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The gene COA7, LOC129388524 (cytochrome c oxidase assembly factor 7| MPRA-validated peak230 silencer) on Chromosome 1 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive, with axonal neuropathy 3
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Task1_train_901
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This sequence change occurs on Chromosome 1, altering COA7, LOC129388524 (cytochrome c oxidase assembly factor 7| MPRA-validated peak230 silencer). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive, with axonal neuropathy 3
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AGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGCATCACCACGCCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGAAAGGGGTTTCGTCATGTTGGCCAGGCTGATCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCTGACCTAGTTTAAGCACACCAAAAGCTACTTTACATTTTTAAAAAGTGAATTTGATGTCTTTTGAAATCTCCTCTGTGCACTTGGGGAAGTCCCTGTCCTCTATCAACTTGAGAGGCTGGCTGCTGTGCTCACAAGCCTTCATTTACACAGCAAGCCTTCCTTTCAGGACGGCTGCAAAACGGAAGCCTAAAACAGTAGATGGTGACAGAATGGTATTGTTACCAGCAGGGAAATGGCAAGCTCGCCCCCTGGTGACAAGCTGGGGAGACAACAGAAAAAGCAAATTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATCGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTAGCCAGGATGGTCATGATCTCCTGATCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCACCCAAAGTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCACAAATGTTCTTAAAAGGCACAACCACCACAAAGAACATACTCTCTACGGTACCTGGAATCTGGAAAGAACACTAATTAACACAAACCGTAGGTCACTCAAAATTGTTCATTCACAGGGACAGTTAAAAAGGCTCAGTTCCAGGGGACAAATGTGTCACAAAGTCCTTGCTTACAAACTCCTAGCTGAAGCTGCCTTGGGAAGAATCTGCTCCCTCAGCATGATGGGCAGTGCCAGGCGACTACACTGGAGGTGCTAATTTTTAACTGCCAATGTCTCTTCTAGACGATGGCAGGCTGATGTTTCATCTTCTTCAGCAACCCTGAAGCATAACAGCCTTTAAGCTGTATGTTGCACGTCCCTCTTGATCTCTGTGAATTTACTGAAAGATGTGACTCTAAAGGCAAAACGAAGCCCACACCAATGATTATGTAAGTCAGAGGGTGGTAGTTGTGACTATTTAACTGTTCTTAGTTCTTTAAGACCTCAATTACGTAAACCAAGATACGTTCTGATTTTCAAGCCATCCTAACCAAAATAATAATGATGAAAATGATGACAGCTGATTCCTTTAGGCCCCGGGGCTGCTAATTTTTCAAACTTCCTGCTATCCTCCCTTCCCTACTACCAATCTCCAGGGCTCTCTAGTTTGCTCCTATTTTTCACAGAGTTGCCAGAGTTTGAAAACTAAGACCCCCATAAACATGGCTATCTTCACAGAACATCCAGATGAAGGAATATTGACTGTAATAAACATTGTACAGAACACCCAGATAAAGGAATATTGACTGAAATAAACATTGTAGGCTATACTCCAGTAGCTGGGGCAATGGATCCATGTAAATGGAGCTACAAATTCAAGTCCCAAGTTTTTTTGCTCCAGCAGGTTGACCTTCAAGGGCTGCATCAGTCTTCAGAAACAGGAGCTGCCAGCCTCAAGCAGTTTGTTGCCTGGGAGGGAGGGTGGACCACATTACCCAAATGTTAAGGGTTGGACACCTTTCTGCTGTTCTTTGTGTAGCTGCTGGGCTCGATTTTTTAGCACCTCGGCCTTGGCCTCATCCTTATCAACACCATCCCCCAGCTTGTACATGCGACTGGCATTGGCACAGGCCCAGATATGACCCAGGTCACAGGCTTTCATGGAGTATTTACATGCCAGGTCCATGTCCTTGGGAAAGCCTGGGGCACCCTGCAGGAACATGGCACTGAGGTTGAAGCAACTGGAAGTATAGCCACCATCACAGGCCCTTGTGTAGTAGTCCCTGGCCTTTCCCAAGTCAGGCTGGCCATCCTCATTAACCTGTCCATCATGTGCCAGGAGGCCAACGTTGTGACATGCTGCTATTGACTTCTTTCCAGGCTTCTCACACGCCATCAAAAAGCACCTGGCGGCAGCTTTCAGGTCCTGGGTCAGACCACCTGAGAGGAAGGAAAGTAGGAAAAAATAAACCCAAGCCAGGGCACAACCTAAATGTCTCAGGCCAAAGTCAGTGAATTTTTTTTTTTTTTTTGGAGAAAGGGTCTTGCTTTGTTAACCAGGCTGGAGTGCACTGGCATGATCACGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCGGCTAAAGCAATCTTCCCATCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACACACCAACCACTATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTTGTAGAGAAAGGATCTCACTATGTTGCCAAGGCTAGTCTTAAACTCTGGGACTCAAGCGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCCAACAACAATTCCTGAATAAAGTTTAAGGCTGAGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGTGCAGGATGATTGCTTGAGGCCAGGAATTCGAGATCAACCTGGGTGACAGAGCAAGACTTTACCTCAAAAAGAAAAAAAAATGTCCATACTATGAGCTCAGGCAGCATGAAAGGTAGCCTGGCATAGTGCACAGACCTCCTAGCTTTCTCAGCCGTAGAATCTTTTATTCAGATGATACCTTATGAGGAAACTCAAACAGGTAAAGGAGGTGAAAATTGGGAATGATAATAATATCTACCTCATGGGGTTACAGTGAGAACATGGCATATGACAAGCACTTAATTGTTTATTAATTTAAACATACAGTGGGCCCTCCATATCCATGGGTTCAACCAACCACACATCAAAAATATTAGGGAAAAAATAACAATACAATTAAAAAATACAAAATATATAAAATAGAACAATTATTTACTCAGTATTTACATTGTATTAGATAGTCTAAGTCAAGATTGTCCAACCCATGGGCCTGGGATGGCTTTGAAAGCGGCTTAACACAAATTCATAAACTTTCTTAAAACATTATGAAATTATTATTATTATTATTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTGTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCTACCTCTGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCACGCCAGGCTAATTTTTGTGTTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCACCACGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTTCACCTGGCCTATGAGATTTTTTTTGTGATTTTTTTTTTAAGCTCATCAGCTATCATTACTGTATTTTATATATGGCCCAAGACAACTCTTCTTCCAATGTGGTCCAGGAAAGCAAAAAGATTGAATACCCCTGTTCTAAGTAATTGATTTAAAATACACAGGAGGCCAGGCGTGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCTGAGATCAGGAGGCTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCATTTCTACAAAAATACAAAAATCAGGCTGGGCGCGGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAAATGAGCTGGGCATGGTGGCAGGGGCCTGTAATGCCAGCCACTCAGGAAGCTGAGGCAGAAGAATGGCATGAACCCCAGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCAGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTAGATGACAGAGCATAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAA
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Task1_train_902
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This alteration occurs within gene COA7 (cytochrome c oxidase assembly factor 7) located on Chromosome 1. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive, with axonal neuropathy 3
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CTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTTTAATCATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGTCCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCCAACCCCAGGTTCTTTTCAAGCCATCATACTGCAGAGCAACTCTGTGTCATGACTATