAGCCTTCGCCTGTCCTCATGTATTGGTCTCTCATGGCACTGTACTCTTCTTGTCCAGCTGTATCCAGTATGTCCAACAAACAGGTTTCACCATCTATAACCACTTGTTTTCTGTAAGAATCCTGGGGGTGTGGAGGGTAAGGGGGCAGGGAGGGAGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTT
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Task1_train_1432
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The variant affects gene NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase), which is on Chromosome 1. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; not provided
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CTGTACTGTTCAACATGGTACCTACTAGTGGCTATTGAGCATTTGGTAGTCAAGGAACTAATTTTTAAATTTTATTTAATCTTAATTAACTGTAAATAACCACATACTGCACAGTACTGTTTTAGTCTCTACCCCTGGATTACCCACAAAGTCATGTATCTGAACTACATTCCACTGGCTATTTGCAAAACTGTGCTTGATGGTAATAGCCTACATTAAGGGATAAGACAGCCTAAAGTACCTGGACCATGTCACTGTCAGGTTACTACTGATTTTTACATTAAACAAGCCTCTTTGAGGATCCATGGGAAAATTTCCTTCTAGTCCGAGCAACTTAACGGCTTTCAGCATACAGATACTGAATCTTTCAGCTGGCTACTTTCCTTTTCACAACAGTGACCAAATTTGTAGTCCACCTTTAGAAAGCCACTGGAACTTCATGCACAATCACAGAATATGCTCACTCCTAAATTTGTTTATTTTACCCTTATTTTTTTGGTCTCACTTAAGCCTATTTTTCATTAATCTTATCTTGCTCTACTATATGCATTTTCATAAGATGTTTTAAATACTCTTTGGTTTGAGCTAAGGCATATAGAAAAATGAATAAATTTCTTGTAAGAAAGAAGAAAAATGACTTCTAGAAATTCAAAAAACATTTATTAGATGCATGCCAAGTGTGGGCATTTTATTAAGTACTGCTATTACTTTTAGACAAAAAAAAAATGGGAAGTACAACAGGTTAGGAAAAGAACACTTGAATTCAGTGTTGGACCAATCTGCTTTTGAGAGCAGACATCTTCACATGGATAGAAAATAAGCCAAGACTCAAGCCTTTAGGCAGAACACTTAAGTAGCATTTACTGTGTGCCAGGCACTATTCTGAGTGATTTGCGTATTTATTAAAACTGTAATCTTCACAACTCTATGAGGTAGGTATTATTATTTCCATATTATAGGTTAGGAAAGCCACATAGCCCCTGAGTCACGTCGCTAATAAACAGAGCTAGGTTTCAATCCAGGCAGAGTTCTCATTCTTAACCATTATATTATTCTGTTTAAGAACACTGTGCTAAGAAAAAGGAGCTTTGGGTTTTTGGTCCTGGCTCTGCTACTAATAACAATCCTGACTCCAAAACCTAACAAACGACATTCTGAACTCTGTTTCTGATTCTGCAAAATAAGAATATTGTACTAGAATTTTTATGGTCCAATCTAGCTTTGAAACTTTATGGTTCTATGGACAAAGTCTATCTTTATGTTCCCTTGCTTTGTTTTCATCTTTATGGACTTCCTATTTGCTTACTCCTATCATTTTATTTTTTATTTTTTTTGGAGACAGAATCTTGCTCTGTTGATTAGGCTGGAGTGCAGCAGTGCAGTGGAGTGAGCATGCCTCGACCTCCTGAGCTCACGTGATCCTCCCACCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGCCACCATGTGTGACTAATTTTTTTATTTTTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGAAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTGACATTCCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCTTTTCCATTACATACTGAAAGATGTTTCTTGGAGATGTTTTCCTCTCTGAAATTCCTTCGTGATCTCTAATTACAACAACTCTGGTTCCAAGTCATTCCCAGTAGCAAGCTTCACTTATGTATTATCAAACTTTATAGTAACAGTATATTATGTAAAATAAATTCCAGTATTAACTTTCAGTAATTACCCTAGATTCTCAATGTCAAACAACCTAAAACCAACTCTTCCCATAATTAAAAAGCTCTATCTTCCCTAGTGTGGTAACCTCATTTCCCCATAAAGATTCAGAACACAAAGATCATCCTTTCAGAGAAAATAATGCTCCTAGTACCTGTAGAGGTTAATATCCGCAAATGACTTGCTATTATTGATGGCAAATACACAGAGGAAGCCTTCGCCTGTCCTCATGTATTGGTCTCTCATGGCACTGTACTCTTCTGGTCCAGCTGTATCCAGTATGTCCAACAAACAGGTTTCACCATCTATAACCACTTGTTTTCTGTAAGAATCCTGGGGGTGTGGAGGGTAAGGGGGCAGGGAGGGAGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTT
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Task1_train_1433
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Assess the clinical impact of this variant on gene NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase), found on Chromosome 1. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; RASopathy
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TACTGTTCAACATGGTACCTACTAGTGGCTATTGAGCATTTGGTAGTCAAGGAACTAATTTTTAAATTTTATTTAATCTTAATTAACTGTAAATAACCACATACTGCACAGTACTGTTTTAGTCTCTACCCCTGGATTACCCACAAAGTCATGTATCTGAACTACATTCCACTGGCTATTTGCAAAACTGTGCTTGATGGTAATAGCCTACATTAAGGGATAAGACAGCCTAAAGTACCTGGACCATGTCACTGTCAGGTTACTACTGATTTTTACATTAAACAAGCCTCTTTGAGGATCCATGGGAAAATTTCCTTCTAGTCCGAGCAACTTAACGGCTTTCAGCATACAGATACTGAATCTTTCAGCTGGCTACTTTCCTTTTCACAACAGTGACCAAATTTGTAGTCCACCTTTAGAAAGCCACTGGAACTTCATGCACAATCACAGAATATGCTCACTCCTAAATTTGTTTATTTTACCCTTATTTTTTTGGTCTCACTTAAGCCTATTTTTCATTAATCTTATCTTGCTCTACTATATGCATTTTCATAAGATGTTTTAAATACTCTTTGGTTTGAGCTAAGGCATATAGAAAAATGAATAAATTTCTTGTAAGAAAGAAGAAAAATGACTTCTAGAAATTCAAAAAACATTTATTAGATGCATGCCAAGTGTGGGCATTTTATTAAGTACTGCTATTACTTTTAGACAAAAAAAAAATGGGAAGTACAACAGGTTAGGAAAAGAACACTTGAATTCAGTGTTGGACCAATCTGCTTTTGAGAGCAGACATCTTCACATGGATAGAAAATAAGCCAAGACTCAAGCCTTTAGGCAGAACACTTAAGTAGCATTTACTGTGTGCCAGGCACTATTCTGAGTGATTTGCGTATTTATTAAAACTGTAATCTTCACAACTCTATGAGGTAGGTATTATTATTTCCATATTATAGGTTAGGAAAGCCACATAGCCCCTGAGTCACGTCGCTAATAAACAGAGCTAGGTTTCAATCCAGGCAGAGTTCTCATTCTTAACCATTATATTATTCTGTTTAAGAACACTGTGCTAAGAAAAAGGAGCTTTGGGTTTTTGGTCCTGGCTCTGCTACTAATAACAATCCTGACTCCAAAACCTAACAAACGACATTCTGAACTCTGTTTCTGATTCTGCAAAATAAGAATATTGTACTAGAATTTTTATGGTCCAATCTAGCTTTGAAACTTTATGGTTCTATGGACAAAGTCTATCTTTATGTTCCCTTGCTTTGTTTTCATCTTTATGGACTTCCTATTTGCTTACTCCTATCATTTTATTTTTTATTTTTTTTGGAGACAGAATCTTGCTCTGTTGATTAGGCTGGAGTGCAGCAGTGCAGTGGAGTGAGCATGCCTCGACCTCCTGAGCTCACGTGATCCTCCCACCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGCCACCATGTGTGACTAATTTTTTTATTTTTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGAAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTGACATTCCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCTTTTCCATTACATACTGAAAGATGTTTCTTGGAGATGTTTTCCTCTCTGAAATTCCTTCGTGATCTCTAATTACAACAACTCTGGTTCCAAGTCATTCCCAGTAGCAAGCTTCACTTATGTATTATCAAACTTTATAGTAACAGTATATTATGTAAAATAAATTCCAGTATTAACTTTCAGTAATTACCCTAGATTCTCAATGTCAAACAACCTAAAACCAACTCTTCCCATAATTAAAAAGCTCTATCTTCCCTAGTGTGGTAACCTCATTTCCCCATAAAGATTCAGAACACAAAGATCATCCTTTCAGAGAAAATAATGCTCCTAGTACCTGTAGAGGTTAATATCCGCAAATGACTTGCTATTATTGATGGCAAATACACAGAGGAAGCCTTCGCCTGTCCTCATGTATTGGTCTCTCATGGCACTGTACTCTTCTTGTCCAGCTGTATCCAGTATGTCCAACAAACAGGTTTCACCATCTATAACCACTTGTTTTCTGTAAGAATCCTGGGGGTGTGGAGGGTAAGGGGGCAGGGAGGGAGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTTTCT
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Task1_train_1434
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Given this context: Chromosome 1, gene NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_1435
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This gene mutation involves NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Epidermal nevus
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AGGGAAGTTCAATTTTTATTAAAAACCACAGGGAATGCAATGCTATTGCCAAGGTTAAATAAGCATCTAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTTTCTCTCCTCTTATTCCTTTAATACAGAATATGGGTAAAGATGATCCGACAAGTGAGAGACAGGATCAGGTCAGCGGGCTACCACTGGGCCTCACCTCTATGGTGGGATCATATTCATCTACAAAGTGGTTCTGGATTAGCTGGATTGTCAGTGCGCTTTTCCCAACACCACCTGCTCCAACCACCACCAGTTTGTACTCAGTCATTTCACACCAGCAAGAACCTGTTGGAAACCAGTAATCAGGGTTAATTGGCGAGCCACATCTACAGTACTTTAAAGCTTTCTATAATCAATGGAAATGAAAACCCTAGTGTGACCTTCCATTTGGTTCTTAAAGTGACTAGAGAACGCAAAAACACCGGATTAATATCGGCCTCACACTTCTGGAGTAGTTTTCTAGCAACCCCCATCCTTAGCTATTTTTCAACAGTCCTTGGGCCCCGCCCTCAGCCTAAGCAATGGAAATCCCCCTTCCTATTACTCCCCGAAGGCTTCTCAGCTCTAGCAGGAAGCCTCCAGGCCGCAACTCCTTCCCATTCTCCCTTCTGTCTCCAAAGATCTCCCCACGTAGGCACCAAATGGAAGGACCCCCGCCCAAGGCCTTTGTCTCCAGCTGATAGATTCTGCTCCATTTCTGGCATCAGTGAAACGCCTGAACATTCCACAGCCCAAAGCCGAACACTATGCATGAGATAAACTTACCTCAAGCTCCACTGCCTCTGCTTTGGACAGATTTAGGACCACAGCCGGGAAAAATGTTGGAGACCCCGGAACCGCCATGAACAGCCCCCACCAAGGAGCGGCACTTCCGGCCCCGCCCGCTACGTAATCAGTCGGCGCCCCAGGCGCCTGAGTCCCCGCCCCGGCCACGTGGGCCTCCGAACCACGAGTCATGCGGCAGGCCGCACCCAGACCCGCCCCTCCCACACGGGACGTTTCAATAATGAAAGCGCTAGGTGCTAGTGTCTCAAAAATCAGTAAAACTTTATTCGCTTCCATTCTTTCGCCATTAACAGAAAACTGGAGAAAGCAAAAATGTTTCGTGTTTACAAAGATAAACGGCCTCTTTACCCAGAGATCAAAACCTCAAACGACAAGGGGGAAGATAAAACCGCCCTCCCCCACATCCCCTGAGCTGACCCTTGTCATCTTAGACAAAGCCTTCAGTCCACTGGCCAGGGACCCTGTATATGGCCAATTCAAGAAGAGGGCCAAGAAATCAGACCCATCCATTCCCGTGATATAAAGTTGAACAGAAGCTACACCAAGGGTCAAGTGTCTGTATTTTACAGGACACAGTAACCAGGCGGCTACTTATAAAAAAAAACAAGATTCATTTCAGGCACAACTTTTTTATTTTTTTTTGTTTTGTTTTTAAATCAGTAAAAGAAACCGGGTCCTAGAAGCTGCAGTGATCTAAGCAGCAGCAAGTTTGTGCATTCATTTTTTTTGTTTTTGTTTAAATATGTTTAAATTATCACACTGCTGGCACTCCTCATTTGCATGAAATTCTGCACCATACTTACTAATTGTAGTAAAGTTACCCCCCAACCCACGAAAAAAAACCTACTCTGGAAGAAAATTTTCACTGAAATATAACCAAACTTCTTTAAGTGGATTGTGACAAGATTATAAATGATATGAAAAATAACATTTTAAAATTTGGCCATCAACTTTAAGAAATGGTTTGCCTATACAAATTTTTGTAATTTTTAAAAGATAATATATTCTACCCTCATATGGTCCTCAGAATTAAAGCATAATGAACAGGAAGAAAAAGGAAAAGAATGCAACTGAGTGCTAAGGCAGAACATCTTGCCAGAAGTAATTAATGAAGGTAGAGTATATAATGAAAAGTGCAGAATTTCATAGGGCCAACAAGATAACAGTCTATATTTTTCACTTACACAGGCAAAGTGGATTCTGCAATTACCAGTTGCGTTAAATGCACCAAATAAAGCTCCTAAAATTGATACTATAAGGCGCCACCTTAAGTTTTTCCAGGCTGCAACTGTGCATTATTTAAAATGGTTTTCTTAAATTTATTTATTTTTTTAAACATAACACGAGGAAGGTGTTAAAACTGGTGTAATAGCTCAATAGAATAAGTATTCCAGATTTCGGGAGGGATGAAGAGGGAGATATTCAGAAC
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Task1_train_1436
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Here is a variant affecting NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_1437
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This is a variant in NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase), located on Chromosome 1. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Neoplasm
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TAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTTTCTCTCCTCTTATTCCTTTAATACAGAATATGGGTAAAGATGATCCGACAAGTGAGAGACAGGATCAGGTCAGCGGGCTACCACTGGGCCTCACCTCTATGGTGGGATCATATTCATCTACAAAGTGGTTCTGGATTAGCTGGATTGTCAGTGCGCTTTTCCCAACACCACCTGCTCCAACCACCACCAGTTTGTACTCAGTCATTTCACACCAGCAAGAACCTGTTGGAAACCAGTAATCAGGGTTAATTGGCGAGCCACATCTACAGTACTTTAAAGCTTTCTATAATCAATGGAAATGAAAACCCTAGTGTGACCTTCCATTTGGTTCTTAAAGTGACTAGAGAACGCAAAAACACCGGATTAATATCGGCCTCACACTTCTGGAGTAGTTTTCTAGCAACCCCCATCCTTAGCTATTTTTCAACAGTCCTTGGGCCCCGCCCTCAGCCTAAGCAATGGAAATCCCCCTTCCTATTACTCCCCGAAGGCTTCTCAGCTCTAGCAGGAAGCCTCCAGGCCGCAACTCCTTCCCATTCTCCCTTCTGTCTCCAAAGATCTCCCCACGTAGGCACCAAATGGAAGGACCCCCGCCCAAGGCCTTTGTCTCCAGCTGATAGATTCTGCTCCATTTCTGGCATCAGTGAAACGCCTGAACATTCCACAGCCCAAAGCCGAACACTATGCATGAGATAAACTTACCTCAAGCTCCACTGCCTCTGCTTTGGACAGATTTAGGACCACAGCCGGGAAAAATGTTGGAGACCCCGGAACCGCCATGAACAGCCCCCACCAAGGAGCGGCACTTCCGGCCCCGCCCGCTACGTAATCAGTCGGCGCCCCAGGCGCCTGAGTCCCCGCCCCGGCCACGTGGGCCTCCGAACCACGAGTCATGCGGCAGGCCGCACCCAGACCCGCCCCTCCCACACGGGACGTTTCAATAATGAAAGCGCTAGGTGCTAGTGTCTCAAAAATCAGTAAAACTTTATTCGCTTCCATTCTTTCGCCATTAACAGAAAACTGGAGAAAGCAAAAATGTTTCGTGTTTACAAAGATAAACGGCCTCTTTACCCAGAGATCAAAACCTCAAACGACAAGGGGGAAGATAAAACCGCCCTCCCCCACATCCCCTGAGCTGACCCTTGTCATCTTAGACAAAGCCTTCAGTCCACTGGCCAGGGACCCTGTATATGGCCAATTCAAGAAGAGGGCCAAGAAATCAGACCCATCCATTCCCGTGATATAAAGTTGAACAGAAGCTACACCAAGGGTCAAGTGTCTGTATTTTACAGGACACAGTAACCAGGCGGCTACTTATAAAAAAAAACAAGATTCATTTCAGGCACAACTTTTTTATTTTTTTTTGTTTTGTTTTTAAATCAGTAAAAGAAACCGGGTCCTAGAAGCTGCAGTGATCTAAGCAGCAGCAAGTTTGTGCATTCATTTTTTTTGTTTTTGTTTAAATATGTTTAAATTATCACACTGCTGGCACTCCTCATTTGCATGAAATTCTGCACCATACTTACTAATTGTAGTAAAGTTACCCCCCAACCCACGAAAAAAAACCTACTCTGGAAGAAAATTTTCACTGAAATATAACCAAACTTCTTTAAGTGGATTGTGACAAGATTATAAATGATATGAAAAATAACATTTTAAAATTTGGCCATCAACTTTAAGAAATGGTTTGCCTATACAAATTTTTGTAATTTTTAAAAGATAATATATTCTACCCTCATATGGTCCTCAGAATTAAAGCATAATGAACAGGAAGAAAAAGGAAAAGAATGCAACTGAGTGCTAAGGCAGAACATCTTGCCAGAAGTAATTAATGAAGGTAGAGTATATAATGAAAAGTGCAGAATTTCATAGGGCCAACAAGATAACAGTCTATATTTTTCACTTACACAGGCAAAGTGGATTCTGCAATTACCAGTTGCGTTAAATGCACCAAATAAAGCTCCTAAAATTGATACTATAAGGCGCCACCTTAAGTTTTTCCAGGCTGCAACTGTGCATTATTTAAAATGGTTTTCTTAAATTTATTTATTTTTTTAAACATAACACGAGGAAGGTGTTAAAACTGGTGTAATAGCTCAATAGAATAAGTATTCCAGATTTCGGGAGGGATGAAGAGGGAGATATTCAGAACCCTTCACCAGATTCCCCCCAACTTGATCATAGTGGATTAATGGTGTGCTTTGTGGATGTGGTTAGTC
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Task1_train_1438
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Here is a variant affecting NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Increased nuchal translucency
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Task1_train_1439
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This variant affects gene NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase) located on Chromosome 1. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
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Pathogenic; Noonan syndrome 6
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TAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTTTCTCTCCTCTTATTCCTTTAATACAGAATATGGGTAAAGATGATCCGACAAGTGAGAGACAGGATCAGGTCAGCGGGCTACCACTGGGCCTCACCTCTATGGTGGGATCATATTCATCTACAAAGTGGTTCTGGATTAGCTGGATTGTCAGTGCGCTTTTCCCAACACCACCTGCTCCAACCACCACCAGTTTGTACTCAGTCATTTCACACCAGCAAGAACCTGTTGGAAACCAGTAATCAGGGTTAATTGGCGAGCCACATCTACAGTACTTTAAAGCTTTCTATAATCAATGGAAATGAAAACCCTAGTGTGACCTTCCATTTGGTTCTTAAAGTGACTAGAGAACGCAAAAACACCGGATTAATATCGGCCTCACACTTCTGGAGTAGTTTTCTAGCAACCCCCATCCTTAGCTATTTTTCAACAGTCCTTGGGCCCCGCCCTCAGCCTAAGCAATGGAAATCCCCCTTCCTATTACTCCCCGAAGGCTTCTCAGCTCTAGCAGGAAGCCTCCAGGCCGCAACTCCTTCCCATTCTCCCTTCTGTCTCCAAAGATCTCCCCACGTAGGCACCAAATGGAAGGACCCCCGCCCAAGGCCTTTGTCTCCAGCTGATAGATTCTGCTCCATTTCTGGCATCAGTGAAACGCCTGAACATTCCACAGCCCAAAGCCGAACACTATGCATGAGATAAACTTACCTCAAGCTCCACTGCCTCTGCTTTGGACAGATTTAGGACCACAGCCGGGAAAAATGTTGGAGACCCCGGAACCGCCATGAACAGCCCCCACCAAGGAGCGGCACTTCCGGCCCCGCCCGCTACGTAATCAGTCGGCGCCCCAGGCGCCTGAGTCCCCGCCCCGGCCACGTGGGCCTCCGAACCACGAGTCATGCGGCAGGCCGCACCCAGACCCGCCCCTCCCACACGGGACGTTTCAATAATGAAAGCGCTAGGTGCTAGTGTCTCAAAAATCAGTAAAACTTTATTCGCTTCCATTCTTTCGCCATTAACAGAAAACTGGAGAAAGCAAAAATGTTTCGTGTTTACAAAGATAAACGGCCTCTTTACCCAGAGATCAAAACCTCAAACGACAAGGGGGAAGATAAAACCGCCCTCCCCCACATCCCCTGAGCTGACCCTTGTCATCTTAGACAAAGCCTTCAGTCCACTGGCCAGGGACCCTGTATATGGCCAATTCAAGAAGAGGGCCAAGAAATCAGACCCATCCATTCCCGTGATATAAAGTTGAACAGAAGCTACACCAAGGGTCAAGTGTCTGTATTTTACAGGACACAGTAACCAGGCGGCTACTTATAAAAAAAAACAAGATTCATTTCAGGCACAACTTTTTTATTTTTTTTTGTTTTGTTTTTAAATCAGTAAAAGAAACCGGGTCCTAGAAGCTGCAGTGATCTAAGCAGCAGCAAGTTTGTGCATTCATTTTTTTTGTTTTTGTTTAAATATGTTTAAATTATCACACTGCTGGCACTCCTCATTTGCATGAAATTCTGCACCATACTTACTAATTGTAGTAAAGTTACCCCCCAACCCACGAAAAAAAACCTACTCTGGAAGAAAATTTTCACTGAAATATAACCAAACTTCTTTAAGTGGATTGTGACAAGATTATAAATGATATGAAAAATAACATTTTAAAATTTGGCCATCAACTTTAAGAAATGGTTTGCCTATACAAATTTTTGTAATTTTTAAAAGATAATATATTCTACCCTCATATGGTCCTCAGAATTAAAGCATAATGAACAGGAAGAAAAAGGAAAAGAATGCAACTGAGTGCTAAGGCAGAACATCTTGCCAGAAGTAATTAATGAAGGTAGAGTATATAATGAAAAGTGCAGAATTTCATAGGGCCAACAAGATAACAGTCTATATTTTTCACTTACACAGGCAAAGTGGATTCTGCAATTACCAGTTGCGTTAAATGCACCAAATAAAGCTCCTAAAATTGATACTATAAGGCGCCACCTTAAGTTTTTCCAGGCTGCAACTGTGCATTATTTAAAATGGTTTTCTTAAATTTATTTATTTTTTTAAACATAACACGAGGAAGGTGTTAAAACTGGTGTAATAGCTCAATAGAATAAGTATTCCAGATTTCGGGAGGGATGAAGAGGGAGATATTCAGAACCCTTCACCAGATTCCCCCCAACTTGATCATAGTGGATTAATGGTGTGCTTTGTGGATGTGGTTAGTC
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Task1_train_1440
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A mutation in NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase), located on Chromosome 1, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_1441
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Here is a genetic alteration in NRAS (NRAS proto-oncogene, GTPase) on Chromosome 1. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Neoplasm
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TAACTATTCAAGCCCATTTCTGCCTATCTGGTTTGTCCCTCAAATTGCTAATATATAATCACAAACAAAAAGTATCCAATATCACCCTACATAAAAGAAAACCCACCAAATTCTATATGCCTGCAGAAAAGAAATATGGTCACTGTGTTCCTGGAAAAGATTAAGAAAACACAGTAACTCAAATGACAACTCTACTGCAGCCAGGAGGCTACAGATTAAGTACCCAGTGTATTTCACTAAGCTATGAACTGGACTGTTTTATTTGTGCTGTTTATTTTACTTAAAGAAATCTAAACATACCTCCACCAATTATAACCTGGCCCTATATACATCATTTGTGTTTATGACTAAATATACAAATACCTTTGTTTCAGAGAAGGTTTTTTTTTTATCATGACAGATGTACCTTTGGGAAATATTCCTGAATCAAATTCTTAAAGGTTCCAAACAAGGTATAGTTATGTTTAATTTCTCAGGAAGACAAACATGCATAGATCATATAAAAAATACTTTCATTTTGGTTTTATGGCAACAGGACTTTTACTTGTATTTTAATGTCATCACACTTGGAGAACTCTCTGGAGTACTGGAAGTGCTCTATACTGTTATCTGGGTGGTAGCTACATGACTATATAGAAACGCAAAAAGCACTGGGCTGTAGACATAAAATTTATGTATTTTACTTATGTAAATTGCTCAATAAATCAAACATTTAAAAATATTTAATTAAAATATTAAACATTTCATGTAAAATATTAAAGCTGTTAAGCTCAAAATAAAGATTTTGCCAAGGGTTAGCAACCAATTTTTTATAGTGGCTACATTAGAGTTAGTTTTCATCAATTAAACACGAGTAGCCAGATGGTAGGGAGGCCAGGTGTTGATTAAAATAATCTCTAAAGTTAGGCATTTCTAAACTGAACAAAATTACAAAACCCTTTATTTATTTATCTATTTATTTATTTTTTGAGACGAAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGGTCTGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGTCCGGCAAAACCCTTTATTTAAAGAGCCTTAGGTGCCACTTACTGAAGACAATCTGTACCATGAACTCTCATAATAACAATAGAATCCCTAAGTACTATTACATAGTGCTTTACCATTCATAAATAACTTAAATATATTATTTAACTTTCCATAACATCCCTGTGTGGTAGGCAGGACAAGTTTATGGTAATTTAAAACATGAGGAAAATGAGGTTGGGAGAGATTCAGTTGCTCAATATCACACAACTAAATAAACTGCAAACAGGGACCAAAATCCTAGGCATAAAGACTAAAAATCTCAAGTTCTTGCTACTCCAATCATCTGGTCTCAGCTGCTTCAACTAGCTAATAAATAAATATTGAAGAACACTCATCTCTGAATCCTTTATCTCCATCCTATTATCTCCCATACAATCAGACAGTCTCGCTACTATGGCCTGTGTTTCTCATGTAATAGAGCTGTTATATATGAAGAAACTCATGAATGAACTCAACACTGAGTTTGCAATAGTTTACAGAACTGTTAAAAACTGGACAGGTTTTAGAAACTTCAGCAGCTAATAAAAATGAACTGTTCTCTATAAACACGTTAAGCTTATTGCATAACTGAATGTATACCCAAAATAACTTTTTACTTTCTCTCCTCTTATTCCTTTAATACAGAATATGGGTAAAGATGATCCGACAAGTGAGAGACAGGATCAGGTCAGCGGGCTACCACTGGGCCTCACCTCTATGGTGGGATCATATTCATCTACAAAGTGGTTCTGGATTAGCTGGATTGTCAGTGCGCTTTTCCCAACACCACCTGCTCCAACCACCACCAGTTTGTACTCAGTCATTTCACACCAGCAAGAACCTGTTGGAAACCAGTAATCAGGGTTAATTGGCGAGCCACATCTACAGTACTTTAAAGCTTTCTATAATCAATGGAAATGAAAACCCTAGTGTGACCTTCCATTTGGTTCTTAAAGTGACTAGAGAACGCAAAAACACCGGATTAATATCGGCCTCACACTTCTGGAGTAGTTTTCTAGCAACCCCCATCCTTAGCTATTTTTCAACAGTCCTTGGGCCCCGCCCTCAGCCTAAGCAATGGAAATCCCCCTTCCTATTACTCCCCGAAGGCTTCTCAGCTCTAGCAGGAAGCCTCCAGGCCGCAACTCCTTCCCATTCTCCCTTCTGTCTCCAAAGATCTCCCCACGTAGGCACCAAATGGAAGGACCCCCGCCCAAGGCCTTTGTCTCCAGCTGATAGATTCTGCTCCATTTCTGGCATCAGTGAAACGCCTGAACATTCCACAGCCCAAAGCCGAACACTATGCATGAGATAAACTTACCTCAAGCTCCACTGCCTCTGCTTTGGACAGATTTAGGACCACAGCCGGGAAAAATGTTGGAGACCCCGGAACCGCCATGAACAGCCCCCACCAAGGAGCGGCACTTCCGGCCCCGCCCGCTACGTAATCAGTCGGCGCCCCAGGCGCCTGAGTCCCCGCCCCGGCCACGTGGGCCTCCGAACCACGAGTCATGCGGCAGGCCGCACCCAGACCCGCCCCTCCCACACGGGACGTTTCAATAATGAAAGCGCTAGGTGCTAGTGTCTCAAAAATCAGTAAAACTTTATTCGCTTCCATTCTTTCGCCATTAACAGAAAACTGGAGAAAGCAAAAATGTTTCGTGTTTACAAAGATAAACGGCCTCTTTACCCAGAGATCAAAACCTCAAACGACAAGGGGGAAGATAAAACCGCCCTCCCCCACATCCCCTGAGCTGACCCTTGTCATCTTAGACAAAGCCTTCAGTCCACTGGCCAGGGACCCTGTATATGGCCAATTCAAGAAGAGGGCCAAGAAATCAGACCCATCCATTCCCGTGATATAAAGTTGAACAGAAGCTACACCAAGGGTCAAGTGTCTGTATTTTACAGGACACAGTAACCAGGCGGCTACTTATAAAAAAAAACAAGATTCATTTCAGGCACAACTTTTTTATTTTTTTTTGTTTTGTTTTTAAATCAGTAAAAGAAACCGGGTCCTAGAAGCTGCAGTGATCTAAGCAGCAGCAAGTTTGTGCATTCATTTTTTTTGTTTTTGTTTAAATATGTTTAAATTATCACACTGCTGGCACTCCTCATTTGCATGAAATTCTGCACCATACTTACTAATTGTAGTAAAGTTACCCCCCAACCCACGAAAAAAAACCTACTCTGGAAGAAAATTTTCACTGAAATATAACCAAACTTCTTTAAGTGGATTGTGACAAGATTATAAATGATATGAAAAATAACATTTTAAAATTTGGCCATCAACTTTAAGAAATGGTTTGCCTATACAAATTTTTGTAATTTTTAAAAGATAATATATTCTACCCTCATATGGTCCTCAGAATTAAAGCATAATGAACAGGAAGAAAAAGGAAAAGAATGCAACTGAGTGCTAAGGCAGAACATCTTGCCAGAAGTAATTAATGAAGGTAGAGTATATAATGAAAAGTGCAGAATTTCATAGGGCCAACAAGATAACAGTCTATATTTTTCACTTACACAGGCAAAGTGGATTCTGCAATTACCAGTTGCGTTAAATGCACCAAATAAAGCTCCTAAAATTGATACTATAAGGCGCCACCTTAAGTTTTTCCAGGCTGCAACTGTGCATTATTTAAAATGGTTTTCTTAAATTTATTTATTTTTTTAAACATAACACGAGGAAGGTGTTAAAACTGGTGTAATAGCTCAATAGAATAAGTATTCCAGATTTCGGGAGGGATGAAGAGGGAGATATTCAGAACCCTTCACCAGATTCCCCCCAACTTGATCATAGTGGATTAATGGTGTGCTTTGTGGATGTGGTTAGTC
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Task1_train_1442
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This alteration in TSHB (thyroid stimulating hormone subunit beta) on Chromosome 1 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
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Pathogenic; Isolated thyroid-stimulating hormone deficiency
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Task1_train_1443
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting NGF, NGF-AS1 (nerve growth factor| NGF antisense RNA 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; not specified
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AGTGCCGCGGGCAGCACTCCAGGACCCTCTTTGTTGGTGTAGCTGCTCACAAGCCAACCTTCCTGATGGGGAGCTTCCTGAAGGCCTCCCTCTCCACTCCTCTCCCCACATCCCAGGCCCAAAGTCCAGTCCTAAGAGAAAAAAAGCCACCCAGAAACTTTGTAGGGGCACCTAGGACGGCTGAGACCACTGGCATTGGACCCCAGTAAAAGTCACAGACACAGATCACTGGGAGGGCTCCTCCCTGAGGCCTTTATCTCACTTAGAATCTCAGCACAGAATGTTCTAGCTGGTGTTTCTTGAGCATAAACCTTTATTCCAATTGCAGTGGCTCTGATAGAAAAAACAGGGCACATTTCATCATACTTCTACCCTAATCAAATGGCTCTCATGCCAAAGCTCCCTACGTTTCTAATTTGCCCTATTTGGATGGCGTTGGAGGTGGGGCCGGACAGCGAGAATTACAGAGGGAATGAATAAGACCATTTGCTCTTTTCTCGGATGGACAATTTGGGCCTGTTCTCTTGAAAACCAGTGTAGGCATTTCATCCTCGGGGGGAGACAGGATGGATAGGAGGGGAAATTTTCTGTCTTAATATAAGTGCTCTGTCTGGGGGAATATTGTGGCTTCAAGGAAAATACAAAATGAAAGTTGCAGGGGAAGGGGGTCGTGTGAGGCTGGGTGGAGCCCTGCTGCAGGCTGAACCCTGGAGTCCCTCTGTCACCTTCACTCCTAAGATGCTCTGGATGGAGTCAGTGTTTATTAGCACATCCAAAAAGCCCCACAAGAACCACCCAGGTTGCTAACTTTCCTGGAGGCTGGAGAGTGCTGGTAAAGATGAGAGATCACACCTCCCTCCTCCTCCTGCTCTGTCCTCCCCTCCCCTTCTTCACATCCACCTCTGGCCTTCTCTTTGTCATCCTTGTTTCATTTCCCCTGTTTGGGAGAAGCAGAAAGCCGTGGTTTCCTGCCGGCCCACCTGTCCTCCACATCTCCAGGTTTATTTGGTTCTTACTCCATTTACTTAGTCTTTCTGCCCCACCCTCTTCTCTGCAGGTCCCACGGCCCCAGTCACCTTTGGTCACTTATGGAAATCATCCAATTAAGAATAAAAATATTTTCAGAAGTTCTCTCCCGTCTCTGGCTTCCCTGGCTGTGGGCTGATGGTGGGGCCCCTGGAAGTTGCTACTGTGGCTGTTAGTGGGTTGCAAGAGTGTCGGAGGCACTAATGTTTTCTTGGGGTAATGAAGTCTTTCTGCAGGAGGCTGCTGAGGGATAAAACGAGTACTAAGGCCAGCTGAACATGAAACCAGATCTACTTTGACAGGCCTCGTGAGATTACTCTGTTACAACTCTTCCAGACAGCACATCTCCCTCTACAAATGAGCAGCTCACAGATCTTTGGTACAAGCCTCTTCCTGTCTATCGAGTGCCCCCAGGACTGAGACTGTGCCTCTGAGGCCAGGGCAGCCCCATGCCCAGTGGTGATCTGCCTCCTGATGAGGCTCCACTAACTTCTCCAAGGGAGGAGACCAGGGCCCATGCTTCCAGGCCGTGGGCAGGTAATCCAATGATTAGGTAGCTTTGGCTCTGGAATGTAGAACAAAGTTGCAATCCAGCAGGCTTCCTTTGCTAATCATGCCTGGCTTAGGCTAATATCTGAAACCAGTTAGCCTTTCCTGAAGTTGCAGCACTGGCTGGGGGTGGGGTAAGGGTTACAGGTGGGCCTTAGAAGGAGCCAGGGGGTGCTTCAGACAATTCCCCCTGCATCTTCCTCAGACTTGCAGATGATTTTACTCAAAAAAAATAACCAGCATCAGCACACAGGATGCTTCCAAAAATTTAATAAATAATGATTCTTTAAAACTGTATAAACTATAAATTACCATGCAGTCCTTATAATTTAAAATAATTTACAGGTTGAGGTAGGGAGGGGCCCAGGAGAGTGTAGAAGGGGCAGGGGGAGGGAGCGTGTCGGCAGGTCAGGCTCTTCTCACAGCCTTCCTGCTGAGCACACACACACAGGCCGTATCTATCCGGATAAACCGCCAGGCAGCCTGCTTGCCATCCATGGTCAGCGCCTTGACAAAGGTGTGAGTCGTGGTACAATATGAGTTCCAGTGCTTTGAGTCAATGCCCCGGCACCCGCTGTCAACGGGATTTGGGTCCCGGCACTTGGTCTCAAAAAAGTACTGTTTGAATACACTGTTGTTAATGTTCACCTCTCCCAACACCATCACCTCCTTGCCCTTGATGTCTGTGGCGGTGGTCTTATCCCCAACCCACACGCTGACACTGTCACACACCGAGAATTCGCCCCTGTGGAAGATGGGATGGGATGATGACCGCTTGCTCCTGTGAGTCCTGTTGAAGGGGGCAGCACCACCGACCTCGAAGTCCAGATCCTGAGTGTCTGCAGCTTCACGGGGAGGCTGGGTGCTAAACAGCACACGGGGTGAACGGAGTCGCCGCTTTTTAAACAGCCTGGGGTCCACAGTAATGTTGCGGGTCTGCCCCGCCACGCGTGCAGCTATCGCCGCTGCCGGGGCGCTGCGGGCTCTGCGAAGGGCAGTGTCAAGGGAATGCTGAAGTTTAGTCCAGTGGGCTTGGGGGATGGTGTGTCCTGCAGGGACATTGCTCTCTGAGTGTGGTTCCGCCTGTATGCCGATCAGAAAAGCTGTGATCAGAGTGTAGAACAACATGGACATTACGCTATGCACCTGGAATGAAAAAGAAATGAGGGTGACTTCATGGAGTACTAAATGCAGTCAAAAGGCAGTTTCTGGGTCCCTCAGAGTTGACCTCCCAAGGGGATCACGAAGAGGTTTCATTCAAACCGGGGCACTTCTGAGAGGGAAAGGGTGTGCTAGCAATGGTTATACCGGGACAACAGGCGTAACCCGGGGCTGACTCAGGCAGTATGGATGTGTGGTCACCCCATCCGAGCTTCTCCAGGAAGTGACAGAGCCCCTGAAATTTTGCCCAGTAGTTCGATATGAGCTTGGAGACATCACTTACAGAGTCCTTTGAGTTCTCTGAAGCTTAAGGCGGCTGAGGGAGGTGGTAAGTGTCCATGTGTGTACCAGGGAGGCCGGTGGGGAGAGTTTAACATCTCTCCCTGGCACTTGTGCCTTGATGTGATGGTGCCGTCCTGCTCAACAGTTTTGAATCCTCTGGGAAGGCACGGGGAAGATCTGCTGGGGACATGTCTTGAAGCCTCAGAACTGGGTACCCCCTTTCAGACAGTGCACTGGGTCAGCTCTAAGATCTGGTGACTCGGAGCCCTTGTTATGAATTCACAAAGCGTCATGTTTGGCAAAAACCTTGTGGCTCTGGGACCATCTTAGTCCAGGCACCTCTTCAGACGCTACCCCACATATATAAATGTGGACCACATAATAGTTCCTCTTTGTGTGATGTTTTTAAAATGTGTTCACTTCTATCTTCTCATGAGTCTGTGAGTTCAATTAGGATTTATCATATTTATTTCACATATAAGGAAACTGATTCACAGAAAATGAACTAACACTAAAGCACTGAAGTCACAAATGAAAACTGAACCAGAAATAGAATCCAAAGTTGACCCCTTACTAAGCTAGTGTCCTTCCATCCACCCTTCCTTCTTTTCTCCCTCCCTTTCTCTTTCACTCTTAAGCATGTCTTTTCTTTTTATTGTTTGTTCTTATGTGACTATAGATCAAATGGTATGGCTCTAACTGTCCCCAAGAGGACTCCATACTGCACTGCAGTTACCCCACAAATAATCCCCCAACTTGGTCAAGTAATTGTGGAATTAGTTCTGCTCCTGGAGGGCCTCTCACTGGCCTCCGCGGAGCTCCTATGCATACTTGTAGATGTGTAGCAAACGTCAGCTCCTCTGTAAAGCTTCCATAGATCTTCCTGGTAGGATCAGAAATATCTCTTGTAAGAGTGCTCTACAAACTTCCAATTCTATCCTTTCTCCCATCTCTCCTTCCCACTCTTATGGGTCATTCTGCTCCGTTTCCACACAGATACGACCTAGTCCTCGAAGCCTTCTCAGATCACTCCAATCAAAAATGATCTTTTGCCATTCTGCACTTCAGAATAGCGTAA
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Task1_train_1444
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This sequence change occurs on Chromosome 1, altering CASQ2 (calsequestrin 2). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
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Pathogenic; Catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 2
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Task1_train_1445
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This is a variant in CASQ2 (calsequestrin 2), located on Chromosome 1. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 2
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CCATTTGTCACTATCCACATATACAAGTGAAGTCTCTTGTCCAAGGTGACCATCAAGAATTTGAAGAGATCATCATTTAAAATCTTGATAAGGAATTTCATGTTGCTATTTTAAGCATAAAACCTAATATCAAAAAGCTATATCCTGGGTTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAACACTAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCAACAGAGCAAAACTAGGTCTCAAAAAAAAGCTATATTCTTGAGGCAAGCATAAGATTCTCATTCAAAATTTTTTTTAAAAATTGGAGGTTTTTTACAATGCAATATGTAATATATTTCATATTACTTTTGTACACCATACTAGCCATGTGATAATGGGCAAGTTAATTGCACCTTTCTGTTCCATCCTTTCATCATCATTAACATGCAGGTAATAATGATAATCACCTCACAGGCTTGTTGTGAGAATGAAATTAAGGCATCCATATAAGCTCCTAGCATAGGCCCTAGCATATGAAATGTGTTAATTAAATACTATTATCATGATGATTCGTCTAGGCGGGGGAAGACGCCAAGGGTACTGAAAGGTGTGCTCTTTATCCTAACCTTGTTTTGCTTCCCTCTTATCTGCCATCCTGAGCTACATGGATGAAGAGGATAGAGGAACATAAAGATGGAAACAAATTGAGACAGACGAACTGAAAAGGAAGGGGAAGGAGAAGCACCCCAGAGTAGTCAGCACTGATACGGAAATGTACAAACTAAAATAAAATTGCCTAAAGAAGAACTGGGGCAAATCTCCCTGGTTAGCCACCTCCCTCTAGCACATTCATTTTAAGCACTGTAAATGGAGGTTTTAATGAAGCAAATGAAAAGAGGGTTAAGTTGGGGCATGGGAGACAGAAAATGAATGGGTTGTTGATGAGGTGACTAAGGATGCTAGTGGGAAGACTGGTTAAAGAAATGGGTTTGCAAACAATTTCAGAATATTTTGGGGTTCTCAGAAATAGTCATAAGCAGCCCACATTTGTACTTCCTACGTGTATGAATGCTACCAGAGTTATGCTCACCCGCTCTAATGCTGTTCCTCTCTCCAAGGCTGAGATACCAGAAAAAAGCCTACCTCACGGGGGCCATGCTGCCAAAGCAGTTTTAAATATGTACAGTACTCAAGTGCTTACTCCTCCTGGTCCCTTCTGCCTGCTCTTCCTGACTCACCCCCACCACCCGCTCATCCCTATATGGGCTGTAGTGATGTTATCATAGGTTCTGTGTCCACCCAAAACCTGGTCACAAAGCTTTCAAAGGGAATATGTCCAAGGGTGTGGCTGCACTATGACAGGTAGCCTTGGTGGTCAGCTGTGGGCTTGGCCAGCGATTTTTCACATTCTGTAGCCACTGCTAAGCCCATCCCTACCCCAATTTTCCACTCATGCTTTCCAATTGACTGCAAAGCTCTCCAGCTGGTGACCATAGGAGCTACCAATGCCAGGGAGACAGCCCATTGCTTGTCCCATTGTAGGGGAGAATCCGACTGGGAGGTGGGTAGGCAGGAAAAGTGGAGAAGAGCTTTTCTCTTTTTTGTAGAACACTCAGCCTGCTTTAAAGCTGGAGAACCTGGCCCCTCCTTAATATTCTTGCAGCTTTCCTGACTGTTTTGTACAATTTTTGCACATGTACTCCACTGTGTTAGGCTCAGGAAGAATTCTAACTTCTATTCTACCCAGCAAAAGAGGTGCTGAAGACCCATCCTCTTTTGGGGTAACCTGACATACCTTGTTTGGAATCTAGCTTTTAGACTGATCGGCTGGGGTTGGCAGACAACTTACATTCTGAGTCCTCACTCTTGAAAAAGCCAATGAGTTTGATGTAGTCTTCAATGCGTTCGAAGGCTTGGACTTCCAGTTTGCTGCTGATGATCTCCACTGGGTCTTCAATTAGCTGAAATGCCACACGCACATACACACATGTTCAAACAAGAGATTTCCTTCTTCACTGGGGAAACAGAGTGCATTGGAGGGAAGTTGTAGCGGACTTTGTGGTTGGTGCCTCAAATATCTATTCCATTCTCCCCACAATCCCCCAGTGAGCATACCAGCAGTACCTTCTGAGGAATAGAACTTAACTTAAAGAGTTAAATGATTGGTGGGGGCAACCTATTCCTTTTGCCAGTTTTAGAAAACATTTATTTTTAATTGTAGATTGACAAATTATAGTTGTATGTATTTATTGGATGTAAAGTGTTGCTATGATCTATAAATATGTGAAATAATTAAATCAAGCTAATTAACCTATCCATCACCTCAAATATTCATCATTTTTTGTGGTGAGAACATTTGAAATTTACTCTTTTAGTGATTTTGAAATATGTAATACATATTATTCACTATATTCACCATGCTGTACAATATATCTCAAAGAACAAAATCTTATTTCTCCTGTCTAATTGAGGCTTTGCACCCTTTGATCATTATCTCTCCATTCCCACCACCCCCACCCCATCCTGCTTTTGGCAACTACTCTCTGCTTCTCTGAGTTCTCGTGTTCTAGATTCCACATATAATAAGTGAGAACATGTTGTATTAGTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTTAACATAATGTTCTCCAATTCCATCTGTATAGTTGCAAATGATAGTTTTCTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAGCTGAATAGTATTCCCTTGTGTATGTATAGCACATTTTCTTTTCTTTCTTTTTGAGATGGAGTCATGCTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACGCCCACCACCATGCCCAGCTAAGTTTTTTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTATTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCAGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCTCCGCCATGTACCACATTTTTTTTAATCCAGTCATCTGCTGATGGACATTTAGGTGGATTTCATAACTTCCCCTGCCAGTTATTGATTCAGGAATGGGCAAGTAACTGGCCCAATAAGGACAGATTTGCTGAAGGCTTTGGGAAAAGTTCTTTACTCTTAAAAGGGCAATGGGAAGCCAAATTTGTTTTTCTGTCATGAAATATGAATGAGGAAATGCAATGTATTTGTTCCTACTGCTGGCCATCTTATAGCTAACTTGAGAATAGTCAGCTTGAGGACACAAGCAACATACTGAAAACACAGTTATCTGTGATTTACAGAGAAAAATGGAGGCAGTGTCTGGATTCGATCAAGTCTAAAGTCTCCTCTAACTAGAGCCTTCTACTTAGGTAAGTCAATCACATTGTTTATTGTTTGAAGCAGTTAGTCTTATTTCCAAAAGCCTCCCCCTAGCTGATAAAGCTGGGGCAGCACCATGCTGTCCCAGAGTTGTTCTGTCACCCCTCTCAACTTTTTTAGGGCATGTGGGTGTGAGTCAATGAGATGGCCAAGCACAGTGCGTCATGAGATGGCACTTTTTTTGGTAAATGTAGCTTCCAACTCACTTCTGACCTTCCCTCTGGTTTTTGACACTGTAGAGAAAGAATGATAGACCACTGGGTACTGGCTGGTAGATAAAGAATCATCGGCATGGATGCTCAACACTAGGTTCTTTATCTGTGCAAGAATATGTGTTCAAAGCATTGAACTTCACAGCGGTTACTGCAAGTGTGAGTTTATCTATGGATGAAATATTTTTATAATGTTTGTTCCTATGTTTGTCTAAGCATATGGATATGAGGCTGTGCTATGTCCATGGCTGAAAAAGTGTGATACTGGGGGGCTGTTTAGCTC
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Task1_train_1446
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This is a variant in ATP1A1 (ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1), located on Chromosome 1. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_1447
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This variant affects gene ATP1A1 (ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1) located on Chromosome 1. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
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Pathogenic; Aldosterone-producing adrenal cortex adenoma
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Task1_train_1448
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Here is a genetic alteration in ATP1A1 (ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1) on Chromosome 1. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Hypomagnesemia, seizures, and intellectual disability 2
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Task1_train_1449
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A mutation in ATP1A1 (ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1), located on Chromosome 1, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; Hypomagnesemia, seizures, and intellectual disability 2
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TCTCCGTCTTTGTCTCCCACTTCTTCTCAATTACCACTCATTACTTAATGGTTATGAACTCATTACTTAATGGTTATGAACAGCTGTTGCCTTCAAGGCTCATCCATTCTTCCTTCGTTTCCATTTCCTCTCTCTACCACCCACGTTGTAGATGCTCTTACAAGTGGGATGCCCACCTGCATGTGCTGCTGTGAGCAGGCAGCTCTGCTCAGGCCCCGGCCGCCACCCACTGGATGGCAGAGCACAGCGATTCATGTTGGCACATCCACCTGTCCAGAAATGCTTGGTGGCCATTCTTCAAAATCCACAAGTTGGTTGAAAAACAATCTTTGTTTTATAAAGCAGGAGAAACTGATGCATCTAGAACCTTTCCAAACGTCCAGTTAGTGATCAAGTGTTGGTGTGCCTGACTCCATTTCTGACCCTTCCTGTGTGGTCTTTAGAAGGATAAATAAGAAAACATGAGTTCTATATTTCTGAAATCTTGGTTTCTCTATTAAAAATCTGTTTTTTATTCAGTCAAAAAATTAATTGAATGTCCCTAATTATTGTGTAGAGCCACGGGCCCTAACTTGTCTTTTCCCTTCCAGCTGTACCTGGGTGTGGTGCTATCAGCCGTTGTAATCATAACTGGTTGCTTCTCCTACTATCAAGAAGCTAAAAGTTCAAAGATCATGGAATCCTTCAAAAACATGGTCCCTCAGGTACCAGACGCTTTGTCCTTCCCCAGTGGATGACTTGACAGCCCCAAGCATGTCAGCCTGTGAATTAGTGTGAAGTTAAGGTTTTCCAAGTATTACATGACTCATCAGAGAGATGGATGTCTTCTACCCCACCCAAAACCAACCTATTTTCCTTCTATCCAAAAAGTGGTAGCCTTTCTTTTGAATGTAAACTCTGAATACAGGCACACCATGTAACAGCAATATCTCTTAAACTGGCGAGCAAGCTTTTGTAACTTGTGTAAATAAAAAAGTGAATAATATCTTTGTTTTGTATTCAGGTAATTAGGATTATGACTATTTTTATTTTCTTGTTTTGGACACTACCTTCTCTTTGTTGGTATACTAACGGTGTAAATTGTTTCTTTTCCAAAGCAAGCCCTTGTGATTCGAAATGGTGAGAAAATGAGCATAAATGCGGAGGAAGTTGTGGTTGGGGATCTGGTGGAAGTAAAAGGAGGAGACCGAATTCCTGCTGACCTCAGAATCATATCTGCAAATGGCTGCAAGGTAGCTCTTTTATTTTAACAAACCTCATAGCTAGCTCTGCTGTTCGGGCAGCTTGATTTGAGGGGTACAGTAGCCCATGATAAGGCTGGTGTATTCACATGACATTTTTCTTCTTTTCCTCACATATAGGTGGATAACTCCTCGCTCACTGGTGAATCAGAACCCCAGACTAGGTCTCCAGATTTCACAAATGAAAACCCCCTGGAGACGAGGAACATTGCCTTCTTTTCAACCAATTGTGTTGAAGGTAGGCCATTTTTGGGCACTTTGAGCATGGCGTGGTATTTCTCTTGGGCATTAACAAAATCAAAACCATAGGCACAATCTCTTGTTTTATTGGCTCCATTTCTGAGAACTTGTGTCAAGCACAGAGCAGAGGTGTTTTCCTAGCTGGCAGGAAACCTTGTGGCAGTTTCCCTTCCCTCCACCTCCACCCTGCCTCTTCTGTCAACAACACCAGTCTGGCATGGGTGTTGGAGCTGCTGTCCTGCTACTGGAGAGAAGTCCCTTTGCCAAACAGCATGTACAGCCAAAGAGCTGGCCCTTAAAAAGTGCTTTTATCAACTCTTTTTGTTTTTTTAGTCATCCTATGTAATTGTGTAAAATCCGTGGCTTCCTTCAGGTTAGATACAATTAGGTACAGTTCTCCCTCCCCTTCTTTTTAAGGCACCGCACGTGGTATTGTTGTCTACACTGGGGATCGCACTGTGATGGGAAGAATTGCCACACTTGCTTCTGGGCTGGAAGGAGGCCAGACCCCCATTGCTGCAGAAATTGAACATTTTATCCACATCATCACGGGTGTGGCTGTGTTCCTGGGTGTGTCTTTCTTCATCCTTTCTCTCATCCTTGAGTACACCTGGCTTGAGGCTGTCATCTTCCTCATCGGTATCATCGTAGCCAATGTGCCGGAAGGTTTGCTGGCCACTGTCACGGTAAGAGGCAGGTGATGGTCACCCTGACTCAGATCAGCTTGCACGAATGTTACACTCTTCCGCTATCCTATTCTAAGGTATTGCCAACTTATGTTTTATTCTGGATGTTTGATATAGTTCTTCTTGAGAGCCACATCACGTGGTGAATTTTGACAGTGAGAAAACCTCAGCATTTGTTTATACGTAAGATAACCCCAAAGCATACATTTTGCTTTTAAATTATCACGTGGTCCTGAACAGTGCAGTGGAGAAAGGAGAAGAACTTGGGATCAAGTAGGGGGATAGAATATGGTAGAATCCTGTTATTATTTTTCTTAATAGATTGCTTTTCTGGAAGGAAGGGGAAGCCTCATGTATGGGTTCCCCTTATTATTTCTTCAAACTTCAGAAGAAGGTTGGAGAGATTTAATTTTAGACAAATTTCTTCCACATTAGGATATAGCAAGAATCTGTATAGAATTCCAGCCTGGTTGAGTGAAGTAATAATCTTCCTAATATTTTTTAGGTCTGTCTGACACTTACTGCCAAACGCATGGCAAGGAAAAACTGCTTAGTGAAGAACTTAGAAGCTGTGGAGACCTTGGGGTCCACGTCCACCATCTGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACTCAGAACCGGATGACAGTGGCCCACATGTGGTTTGACAATCAAATCCATGAAGCTGATACGACAGAGAATCAGAGTGGTAAGGCCAGGGTTACCACACACCTCAGCCACCTGCTGACTTCGCTTGGTTTTTTTTCTTTTAAGAAATTGCATGAAATTTCTTTTTTTTTTTTAAGCTCATGGCAGCTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTATCATTTAGTGAAGAGTCAAGGGTATGGGATATTGATTTTTTGCATGTCAGTAGAAACTTTAAATTGCCCTACAAACGTGACTGAAGAATGCCTAAAATGTGATTGGTTTCATTAATTGGGAAATGAGATGTATCACTGCAGATTTCTATGGGACTTTAATAGGAGAACTGAGAACACAGCCTTTGAAGTTAATGCATTGTTGTTCTGTTGTGTTTTCTTGCCTCCATCAGGTGTCTCTTTTGACAAGACTTCAGCTACCTGGCTTGCTCTGTCCAGAATTGCAGGTCTTTGTAACAGGGCAGTGTTTCAGGCTAACCAGGAAAACCTACCTATTCTTAAGGTATGCTCAAGAGTTAACTAATGGAGGGATGTAGACAGCACATGAGAACTGCCATTTGAGTGTTAAAAGTAGCAAATTACCTTTGTGGTCTGTGTGACTGTTCACTGTAGAACACCTGGAGTGGTCTGTGCAGTACTTTGCTGTGTGTAACTTACATTGTGTTGCCTGTAGATCCTGATGTATTATAGGACCCCCTGCTCCATATAGGTTGATTAAAAAGGGAAGATGCAGTAAAAATCTGACCAAAGTGGGAGGGGAGGAGACGGAAGACAGTCTTTATTGGTGAAAAACCTAATTCATCTGCTTTTACTACTCTTGAGTTTATATGTTATCACCTAACCTAGTGGACAGTGAGAGCTGAGGGCTGCAGTGACTCCATAATCGTATTTGCATATTAGGATACAGTAGATTCCAGTAACTCCTTTAAGCCATTTATTTTCCTGAAATAGCTCAGCTTATCTTATCTTATTGGTTCTTAGCTTGTTTACTAATGATGTAAAAATAAGCTCCAGGCCAAAATAAGCCCAGCCTTAGCCTGTGGAATTCTGATGCAGTTTGAAATGATTGAGATTTTACTATGCTGCCCAAGTGAAGATGCAGTCTCAGAAGGATCATGAATTGTACAAAGTCCTGTAGGAGAAGAAAGCTATGTGAGGCTCTCTGGGTCCCACATTCTCTGTGAAGCTGCCTGTAGTAGTTGTGGGTATAAACTAAGTTGCCAAAGGGAATATGGCTTGGATGTAAC
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Task1_train_1450
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This variant affects the gene ATP1A1 (ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1) found on Chromosome 1. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
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Pathogenic; Hypomagnesemia, seizures, and intellectual disability 2
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TCCGTCTTTGTCTCCCACTTCTTCTCAATTACCACTCATTACTTAATGGTTATGAACTCATTACTTAATGGTTATGAACAGCTGTTGCCTTCAAGGCTCATCCATTCTTCCTTCGTTTCCATTTCCTCTCTCTACCACCCACGTTGTAGATGCTCTTACAAGTGGGATGCCCACCTGCATGTGCTGCTGTGAGCAGGCAGCTCTGCTCAGGCCCCGGCCGCCACCCACTGGATGGCAGAGCACAGCGATTCATGTTGGCACATCCACCTGTCCAGAAATGCTTGGTGGCCATTCTTCAAAATCCACAAGTTGGTTGAAAAACAATCTTTGTTTTATAAAGCAGGAGAAACTGATGCATCTAGAACCTTTCCAAACGTCCAGTTAGTGATCAAGTGTTGGTGTGCCTGACTCCATTTCTGACCCTTCCTGTGTGGTCTTTAGAAGGATAAATAAGAAAACATGAGTTCTATATTTCTGAAATCTTGGTTTCTCTATTAAAAATCTGTTTTTTATTCAGTCAAAAAATTAATTGAATGTCCCTAATTATTGTGTAGAGCCACGGGCCCTAACTTGTCTTTTCCCTTCCAGCTGTACCTGGGTGTGGTGCTATCAGCCGTTGTAATCATAACTGGTTGCTTCTCCTACTATCAAGAAGCTAAAAGTTCAAAGATCATGGAATCCTTCAAAAACATGGTCCCTCAGGTACCAGACGCTTTGTCCTTCCCCAGTGGATGACTTGACAGCCCCAAGCATGTCAGCCTGTGAATTAGTGTGAAGTTAAGGTTTTCCAAGTATTACATGACTCATCAGAGAGATGGATGTCTTCTACCCCACCCAAAACCAACCTATTTTCCTTCTATCCAAAAAGTGGTAGCCTTTCTTTTGAATGTAAACTCTGAATACAGGCACACCATGTAACAGCAATATCTCTTAAACTGGCGAGCAAGCTTTTGTAACTTGTGTAAATAAAAAAGTGAATAATATCTTTGTTTTGTATTCAGGTAATTAGGATTATGACTATTTTTATTTTCTTGTTTTGGACACTACCTTCTCTTTGTTGGTATACTAACGGTGTAAATTGTTTCTTTTCCAAAGCAAGCCCTTGTGATTCGAAATGGTGAGAAAATGAGCATAAATGCGGAGGAAGTTGTGGTTGGGGATCTGGTGGAAGTAAAAGGAGGAGACCGAATTCCTGCTGACCTCAGAATCATATCTGCAAATGGCTGCAAGGTAGCTCTTTTATTTTAACAAACCTCATAGCTAGCTCTGCTGTTCGGGCAGCTTGATTTGAGGGGTACAGTAGCCCATGATAAGGCTGGTGTATTCACATGACATTTTTCTTCTTTTCCTCACATATAGGTGGATAACTCCTCGCTCACTGGTGAATCAGAACCCCAGACTAGGTCTCCAGATTTCACAAATGAAAACCCCCTGGAGACGAGGAACATTGCCTTCTTTTCAACCAATTGTGTTGAAGGTAGGCCATTTTTGGGCACTTTGAGCATGGCGTGGTATTTCTCTTGGGCATTAACAAAATCAAAACCATAGGCACAATCTCTTGTTTTATTGGCTCCATTTCTGAGAACTTGTGTCAAGCACAGAGCAGAGGTGTTTTCCTAGCTGGCAGGAAACCTTGTGGCAGTTTCCCTTCCCTCCACCTCCACCCTGCCTCTTCTGTCAACAACACCAGTCTGGCATGGGTGTTGGAGCTGCTGTCCTGCTACTGGAGAGAAGTCCCTTTGCCAAACAGCATGTACAGCCAAAGAGCTGGCCCTTAAAAAGTGCTTTTATCAACTCTTTTTGTTTTTTTAGTCATCCTATGTAATTGTGTAAAATCCGTGGCTTCCTTCAGGTTAGATACAATTAGGTACAGTTCTCCCTCCCCTTCTTTTTAAGGCACCGCACGTGGTATTGTTGTCTACACTGGGGATCGCACTGTGATGGGAAGAATTGCCACACTTGCTTCTGGGCTGGAAGGAGGCCAGACCCCCATTGCTGCAGAAATTGAACATTTTATCCACATCATCACGGGTGTGGCTGTGTTCCTGGGTGTGTCTTTCTTCATCCTTTCTCTCATCCTTGAGTACACCTGGCTTGAGGCTGTCATCTTCCTCATCGGTATCATCGTAGCCAATGTGCCGGAAGGTTTGCTGGCCACTGTCACGGTAAGAGGCAGGTGATGGTCACCCTGACTCAGATCAGCTTGCACGAATGTTACACTCTTCCGCTATCCTATTCTAAGGTATTGCCAACTTATGTTTTATTCTGGATGTTTGATATAGTTCTTCTTGAGAGCCACATCACGTGGTGAATTTTGACAGTGAGAAAACCTCAGCATTTGTTTATACGTAAGATAACCCCAAAGCATACATTTTGCTTTTAAATTATCACGTGGTCCTGAACAGTGCAGTGGAGAAAGGAGAAGAACTTGGGATCAAGTAGGGGGATAGAATATGGTAGAATCCTGTTATTATTTTTCTTAATAGATTGCTTTTCTGGAAGGAAGGGGAAGCCTCATGTATGGGTTCCCCTTATTATTTCTTCAAACTTCAGAAGAAGGTTGGAGAGATTTAATTTTAGACAAATTTCTTCCACATTAGGATATAGCAAGAATCTGTATAGAATTCCAGCCTGGTTGAGTGAAGTAATAATCTTCCTAATATTTTTTAGGTCTGTCTGACACTTACTGCCAAACGCATGGCAAGGAAAAACTGCTTAGTGAAGAACTTAGAAGCTGTGGAGACCTTGGGGTCCACGTCCACCATCTGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACTCAGAACCGGATGACAGTGGCCCACATGTGGTTTGACAATCAAATCCATGAAGCTGATACGACAGAGAATCAGAGTGGTAAGGCCAGGGTTACCACACACCTCAGCCACCTGCTGACTTCGCTTGGTTTTTTTTCTTTTAAGAAATTGCATGAAATTTCTTTTTTTTTTTTAAGCTCATGGCAGCTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTATCATTTAGTGAAGAGTCAAGGGTATGGGATATTGATTTTTTGCATGTCAGTAGAAACTTTAAATTGCCCTACAAACGTGACTGAAGAATGCCTAAAATGTGATTGGTTTCATTAATTGGGAAATGAGATGTATCACTGCAGATTTCTATGGGACTTTAATAGGAGAACTGAGAACACAGCCTTTGAAGTTAATGCATTGTTGTTCTGTTGTGTTTTCTTGCCTCCATCAGGTGTCTCTTTTGACAAGACTTCAGCTACCTGGCTTGCTCTGTCCAGAATTGCAGGTCTTTGTAACAGGGCAGTGTTTCAGGCTAACCAGGAAAACCTACCTATTCTTAAGGTATGCTCAAGAGTTAACTAATGGAGGGATGTAGACAGCACATGAGAACTGCCATTTGAGTGTTAAAAGTAGCAAATTACCTTTGTGGTCTGTGTGACTGTTCACTGTAGAACACCTGGAGTGGTCTGTGCAGTACTTTGCTGTGTGTAACTTACATTGTGTTGCCTGTAGATCCTGATGTATTATAGGACCCCCTGCTCCATATAGGTTGATTAAAAAGGGAAGATGCAGTAAAAATCTGACCAAAGTGGGAGGGGAGGAGACGGAAGACAGTCTTTATTGGTGAAAAACCTAATTCATCTGCTTTTACTACTCTTGAGTTTATATGTTATCACCTAACCTAGTGGACAGTGAGAGCTGAGGGCTGCAGTGACTCCATAATCGTATTTGCATATTAGGATACAGTAGATTCCAGTAACTCCTTTAAGCCATTTATTTTCCTGAAATAGCTCAGCTTATCTTATCTTATTGGTTCTTAGCTTGTTTACTAATGATGTAAAAATAAGCTCCAGGCCAAAATAAGCCCAGCCTTAGCCTGTGGAATTCTGATGCAGTTTGAAATGATTGAGATTTTACTATGCTGCCCAAGTGAAGATGCAGTCTCAGAAGGATCATGAATTGTACAAAGTCCTGTAGGAGAAGAAAGCTATGTGAGGCTCTCTGGGTCCCACATTCTCTGTGAAGCTGCCTGTAGTAGTTGTGGGTATAAACTAAGTTGCCAAAGGGAATATGGCTTGGATGTAACTC
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Task1_train_1451
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Here is a variant affecting ATP1A1 (ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Aldosterone-producing adrenal cortex adenoma
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CTTCAAGGCTCATCCATTCTTCCTTCGTTTCCATTTCCTCTCTCTACCACCCACGTTGTAGATGCTCTTACAAGTGGGATGCCCACCTGCATGTGCTGCTGTGAGCAGGCAGCTCTGCTCAGGCCCCGGCCGCCACCCACTGGATGGCAGAGCACAGCGATTCATGTTGGCACATCCACCTGTCCAGAAATGCTTGGTGGCCATTCTTCAAAATCCACAAGTTGGTTGAAAAACAATCTTTGTTTTATAAAGCAGGAGAAACTGATGCATCTAGAACCTTTCCAAACGTCCAGTTAGTGATCAAGTGTTGGTGTGCCTGACTCCATTTCTGACCCTTCCTGTGTGGTCTTTAGAAGGATAAATAAGAAAACATGAGTTCTATATTTCTGAAATCTTGGTTTCTCTATTAAAAATCTGTTTTTTATTCAGTCAAAAAATTAATTGAATGTCCCTAATTATTGTGTAGAGCCACGGGCCCTAACTTGTCTTTTCCCTTCCAGCTGTACCTGGGTGTGGTGCTATCAGCCGTTGTAATCATAACTGGTTGCTTCTCCTACTATCAAGAAGCTAAAAGTTCAAAGATCATGGAATCCTTCAAAAACATGGTCCCTCAGGTACCAGACGCTTTGTCCTTCCCCAGTGGATGACTTGACAGCCCCAAGCATGTCAGCCTGTGAATTAGTGTGAAGTTAAGGTTTTCCAAGTATTACATGACTCATCAGAGAGATGGATGTCTTCTACCCCACCCAAAACCAACCTATTTTCCTTCTATCCAAAAAGTGGTAGCCTTTCTTTTGAATGTAAACTCTGAATACAGGCACACCATGTAACAGCAATATCTCTTAAACTGGCGAGCAAGCTTTTGTAACTTGTGTAAATAAAAAAGTGAATAATATCTTTGTTTTGTATTCAGGTAATTAGGATTATGACTATTTTTATTTTCTTGTTTTGGACACTACCTTCTCTTTGTTGGTATACTAACGGTGTAAATTGTTTCTTTTCCAAAGCAAGCCCTTGTGATTCGAAATGGTGAGAAAATGAGCATAAATGCGGAGGAAGTTGTGGTTGGGGATCTGGTGGAAGTAAAAGGAGGAGACCGAATTCCTGCTGACCTCAGAATCATATCTGCAAATGGCTGCAAGGTAGCTCTTTTATTTTAACAAACCTCATAGCTAGCTCTGCTGTTCGGGCAGCTTGATTTGAGGGGTACAGTAGCCCATGATAAGGCTGGTGTATTCACATGACATTTTTCTTCTTTTCCTCACATATAGGTGGATAACTCCTCGCTCACTGGTGAATCAGAACCCCAGACTAGGTCTCCAGATTTCACAAATGAAAACCCCCTGGAGACGAGGAACATTGCCTTCTTTTCAACCAATTGTGTTGAAGGTAGGCCATTTTTGGGCACTTTGAGCATGGCGTGGTATTTCTCTTGGGCATTAACAAAATCAAAACCATAGGCACAATCTCTTGTTTTATTGGCTCCATTTCTGAGAACTTGTGTCAAGCACAGAGCAGAGGTGTTTTCCTAGCTGGCAGGAAACCTTGTGGCAGTTTCCCTTCCCTCCACCTCCACCCTGCCTCTTCTGTCAACAACACCAGTCTGGCATGGGTGTTGGAGCTGCTGTCCTGCTACTGGAGAGAAGTCCCTTTGCCAAACAGCATGTACAGCCAAAGAGCTGGCCCTTAAAAAGTGCTTTTATCAACTCTTTTTGTTTTTTTAGTCATCCTATGTAATTGTGTAAAATCCGTGGCTTCCTTCAGGTTAGATACAATTAGGTACAGTTCTCCCTCCCCTTCTTTTTAAGGCACCGCACGTGGTATTGTTGTCTACACTGGGGATCGCACTGTGATGGGAAGAATTGCCACACTTGCTTCTGGGCTGGAAGGAGGCCAGACCCCCATTGCTGCAGAAATTGAACATTTTATCCACATCATCACGGGTGTGGCTGTGTTCCTGGGTGTGTCTTTCTTCATCCTTTCTCTCATCCTTGAGTACACCTGGCTTGAGGCTGTCATCTTCCTCATCGGTATCATCGTAGCCAATGTGCCGGAAGGTTTGCTGGCCACTGTCACGGTAAGAGGCAGGTGATGGTCACCCTGACTCAGATCAGCTTGCACGAATGTTACACTCTTCCGCTATCCTATTCTAAGGTATTGCCAACTTATGTTTTATTCTGGATGTTTGATATAGTTCTTCTTGAGAGCCACATCACGTGGTGAATTTTGACAGTGAGAAAACCTCAGCATTTGTTTATACGTAAGATAACCCCAAAGCATACATTTTGCTTTTAAATTATCACGTGGTCCTGAACAGTGCAGTGGAGAAAGGAGAAGAACTTGGGATCAAGTAGGGGGATAGAATATGGTAGAATCCTGTTATTATTTTTCTTAATAGATTGCTTTTCTGGAAGGAAGGGGAAGCCTCATGTATGGGTTCCCCTTATTATTTCTTCAAACTTCAGAAGAAGGTTGGAGAGATTTAATTTTAGACAAATTTCTTCCACATTAGGATATAGCAAGAATCTGTATAGAATTCCAGCCTGGTTGAGTGAAGTAATAATCTTCCTAATATTTTTTAGGTCTGTCTGACACTTACTGCCAAACGCATGGCAAGGAAAAACTGCTTAGTGAAGAACTTAGAAGCTGTGGAGACCTTGGGGTCCACGTCCACCATCTGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACTCAGAACCGGATGACAGTGGCCCACATGTGGTTTGACAATCAAATCCATGAAGCTGATACGACAGAGAATCAGAGTGGTAAGGCCAGGGTTACCACACACCTCAGCCACCTGCTGACTTCGCTTGGTTTTTTTTCTTTTAAGAAATTGCATGAAATTTCTTTTTTTTTTTTAAGCTCATGGCAGCTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTATCATTTAGTGAAGAGTCAAGGGTATGGGATATTGATTTTTTGCATGTCAGTAGAAACTTTAAATTGCCCTACAAACGTGACTGAAGAATGCCTAAAATGTGATTGGTTTCATTAATTGGGAAATGAGATGTATCACTGCAGATTTCTATGGGACTTTAATAGGAGAACTGAGAACACAGCCTTTGAAGTTAATGCATTGTTGTTCTGTTGTGTTTTCTTGCCTCCATCAGGTGTCTCTTTTGACAAGACTTCAGCTACCTGGCTTGCTCTGTCCAGAATTGCAGGTCTTTGTAACAGGGCAGTGTTTCAGGCTAACCAGGAAAACCTACCTATTCTTAAGGTATGCTCAAGAGTTAACTAATGGAGGGATGTAGACAGCACATGAGAACTGCCATTTGAGTGTTAAAAGTAGCAAATTACCTTTGTGGTCTGTGTGACTGTTCACTGTAGAACACCTGGAGTGGTCTGTGCAGTACTTTGCTGTGTGTAACTTACATTGTGTTGCCTGTAGATCCTGATGTATTATAGGACCCCCTGCTCCATATAGGTTGATTAAAAAGGGAAGATGCAGTAAAAATCTGACCAAAGTGGGAGGGGAGGAGACGGAAGACAGTCTTTATTGGTGAAAAACCTAATTCATCTGCTTTTACTACTCTTGAGTTTATATGTTATCACCTAACCTAGTGGACAGTGAGAGCTGAGGGCTGCAGTGACTCCATAATCGTATTTGCATATTAGGATACAGTAGATTCCAGTAACTCCTTTAAGCCATTTATTTTCCTGAAATAGCTCAGCTTATCTTATCTTATTGGTTCTTAGCTTGTTTACTAATGATGTAAAAATAAGCTCCAGGCCAAAATAAGCCCAGCCTTAGCCTGTGGAATTCTGATGCAGTTTGAAATGATTGAGATTTTACTATGCTGCCCAAGTGAAGATGCAGTCTCAGAAGGATCATGAATTGTACAAAGTCCTGTAGGAGAAGAAAGCTATGTGAGGCTCTCTGGGTCCCACATTCTCTGTGAAGCTGCCTGTAGTAGTTGTGGGTATAAACTAAGTTGCCAAAGGGAATATGGCTTGGATGTAACTCAGATGCCTTCTGTGATGAGGATAGGGTTCATTTATTCTGCAAAGGAGATTTTCTTGGCATTGAATTGATGTTGATTTGAGGATAATGT
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CTTCAAGGCTCATCCATTCTTCCTTCGTTTCCATTTCCTCTCTCTACCACCCACGTTGTAGATGCTCTTACAAGTGGGATGCCCACCTGCATGTGCTGCTGTGAGCAGGCAGCTCTGCTCAGGCCCCGGCCGCCACCCACTGGATGGCAGAGCACAGCGATTCATGTTGGCACATCCACCTGTCCAGAAATGCTTGGTGGCCATTCTTCAAAATCCACAAGTTGGTTGAAAAACAATCTTTGTTTTATAAAGCAGGAGAAACTGATGCATCTAGAACCTTTCCAAACGTCCAGTTAGTGATCAAGTGTTGGTGTGCCTGACTCCATTTCTGACCCTTCCTGTGTGGTCTTTAGAAGGATAAATAAGAAAACATGAGTTCTATATTTCTGAAATCTTGGTTTCTCTATTAAAAATCTGTTTTTTATTCAGTCAAAAAATTAATTGAATGTCCCTAATTATTGTGTAGAGCCACGGGCCCTAACTTGTCTTTTCCCTTCCAGCTGTACCTGGGTGTGGTGCTATCAGCCGTTGTAATCATAACTGGTTGCTTCTCCTACTATCAAGAAGCTAAAAGTTCAAAGATCATGGAATCCTTCAAAAACATGGTCCCTCAGGTACCAGACGCTTTGTCCTTCCCCAGTGGATGACTTGACAGCCCCAAGCATGTCAGCCTGTGAATTAGTGTGAAGTTAAGGTTTTCCAAGTATTACATGACTCATCAGAGAGATGGATGTCTTCTACCCCACCCAAAACCAACCTATTTTCCTTCTATCCAAAAAGTGGTAGCCTTTCTTTTGAATGTAAACTCTGAATACAGGCACACCATGTAACAGCAATATCTCTTAAACTGGCGAGCAAGCTTTTGTAACTTGTGTAAATAAAAAAGTGAATAATATCTTTGTTTTGTATTCAGGTAATTAGGATTATGACTATTTTTATTTTCTTGTTTTGGACACTACCTTCTCTTTGTTGGTATACTAACGGTGTAAATTGTTTCTTTTCCAAAGCAAGCCCTTGTGATTCGAAATGGTGAGAAAATGAGCATAAATGCGGAGGAAGTTGTGGTTGGGGATCTGGTGGAAGTAAAAGGAGGAGACCGAATTCCTGCTGACCTCAGAATCATATCTGCAAATGGCTGCAAGGTAGCTCTTTTATTTTAACAAACCTCATAGCTAGCTCTGCTGTTCGGGCAGCTTGATTTGAGGGGTACAGTAGCCCATGATAAGGCTGGTGTATTCACATGACATTTTTCTTCTTTTCCTCACATATAGGTGGATAACTCCTCGCTCACTGGTGAATCAGAACCCCAGACTAGGTCTCCAGATTTCACAAATGAAAACCCCCTGGAGACGAGGAACATTGCCTTCTTTTCAACCAATTGTGTTGAAGGTAGGCCATTTTTGGGCACTTTGAGCATGGCGTGGTATTTCTCTTGGGCATTAACAAAATCAAAACCATAGGCACAATCTCTTGTTTTATTGGCTCCATTTCTGAGAACTTGTGTCAAGCACAGAGCAGAGGTGTTTTCCTAGCTGGCAGGAAACCTTGTGGCAGTTTCCCTTCCCTCCACCTCCACCCTGCCTCTTCTGTCAACAACACCAGTCTGGCATGGGTGTTGGAGCTGCTGTCCTGCTACTGGAGAGAAGTCCCTTTGCCAAACAGCATGTACAGCCAAAGAGCTGGCCCTTAAAAAGTGCTTTTATCAACTCTTTTTGTTTTTTTAGTCATCCTATGTAATTGTGTAAAATCCGTGGCTTCCTTCAGGTTAGATACAATTAGGTACAGTTCTCCCTCCCCTTCTTTTTAAGGCACCGCACGTGGTATTGTTGTCTACACTGGGGATCGCACTGTGATGGGAAGAATTGCCACACTTGCTTCTGGGCTGGAAGGAGGCCAGACCCCCATTGCTGCAGAAATTGAACATTTTATCCACATCATCACGGGTGTGGCTGTGTTCCTGGGTGTGTCTTTCTTCATCCTTTCTCTCATCCTTGAGTACACCTGGCTTGAGGCTGTCATCTTCCTCATCGGTATCATCGTAGCCAATGGGCCGGAAGGTTTGCTGGCCACTGTCACGGTAAGAGGCAGGTGATGGTCACCCTGACTCAGATCAGCTTGCACGAATGTTACACTCTTCCGCTATCCTATTCTAAGGTATTGCCAACTTATGTTTTATTCTGGATGTTTGATATAGTTCTTCTTGAGAGCCACATCACGTGGTGAATTTTGACAGTGAGAAAACCTCAGCATTTGTTTATACGTAAGATAACCCCAAAGCATACATTTTGCTTTTAAATTATCACGTGGTCCTGAACAGTGCAGTGGAGAAAGGAGAAGAACTTGGGATCAAGTAGGGGGATAGAATATGGTAGAATCCTGTTATTATTTTTCTTAATAGATTGCTTTTCTGGAAGGAAGGGGAAGCCTCATGTATGGGTTCCCCTTATTATTTCTTCAAACTTCAGAAGAAGGTTGGAGAGATTTAATTTTAGACAAATTTCTTCCACATTAGGATATAGCAAGAATCTGTATAGAATTCCAGCCTGGTTGAGTGAAGTAATAATCTTCCTAATATTTTTTAGGTCTGTCTGACACTTACTGCCAAACGCATGGCAAGGAAAAACTGCTTAGTGAAGAACTTAGAAGCTGTGGAGACCTTGGGGTCCACGTCCACCATCTGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACTCAGAACCGGATGACAGTGGCCCACATGTGGTTTGACAATCAAATCCATGAAGCTGATACGACAGAGAATCAGAGTGGTAAGGCCAGGGTTACCACACACCTCAGCCACCTGCTGACTTCGCTTGGTTTTTTTTCTTTTAAGAAATTGCATGAAATTTCTTTTTTTTTTTTAAGCTCATGGCAGCTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTATCATTTAGTGAAGAGTCAAGGGTATGGGATATTGATTTTTTGCATGTCAGTAGAAACTTTAAATTGCCCTACAAACGTGACTGAAGAATGCCTAAAATGTGATTGGTTTCATTAATTGGGAAATGAGATGTATCACTGCAGATTTCTATGGGACTTTAATAGGAGAACTGAGAACACAGCCTTTGAAGTTAATGCATTGTTGTTCTGTTGTGTTTTCTTGCCTCCATCAGGTGTCTCTTTTGACAAGACTTCAGCTACCTGGCTTGCTCTGTCCAGAATTGCAGGTCTTTGTAACAGGGCAGTGTTTCAGGCTAACCAGGAAAACCTACCTATTCTTAAGGTATGCTCAAGAGTTAACTAATGGAGGGATGTAGACAGCACATGAGAACTGCCATTTGAGTGTTAAAAGTAGCAAATTACCTTTGTGGTCTGTGTGACTGTTCACTGTAGAACACCTGGAGTGGTCTGTGCAGTACTTTGCTGTGTGTAACTTACATTGTGTTGCCTGTAGATCCTGATGTATTATAGGACCCCCTGCTCCATATAGGTTGATTAAAAAGGGAAGATGCAGTAAAAATCTGACCAAAGTGGGAGGGGAGGAGACGGAAGACAGTCTTTATTGGTGAAAAACCTAATTCATCTGCTTTTACTACTCTTGAGTTTATATGTTATCACCTAACCTAGTGGACAGTGAGAGCTGAGGGCTGCAGTGACTCCATAATCGTATTTGCATATTAGGATACAGTAGATTCCAGTAACTCCTTTAAGCCATTTATTTTCCTGAAATAGCTCAGCTTATCTTATCTTATTGGTTCTTAGCTTGTTTACTAATGATGTAAAAATAAGCTCCAGGCCAAAATAAGCCCAGCCTTAGCCTGTGGAATTCTGATGCAGTTTGAAATGATTGAGATTTTACTATGCTGCCCAAGTGAAGATGCAGTCTCAGAAGGATCATGAATTGTACAAAGTCCTGTAGGAGAAGAAAGCTATGTGAGGCTCTCTGGGTCCCACATTCTCTGTGAAGCTGCCTGTAGTAGTTGTGGGTATAAACTAAGTTGCCAAAGGGAATATGGCTTGGATGTAACTCAGATGCCTTCTGTGATGAGGATAGGGTTCATTTATTCTGCAAAGGAGATTTTCTTGGCATTGAATTGATGTTGATTTGAGGATAATGT
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Task1_train_1452
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This sequence variant lies in ATP1A1-AS1, ATP1A1 (ATP1A1 antisense RNA 1| ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1) on Chromosome 1. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; Charcot-Marie-tooth disease, axonal, type 2DD
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Task1_train_1453
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A mutation on Chromosome 1 affecting ATP1A1-AS1, ATP1A1 (ATP1A1 antisense RNA 1| ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; Charcot-Marie-tooth disease, axonal, type 2DD
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ATACTTGTGGTTTGGGGTGGGTGTGGGCATGTGGGGAGGTGGCTGGAGGTATGTGTACACAAGTGTTCCCCAATCCCTGTGTTCTGAAATTTCGTATGTTCTTTTTTAATGTGAACAAATGTCAGGAATTTATGAATATATCATAGTGCTCATTTTTTTTTTTTTCTGTAGCATTCAAAGTATGTTACAGGTGTAAGATACTTCAGAGTTCAGAAAGAAGGGATCTTGGGTCTTTTATAGCAAATACTAAATAGTAAGTGAAGCTTTGTTTTCCACCATGGACTGCCACACATCCAACCATCCAATGTTTATGTCTCAACAATCCTTCACAGTTGTCTATTCATAAGAACCCCAACACATCGGAGCCCCAACACCTGTTGGTGATGAAGGGCGCCCCAGAAAGGATCCTAGACCGTTGCAGCTCTATCCTCCTCCACGGCAAGGAGCAGCCCCTGGATGAGGAGCTGAAAGACGCCTTTCAGAACGCCTATTTGGAGCTGGGGGGCCTCGGAGAACGAGTCCTAGGTATGCAGATAACCTGGTAACAGAGTGCCTGGGCACGTTTTTATCCAGTAACCTAGTCTGGTAGACAGTTAACAAGTGATCCTATGAACCTCTATGTCTTGTTGACCTTCCTCTACATCTTTTAGGGGCAATCCTCCTATTTGTTTATTTGCCCCCTATTATTTTGAAAACAATAAGTGCTGAAGAAATGTTCAGCGTATTGGGCTGTGAGAAACAACGTCCTGATGGTTTGCTTCTGACTTGTACTTAGACCTTTGGTCTCATGCTAGTCAGTTCTGTTTGTTTAAAAAAAAAAATGGTGGAAGAATATCTTTCTTATCTAACCTTTGTTGCTGTGGACATGACTTATAAGCCTAATTAAAGTTAATTAATTCTTAGTGTGTCTAAGTTAGACATACTATTTCCTGACTGCCTTGGAATGGGTGTGAATTTACATGAGCACTTATGTGCTCAGCTTAGAAACTAGACTAACGGTAAACTTTTAGTCTAAGATGCTACCTATTTTTTTCTACCCTGACAGCTACTGAGGCTGAGAAGTTCACTTTACCCATTGTCTAATGTATTTGGGAAAGTGGCATTTATAATACTTTGTAGGTTGACAGATACTACATTCATTATTTATATAATGCTTCCTATTCTTCTTAACTTGGGTAAATCTAACTCATGGTATCTTTCGTATGTGTCTATCCAACCGAAGGATTGCTATCTTCTCTTTAAGTGTTTTTCACTTCCCTACTTCCACCACCCCAAAGTGGAAGCAGTCTCTCTTCTTTTGAGTCCACATGGCACGTTAAAGATCATTGTAACGTCATACAACATTGAAAAGAATGTCTTACATTATCTTGATTCTTGTATTTACTATACTAGATGATAAACCCCCTGGGCAGAATGCATCTGATCTGTACTTATCCTCAAAAGTAGCTAGCATGATGTCCCACATTGGTGCTCAGTAATATGTTTCAGTTAAATGAACAAGAGAGCAGAGGTATGGCCTTGATGTTTCCAGAGAAGGCAGCTGAGGCAGATAATTCCATGATTTGCCAAATCCAAATAACTTAATGTCATCATCAGTGGGCAAGTCTAGAACCCTAATATCCTGGTGCTCAAAATTAGTGTTATCAATTCAGTCTTCTCCACATTAAACAATTTCCAATTCCTTTGAGGCCTGGTGTGATGGATTCTGTCTTTCAAATGCTTTTTTTCTTTCAGTGACTCTATCGTTCATAAATGTTAAATAAAACCCTCACTCTGTTATAAAAATATAGACTTTAAAAATTTTCCAAAGTAAACACTCCAGAGAAAGGTAGGCGGGCTGAATAGGCTGCTGTTGTCCTTCTTACTGCCCAGCGTCACTGAAATTTTCAAAGGCTCCTGTCCTCCTCGCAGGTTTCTGCCACCTCTTTCTGCCAGATGAACAGTTTCCTGAAGGGTTCCAGTTTGACACTGACGATGTGAATTTCCCTATCGATAATCTGTGCTTTGTTGGGCTCATCTCCATGATTGACCCTCCACGGGCGGCCGTTCCTGATGCCGTGGGCAAATGTCGAAGTGCTGGAATTAAGGTAGTGCCCAGGCGCCTCCTTGGCTTCATCTCTTAGTGCCTTGGGACACCCTACTCAGTGAATGTTGCCTTTTGAGGTCCAGATGGCCAGCTGTTCTATCTCACCTGGAGTATTAATTTCTCATCTCCAAAGCTTTACTTCCACCCAGAAAAGACCAGATAGTATTAAAATATGATGGTGTAAACACACGAGGAATTAAAAATTTTTTGGAAAGCAATTGTGTAAAAAAGAAATGTAAGCAAAGTAAAAACAGCAAAAGACTTGAAGTTTTAAAATACTTGCATTATTCTAAGTTAATGTACCTTATGCAATGAATGGCATATCTTCTGTGTTTTCAGTTAACTGTTTGTTAATGAGTGTTTGGTGTCCTCTGTGTATCTGTCTTTTTTTAAGTAGCTGAATATTACTCAAGTGCACTAATATCCTGTTGCTGGGTATTTGGTTTCTGTTTTTTACTCTCAGGATTTTATTTTATTTATTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCCAGGCTGGAATGTCATAGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCACCCGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAAGTAAAGATAGGGTTTCGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGGTTACAAGCGTGAGCCACCACACCCGGCCTACTCTCAGGATTAATACTGCCCTGAAAAGCTTTGTAGAAGTTATTTCCTCACCATTCCGACTGCTTCTTTTTAAAGTATATTCTAAGTATAATCACTGCATCAAAAAATAACAATTTTGAATTCTTGTCACATGTTGCTTTTCCTCCAAGTTGTGCCAATTTGAGAATGCTAGCCAGTAGCATGTGGTGTCTTCACAGTCCCACCAGCATCAGATTTTTATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGGTTTTAGTAATTTTCAAGTATTTTTATGTAACTCTGTAGAAGGAAAAATAGACATTGTGTATGCTAGTGATTGTATACCAAGATAAAACCTGAGTATTGCCTTTGTGTTTCCTTTCTGTGGATATATATGTTTATATTTTTGGCTAATCGATGTTTATTAGTTTTATATTTGCATTCCTTTCCTTTTGATAGTCTAAGCCGAATCATCCTTAGTATTTACTCTTGCCTACTGGATATAAGACTTTAAGGTCATTTACTTGGCAGTTGCATTCAACACATTGTCTTGTTTATTACAGGTCATCATGGTCACAGGAGACCATCCAATCACAGCTAAAGCTATTGCCAAAGGTGTGGGCATCATCTCAGAAGGCAATGAGACCGTGGAAGACATTGCTGCCCGCCTCAACATCCCAGTCAGCCAGGTGAACCCCAGGTAAGGCAGGAAGCTCAAATCACAGTCTGCTGTGAACAAGCAAATAGTGATGGTTTAAAATCTTCAGCGTGGTTCTATAATGGTTTGCATCTAGGCTTGCTCTGAGTAGGAAATGTACCTGCACTGCCAGAAAGCAACCTTGTCATTCCTAAGAAGGGTTTTAAGTAAGAGCAAGTCATAATAATTAGCACTTAGATGGTATTTACTGTTCTAAGAGCTTGATATGGTGACCTATTATTTGCAGAGCAGGGAAGGTAAGGATTCAAGAGGCTTTTGAAGTACCTCAGAACTGGTGAAATCATGCAGTAAATTCAGCAGTCTAGCTTCTGATTTCATGCTGTTAACCACTGAGCTCTACTGCCTAGCACCTAGCATCTTGACACTTTCCAGGTCCACACTAACAAAATAAAATAAGGAAGGGACAATTACTTAGGCCATTCAGGCAAACACAGGAGACATTTGGCAATGAAGTAAAACAGATAATAGCAAATTGGTTTTGTTTTAAGGTTTAGGGCCCTTTCACCCTATGTTACGGTTAGAGGAGGGTTTGGTCTTGTATC
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Task1_train_1454
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A change on Chromosome 1 affects gene ATP1A1-AS1, ATP1A1 (ATP1A1 antisense RNA 1| ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Hypomagnesemia, seizures, and intellectual disability 2
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AGATCTTATTCAGATACTGCCCATTAGCATCCATTTCTGTATACTTCTTGGATATGTTCAGTTTCCAGTGTGCTTGTCTCATAAGCTAACAGTAAAAAATCTTGGTTTTCATAGGTCGTCTGATCTTTGATAACTTGAAGAAATCCATTGCTTATACCTTAACCAGTAACATTCCCGAGATCACCCCGTTCCTGATATTTATTATTGCAAACATTCCACTACCACTGGGGACTGTCACCATCCTCTGCATTGACTTGGGCACTGACATGGTGAGTGTCACAACAGTCACAGATCGATAGTAGTGAGGTGTGAGCTGTGTCTTCATTCACTGGCACTATGCTCCCAGCATCCATGAGGCTGGCGTTGGGAAAAGAAATTCTCAGGACCAGTATCCAGTGTGTGTCCCAATCCCGGCTTCACAGAATCAGTATTACCACTCTTCAAGGCAGCAGTTAACATTTGTTTATCAGATGGGAATCTTTATTTTTGTATACTTCACCTAAAAGATTTTTAAATGGGAGGGCAAGAATTTTATAACAAAAGGTTCACAATATTAGCTTCCTTATTTTTAGTAACTAAATTCCTTCTCCCCACCCCTTCCCAGGTTCCTGCCATCTCCCTGGCTTATGAGCAGGCTGAGAGTGACATCATGAAGAGACAGCCCAGAAATCCCAAAACAGACAAACTTGTGAATGAGCGGCTGATCAGCATGGCCTATGGGCAGATTGGTAAGCTGCAGCCTGGAGTGGGAAGCTGGCACATCTAAGGCATCTGAGGTGATGGTGTCCACCTCAGGTTGAGGTTGATTTCAGAGACTGCAAATCCAGGCGACTTTCAGGTCTAGGATGAGCCCTAACGGAGTGAGCCTGTGGAGTTTCTCTGAACTCTCTTCCATGTGAGAATACATCTGTTGCTGTTTGCCCAGTTACCTTTTGTGGAAACTGGTTTTCTATACTGAGCACCTTGGAACTGGGCTCAACTCTGCCTGAGAAATGAGGATGTCCTTCCTCACTGAGCCTTGCGGAACAGGAGGCATGGTTCTAAGGAATTGTGTGTACTGACGCACAGGCTGCTTTCCCTGGAGATACACACTTATCTGTCACTCACTTGGATGGAGTTAGGCATTGGAGAAAGTATATGTGTTTGAGAGTTTGGCTGGTAGGTCACCACCAAAGGGTGATCCTCCATCCACCTCACACTGGACTTCTGCCCCCACAGTGCAGCATGACTAGCTAACAGGTGATCCAGGTGGTGGGCAATCAGCATGCCATTTGTTTTTAAATCCTCTGCCTAGGGTTCCTTCAAGAGAACCTGGCAAAGCCACCATGGATGTCTTATTCTCCTGGATTAATGGGTCACATAACTGTGAACGCTTGGATAAAGAAGAACAGATTAGATAGAATATTGTGGAAATTATGGCAAAGATTCATTAGACAGTTGTTGGCAACAAAGTAATTGGCTGGTGGCCCATCCTGACCTTCTCCAAGGAGGCCTGCTTTTGAGAGGAAGGAAGACTAGGTCTCTGGTGGTTTAGGATGAAACCCTGCCCTGAGGAACTTGGAGCAGCGTGGTTAAATTGGATGCCAGGGGGAGGAGGGTCCTGAAGGTGGGGAGGAGAGTCAGAAAGTGCCACAGTGGCTAGAAAAATGGCAGCATGTAGGAATTTTGAAAGATGGAAAAGAAGTTATCATTTGTCAGAGATTAAAAAGTAGGGAAGTGGATTTCCCCTAAAGGTCATACCCTTAGAAGCAGCTGGTCAAGTAACAGGTGGGCATTTTGAGAGCAAGGCACATGTGTCTTTGTGTAGGCTCCAAAAAGTGACTCAAAAAGCAGAGGGCCCTGAGATTGGAGTGTATGCCTGGGGTCCTCCATCCCATCCCTCATAGCCTGTGAGTGACCAGGCAATTCTTTCCTGTGCTTTTATCAACCAGGGGGAAACACTCCTCCATATGTGCTCTCCCAGGCCTGCTGCAGTAATCAGCTGAAGGCTATACAGGTACCCTTGTGTGTGAGGTTCTAGTAATTGGGTTGTTTTCCCAACTTAGGAAGGATCCAGGCCCTGGGAGGCTTCTTTACTTACTTTGTGATTCTGGCTGAGAACGGCTTCCTCCCAATTCACCTGTTGGGCCTCCGAGTGGACTGGGATGACCGCTGGATCAACGATGTGGAAGACAGCTACGGGCAGCAGTGGGTGAGTGGGCACCTCTGACCTGACCAGTGTCAGAGCTCCTCAAGCCCCAGAAGACTGAGGCCACACTGCCACCAGCCATGCAGGTGAAGAGCCAGAGCTCATCTTCTGTCTTCTGCATTTCAGACCTATGAGCAGAGGAAAATCGTGGAGTTCACCTGCCACACAGCCTTCTTCGTCAGTATCGTGGTGGTGCAGTGGGCCGACTTGGTCATCTGTAAGACCAGGAGGAATTCGGTCTTCCAGCAGGGGATGAAGTAAGTAATGAAGGACATGTCAAGGCCTTGGCTCAAAGAAGGGGACTGGTGATTTGTAAACCCTTTGCCAAAAACTAAACATATGACACATATAGCCAGGTTTCTGGAATCTCTAGTTTATAGAGCAAATTTAGGAAGCAAGAAATGTAGCTTTCTAGTTTTTTCATCTGACCTCCAAGTTTTCAAGTACAGCTAATACATAAAGATGTTGATCTGCCATTTTAATGCATAGCATTAGAAGATAAACCTTTATTTGCACCTTTTAAGTTTTTTCTCCCCTACTTTGATTTTAGGAACAAGATCTTGATATTTGGCCTCTTTGAAGAGACAGCCCTGGCTGCTTTCCTTTCCTACTGCCCTGGAATGGGTGTTGCTCTTAGGATGTATCCCCTCAAGTAAGTTGATCCTCTGGTAGCTCCAAAAAGTATGAAATAGTATGTGTGGCTTTTCCCCCCATTACTTGTGGTAATAGTTGTTATTTTCAGAATTTTGAGTGGTATGTACAAAAATTCCTATGGGTTGGAAAACTGTGAAAGCTTGACATGTCAGTAAATCAGACTAACAAATCCTGAGGCTTCCATGATAGCAGCTAGTGTTTAGGATTTGGCCCAAGATAAGATAAAGCCACACAGGCTCTAGCTCCATGGAACTGCTCAACAGCGAACTGCATTGAGCACTCAGGTCTGCCACAGCTGTAGTCCAGTTGTCTTTAGAGGCCAACTGGGGGTATGCTGGAGCGTAGGCGCCCAGGCTCAAATCTTGATTTGCTTGCTTAGTCACTGTCCCATTACAAGTCATCCACCTTTCTGAGACTCTGAATACTCTGCTCTCAAAGAAAGAAGGTTGGAGAAACAGATCTGAGGTCCCTTTTACTTTATAATCAGTCATGGGTAGAGTTGATCAAAGGAAGCATACTGCTAGTCTTTGGCCTTAAACACAGTGAATGACTCTGCATTTCAGATAAACTTGAATTTTCAAAGAGGGTTTATCACAAACTCCGTTAGTTTTTTGCAACATTGAGTATGTTTGGTGATACCTGGTTGAGGTTAAGCAACTGCAACTTGATTAAAACGTGCAAAGCCACAGATTGTGGGACCCATTTACAAGTTCCTTTGAAGCTTTTGATTTAAAGCATTAGTCTCCTTTGAATTCCTGCTGTCCTCATCCTTGCTCAGACCCGTCTGGACCATCTCTCAATCCCCTGTTGCCAGCACTTCCTTCAGCTCATCTTATCCCTAAAGTAACCAAAACCCATCAGCCTCATTCACTTCCTGTGGGTTATGTGCAGACATCGTCTGTGGTGCAAGATGAGACTGGCATCCAGAGTCAGTCTCATTGTCCCAACCTGTCTTTATAGCTTTCTCTTGTACCCCTTACCCATCCAAGCTCATGTTAGGTGAATTCGGCTTTCTTCCTCTGCCTTTGTGTTTGGTAAGATCCTTCCTCCCCACATCCCTCCTTCTGTTCCCTCTTACCCTGCCAATCCTGATAGTCCCTTCAGGGCCGGTTTCCTTGGAGCTTGTCCCTCCAGGGCCTGTGCACTTGCACCTCTTCTCTGGCATTACTTGTTGCTTGTCATTTCACCTCCCTGCTAGGTTTTAATCTAGAAGGCATGGGCCACAGTGTCTTTCTTCTCTGTGCATCCCCAGCT
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Task1_train_1455
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This genomic variant is located on Chromosome 1, within the ATP1A1, ATP1A1-AS1 (ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1| ATP1A1 antisense RNA 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Hypomagnesemia, seizures, and intellectual disability 2
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GCTCCCAGCATCCATGAGGCTGGCGTTGGGAAAAGAAATTCTCAGGACCAGTATCCAGTGTGTGTCCCAATCCCGGCTTCACAGAATCAGTATTACCACTCTTCAAGGCAGCAGTTAACATTTGTTTATCAGATGGGAATCTTTATTTTTGTATACTTCACCTAAAAGATTTTTAAATGGGAGGGCAAGAATTTTATAACAAAAGGTTCACAATATTAGCTTCCTTATTTTTAGTAACTAAATTCCTTCTCCCCACCCCTTCCCAGGTTCCTGCCATCTCCCTGGCTTATGAGCAGGCTGAGAGTGACATCATGAAGAGACAGCCCAGAAATCCCAAAACAGACAAACTTGTGAATGAGCGGCTGATCAGCATGGCCTATGGGCAGATTGGTAAGCTGCAGCCTGGAGTGGGAAGCTGGCACATCTAAGGCATCTGAGGTGATGGTGTCCACCTCAGGTTGAGGTTGATTTCAGAGACTGCAAATCCAGGCGACTTTCAGGTCTAGGATGAGCCCTAACGGAGTGAGCCTGTGGAGTTTCTCTGAACTCTCTTCCATGTGAGAATACATCTGTTGCTGTTTGCCCAGTTACCTTTTGTGGAAACTGGTTTTCTATACTGAGCACCTTGGAACTGGGCTCAACTCTGCCTGAGAAATGAGGATGTCCTTCCTCACTGAGCCTTGCGGAACAGGAGGCATGGTTCTAAGGAATTGTGTGTACTGACGCACAGGCTGCTTTCCCTGGAGATACACACTTATCTGTCACTCACTTGGATGGAGTTAGGCATTGGAGAAAGTATATGTGTTTGAGAGTTTGGCTGGTAGGTCACCACCAAAGGGTGATCCTCCATCCACCTCACACTGGACTTCTGCCCCCACAGTGCAGCATGACTAGCTAACAGGTGATCCAGGTGGTGGGCAATCAGCATGCCATTTGTTTTTAAATCCTCTGCCTAGGGTTCCTTCAAGAGAACCTGGCAAAGCCACCATGGATGTCTTATTCTCCTGGATTAATGGGTCACATAACTGTGAACGCTTGGATAAAGAAGAACAGATTAGATAGAATATTGTGGAAATTATGGCAAAGATTCATTAGACAGTTGTTGGCAACAAAGTAATTGGCTGGTGGCCCATCCTGACCTTCTCCAAGGAGGCCTGCTTTTGAGAGGAAGGAAGACTAGGTCTCTGGTGGTTTAGGATGAAACCCTGCCCTGAGGAACTTGGAGCAGCGTGGTTAAATTGGATGCCAGGGGGAGGAGGGTCCTGAAGGTGGGGAGGAGAGTCAGAAAGTGCCACAGTGGCTAGAAAAATGGCAGCATGTAGGAATTTTGAAAGATGGAAAAGAAGTTATCATTTGTCAGAGATTAAAAAGTAGGGAAGTGGATTTCCCCTAAAGGTCATACCCTTAGAAGCAGCTGGTCAAGTAACAGGTGGGCATTTTGAGAGCAAGGCACATGTGTCTTTGTGTAGGCTCCAAAAAGTGACTCAAAAAGCAGAGGGCCCTGAGATTGGAGTGTATGCCTGGGGTCCTCCATCCCATCCCTCATAGCCTGTGAGTGACCAGGCAATTCTTTCCTGTGCTTTTATCAACCAGGGGGAAACACTCCTCCATATGTGCTCTCCCAGGCCTGCTGCAGTAATCAGCTGAAGGCTATACAGGTACCCTTGTGTGTGAGGTTCTAGTAATTGGGTTGTTTTCCCAACTTAGGAATGATCCAGGCCCTGGGAGGCTTCTTTACTTACTTTGTGATTCTGGCTGAGAACGGCTTCCTCCCAATTCACCTGTTGGGCCTCCGAGTGGACTGGGATGACCGCTGGATCAACGATGTGGAAGACAGCTACGGGCAGCAGTGGGTGAGTGGGCACCTCTGACCTGACCAGTGTCAGAGCTCCTCAAGCCCCAGAAGACTGAGGCCACACTGCCACCAGCCATGCAGGTGAAGAGCCAGAGCTCATCTTCTGTCTTCTGCATTTCAGACCTATGAGCAGAGGAAAATCGTGGAGTTCACCTGCCACACAGCCTTCTTCGTCAGTATCGTGGTGGTGCAGTGGGCCGACTTGGTCATCTGTAAGACCAGGAGGAATTCGGTCTTCCAGCAGGGGATGAAGTAAGTAATGAAGGACATGTCAAGGCCTTGGCTCAAAGAAGGGGACTGGTGATTTGTAAACCCTTTGCCAAAAACTAAACATATGACACATATAGCCAGGTTTCTGGAATCTCTAGTTTATAGAGCAAATTTAGGAAGCAAGAAATGTAGCTTTCTAGTTTTTTCATCTGACCTCCAAGTTTTCAAGTACAGCTAATACATAAAGATGTTGATCTGCCATTTTAATGCATAGCATTAGAAGATAAACCTTTATTTGCACCTTTTAAGTTTTTTCTCCCCTACTTTGATTTTAGGAACAAGATCTTGATATTTGGCCTCTTTGAAGAGACAGCCCTGGCTGCTTTCCTTTCCTACTGCCCTGGAATGGGTGTTGCTCTTAGGATGTATCCCCTCAAGTAAGTTGATCCTCTGGTAGCTCCAAAAAGTATGAAATAGTATGTGTGGCTTTTCCCCCCATTACTTGTGGTAATAGTTGTTATTTTCAGAATTTTGAGTGGTATGTACAAAAATTCCTATGGGTTGGAAAACTGTGAAAGCTTGACATGTCAGTAAATCAGACTAACAAATCCTGAGGCTTCCATGATAGCAGCTAGTGTTTAGGATTTGGCCCAAGATAAGATAAAGCCACACAGGCTCTAGCTCCATGGAACTGCTCAACAGCGAACTGCATTGAGCACTCAGGTCTGCCACAGCTGTAGTCCAGTTGTCTTTAGAGGCCAACTGGGGGTATGCTGGAGCGTAGGCGCCCAGGCTCAAATCTTGATTTGCTTGCTTAGTCACTGTCCCATTACAAGTCATCCACCTTTCTGAGACTCTGAATACTCTGCTCTCAAAGAAAGAAGGTTGGAGAAACAGATCTGAGGTCCCTTTTACTTTATAATCAGTCATGGGTAGAGTTGATCAAAGGAAGCATACTGCTAGTCTTTGGCCTTAAACACAGTGAATGACTCTGCATTTCAGATAAACTTGAATTTTCAAAGAGGGTTTATCACAAACTCCGTTAGTTTTTTGCAACATTGAGTATGTTTGGTGATACCTGGTTGAGGTTAAGCAACTGCAACTTGATTAAAACGTGCAAAGCCACAGATTGTGGGACCCATTTACAAGTTCCTTTGAAGCTTTTGATTTAAAGCATTAGTCTCCTTTGAATTCCTGCTGTCCTCATCCTTGCTCAGACCCGTCTGGACCATCTCTCAATCCCCTGTTGCCAGCACTTCCTTCAGCTCATCTTATCCCTAAAGTAACCAAAACCCATCAGCCTCATTCACTTCCTGTGGGTTATGTGCAGACATCGTCTGTGGTGCAAGATGAGACTGGCATCCAGAGTCAGTCTCATTGTCCCAACCTGTCTTTATAGCTTTCTCTTGTACCCCTTACCCATCCAAGCTCATGTTAGGTGAATTCGGCTTTCTTCCTCTGCCTTTGTGTTTGGTAAGATCCTTCCTCCCCACATCCCTCCTTCTGTTCCCTCTTACCCTGCCAATCCTGATAGTCCCTTCAGGGCCGGTTTCCTTGGAGCTTGTCCCTCCAGGGCCTGTGCACTTGCACCTCTTCTCTGGCATTACTTGTTGCTTGTCATTTCACCTCCCTGCTAGGTTTTAATCTAGAAGGCATGGGCCACAGTGTCTTTCTTCTCTGTGCATCCCCAGCTCCCTACACAAAGCTGGTGTACAGCAGGGGCCAGCCATCTCCAAATTGAATTCTGTCAGCTTGGGCCATTATGTATCAAGATGGGGCTTGGAGAGGTCACAGAGCTTTCCAAAAAGGCTGGTGGAAAATTACACTGAAAAGGGGGCATTTCCATCTTCTGGGTCCTTCCCTGGTTTTTTTGCCACCACCAAAGAGATTGTTCTGACAGGTTCTGCCCAATTTTGGAAGGTGGTTCAGTTATTCGGTGACTGAGTCAAATGAGATCATCTCTCTTAGCTGCCTTGTCAGACACACAGGAAGAAGAGGAGACCACCGGAGTCCTGCCCAGGGACAGCCTTT
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Task1_train_1456
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This sequence change occurs on Chromosome 1, altering SPAG17 (sperm associated antigen 17). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
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Pathogenic; Spermatogenic failure 55
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Task1_train_1457
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This genomic variant is located on Chromosome 1, within the WARS2 (tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Neurodevelopmental disorder, mitochondrial, with abnormal movements and lactic acidosis, with or without seizures
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AGGGGTAAGGGTTTTACTCTCAGATTTGCTTCTCTTATGGAGTGATATCGTACAAGCTAATTGGATTCTCTCAGCCTCACTTTCCTCATGTGTAAAATGACAATAATTCTCCTAATTCATAGGGGGTTGGTGAGACTAAACTGAAATGAATGCAAGAAAGCACTTATTAAGAATATAATTCAGGGACTTGGGCTCTTGTACAATAAATAAATCAGGTCAAAATAATGCAACCTCCTTAGAAGATCATATCCCATATCTCTGAATTAAAAAACAAATTATTGCTGGAACAGTTGGTGTTATCTCTTGGAAAACAAGTTAAGCAGCTTAAATATATTAAATCAGGCACCGTCTCAGTGACAAACAAACTATAAGAATGGACTTGTTTTTATGAGCTCTGAATACAAATTGGCATCTGATCAAATGGCATCTCAAGGATTATACATCTAAGACCTCTATATATTGCTTTATAAAAGGGTTGAAGTAGATAACGTGTGCATCTGTTACAGTAAGTACTCCAGAGAGAAGCACAAATGATACTCCATTTCCCAAATTACTCCTTACTTCAATCACATTTCTGCAGGCCAAGGAGTGTGCCTCAATAATTGGGGATTCAGACAGCTATGCCTTCTTGATTTATTTTTTGTTGTTGTTGTTCACAGCATTTTGTTGATGGGATTTGGAACACTGTCGTATTTCAAAGCTACAAAGCAATATTCATCAAATAAAGCCAATAATCAGCTATACCAAATTAAATGTCCCAAAACTATAACTTTTTCTTTTTAGGAAAGCTGCCGTTATCAGAATGCATGGAGTGCAAGGCACAAAAGCCTTGCTGTGATTCGTTGAAACTTCCTATAGAAAACCCACCAATTTCTTCACCTCCTGGCACACAGTGTATGCTAATTCTTTGGCTTTTGCTGATCCAATTTGTAAAACCTTCTCTAAATGGTCCTTGTCCAGCTTCAGTTTTTCAATTTCACGCTTAATTGGGGCAAACTTCTCAATCACAGCATCTGCCACGGCCAGCTTGTAGCGAGCAGTGTTCATGCCCGCGCTGCGGCGCACCACTTCCTCCACGGAGAGCCCCGTCACCGCGGCATGCACCGCCACTATGTTGGACACGCCAGCGCGGCCAGCCGGGTCATAGGTGACCTCCGAGGTGAAGTCTGTCACAGCCTTGCGGAATTTCTGCACTATCTCCTCTGGGCTGTCTGTTATTCGGACGGTGGCCAGTTTGTCAGGGTCTGATTTCGACATTTTGGCAGAAGGATCACGTAGGGATTTTACCTTCTTCATGGATGCTAGGTTAAAAACACCAACACACACATACCCAAAACAAAAACAAAACAAACAGATCACCAAGATGTACACACAGACAGTTCCCAACTTGCAATGGTTTGAATTATGATTTTTCAACTTTACAGTGGTGCAAATGTGATATCCATTCAGTAGAAACTGTACTTGAAATACCCACACAACCATTCTGTTTTTCACTTTCAGTATAGTATTCAATAAATTACATGAGATATTCAATACTTTATTATAAAATAGGCTTTGTGTTAGATGATTCTGCCCAATTATAGACTAATGTAAGTGTTCTGAGCACGCTGAAGGTGGGCTAGGCTAAGCTGTGATGTTCAGTAGGTTATGTGTGTTAAATGCATTTTTGATTAACAGTGTTTCCAACTTACAATGGCTTTATCAGGATGTAACCCAATTATAAGTCAAGAAGCATCTGTTCATACTTCATAAATTATATACTACTTTATAAATATTATTTTAAATTTTTGGTCTCTTCCATACTTTTAAAATATTTTTAGTTATCCTTTTCAATAATCCAACATCTTTTTCAGGAATCCAACGTAGTCTACTTTCTAGTCCTACACTAGAGAAAACAATGAGGACTCTAGTTACAGATCCTGAAGCCTGTCTACAAGAAAGCTGAGGTTAGTCCCAAGAAAGTTCCAAGCCTATCTATTGTCCAATCCTCTCTTTAGAATATACCCTGATGTAACAATTATAAGTTTCTTACTTACTGAGAATGGACTCGGGCACTGGAAAGAACTCCCCATACTTCTTGTTGAAACCTTGTGCTAGATCCTGAACTAGTTCCATGTGCTGGACTTGATCCTCCCCAACAGGAACGTGTGTGGACCTTTAATAAAAGACAGACAGAAAAACAACAGCAAGGCTCTTTCTTAGAGACAGAAATGATATTGCAAGCAGCTGCATTTCCTGTGAATATTTCACTGTTGGTATTCAACAAATGTTCACCAACTATAGAGGGAATGTTTAGACCTAAGTCTTTATCTATGGATCAGACAAAAGCCAAAGAGATGTTTCTCTACTCTAGTTGTGTTTTTTCCACAGCAGGGGAATACAGCCATCAACACCAGCATGACAGGATCTTGCTGGGAGGGAGGAATGGGATTTTAAATAGCATATGCTCTAGGCACAATTGTGTTTTAAAACTACTCCTCATTCCCTCACCCAGTCAGCACATATTATTCCCAGCCCTGACCAGATGCTCTTTACCTCAGAACTACAGCTCATACTTGAAAGACACCCCACCCCACTCTTCAAATCAAAGGCAGCAGAAAGTTCTTCAGGCAAGAGTTTTTCCTCCCTGTCACATAGGGAGTAATTCAATATTCTTTGGAGTAAGCTTCATTTTCAAGTACATTGCAATCACAGGACAATTAATATGTTGCAGAGAACTTAAAATCTATAAGTACAATGTAGATGGCTATCAAAAACTATGTGGGATGAAAAAAGCAAGTTGGAGAAAACATGAAATACACTGACATTTACGTAAATTTTACAAGTGCCTATGGAAATATATCTGTAATAATAAGTAAAAAAACATACTGGAAGCTCCTCCCCAAATTTGTAATTGTAGCTGCTTCTAGAGAAGGTGGAAAGGAAATAGATCTGAAGAAAAGAACAAAGGAGACTTGAATTTTATCTGTAATATTTCATATTATGAAGAAATGAAGATGTGAAACCAAAAATATCAGAATATAGGGAATGACTTCATCATGAGTTTAATCCCATATGTAAAGTTTGCAGTGTCAGATCATGACATAGTACATCAAATAAGGGAAGAATGAACCATTATAGAGAAGTCTTGATGAGGAAAATTTTATACTGAAGCAATATGGCGGGATTAAAAAACAGGCAATTTTATACATGCAATGCTTGGCTGGGAGTTTATACCTGATAATACAAGTAATACAGTGCGCTGAGGTTTTTTTAATCAAAGAAACAATATTGCTCCTGTGAAAAAAGCAGCGAGCCATCATAGGCAAGTTTCTTACCCTTTCTAAGCCTTCGTTTCCTCTGTAAAGTGAGGTTCATCATGGAGCTTACCTCATATAGCTCTTTCATGGATAACACGTATACTAATTGATAGTAAGAGCTCAATAAATGGTTGCTATTGATATAATATATAACTATATATTCATTAATATCTGACATGATGAAGGACAAATAAAGGTAAAATGAAGGACAAATGGTAAAATAAAGATACTATAGAGAACCTTGATGAGGGGTACACTGACTTTTTTCACACCAGATCATTTTCCTTTTTCAGAGCTGACATACCACAAATAGTAATGCATAATCCCAGAGATAGTCACAGACCTGGGCAGTGATCCTGATATGCATAGAAAACTTACTTGAAACTGACAGTTCACATATCTGATCAGGTAATCCCAAAATATAAATGGTATGTTACAGGAATTCTGAGAGCTCTTTTAATTTAAGGAAAACAAGAACAGAACAATCAATGGAAAGGCAAAATGTAAGGACCATGACAGCAGACCCAGAGTGGTTTCTCTTCTTCTAAGGTCAATAAGTGAATGTTGGCCAGGTGCATTGGCTCACGCTTGTAATGCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGGTCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACTAGCCTGACCAACAAGGCGAAACCCGGTCCCTGTTAAAAATACATAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGGTACTCCGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCGGAGGCGGAGGTGGAGGCTGCGGTGA
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Task1_train_1458
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This gene mutation involves WARS2 (tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Neurodevelopmental disorder, mitochondrial, with abnormal movements and lactic acidosis, with or without seizures
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Task1_train_1459
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting WARS2 (tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Neurodevelopmental disorder, mitochondrial, with abnormal movements and lactic acidosis, with or without seizures
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AAAGTCATGTGTAAGCAAAGCCTTCCTGACCAACTATAAGGAATGAAGTTGAGGTAAATTGACTTTATGGTCCTTTTAAAGATCAGATTCTATTATTTTATCAAATTATCTACAAGCTGGCAACAAAGTTGATAACTGCATTTATTTTTTAAACATACAGTTGGCCCTCTGAATTTGTGTGTTCTGCATCCATGGACTCAACCAAACAGCAGATTGAAAATATTAGGAAAAAACAACTAATAAAAATAACACCGCCACTATATATACACTATGGAATACTACACAGTCATAACAAGGAATGAAATCATGTCTTTTGCAGCAACATGGAGGCCAACATGAAATACAGGCCATTACCCTAAGTGAAATCATTCAGAAACAGAAAATCAAATATTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAACTAAACAATAGGTACACATGGACATATAGAGAGAAATGGCAGACACTAGAGACTCCAAAAGCCAGGAAGAGGATGTTGGTTGAAAAATCACCTATTGAGTACAATGTTCACTATTTGGGTGACAGGTACACTAAAAGCTCAGACTTCACCACTACACAACATATCCATGTGACAAAACTGCACATACACCTTCCTAATCTCTAAAAATTTAAAAAATTAGTGTATATATATACATATATATGAAATCAGTGTGTATTTAGGCATCAAAAAATAACAATACCACGATAGAAAAATAATACAAATTAAAAAACAATACAGTATAACAACTATTTGCATAGCATTTATATTGTATTAGGTTATTATAAGTAATGTAGAGATGGTTTAAAGTATACGAGAGAGTATGTGTAGGTTATATGCAAATATGATTCCATTTTATATAAGGAACTTGAGCATCTGCAGATTTTGGTAGCTTTGGTGGTCCTGGAGCCAACACTCTTTGGATGCCAAGGGATCATTATACTCTTTTCGTTTATCACATATTTTTTAACTGTCTGCTCTGTAAGAATCATTACATTAAGTTTTATGTATAACAAAACATATATAAAAATAATGATAGAAATGTACAATCAAGGAAGGTTGCATATATACATGCATGTTAACATGTACCATAGCATGTATAACATACCATTCCTTGGCTGGGCTTTGTCCTAAGGTTAAAGCAGATACATAATGAAGGCATGATCTAGTTAGAATTTTCATCTTTTTCTAGGGTGTATCTTGATTGCCTTGTCTCTAGGCCAGACTATCGGCCTGTCCAAGAATAAACTGATTCATCCATAGTGAAGATATGAGTCAAATATTTTGGCTTTACTATGAAGCCTTTCTTGGCTTAGACACAACACACTGGGACTTTGTCTTCCAATTTCCCAACTTGTGCTATCAAATCTTCTCAAAAACTATTATAAAAAGAATGAACAATGGGAATCATCCAACAGACCTTCTAAATAGAACATCTAATAAAGCAACATTGGAATTACATAAAACTATTGGTCACTAACTTCTATCCTTGATCACAAGGAGATTAGTCAACAACACAAAGTAATCAGTTTGAAAGCAACCCAGCATAGCAAAACAATTCCAGGGCTAGAAGTACTAATGAAACACAATTCTTGGTATATGAAGCATCATAAACTTACCGAATACAGTGGAGGAAAAGCTGAAAAATACTCTTGCAATATAATGATACTTAATGATATAAATACAAGTAAAACATTAAGCTGAAAAAAATCACATTTGAAAAAGTCACCTTCAAACACTTTTTAAAAATCACGAGCAGGGGCTGTATGAACCATTCAACATTTTTTCCTCAAATAATCTACACATAAGAGTTTTCTCAGTTCTAATCTGAGAAGCTGACCTGAGATTGTTGGAAAAGGATGCTTTTTTCCGGGTTTATGCCACAGGCAAGAAGAACAGCAGTCATGTCCAGGATGCTCTGCCGAAGGACAGCTGGGTCTTGGGGGACAGTAATGGAGTGGAGGTCAACAATGCTGTATAATACAGAGTCATATTCATCCTGTAACCTCACCCAGCTCTCAATGGCTCCCAGGTAATTGCCCAGGTGGAGGATTCCTGTAGGTTGAATGCCGGAAAATACTCGCTTCTTGCTGTCTTTCTGGAACAAAGGAAAACAAGCATATTTGCTTTTGAGGCAGAATCCCATGAATCCTATGCCCATGTTATCATAGCTATGGGAGCTAGTTATATTTTTGTAAACTACAATCTGACAGTCATCATCATCCATTTATTTTGTGCCTACACTGTAAATCACTATGCTAGGTGCTACTAGGCACAAAAAAATGATATTAAAAATGTTTTTGCACTCAAACATGGACAAATGCAAAGACATATAAGAAAAGATCTGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCGTGCCTGTAATCCCGACACTTTGGGAGGCTGAAGAGGGTGGATCACCTGAGATCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATCACCTGGGCGTGGTGGTACACCTTTAATGCCAGCTACTCCGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCTAGCCTAGGCAACAGAGCGAGACCCCGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAGATCTGCATCCCCAAGAGCATGTGATCTAATTGGAGATAGAGGGTATTGTTTATGAAAAGATAAGTAAAGGTATAACATGGTAACATGATCATGACCAGTTTGGAATGATACAGAATAGGGTTCAGAGAGGAATTCCCAAGAGGAAAAGATAACTGAGGTTTGGTGGTCAACGAGGAAGCCTTCAGACATAGAATGAAATTTCACTGGAGATTAAAGGGGCCTCAAGGGTTTTTCATGTCATTTAATTTATTTTGCAGTTAAGGAAATGAAGGCCTTAGCATTAGTGCTAAAGGCTACTACTATTGCCTTAAGATTTTTTTATATTGTTGATATTATAATTTGGTGTATGAGATCTTGGGCTAGAAATTAGAAAACATACACTCTATTTCTAATATTACTTCTTAATAAGGTTATTTACATTTTCTATGCCTTGGTTTCCTTTTACTTTTAATAAAATCATATTTGGGTTTTCAATTCTTCAAAAGGAAATTTTAATTCTACATAATTATTTAAATTATAAAAAGCATTTTTACTCTGGTCATATTTTCCCTTTGGTTTGTACTTTCTAATACTGAAGTCATAATAGGAAAATGAAAAGAAAAAAAATGCAATACAAAGTAAAAAAAATTGCTATTTTTCCCCTGAATTATTTTATAATACATTCCATAGTGAAAAACCAAAAATGAGTATGTATCAATAAATATACTGTAACTAAAAGGCCCTGAGAAAATATAATGCATCATTATCATTTTTAACCACCACCACAGCAAAACAATAGCAGCAATAATTTACTGAACAACTATGTTGCAAGCATTTATGCCCAGTGCTTTACATATATTAATGCATTTAATCATTTTAATACCTAATATGGTAGGCATATTATTACCTCCAGTTTATAGATGAGAGACGTGAGGCTCACAGATTTAACTAGATTGCCCATGGTCACACAGCTAGTAAGTGGTGGAGTTGAGGTTTCAGGCCAGATATCACTGACTTCAAAGCCCATGTATGCTCTCTCTACTAGCTACTATGCTTTGCTTAGCTACCATCTATTAAGACTTTATTATATTCATTGTATTAATTTTGCAACTTTTCAGTCAGTTTAAAAATTTGCAAAATAAAAAATTACAGGGACAAAAAAGACCATTATTATACAGGTATCTTAATGTATTATGAGCCAAGTTTCTCTAGTGTATATATCTAGGAGTAGAATTGCCGAGTCATAAGGTATGTATACGTATCTTCAATTGTAGTACTTCAATATAGTGAACTATTCCTAAGTATGTAACATTATACACTTTCTACCAAGTTCCTGTTGTTCCATATCCTCATCAACACTTGGTATTAGCAGTCTTTTTATTTTTAGCTAATCTGATGGAAATGAGGTAGAATCTCATTATGGTTTAACTCTCTTTGATTATTAAAGAAGTTGGGAACTCTTTTTATGATTACTACC
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Task1_train_1460
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A mutation in HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2), located on Chromosome 1, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; 3 beta-Hydroxysteroid dehydrogenase deficiency
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Task1_train_1461
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This sequence change occurs on Chromosome 1, altering HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
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Pathogenic; not provided
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ATTCCACTCTCGGGCTGACACCCACCTCCTCCCCAGCAGCCTCTTCCCTGCCTCCACCATTCCAGGGCCTTCTTGGAGTTGCCTGACAGTGGGAAGGGGCTGGGAGTAGACAAAACAAGGCAGAGGCATCAGAAGAGCAAATGGTCCCACCTGTATCCCAGGAAGGAATTTCTCCAGCCTTGAATTTTTCATTCTGAATTTCGCTCTCACTGTTCTTTGGCCTTTGTGGGCATTTTCAGTTAAACTGGCTTATTCTTACTCTTTCTCAGAAAAGTTGATTCTAAACAGCTATTCCTGCACCTGGGGTACAGGGTACAAAAATGGCAGGTGGAATGGGCAGGTTTGAGCCTTCACTAGAAAATTGACTTTAGATCTGTCCCTTAACCTCTCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCAATAAAGTGGGACTCAGAATACCTACCTCACGAGATAGCTGTAAAAGGAAATAAGCAAGCTGTGAGCCGTATGCAGATTATAAAGCACAAATGAGTGTAGAGTATTTATCTGAGCTCCATGTAGCATGGTGTTCATTTTGTGGGCTAATTCCAGGTGACAACTTTACCGGCAGCGTCACTACCTGTGGATTTCAGAGGAGCCTGAAGATATGGATGTTACATCCGCTGCCCTTGGCTAGACATTAGACAGCTGAGATGTTAGTTCATTGGTGGCTAACTCATTTTCAGCATTGCTATCTGCTTTTTATGATATCTGATAAAAGTTTCTCAATGAAATTAATCATTTAAGCCCATCTGCAATTCCTGAGTAATGGCTCCACTCTCCTCCCAGTTGCCCAAGCAGGAAACTGTAAGGGTGATTTTGTCTCCTTTTCCTCTCATCCCAGCTCCAGTAGGTACCAGGACCTTCAAGGTGAGGTCTGAAATTCAAACCTGGAGTGCATCTCTCCCCTCCTCTGCTTCCACTGCTGGACCCTGGTTCCAGTCCTCATCTAAACTTTGGCACAGACATTCTGATTAATCTCTTGATCACCTGGCTTTCTCATTTCCCCTATACCAGTCTGTTTTATATCCTCAAGCCAAGGTAAACTTCCTACGCCACAACTCTGCGTCTGTTTATCTTTTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGAGACAGGGTCTTTCTCTGCCACTGAGGCTAGCATGCAGTGGCATGATCTCAATTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGACTCCATCCTTCCTCCTGCTTCAGGTTTGTGATTAGCTGGGACTATAGGCACATACCATCACGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGTAAAGACAGGGTTTTGCCATGTTTTCCAGCCAGACCTCCACCTCCAGAAATCAAGTGATTCACCACCTCAGAGTCCCAAAGAGCTGGAATTACAGGAATGAGCCACTGCACCCGGCCTGTTTCTCTACTTATTCCAACATAAATAAGGGTTTTTCTTTGACATGGTGCTGGAGACCCAAAATCATAATTCTATACATGATTCCTCATCGCCTACAGAATTAAATTCAAACTTTCCCTCTTATACCCAACTCTCCACAATCACTCTATTCTCCATAAAAAATTTGGTGAGTCTCCCATGACTCTAGCAATGCTTATATTTCACGGATGTGTGACAATTCACTGCTCACATTACTTTTCTGGAATAAGATGGGGTAGAAACAGATGTTTGCTCTTTCCCAATAAACTGCTACACATGCTGATTTCTGTGCTTTTGTTTACTTGTTCCTTTTATGGAATGTAGTACACCCTCCACTCTAATACCCACACTCTAATCTCTTTGAGCACCTATGTAACATCGCCTTTATCAGAAAACTTCCCAGCCAGATCCAGAAATCTTTCCAATGACCTGACCTGTGTTCACACAGAGCTCCAGAACAGGACCAAGCTGACTGTACTTGAAGGAGACATTCTGGATGAGCCATTCCTGAAAAGAGCCTGCCAGGACGTCTCGGTCGTCATCCACACCGCCTGTATCATTGATGTCTTTGGTGTCACTCACAGAGAGTCCATCATGAATGTCAATGTGAAAGGTACAGTAGCCTGGGGAGGAGATAAAACAAGTTGGTTAAATGAGGATCAGAAAGAAGGACAAGAAAGGGAAGAGAAGTCACTCCATTGAACACCTGCTGAGCTCTTGGCCAAGTGCCTTTGCTGATCACTACTGACTGGGGAGTTCAAGGCTGGTAACCTCAGTTTTTTAGATGAGAAAACTAGGGCTGAGAGACAGCAAGTAACTTGTCCAAGGCCCCAAAAGTAAGTAAGTAAGTAGGAGAGTTAGACTTTAAACTCACTCCTGTGTGACTCCAAAGGCTGTGGAAGCTCTTTCTACTGTGGCCCCAATCAAAAGTCAACTAAACTCCAACTTCAAATTCACGATATCCAGCTACTCCTTGGCTCCCCGGGCCAGAATCAGACCTTCCAGGTGCCACCATAGTCATCATTTTGAACCTTGTGTGTAGGCTGATGAGAACATTCAGAGTCTTCCTGCCCACCTCAAAGAAGTCCTCTCAAGAGAACTAGCAAAGCTGGTTCACAGAGGTCTGTCAGGACAGAATTATCCAGCACATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTT
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Task1_train_1462
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Located on Chromosome 1, this mutation impacts HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; 3 beta-Hydroxysteroid dehydrogenase deficiency
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ACTCACTCCTGTGTGACTCCAAAGGCTGTGGAAGCTCTTTCTACTGTGGCCCCAATCAAAAGTCAACTAAACTCCAACTTCAAATTCACGATATCCAGCTACTCCTTGGCTCCCCGGGCCAGAATCAGACCTTCCAGGTGCCACCATAGTCATCATTTTGAACCTTGTGTGTAGGCTGATGAGAACATTCAGAGTCTTCCTGCCCACCTCAAAGAAGTCCTCTCAAGAGAACTAGCAAAGCTGGTTCACAGAGGTCTGTCAGGACAGAATTATCCAGCACATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCTACGGCTGTATCATGACCCAATCTCAGTCAGAGCCACAGAAGAATGCACCCTGAGTCTGTTATAACCACTGCACTTGGGAGTGGGGAGTGGGGCACATGGATCTGTGCATGTGGTTGCAGCTCCTTTGGGATATTTCCTGACACTGTCATCATGCTCTTCGTGGGCAGGTACCCAGCTACTGTTGGAGGCCTGTGTCCAAGCCAGTGTGCCAGTCTTCATCTACACCAGTAGCATAGAGGTAGCCGGGCCCAACTCCTACAAGGAAATCATCCAGAACGGCCACGAAGAAGAGCCTCTGGAAAACACATGGCCCACTCCATACCCGTACAGCAAAAAGCTTGCTGAGAAGGCTGTGCTGGCGGCTAATGGGTGGAATCTAAAAAATGGTGATACCTTGTACACTTGTGCGTTAAGACCCACATATATCTATGGGGAAGGAGGCCCATTCCTTTCTGCCAGTATAAATGAGGCCCTGAACAACAATGGGATCCTGTCAAGTGTTGGAAAGTTCTCTACAGTCAACCCAGTCTATGTTGGCAACGTGGCCTGGGCCCACATTCTGGCCTTGAGGGCTCTGCGGGACCCCAAGAAGGCCCCAAGTGTCCGAGGTCAATTCTATTACATCTCAGATGACACGCCTCACCAAAGCTATGATAACCTTAATTACATCCTGAGCAAAGAGTTTGGCCTCCGCCTTGATTCCAGATGGAGCCTTCCTTTAACCCTGATGTACTGGATTGGCTTCCTGCTGGAAGTAGTGAGCTTCCTACTCAGCCCAATTTACTCCTATCAACCCCCCTTCAACCGCCACACAGTCACATTATCAAATAGTGTGTTCACCTTCTCTTACAAGAAGGCTCAGCGAGATCTGGCGTATAAGCCACTCTACAGCTGGGAGGAAGCCAAGCAGAAAACCGTGGAGTGGGTTGGTTCCCTTGTGGACCGGCACAAGGAGACCCTGAAGTCCAAGACTCAGTGATTTAAGGATGACAGAGATGTGCATGTGGGTATTGTTAGGAAATGTCATCAAACTCCACCCACCTGGCTTCATACAGAAGGCAACAGGGGCACAAGCCCAGGTCCTGCTGCCTCTCTTTCACACAATGCCCAACTTACTGTCTTCTTCATGTCATCAAAATCTGCACAGTCACTGGCCCAACCAGAACTTTCTGTCCTAATCATACACCAGAAGACAAACAATATGATTTGCTGTTACCAAATCTCAGTGGCTGATTCTGAACAATTGTGGTCTCTCTTAACTTGAGGTTCTCTTTTGACTAATAGAGCTCCATTTCCCCTCTTAAATGAGAAAGCATTTCTTTTCTCTTTAATCTCCTATTCCTTCACACAGTTCAACATAAAGAGCAATAAATGTTTTAATGCTTAACATGGAGAGAAGCATGGTTTCTGTTAATACATACTTTCATCCTTTTCCTTTCATTTCCAACTATCACCATCTCCAACTTAGAAGAGTAGCATGAAACCAGGGTTGGGGGGTGGGCAGAGTAGTAGGAGGTACAGAAAGGGCAGATGAATACTGAATAAGCTCTACTATGTTTTAGGCATGTATGAAATGAACTACATATGACATATATTATCTCATTTAATACTCATCAGAAACCTGTCAATTGAGGAAAATGACAAGACACGTCTCAATCATTTTAGGAGATTCACTTGAAGATGTGCCCAGGAGACAGGCCTATGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGGGCTCCAATTCAAAGGAGGGAAAGAGAGGGATATTGAGAAGCACACAGTTTTTATGTAACGGGATGGTAGGAAAAAAATAGTCATTCATGCCTTTGTCTGGCTCAGTGAATCTGCATTTTTTACATAAGATGACATAAACAGTAGGGGCAGAGGGAAATGCAGATTCCCTGCATTTTACATAAAATAACAGACAAAATGGGGTAGGGGAAAAATCAGATAGGCATTTGTGTCTGGGGTAACTGCACCGGTAGTGATAAGCTATCAATTTGCATTGCCGTGGTGAAGTTTTAACAGCTCACTAGGAAATTCCTTGTGGGCAAAATATGGGGGAGGCATGTAGCTTTTCATCTTGTAGCCATCTTGTTTAGGCACCAAAAGGGGGGAGGCAGGTTTGCCTGACCCAGTTCCCAGCTTGATTTTTCCCTTTGGCTAAATGAGATTGGGGCCCCATAATTTAATTTTTTTCACGTTTTCCCCCTTTTTTTCTCTAAACTCTTTTGAAGTACTGCATTTTGAAAGAAATATGCATTCCTGGCCTCTGGTTGCTTTTTCTTTTTTTTTTT
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ACTCACTCCTGTGTGACTCCAAAGGCTGTGGAAGCTCTTTCTACTGTGGCCCCAATCAAAAGTCAACTAAACTCCAACTTCAAATTCACGATATCCAGCTACTCCTTGGCTCCCCGGGCCAGAATCAGACCTTCCAGGTGCCACCATAGTCATCATTTTGAACCTTGTGTGTAGGCTGATGAGAACATTCAGAGTCTTCCTGCCCACCTCAAAGAAGTCCTCTCAAGAGAACTAGCAAAGCTGGTTCACAGAGGTCTGTCAGGACAGAATTATCCAGCACATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCTACGGCTGTATCATGACCCAATCTCAGTCAGAGCCACAGAAGAATGCACCCTGAGTCTGTTATAACCACTGCACTTGGGAGTGGGGAGTGGGGCACATGGATCTGTGCATGTGGTTGCAGCTCCTTTGGGATATTTCCTGACACTGTCATCATGCTCTTCGTGGGCAGGTACCCAGCTACTGTTGGAGGCCTGTGTCCAAGCCAGTGTGCCAGTCTTCATCTACACCAGTAGCATAGAGGTAGCCAGGCCCAACTCCTACAAGGAAATCATCCAGAACGGCCACGAAGAAGAGCCTCTGGAAAACACATGGCCCACTCCATACCCGTACAGCAAAAAGCTTGCTGAGAAGGCTGTGCTGGCGGCTAATGGGTGGAATCTAAAAAATGGTGATACCTTGTACACTTGTGCGTTAAGACCCACATATATCTATGGGGAAGGAGGCCCATTCCTTTCTGCCAGTATAAATGAGGCCCTGAACAACAATGGGATCCTGTCAAGTGTTGGAAAGTTCTCTACAGTCAACCCAGTCTATGTTGGCAACGTGGCCTGGGCCCACATTCTGGCCTTGAGGGCTCTGCGGGACCCCAAGAAGGCCCCAAGTGTCCGAGGTCAATTCTATTACATCTCAGATGACACGCCTCACCAAAGCTATGATAACCTTAATTACATCCTGAGCAAAGAGTTTGGCCTCCGCCTTGATTCCAGATGGAGCCTTCCTTTAACCCTGATGTACTGGATTGGCTTCCTGCTGGAAGTAGTGAGCTTCCTACTCAGCCCAATTTACTCCTATCAACCCCCCTTCAACCGCCACACAGTCACATTATCAAATAGTGTGTTCACCTTCTCTTACAAGAAGGCTCAGCGAGATCTGGCGTATAAGCCACTCTACAGCTGGGAGGAAGCCAAGCAGAAAACCGTGGAGTGGGTTGGTTCCCTTGTGGACCGGCACAAGGAGACCCTGAAGTCCAAGACTCAGTGATTTAAGGATGACAGAGATGTGCATGTGGGTATTGTTAGGAAATGTCATCAAACTCCACCCACCTGGCTTCATACAGAAGGCAACAGGGGCACAAGCCCAGGTCCTGCTGCCTCTCTTTCACACAATGCCCAACTTACTGTCTTCTTCATGTCATCAAAATCTGCACAGTCACTGGCCCAACCAGAACTTTCTGTCCTAATCATACACCAGAAGACAAACAATATGATTTGCTGTTACCAAATCTCAGTGGCTGATTCTGAACAATTGTGGTCTCTCTTAACTTGAGGTTCTCTTTTGACTAATAGAGCTCCATTTCCCCTCTTAAATGAGAAAGCATTTCTTTTCTCTTTAATCTCCTATTCCTTCACACAGTTCAACATAAAGAGCAATAAATGTTTTAATGCTTAACATGGAGAGAAGCATGGTTTCTGTTAATACATACTTTCATCCTTTTCCTTTCATTTCCAACTATCACCATCTCCAACTTAGAAGAGTAGCATGAAACCAGGGTTGGGGGGTGGGCAGAGTAGTAGGAGGTACAGAAAGGGCAGATGAATACTGAATAAGCTCTACTATGTTTTAGGCATGTATGAAATGAACTACATATGACATATATTATCTCATTTAATACTCATCAGAAACCTGTCAATTGAGGAAAATGACAAGACACGTCTCAATCATTTTAGGAGATTCACTTGAAGATGTGCCCAGGAGACAGGCCTATGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGGGCTCCAATTCAAAGGAGGGAAAGAGAGGGATATTGAGAAGCACACAGTTTTTATGTAACGGGATGGTAGGAAAAAAATAGTCATTCATGCCTTTGTCTGGCTCAGTGAATCTGCATTTTTTACATAAGATGACATAAACAGTAGGGGCAGAGGGAAATGCAGATTCCCTGCATTTTACATAAAATAACAGACAAAATGGGGTAGGGGAAAAATCAGATAGGCATTTGTGTCTGGGGTAACTGCACCGGTAGTGATAAGCTATCAATTTGCATTGCCGTGGTGAAGTTTTAACAGCTCACTAGGAAATTCCTTGTGGGCAAAATATGGGGGAGGCATGTAGCTTTTCATCTTGTAGCCATCTTGTTTAGGCACCAAAAGGGGGGAGGCAGGTTTGCCTGACCCAGTTCCCAGCTTGATTTTTCCCTTTGGCTAAATGAGATTGGGGCCCCATAATTTAATTTTTTTCACGTTTTCCCCCTTTTTTTCTCTAAACTCTTTTGAAGTACTGCATTTTGAAAGAAATATGCATTCCTGGCCTCTGGTTGCTTTTTCTTTTTTTTTTT
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Task1_train_1463
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This genomic variant is located on Chromosome 1, within the HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Congenital adrenal hyperplasia
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ACTCACTCCTGTGTGACTCCAAAGGCTGTGGAAGCTCTTTCTACTGTGGCCCCAATCAAAAGTCAACTAAACTCCAACTTCAAATTCACGATATCCAGCTACTCCTTGGCTCCCCGGGCCAGAATCAGACCTTCCAGGTGCCACCATAGTCATCATTTTGAACCTTGTGTGTAGGCTGATGAGAACATTCAGAGTCTTCCTGCCCACCTCAAAGAAGTCCTCTCAAGAGAACTAGCAAAGCTGGTTCACAGAGGTCTGTCAGGACAGAATTATCCAGCACATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCTACGGCTGTATCATGACCCAATCTCAGTCAGAGCCACAGAAGAATGCACCCTGAGTCTGTTATAACCACTGCACTTGGGAGTGGGGAGTGGGGCACATGGATCTGTGCATGTGGTTGCAGCTCCTTTGGGATATTTCCTGACACTGTCATCATGCTCTTCGTGGGCAGGTACCCAGCTACTGTTGGAGGCCTGTGTCCAAGCCAGTGTGCCAGTCTTCATCTACACCAGTAGCATAGAGGTAGCCGGGCCCAACTCCTACAAGGAAATCATCCAGAACGGCCACGAAGAAGAGCCTCTGGAAAACACATGGCCCACTCCATACCCGTACAGCAAAAAGCTTGCTGAGAAGGCTGTGCTGGCGGCTAATGGGTGGAATCTAAAAAATGGTGATACCTTGTACACTTGTGCGTTAAGACCCACATATATCTATGGGGAAGGAGGCCCATTCCTTTCTGCCAGTATAAATGAGGCCCTGAACAACAATGGGATCCTGTCAAGTGTTGGAAAGTTCTCTACAGTCAACCCAGTCTATGTTGGCAACGTGGCCTGGGCCCACATTCTGGCCTTGAGGGCTCTGCGGGACCCCAAGAAGGCCCCAAGTGTCCGAGGTCAATTCTATTACATCTCAGATGACACGCCTCACCAAAGCTATGATAACCTTAATTACATCCTGAGCAAAGAGTTTGGCCTCCGCCTTGATTCCAGATGGAGCCTTCCTTTAACCCTGATGTACTGGATTGGCTTCCTGCTGGAAGTAGTGAGCTTCCTACTCAGCCCAATTTACTCCTATCAACCCCCCTTCAACCGCCACACAGTCACATTATCAAATAGTGTGTTCACCTTCTCTTACAAGAAGGCTCAGCGAGATCTGGCGTATAAGCCACTCTACAGCTGGGAGGAAGCCAAGCAGAAAACCGTGGAGTGGGTTGGTTCCCTTGTGGACCGGCACAAGGAGACCCTGAAGTCCAAGACTCAGTGATTTAAGGATGACAGAGATGTGCATGTGGGTATTGTTAGGAAATGTCATCAAACTCCACCCACCTGGCTTCATACAGAAGGCAACAGGGGCACAAGCCCAGGTCCTGCTGCCTCTCTTTCACACAATGCCCAACTTACTGTCTTCTTCATGTCATCAAAATCTGCACAGTCACTGGCCCAACCAGAACTTTCTGTCCTAATCATACACCAGAAGACAAACAATATGATTTGCTGTTACCAAATCTCAGTGGCTGATTCTGAACAATTGTGGTCTCTCTTAACTTGAGGTTCTCTTTTGACTAATAGAGCTCCATTTCCCCTCTTAAATGAGAAAGCATTTCTTTTCTCTTTAATCTCCTATTCCTTCACACAGTTCAACATAAAGAGCAATAAATGTTTTAATGCTTAACATGGAGAGAAGCATGGTTTCTGTTAATACATACTTTCATCCTTTTCCTTTCATTTCCAACTATCACCATCTCCAACTTAGAAGAGTAGCATGAAACCAGGGTTGGGGGGTGGGCAGAGTAGTAGGAGGTACAGAAAGGGCAGATGAATACTGAATAAGCTCTACTATGTTTTAGGCATGTATGAAATGAACTACATATGACATATATTATCTCATTTAATACTCATCAGAAACCTGTCAATTGAGGAAAATGACAAGACACGTCTCAATCATTTTAGGAGATTCACTTGAAGATGTGCCCAGGAGACAGGCCTATGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGGGCTCCAATTCAAAGGAGGGAAAGAGAGGGATATTGAGAAGCACACAGTTTTTATGTAACGGGATGGTAGGAAAAAAATAGTCATTCATGCCTTTGTCTGGCTCAGTGAATCTGCATTTTTTACATAAGATGACATAAACAGTAGGGGCAGAGGGAAATGCAGATTCCCTGCATTTTACATAAAATAACAGACAAAATGGGGTAGGGGAAAAATCAGATAGGCATTTGTGTCTGGGGTAACTGCACCGGTAGTGATAAGCTATCAATTTGCATTGCCGTGGTGAAGTTTTAACAGCTCACTAGGAAATTCCTTGTGGGCAAAATATGGGGGAGGCATGTAGCTTTTCATCTTGTAGCCATCTTGTTTAGGCACCAAAAGGGGGGAGGCAGGTTTGCCTGACCCAGTTCCCAGCTTGATTTTTCCCTTTGGCTAAATGAGATTGGGGCCCCATAATTTAATTTTTTTCACGTTTTCCCCCTTTTTTTCTCTAAACTCTTTTGAAGTACTGCATTTTGAAAGAAATATGCATTCCTGGCCTCTGGTTGCTTTTTCTTTTTTTTTTT
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ACTCACTCCTGTGTGACTCCAAAGGCTGTGGAAGCTCTTTCTACTGTGGCCCCAATCAAAAGTCAACTAAACTCCAACTTCAAATTCACGATATCCAGCTACTCCTTGGCTCCCCGGGCCAGAATCAGACCTTCCAGGTGCCACCATAGTCATCATTTTGAACCTTGTGTGTAGGCTGATGAGAACATTCAGAGTCTTCCTGCCCACCTCAAAGAAGTCCTCTCAAGAGAACTAGCAAAGCTGGTTCACAGAGGTCTGTCAGGACAGAATTATCCAGCACATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCTACGGCTGTATCATGACCCAATCTCAGTCAGAGCCACAGAAGAATGCACCCTGAGTCTGTTATAACCACTGCACTTGGGAGTGGGGAGTGGGGCACATGGATCTGTGCATGTGGTTGCAGCTCCTTTGGGATATTTCCTGACACTGTCATCATGCTCTTCGTGGGCAGGTACCCAGCTACTGTTGGAGGCCTGTGTCCAAGCCAGTGTGCCAGTCTTCATCTACACCAGTAGCATAGAGGTAGCCAGGCCCAACTCCTACAAGGAAATCATCCAGAACGGCCACGAAGAAGAGCCTCTGGAAAACACATGGCCCACTCCATACCCGTACAGCAAAAAGCTTGCTGAGAAGGCTGTGCTGGCGGCTAATGGGTGGAATCTAAAAAATGGTGATACCTTGTACACTTGTGCGTTAAGACCCACATATATCTATGGGGAAGGAGGCCCATTCCTTTCTGCCAGTATAAATGAGGCCCTGAACAACAATGGGATCCTGTCAAGTGTTGGAAAGTTCTCTACAGTCAACCCAGTCTATGTTGGCAACGTGGCCTGGGCCCACATTCTGGCCTTGAGGGCTCTGCGGGACCCCAAGAAGGCCCCAAGTGTCCGAGGTCAATTCTATTACATCTCAGATGACACGCCTCACCAAAGCTATGATAACCTTAATTACATCCTGAGCAAAGAGTTTGGCCTCCGCCTTGATTCCAGATGGAGCCTTCCTTTAACCCTGATGTACTGGATTGGCTTCCTGCTGGAAGTAGTGAGCTTCCTACTCAGCCCAATTTACTCCTATCAACCCCCCTTCAACCGCCACACAGTCACATTATCAAATAGTGTGTTCACCTTCTCTTACAAGAAGGCTCAGCGAGATCTGGCGTATAAGCCACTCTACAGCTGGGAGGAAGCCAAGCAGAAAACCGTGGAGTGGGTTGGTTCCCTTGTGGACCGGCACAAGGAGACCCTGAAGTCCAAGACTCAGTGATTTAAGGATGACAGAGATGTGCATGTGGGTATTGTTAGGAAATGTCATCAAACTCCACCCACCTGGCTTCATACAGAAGGCAACAGGGGCACAAGCCCAGGTCCTGCTGCCTCTCTTTCACACAATGCCCAACTTACTGTCTTCTTCATGTCATCAAAATCTGCACAGTCACTGGCCCAACCAGAACTTTCTGTCCTAATCATACACCAGAAGACAAACAATATGATTTGCTGTTACCAAATCTCAGTGGCTGATTCTGAACAATTGTGGTCTCTCTTAACTTGAGGTTCTCTTTTGACTAATAGAGCTCCATTTCCCCTCTTAAATGAGAAAGCATTTCTTTTCTCTTTAATCTCCTATTCCTTCACACAGTTCAACATAAAGAGCAATAAATGTTTTAATGCTTAACATGGAGAGAAGCATGGTTTCTGTTAATACATACTTTCATCCTTTTCCTTTCATTTCCAACTATCACCATCTCCAACTTAGAAGAGTAGCATGAAACCAGGGTTGGGGGGTGGGCAGAGTAGTAGGAGGTACAGAAAGGGCAGATGAATACTGAATAAGCTCTACTATGTTTTAGGCATGTATGAAATGAACTACATATGACATATATTATCTCATTTAATACTCATCAGAAACCTGTCAATTGAGGAAAATGACAAGACACGTCTCAATCATTTTAGGAGATTCACTTGAAGATGTGCCCAGGAGACAGGCCTATGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGGGCTCCAATTCAAAGGAGGGAAAGAGAGGGATATTGAGAAGCACACAGTTTTTATGTAACGGGATGGTAGGAAAAAAATAGTCATTCATGCCTTTGTCTGGCTCAGTGAATCTGCATTTTTTACATAAGATGACATAAACAGTAGGGGCAGAGGGAAATGCAGATTCCCTGCATTTTACATAAAATAACAGACAAAATGGGGTAGGGGAAAAATCAGATAGGCATTTGTGTCTGGGGTAACTGCACCGGTAGTGATAAGCTATCAATTTGCATTGCCGTGGTGAAGTTTTAACAGCTCACTAGGAAATTCCTTGTGGGCAAAATATGGGGGAGGCATGTAGCTTTTCATCTTGTAGCCATCTTGTTTAGGCACCAAAAGGGGGGAGGCAGGTTTGCCTGACCCAGTTCCCAGCTTGATTTTTCCCTTTGGCTAAATGAGATTGGGGCCCCATAATTTAATTTTTTTCACGTTTTCCCCCTTTTTTTCTCTAAACTCTTTTGAAGTACTGCATTTTGAAAGAAATATGCATTCCTGGCCTCTGGTTGCTTTTTCTTTTTTTTTTT
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Task1_train_1464
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The variant affects gene HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2), which is on Chromosome 1. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; not provided
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TCTACTGTGGCCCCAATCAAAAGTCAACTAAACTCCAACTTCAAATTCACGATATCCAGCTACTCCTTGGCTCCCCGGGCCAGAATCAGACCTTCCAGGTGCCACCATAGTCATCATTTTGAACCTTGTGTGTAGGCTGATGAGAACATTCAGAGTCTTCCTGCCCACCTCAAAGAAGTCCTCTCAAGAGAACTAGCAAAGCTGGTTCACAGAGGTCTGTCAGGACAGAATTATCCAGCACATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCTACGGCTGTATCATGACCCAATCTCAGTCAGAGCCACAGAAGAATGCACCCTGAGTCTGTTATAACCACTGCACTTGGGAGTGGGGAGTGGGGCACATGGATCTGTGCATGTGGTTGCAGCTCCTTTGGGATATTTCCTGACACTGTCATCATGCTCTTCGTGGGCAGGTACCCAGCTACTGTTGGAGGCCTGTGTCCAAGCCAGTGTGCCAGTCTTCATCTACACCAGTAGCATAGAGGTAGCCGGGCCCAACTCCTACAAGGAAATCATCCAGAACGGCCACAAAGAAGAGCCTCTGGAAAACACATGGCCCACTCCATACCCGTACAGCAAAAAGCTTGCTGAGAAGGCTGTGCTGGCGGCTAATGGGTGGAATCTAAAAAATGGTGATACCTTGTACACTTGTGCGTTAAGACCCACATATATCTATGGGGAAGGAGGCCCATTCCTTTCTGCCAGTATAAATGAGGCCCTGAACAACAATGGGATCCTGTCAAGTGTTGGAAAGTTCTCTACAGTCAACCCAGTCTATGTTGGCAACGTGGCCTGGGCCCACATTCTGGCCTTGAGGGCTCTGCGGGACCCCAAGAAGGCCCCAAGTGTCCGAGGTCAATTCTATTACATCTCAGATGACACGCCTCACCAAAGCTATGATAACCTTAATTACATCCTGAGCAAAGAGTTTGGCCTCCGCCTTGATTCCAGATGGAGCCTTCCTTTAACCCTGATGTACTGGATTGGCTTCCTGCTGGAAGTAGTGAGCTTCCTACTCAGCCCAATTTACTCCTATCAACCCCCCTTCAACCGCCACACAGTCACATTATCAAATAGTGTGTTCACCTTCTCTTACAAGAAGGCTCAGCGAGATCTGGCGTATAAGCCACTCTACAGCTGGGAGGAAGCCAAGCAGAAAACCGTGGAGTGGGTTGGTTCCCTTGTGGACCGGCACAAGGAGACCCTGAAGTCCAAGACTCAGTGATTTAAGGATGACAGAGATGTGCATGTGGGTATTGTTAGGAAATGTCATCAAACTCCACCCACCTGGCTTCATACAGAAGGCAACAGGGGCACAAGCCCAGGTCCTGCTGCCTCTCTTTCACACAATGCCCAACTTACTGTCTTCTTCATGTCATCAAAATCTGCACAGTCACTGGCCCAACCAGAACTTTCTGTCCTAATCATACACCAGAAGACAAACAATATGATTTGCTGTTACCAAATCTCAGTGGCTGATTCTGAACAATTGTGGTCTCTCTTAACTTGAGGTTCTCTTTTGACTAATAGAGCTCCATTTCCCCTCTTAAATGAGAAAGCATTTCTTTTCTCTTTAATCTCCTATTCCTTCACACAGTTCAACATAAAGAGCAATAAATGTTTTAATGCTTAACATGGAGAGAAGCATGGTTTCTGTTAATACATACTTTCATCCTTTTCCTTTCATTTCCAACTATCACCATCTCCAACTTAGAAGAGTAGCATGAAACCAGGGTTGGGGGGTGGGCAGAGTAGTAGGAGGTACAGAAAGGGCAGATGAATACTGAATAAGCTCTACTATGTTTTAGGCATGTATGAAATGAACTACATATGACATATATTATCTCATTTAATACTCATCAGAAACCTGTCAATTGAGGAAAATGACAAGACACGTCTCAATCATTTTAGGAGATTCACTTGAAGATGTGCCCAGGAGACAGGCCTATGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGGGCTCCAATTCAAAGGAGGGAAAGAGAGGGATATTGAGAAGCACACAGTTTTTATGTAACGGGATGGTAGGAAAAAAATAGTCATTCATGCCTTTGTCTGGCTCAGTGAATCTGCATTTTTTACATAAGATGACATAAACAGTAGGGGCAGAGGGAAATGCAGATTCCCTGCATTTTACATAAAATAACAGACAAAATGGGGTAGGGGAAAAATCAGATAGGCATTTGTGTCTGGGGTAACTGCACCGGTAGTGATAAGCTATCAATTTGCATTGCCGTGGTGAAGTTTTAACAGCTCACTAGGAAATTCCTTGTGGGCAAAATATGGGGGAGGCATGTAGCTTTTCATCTTGTAGCCATCTTGTTTAGGCACCAAAAGGGGGGAGGCAGGTTTGCCTGACCCAGTTCCCAGCTTGATTTTTCCCTTTGGCTAAATGAGATTGGGGCCCCATAATTTAATTTTTTTCACGTTTTCCCCCTTTTTTTCTCTAAACTCTTTTGAAGTACTGCATTTTGAAAGAAATATGCATTCCTGGCCTCTGGTTGCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGCTGGTTTCTCATGGCTAGGATGGTTTATTCCTAG
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Task1_train_1465
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Here is a genetic alteration in HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2) on Chromosome 1. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; 3 beta-Hydroxysteroid dehydrogenase deficiency
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CATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCTACGGCTGTATCATGACCCAATCTCAGTCAGAGCCACAGAAGAATGCACCCTGAGTCTGTTATAACCACTGCACTTGGGAGTGGGGAGTGGGGCACATGGATCTGTGCATGTGGTTGCAGCTCCTTTGGGATATTTCCTGACACTGTCATCATGCTCTTCGTGGGCAGGTACCCAGCTACTGTTGGAGGCCTGTGTCCAAGCCAGTGTGCCAGTCTTCATCTACACCAGTAGCATAGAGGTAGCCGGGCCCAACTCCTACAAGGAAATCATCCAGAACGGCCACGAAGAAGAGCCTCTGGAAAACACATGGCCCACTCCATACCCGTACAGCAAAAAGCTTGCTGAGAAGGCTGTGCTGGCGGCTAATGGGTGGAATCTAAAAAATGGTGATACCTTGTACACTTGTGCGTTAAGACCCACATATATCTATGGGGAAGGAGGCCCATTCCTTTCTGCCAGTATAAATGAGGCCCTGAACAACAATGGGATCCTGTCAAGTGTTGGAAAGTTCTCTACAGTCAACCCAGTCTATGTTGGCAACGTGGCCTGGGCCCACATTCTGGCCTTGAGGGCTCTGCGGGACCCCAAGAAGGCCCCAAGTGTCCGAGGTCAATTCTATTACATCTCAGATGACACGCCTCACCAAAGCTATGATAACCTTAATTACATCCTGAGCAAAGAGTTTGGCCTCCGCCTTGATTCCAGATGGAGCCTTCCTTTAACCCTGATGTACTGGATTGGCTTCCTGCTGGAAGTAGTGAGCTTCCTACTCAGCCCAATTTACTCCTATCAACCCCCCTTCAACCGCCACACAGTCACATTATCAAATAGTGTGTTCACCTTCTCTTACAAGAAGGCTCAGCGAGATCTGGCGTATAAGCCACTCTACAGCTGGGAGGAAGCCAAGCAGAAAACCGTGGAGTGGGTTGGTTCCCTTGTGGACCGGCACAAGGAGACCCTGAAGTCCAAGACTCAGTGATTTAAGGATGACAGAGATGTGCATGTGGGTATTGTTAGGAAATGTCATCAAACTCCACCCACCTGGCTTCATACAGAAGGCAACAGGGGCACAAGCCCAGGTCCTGCTGCCTCTCTTTCACACAATGCCCAACTTACTGTCTTCTTCATGTCATCAAAATCTGCACAGTCACTGGCCCAACCAGAACTTTCTGTCCTAATCATACACCAGAAGACAAACAATATGATTTGCTGTTACCAAATCTCAGTGGCTGATTCTGAACAATTGTGGTCTCTCTTAACTTGAGGTTCTCTTTTGACTAATAGAGCTCCATTTCCCCTCTTAAATGAGAAAGCATTTCTTTTCTCTTTAATCTCCTATTCCTTCACACAGTTCAACATAAAGAGCAATAAATGTTTTAATGCTTAACATGGAGAGAAGCATGGTTTCTGTTAATACATACTTTCATCCTTTTCCTTTCATTTCCAACTATCACCATCTCCAACTTAGAAGAGTAGCATGAAACCAGGGTTGGGGGGTGGGCAGAGTAGTAGGAGGTACAGAAAGGGCAGATGAATACTGAATAAGCTCTACTATGTTTTAGGCATGTATGAAATGAACTACATATGACATATATTATCTCATTTAATACTCATCAGAAACCTGTCAATTGAGGAAAATGACAAGACACGTCTCAATCATTTTAGGAGATTCACTTGAAGATGTGCCCAGGAGACAGGCCTATGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGGGCTCCAATTCAAAGGAGGGAAAGAGAGGGATATTGAGAAGCACACAGTTTTTATGTAACGGGATGGTAGGAAAAAAATAGTCATTCATGCCTTTGTCTGGCTCAGTGAATCTGCATTTTTTACATAAGATGACATAAACAGTAGGGGCAGAGGGAAATGCAGATTCCCTGCATTTTACATAAAATAACAGACAAAATGGGGTAGGGGAAAAATCAGATAGGCATTTGTGTCTGGGGTAACTGCACCGGTAGTGATAAGCTATCAATTTGCATTGCCGTGGTGAAGTTTTAACAGCTCACTAGGAAATTCCTTGTGGGCAAAATATGGGGGAGGCATGTAGCTTTTCATCTTGTAGCCATCTTGTTTAGGCACCAAAAGGGGGGAGGCAGGTTTGCCTGACCCAGTTCCCAGCTTGATTTTTCCCTTTGGCTAAATGAGATTGGGGCCCCATAATTTAATTTTTTTCACGTTTTCCCCCTTTTTTTCTCTAAACTCTTTTGAAGTACTGCATTTTGAAAGAAATATGCATTCCTGGCCTCTGGTTGCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGCTGGTTTCTCATGGCTAGGATGGTTTATTCCTAGAAGTTCAGGTCCCACATCACTAGGAAGGCTCATTCCTGGGAGGTTATGTCTCACCTTGCTAGGAAGGCTTATTCCTAGGAAATCTTGTCCCATGAAGAAAAAAAAAAAATGGAGGGGTGGGGTGGAAGAAGGGAAAATGAGAGGAAACCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAATATATAGGGACCTAGGCCAGATTTATAGCAACAAAAGGAAAGCAAACCTGGAAGCTGGGT
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Task1_train_1466
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Here is a variant affecting HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Congenital adrenal hyperplasia
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Task1_train_1467
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This gene mutation involves HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Congenital adrenal hyperplasia
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ATGCCTTCCCATAATATTTTCTTAACAAAAAGAGTTTCCCAGTGTCCAGAATACAATCTCTTCAGCTCACCACAGGGTCTACTATTACAGAGCCATTTCCTGCCAGGTGCCCAAAGTGCACCCTCATTTGATCCACATTTTTTAAAGGAATCTTGCCATGCAGTCTCACCCTCTGATTCCCAGAGCCCAGTCTCTTCAAAACACAGCTCCCCACTGCTGGCCTGACCCTCCACATTCAGACTACCCAAACTCCTTTTATAAAGCAACTAATTGCTTTTGAGTCTCCAGCACTGTCTAAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTTTCCAGTTTCTACATAGCCATACCCCTAAGTACCGCTATAGTTCAAGGAGTGTGCTAAGAGTGAATAGTTTTTTGTTTTAATTTTGACTTTCCACAGCTCCCAAAAACAAGGGATAAGAAATGACAAGGGGAGTGTTAGAGGCGTCTGTTTCTTAAAACCATTATCACTCCCGGGCTTAGAAAATACTTCACAATGATGGCCATTTCATGAGGCTGTCTCTCCAGAAACTCAAATTGCACAGAGACTTTAAAAGTGGCTAAGAATACAAAATAAGTAAATAAAAATGATCCTTTGCCTAGGAAATTCCTTCCTTCTTCAAGGGAAGACACTCCAGATACCTCCATGAGCTTTGCTTCCACACAGCTCAGGTGATGCTGACAGGTCTTCCCAGTGCAGGTGTTATCAGCAGAGGGCACACTCCCTCCCCAGTCCTCCACCAGGCTCCACAGGAAATGCCAGGGCAGGATTTAAAGGAAGGTTTATCACCCCCACTTTATATAACTGGGTAACAGAGTCATAGCCAGAATTGGAAGCAGCTTTTCCAGGGAACACACAATCAGGAAAGGAGTGTGGGTTTCCAGCATCTCCCCACAACCCACTGTTTGCTCGATGACTCCAGGGATGGTCTTTGTGACAAAGTTTTATTAATCCATTGCAAAATGAGAAAAATACCAGCAATTCTATGTATATCTAAGAGTGTATATTGCCTATATTCAACTGTGAATTTGTGTGTGTAACACAAATTCTTCCACTGCCCTTTCTTGCCTAAGGACTGATTGGGACTGTTCATATTCTCAGAGTATAGCCTCCTGATTTTTTAGATTTTAAATGATCTGTCTTTAATTGTATTGATGACAAATCATACTTTTTCAATATCCTTACTTGGCAAAAAATAAAGTGATTACCCTAGGTCCTTTTCCAAAATTAAAGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATATGTATATATATGTATATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATGTATATATATATTTTATAATATATATATATATATACACACACGTATACATACACACACACACACACACACCACACACAAACATAGGTCCATGAAACCCAAAAGTCTAGAAATTCTTGCTTTCTAGAACCCAAATGTCAGTTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCTACGGCTGTATCATGACCCAATCTCAGTCAGAGCCACAGAAGAATGCACCCTGAGTCTGTTATAACCACTGCACTTGGGAGTGGGGAGTGGGGCACATGGATCTGTGCATGTGGTTGCAGCTCCTTTGGGATATTTCCTGACACTGTCATCATGCTCTTCGTGGGCAGGTACCCAGCTACTGTTGGAGGCCTGTGTCCAAGCCAGTGTGCCAGTCTTCATCTACACCAGTAGCATAGAGGTAGCCGGGCCCAACTCCTACAAGGAAATCATCCAGAACGGCCACGAAGAAGAGCCTCTGGAAAACACATGGCCCACTCCATACCCGTACAGCAAAAAGCTTGCTGAGAAGGCTGTGCTGGCGGCTAATGGGTGGAATCTAAAAAATGGTGATACCTTGTACACTTGTGCGTTAAGACCCACATATATCTATGGGGAAGGAGGCCCATTCCTTTCTGCCAGTATAAATGAGGCCCTGAACAACAATGGGATCCTGTCAAGTGTTGGAAAGTTCTCTACAGTCAACCCAGTCTATGTTGGCAACGTGGCCTGGGCCCACATTCTGGCCTTGAGGGCTCTGCGGGACCCCAAGAAGGCCCCAAGTGTCCGAGGTCAATTCTATTACATCTCAGATGACACGCCTCACCAAAGCTATGATAACCTTAATTACATCCTGAGCAAAGAGTTTGGCCTCCGCCTTGATTCCAGATGGAGCCTTCCTTTAACCCTGATGTACTGGATTGGCTTCCTGCTGGAAGTAGTGAGCTTCCTACTCAGCCCAATTTACTCCTATCAACCCCCCTTCAACCGCCACACAGTCACATTATCAAATAGTGTGTTCACCTTCTCTTACAAGAAGGCTCAGCGAGATCTGGCGTATAAGCCACTCTACAGCTGGGAGGAAGCCAAGCAGAAAACCGTGGAGTGGGTTGGTTCCCTTGTGGACCGGCACAAGGAGACCCTGAAGTCCAAGACTCAGTGATTTAAGGATGACAGAGATGTGCATGTGGGTATTGTTAGGAAATGTCATCAAACTCCACCCACCTGGCTTCATACAGAAGGCAACAGGGGCACAAGCCCAGGTCCTGCTGCCTCTCTTTCACACAATGCCCAACTTACTGTCTTCTTCATGTCATCAAAATCTGCACAGTCACTGGCCCAACCAGAACTTTCTGTCCTAATCATACACCAGAAGACAAACAATATGATTTGCTGTTACCAAATCTCAGTGGCTGATTCTGAACAATTGTGGTCTCTCTTAACTTGAGGTTCTCTTTTGACTAATAGAGCTCCATTTCCCCTCTTAAATGAGAAAGCATTTCTTTTCTCTTTAATCTCCTATTCCTTCACACAGTTCAACATAAAGAGCAATAAATGTTTTAATGCTTAACATGGAGAGAAGCATGGTTTCTGTTAATACATACTTTCATCCTTTTCCTTTCATTTCCAACTATCACCATCTCCAACTTAGAAGAGTAGCATGAAACCAGGGTTGGGGGGTGGGCAGAGTAGTAGGAGGTACAGAAAGGGCAGATGAATACTGAATAAGCTCTACTATGTTTTAGGCATGTATGAAATGAACTACATATGACATATATTATCTCATTTAATACTCATCAGAAACCTGTCAATTGAGGAAAATGACAAGACACGTCTCAATCATTTTAGGAGATTCACTTGAAGATGTGCCCAGGAGACAGGCCTATGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGGGCTCCAATTCAAAGGAGGGAAAGAGAGGGATATTGAGAAGCACACAGTTTTTATGTAACGGGATGGTAGGAAAAAAATAGTCATTCATGCCTTTGTCTGGCTCAGTGAATCTGCATTTTTTACATAAGATGACATAAACAGTAGGGGCAGAGGGAAATGCAGATTCCCTGCATTTTACATAAAATAACAGACAAAATGGGGTAGGGGAAAAATCAGATAGGCATTTGTGTCTGGGGTAACTGCACCGGTAGTGATAAGCTATCAATTTGCATTGCCGTGGTGAAGTTTTAACAGCTCACTAGGAAATTCCTTGTGGGCAAAATATGGGGGAGGCATGTAGCTTTTCATCTTGTAGCCATCTTGTTTAGGCACCAAAAGGGGGGAGGCAGGTTTGCCTGACCCAGTTCCCAGCTTGATTTTTCCCTTTGGCTAAATGAGATTGGGGCCCCATAATTTAATTTTTTTCACGTTTTCCCCCTTTTTTTCTCTAAACTCTTTTGAAGTACTGCATTTTGAAAGAAATATGCATTCCTGGCCTCTGGTTGCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGCTGGTTTCTCATGGCTAGGATGGTTTATTCCTAGAAGTTCAGGTCCCACATCACTAGGAAGGCTCATTCCTGGGAGGTTATGTCTCACCTTGCTAGGAAGGCTTATTCCTAGGAAATCTTGTCCCATGAAGAAAAAAAAAAAATGGAGGGGTGGGGTGGAAGAAGGGAAAATGAGAGGAAACCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAATATATAGGGACCTAGGCCAGATTTATAGCAACAAAAGGAAAGCAAACCTGGAAGCTGGGTG
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Task1_train_1468
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This is a variant in HSD3B2 (hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2), located on Chromosome 1. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; 3 beta-Hydroxysteroid dehydrogenase deficiency
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Task1_train_1469
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A variant found in Chromosome 1 affects PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; PHGDH deficiency
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Task1_train_1470
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Here is a mutation in PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase) on Chromosome 1. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
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Pathogenic; PHGDH deficiency
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Task1_train_1471
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A mutation on Chromosome 1 affecting PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; Neu-Laxova syndrome 1
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GACTTATGTAACAATTATCACACACCCTCCTTTTCACTTGGAAATGGACTCTTAATCTGTTAATTATTTTCTTAACGGTTTAGAAGTGTCTTTTATTGTGTGGCTTGGATCTGTTTAAAAAGTAGGTGGGTCATAAATAATAAATAAAGAAAACAGGTGATCAGGCTTAGGAGGCCCTCTGGGTTGTGCGTTCAGACAGTATCCAAGAAGTTTGACTTGGTGTGAAAGGGTGGGATTACATGTTAATGATAGCAGGGTTTAGATTCTACACTGAAAGGAAGCAGTTAGTGAGCCCTGGGAGGAGTTGAAGGAAAGCAGTTACAAAAATGGATGCTTCCCAAGACCCTCCATTAAGCCTCCTGGGATAGGTCCCCTGTCTGTCCCTAGACTCCAGGGTACTGCTGGGCACTTCAAGAGAGACAGAGAATTTGAATACTCATGAGTCTTGGAATGTAGGAATAACAATTCATCCGAACAAGCAAACATGATAGACAATTTTTTTTTTTACCCACTGAGGACATTGTGTCTAAAAATCTGATTTGTGCCCAGGAATTATCTGTATAGAATTTTCATTACTTTATAGAATTGATATTGCATAGTTCTGTAGGATAAGGATCTAGCACTTGAGTTATGAATAGCTCAGGATGACATAACACACAATGGTTAGTTGGACTGGATATGTCCATAAAGCTGAATTCTAATTCAACTATGAGCATCTCTGATTCTGCTTCTGATTCTAGGTGACTTTAATCCCAAATTGAATTTTCTGACATTTCTGTAAAATGGGGCATGAGAGAGCACGTCGGTTATGGGGTTTAAATATAAAAGAGTTAAGAGCTGAGAAGTGCCTCCTTGGTCAATTAAACCACACTGACATCCCGTTTTCCTTTTCTTCTTTTTCATAATTAGAGAGGAAGTGGAGGGAAAGGAAATAAATAACTTTAACAAAGTATGCCTAGTTTAAATGCACCAGGTCCCCGCTCTTTTATAAACTCATAATTCTCATTGCATCACTAATTTGAAATTAATCACAGCTCCTTGGTGTCTCAGAAAGCTTCCTATTGCTTTTCACTACGTAACTTTCCAAGTCTGTGTGTTTGGTACTCTAGGATGTTAGGCCACCAGAGGAAAGAGGATGTATCTTTTTTTTTTTTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGCGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCCCCAGAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTTCTTGCGATAGTTTACTGAGAATGATGATTTCCAATTTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCATATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTTCTTTTTGATAGTCGAATTCCCTTCAACGTCTAGCACAGTGCCTTGCACATTTACCCACTCAAAAAAAATTTCGTAAGGAATTAATAAATGAATCCTTAGGAGGAAAAGTGAAAATGAAGTTTTTCTCTCAGGATGAGGTGTATTTCTCCGTTCATTTCAGATATGCATCAGCTAGTCAGCGTAAATTGTGCTTTTTATATGCTCACCAGGTGTAGGTAAGAGCTTTGGCTGAGATGGAGAAATTCATCGCGGGAGGATAATAAAGCGGGCAGGGATTTGGCAACCTCAGAGCCGCGAGGAGGAGGCGGAGTCGCGGAGAGTTTGAGTATTTCCGTCCAATCAAAAGGAGACTGTAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGATGACTGGGGAGCGGGAGCTGGAGAATACTGCCCAGTTACTCTAGCGCGCCAGGCCGAACCGCAGCTTCTTGGCTTAGGTACTTCTACTCACAGCGGCCGATTCCGAGGCCAACTCCAGCAATGGCTTTTGCAAATCTGCGGAAAGTGCTCATCAGTGACAGCCTGGACCCTTGCTGCCGGAAGATCTTGCAAGATGGAGGGCTGCAGGTGGTGGAAAAGCAGAACCTTAGCAAAGAGGAGCTGATAGCGGAGCTGCAGGTAAGGCGAGAGAGAGAAAATTGAGGTCTCTAGGGCAACCTCCATGGAAAAAGGCTGGCTGCGCCCAGGCCAGCGCGCCCCCCTCGCATGCACCCCGTATCAATTAGTTCCGGGGCCTCCTGAGATTGGGGGGTAGAGAAGAACGGGGGCGGGAGGAGGCAGAAAGAGGGAAGAACAAACGGCGGCGAGATGCAAACTTTTCTTTTAGTTTGCAACCGCGTCTTTCACGTTGGCATGCCTCCGCTAGCATTGCAAAGTGCGGGCTGCTCCAACTGGTCCTGCAGGCTGCTCGCGGATGCCAGCGCGGGATGCCAGCGCGGCGCCCCAGCGCCTTAGCGCGCAATTGTTCTGGCAGCCTCGCGCCGCCTCTCCCCCAACCCCCAACCGCCTCCGCGCGGGGCGATCGGGAGAGGGGCCCCAAAGTGGCTTCTTTGCGGGGAACCCAGGGACTGGCGATTCTTCCCAACCAAGTTCTGGGCCGCCCCGCCGATTCTAGCCTGCCTTGGCGGTGGCGGGGTTGGGGGGGTCGGGGGGCGGGGGGAAGCTGGCGGAGACCCAACCAGTCTGGTGGCTGCTGGGGCAGCTGGAGGGGAAGGCAGCCCTCGTAAGGCAGCAAACACGTACCCGCCCCTCGTCTGATGCAAGACTGCTCCGTGCTTTCGCCGCCCCTCTGCCTCCTGGGAGCCTTCGGAGGAAAGGGAGGCGGGCGGGGAGCGCTGGGGTCCAGATTTAGCCTCCTCCCCACCTTTGGTTTATCGCTGGTTGGGAGTGACCAGACTCGACTAGAATCCGATCCCAAACGCTCCCAGATGATTTATAGTCTTAGCAAATTTTTATCTCCTTTTGTTGTGATATATAATTAATCTACTTCAAATCTTTATCCACCGTGTTTGAAAAGGCCTGCTGGGCCTGGTGGCCTTGTCCGGAATATTTATTTTGTGAACTCTTCACTCCAGTGCCTGCACTTTCGACCTCTGTAGTCGACCCAGCTGCCCAGTCTCTACCTCACCTGATCCAGTATATTCTCCCCCACCCTCCAAATCGCACAACCGCCTTCTGCCCGCCTCAGCCCTGTCCACCACCTTCAGCCGTCTCCTCCTCCGAGGACCCCTTAGACCGCAGAGGCTGCTGTTGTTGCTTTAGTTGTGCCACAACCACGTGGTCCTGGAAACTGCCTCGCTCACTTTGTCTGCCTTTGTATCTGCTGGCGTGGATCTTGTCACCATGGCATGACACTATATCCAAGTATCCAGCTCTGCCCTGTACTCAGAAGAATTTGGTCCCTGCCTTCAAGAAGTTTGTAAGCTGGTTAGGGAGCATGGCTAATACGCAGGAGACAGTTGAGCAGATGACACAAGAGCATAGCCCCGAATTAGACCATCCAGCTCCCTAACCTTTGCGTGTTCCCCTTCTGGAAAAGCCAGAGAAAGGTCCAATCATCATGCACAGAATTGGTGGGCAAGGGCTTAGGACTTGAGTAGGATTGGACGGGTGGCAGGCTCCTCACATCTGTCACCTCCTTTCTTGTGTGAAATTGTATCAGTGGCTCTGGGGAACAACCAGGAAAGGCAGTGGGGTGTCCTGCAGAACAGCCTCTGACTCTCACCTCCACCAGAGCACCAGGTTGGGAAGAGGGTGGCAATCAAGTGCTTTCACCTCTCTAAAGGAAATTAGAAACCTGATACCCCAGTGAGGGGGTGGGGATAGGGAGGGATGAGGGCAGAATTGAGAGGAATGGGAGGCCTCATCCATAATGAGGGGTTGTTCCATGAAGTCAGGAATCAGCTGGGTGGATGCTGGGAGTCTGGTGCTGAAACTTGGAGAACATTTTAAAGGCGCTGAAAACTCTTGGCAGGAGAGGAGGAGTGTTTGTTGGCTAACTTGACTGCTGGGCATTTTTGGACTGTTTG
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Task1_train_1472
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Given a variant located on Chromosome 1 and affecting PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Neu-Laxova syndrome 1
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Task1_train_1473
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This variant lies on Chromosome 1 and affects the gene PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; PHGDH deficiency
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GACTTATGTAACAATTATCACACACCCTCCTTTTCACTTGGAAATGGACTCTTAATCTGTTAATTATTTTCTTAACGGTTTAGAAGTGTCTTTTATTGTGTGGCTTGGATCTGTTTAAAAAGTAGGTGGGTCATAAATAATAAATAAAGAAAACAGGTGATCAGGCTTAGGAGGCCCTCTGGGTTGTGCGTTCAGACAGTATCCAAGAAGTTTGACTTGGTGTGAAAGGGTGGGATTACATGTTAATGATAGCAGGGTTTAGATTCTACACTGAAAGGAAGCAGTTAGTGAGCCCTGGGAGGAGTTGAAGGAAAGCAGTTACAAAAATGGATGCTTCCCAAGACCCTCCATTAAGCCTCCTGGGATAGGTCCCCTGTCTGTCCCTAGACTCCAGGGTACTGCTGGGCACTTCAAGAGAGACAGAGAATTTGAATACTCATGAGTCTTGGAATGTAGGAATAACAATTCATCCGAACAAGCAAACATGATAGACAATTTTTTTTTTTACCCACTGAGGACATTGTGTCTAAAAATCTGATTTGTGCCCAGGAATTATCTGTATAGAATTTTCATTACTTTATAGAATTGATATTGCATAGTTCTGTAGGATAAGGATCTAGCACTTGAGTTATGAATAGCTCAGGATGACATAACACACAATGGTTAGTTGGACTGGATATGTCCATAAAGCTGAATTCTAATTCAACTATGAGCATCTCTGATTCTGCTTCTGATTCTAGGTGACTTTAATCCCAAATTGAATTTTCTGACATTTCTGTAAAATGGGGCATGAGAGAGCACGTCGGTTATGGGGTTTAAATATAAAAGAGTTAAGAGCTGAGAAGTGCCTCCTTGGTCAATTAAACCACACTGACATCCCGTTTTCCTTTTCTTCTTTTTCATAATTAGAGAGGAAGTGGAGGGAAAGGAAATAAATAACTTTAACAAAGTATGCCTAGTTTAAATGCACCAGGTCCCCGCTCTTTTATAAACTCATAATTCTCATTGCATCACTAATTTGAAATTAATCACAGCTCCTTGGTGTCTCAGAAAGCTTCCTATTGCTTTTCACTACGTAACTTTCCAAGTCTGTGTGTTTGGTACTCTAGGATGTTAGGCCACCAGAGGAAAGAGGATGTATCTTTTTTTTTTTTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGCGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCCCCAGAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTTCTTGCGATAGTTTACTGAGAATGATGATTTCCAATTTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCATATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTTCTTTTTGATAGTCGAATTCCCTTCAACGTCTAGCACAGTGCCTTGCACATTTACCCACTCAAAAAAAATTTCGTAAGGAATTAATAAATGAATCCTTAGGAGGAAAAGTGAAAATGAAGTTTTTCTCTCAGGATGAGGTGTATTTCTCCGTTCATTTCAGATATGCATCAGCTAGTCAGCGTAAATTGTGCTTTTTATATGCTCACCAGGTGTAGGTAAGAGCTTTGGCTGAGATGGAGAAATTCATCGCGGGAGGATAATAAAGCGGGCAGGGATTTGGCAACCTCAGAGCCGCGAGGAGGAGGCGGAGTCGCGGAGAGTTTGAGTATTTCCGTCCAATCAAAAGGAGACTGTAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGATGACTGGGGAGCGGGAGCTGGAGAATACTGCCCAGTTACTCTAGCGCGCCAGGCCGAACCGCAGCTTCTTGGCTTAGGTACTTCTACTCACAGCGGCCGATTCCGAGGCCAACTCCAGCAATGGCTTTTGCAAATCTGCGGAAAGTGCTCATCAGTGACAGCCTGGACCCTTGCTGCCGGAAGATCTTGCAAGATGGAGGGCTGCAGGTGGTGGAAAAGCAGAACCTTAGCAAAGAGGAGCTGATAGCGGAGCTGCAGGTAAGGCGAGAGAGAGAAAATTGAGGTCTCTAGGGCAACCTCCATGGAAAAAGGCTGGCTGCGCCCAGGCCAGCGCGCCCCCCTCGCATGCACCCCGTATCAATTAGTTCCGGGGCCTCCTGAGATTGGGGGGTAGAGAAGAACGGGGGCGGGAGGAGGCAGAAAGAGGGAAGAACAAACGGCGGCGAGATGCAAACTTTTCTTTTAGTTTGCAACCGCGTCTTTCACGTTGGCATGCCTCCGCTAGCATTGCAAAGTGCGGGCTGCTCCAACTGGTCCTGCAGGCTGCTCGCGGATGCCAGCGCGGGATGCCAGCGCGGCGCCCCAGCGCCTTAGCGCGCAATTGTTCTGGCAGCCTCGCGCCGCCTCTCCCCCAACCCCCAACCGCCTCCGCGCGGGGCGATCGGGAGAGGGGCCCCAAAGTGGCTTCTTTGCGGGGAACCCAGGGACTGGCGATTCTTCCCAACCAAGTTCTGGGCCGCCCCGCCGATTCTAGCCTGCCTTGGCGGTGGCGGGGTTGGGGGGGTCGGGGGGCGGGGGGAAGCTGGCGGAGACCCAACCAGTCTGGTGGCTGCTGGGGCAGCTGGAGGGGAAGGCAGCCCTCGTAAGGCAGCAAACACGTACCCGCCCCTCGTCTGATGCAAGACTGCTCCGTGCTTTCGCCGCCCCTCTGCCTCCTGGGAGCCTTCGGAGGAAAGGGAGGCGGGCGGGGAGCGCTGGGGTCCAGATTTAGCCTCCTCCCCACCTTTGGTTTATCGCTGGTTGGGAGTGACCAGACTCGACTAGAATCCGATCCCAAACGCTCCCAGATGATTTATAGTCTTAGCAAATTTTTATCTCCTTTTGTTGTGATATATAATTAATCTACTTCAAATCTTTATCCACCGTGTTTGAAAAGGCCTGCTGGGCCTGGTGGCCTTGTCCGGAATATTTATTTTGTGAACTCTTCACTCCAGTGCCTGCACTTTCGACCTCTGTAGTCGACCCAGCTGCCCAGTCTCTACCTCACCTGATCCAGTATATTCTCCCCCACCCTCCAAATCGCACAACCGCCTTCTGCCCGCCTCAGCCCTGTCCACCACCTTCAGCCGTCTCCTCCTCCGAGGACCCCTTAGACCGCAGAGGCTGCTGTTGTTGCTTTAGTTGTGCCACAACCACGTGGTCCTGGAAACTGCCTCGCTCACTTTGTCTGCCTTTGTATCTGCTGGCGTGGATCTTGTCACCATGGCATGACACTATATCCAAGTATCCAGCTCTGCCCTGTACTCAGAAGAATTTGGTCCCTGCCTTCAAGAAGTTTGTAAGCTGGTTAGGGAGCATGGCTAATACGCAGGAGACAGTTGAGCAGATGACACAAGAGCATAGCCCCGAATTAGACCATCCAGCTCCCTAACCTTTGCGTGTTCCCCTTCTGGAAAAGCCAGAGAAAGGTCCAATCATCATGCACAGAATTGGTGGGCAAGGGCTTAGGACTTGAGTAGGATTGGACGGGTGGCAGGCTCCTCACATCTGTCACCTCCTTTCTTGTGTGAAATTGTATCAGTGGCTCTGGGGAACAACCAGGAAAGGCAGTGGGGTGTCCTGCAGAACAGCCTCTGACTCTCACCTCCACCAGAGCACCAGGTTGGGAAGAGGGTGGCAATCAAGTGCTTTCACCTCTCTAAAGGAAATTAGAAACCTGATACCCCAGTGAGGGGGTGGGGATAGGGAGGGATGAGGGCAGAATTGAGAGGAATGGGAGGCCTCATCCATAATGAGGGGTTGTTCCATGAAGTCAGGAATCAGCTGGGTGGATGCTGGGAGTCTGGTGCTGAAACTTGGAGAACATTTTAAAGGCGCTGAAAACTCTTGGCAGGAGAGGAGGAGTGTTTGTTGGCTAACTTGACTGCTGGGCATTTTTGGACTGTTTG
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Task1_train_1474
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The variant affects gene PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase), which is on Chromosome 1. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; PHGDH deficiency
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Task1_train_1475
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A variant affecting Chromosome 1, within the gene PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Neu-Laxova syndrome 1
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TCAAGAATTTCTAAGATGTTTCTAAACTGAGTCTGGCCCAGATCCATAACAGGGACTCCTGCCCCAGAGCATCTGAGGAGGAAGAGATGAGAGCAAAGAGGCTGCCGTCCAGCAGGAGAGAGGCTCTGGGAAAGAGCTGGCTCAAGGAAAGGGAAGACCTCTGGAAGCCAGGGATGAGCGTGGGGATCCTGGTGCTGCCCCAGCAGGAAGATGCTTCGCTTTCTTCCAGGCTTGCTGAATGACAACACCTTTGCCCAGTGCAAGAAGGGGGTGCGTGTGGTGAACTGTGCCCGTGGAGGGATCGTGGACGAAGGCGCCCTGCTCCGGGCCCTGCAGTCTGGCCAGTGTGCCGGGGCTGCACTGGACGTGTTTACGGAAGTAAGTGCCTGGCAGCCTCAGCGTCAGGAGGACGGGAGAGATAGGGAGCAGAGAGGCCCATGGCAGGGAAAGCCTGGCGTTTTACAGAAAGCCTCTAGCTTATTGTCTCTTTCATCCATGGTAAAAGGAGAAAACTGTGTTGCCAAAAACACACCTTTGTGGTTTGAGGAGTCCTTGCGGAGCCTGGTATGGAGGCAGCTATGTGGTTTTCTGCAAAACTCGGGCTTTAAAGGGGACCCAGTTCCTGGTTCCGGGCTTCTCAGACTGCTAACATATTGACAAAGATAAAGCCACAAATCAGTTCTGAAGTTGAGGGTCTGGAGCAGGAAGAGAGGGGGCTTTAGTGTATAGTTGAGGGACCCTGATGGAAATGCAGTCCCATTGCCAAGAAAATGTCCTTTTCAGTGTCCATGGGCATTCTTTTTCCCTTCTTCTCTTGCTGGGTGGACAGAAGCCCGAGGATACTGGCAGTATTCCCTCAGGGTCCTCGGGGTGGGCTGCTTTCCCAGCTGGAGCAGAGGCTCAGCCTCACACCAGATCCAGTAGGGAAGAGTGCATTTGCACTCGAATCCTTTTGGCTCCTCTCCTGAAAGATCCTGTCCCCAACATTGGAGCTTCCCCTGGTGAGGAAGGGGAAAGGACATGGACTTTGGATTAGGTAGTTGTGGTTCGCAGGTTACTAGCTGTGTGTCCTTGGAAGGTCACTGGCCCTCTCTGAGCCCCTGTAGCACTCACTGTGTACTCCCAGCCCAGGGCACACAGTGCCTTTTGGTTTGTAACCTTGGTCATCTTTCTCAGCTCTTAGATCATAAGCTCCCTGAAGGCAGGGCAAGCCTTGTCCATCTTTGTATCACCATCCTCCCTAACACAGCACCTTCTCCTGCTCTCTTCAGCATCCTTGAACCACTTGCTGGTGGTACTTACATGGTTACATGTGGCCGGGACTCACAGGATTACATGGTTACATGTGGCCAGGACTCACAGGGTTAAATGGTCAAAATTCAATGGGACCAACAGAGCCCTGAGGAGAATGGCCGGAAGATGCCTAAATAACATACCCAAGGGCAATCTTCTCAGTGAGCAGAAGGGTGGAAAAGACACTGGAGGGTGGGGTGGAGGTGCCACAGATGGGCAACCTGTCCTGATGAGAGCCAAGATGCAGTTACCTGCGTGGAGTGTCTTGGAAGAGCAGGACACTGTGCTAAAAGTCCAGCAAGGCACATCGACAGCAAGTGCTGCATGGATGCAGGGGGGTGAGTTTCGGGGAAAAGCCCAGTAACAACAACAACAGTAGCTCCTATTGGTCAAGGGCCTCCCATGTTAAAGGTGCATAATCCCCACAGTAATGTTATGAGGGAGATAGGATCAACCCATTTCACAGATAAAGAAACTGAGGCTTAGATCAAGGTTCACCCCCAAGGCACCTAGGTGGTTAAGTGGTGAAGGTGAGATTTGAATCTGGTTCACACTTTGTGCTGTGTCCACTCTGCTGAGATGGAACATTCATGTGGAAGCCCATTATTGAGTCCAGTGACCACCCTGACAAAATAGAAGTGGAAGGCACCAGAACTCCTGACTGCCTTCCCTCCAACTTTCCTGTTGCCTGGGGTGGCCCAAGAGGGTGTGGCCAGTCCATGGCAGCCAACTTAGAGGTATCTCTTTCTGGGCAGGAGCCGCCACGGGACCGGGCCTTGGTGGACCATGAGAATGTCATCAGCTGTCCCCACCTGGGTGCCAGCACCAAGGAGGCTCAGAGCCGCTGTGGGGAGGAAATTGCTGTTCAGTTCGTGGACATGGTGAAGGGGAAATCTCTCACGGGGGTTGTAAGTATCACCACCTGGGGCTGGGGGCCAGGAGTCAGAGGGAGGAGAGGAAGGAAGGCATCTTGTAGGGGCTGGTGGCAGCGTGGGTGAATAGATTCAGCCCTGGGAGCTGAAGATAAGGGAAATCTGCTTGAGTCAGCACTCTCCGGAGCAGGTGGGCGGGAGCCTCCCGTCTCCAGCCTTGATAGCAGAGGCCTTGGCAGCAGAGAGCCCGGCTCAGGCCTGTTATATCGTAGTCTTGCTGCAGAGATTGTGGCCCTTCCCAGGCCCAGCCTCTAGAGAAAGGCTCCTTTGTTCTCCACATGCCGTGGGAGTGAAGGAGTGCTGCTTGGGTGCCAGCTGGACGCAGCCGCAGCAGGTGGGGATGTGGTTGGGGACGGCCATGTAGAAATTTGCACCCTGTAAGCTCCCCAGACCCTGCCTTGACAGCCTGCCCTACCTACTCCCAAATGAGCCCTCTGTGCTGGCTGACCCCCTTGCTTTCCCCAAATCAAGGCATAAGACCCCCACTTCTTGTCTTTGCTTCCATCAAGCCCTTCCTGGCATGTGCGTCTCCTACGAGCTTAACCTGACTTACACTTCAAGTCCTGTCTCATTCATTCAGTCTGTGGATATTCCTTAAGTTTCACTGGGTACCAGACATTGTCATAGCTCTTGGGAGACACGGGTGCATGAGGGAGGCATAGCTCTCCTTCCAGGGGCTTGCTGCCTCCTTCTGAAGTCTTGCTTGGCCTTTCCAGCCCCTTCTCAATTCTGAGAACCATGTTCTTTCTTGTTATTAAGGTTCAGTTCCATGGGGTGTTTTTTTTTTTCCCTAATCTTTCTACTTAACCTAAGTTCTAAGTTCCCTGAGGACAAAAAAACATGACTTAAGCCTCTCTGCAGCTTGTGTGGGTGGGCCCAGGCCATGGAGTCAAAGGGTCAGGAAAATGGGCTGGGTGTTCTTGGTTGTCCTGGCTGACCCTCAGCTGGGTGATTTTCGCTGGTGAGGACAGCACTGTGGCAGGAGAGACGGGGATTTTGGTTCTGCCCTCCCACCTCTGGATTGAGAGCCCAGCCCTCCAGGCCTCTCTGCCCCCTCCATCCTGAGGAAAGAAGGGTGCCTCCTGCTGCCCAGCAGCCCCACACAGTCCATGGAAGTCAGCAGGGCTATGACCAGCAGCATGCGAGGAGGTCAGCAGAGACTCTGACCTGTCTGCATCCTCTGTCCTCTATGCTGTGTGGGCTCCTCAGGGCAGAGCACACTTCACTCATCTTGCACCTGGTCGGCCTCTGAGCAGGTTCGTTCCTCCCAGGAGATGCTGCTCGTTTCCCAGGCTGAGGTTTGAGCTCATCACCATTGCCAGCCAATCTGGGCTTCAGGGTTTTACCCTTTCAGCCTTCTCAGAAAGCAGCTGTCTGCCTTCCCCATCGCAGCCTTGCAATTTATTGCCATTACCATTAGGTAGCAGTGACATTCCAGAGCTTTTCCTGAAAGGGACTCCTGAATATAAGCTCTGGCAGAGCGAGGGGGTGGGGGAGGGAGGGGGACCTTGCAGAGAGATGGGGAGGAGGGGGTGAGAGGTGTATGGGCTCTGCCCTGCTGGGTGTATCTGCTGCAGGACACAGAGTTCCATCAAATGGACCACACAGTGTCCCCATCTTAGGAGGTGAAACCTCTTGGTCAAAATAACTACCCTTAGCAAATTGAACTGTTCACCCACATCAGCAAATAGTCTTAGAGTAGCCATTTGGAAAAAGAGACATTTTTGTCACATAAGAAATATATTTTCCTAATTCTTCCCTGCATTTTCCCCAGTTCAATTCTGTTCTAACCTCAGACACAGAATAACATTAGGGTCAGGTTGGTGTCCCAAAGTGCCTGACTCCTCCCTGGAATTCTCCCACCTGTCCAC
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Task1_train_1476
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This variant impacts the gene PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase) on Chromosome 1. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
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Pathogenic; not specified
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CCAGAGCATCTGAGGAGGAAGAGATGAGAGCAAAGAGGCTGCCGTCCAGCAGGAGAGAGGCTCTGGGAAAGAGCTGGCTCAAGGAAAGGGAAGACCTCTGGAAGCCAGGGATGAGCGTGGGGATCCTGGTGCTGCCCCAGCAGGAAGATGCTTCGCTTTCTTCCAGGCTTGCTGAATGACAACACCTTTGCCCAGTGCAAGAAGGGGGTGCGTGTGGTGAACTGTGCCCGTGGAGGGATCGTGGACGAAGGCGCCCTGCTCCGGGCCCTGCAGTCTGGCCAGTGTGCCGGGGCTGCACTGGACGTGTTTACGGAAGTAAGTGCCTGGCAGCCTCAGCGTCAGGAGGACGGGAGAGATAGGGAGCAGAGAGGCCCATGGCAGGGAAAGCCTGGCGTTTTACAGAAAGCCTCTAGCTTATTGTCTCTTTCATCCATGGTAAAAGGAGAAAACTGTGTTGCCAAAAACACACCTTTGTGGTTTGAGGAGTCCTTGCGGAGCCTGGTATGGAGGCAGCTATGTGGTTTTCTGCAAAACTCGGGCTTTAAAGGGGACCCAGTTCCTGGTTCCGGGCTTCTCAGACTGCTAACATATTGACAAAGATAAAGCCACAAATCAGTTCTGAAGTTGAGGGTCTGGAGCAGGAAGAGAGGGGGCTTTAGTGTATAGTTGAGGGACCCTGATGGAAATGCAGTCCCATTGCCAAGAAAATGTCCTTTTCAGTGTCCATGGGCATTCTTTTTCCCTTCTTCTCTTGCTGGGTGGACAGAAGCCCGAGGATACTGGCAGTATTCCCTCAGGGTCCTCGGGGTGGGCTGCTTTCCCAGCTGGAGCAGAGGCTCAGCCTCACACCAGATCCAGTAGGGAAGAGTGCATTTGCACTCGAATCCTTTTGGCTCCTCTCCTGAAAGATCCTGTCCCCAACATTGGAGCTTCCCCTGGTGAGGAAGGGGAAAGGACATGGACTTTGGATTAGGTAGTTGTGGTTCGCAGGTTACTAGCTGTGTGTCCTTGGAAGGTCACTGGCCCTCTCTGAGCCCCTGTAGCACTCACTGTGTACTCCCAGCCCAGGGCACACAGTGCCTTTTGGTTTGTAACCTTGGTCATCTTTCTCAGCTCTTAGATCATAAGCTCCCTGAAGGCAGGGCAAGCCTTGTCCATCTTTGTATCACCATCCTCCCTAACACAGCACCTTCTCCTGCTCTCTTCAGCATCCTTGAACCACTTGCTGGTGGTACTTACATGGTTACATGTGGCCGGGACTCACAGGATTACATGGTTACATGTGGCCAGGACTCACAGGGTTAAATGGTCAAAATTCAATGGGACCAACAGAGCCCTGAGGAGAATGGCCGGAAGATGCCTAAATAACATACCCAAGGGCAATCTTCTCAGTGAGCAGAAGGGTGGAAAAGACACTGGAGGGTGGGGTGGAGGTGCCACAGATGGGCAACCTGTCCTGATGAGAGCCAAGATGCAGTTACCTGCGTGGAGTGTCTTGGAAGAGCAGGACACTGTGCTAAAAGTCCAGCAAGGCACATCGACAGCAAGTGCTGCATGGATGCAGGGGGGTGAGTTTCGGGGAAAAGCCCAGTAACAACAACAACAGTAGCTCCTATTGGTCAAGGGCCTCCCATGTTAAAGGTGCATAATCCCCACAGTAATGTTATGAGGGAGATAGGATCAACCCATTTCACAGATAAAGAAACTGAGGCTTAGATCAAGGTTCACCCCCAAGGCACCTAGGTGGTTAAGTGGTGAAGGTGAGATTTGAATCTGGTTCACACTTTGTGCTGTGTCCACTCTGCTGAGATGGAACATTCATGTGGAAGCCCATTATTGAGTCCAGTGACCACCCTGACAAAATAGAAGTGGAAGGCACCAGAACTCCTGACTGCCTTCCCTCCAACTTTCCTGTTGCCTGGGGTGGCCCAAGAGGGTGTGGCCAGTCCATGGCAGCCAACTTAGAGGTATCTCTTTCTGGGCAGGAGCCGCCACGGGACCGGGCCTTGGTGGACCATGAGAATGTCATCAGCTGTCCCCACCTGGGTCCCAGCACCAAGGAGGCTCAGAGCCGCTGTGGGGAGGAAATTGCTGTTCAGTTCGTGGACATGGTGAAGGGGAAATCTCTCACGGGGGTTGTAAGTATCACCACCTGGGGCTGGGGGCCAGGAGTCAGAGGGAGGAGAGGAAGGAAGGCATCTTGTAGGGGCTGGTGGCAGCGTGGGTGAATAGATTCAGCCCTGGGAGCTGAAGATAAGGGAAATCTGCTTGAGTCAGCACTCTCCGGAGCAGGTGGGCGGGAGCCTCCCGTCTCCAGCCTTGATAGCAGAGGCCTTGGCAGCAGAGAGCCCGGCTCAGGCCTGTTATATCGTAGTCTTGCTGCAGAGATTGTGGCCCTTCCCAGGCCCAGCCTCTAGAGAAAGGCTCCTTTGTTCTCCACATGCCGTGGGAGTGAAGGAGTGCTGCTTGGGTGCCAGCTGGACGCAGCCGCAGCAGGTGGGGATGTGGTTGGGGACGGCCATGTAGAAATTTGCACCCTGTAAGCTCCCCAGACCCTGCCTTGACAGCCTGCCCTACCTACTCCCAAATGAGCCCTCTGTGCTGGCTGACCCCCTTGCTTTCCCCAAATCAAGGCATAAGACCCCCACTTCTTGTCTTTGCTTCCATCAAGCCCTTCCTGGCATGTGCGTCTCCTACGAGCTTAACCTGACTTACACTTCAAGTCCTGTCTCATTCATTCAGTCTGTGGATATTCCTTAAGTTTCACTGGGTACCAGACATTGTCATAGCTCTTGGGAGACACGGGTGCATGAGGGAGGCATAGCTCTCCTTCCAGGGGCTTGCTGCCTCCTTCTGAAGTCTTGCTTGGCCTTTCCAGCCCCTTCTCAATTCTGAGAACCATGTTCTTTCTTGTTATTAAGGTTCAGTTCCATGGGGTGTTTTTTTTTTTCCCTAATCTTTCTACTTAACCTAAGTTCTAAGTTCCCTGAGGACAAAAAAACATGACTTAAGCCTCTCTGCAGCTTGTGTGGGTGGGCCCAGGCCATGGAGTCAAAGGGTCAGGAAAATGGGCTGGGTGTTCTTGGTTGTCCTGGCTGACCCTCAGCTGGGTGATTTTCGCTGGTGAGGACAGCACTGTGGCAGGAGAGACGGGGATTTTGGTTCTGCCCTCCCACCTCTGGATTGAGAGCCCAGCCCTCCAGGCCTCTCTGCCCCCTCCATCCTGAGGAAAGAAGGGTGCCTCCTGCTGCCCAGCAGCCCCACACAGTCCATGGAAGTCAGCAGGGCTATGACCAGCAGCATGCGAGGAGGTCAGCAGAGACTCTGACCTGTCTGCATCCTCTGTCCTCTATGCTGTGTGGGCTCCTCAGGGCAGAGCACACTTCACTCATCTTGCACCTGGTCGGCCTCTGAGCAGGTTCGTTCCTCCCAGGAGATGCTGCTCGTTTCCCAGGCTGAGGTTTGAGCTCATCACCATTGCCAGCCAATCTGGGCTTCAGGGTTTTACCCTTTCAGCCTTCTCAGAAAGCAGCTGTCTGCCTTCCCCATCGCAGCCTTGCAATTTATTGCCATTACCATTAGGTAGCAGTGACATTCCAGAGCTTTTCCTGAAAGGGACTCCTGAATATAAGCTCTGGCAGAGCGAGGGGGTGGGGGAGGGAGGGGGACCTTGCAGAGAGATGGGGAGGAGGGGGTGAGAGGTGTATGGGCTCTGCCCTGCTGGGTGTATCTGCTGCAGGACACAGAGTTCCATCAAATGGACCACACAGTGTCCCCATCTTAGGAGGTGAAACCTCTTGGTCAAAATAACTACCCTTAGCAAATTGAACTGTTCACCCACATCAGCAAATAGTCTTAGAGTAGCCATTTGGAAAAAGAGACATTTTTGTCACATAAGAAATATATTTTCCTAATTCTTCCCTGCATTTTCCCCAGTTCAATTCTGTTCTAACCTCAGACACAGAATAACATTAGGGTCAGGTTGGTGTCCCAAAGTGCCTGACTCCTCCCTGGAATTCTCCCACCTGTCCACCAGGGAAGACTGAGAATCCTCCTTTTACTTGGGAGCCCTGTGATGGACACCTCCCCGGGCTTG
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Task1_train_1477
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Here’s a variant in PHGDH (phosphoglycerate dehydrogenase) located on Chromosome 1. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Neu-Laxova syndrome 1
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GGAGGCCCTAATTAAGCAACAGGATGCTGGATTCTGGTTTTTGGCCCTGTCTCTTCCCTGCTGTGTGACTCTCCCTTCTGAGGCTTGGATTCTTCACTTGTAAAGTGAGAGTTAGGGGCAGATGAGCCAGGAGCGGTGAGGACACTTTGTGCTCTGTAACTTACTAAGGTGGTACCTTGGGCCGTCTGACAGCCCTCGAGAGAGAGTTTGCTCAGCCGTGGAGTGGGAATGAGAACAGTGCCCTCTGACCACCCCTCGGGCTGCTGAGTGGGCTGTGGCCACCTTTGCAGTGGATCCAGTACTGTGCGGATGTGGTTGAGTGACCAAGGAGGGCTCCAGTTTCCTTAACCCTGTAGACGTGTATCTTTCCCCATGGACTCTTGGGTGTCTCACAGTTGGGCAGAGATTGCAGGGAGAGGGCAGCTAAACCCTAGGCATTGACAATACCAGGGAAGGGCAGAGCCAGGGGGTCCCACTGGCCTGGGTGTCCAAGCGCCGAAGGAAACAAGGCAGGGAGCTGGGCAGCAGTTGCTTCGGTTACTTCTTTCTGCTTTGATTTCCTGAGGCTGGCAAGGCTCTGAGTGCCAGGAAGGGGTAAGAGTAGGGAATTTTCCTGTGTCCCCTGGGAGAATAATAGGTAGGCCAGGATGGCCAAGCCAGGTGCAGGGTTGGGGAGCGGAGTGGAGTTGAGCTGAGTTTTGGAGAGGAGTTTCTCAGGGTGGTTAAAACATCCTGGGTTTCCTGGCTTGGGCCCAGATTATGCCTCTTCTGAGCCCACTGAAGGGCGAGTGGACCTGCCTGGAGCAAGCTGCCTTTGGGGTCCCCAGGGCAGCGAGGAGCCCATAGTCCAGAGCTAGGTGCCAGTGGCTTCCTGCCCCCTCCTGTAGTGCTCAACAAACAGTGACCTCATGGTAGCTTCTCTCTGTCCCCAGGAACATCCCTGAAGAATGCTGGGAACTGCCTAAGCCCCGCAGTCATTGTCGGCCTCCTGAAAGAGGCTTCCAAGCAGGCGGATGTGAACTTGGTGAACGCTAAGCTGCTGGTGAAAGAGGCTGGCCTCAATGTGCGCCCCTCTCCCCCACGCTGCCTCCCCATCCCTGTCAGCACTAGTCTTCTCCCCCACATTTCCAGAGCCCGTTCTCTGAGCGGAGGCCTAGGTCCCAGCCTTGCATCGGCCTGTCTACCTGTGAGGGGTAGCTGCAGTTTCTTCAACTGCAAAATGAAGATACTGCCTGGCCCCGAGTGTTGCTAATGGCACTGCTTTGTGTATGAGTGCTGTGGGAATGGAGGCAGTAGAAGTGTCCCCATTTCACAGCCAAAGAAAATGACGAGCTAGTGTGTTTGACTCTGCCCGACATGGCTGCCAGGCCATGTTTGACTCTGCCTAACTCCCCTCAGGGCTCCTCATGCCGTAGCACCCGGGTTCTTGATTCACTTGCAAGCTCTAGGAGCCCTGCTGCCTTGCACGGCTTCCCGTTGGCGCCTTCCCCTCTGGTTCCCTGTTTAGATCAAAGTCTGTTTCAAAGCCTGTTGCTCAGCCAGTGGGAGCTGGCAGAAGGGATAGGCAGTAGAGCTGCCATGTCCTCACCCCTCTGCTCCCCTCCACTCCTGCATGCCAGTCATGCCACTGATGCCGTGCAGGAGGCTGTGTCAGAGCAGGAGGGGCCAGAGTGGAGTCTCCTCACAGCCCTGCCTCCCTGCTTTTCTTTCCTCCCTGTTTTCCTCCAAGCCTTCGCCTGTGCCTGGCAGATCTCTTTGCCCTCCCTTTAAGGAGATCATTGGCTGTTCCAGGAAGCTGATGCCGAAGGGCACACAGCTTGGCCCATTTGCCCTCTCCCTTCTGGTCCTGAATTACTGAGCACATTATCCAGGCTGGAGCCCTACATCCTACCAATGGGTGATTTGGCCAAGAGAGGAGGGTGGACGTGGTGCAGCCAGGAGGTGTAACAGTCACCTTGCCTTCTCCACACAGGTCACCACCTCCCACAGCCCTGCTGCACCAGGGGAGCAAGGCTTCGGGGAATGCCTCCTGGCCGTGGCCCTGGCAGGCGCCCCTTACCAGGCTGTGGGCTTGGTCCAAGGCACTACGCCTGTACTGCAGGGGCTCAATGGAGCTGTCTTCAGGCCAGAAGTGCCTCTCCGCAGGGACCTGCCCCTGCTCCTATTCCGGACTCAGACCTCTGACCCTGCAATGCTGCCTACCATGATTGGTGAGGAGGGCCCTGTAGGGCTGGCTGGTGTCCTTGAGGCTGGGGTGGGGTCTGCCCTGGAATTGAACTCTACCCACCTTCCTTTAGCCCCTCTTCATGTCCCAGGGTGTCTCTGGATCTGCACCATACAGAGGGTCTGATGCCAGTTTTCAGAACCTTCAGGGAGTGGATACTCAGTTCAAAGAGGGAAAGTGCCTTATCCAGGGTCACAGAGCAGCATGGCAGGGGTGGGGCCATAGCCTCTATTCCTGCCCAGCTGTGGATCCTCAGCTTGCCATGTTAGGTACACTGGACCAGCTTGTGGAGCCATAGCCCAGGAGCTCAGGGACATTGAGTGCAGGTTTCTTACTCCTACCTGCTGGCCCTGTGGCTGTCCCTGGTGGCCAGCCCAGCTGCAGCAAAACCTACAAAGCCTCCAGCCATGGTAGGCGTCTTGGACCTGCCCCAGTCAGCTGGGGCTTGGGCTGCTAGGGGTTTTGGCACACGTCCATGTTTGGCGGAGGGTGTGCCTTCAAACCCTGAAGGGCCTAATTTCACCATTCTTTCTGGCTGCCCAAGGGAACTTCCCTGCTTTTCTCCCTTGCTGTTGGCTGGATAAAACTGGCAATCAGAAAGTCAAGAGCTACAGCTGATGGTCATGGTGTTCCCAGAGAGTCAGGAATATCCATGGAAGCTGAGCAGATGCCCTGTTGCTCTCCCATCTCAGCTCTTTGATTCTGAGACCATCATCCGCTCATTGCACCTTTGATCACAAAAGCTTTGAACTTCTGATTCTGCTCCCAATCCCTCGCTCCTTTTTCCCCTATCCCCTGTGCCAACCAGGAGTTTCTTCTATTTCCAGGCCTCCTGGCAGAGGCAGGCGTGCGGCTGCTGTCCTACCAGACTTCACTGGTGTCAGATGGGGAGACCTGGCACGTCATGGGCATCTCCTCCTTGCTGCCCAGCCTGGAAGCGTGGAAGCAGCATGTGACTGAAGCCTTCCAGTTCCACTTCTAACCTTGGAGCTCACTGGTCCCTGCCTCTGGGGCTTTTCTGAAGAAACCCACCCACTGTGATCAATAGGGAGAGAAAATCCACATTCTTGGGCTGAACGCGGGCCTCTGACACTGCTTACACTGCACTCTGACCCTGTAGTACAGCAATAACCGTCTAATAAAGAGCCTACCCCCAACTCCTTCTGCACTTTTGTGTGGTCATTATCCTAAAGCGCCACCAGAGGGCGTCCAAAGGCAGACGTAGGGTTTGGTTTAGACTGCGGGAGCGGAGCGGGTGTGGGGGAAGATGGGGATGAGCAAATGGCTTGGTTGAGTTCTTTGAAGGTGATCCCTCTCTTGTCTGCCGAAGGTTACTCAGAGGCACTTTTACAGGAGCAAAGCTCAATGTATTTCACAGTGCTACGGTATTTCAGACCCCTTCCATCTGGGAATATACATGCACGTTAATAAGTAAGATTCAACACACAAGCCCAGCATTATGTACCAGGCACTGGGCTAGGTGCTTTACTTTAAGAGGAGAATTCAAACCTGACCCTTTTTCCATAGAAGTCTGGTGGGAGGGACAGAGCATGCAGAGGTGACTGGAAGCAGTGAGTGATGCTACAACAGAGGTGTATAGGAAATTCTCTAGAGTCCAAAGGAGGAAGTAATTTGAGCTGAGGATATTGGTGTCTCAGGAGATGTTTAGAAGGATTTCATAAGGGAAAGAAAGTGTAAAATTATGGGGGTATGAGACTATTTGGCAAGTTCACAAAGCAAGGTCAGTGTGGGTTGGTGAACATGTCACTTTTTTTTGAAAGATGATTTTCATGCAAAATACAGCTGAACGGCACTCTACCCAAAAGATTCACTTCAGGGAATTTTTTTCCCCATTAATAAGGGATGATCCAT
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Task1_train_1478
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A variant found in Chromosome 1 affects HMGCS2 (3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase deficiency
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Task1_train_1479
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This variant affects the gene HMGCS2 (3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2) found on Chromosome 1. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
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Pathogenic; 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase deficiency
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CTTCAAATAGAACAACAGCCTATCATCCCGATCTTCTCCCTGTCTACCTCATGCAACTAGAAATGGGTTCCAGGCACCCTACATAAAGAGGGACTTCTGGTAGACCCCAGGGACAGGCCTTTGTGTAGGAAACCTTGCCAAAAGGAAAGCAGCTAATATCCAAGATATATAAGGCAGAGAAAACACAAGATAATTTTTGGTGTACATAGAGCTTCTCCCCTCTCATGAGGACAGGGTAAATTCAGTGCATTCTGAAGGTGTCTCCAGATGGAGATCAGACCACTGGACTCACCCTTCAGGCTCCCATGTTGATTGGTAATGGTTCAGCAGTCATAACTTTTTGATCATCCCCTGTGAGTAATAATTTGATCAAGTTCACCCATAAGCACTTTTTCCTGCCCGTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGCAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGCCTGGAGTGCCCGGAATGCAGTGGCGTGATCATGGCTCACTGCAGCCTTTACCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGGATTCAGGATCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCAAGCTGCCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAAGCTATAGTGCAGTAGCTCGATCTCAGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCTCGAGTTGCTGGGACTACAGGCACGTACCACCATGCCCAGCTGATGTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGTTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGTATTACAGGCATGAGCCACCGTGAACATCCATGGCTAATTGTTTAAAAAAATTTTGTAGAGATGGGGCCTCCCTCTGTTCCCAAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAGAGATCCTCCTGCCTGAGCCTTCCAAAGTGCTAGGATTATAGGCATGAGCCACTTCATGAGCCCTTTCTTATGTTAGATGCAGTACTTCCTTATAAAACCCACAAAACAGAAAATGAATAGAAATAACATCCAACATTTGAGCACCTGCTAAGCACTGCTATTTTAATTGTTTTAGATACTTAATGCTCATAAAAACAGTAGAACACAGGTATTGTGATTGCACACATGCTACAGTTGGGGAAGGTGAGGTGCATTGAGGTTAAGTATTATCCAAAGTCAACCCTAATAATTGGTTAAAAAAATTTGAACCCAGGTTGTGGGCTCTAAAGTCAGACCCATTTAACCACCATGCTCTACTAAGTATAGAGATTTTAAATAAATGAGACAAAAATATGCATACCAAAGCTACTGTTTTCTTGATGTGCCCAAACAGATCTTGCCCATCCCTTGACATCATGTACTTCACTTTGGAGACCACTGTCTGATACAGACTGTAAATCTGCCTATACATACACCTTTGGTACGAGTTTCTTTCATCTTCCTTCCTTTTCCTGCCTTCTCCCTCCTTTCCTTTCTTTTATATTTATTTATTTATTTATGACAGGATCTCATTCTGTCATCCAGGTTGGAGTCCAATGACACAATCATGGCTCACTGCAACCTTCCACTCCTGGGCTCACACCATCCTCCCACTTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACCACACGTGCACACAACCATGCTCAGCTAATTTTTGTAGAGATGAGGTTTCACCACGTTGCCCAGGCGGGTCTCGAACTCCTAGGTTCAGGCGATCTGCCCGCCTAAACCTCCCCAAATGCTGAGATTACAGGCATGAGCCACTACACCAGGCCCCTTCCTTTCTTTTAAATTTCTGAGCCAAAAGAGAAACCCAACTTTGTTGACCCTGCAGCCCACGGGGGCGGAGGCTGAGGGTGTGCATGGAGGACATGGAGCCAGATGCAGTACTCACTGGGACAGAAGCGAGGCCAGGCACCCGTACAGGGATGAGGTGTACATGTTCCCATTGTGAGTGGAGAGGTAAAGGGAAGCCTTGGTTTTCTTGTCGAACATGTCCTGAGAGGCCTTTAGAAGTGCTTTATCCAGGTCCTTGTTGGTGTAGGTGTCTTCCAGCTTTAGCCCCCTGTGAGGTAGCCAGAGGTAGCCATGTGAGAGGCCAGGGGACGGGAGGCAGGGAGCAAGGGGGAAAAGTAACAGCTTCTGGAGAGGACTTTGGGGCGCATGTTTTTCCTACAATATTTGGAAATACAGAACAGTACAGAGGAGAACATACCACTAATGGCCTTACCATTCAGAGAGAGTACTTAGGGCTTATTTTTCTGGTGGAATCCATCCCTAATTTTATAGAGCTTACTAGAAAATTAGAAAGAAAATCATGCTATGTGTTGTGGTTAGCATACTTTCTTAACTTAGTGTGTGTGTGTATATATATATATATTTTTTTTCCATGACATTCTATAACATTATTTGTAAAGGCTGAAGAATGGTCCATGACAGGATGTACCGCACTTTAACCCATCTTCCTGCTCCTGTTCCTCACTAGTTAAAACACTACAGCGAATAGGTAGGTGTTCTTTTAAACACATGGGATTACTGAGCCCAAAGTTTGCACATCTTTAAGGCTTTGGCTTCATGCTCTCCTGTTACTCCTCAAAACACCTGATCCATTTACGCATCCACTACTGCCCATTTTCCCACAGGCTTGACAATTCTGGGTATTCACATTTTAAAAAGACTATCTAGAGAAAATGGTAACTTGAGTAAACTTTTTATTAATGAATATGCATATTTAAAATGTGATCATATACATGTCTTCTTTGAGAAAATTTTCTGTTCATATCCTTTGCTCATTTTTCTATTAGGGTATTTATTTTATTATTGATAATATCTTTATATATTAAAGATATTAAGCTAGTATCTTTGGTATATGTTATACTTTTTGTTTCGATAGGGCTGGTCTTACAAGCAGTGTTTGTGCTAATTTTGATGTTTTAGTTAGTGGCAGGGTTAGGAGTACTAGTTAGTAACAGGGGCTACACTTGGTAGCCTATTCTACTGTTGATAAAATTGACCAAAATTTGAAATAAACAGGTACCAAGAAGAAAGGGAAAGATTCCTTTCCCAGTGGAAACTGTATTGAAGACATTTCTTTGTAAATATTAGTGTATTAGTGTAGTGAATCAATAAACAGCATTCTTTCTGCTTTTTCACATCTAAGGGGATGAGCTGGAACATCCCCATTTTATAGATGGGAGAAAAGCAAAAGCAGGACATGAATTAAGACAATGGCAAATGAGAATGGGACCTGACACTTCTCAAATTGCTACCCTGTAGTGTGATCATTTGCTTCTGTGTGTTTGTGTCTGTATAGGCTGTGAGATGCTCTAGGGCAGGGACCATGGAGTCACATTCATTTTAGTATCCTGAGAGGTTAATACGATGTCTAGCACATAACATGTTCAGAAAATGTTTATTGACTGAATGATTTAGCTACTCTCTTTCTCCCTTCCTCTCTTTCTCCCTTTCTCTCTTTCTTTCTTTATCCTCTGTAGTTTCTTACTGCCCCTTGATCCTGCAGTGCTGCCAAATCCCCCATGTTTCCCTGCAATAACTCATGGAGGGCCCTACCCAGACAATAACCCACTACCCCGTGGAAGGACCTGGGATTGTTCCTGTTCTGCTGGAGGATTGCCATTTGTCCCCCACAGGGGTGCTGGTGGTCTAGACTTAAGGCATGAAGAAGCCTCCTTCTTGCTCACACCTCACCAGCCTCTAGGCTCCCCAAGAAGAGAACTCACCCGAAAGCCTCCAGCCCCTTATATAAGCTGGTTTGTGTGTCACTGCTGGCTGACAGGAAGTCATTGAACATCAGGCGAGCCAGAGACTTCTGGACCATCTTGCAAAAGGGTGTATGAAAGATCATGTACTGTAAATCGTCAAGGGTGAAGGGTCGATCGCTGCCAGCTGGAAGAGGAAGCGTGAAGGCAAGGATGGGGCATGAGGGGCGAGCCATTTAGATATCCTCCCTGAGATTTAACTGTGCCGAGTTTCTCCAGGCCTCCCAGGGAACTACTTCCCACCTCCTGCAAACACATAT
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Task1_train_1480
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Gene HMGCS2 (3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2) on Chromosome 1 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
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Pathogenic; not specified
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Task1_train_1481
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This mutation is located in gene HMGCS2 (3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2) on Chromosome 1. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
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Pathogenic; 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase deficiency
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Task1_train_1482
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The gene NOTCH2 (notch receptor 2) on Chromosome 1 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Alagille syndrome due to a NOTCH2 point mutation
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Task1_train_1483
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Here’s a variant in NOTCH2 (notch receptor 2) located on Chromosome 1. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Alagille syndrome due to a NOTCH2 point mutation
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TGTCAGGGAAGAGAAAGAGTTACACCAAGCTATCTATAGCCAGCCTACTGCAAGCTGAGTACTGAGAGGGCAGAGAACTCCATCCTGACACATGCCTGGACAAGCCCAATATCCTCATCAAGCTCTCGAAACCCAGTGTCTGCCCAAACTGCTTCCATCTTTGTCTATACATATAACAAGAGAAGCTGTAAGGAGAAACGGGAATGGGCTTATAACTGAGGCACTGCTATGAGCCTCCTCAAGCTCAGAGCCCACAAACTGTACCTTGTTGTCCTGCATGTCTCGGTTGGCCCCATTTTTCAACAACAAAAGAGTTGCCTCCACATTATTGACAGCAGCTGCCCAGTGAAGAGCAGATTTTCCTGCAGGGGAGAAACATTTTTATAAACAGACATATCCTACTCTTAGTATAAGACACTATGACTTGCACAATGAAATCTTAAACTCCCCAGAGATCAGCAGGAAGCAGTTCTCTGTAGGGGTCTATAGGAAAAACCAAAGTAATCTCTTCTTTTTCCTCTGTTCTAGAAATACTTCAGTACAGGCTGCCTAGCCTGCAGAAGACCTCTAGGTGAAAGGATCACTTGTATGAGGCATTCATGTCCCCTACATGGCAGAATCTACCCTGTTACATACTGAAGATAAAAACCTATATATTACATGTCAGAATTTATATTGAGAATATTCTACAACTCTCCTAGAGAAGTCAGCTCTCATAAATCCTCAAATCAAGTGTTATGCCTAGGAAACTACATGGGAACACCTTTCATGTATCTGCTCTGAGGTCCAAGAACCCTCATTAAAAATCCCTCATTTTAATTAGGGATCTCCTACTGGCTTGGATCTCTGAGCTCAGCATGTTAAATAAATGCATGAATGAAAGAATGAGTGAATCTCTCACGTATTTGGATCTCAGGCAGTTCTCTAAGGGTCACGTAACTCTATTCCCCTCGTCAGAGGCATGCTTTGCAGGTAAGAATCCAAATCCCTGCCTTTCATCCCTACCATGGTCATCCACTGCATTCACATCCGCTTGGCAGTTGATCAGTTCTGCCACCATTCCCTCCACAGCCAGGCGGGCAGCCAGGATCAGGGGTGTAGTACCATCATTCATCCTGGCATCTAGATCAGTTACTCGGTTGCGAATCAGAATCTAGAAGAGGAGAAAGTACAGAAAAGAGAGTCACCTGGATGAAGGAAAATAATGAAACTCAGTGAAGAAACAAGGGCATCAGAGCTGAGGCTACAGTGTAGATTCCTGGAGGAGAGGGAAAGTCTTGTTATCTTTGTGCCCAAGATTCTATCATGATCAATCAATAAATATTTGTTGCATGAATAAATAAATACATGCTCAATAAATAATGGCTGATGTAAAGTGATGAGCCTTCTACTTTCTCAGGAAAGAAGAGGGATGTGGGGAAATATCACAACTTCAGTCAGGATACAGCCTAAGGTGATTCAGAATGCTTCCAATTTCCTCATAAGGATAAACAGGCATCAGGGAATATAATATGAACTCAGGTCAAGAAAACTGCCAATGAGCAGCTAGAAGCCCATACAGTCAGGCCAATCCATAAGAAGTAGCGGATACTAGTCAAAGGCTCCGGACCAGCTATCACTCTCATCTAATCTACGCATTTGGGAGGCATCTTGGCACAACAAATTATCACTAATAATCAGAAAGACTGGTGTTGTCTGCAGTTGGCTCTATCACTATCTTCCTATATATAGCTAGGTCAATTTGCCTGCCTCCCTTTTCCCACTTTCCCATCTACCAAGCATGACTCTAATACCTGCCCTAATCTCTCAAATGATTGAATAAATTCAATGAGATATTAATTCTTTAAAAACGATAAAACATTATAGAGCCATAGGAATTATTATTCAAGTGACTCTTCTCATGTTCTTTACCTGGAAGACACCTTGGGCATCAGCTGCCACTGCAGCATGGAGTGGACAGCGGCCCATGTTGTCCTGGGCATTGGCATCTGCACCTGCATCCAGGAGACGCTTGGCAGCATCAGCCCGTGAGTAGCGGGCTGCAAGGTGCAGGGCCATCTCACCAGTCCGGTCTGTCTGGGCCTGGAGGCTGGCACCCTGGTAGACCAAGTCTGTGATGATGTTAGCAGAAGAGTCCTCTGCATCTTCATCTTCATCACTCAAATCTGAGCTGCCTCCTCGGAGAGAAGCCAACATCAATGGGGTGCAGCCATCTGTAGGAATGGAAAATTCCATAAAGTACTCAAGAAGGAGAAGGTAGTTAACCCTATGGTTGAAACAGCTCTATTTGACTAAAGTTATTCTTAGGGGCAAAGAATTCCCTGTACTTCTTGTAGTAACTGGTTATTAGTTTCACATTTGCCACCTTTTCCTCTGATAGTATCATTTCTGTAAAGAATAATGGGAAAGTACAAGTCTTTTTAAGCTGGGGGCTCTTCTCTAAACACGTTTTTCTGTTCAAGTTTAAGTGCTGTTATTTTAATTGGACATTTAAAAATATCTAATATTAATAGAACAATTAATACATGCATAAGATACTAACTATCCTCTGCTTTGGGATATTATTTTTCTATCCCACTACAATCTAACCCATTTTATCAGCCTGTTTAGTCTCAACACACTGTACATGAAGCAATGTGAAATCCTTCCCTTTCTGAGCTGATAATTTCTTTGTGGCTACATTCCTTAAGCATTCATTTCCTCGAGCTGATTTAGAGTCTGTGAAATTGGGAAGGGGTTTATGACTGGACAGGGCAAACACAGGGACAACAATGTGGAACCATGGGCAGACACAGCCCAGTGAAGAGGGGAAGAGGCCCGGTGCTGACCTGGGCCACGGACATTCACATCTAACACATCCACCTCCTGCTCTGCCTGAGGAGGGGTGAGAGCCAGCGATGGTGTCCTACGGATGTCTGCAGCTTCAAGGTGCTGCTGTGTCCATGGCCGTCGATCAATGGGGTCATCTTCTTCTGAGAGTAAGGCCTCATCTTCAGCCTGAAAGGTGAAAACAATGCTCCCTATCAATCTGGCCACCACCAGAAACTGCTAATCAGAAGGTGTCCAGAGCCTCCACCACCGCTGCTTATCTCCCATTGTTTTCTCTCTTCCTACTCCTCCACCCCTCCAGAGGATTACCTCAGCCTTGGCTTCCCACTGCTCTCGTGATGTGGCTCCTGCTTACCTTTCCTGCATCATCTAGACAACTCCCTCCCCCAATCCCAAACTCTAGGCTTTAGCCTTTAGATCTCCAGAGCACCCAATTCTCACTTTTCCTACCCTCCACTAGAAAGTAAACTTTAATTCTTCTTGTTGGCCCTAAAAAGCATACTCTGCTTACCTCTGCTTAACTGATCATGTGTTAAATGCTTACACAGCACTACATGGCCATCTCCACCACAAGGCTGTAAGCTTCTCAAGAAGGGAAAATAAGCCTTGTTCAAGGTTGTTTCCTTGTACTCAACATAGCACCCAACATGTAGTAAGCACTCAGGAAAGACTATTCAATAATAATAATCATGATAATTTAAAAGCAGCTACCCTTTACTGAATACCTAGTACATGACAGGAAAGTAGATAAGGCACATATGCCAACACAACAACTCACAGAGGAAAGGGTTATTATTATCCGCATTTTACAAGGAAGGATAATTACAAAGAGGTTAAGTAACTTGCCAGCTACTAAGCGGCAGAGTTTTGGATTTGAATCCAGTTCTGATATTAACTAAAGCAATCTTCTTAACCATCATGCTCCACCAGCTCCCAGCCATGCACAGCTGTGGATGGATGGTCTGCTTTTTCATGTCAGTCTCAGCCCAATCTACCACTTGCTTTTATATGGCTTTAGTTTCCTGGGCTCAAGGTATGGAGCCTCCAATGTCAACGTTTTGCCATGATCACTGGCTTTCATTTTGCCAATGTCAATGATAACTGGCTTTCTTCCACTGCTTAATTTCATCTTCTCTTATAGAAGAAGTGCCCATAAAGGATAAGGAAGAGATGTGGCCATGAAGGAATTGCCATCTACACACACCATTCCTGACTTGACTACTGCCAGCATAACACTAAAGGAAACAGATGTGCTTAGTATTTTTAA
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Task1_train_1484
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A variant on Chromosome 1 in gene NOTCH2 (notch receptor 2) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; Alagille syndrome due to a NOTCH2 point mutation
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Task1_train_1485
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Given a variant located on Chromosome 1 and affecting NOTCH2 (notch receptor 2), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Alagille syndrome due to a NOTCH2 point mutation
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TCAGACACGGAGTACTGGAACAGTCATCAATATCAATCTGGCAAACTGGCCCAGTGAAACCTCAAAAAGGGACAGTGGTAACATGAGTCAAAGGATTATCTTGTGTCTCCCTTTACCATGAGAATGATGTTAGGTTACTAGCAGGGCTTATACCAATGGGTCAATAAGCCTATGCTTTATTATTCTCCCCAACAGGTAACTGGAATAACCAGGTGACACTCAGGGAATCAGAGGCACTTGTGGTGTGTCTCTACCATTGCTTCTTCACAGACAGACTTCACTTCTAAATGAAGGATGTAGGAAGTGAAATTTATAGGTGGAACCTCAAACAAGTAACTGTAGCTTCAGAGGCAACAGAAACCTTCTCTCTGAAGATACAATGGGGTAAGATGCAATCTATGGAGGACAATTTGGCATATCTTCAAAAATAGCTTGAGGAAAAAAAAGGAGAGACAGAGAATCTTGGAAAAATTGGCATGTGTTGTCTGTTTCTGAACTCATGGGTGAAATGTCTAAAAATAACAGTCTCACAGAGGGCCTTCAAGAATATGACCCATGGGAAAAAAATAAAATCCCGAATAGCCTACAACTAAGGCTTCTGTGAGGTATGAGCATTCTGAAATATATACACAGACGAAGAGGTCATGGGCCATTCAAGAATAGACTTGGACTTTTGGCCACAAAGGACTTGTAAGATATAGTAGCTAAAACAAATTCTCTATTTCTGTACACACACACTCCTATCACCAAGCACTTACTCTAATGATTTCCTCATGCACAGCCCACACACATTCTCTCCCTGCTCTCTTCCCTGTGGTCAGTTGGCTTTGTGCTTTAAGAGAAAACAGGGCCAGGTCGTGGGCACTTACCAGGAGGACACAGGCACTGGAAACGATTGACTTTATCCACACACTGCCCATTGTTCACACAAGGGTTGCTCTGACATTCATTTATTTCTAATTCACAATGCACACCTTTGAAACCTAAACAAAACAGACCACACAAGTGGCTTAAAGAGAGAGAAAGGTGTATTCCAGACAAGGAAGCACAAATTTGCAATGATAACTACATCCTTTGCGAGTACACACATTTCTGCAGAGAAAAAAGGAACTCTGCCATGATGAGAAATAGTCACTCCAAGTGTCAAGCAGGACAGGGCATACTGTGAAATACCCATGTCACTGTGAAAAGCGGGAAGGGATTACATTAAAAGACATTGGCAAGACCTAGCATATAAACAAGGACTGCTCCACATTTTCTGTGATAAATCCATACTTTCTGGACTGTGGAAGGCCCAAAATGTCCCCACTCTATGTTCCTAAAGACAAGCTGAGCTGGAGCTGTTGTTGCCTTCAGGGTGCAGTTCAAGGTCAGCAGTGCCTTTCAAGGCTGGAGTGGCCGGCAGCCTTAATCAGGCAGAGCAGCCAATGTTAGCCATCATTTCAAGCTGGATTTGGCTGTATCCTCTCAAAATTAAAGACATGGTCTATGCAGAAGAGCTCCAGAATACAACTAAACATGTACTGCACTTTAGATAAATGGAAACTTCCTATATAATTGTGGATAAAATTTATTTATATAAATGGAATGGTATGGTATTTGTAATTACATGAAGGTATCAGGAAAACTTGCTATTTAAAGGATTCTTACAGTAAATCATTTTTGAAATTTTCTATTACATGTGGATTTTGATATAACAGGCTTGTTTAATTTGGTCTACATAGCTTGATGAATTCTAGCACTGCCTTACTCTTTGAGTAAGGAAGGTTTGCTTGTGAACCCTGACTTCCTCTAGTCCCCAGTCAGCAAAGGAAATCAAATGCTGACAGAGCTCATCAGACTGCAATAGTATACTGAATGCTCTACCAAGAGAAGTTCAGAACAGTCCCTCCTCTCTAGACCCAACATGCTGATGGGCCCATTTACCTGGCATGCACAGACATGTGAAGCCTCCAATCTTATCCAGACAGGTAGCATCATTCTGGCAGGGGTCTGAATGGCACTCATTGATGTCCATCTCACAACGAGGTCCTGCATAACCCTTCAGACACTCACAGTGGAAGGCGCCATCCGTGTTCACACATTTTCCTGCATGCTCACAAGGATTGCTATTGGCTGAAAGACACAAGTACCAATTACTGGGATCAAAGCAGTTGAGTTTCCACAAATGTGAACAATAGAAGAGCATCTGATGGTTATAGCATCAGGGCCAGGCCTTCAATAATATCATTCCCAATTTTCTATTTTTTTTTCCTTAATTTAAAAAGAAATAAAAGCGGAGTATCCTCAACTGTTATGCATTTCTGCTATTGCAGTTTCTGCCCAAACTGTCATTGAGGTAGGGCTTTATATTAAGAATCAAGTACATACGTTTCATACAGTTAATCCCCAGAATGGAATATATGGTTATGGCTATGCTGAAAGGTCACTTGTAAACACTGGCCATGTAGCAAGAGTAATCTGAGGTTTGGGTGTATGTAATTTGCTTCTACAGTAAAATGTGCTTCAGTTTAAACATTTGCTGAGCTCAACAGACACTTCACAGAACAGAAAAAGTTCTGCTTACTCACCCATGGCACATTCATCCACATCTTCTGTGCAGTCAGCCCCTTTGTAGCCTTGTGGGCAGGTGCAAATATATTGCCCATTTAGGGGGTTGGTGTCACACAGTGCCCCCTTGTGGCAAGGATTGCTGATGCATGCATCATCCAGATGACACAGGAGACCTGTCACAGGGTGGGGCAAAGGACAACTAAGAGAAAATGTCTCTCACTTGGGGAAGAGCTTTCTCTTTCACCCAGGAGGGAAAACCTCATGATCAGTTCCTCAGAATCCAACATGGAGATTTATACGCAACTTCTGCTTTGCCTGACCCTACCTTGGGGACATGCTTGGCCACCAGCAAAGCACCTAGATGCAACCCTAGACTCTGACCCTGAGCTCTCAGCTAGACCTCTCCTCCAGGACAGAGACATCTACAGGCCAGAAGATAAGAAGACGGAGACAGGAAAGTGGAGCTATCTTCCAGATAGTGTGCCAGATTTAGCAAATAAAATAGAGGATGTCCAGTTGAATTTTAGATAAACAAGAAGTAATTTTTAGTATGTCTCAAATATTCCATACATCCTATATTTTATCCGGAATCCTACTTCCCCAATATTATGCTACCTGATGATCATGGGGCCACCTGAACACCATCAGCCTCTACTAGAGTAATCTTTTAATAGCATCAACATTCCTGATTCAGGTGGCCCCAGGTCTCTGAAGATATTACTAGGCTTCCTGTTTTATATAGTTCACATGGGAACTGGATTTTCCAGTCTGCAATTAACTTAAGAAGAGGTAACTAAAGCTTCTTCCACAAAGCTGGAGCTAGAGCTTTTGGAAAGGCCTCCATGAAAGAACATTTCAAAACTGCTGGGCAGAAAGTTCTCCCAGCTAAATTATCTTCTCCCATCACCTTCCTCCTTACATTGCTCTCCTTCTCCTAGAACTAGTAGTTGTTAAATTGAGAGGCTAGAGCAATGTTAACTTTGTAGCATGTAAAAATCTTCCCTGAGGGGAATATTTTCATAGACATTGAGGGTTAGAAGGCACTTAAATGTTTCTCTCCTGCCAACTTCTTCTGAGTAAATAGATGGTTTCTTCTTAAAATGAAGCCTGTGGATCCATTTATTAGCCATTTTATCTTAATAGCTGAGGTGCTTTTCAGTCTAAGATCTTAAGGACTTCAGCAGATGTTCCAAAGACAATAGTTACTAACTTTCCTTTTTTGGAATGAAAAACTAAAGTATGTAGAGTTGAGAAGAGAGCCTAAAGTCCTAAAGAGGAAGATTATCTTCATAGCACTTTGGCTAGCAGGTTACATTTCTGGAACAGTCCTGAGTGATATGTTCCCATAGATGGTAACTCAAAGAATATGCTGTTTGGGATGAAAGAGAAGGCAGAGTCCTGAATGCCCCCTGCCCCTTCCCTGTTTCTAGATCCGTCCTTCTGCTACCTACCTGCCTTCCCCTCTGGGCACATGCAAGAGAAGGAGGCCACACGGTCGATGCAGGTGGAGCCTGGAGTACAGGAGGCGAAGGCACAATCATCA
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Task1_train_1486
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Gene NOTCH2 (notch receptor 2) on Chromosome 1 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; Keratoacanthoma
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Task1_train_1487
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This gene mutation involves NOTCH2 (notch receptor 2) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Keratoacanthoma
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CGAATAGCCTACAACTAAGGCTTCTGTGAGGTATGAGCATTCTGAAATATATACACAGACGAAGAGGTCATGGGCCATTCAAGAATAGACTTGGACTTTTGGCCACAAAGGACTTGTAAGATATAGTAGCTAAAACAAATTCTCTATTTCTGTACACACACACTCCTATCACCAAGCACTTACTCTAATGATTTCCTCATGCACAGCCCACACACATTCTCTCCCTGCTCTCTTCCCTGTGGTCAGTTGGCTTTGTGCTTTAAGAGAAAACAGGGCCAGGTCGTGGGCACTTACCAGGAGGACACAGGCACTGGAAACGATTGACTTTATCCACACACTGCCCATTGTTCACACAAGGGTTGCTCTGACATTCATTTATTTCTAATTCACAATGCACACCTTTGAAACCTAAACAAAACAGACCACACAAGTGGCTTAAAGAGAGAGAAAGGTGTATTCCAGACAAGGAAGCACAAATTTGCAATGATAACTACATCCTTTGCGAGTACACACATTTCTGCAGAGAAAAAAGGAACTCTGCCATGATGAGAAATAGTCACTCCAAGTGTCAAGCAGGACAGGGCATACTGTGAAATACCCATGTCACTGTGAAAAGCGGGAAGGGATTACATTAAAAGACATTGGCAAGACCTAGCATATAAACAAGGACTGCTCCACATTTTCTGTGATAAATCCATACTTTCTGGACTGTGGAAGGCCCAAAATGTCCCCACTCTATGTTCCTAAAGACAAGCTGAGCTGGAGCTGTTGTTGCCTTCAGGGTGCAGTTCAAGGTCAGCAGTGCCTTTCAAGGCTGGAGTGGCCGGCAGCCTTAATCAGGCAGAGCAGCCAATGTTAGCCATCATTTCAAGCTGGATTTGGCTGTATCCTCTCAAAATTAAAGACATGGTCTATGCAGAAGAGCTCCAGAATACAACTAAACATGTACTGCACTTTAGATAAATGGAAACTTCCTATATAATTGTGGATAAAATTTATTTATATAAATGGAATGGTATGGTATTTGTAATTACATGAAGGTATCAGGAAAACTTGCTATTTAAAGGATTCTTACAGTAAATCATTTTTGAAATTTTCTATTACATGTGGATTTTGATATAACAGGCTTGTTTAATTTGGTCTACATAGCTTGATGAATTCTAGCACTGCCTTACTCTTTGAGTAAGGAAGGTTTGCTTGTGAACCCTGACTTCCTCTAGTCCCCAGTCAGCAAAGGAAATCAAATGCTGACAGAGCTCATCAGACTGCAATAGTATACTGAATGCTCTACCAAGAGAAGTTCAGAACAGTCCCTCCTCTCTAGACCCAACATGCTGATGGGCCCATTTACCTGGCATGCACAGACATGTGAAGCCTCCAATCTTATCCAGACAGGTAGCATCATTCTGGCAGGGGTCTGAATGGCACTCATTGATGTCCATCTCACAACGAGGTCCTGCATAACCCTTCAGACACTCACAGTGGAAGGCGCCATCCGTGTTCACACATTTTCCTGCATGCTCACAAGGATTGCTATTGGCTGAAAGACACAAGTACCAATTACTGGGATCAAAGCAGTTGAGTTTCCACAAATGTGAACAATAGAAGAGCATCTGATGGTTATAGCATCAGGGCCAGGCCTTCAATAATATCATTCCCAATTTTCTATTTTTTTTTCCTTAATTTAAAAAGAAATAAAAGCGGAGTATCCTCAACTGTTATGCATTTCTGCTATTGCAGTTTCTGCCCAAACTGTCATTGAGGTAGGGCTTTATATTAAGAATCAAGTACATACGTTTCATACAGTTAATCCCCAGAATGGAATATATGGTTATGGCTATGCTGAAAGGTCACTTGTAAACACTGGCCATGTAGCAAGAGTAATCTGAGGTTTGGGTGTATGTAATTTGCTTCTACAGTAAAATGTGCTTCAGTTTAAACATTTGCTGAGCTCAACAGACACTTCACAGAACAGAAAAAGTTCTGCTTACTCACCCATGGCACATTCATCCACATCTTCTGTGCAGTCAGCCCCTTTGTAGCCTTGTGGGCAGGTGCAAATATATTGCCCATTTAGGGGGTTGGTGTCACACAGTGCCCCCTTGTGGCAAGGATTGCTGATGCATGCATCATCCAGATGACACAGGAGACCTGTCACAGGGTGGGGCAAAGGACAACTAAGAGAAAATGTCTCTCACTTGGGGAAGAGCTTTCTCTTTCACCCAGGAGGGAAAACCTCATGATCAGTTCCTCAGAATCCAACATGGAGATTTATACGCAACTTCTGCTTTGCCTGACCCTACCTTGGGGACATGCTTGGCCACCAGCAAAGCACCTAGATGCAACCCTAGACTCTGACCCTGAGCTCTCAGCTAGACCTCTCCTCCAGGACAGAGACATCTACAGGCCAGAAGATAAGAAGACGGAGACAGGAAAGTGGAGCTATCTTCCAGATAGTGTGCCAGATTTAGCAAATAAAATAGAGGATGTCCAGTTGAATTTTAGATAAACAAGAAGTAATTTTTAGTATGTCTCAAATATTCCATACATCCTATATTTTATCCGGAATCCTACTTCCCCAATATTATGCTACCTGATGATCATGGGGCCACCTGAACACCATCAGCCTCTACTAGAGTAATCTTTTAATAGCATCAACATTCCTGATTCAGGTGGCCCCAGGTCTCTGAAGATATTACTAGGCTTCCTGTTTTATATAGTTCACATGGGAACTGGATTTTCCAGTCTGCAATTAACTTAAGAAGAGGTAACTAAAGCTTCTTCCACAAAGCTGGAGCTAGAGCTTTTGGAAAGGCCTCCATGAAAGAACATTTCAAAACTGCTGGGCAGAAAGTTCTCCCAGCTAAATTATCTTCTCCCATCACCTTCCTCCTTACATTGCTCTCCTTCTCCTAGAACTAGTAGTTGTTAAATTGAGAGGCTAGAGCAATGTTAACTTTGTAGCATGTAAAAATCTTCCCTGAGGGGAATATTTTCATAGACATTGAGGGTTAGAAGGCACTTAAATGTTTCTCTCCTGCCAACTTCTTCTGAGTAAATAGATGGTTTCTTCTTAAAATGAAGCCTGTGGATCCATTTATTAGCCATTTTATCTTAATAGCTGAGGTGCTTTTCAGTCTAAGATCTTAAGGACTTCAGCAGATGTTCCAAAGACAATAGTTACTAACTTTCCTTTTTTGGAATGAAAAACTAAAGTATGTAGAGTTGAGAAGAGAGCCTAAAGTCCTAAAGAGGAAGATTATCTTCATAGCACTTTGGCTAGCAGGTTACATTTCTGGAACAGTCCTGAGTGATATGTTCCCATAGATGGTAACTCAAAGAATATGCTGTTTGGGATGAAAGAGAAGGCAGAGTCCTGAATGCCCCCTGCCCCTTCCCTGTTTCTAGATCCGTCCTTCTGCTACCTACCTGCCTTCCCCTCTGGGCACATGCAAGAGAAGGAGGCCACACGGTCGATGCAGGTGGAGCCTGGAGTACAGGAGGCGAAGGCACAATCATCAATGTTCTCACTGCAGTCATCTCCACTCCAGCCGTTGACACATACACAGCCATAGCCTCCATTGCGGTTGGCACAGGTGCCCCCATTTTGACAGGCATTGGGCTGCAGCAGGCATTCATCCACATCCTCTGTGCAGAACTGTCCTTTTAGGGGGAAATTACTTTTGATTAGGGCTCTTGAGTCTCAAAGGACTAGTACCATACCAGCCCCCCACACTCTTCATCTTCATGTGACCTGTCTGAAATTAAGGCAAGCAGAGCTCCAGAAGGCTGGGTCTTCACATGAATTTTAAGGCCAATTTGAGCCATCTAAATGATATTTTTTCCAGGCAAATCGTTTCAAGATGAATAGTTACTACCGTTAGAAACTCTAACAACATTAGGGTTTAGCCAACTTATCAAAGAGAAGGTAAAACCTGTAGGACCCTCGAGTTAACTAATCCCTGGGTCAATGAACATATAAGTAAGAAGAGCAAGGAGAGAAGAGTATAAAAATGAGTAAGAAAAAATAATGAGAAGGAACCTATATGCCAAACATTAGGGTAACTGTTCTATATCTTGACTGTATCAACGTCAA
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Task1_train_1488
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Given this context: Chromosome 1, gene PEX11B (peroxisomal biogenesis factor 11 beta) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
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Pathogenic; Peroxisome biogenesis disorder 14B
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Task1_train_1489
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This variant lies on Chromosome 1 and affects the gene HJV (hemojuvelin BMP co-receptor). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; Juvenile hemochromatosis
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TGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGCCCGGGTTCAAGCAATTCTCGATTCTCATGCCTCTGCCTCCTGAGTAGCTTGGATTACAGGATTACAGGCATGGACTATCATGCCTGGCAAATTTCTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACCCACATTGGCCTACCAAAGTGCTGGATTACAGGTGTCAGCCACCGCGCCCAGCCTCAGAGTAGCTTTTGTGGTGACATTGACCACCACAACTCCCCTTTTAGAATCTTTACCAGCTCCACAACCAGAATCTTTAATGGCTCTCTGCTTCCTTGACAATATAGTATAGTGATTAAAAATTAAGTTTCGGGATCCAAACGGCATAGGTTCAGTTTCTGGCTCTGCCATTTGTTAACTGTGTGACTGGAGGCAAGTTCCATAATTTGTTAGCTGTGTGACTGGAGGCAAGTTTCCTTATATAAAAATAGAGATAAGAATACCACCTTCCTTAGAGAGCTATGAGAATTAAGTCAATGTTTTAAAAGTGTTTAAAACATTGCCTGGCAGATTTTAAGCTTCAATAAGTGTTAGATATTAATCAAATTTAAACCCCTTACCCCCTTTTTAAGGTGCTTCATAATCTGGCCTCTGCCCATCTAACCTTCTGTCCCATTACTCCTTGTCTACTGCATTTGAGTTTTGCTCATTTCCTTGCTGAATCATGAATCCATGCATAACTCCAGATGGTTTTCATTGCCTGGAAGATCGTTAACAATTTGAATCTTACCCAGTCTTCAAAGCTCACTTCAAATCCCATCTTCTCTGTTACCTTTTATTATTCTTATTACTTTAGTTCAAATCTACCATCTTCCCATCTGAATGTACCATACTGTAGGATTTAGTGAATAATTACACACTCATCACTCTTTCATGTGAATTGGTTTTGTCTCTCCAATAGCCTGTAAACTCCCTGAGATAGCAACAGTATCTGATACTTCCGAGCCCTCTTTCAGTGGAGTGAACACATTGCATTTACTCCATTTCAAGCATCTGTAAAGAGATTCAACATAGGCAACAGAGGATGGTGTGAAGAATTTGTAGCTTTAATAACAGATTAGTTAGGGGGTAGGGATGATACTTCTGTCCTACCTGTGCCATTCTTCAAAAGCAGAGACTCCCTTCACCTAAGAGCTAGACAATGCCTGCTTCATTTTTGAATCAAGAAAGCAGAACATACCTTACACACACATATTCATCAAATAGACTTCTTTCCCTAATTATGTCTTCCTCCTTTGAGTTTCTTATGGCTAATGATCATGTCTTCTGCTTTCAGCTCTTGCCTCTTAAAAATCTCAACCCTTAAATCTTTACTGATCATTAAAACCTTCATGACCTCTAAACTTATAAGGGTGAAATCTGCAGTAAATGGATTAGAACAATTTGTTTACTATAAATGAGGCTGGAAAAATTGGTGAAGAGCCCCACAGAGATCCGGAATGCAGTAACCTTGCCCAGAATCCTTATTCTGTGATAATTTCAACCCTGGACTGCAGCCTCATCTGACTCTGGATAATGTCATTGTTTCACGTGTCTCCTAGGCCCTGCTTCCTTTAATGATTCTTTACATTCTTCTATGCCAATCTGTATCTCCAAATCATTTCCAAACTAGTAATGGGACTGATGGTCCCCTTACTGAATGCAAAGCCACAGAACAAAGAGCCCAGAAAGGAGTGGAGCTAAGAGGGTTGCTGAGGAAAGAGGAACCCCAGCATCTGAGGGGAAGAGATGCAGCTTCTCTAAGTCTGGCAGGAAGGCTCGGGCATCCTCCAGTGCTGCCTGAGCTGCCACGGTAAAGTTGGGATCACCAGAAATTAAAACATCAAAGACACAGGAATGGAAGTAAGCATCTTCCACTGGAAGCCCTTCCTTGCACAGCCGTCTGGCAGTATCAATGGTTATAGCTCCCCGACGATTGCGCTCTGATCGAGAGAGTCGCTGACTTGGAGGGCACCCCCCAACACAGAGCTGCAGGTCCTGTTCAGCTGAGAAGGCCATGGCCACATCCTCTGCTACCTTGATGGAGAAGGAGAGCTGCCCAGCTGTCTGCCGAATGATTATAGTTGTGCCAATGTAGGCAGCTTGGATCTCCACATGGTTCCCAGGGTTAGCAGTTTGAATCGACAAACTGGATCCCCCAGGTCGGTCACCTCCATTGATAGAACCATCTTCAAAGGCTACAGGAAGATTATCCACCTCAGCCTGATACACCTTCTGATCAATGCATTCCTGCATGTTCTTAAATATGATGGTGAGCTGTGAGGACAAGAGGGAAAACAGTTCATTTTGGGTTCAGTGCATCTTCCCCCCAATCAGACCTCATACATAGTTAGAGATCTGATCCAAGTAGAGATGCAGGACTACTATGGCCCTCAATCCTTGATCCCTTCTCCTATTTATGTTCCAGTATTACCTCATCCCTACTTAACCCCCTCTCTACTTAATCGTGGCAACTTCCTAGGAGAGGGAAAAGTTTCCCTTCTGAAACTCCTCAGGTCCGCCCTCTCCGACTGTCTCTTCAAGGTTTTCTGCATTTGAGTCAAATTCCCATCAAGGGGAAGTGATTTACAGCTCCAGGTGTTTGGTAGAAGGGAGTGATTCGAGATGGGGGAGAGGTTGAGGAAGAAAAGGGAATTAGGGAGCATTGCTGTTGAATAGTGGGGATGGGGAGGAATGGTGCCCGTGGAAGAATCTCATGAGGTGGATCGGAAGGAAGATTGAGTGCCTGACCTTCCGGGTGGCGGTAGCGTTGGCCCCCAACGCCATGGGGGAGCTGGTGGCTTGGACAAAGAGGAAGTCATTATCCAGTAGAGGCCAAGCTCCTTGGACACGGCATGTGTGAAAGTGATGGTGGAAGCTGCGCACATGGGGGTCCCCGAAGGAAGCGCAATGCAAGAACCCCGGGGGACGACCATGCAGCCGGGAAAACCGGCCTTCATAGTCACAAGGGTCCGGGGCAGGGAGGCCGGAGCCCGCGCCTGGAAGGGCGGGGCCCCGGGGCGGGGGAGGGGCTGTAGGGCCCTGGCGGGAGCAGTTGTGCTGGATCATCAGGTCTTCGATGCCATGTACCGCCGAATGGAAGGCGAGGTCCCCGCGGCAGGTGCGGGCGGTGCGCCGAGTGCAGAGCGCATAGGAGCGGAGGGCTCGACAGAGGCCGCCAGAGCCCACCCCTCCACCCCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGAAGTGCTCCTGATGAACCCCCACCTCTAAGGCTCAGAGTGGACGATACGTACTCAGCATTGCAGCGGAGGATCTTGCATTGAGAATGAGCTAAAGACAGAAGGGAGAGGATTGTGAGACGGTCCTCAGACCTCTGCTCTATCGGAGTGTAGTTTGCTCATAACTCTTCCAAATCTCATCAGGGGTTTCCAGCCTTCCTAAAACCTAACTAAGGGCCTTCCCCAGCCCCCAACCCCCTAGTCCCTAGTTCTCTCGGCTGTCTTACTAAAAGTGTGTAAGCCTGCCACATCTCTTCTGCCTGTCGACCAAGGGCTTCCCCAGTGGCCTTCCCCAGACTGAACGGGAAATAAAATATTAGTATTTGAGAGCAGGGCGAGTGATCGGGACTCTCAGCGCCTATCTCTCCTCACTCATTCAGGCTCACATGCCCACCCCTACATAGCAGCCTACCCTCTAGATTTCCCCAAACCCTTCCCTGGCCCTTCCTTACCATGTCCACAGAGGAGCAGCAGGAGAGTGAGAGTGCTTAGAGTTGGGGGACTGCCATGGGAGGACCTGGGACTAGGGGACTGGCCTGGCTCCCCCATACCTATCCAGCCAGGTTTCCCAGGCGCCGGTTCTTCCCAGCTGATGACCCTCCTACCTAGTGAATTTTGACCGGAAGCCCTGTAAGTGACTGAAAAAAGAAATTTGGCTGGACATGGAGAGAGAGAAGAATTGAAGATTGGTAAGGATAATGTGGAGTGAATCTGGGGAGATCAAGAAAAGGATGAACAGACTGGAATTTGGGGAGATTGGAGTT
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Task1_train_1490
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Here is a variant affecting HJV (hemojuvelin BMP co-receptor) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Hemochromatosis type 2A
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Task1_train_1491
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This alteration occurs within gene HJV (hemojuvelin BMP co-receptor) located on Chromosome 1. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Hemochromatosis type 2A
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CATGGACTATCATGCCTGGCAAATTTCTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACCCACATTGGCCTACCAAAGTGCTGGATTACAGGTGTCAGCCACCGCGCCCAGCCTCAGAGTAGCTTTTGTGGTGACATTGACCACCACAACTCCCCTTTTAGAATCTTTACCAGCTCCACAACCAGAATCTTTAATGGCTCTCTGCTTCCTTGACAATATAGTATAGTGATTAAAAATTAAGTTTCGGGATCCAAACGGCATAGGTTCAGTTTCTGGCTCTGCCATTTGTTAACTGTGTGACTGGAGGCAAGTTCCATAATTTGTTAGCTGTGTGACTGGAGGCAAGTTTCCTTATATAAAAATAGAGATAAGAATACCACCTTCCTTAGAGAGCTATGAGAATTAAGTCAATGTTTTAAAAGTGTTTAAAACATTGCCTGGCAGATTTTAAGCTTCAATAAGTGTTAGATATTAATCAAATTTAAACCCCTTACCCCCTTTTTAAGGTGCTTCATAATCTGGCCTCTGCCCATCTAACCTTCTGTCCCATTACTCCTTGTCTACTGCATTTGAGTTTTGCTCATTTCCTTGCTGAATCATGAATCCATGCATAACTCCAGATGGTTTTCATTGCCTGGAAGATCGTTAACAATTTGAATCTTACCCAGTCTTCAAAGCTCACTTCAAATCCCATCTTCTCTGTTACCTTTTATTATTCTTATTACTTTAGTTCAAATCTACCATCTTCCCATCTGAATGTACCATACTGTAGGATTTAGTGAATAATTACACACTCATCACTCTTTCATGTGAATTGGTTTTGTCTCTCCAATAGCCTGTAAACTCCCTGAGATAGCAACAGTATCTGATACTTCCGAGCCCTCTTTCAGTGGAGTGAACACATTGCATTTACTCCATTTCAAGCATCTGTAAAGAGATTCAACATAGGCAACAGAGGATGGTGTGAAGAATTTGTAGCTTTAATAACAGATTAGTTAGGGGGTAGGGATGATACTTCTGTCCTACCTGTGCCATTCTTCAAAAGCAGAGACTCCCTTCACCTAAGAGCTAGACAATGCCTGCTTCATTTTTGAATCAAGAAAGCAGAACATACCTTACACACACATATTCATCAAATAGACTTCTTTCCCTAATTATGTCTTCCTCCTTTGAGTTTCTTATGGCTAATGATCATGTCTTCTGCTTTCAGCTCTTGCCTCTTAAAAATCTCAACCCTTAAATCTTTACTGATCATTAAAACCTTCATGACCTCTAAACTTATAAGGGTGAAATCTGCAGTAAATGGATTAGAACAATTTGTTTACTATAAATGAGGCTGGAAAAATTGGTGAAGAGCCCCACAGAGATCCGGAATGCAGTAACCTTGCCCAGAATCCTTATTCTGTGATAATTTCAACCCTGGACTGCAGCCTCATCTGACTCTGGATAATGTCATTGTTTCACGTGTCTCCTAGGCCCTGCTTCCTTTAATGATTCTTTACATTCTTCTATGCCAATCTGTATCTCCAAATCATTTCCAAACTAGTAATGGGACTGATGGTCCCCTTACTGAATGCAAAGCCACAGAACAAAGAGCCCAGAAAGGAGTGGAGCTAAGAGGGTTGCTGAGGAAAGAGGAACCCCAGCATCTGAGGGGAAGAGATGCAGCTTCTCTAAGTCTGGCAGGAAGGCTCGGGCATCCTCCAGTGCTGCCTGAGCTGCCACGGTAAAGTTGGGATCACCAGAAATTAAAACATCAAAGACACAGGAATGGAAGTAAGCATCTTCCACTGGAAGCCCTTCCTTGCACAGCCGTCTGGCAGTATCAATGGTTATAGCTCCCCGACGATTGCGCTCTGATCGAGAGAGTCGCTGACTTGGAGGGCACCCCCCAACACAGAGCTGCAGGTCCTGTTCAGCTGAGAAGGCCATGGCCACATCCTCTGCTACCTTGATGGAGAAGGAGAGCTGCCCAGCTGTCTGCCGAATGATTATAGTTGTGCCAATGTAGGCAGCTTGGATCTCCACATGGTTCCCAGGGTTAGCAGTTTGAATCGACAAACTGGATCCCCCAGGTCGGTCACCTCCATTGATAGAACCATCTTCAAAGGCTACAGGAAGATTATCCACCTCAGCCTGATACACCTTCTGATCAATGCATTCCTGCATGTTCTTAAATATGATGGTGAGCTGTGAGGACAAGAGGGAAAACAGTTCATTTTGGGTTCAGTGCATCTTCCCCCCAATCAGACCTCATACATAGTTAGAGATCTGATCCAAGTAGAGATGCAGGACTACTATGGCCCTCAATCCTTGATCCCTTCTCCTATTTATGTTCCAGTATTACCTCATCCCTACTTAACCCCCTCTCTACTTAATCGTGGCAACTTCCTAGGAGAGGGAAAAGTTTCCCTTCTGAAACTCCTCAGGTCCGCCCTCTCCGACTGTCTCTTCAAGGTTTTCTGCATTTGAGTCAAATTCCCATCAAGGGGAAGTGATTTACAGCTCCAGGTGTTTGGTAGAAGGGAGTGATTCGAGATGGGGGAGAGGTTGAGGAAGAAAAGGGAATTAGGGAGCATTGCTGTTGAATAGTGGGGATGGGGAGGAATGGTGCCCGTGGAAGAATCTCATGAGGTGGATCGGAAGGAAGATTGAGTGCCTGACCTTCCGGGTGGCGGTAGCGTTGGCCCCCAACGCCATGGGGGAGCTGGTGGCTTGGACAAAGAGGAAGTCATTATCCAGTAGAGGCCAAGCTCCTTGGACACGGCATGTGTGAAAGTGATGGTGGAAGCTGCGCACATGGGGGTCCCCGAAGGAAGCGCAATGCAAGAACCCCGGGGGACGACCATGCAGCCGGGAAAACCGGCCTTCATAGTCACAAGGGTCCGGGGCAGGGAGGCCGGAGCCCGCGCCTGGAAGGGCGGGGCCCCGGGGCGGGGGAGGGGCTGTAGGGCCCTGGCGGGAGCAGTTGTGCTGGATCATCAGGTCTTCGATGCCATGTACCGCCGAATGGAAGGCGAGGTCCCCGCGGCAGGTGCGGGCGGTGCGCCGAGTGCAGAGCGCATAGGAGCGGAGGGCTCGACAGAGGCCGCCAGAGCCCACCCCTCCACCCCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGAAGTGCTCCTGATGAACCCCCACCTCTAAGGCTCAGAGTGGACGATACGTACTCAGCATTGCAGCGGAGGATCTTGCATTGAGAATGAGCTAAAGACAGAAGGGAGAGGATTGTGAGACGGTCCTCAGACCTCTGCTCTATCGGAGTGTAGTTTGCTCATAACTCTTCCAAATCTCATCAGGGGTTTCCAGCCTTCCTAAAACCTAACTAAGGGCCTTCCCCAGCCCCCAACCCCCTAGTCCCTAGTTCTCTCGGCTGTCTTACTAAAAGTGTGTAAGCCTGCCACATCTCTTCTGCCTGTCGACCAAGGGCTTCCCCAGTGGCCTTCCCCAGACTGAACGGGAAATAAAATATTAGTATTTGAGAGCAGGGCGAGTGATCGGGACTCTCAGCGCCTATCTCTCCTCACTCATTCAGGCTCACATGCCCACCCCTACATAGCAGCCTACCCTCTAGATTTCCCCAAACCCTTCCCTGGCCCTTCCTTACCATGTCCACAGAGGAGCAGCAGGAGAGTGAGAGTGCTTAGAGTTGGGGGACTGCCATGGGAGGACCTGGGACTAGGGGACTGGCCTGGCTCCCCCATACCTATCCAGCCAGGTTTCCCAGGCGCCGGTTCTTCCCAGCTGATGACCCTCCTACCTAGTGAATTTTGACCGGAAGCCCTGTAAGTGACTGAAAAAAGAAATTTGGCTGGACATGGAGAGAGAGAAGAATTGAAGATTGGTAAGGATAATGTGGAGTGAATCTGGGGAGATCAAGAAAAGGATGAACAGACTGGAATTTGGGGAGATTGGAGTTCCTCAAACTATAAGTGTGGCAGTTAAGCCTCTTTGCCCTGTTCCTGTGGCCACTTTTAGGGCCCTTGTGCAATACCCCTAGGTGGGGGTGGAGGGAAGGTTGAGTGAACTCAAGGGG
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Task1_train_1492
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Located on Chromosome 1, this mutation impacts HJV (hemojuvelin BMP co-receptor). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; HJV-related disorder
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Task1_train_1493
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Assess the clinical impact of this variant on gene HJV (hemojuvelin BMP co-receptor), found on Chromosome 1. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; not provided
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TCTTCAAAAGCAGAGACTCCCTTCACCTAAGAGCTAGACAATGCCTGCTTCATTTTTGAATCAAGAAAGCAGAACATACCTTACACACACATATTCATCAAATAGACTTCTTTCCCTAATTATGTCTTCCTCCTTTGAGTTTCTTATGGCTAATGATCATGTCTTCTGCTTTCAGCTCTTGCCTCTTAAAAATCTCAACCCTTAAATCTTTACTGATCATTAAAACCTTCATGACCTCTAAACTTATAAGGGTGAAATCTGCAGTAAATGGATTAGAACAATTTGTTTACTATAAATGAGGCTGGAAAAATTGGTGAAGAGCCCCACAGAGATCCGGAATGCAGTAACCTTGCCCAGAATCCTTATTCTGTGATAATTTCAACCCTGGACTGCAGCCTCATCTGACTCTGGATAATGTCATTGTTTCACGTGTCTCCTAGGCCCTGCTTCCTTTAATGATTCTTTACATTCTTCTATGCCAATCTGTATCTCCAAATCATTTCCAAACTAGTAATGGGACTGATGGTCCCCTTACTGAATGCAAAGCCACAGAACAAAGAGCCCAGAAAGGAGTGGAGCTAAGAGGGTTGCTGAGGAAAGAGGAACCCCAGCATCTGAGGGGAAGAGATGCAGCTTCTCTAAGTCTGGCAGGAAGGCTCGGGCATCCTCCAGTGCTGCCTGAGCTGCCACGGTAAAGTTGGGATCACCAGAAATTAAAACATCAAAGACACAGGAATGGAAGTAAGCATCTTCCACTGGAAGCCCTTCCTTGCACAGCCGTCTGGCAGTATCAATGGTTATAGCTCCCCGACGATTGCGCTCTGATCGAGAGAGTCGCTGACTTGGAGGGCACCCCCCAACACAGAGCTGCAGGTCCTGTTCAGCTGAGAAGGCCATGGCCACATCCTCTGCTACCTTGATGGAGAAGGAGAGCTGCCCAGCTGTCTGCCGAATGATTATAGTTGTGCCAATGTAGGCAGCTTGGATCTCCACATGGTTCCCAGGGTTAGCAGTTTGAATCGACAAACTGGATCCCCCAGGTCGGTCACCTCCATTGATAGAACCATCTTCAAAGGCTACAGGAAGATTATCCACCTCAGCCTGATACACCTTCTGATCAATGCATTCCTGCATGTTCTTAAATATGATGGTGAGCTGTGAGGACAAGAGGGAAAACAGTTCATTTTGGGTTCAGTGCATCTTCCCCCCAATCAGACCTCATACATAGTTAGAGATCTGATCCAAGTAGAGATGCAGGACTACTATGGCCCTCAATCCTTGATCCCTTCTCCTATTTATGTTCCAGTATTACCTCATCCCTACTTAACCCCCTCTCTACTTAATCGTGGCAACTTCCTAGGAGAGGGAAAAGTTTCCCTTCTGAAACTCCTCAGGTCCGCCCTCTCCGACTGTCTCTTCAAGGTTTTCTGCATTTGAGTCAAATTCCCATCAAGGGGAAGTGATTTACAGCTCCAGGTGTTTGGTAGAAGGGAGTGATTCGAGATGGGGGAGAGGTTGAGGAAGAAAAGGGAATTAGGGAGCATTGCTGTTGAATAGTGGGGATGGGGAGGAATGGTGCCCGTGGAAGAATCTCATGAGGTGGATCGGAAGGAAGATTGAGTGCCTGACCTTCCGGGTGGCGGTAGCGTTGGCCCCCAACGCCATGGGGGAGCTGGTGGCTTGGACAAAGAGGAAGTCATTATCCAGTAGAGGCCAAGCTCCTTGGACACGGCATGTGTGAAAGTGATGGTGGAAGCTGCGCACATGGGGGTCCCCGAAGGAAGCGCAATGCAAGAACCCCGGGGGACGACCATGCAGCCGGGAAAACCGGCCTTCATAGTCACAAGGGTCCGGGGCAGGGAGGCCGGAGCCCGCGCCTGGAAGGGCGGGGCCCCGGGGCGGGGGAGGGGCTGTAGGGCCCTGGCGGGAGCAGTTGTGCTGGATCATCAGGTCTTCGATGCCATGTACCGCCGAATGGAAGGCGAGGTCCCCGCGGCAGGTGCGGGCGGTGCGCCGAGTGCAGAGCGCATAGGAGCGGAGGGCTCGACAGAGGCCGCCAGAGCCCACCCCTCCACCCCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGAAGTGCTCCTGATGAACCCCCACCTCTAAGGCTCAGAGTGGACGATACGTACTCAGCATTGCAGCGGAGGATCTTGCATTGAGAATGAGCTAAAGACAGAAGGGAGAGGATTGTGAGACGGTCCTCAGACCTCTGCTCTATCGGAGTGTAGTTTGCTCATAACTCTTCCAAATCTCATCAGGGGTTTCCAGCCTTCCTAAAACCTAACTAAGGGCCTTCCCCAGCCCCCAACCCCCTAGTCCCTAGTTCTCTCGGCTGTCTTACTAAAAGTGTGTAAGCCTGCCACATCTCTTCTGCCTGTCGACCAAGGGCTTCCCCAGTGGCCTTCCCCAGACTGAACGGGAAATAAAATATTAGTATTTGAGAGCAGGGCGAGTGATCGGGACTCTCAGCGCCTATCTCTCCTCACTCATTCAGGCTCACATGCCCACCCCTACATAGCAGCCTACCCTCTAGATTTCCCCAAACCCTTCCCTGGCCCTTCCTTACCATGTCCACAGAGGAGCAGCAGGAGAGTGAGAGTGCTTAGAGTTGGGGGACTGCCATGGGAGGACCTGGGACTAGGGGACTGGCCTGGCTCCCCCATACCTATCCAGCCAGGTTTCCCAGGCGCCGGTTCTTCCCAGCTGATGACCCTCCTACCTAGTGAATTTTGACCGGAAGCCCTGTAAGTGACTGAAAAAAGAAATTTGGCTGGACATGGAGAGAGAGAAGAATTGAAGATTGGTAAGGATAATGTGGAGTGAATCTGGGGAGATCAAGAAAAGGATGAACAGACTGGAATTTGGGGAGATTGGAGTTCCTCAAACTATAAGTGTGGCAGTTAAGCCTCTTTGCCCTGTTCCTGTGGCCACTTTTAGGGCCCTTGTGCAATACCCCTAGGTGGGGGTGGAGGGAAGGTTGAGTGAACTCAAGGGGGCAGAGTCCACTGTATTGCTCCATTCTGAGCTACCAAACAGCAGGTATGTCAAAGATGGAGGAATCATGGGGCTAGATCAGATACCAGTAATCCTAGTGGGTACCCTAGTAAAATTAGGACCTGAAAATATTTCAGAAACATACTTCTTATTTGTCCCTCTCCATTAGGAGGAGATGCCCTCTAGGAGTCATACATTTCTTTTCCTCCTTTGTGTCAGAACACAAGAAGGATTAAGGGTGGCATACCCATCCCGTCTAGAATATCAGTATTCAAATGAAAAGGAAACCAATCTCTTTTCATCAGCTCTAGAGAGCTGCAATTTTAATCTCCCTCTCTCATGGAATAATGGGATGCAAACCAAACATGCAAATCAATATTTGTTTTTTCTAAGTCAACAGTTCTTGTATTTTCCCAAATATCACTCCTTCCATTAATCTCTTCTTTTCAAATTCTGAAGTTCTCAGTCTTTTATGATGACAGGAGTTGGAGAGGGGCTAAATCCCTCCTGCCTAACTCCCCTATCTTATGGGTAAGGATATGATTGGGGGAAGAGTCCTGCAAGAGGGAGAATAGAATGGAGGGACTAGAGTTGTGGGGAGAAATCATTTACAGGGAGCAGCCCCCATGCTTGGAATCTCAATGTGAAGGGCATTGCTAAGTGGGGGCAGGATAGAAGGGTATCAGTGACTCATCATCTGAGGTCATATTTGGCCTTGGTAAGAAAACTACAGAATAGAGGACGTAGGGAACTCCTTCTAAAACTTCATCAGGAGTCTTGAGGTAATAAGGTAAAGAGAGGGCTAAGACTGCCAGAGGAGAGACAGAGAATTAAACTTCAAAAAGCTAGAGGCCAGAGGCCAGAAAGAAATAAGACAGAAAGAGAAATGGAGATTGGGGCACCTTGGTAGGGAGAGATCCCAGCATTTGGACGAGAGACATCCAAGTAGGTGTTTGTAATTTTATAAAAGTCTAACTTCAATATAAAAGCTTATTAAAGGAATTGCAATTTCATTTTGACTTACTGTTTCCAGAGGTCAAACATTACTCTGCTATCCAATTCTCCAGCCATGATTCCCT
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TCTTCAAAAGCAGAGACTCCCTTCACCTAAGAGCTAGACAATGCCTGCTTCATTTTTGAATCAAGAAAGCAGAACATACCTTACACACACATATTCATCAAATAGACTTCTTTCCCTAATTATGTCTTCCTCCTTTGAGTTTCTTATGGCTAATGATCATGTCTTCTGCTTTCAGCTCTTGCCTCTTAAAAATCTCAACCCTTAAATCTTTACTGATCATTAAAACCTTCATGACCTCTAAACTTATAAGGGTGAAATCTGCAGTAAATGGATTAGAACAATTTGTTTACTATAAATGAGGCTGGAAAAATTGGTGAAGAGCCCCACAGAGATCCGGAATGCAGTAACCTTGCCCAGAATCCTTATTCTGTGATAATTTCAACCCTGGACTGCAGCCTCATCTGACTCTGGATAATGTCATTGTTTCACGTGTCTCCTAGGCCCTGCTTCCTTTAATGATTCTTTACATTCTTCTATGCCAATCTGTATCTCCAAATCATTTCCAAACTAGTAATGGGACTGATGGTCCCCTTACTGAATGCAAAGCCACAGAACAAAGAGCCCAGAAAGGAGTGGAGCTAAGAGGGTTGCTGAGGAAAGAGGAACCCCAGCATCTGAGGGGAAGAGATGCAGCTTCTCTAAGTCTGGCAGGAAGGCTCGGGCATCCTCCAGTGCTGCCTGAGCTGCCACGGTAAAGTTGGGATCACCAGAAATTAAAACATCAAAGACACAGGAATGGAAGTAAGCATCTTCCACTGGAAGCCCTTCCTTGCACAGCCGTCTGGCAGTATCAATGGTTATAGCTCCCCGACGATTGCGCTCTGATCGAGAGAGTCGCTGACTTGGAGGGCACCCCCCAACACAGAGCTGCAGGTCCTGTTCAGCTGAGAAGGCCATGGCCACATCCTCTGCTACCTTGATGGAGAAGGAGAGCTGCCCAGCTGTCTGCCGAATGATTATAGTTGTGCCAATGTAGGCAGCTTGGATCTCCACATGGTTCCCAGGGTTAGCAGTTTGAATCGACAAACTGGATCCCCCAGGTCGGTCACCTCCATTGATAGAACCATCTTCAAAGGCTACAGGAAGATTATCCACCTCAGCCTGATACACCTTCTGATCAATGCATTCCTGCATGTTCTTAAATATGATGGTGAGCTGTGAGGACAAGAGGGAAAACAGTTCATTTTGGGTTCAGTGCATCTTCCCCCCAATCAGACCTCATACATAGTTAGAGATCTGATCCAAGTAGAGATGCAGGACTACTATGGCCCTCAATCCTTGATCCCTTCTCCTATTTATGTTCCAGTATTACCTCATCCCTACTTAACCCCCTCTCTACTTAATCGTGGCAACTTCCTAGGAGAGGGAAAAGTTTCCCTTCTGAAACTCCTCAGGTCCGCCCTCTCCGACTGTCTCTTCAAGGTTTTCTGCATTTGAGTCAAATTCCCATCAAGGGGAAGTGATTTACAGCTCCAGGTGTTTGGTAGAAGGGAGTGATTCGAGATGGGGGAGAGGTTGAGGAAGAAAAGGGAATTAGGGAGCATTGCTGTTGAATAGTGGGGATGGGGAGGAATGGTGCCCGTGGAAGAATCTCATGAGGTGGATCGGAAGGAAGATTGAGTGCCTGACCTTCCGGGTGGCGGTAGCGTTGGCCCCCAACGCCATGGGGGAGCTGGTGGCTTGGACAAAGAGGAAGTCATTATCCAGTAGAGGCCAAGCTCCTTGGACACGGCATGTGTGAAAGTGATGGTGGAAGCTGCGCACATGGGGGTCCCCGAAGGAAGCGCAATGCAAGAACCCCGGGGGACGACCATGCAGCCGGGAAAACCGGCCTTCATAGTCACAAGGGTCCGGGGCAGGGAGGCCGGAGCCCGCGCCTGGAAGGGCGGGGCCCCGGGGCGGGGGAGGGGCTGTAGGGCCCTGGCGGGAGCAGTTGTGCTGGATCATCAGGTCTTCGATGCCATGTACCGCCGAATGGAAGGCGAGGTCCCCGCGGCAGGTGCGGGCGGTGCGCCGAGTGCAGAGCGCATAGGAGCGGAGGGCTCGACGGAGGCCGCCAGAGCCCACCCCTCCACCCCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGAAGTGCTCCTGATGAACCCCCACCTCTAAGGCTCAGAGTGGACGATACGTACTCAGCATTGCAGCGGAGGATCTTGCATTGAGAATGAGCTAAAGACAGAAGGGAGAGGATTGTGAGACGGTCCTCAGACCTCTGCTCTATCGGAGTGTAGTTTGCTCATAACTCTTCCAAATCTCATCAGGGGTTTCCAGCCTTCCTAAAACCTAACTAAGGGCCTTCCCCAGCCCCCAACCCCCTAGTCCCTAGTTCTCTCGGCTGTCTTACTAAAAGTGTGTAAGCCTGCCACATCTCTTCTGCCTGTCGACCAAGGGCTTCCCCAGTGGCCTTCCCCAGACTGAACGGGAAATAAAATATTAGTATTTGAGAGCAGGGCGAGTGATCGGGACTCTCAGCGCCTATCTCTCCTCACTCATTCAGGCTCACATGCCCACCCCTACATAGCAGCCTACCCTCTAGATTTCCCCAAACCCTTCCCTGGCCCTTCCTTACCATGTCCACAGAGGAGCAGCAGGAGAGTGAGAGTGCTTAGAGTTGGGGGACTGCCATGGGAGGACCTGGGACTAGGGGACTGGCCTGGCTCCCCCATACCTATCCAGCCAGGTTTCCCAGGCGCCGGTTCTTCCCAGCTGATGACCCTCCTACCTAGTGAATTTTGACCGGAAGCCCTGTAAGTGACTGAAAAAAGAAATTTGGCTGGACATGGAGAGAGAGAAGAATTGAAGATTGGTAAGGATAATGTGGAGTGAATCTGGGGAGATCAAGAAAAGGATGAACAGACTGGAATTTGGGGAGATTGGAGTTCCTCAAACTATAAGTGTGGCAGTTAAGCCTCTTTGCCCTGTTCCTGTGGCCACTTTTAGGGCCCTTGTGCAATACCCCTAGGTGGGGGTGGAGGGAAGGTTGAGTGAACTCAAGGGGGCAGAGTCCACTGTATTGCTCCATTCTGAGCTACCAAACAGCAGGTATGTCAAAGATGGAGGAATCATGGGGCTAGATCAGATACCAGTAATCCTAGTGGGTACCCTAGTAAAATTAGGACCTGAAAATATTTCAGAAACATACTTCTTATTTGTCCCTCTCCATTAGGAGGAGATGCCCTCTAGGAGTCATACATTTCTTTTCCTCCTTTGTGTCAGAACACAAGAAGGATTAAGGGTGGCATACCCATCCCGTCTAGAATATCAGTATTCAAATGAAAAGGAAACCAATCTCTTTTCATCAGCTCTAGAGAGCTGCAATTTTAATCTCCCTCTCTCATGGAATAATGGGATGCAAACCAAACATGCAAATCAATATTTGTTTTTTCTAAGTCAACAGTTCTTGTATTTTCCCAAATATCACTCCTTCCATTAATCTCTTCTTTTCAAATTCTGAAGTTCTCAGTCTTTTATGATGACAGGAGTTGGAGAGGGGCTAAATCCCTCCTGCCTAACTCCCCTATCTTATGGGTAAGGATATGATTGGGGGAAGAGTCCTGCAAGAGGGAGAATAGAATGGAGGGACTAGAGTTGTGGGGAGAAATCATTTACAGGGAGCAGCCCCCATGCTTGGAATCTCAATGTGAAGGGCATTGCTAAGTGGGGGCAGGATAGAAGGGTATCAGTGACTCATCATCTGAGGTCATATTTGGCCTTGGTAAGAAAACTACAGAATAGAGGACGTAGGGAACTCCTTCTAAAACTTCATCAGGAGTCTTGAGGTAATAAGGTAAAGAGAGGGCTAAGACTGCCAGAGGAGAGACAGAGAATTAAACTTCAAAAAGCTAGAGGCCAGAGGCCAGAAAGAAATAAGACAGAAAGAGAAATGGAGATTGGGGCACCTTGGTAGGGAGAGATCCCAGCATTTGGACGAGAGACATCCAAGTAGGTGTTTGTAATTTTATAAAAGTCTAACTTCAATATAAAAGCTTATTAAAGGAATTGCAATTTCATTTTGACTTACTGTTTCCAGAGGTCAAACATTACTCTGCTATCCAATTCTCCAGCCATGATTCCCT
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Task1_train_1494
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Gene GJA5, LOC122128420 (gap junction protein alpha 5| Sharpr-MPRA regulatory region 3144), found on Chromosome 1, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
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Pathogenic; Atrial fibrillation, familial, 11
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CAGAGATGGGCAGGTGAGTCAGAGGTTGAACCTCCTTCTGAGCCTTTACCCTCCTCTGTCCCAACCTCTTGTGGCTATCTGTTTAGGTTAATAACTGCCAGGCAGCCGGAGAGGAGAGCAGGAAGACACAAGTTTCTCTGTGGTTTCCTTTCCTTATTTCAGGACTCCCCAAGCCTTTACCCATCCCATCAGCACCCACACACACACACACGTGCATTTTAATAATGTAATAATCCCTCTATAAGTCTCAGTTTCCAATTCCAAGCATCGTTTACCTTCATCCAAAACAACAGCAACCCATTATGGATCCAGTGAATACAGAGACCAGGCCAATCCCTGGGGAAGGCAAGGCTTTTCTACAGCCCCCACTTGGCAGTCTCATTAGGGGCACTAGGGAGACATAGGAATCTCTGCGCTCTTTAAATAAAGGCCCTGCCAAGAGAGCTGGAGATTCCCCTACTATTTCCTTGCCCCTGCTAAAGCCTCCAGGAGAGAGAGATCTGGGGGCCTCCATAGCTGTCATCACACCTCCTCTTGGCACTAAGTTGGCAGTCAGCAAAGGAAGTAAATAGGAGGGGAAAATAGTTTTCCAGTGTTTTCTCTCCATTTTTATTTTCATCTTCACAGCAGAATTTTTTTTTCCACAAGGGGAATCTGAGAAGTACAATGCTTTCTTTGTTTTAACAAGGCCTGGGGAAATTCCACTGGCCTCAGTGGCTGATGATCTGGTCAGGGTTCGAGAGAGGACAACAGCTTCTTGGATATTCCTGTTGGTAAGGCCTTCAGGGAATGGCTGGGTGAACAGCCAAGGGAGAAAGGGAAGGGATGGTTTCTATCATTGGATTGAACTGTAAAGGAGCTGCAGGGTGACAGATGTTGGCAGGAATTCCAGTAGAGTTTGTGTGTACAGTGACTCCCTAGCAGGGCTGACACCTGCACAGGCTAGGTGTACACCCTAGCAGAAGGAAAGGTTGCAACATCACCAAGGTGGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAAGGCATTTGTAAAGCTGAGGCTGCTGGTAAAGTTCCAAGAAGCCCTTTTTAAGGCTGAGTAGAGGGAGGAGAAGCCAAGGGCAACCCAAGGCCATCTCACCACTACTCCGAGGAATGGTCCATGGAGACAACAGATTCAAGAGCACATATAATGCAAGTTCCTTGATTCATGCTGTCTATTGGCTGGGAACTTTGAGCTCTTCCTTGGAGGAGGGAGGGTGATCAGGTCAAGGAGGTAGGAACTTAGAGAACGCATTTGGTATGCTGCTGGTATGTAGAGAGAGAGTCATTCTATCCCTCTGGCTATCCCTTCCAGGCCAGCTTTTGCCATGCTTCCCTTCTTTCCCTCTACCCTGTTTCATGAGTAATCTGAAAGGCTTCGTATACTGGGTAGAGGGTGGGGAGGGAACTGCAGTCTGGGTGGGTTGTCACCTCTCTTACTATCCCAGAGCCCTGGTTATAGTTTCTAGAATTAATGAGCAACGTCATTGAGACCCGGGGCTCAAAGGAGCCAAGCAGTGATGACAGTGAGAAAGCATCAGTTCAGAAGGGACACGTCTTTCCTCTCTGAGCCTCCTTTGTTCCCACCTGGTCCTGATCCTCCCATAAAGGAGGGTCACACTGATAGGTCATCTGACCTTGCCTTGCTGCTGGCCTTACTAAGACGTCGCTTGTCACTATGATAGCCATGGGGAAGGCGGTGACCTGGTGAGACTCCATTGGGCACCTCAGGCTTCTGGCCATAACGAACCTGGATGAAACCTTCCCCAGGAGTCTGCTCCTGACCTCGTACTTGCTCGGTGACCAGGTTGTCTGTGTTTTGTTGGGAGGCCATATTATTGCTGAAGGGATTGAAGAATTTTCCCCCAGGGCCATTCTCCAGGCACTGATTAAAGTCGGGGGGTGGTGTGCAGCTCTGGACTATGCCCACAGAGGGGCCAGAAAGCTGGCACTTAGCCATGTGCTGCCGCGGTTTGACAAATCGCTGTCTGATCTTCTTCCAGCCCAGGTGGTAGAGTTCAGCCAGGCTAAGGAGGAGGGACAGTGCAGCCACAGCCAGCATAAAGACAATGAAGACATTCTTCTCTGTGGGCCGGGATACGTAACAGTTGACCGGGTGGGGACAGGGACTCCTGCGGCAGACATGCAGGGTGGTCAGGAAGATTCCGTAGATGAAGTACTGGCCCACAATGAAGCCCACCTCCATGGTGGTGCGGATCAGGATGCTGCACACATAGGTGTTGAGCAGAGTGCCCTGGAGGGCAATCCTTCCATTCCCTTCCTCCCAGCAGGACAGTTCTGCCTTCTCTGCCACCGGGTACTCGTAAGAGCCAGAGCCCCGGACCTCTTTGGCCCTCTCGGCCTCCCGTAGCTTGCGCTTCTCCTGCATGCGCACAGTGTGCATGGCGTGGCCCATGTACACCAGAGAGGGCGTGGAGACGAAGATGATCTGCAGCACCCAGTAGCGAATGTGGGAGATGGGGAAAGCCTGGTCGTAGCAGACATTCTGGCAGCCAGGCTGAATCGTATCACACCGGAAATCAGCCTGCTCATCCCCCCAGGAAGACTCAGCAGCTGTGCCCAGCACGAGCATACGGAATATGAAGAGGACAGTGAGCCAGACCTTGCCTACCACGGTCGAGTGCTTGTGTACTTCCTCCAGGAAATTTCCCAGGAAGCTCCAATCGCCCATCTTGGCACAGCCAGGGAACAGATGCCAAAACTTCTGCAAATGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAGAAGAAGGATGTTCTGTGAAGGTCTGGAATGTCTATCATGTTCTGGGATTCCACTGATCCATCCATCCAATGGGTTCTTTAAGAAAATGCAACTTAGAAGTCAAAGCAACCAACGAAAAGCTCGCTCTCCTTTCCCAGCAAAAATAAAAAGAAAGAGAAGATTCAAAGTAGCCATATTAGCAAAATTAGAGCATGGCTCCCACACTTTAACGGATCTAGAAATCGTGGTGTGTGTTACAATATGGATTCTGCTCTTGCCCCAGTAATTCTACTTCAGGAGGTCTGGGATGGCCCCCAGGAATCTGGATTTACAACAAGCAGCCCAAGTAATTCTGATGCAGGCGGTGAGGGACCGCACCTGGAGAAACACGAGTATTAAAAAGAACACAAGACTGGGGTCTGCAAATGTGACTCTGGGCATTTACCTCACTGAGTCTGTTTCTTCATTTATCGAATGGGGATGGGAATAGCTACACCAGAGAATTCTGAGGATTAAATGATATGAGGTGTGTGATATTCTGAAAATCATTCCACAACTGTTCCAAATGTTTAAATGGCTGTTGGATGGAAAAGGAATTTTTTTATGGCTCCAGAGGGCAGAACTAGGTGGAGGAGGAAAGAGTGAGGATGGGATTGGCAAATTTGGCCCCTCAGGAAGCACTCTGCAAAAATCAGAACCATCCAGCATGGACCAGCTGTGTTGGGAGGTGGCAAACAAAAAGTGTGCTTTGGTCACACCAGCTAACAGTATCACAGATGAGTGCTCACTTCCCCTGGCTGGTAAGGCAATGTTGATCTCCCATGCCTCGGTGCAACACAGCCATTCCAGCCACACAGCTCAGCTCGCCCTGCTGCTAAGTTTCTGTGTCTCATTTAAATAAGGTTCCCACACACAGATCTGCCCACCCTTATGTCCAGAATAAATGTCCCAAAACTTTATGTCCCTTACAAAATCCTCCCTCATCTGGCCTTTGTCTGCTTTTCCAGCCTGTTCCTGCCTGTCCACATGAGTTCCTTTTGTCCAGCCATGCCAAGTCTTCCCAAATGCCCTCCTTCTGTACCCCTACATGTCCCCTCACCCCTAGCTGAATCCCATTTACCTTTCAAAACTTAACCCAGTCATTGCCTCCTCCAGCCCTCCCTCCTCCCTCAAGCTGAGCCTCTTCAGCTCCTGTGATGGCCCCCGGGACACTTACTCGTCTCCCAGTGCTTGCTGCCTTGTGTTGTAATCCTCTGCCTGTCTGTGTTCTCCCAGGAGGGACTGTTTGAAAATGGAGACTGTCTTTTCTTCTGTATCAC
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CAGAGATGGGCAGGTGAGTCAGAGGTTGAACCTCCTTCTGAGCCTTTACCCTCCTCTGTCCCAACCTCTTGTGGCTATCTGTTTAGGTTAATAACTGCCAGGCAGCCGGAGAGGAGAGCAGGAAGACACAAGTTTCTCTGTGGTTTCCTTTCCTTATTTCAGGACTCCCCAAGCCTTTACCCATCCCATCAGCACCCACACACACACACACGTGCATTTTAATAATGTAATAATCCCTCTATAAGTCTCAGTTTCCAATTCCAAGCATCGTTTACCTTCATCCAAAACAACAGCAACCCATTATGGATCCAGTGAATACAGAGACCAGGCCAATCCCTGGGGAAGGCAAGGCTTTTCTACAGCCCCCACTTGGCAGTCTCATTAGGGGCACTAGGGAGACATAGGAATCTCTGCGCTCTTTAAATAAAGGCCCTGCCAAGAGAGCTGGAGATTCCCCTACTATTTCCTTGCCCCTGCTAAAGCCTCCAGGAGAGAGAGATCTGGGGGCCTCCATAGCTGTCATCACACCTCCTCTTGGCACTAAGTTGGCAGTCAGCAAAGGAAGTAAATAGGAGGGGAAAATAGTTTTCCAGTGTTTTCTCTCCATTTTTATTTTCATCTTCACAGCAGAATTTTTTTTTCCACAAGGGGAATCTGAGAAGTACAATGCTTTCTTTGTTTTAACAAGGCCTGGGGAAATTCCACTGGCCTCAGTGGCTGATGATCTGGTCAGGGTTCGAGAGAGGACAACAGCTTCTTGGATATTCCTGTTGGTAAGGCCTTCAGGGAATGGCTGGGTGAACAGCCAAGGGAGAAAGGGAAGGGATGGTTTCTATCATTGGATTGAACTGTAAAGGAGCTGCAGGGTGACAGATGTTGGCAGGAATTCCAGTAGAGTTTGTGTGTACAGTGACTCCCTAGCAGGGCTGACACCTGCACAGGCTAGGTGTACACCCTAGCAGAAGGAAAGGTTGCAACATCACCAAGGTGGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAAGGCATTTGTAAAGCTGAGGCTGCTGGTAAAGTTCCAAGAAGCCCTTTTTAAGGCTGAGTAGAGGGAGGAGAAGCCAAGGGCAACCCAAGGCCATCTCACCACTACTCCGAGGAATGGTCCATGGAGACAACAGATTCAAGAGCACATATAATGCAAGTTCCTTGATTCATGCTGTCTATTGGCTGGGAACTTTGAGCTCTTCCTTGGAGGAGGGAGGGTGATCAGGTCAAGGAGGTAGGAACTTAGAGAACGCATTTGGTATGCTGCTGGTATGTAGAGAGAGAGTCATTCTATCCCTCTGGCTATCCCTTCCAGGCCAGCTTTTGCCATGCTTCCCTTCTTTCCCTCTACCCTGTTTCATGAGTAATCTGAAAGGCTTCGTATACTGGGTAGAGGGTGGGGAGGGAACTGCAGTCTGGGTGGGTTGTCACCTCTCTTACTATCCCAGAGCCCTGGTTATAGTTTCTAGAATTAATGAGCAACGTCATTGAGACCCGGGGCTCAAAGGAGCCAAGCAGTGATGACAGTGAGAAAGCATCAGTTCAGAAGGGACACGTCTTTCCTCTCTGAGCCTCCTTTGTTCCCACCTGGTCCTGATCCTCCCATAAAGGAGGGTCACACTGATAGGTCATCTGACCTTGCCTTGCTGCTGGCCTTACTAAGACGTCGCTTGTCACTATGATAGCCATGGGGAAGGCGGTGACCTGGTGAGACTCCATTGGGCACCTCAGGCTTCTGGCCATAACGAACCTGGATGAAACCTTCCCCAGGAGTCTGCTCCTGACCTCGTACTTGCTCGGTGACCAGGTTGTCTGTGTTTTGTTGGGAGGCCATATTATTGCTGAAGGGATTGAAGAATTTTCCCCCAGGGCCATTCTCCAGGCACTGATTAAAGTCGGGGGGTGGTGTGCAGCTCTGGACTATGCCCACAGAGGGGCCAGAAAGCTGGCACTTAGCCATGTGCTGCCGCGGTTTGACAAATCGCTGTCTGATCTTCTTCCAGCCCATGTGGTAGAGTTCAGCCAGGCTAAGGAGGAGGGACAGTGCAGCCACAGCCAGCATAAAGACAATGAAGACATTCTTCTCTGTGGGCCGGGATACGTAACAGTTGACCGGGTGGGGACAGGGACTCCTGCGGCAGACATGCAGGGTGGTCAGGAAGATTCCGTAGATGAAGTACTGGCCCACAATGAAGCCCACCTCCATGGTGGTGCGGATCAGGATGCTGCACACATAGGTGTTGAGCAGAGTGCCCTGGAGGGCAATCCTTCCATTCCCTTCCTCCCAGCAGGACAGTTCTGCCTTCTCTGCCACCGGGTACTCGTAAGAGCCAGAGCCCCGGACCTCTTTGGCCCTCTCGGCCTCCCGTAGCTTGCGCTTCTCCTGCATGCGCACAGTGTGCATGGCGTGGCCCATGTACACCAGAGAGGGCGTGGAGACGAAGATGATCTGCAGCACCCAGTAGCGAATGTGGGAGATGGGGAAAGCCTGGTCGTAGCAGACATTCTGGCAGCCAGGCTGAATCGTATCACACCGGAAATCAGCCTGCTCATCCCCCCAGGAAGACTCAGCAGCTGTGCCCAGCACGAGCATACGGAATATGAAGAGGACAGTGAGCCAGACCTTGCCTACCACGGTCGAGTGCTTGTGTACTTCCTCCAGGAAATTTCCCAGGAAGCTCCAATCGCCCATCTTGGCACAGCCAGGGAACAGATGCCAAAACTTCTGCAAATGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAGAAGAAGGATGTTCTGTGAAGGTCTGGAATGTCTATCATGTTCTGGGATTCCACTGATCCATCCATCCAATGGGTTCTTTAAGAAAATGCAACTTAGAAGTCAAAGCAACCAACGAAAAGCTCGCTCTCCTTTCCCAGCAAAAATAAAAAGAAAGAGAAGATTCAAAGTAGCCATATTAGCAAAATTAGAGCATGGCTCCCACACTTTAACGGATCTAGAAATCGTGGTGTGTGTTACAATATGGATTCTGCTCTTGCCCCAGTAATTCTACTTCAGGAGGTCTGGGATGGCCCCCAGGAATCTGGATTTACAACAAGCAGCCCAAGTAATTCTGATGCAGGCGGTGAGGGACCGCACCTGGAGAAACACGAGTATTAAAAAGAACACAAGACTGGGGTCTGCAAATGTGACTCTGGGCATTTACCTCACTGAGTCTGTTTCTTCATTTATCGAATGGGGATGGGAATAGCTACACCAGAGAATTCTGAGGATTAAATGATATGAGGTGTGTGATATTCTGAAAATCATTCCACAACTGTTCCAAATGTTTAAATGGCTGTTGGATGGAAAAGGAATTTTTTTATGGCTCCAGAGGGCAGAACTAGGTGGAGGAGGAAAGAGTGAGGATGGGATTGGCAAATTTGGCCCCTCAGGAAGCACTCTGCAAAAATCAGAACCATCCAGCATGGACCAGCTGTGTTGGGAGGTGGCAAACAAAAAGTGTGCTTTGGTCACACCAGCTAACAGTATCACAGATGAGTGCTCACTTCCCCTGGCTGGTAAGGCAATGTTGATCTCCCATGCCTCGGTGCAACACAGCCATTCCAGCCACACAGCTCAGCTCGCCCTGCTGCTAAGTTTCTGTGTCTCATTTAAATAAGGTTCCCACACACAGATCTGCCCACCCTTATGTCCAGAATAAATGTCCCAAAACTTTATGTCCCTTACAAAATCCTCCCTCATCTGGCCTTTGTCTGCTTTTCCAGCCTGTTCCTGCCTGTCCACATGAGTTCCTTTTGTCCAGCCATGCCAAGTCTTCCCAAATGCCCTCCTTCTGTACCCCTACATGTCCCCTCACCCCTAGCTGAATCCCATTTACCTTTCAAAACTTAACCCAGTCATTGCCTCCTCCAGCCCTCCCTCCTCCCTCAAGCTGAGCCTCTTCAGCTCCTGTGATGGCCCCCGGGACACTTACTCGTCTCCCAGTGCTTGCTGCCTTGTGTTGTAATCCTCTGCCTGTCTGTGTTCTCCCAGGAGGGACTGTTTGAAAATGGAGACTGTCTTTTCTTCTGTATCAC
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Task1_train_1495
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This alteration in GJA5, LOC122128420 (gap junction protein alpha 5| Sharpr-MPRA regulatory region 3144) on Chromosome 1 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
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Pathogenic; Atrial fibrillation, familial, 11
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GTTGAACCTCCTTCTGAGCCTTTACCCTCCTCTGTCCCAACCTCTTGTGGCTATCTGTTTAGGTTAATAACTGCCAGGCAGCCGGAGAGGAGAGCAGGAAGACACAAGTTTCTCTGTGGTTTCCTTTCCTTATTTCAGGACTCCCCAAGCCTTTACCCATCCCATCAGCACCCACACACACACACACGTGCATTTTAATAATGTAATAATCCCTCTATAAGTCTCAGTTTCCAATTCCAAGCATCGTTTACCTTCATCCAAAACAACAGCAACCCATTATGGATCCAGTGAATACAGAGACCAGGCCAATCCCTGGGGAAGGCAAGGCTTTTCTACAGCCCCCACTTGGCAGTCTCATTAGGGGCACTAGGGAGACATAGGAATCTCTGCGCTCTTTAAATAAAGGCCCTGCCAAGAGAGCTGGAGATTCCCCTACTATTTCCTTGCCCCTGCTAAAGCCTCCAGGAGAGAGAGATCTGGGGGCCTCCATAGCTGTCATCACACCTCCTCTTGGCACTAAGTTGGCAGTCAGCAAAGGAAGTAAATAGGAGGGGAAAATAGTTTTCCAGTGTTTTCTCTCCATTTTTATTTTCATCTTCACAGCAGAATTTTTTTTTCCACAAGGGGAATCTGAGAAGTACAATGCTTTCTTTGTTTTAACAAGGCCTGGGGAAATTCCACTGGCCTCAGTGGCTGATGATCTGGTCAGGGTTCGAGAGAGGACAACAGCTTCTTGGATATTCCTGTTGGTAAGGCCTTCAGGGAATGGCTGGGTGAACAGCCAAGGGAGAAAGGGAAGGGATGGTTTCTATCATTGGATTGAACTGTAAAGGAGCTGCAGGGTGACAGATGTTGGCAGGAATTCCAGTAGAGTTTGTGTGTACAGTGACTCCCTAGCAGGGCTGACACCTGCACAGGCTAGGTGTACACCCTAGCAGAAGGAAAGGTTGCAACATCACCAAGGTGGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAAGGCATTTGTAAAGCTGAGGCTGCTGGTAAAGTTCCAAGAAGCCCTTTTTAAGGCTGAGTAGAGGGAGGAGAAGCCAAGGGCAACCCAAGGCCATCTCACCACTACTCCGAGGAATGGTCCATGGAGACAACAGATTCAAGAGCACATATAATGCAAGTTCCTTGATTCATGCTGTCTATTGGCTGGGAACTTTGAGCTCTTCCTTGGAGGAGGGAGGGTGATCAGGTCAAGGAGGTAGGAACTTAGAGAACGCATTTGGTATGCTGCTGGTATGTAGAGAGAGAGTCATTCTATCCCTCTGGCTATCCCTTCCAGGCCAGCTTTTGCCATGCTTCCCTTCTTTCCCTCTACCCTGTTTCATGAGTAATCTGAAAGGCTTCGTATACTGGGTAGAGGGTGGGGAGGGAACTGCAGTCTGGGTGGGTTGTCACCTCTCTTACTATCCCAGAGCCCTGGTTATAGTTTCTAGAATTAATGAGCAACGTCATTGAGACCCGGGGCTCAAAGGAGCCAAGCAGTGATGACAGTGAGAAAGCATCAGTTCAGAAGGGACACGTCTTTCCTCTCTGAGCCTCCTTTGTTCCCACCTGGTCCTGATCCTCCCATAAAGGAGGGTCACACTGATAGGTCATCTGACCTTGCCTTGCTGCTGGCCTTACTAAGACGTCGCTTGTCACTATGATAGCCATGGGGAAGGCGGTGACCTGGTGAGACTCCATTGGGCACCTCAGGCTTCTGGCCATAACGAACCTGGATGAAACCTTCCCCAGGAGTCTGCTCCTGACCTCGTACTTGCTCGGTGACCAGGTTGTCTGTGTTTTGTTGGGAGGCCATATTATTGCTGAAGGGATTGAAGAATTTTCCCCCAGGGCCATTCTCCAGGCACTGATTAAAGTCGGGGGGTGGTGTGCAGCTCTGGACTATGCCCACAGAGGGGCCAGAAAGCTGGCACTTAGCCATGTGCTGCCGCGGTTTGACAAATCGCTGTCTGATCTTCTTCCAGCCCAGGTGGTAGAGTTCAGCCAGGCTAAGGAGGAGGGACAGTGCAGCCACAGCCAGCATAAAGACAATGAAGACATTCTTCTCTGTGGGCCGGGATACGTAACAGTTGACCGGGTGGGGACAGGGACTCCTGCGGCAGACATGCAGGGTGGTCAGGAAGATTCCGTAGATGAAGTACTGGCCCACAATGAAGCCCACCTCCATGGTGGTGCGGATCAGGATGCTGCACACATAGGTGTTGAGCAGAGTGCCCTGGAGGGCAATCCTTCCATTCCCTTCCTCCCAGCAGGACAGTTCTGCCTTCTCTGCCACCGGGTACTCGTAAGAGCCAGAGCCCCGGACCTCTTTGGCCCTCTCGGCCTCCCGTAGCTTGCGCTTCTCCTGCATGCGCACAGTGTGCATGGCGTGGCCCATGTACACCAGAGAGGGCGTGGAGACGAAGATGATCTGCAGCACCCAGTAGCGAATGTGGGAGATGGGGAAAGCCTGGTCGTAGCAGACATTCTGGCAGCCAGGCTGAATCGTATCACACCGGAAATCAGCCTGCTCATCCCCCCAGGAAGACTCAGCAGCTGTGCCCAGCACGAGCATACGGAATATGAAGAGGACAGTGAGCCAGACCTTGCCTACCACGGTCGAGTGCTTGTGTACTTCCTCCAGGAAATTTCCCAGGAAGCTCCAATCGCCCATCTTGGCACAGCCAGGGAACAGATGCCAAAACTTCTGCAAATGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAGAAGAAGGATGTTCTGTGAAGGTCTGGAATGTCTATCATGTTCTGGGATTCCACTGATCCATCCATCCAATGGGTTCTTTAAGAAAATGCAACTTAGAAGTCAAAGCAACCAACGAAAAGCTCGCTCTCCTTTCCCAGCAAAAATAAAAAGAAAGAGAAGATTCAAAGTAGCCATATTAGCAAAATTAGAGCATGGCTCCCACACTTTAACGGATCTAGAAATCGTGGTGTGTGTTACAATATGGATTCTGCTCTTGCCCCAGTAATTCTACTTCAGGAGGTCTGGGATGGCCCCCAGGAATCTGGATTTACAACAAGCAGCCCAAGTAATTCTGATGCAGGCGGTGAGGGACCGCACCTGGAGAAACACGAGTATTAAAAAGAACACAAGACTGGGGTCTGCAAATGTGACTCTGGGCATTTACCTCACTGAGTCTGTTTCTTCATTTATCGAATGGGGATGGGAATAGCTACACCAGAGAATTCTGAGGATTAAATGATATGAGGTGTGTGATATTCTGAAAATCATTCCACAACTGTTCCAAATGTTTAAATGGCTGTTGGATGGAAAAGGAATTTTTTTATGGCTCCAGAGGGCAGAACTAGGTGGAGGAGGAAAGAGTGAGGATGGGATTGGCAAATTTGGCCCCTCAGGAAGCACTCTGCAAAAATCAGAACCATCCAGCATGGACCAGCTGTGTTGGGAGGTGGCAAACAAAAAGTGTGCTTTGGTCACACCAGCTAACAGTATCACAGATGAGTGCTCACTTCCCCTGGCTGGTAAGGCAATGTTGATCTCCCATGCCTCGGTGCAACACAGCCATTCCAGCCACACAGCTCAGCTCGCCCTGCTGCTAAGTTTCTGTGTCTCATTTAAATAAGGTTCCCACACACAGATCTGCCCACCCTTATGTCCAGAATAAATGTCCCAAAACTTTATGTCCCTTACAAAATCCTCCCTCATCTGGCCTTTGTCTGCTTTTCCAGCCTGTTCCTGCCTGTCCACATGAGTTCCTTTTGTCCAGCCATGCCAAGTCTTCCCAAATGCCCTCCTTCTGTACCCCTACATGTCCCCTCACCCCTAGCTGAATCCCATTTACCTTTCAAAACTTAACCCAGTCATTGCCTCCTCCAGCCCTCCCTCCTCCCTCAAGCTGAGCCTCTTCAGCTCCTGTGATGGCCCCCGGGACACTTACTCGTCTCCCAGTGCTTGCTGCCTTGTGTTGTAATCCTCTGCCTGTCTGTGTTCTCCCAGGAGGGACTGTTTGAAAATGGAGACTGTCTTTTCTTCTGTATCACCAGAGCCTGGCCCAGAGTAGGTGT
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GTTGAACCTCCTTCTGAGCCTTTACCCTCCTCTGTCCCAACCTCTTGTGGCTATCTGTTTAGGTTAATAACTGCCAGGCAGCCGGAGAGGAGAGCAGGAAGACACAAGTTTCTCTGTGGTTTCCTTTCCTTATTTCAGGACTCCCCAAGCCTTTACCCATCCCATCAGCACCCACACACACACACACGTGCATTTTAATAATGTAATAATCCCTCTATAAGTCTCAGTTTCCAATTCCAAGCATCGTTTACCTTCATCCAAAACAACAGCAACCCATTATGGATCCAGTGAATACAGAGACCAGGCCAATCCCTGGGGAAGGCAAGGCTTTTCTACAGCCCCCACTTGGCAGTCTCATTAGGGGCACTAGGGAGACATAGGAATCTCTGCGCTCTTTAAATAAAGGCCCTGCCAAGAGAGCTGGAGATTCCCCTACTATTTCCTTGCCCCTGCTAAAGCCTCCAGGAGAGAGAGATCTGGGGGCCTCCATAGCTGTCATCACACCTCCTCTTGGCACTAAGTTGGCAGTCAGCAAAGGAAGTAAATAGGAGGGGAAAATAGTTTTCCAGTGTTTTCTCTCCATTTTTATTTTCATCTTCACAGCAGAATTTTTTTTTCCACAAGGGGAATCTGAGAAGTACAATGCTTTCTTTGTTTTAACAAGGCCTGGGGAAATTCCACTGGCCTCAGTGGCTGATGATCTGGTCAGGGTTCGAGAGAGGACAACAGCTTCTTGGATATTCCTGTTGGTAAGGCCTTCAGGGAATGGCTGGGTGAACAGCCAAGGGAGAAAGGGAAGGGATGGTTTCTATCATTGGATTGAACTGTAAAGGAGCTGCAGGGTGACAGATGTTGGCAGGAATTCCAGTAGAGTTTGTGTGTACAGTGACTCCCTAGCAGGGCTGACACCTGCACAGGCTAGGTGTACACCCTAGCAGAAGGAAAGGTTGCAACATCACCAAGGTGGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAAGGCATTTGTAAAGCTGAGGCTGCTGGTAAAGTTCCAAGAAGCCCTTTTTAAGGCTGAGTAGAGGGAGGAGAAGCCAAGGGCAACCCAAGGCCATCTCACCACTACTCCGAGGAATGGTCCATGGAGACAACAGATTCAAGAGCACATATAATGCAAGTTCCTTGATTCATGCTGTCTATTGGCTGGGAACTTTGAGCTCTTCCTTGGAGGAGGGAGGGTGATCAGGTCAAGGAGGTAGGAACTTAGAGAACGCATTTGGTATGCTGCTGGTATGTAGAGAGAGAGTCATTCTATCCCTCTGGCTATCCCTTCCAGGCCAGCTTTTGCCATGCTTCCCTTCTTTCCCTCTACCCTGTTTCATGAGTAATCTGAAAGGCTTCGTATACTGGGTAGAGGGTGGGGAGGGAACTGCAGTCTGGGTGGGTTGTCACCTCTCTTACTATCCCAGAGCCCTGGTTATAGTTTCTAGAATTAATGAGCAACGTCATTGAGACCCGGGGCTCAAAGGAGCCAAGCAGTGATGACAGTGAGAAAGCATCAGTTCAGAAGGGACACGTCTTTCCTCTCTGAGCCTCCTTTGTTCCCACCTGGTCCTGATCCTCCCATAAAGGAGGGTCACACTGATAGGTCATCTGACCTTGCCTTGCTGCTGGCCTTACTAAGACGTCGCTTGTCACTATGATAGCCATGGGGAAGGCGGTGACCTGGTGAGACTCCATTGGGCACCTCAGGCTTCTGGCCATAACGAACCTGGATGAAACCTTCCCCAGGAGTCTGCTCCTGACCTCGTACTTGCTCGGTGACCAGGTTGTCTGTGTTTTGTTGGGAGGCCATATTATTGCTGAAGGGATTGAAGAATTTTCCCCCAGGGCCATTCTCCAGGCACTGATTAAAGTCGGGGGGTGGTGTGCAGCTCTGGACTATGCCCACAGAGGGGCCAGAAAGCTGGCACTTAGCCATGTGCTGCCGCGGTTTGACAAATCGCTGTCTGATCTTCTTCCAGCCCAGGTGGTAGAGTTCAGCCAGGCTAATGAGGAGGGACAGTGCAGCCACAGCCAGCATAAAGACAATGAAGACATTCTTCTCTGTGGGCCGGGATACGTAACAGTTGACCGGGTGGGGACAGGGACTCCTGCGGCAGACATGCAGGGTGGTCAGGAAGATTCCGTAGATGAAGTACTGGCCCACAATGAAGCCCACCTCCATGGTGGTGCGGATCAGGATGCTGCACACATAGGTGTTGAGCAGAGTGCCCTGGAGGGCAATCCTTCCATTCCCTTCCTCCCAGCAGGACAGTTCTGCCTTCTCTGCCACCGGGTACTCGTAAGAGCCAGAGCCCCGGACCTCTTTGGCCCTCTCGGCCTCCCGTAGCTTGCGCTTCTCCTGCATGCGCACAGTGTGCATGGCGTGGCCCATGTACACCAGAGAGGGCGTGGAGACGAAGATGATCTGCAGCACCCAGTAGCGAATGTGGGAGATGGGGAAAGCCTGGTCGTAGCAGACATTCTGGCAGCCAGGCTGAATCGTATCACACCGGAAATCAGCCTGCTCATCCCCCCAGGAAGACTCAGCAGCTGTGCCCAGCACGAGCATACGGAATATGAAGAGGACAGTGAGCCAGACCTTGCCTACCACGGTCGAGTGCTTGTGTACTTCCTCCAGGAAATTTCCCAGGAAGCTCCAATCGCCCATCTTGGCACAGCCAGGGAACAGATGCCAAAACTTCTGCAAATGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAGAAGAAGGATGTTCTGTGAAGGTCTGGAATGTCTATCATGTTCTGGGATTCCACTGATCCATCCATCCAATGGGTTCTTTAAGAAAATGCAACTTAGAAGTCAAAGCAACCAACGAAAAGCTCGCTCTCCTTTCCCAGCAAAAATAAAAAGAAAGAGAAGATTCAAAGTAGCCATATTAGCAAAATTAGAGCATGGCTCCCACACTTTAACGGATCTAGAAATCGTGGTGTGTGTTACAATATGGATTCTGCTCTTGCCCCAGTAATTCTACTTCAGGAGGTCTGGGATGGCCCCCAGGAATCTGGATTTACAACAAGCAGCCCAAGTAATTCTGATGCAGGCGGTGAGGGACCGCACCTGGAGAAACACGAGTATTAAAAAGAACACAAGACTGGGGTCTGCAAATGTGACTCTGGGCATTTACCTCACTGAGTCTGTTTCTTCATTTATCGAATGGGGATGGGAATAGCTACACCAGAGAATTCTGAGGATTAAATGATATGAGGTGTGTGATATTCTGAAAATCATTCCACAACTGTTCCAAATGTTTAAATGGCTGTTGGATGGAAAAGGAATTTTTTTATGGCTCCAGAGGGCAGAACTAGGTGGAGGAGGAAAGAGTGAGGATGGGATTGGCAAATTTGGCCCCTCAGGAAGCACTCTGCAAAAATCAGAACCATCCAGCATGGACCAGCTGTGTTGGGAGGTGGCAAACAAAAAGTGTGCTTTGGTCACACCAGCTAACAGTATCACAGATGAGTGCTCACTTCCCCTGGCTGGTAAGGCAATGTTGATCTCCCATGCCTCGGTGCAACACAGCCATTCCAGCCACACAGCTCAGCTCGCCCTGCTGCTAAGTTTCTGTGTCTCATTTAAATAAGGTTCCCACACACAGATCTGCCCACCCTTATGTCCAGAATAAATGTCCCAAAACTTTATGTCCCTTACAAAATCCTCCCTCATCTGGCCTTTGTCTGCTTTTCCAGCCTGTTCCTGCCTGTCCACATGAGTTCCTTTTGTCCAGCCATGCCAAGTCTTCCCAAATGCCCTCCTTCTGTACCCCTACATGTCCCCTCACCCCTAGCTGAATCCCATTTACCTTTCAAAACTTAACCCAGTCATTGCCTCCTCCAGCCCTCCCTCCTCCCTCAAGCTGAGCCTCTTCAGCTCCTGTGATGGCCCCCGGGACACTTACTCGTCTCCCAGTGCTTGCTGCCTTGTGTTGTAATCCTCTGCCTGTCTGTGTTCTCCCAGGAGGGACTGTTTGAAAATGGAGACTGTCTTTTCTTCTGTATCACCAGAGCCTGGCCCAGAGTAGGTGT
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Task1_train_1496
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Located on Chromosome 1, this mutation impacts GJA5 (gap junction protein alpha 5). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; Atrial fibrillation, somatic
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ATAAAGGCCCTGCCAAGAGAGCTGGAGATTCCCCTACTATTTCCTTGCCCCTGCTAAAGCCTCCAGGAGAGAGAGATCTGGGGGCCTCCATAGCTGTCATCACACCTCCTCTTGGCACTAAGTTGGCAGTCAGCAAAGGAAGTAAATAGGAGGGGAAAATAGTTTTCCAGTGTTTTCTCTCCATTTTTATTTTCATCTTCACAGCAGAATTTTTTTTTCCACAAGGGGAATCTGAGAAGTACAATGCTTTCTTTGTTTTAACAAGGCCTGGGGAAATTCCACTGGCCTCAGTGGCTGATGATCTGGTCAGGGTTCGAGAGAGGACAACAGCTTCTTGGATATTCCTGTTGGTAAGGCCTTCAGGGAATGGCTGGGTGAACAGCCAAGGGAGAAAGGGAAGGGATGGTTTCTATCATTGGATTGAACTGTAAAGGAGCTGCAGGGTGACAGATGTTGGCAGGAATTCCAGTAGAGTTTGTGTGTACAGTGACTCCCTAGCAGGGCTGACACCTGCACAGGCTAGGTGTACACCCTAGCAGAAGGAAAGGTTGCAACATCACCAAGGTGGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAAGGCATTTGTAAAGCTGAGGCTGCTGGTAAAGTTCCAAGAAGCCCTTTTTAAGGCTGAGTAGAGGGAGGAGAAGCCAAGGGCAACCCAAGGCCATCTCACCACTACTCCGAGGAATGGTCCATGGAGACAACAGATTCAAGAGCACATATAATGCAAGTTCCTTGATTCATGCTGTCTATTGGCTGGGAACTTTGAGCTCTTCCTTGGAGGAGGGAGGGTGATCAGGTCAAGGAGGTAGGAACTTAGAGAACGCATTTGGTATGCTGCTGGTATGTAGAGAGAGAGTCATTCTATCCCTCTGGCTATCCCTTCCAGGCCAGCTTTTGCCATGCTTCCCTTCTTTCCCTCTACCCTGTTTCATGAGTAATCTGAAAGGCTTCGTATACTGGGTAGAGGGTGGGGAGGGAACTGCAGTCTGGGTGGGTTGTCACCTCTCTTACTATCCCAGAGCCCTGGTTATAGTTTCTAGAATTAATGAGCAACGTCATTGAGACCCGGGGCTCAAAGGAGCCAAGCAGTGATGACAGTGAGAAAGCATCAGTTCAGAAGGGACACGTCTTTCCTCTCTGAGCCTCCTTTGTTCCCACCTGGTCCTGATCCTCCCATAAAGGAGGGTCACACTGATAGGTCATCTGACCTTGCCTTGCTGCTGGCCTTACTAAGACGTCGCTTGTCACTATGATAGCCATGGGGAAGGCGGTGACCTGGTGAGACTCCATTGGGCACCTCAGGCTTCTGGCCATAACGAACCTGGATGAAACCTTCCCCAGGAGTCTGCTCCTGACCTCGTACTTGCTCGGTGACCAGGTTGTCTGTGTTTTGTTGGGAGGCCATATTATTGCTGAAGGGATTGAAGAATTTTCCCCCAGGGCCATTCTCCAGGCACTGATTAAAGTCGGGGGGTGGTGTGCAGCTCTGGACTATGCCCACAGAGGGGCCAGAAAGCTGGCACTTAGCCATGTGCTGCCGCGGTTTGACAAATCGCTGTCTGATCTTCTTCCAGCCCAGGTGGTAGAGTTCAGCCAGGCTAAGGAGGAGGGACAGTGCAGCCACAGCCAGCATAAAGACAATGAAGACATTCTTCTCTGTGGGCCGGGATACGTAACAGTTGACCGGGTGGGGACAGGGACTCCTGCGGCAGACATGCAGGGTGGTCAGGAAGATTCCGTAGATGAAGTACTGGCCCACAATGAAGCCCACCTCCATGGTGGTGCGGATCAGGATGCTGCACACATAGGTGTTGAGCAGAGTGCCCTGGAGGGCAATCCTTCCATTCCCTTCCTCCCAGCAGGACAGTTCTGCCTTCTCTGCCACCGGGTACTCGTAAGAGCCAGAGCCCCGGACCTCTTTGGCCCTCTCGGCCTCCCGTAGCTTGCGCTTCTCCTGCATGCGCACAGTGTGCATGGCGTGGCCCATGTACACCAGAGAGGACGTGGAGACGAAGATGATCTGCAGCACCCAGTAGCGAATGTGGGAGATGGGGAAAGCCTGGTCGTAGCAGACATTCTGGCAGCCAGGCTGAATCGTATCACACCGGAAATCAGCCTGCTCATCCCCCCAGGAAGACTCAGCAGCTGTGCCCAGCACGAGCATACGGAATATGAAGAGGACAGTGAGCCAGACCTTGCCTACCACGGTCGAGTGCTTGTGTACTTCCTCCAGGAAATTTCCCAGGAAGCTCCAATCGCCCATCTTGGCACAGCCAGGGAACAGATGCCAAAACTTCTGCAAATGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAGAAGAAGGATGTTCTGTGAAGGTCTGGAATGTCTATCATGTTCTGGGATTCCACTGATCCATCCATCCAATGGGTTCTTTAAGAAAATGCAACTTAGAAGTCAAAGCAACCAACGAAAAGCTCGCTCTCCTTTCCCAGCAAAAATAAAAAGAAAGAGAAGATTCAAAGTAGCCATATTAGCAAAATTAGAGCATGGCTCCCACACTTTAACGGATCTAGAAATCGTGGTGTGTGTTACAATATGGATTCTGCTCTTGCCCCAGTAATTCTACTTCAGGAGGTCTGGGATGGCCCCCAGGAATCTGGATTTACAACAAGCAGCCCAAGTAATTCTGATGCAGGCGGTGAGGGACCGCACCTGGAGAAACACGAGTATTAAAAAGAACACAAGACTGGGGTCTGCAAATGTGACTCTGGGCATTTACCTCACTGAGTCTGTTTCTTCATTTATCGAATGGGGATGGGAATAGCTACACCAGAGAATTCTGAGGATTAAATGATATGAGGTGTGTGATATTCTGAAAATCATTCCACAACTGTTCCAAATGTTTAAATGGCTGTTGGATGGAAAAGGAATTTTTTTATGGCTCCAGAGGGCAGAACTAGGTGGAGGAGGAAAGAGTGAGGATGGGATTGGCAAATTTGGCCCCTCAGGAAGCACTCTGCAAAAATCAGAACCATCCAGCATGGACCAGCTGTGTTGGGAGGTGGCAAACAAAAAGTGTGCTTTGGTCACACCAGCTAACAGTATCACAGATGAGTGCTCACTTCCCCTGGCTGGTAAGGCAATGTTGATCTCCCATGCCTCGGTGCAACACAGCCATTCCAGCCACACAGCTCAGCTCGCCCTGCTGCTAAGTTTCTGTGTCTCATTTAAATAAGGTTCCCACACACAGATCTGCCCACCCTTATGTCCAGAATAAATGTCCCAAAACTTTATGTCCCTTACAAAATCCTCCCTCATCTGGCCTTTGTCTGCTTTTCCAGCCTGTTCCTGCCTGTCCACATGAGTTCCTTTTGTCCAGCCATGCCAAGTCTTCCCAAATGCCCTCCTTCTGTACCCCTACATGTCCCCTCACCCCTAGCTGAATCCCATTTACCTTTCAAAACTTAACCCAGTCATTGCCTCCTCCAGCCCTCCCTCCTCCCTCAAGCTGAGCCTCTTCAGCTCCTGTGATGGCCCCCGGGACACTTACTCGTCTCCCAGTGCTTGCTGCCTTGTGTTGTAATCCTCTGCCTGTCTGTGTTCTCCCAGGAGGGACTGTTTGAAAATGGAGACTGTCTTTTCTTCTGTATCACCAGAGCCTGGCCCAGAGTAGGTGTTTAATATATCTTAGTTGAGTGAATGAAGGAGGGGCTGACAGGCACTGTTGTTTCCTACCCAATAGAAAACCAATTCCCTGTTTCTTGCCTGCCTCCCATTGGCAGGGTGAAAAAGCCAGGTATCACTTTCTTAATCTCCTCTGCAGTTAGTTCTGGTAGGTGAGGTATGGGGAGAATCTAAAGTAGAGGGAATGCTCCAGAAAAGGTTTTTCTACCCCCCAGTAAATGGAGAGAGCCTCACTCACAGTGCTCCCATCCCCCTGTGAACAAGAGGGAACCTCACTCACAGTGCTCCCATCCCCTGGTGAACAGGAGGGAGACTACTCACAGTGCTCCCATCCCCCGGTGAATAGGAGTGAGCCTCACTTAGCCCCACCGCTTCCTGCCTGTGGACAGAGT
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Task1_train_1497
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This sequence change occurs on Chromosome 1, altering GJA5 (gap junction protein alpha 5). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
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Pathogenic; Atrial fibrillation, familial, 11
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CTGCCAAGAGAGCTGGAGATTCCCCTACTATTTCCTTGCCCCTGCTAAAGCCTCCAGGAGAGAGAGATCTGGGGGCCTCCATAGCTGTCATCACACCTCCTCTTGGCACTAAGTTGGCAGTCAGCAAAGGAAGTAAATAGGAGGGGAAAATAGTTTTCCAGTGTTTTCTCTCCATTTTTATTTTCATCTTCACAGCAGAATTTTTTTTTCCACAAGGGGAATCTGAGAAGTACAATGCTTTCTTTGTTTTAACAAGGCCTGGGGAAATTCCACTGGCCTCAGTGGCTGATGATCTGGTCAGGGTTCGAGAGAGGACAACAGCTTCTTGGATATTCCTGTTGGTAAGGCCTTCAGGGAATGGCTGGGTGAACAGCCAAGGGAGAAAGGGAAGGGATGGTTTCTATCATTGGATTGAACTGTAAAGGAGCTGCAGGGTGACAGATGTTGGCAGGAATTCCAGTAGAGTTTGTGTGTACAGTGACTCCCTAGCAGGGCTGACACCTGCACAGGCTAGGTGTACACCCTAGCAGAAGGAAAGGTTGCAACATCACCAAGGTGGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAAGGCATTTGTAAAGCTGAGGCTGCTGGTAAAGTTCCAAGAAGCCCTTTTTAAGGCTGAGTAGAGGGAGGAGAAGCCAAGGGCAACCCAAGGCCATCTCACCACTACTCCGAGGAATGGTCCATGGAGACAACAGATTCAAGAGCACATATAATGCAAGTTCCTTGATTCATGCTGTCTATTGGCTGGGAACTTTGAGCTCTTCCTTGGAGGAGGGAGGGTGATCAGGTCAAGGAGGTAGGAACTTAGAGAACGCATTTGGTATGCTGCTGGTATGTAGAGAGAGAGTCATTCTATCCCTCTGGCTATCCCTTCCAGGCCAGCTTTTGCCATGCTTCCCTTCTTTCCCTCTACCCTGTTTCATGAGTAATCTGAAAGGCTTCGTATACTGGGTAGAGGGTGGGGAGGGAACTGCAGTCTGGGTGGGTTGTCACCTCTCTTACTATCCCAGAGCCCTGGTTATAGTTTCTAGAATTAATGAGCAACGTCATTGAGACCCGGGGCTCAAAGGAGCCAAGCAGTGATGACAGTGAGAAAGCATCAGTTCAGAAGGGACACGTCTTTCCTCTCTGAGCCTCCTTTGTTCCCACCTGGTCCTGATCCTCCCATAAAGGAGGGTCACACTGATAGGTCATCTGACCTTGCCTTGCTGCTGGCCTTACTAAGACGTCGCTTGTCACTATGATAGCCATGGGGAAGGCGGTGACCTGGTGAGACTCCATTGGGCACCTCAGGCTTCTGGCCATAACGAACCTGGATGAAACCTTCCCCAGGAGTCTGCTCCTGACCTCGTACTTGCTCGGTGACCAGGTTGTCTGTGTTTTGTTGGGAGGCCATATTATTGCTGAAGGGATTGAAGAATTTTCCCCCAGGGCCATTCTCCAGGCACTGATTAAAGTCGGGGGGTGGTGTGCAGCTCTGGACTATGCCCACAGAGGGGCCAGAAAGCTGGCACTTAGCCATGTGCTGCCGCGGTTTGACAAATCGCTGTCTGATCTTCTTCCAGCCCAGGTGGTAGAGTTCAGCCAGGCTAAGGAGGAGGGACAGTGCAGCCACAGCCAGCATAAAGACAATGAAGACATTCTTCTCTGTGGGCCGGGATACGTAACAGTTGACCGGGTGGGGACAGGGACTCCTGCGGCAGACATGCAGGGTGGTCAGGAAGATTCCGTAGATGAAGTACTGGCCCACAATGAAGCCCACCTCCATGGTGGTGCGGATCAGGATGCTGCACACATAGGTGTTGAGCAGAGTGCCCTGGAGGGCAATCCTTCCATTCCCTTCCTCCCAGCAGGACAGTTCTGCCTTCTCTGCCACCGGGTACTCGTAAGAGCCAGAGCCCCGGACCTCTTTGGCCCTCTCGGCCTCCCGTAGCTTGCGCTTCTCCTGCATGCGCACAGTGTGCATGGCGTGGCCCATGTACACCAGAGAGGGCGTGGAGACGAAGATGATCTGCAGCACCCAGTAGCGAATGTGGGAGATGGGGAAAGCCTGGTCGTAGCAGACATTCTGGCAGCCAGGCTGAATCGTATCACACCGGAAATCAGCCTGCTCATCCCCCCAGGAAGACTCAGCAGCTGTGCCCAGCACGAGCATACGGAATATGAAGAGGACAGTGAGCCAGACCTTGCCTACCACGGTCGAGTGCTTGTGTACTTCCTCCAGGAAATTTCCCAGGAAGCTCCAATCGCCCATCTTGGCACAGCCAGGGAACAGATGCCAAAACTTCTGCAAATGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAGAAGAAGGATGTTCTGTGAAGGTCTGGAATGTCTATCATGTTCTGGGATTCCACTGATCCATCCATCCAATGGGTTCTTTAAGAAAATGCAACTTAGAAGTCAAAGCAACCAACGAAAAGCTCGCTCTCCTTTCCCAGCAAAAATAAAAAGAAAGAGAAGATTCAAAGTAGCCATATTAGCAAAATTAGAGCATGGCTCCCACACTTTAACGGATCTAGAAATCGTGGTGTGTGTTACAATATGGATTCTGCTCTTGCCCCAGTAATTCTACTTCAGGAGGTCTGGGATGGCCCCCAGGAATCTGGATTTACAACAAGCAGCCCAAGTAATTCTGATGCAGGCGGTGAGGGACCGCACCTGGAGAAACACGAGTATTAAAAAGAACACAAGACTGGGGTCTGCAAATGTGACTCTGGGCATTTACCTCACTGAGTCTGTTTCTTCATTTATCGAATGGGGATGGGAATAGCTACACCAGAGAATTCTGAGGATTAAATGATATGAGGTGTGTGATATTCTGAAAATCATTCCACAACTGTTCCAAATGTTTAAATGGCTGTTGGATGGAAAAGGAATTTTTTTATGGCTCCAGAGGGCAGAACTAGGTGGAGGAGGAAAGAGTGAGGATGGGATTGGCAAATTTGGCCCCTCAGGAAGCACTCTGCAAAAATCAGAACCATCCAGCATGGACCAGCTGTGTTGGGAGGTGGCAAACAAAAAGTGTGCTTTGGTCACACCAGCTAACAGTATCACAGATGAGTGCTCACTTCCCCTGGCTGGTAAGGCAATGTTGATCTCCCATGCCTCGGTGCAACACAGCCATTCCAGCCACACAGCTCAGCTCGCCCTGCTGCTAAGTTTCTGTGTCTCATTTAAATAAGGTTCCCACACACAGATCTGCCCACCCTTATGTCCAGAATAAATGTCCCAAAACTTTATGTCCCTTACAAAATCCTCCCTCATCTGGCCTTTGTCTGCTTTTCCAGCCTGTTCCTGCCTGTCCACATGAGTTCCTTTTGTCCAGCCATGCCAAGTCTTCCCAAATGCCCTCCTTCTGTACCCCTACATGTCCCCTCACCCCTAGCTGAATCCCATTTACCTTTCAAAACTTAACCCAGTCATTGCCTCCTCCAGCCCTCCCTCCTCCCTCAAGCTGAGCCTCTTCAGCTCCTGTGATGGCCCCCGGGACACTTACTCGTCTCCCAGTGCTTGCTGCCTTGTGTTGTAATCCTCTGCCTGTCTGTGTTCTCCCAGGAGGGACTGTTTGAAAATGGAGACTGTCTTTTCTTCTGTATCACCAGAGCCTGGCCCAGAGTAGGTGTTTAATATATCTTAGTTGAGTGAATGAAGGAGGGGCTGACAGGCACTGTTGTTTCCTACCCAATAGAAAACCAATTCCCTGTTTCTTGCCTGCCTCCCATTGGCAGGGTGAAAAAGCCAGGTATCACTTTCTTAATCTCCTCTGCAGTTAGTTCTGGTAGGTGAGGTATGGGGAGAATCTAAAGTAGAGGGAATGCTCCAGAAAAGGTTTTTCTACCCCCCAGTAAATGGAGAGAGCCTCACTCACAGTGCTCCCATCCCCCTGTGAACAAGAGGGAACCTCACTCACAGTGCTCCCATCCCCTGGTGAACAGGAGGGAGACTACTCACAGTGCTCCCATCCCCCGGTGAATAGGAGTGAGCCTCACTTAGCCCCACCGCTTCCTGCCTGTGGACAGAGTTGTATGAAC
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CTGCCAAGAGAGCTGGAGATTCCCCTACTATTTCCTTGCCCCTGCTAAAGCCTCCAGGAGAGAGAGATCTGGGGGCCTCCATAGCTGTCATCACACCTCCTCTTGGCACTAAGTTGGCAGTCAGCAAAGGAAGTAAATAGGAGGGGAAAATAGTTTTCCAGTGTTTTCTCTCCATTTTTATTTTCATCTTCACAGCAGAATTTTTTTTTCCACAAGGGGAATCTGAGAAGTACAATGCTTTCTTTGTTTTAACAAGGCCTGGGGAAATTCCACTGGCCTCAGTGGCTGATGATCTGGTCAGGGTTCGAGAGAGGACAACAGCTTCTTGGATATTCCTGTTGGTAAGGCCTTCAGGGAATGGCTGGGTGAACAGCCAAGGGAGAAAGGGAAGGGATGGTTTCTATCATTGGATTGAACTGTAAAGGAGCTGCAGGGTGACAGATGTTGGCAGGAATTCCAGTAGAGTTTGTGTGTACAGTGACTCCCTAGCAGGGCTGACACCTGCACAGGCTAGGTGTACACCCTAGCAGAAGGAAAGGTTGCAACATCACCAAGGTGGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAGGGCATTTGCCAGAGGTACATACCAAGGCATTTGTAAAGCTGAGGCTGCTGGTAAAGTTCCAAGAAGCCCTTTTTAAGGCTGAGTAGAGGGAGGAGAAGCCAAGGGCAACCCAAGGCCATCTCACCACTACTCCGAGGAATGGTCCATGGAGACAACAGATTCAAGAGCACATATAATGCAAGTTCCTTGATTCATGCTGTCTATTGGCTGGGAACTTTGAGCTCTTCCTTGGAGGAGGGAGGGTGATCAGGTCAAGGAGGTAGGAACTTAGAGAACGCATTTGGTATGCTGCTGGTATGTAGAGAGAGAGTCATTCTATCCCTCTGGCTATCCCTTCCAGGCCAGCTTTTGCCATGCTTCCCTTCTTTCCCTCTACCCTGTTTCATGAGTAATCTGAAAGGCTTCGTATACTGGGTAGAGGGTGGGGAGGGAACTGCAGTCTGGGTGGGTTGTCACCTCTCTTACTATCCCAGAGCCCTGGTTATAGTTTCTAGAATTAATGAGCAACGTCATTGAGACCCGGGGCTCAAAGGAGCCAAGCAGTGATGACAGTGAGAAAGCATCAGTTCAGAAGGGACACGTCTTTCCTCTCTGAGCCTCCTTTGTTCCCACCTGGTCCTGATCCTCCCATAAAGGAGGGTCACACTGATAGGTCATCTGACCTTGCCTTGCTGCTGGCCTTACTAAGACGTCGCTTGTCACTATGATAGCCATGGGGAAGGCGGTGACCTGGTGAGACTCCATTGGGCACCTCAGGCTTCTGGCCATAACGAACCTGGATGAAACCTTCCCCAGGAGTCTGCTCCTGACCTCGTACTTGCTCGGTGACCAGGTTGTCTGTGTTTTGTTGGGAGGCCATATTATTGCTGAAGGGATTGAAGAATTTTCCCCCAGGGCCATTCTCCAGGCACTGATTAAAGTCGGGGGGTGGTGTGCAGCTCTGGACTATGCCCACAGAGGGGCCAGAAAGCTGGCACTTAGCCATGTGCTGCCGCGGTTTGACAAATCGCTGTCTGATCTTCTTCCAGCCCAGGTGGTAGAGTTCAGCCAGGCTAAGGAGGAGGGACAGTGCAGCCACAGCCAGCATAAAGACAATGAAGACATTCTTCTCTGTGGGCCGGGATACGTAACAGTTGACCGGGTGGGGACAGGGACTCCTGCGGCAGACATGCAGGGTGGTCAGGAAGATTCCGTAGATGAAGTACTGGCCCACAATGAAGCCCACCTCCATGGTGGTGCGGATCAGGATGCTGCACACATAGGTGTTGAGCAGAGTGCCCTGGAGGGCAATCCTTCCATTCCCTTCCTCCCAGCAGGACAGTTCTGCCTTCTCTGCCACCGGGTACTCGTAAGAGCCAGAGCCCCGGACCTCTTTGGCCCTCTCGGCCTCCCGTAGCTTGCGCTTCTCCTGCATGCGCACAGTGTGCATGGCGTGGCCCATGTACACCAGAGAGGGCGTGGAGATGAAGATGATCTGCAGCACCCAGTAGCGAATGTGGGAGATGGGGAAAGCCTGGTCGTAGCAGACATTCTGGCAGCCAGGCTGAATCGTATCACACCGGAAATCAGCCTGCTCATCCCCCCAGGAAGACTCAGCAGCTGTGCCCAGCACGAGCATACGGAATATGAAGAGGACAGTGAGCCAGACCTTGCCTACCACGGTCGAGTGCTTGTGTACTTCCTCCAGGAAATTTCCCAGGAAGCTCCAATCGCCCATCTTGGCACAGCCAGGGAACAGATGCCAAAACTTCTGCAAATGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAGAAGAAGGATGTTCTGTGAAGGTCTGGAATGTCTATCATGTTCTGGGATTCCACTGATCCATCCATCCAATGGGTTCTTTAAGAAAATGCAACTTAGAAGTCAAAGCAACCAACGAAAAGCTCGCTCTCCTTTCCCAGCAAAAATAAAAAGAAAGAGAAGATTCAAAGTAGCCATATTAGCAAAATTAGAGCATGGCTCCCACACTTTAACGGATCTAGAAATCGTGGTGTGTGTTACAATATGGATTCTGCTCTTGCCCCAGTAATTCTACTTCAGGAGGTCTGGGATGGCCCCCAGGAATCTGGATTTACAACAAGCAGCCCAAGTAATTCTGATGCAGGCGGTGAGGGACCGCACCTGGAGAAACACGAGTATTAAAAAGAACACAAGACTGGGGTCTGCAAATGTGACTCTGGGCATTTACCTCACTGAGTCTGTTTCTTCATTTATCGAATGGGGATGGGAATAGCTACACCAGAGAATTCTGAGGATTAAATGATATGAGGTGTGTGATATTCTGAAAATCATTCCACAACTGTTCCAAATGTTTAAATGGCTGTTGGATGGAAAAGGAATTTTTTTATGGCTCCAGAGGGCAGAACTAGGTGGAGGAGGAAAGAGTGAGGATGGGATTGGCAAATTTGGCCCCTCAGGAAGCACTCTGCAAAAATCAGAACCATCCAGCATGGACCAGCTGTGTTGGGAGGTGGCAAACAAAAAGTGTGCTTTGGTCACACCAGCTAACAGTATCACAGATGAGTGCTCACTTCCCCTGGCTGGTAAGGCAATGTTGATCTCCCATGCCTCGGTGCAACACAGCCATTCCAGCCACACAGCTCAGCTCGCCCTGCTGCTAAGTTTCTGTGTCTCATTTAAATAAGGTTCCCACACACAGATCTGCCCACCCTTATGTCCAGAATAAATGTCCCAAAACTTTATGTCCCTTACAAAATCCTCCCTCATCTGGCCTTTGTCTGCTTTTCCAGCCTGTTCCTGCCTGTCCACATGAGTTCCTTTTGTCCAGCCATGCCAAGTCTTCCCAAATGCCCTCCTTCTGTACCCCTACATGTCCCCTCACCCCTAGCTGAATCCCATTTACCTTTCAAAACTTAACCCAGTCATTGCCTCCTCCAGCCCTCCCTCCTCCCTCAAGCTGAGCCTCTTCAGCTCCTGTGATGGCCCCCGGGACACTTACTCGTCTCCCAGTGCTTGCTGCCTTGTGTTGTAATCCTCTGCCTGTCTGTGTTCTCCCAGGAGGGACTGTTTGAAAATGGAGACTGTCTTTTCTTCTGTATCACCAGAGCCTGGCCCAGAGTAGGTGTTTAATATATCTTAGTTGAGTGAATGAAGGAGGGGCTGACAGGCACTGTTGTTTCCTACCCAATAGAAAACCAATTCCCTGTTTCTTGCCTGCCTCCCATTGGCAGGGTGAAAAAGCCAGGTATCACTTTCTTAATCTCCTCTGCAGTTAGTTCTGGTAGGTGAGGTATGGGGAGAATCTAAAGTAGAGGGAATGCTCCAGAAAAGGTTTTTCTACCCCCCAGTAAATGGAGAGAGCCTCACTCACAGTGCTCCCATCCCCCTGTGAACAAGAGGGAACCTCACTCACAGTGCTCCCATCCCCTGGTGAACAGGAGGGAGACTACTCACAGTGCTCCCATCCCCCGGTGAATAGGAGTGAGCCTCACTTAGCCCCACCGCTTCCTGCCTGTGGACAGAGTTGTATGAAC
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Task1_train_1498
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A variant found in Chromosome 1 affects GJA8 (gap junction protein alpha 8). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; Cataract 1 multiple types
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Task1_train_1499
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A variant was discovered in gene GJA8 (gap junction protein alpha 8), Chromosome 1. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
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Pathogenic; Cataract 1 multiple types
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CACAAGAAGCGAACAGCTATTGTGCCTGCCCTGACAGCACAGGCTGGACATTGCAGATGCCTGCAATTAGTATCCTGCCACCAGGTTCTGTCTGGCCAGACTCCAAATCACAGGTTGGAAATAGGCTTTTGTGTTTAACAAATATCACTGTGATTAAAAAACAATAGGCATATCCCTTTAGCCCCATAGGTTCCTAGGCCTATAGCATGGGGCATGGCTAGAAGAAGCCCAGAGCAAGATCCTCTAACATGGGCTCTTGCCCTGGTCTGAGGGCAGTGATGAGTAAACTTATAACTCTAGAGATGTTCAAGCTGCAGGAACAACTGTTCTCCATTGAGGTGGAAGTTTTGCTCATCATTCTTTATAGGTTACAGGTTTGCACTGGATGAATGACCCAGTTGCAGCCAGCCCCTTGTCAGCTCAATGCCATTTCCATTAGCCATTGCTGTGCTACAGGCATTATATACTATCATGTTTAACGATATTTTTTCTATAGACCAAATTTTTGACTCTATTAAAACAGCCATATGTTACAGACCCTGAAACATTTTCATTCCATAGGACACTAAAAGTGTCCTAGAAGACCTTCCTCATCCTGTGACATGATTCCTTCCCAAAGCATTCTCTCTGTTCTTTGGATTTAAAAGAGTAATAATAAAAATATACGGCCCTCAATGTGTAAAGCTATTAATAAGGGTTTCCAGATTTCAACCTAGAGAAGAGGAAACATAAATTAAGAGCACAGAAGTCAAAGAATTGTGTAGCTTTGATTGCAGGCAGTTTATCTCAATGGTGTAGTGGGAAGAACCCAGCCTTTGTGATCAAGCAAACAGAACTGCTGCTATTTAGCTGTCTAATCTTGGACAATATATTTAGCCTCTCTGAGCCTCAGATTTCTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTCCTTTGAGACAGGGTCTTTCTCTGTTGCCCAGGATGGAGTATAGTGGCACATATCAGGGTTCACTGCAACCTCGACCTCCCAGGCTCAAGCAATCTTCCTGGCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAACACAGGCATGCACCACCGAGCCCAGCTAGTTTTTAAAGTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTCTATCTCCTGGGCTCAAGTGATTCTCTTGCCCTGGCCTCCCAAAGTTCTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTCAGTTTTCTTATTTGTTGGAATCAACTTAGTTAACAAATACTTATCAAGTTCTCACTGTGTGCTGGGCTGTATGTCAGGCATTGAGTATATAGCTGTAAATAAGACAGGCATGGCTCCTACCGTCATGGAAATTACAGTCTAGCAGGATCAAGTTAAATGAAATAATATAATGTCAAAGTTCTTTCACAAAGTTGGTATTCAATAAATGCTAATCCCCTTCCACTTCCCTTCAAATATACGATCATTATATATTCTGACACTCAAACATAAGATGGCCACAGACAATTTCATACATACAAGAATTGTGTTGGGAGCCCAGACACCCATAGTATAAGGGAACTCTTCAGCATTATGTCTCACGAAACTTAGATCAGTGTGTGGTCTTGATTTAAATCCATGTAACCAAGGGTTTCTATTTATGGTCAACAATGAATCCTTATTTTTGGTGGACTTTAAGGAATTATACAAATATTGCCTCATTGATGCTTTCAGACCATTTGTGAAGTGAATGAGAATAGGTATTATTATTATTAAACCCATTTTACAGATGAGGAAGCGGATGGAAGCACATTCTTCGGGGCCTTCTTTGTTCTCTAGTCCTAGTCTGCACAAAGGAAGCACTGGATAGACGCTGTGTGCACATTGACCGTTCTGGCAACTTGGAAAGGAGAGGTACCCCGCGTTAGCAAAAACAGATATTGACTCAGGGTTGCATTGCGGCCGCTCAGCTCTTGCCTTCTCCCTCATTTCTTCAGGTGGGTGAGAAATGGGCGACTGGAGTTTCCTGGGGAACATCTTGGAGGAGGTGAATGAGCACTCCACCGTCATCGGCAGAGTCTGGCTCACCGTGCTTTTCATCTTCCGGATCCTCATCCTTGGCACGGCCGCAGAGTTCGTGTGGGGGGATGAGCAATCCGACTTCGTGTGCAACACCCAGCAGCCTGGCTGCGAGAACGTCTGCTACGACGAGGCCTTTCCCATCTCCCACATTCGCCTCTGGGTGCTGCAGATCATCTTCGTCTCCACCCCGTCCCTGATGTACGTGGGGCACGCGGTGCACTACGTCCGCATGGAGGAGAAGCGCAAAAGCCGCGAGGCGGAGGAGCTGGGCCAGCAGGCGGGGACTAACGGCGGCCCGGACCAGGGCAGCGTCAAGAAGAGCAGCGGCAGCAAAGGCACTAAGAAGTTCCGGCTGGAGGGGACCCTGCTGAGGACCTACATCTGCCACATCATCTTCAAGACCCTCTTTGAAGTGGGCTTCATCGTGGGCCACTACTTCCTGTACGGGTTCCGGATCCTGCCTCTGTACCGCTGCAGCCGGTGGCCCTGCCCCAATGTGGTGGACTGCTTCGTGTCCCGGCCCACGGAGAAAACCATCTTCATCCTGTTCATGTTGTCTGTGGCCTCTGTGTCCCTATTCCTCAACGTGATGGAGTTGGGCCACCTGGGCCTGAAGGGGATCCGGTCTGCCTTGAAGAGGCCTGTAGAGCAGCCCCTGGGGGAGATTCCTGAGAAATCCCTCCACTCCATTGCTGTCTCCTCCATCCAGAAAGCCAAGGGCTATCAGCTCCTAGAAGAAGAGAAAATCGTTTCCCACTATTTCCCCTTGACCGAGGTTGGGATGGTGGAGACCAGCCCACTGCCTGCCAAGCCTTTCAATCAGTTCGAGGAGAAGATCAGCACAGGACCCCTGGGGGACTTGTCCCGGGGCTACCAAGAGACACTGCCTTCCTACGCTCAGGTGGGGGCACAAGAAGTGGAGGGCGAGGGGCCGCCTGCAGAGGAGGGAGCCGAACCCGAGGTGGGAGAGAAGAAGGAGGAAGCAGAGAGGCTGACCACGGAGGAGCAGGAGAAGGTGGCCGTGCCAGAGGGGGAGAAAGTAGAGACCCCCGGAGTGGATAAGGAGGGTGAAAAAGAAGAGCCGCAGTCGGAGAAGGTGTCAAAGCAAGGGCTGCCAGCTGAGAAGACACCTTCACTCTGTCCAGAGCTGACAACAGATGATGCCAGACCCCTGAGCAGGCTAAGCAAAGCCAGCAGCCGAGCCAGGTCAGACGATCTAACCGTATGAAGTGACGCCAAAGAAAAAAAAAAAAACGCCCAAGCTTACGTAGGGCAAGATGAAAGGAACAGGTGCCAACATGATCTGAATCTTCTGTCTCCTGTCCTCCCACCAGCCTCTGGTTGGACAGGCACTGCAGCAGGGCAGTGCACTCCAGGCAACTCTAGGAAACAGTCTTTCCCACATCCAGCATAAGGGCTACCAAGATAAACCCATCGACCCACTAAAGTTCCCCAGTCTCATAGGACTACCCCGCTCCTCCAACCCCAGCAGCTATGGGTGACTCTTCTTTCATCCCCATTTCTCCATAGAAACCCTTAAATCGGAATTGGGGTTGCCTCATAGCCTTTTACCCATCTTGTCTCAAGCTCACTAAGCCAGAATCTATCATCCCAGCATTTCTGAAGCAGATACCATGTGACCATATTTCAGGGATCCAGACTCAAAAGCCTACAGAATACAGACAGGTGACATAAGTTGCAAGACAGGCCTGTTCTAATGCAAGGGAGAGAATGGGGCTGTGAAAGTTGGAAAGCAGGGGCAGCTGCTGCTCACTTCCAGACAATGAGTACCATGAAGTGTTACCTGGTCTTTCTGATTTTTCAAGGGAAGCCAGAAATCCAACCTTTTTTTTAGACAGGCTCTCTCTTGCCCAGGCTGGGGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCTCACCTTAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCGCACACCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTACAGATGGCGTTTCACCATGTTGCCTAGGCTGA
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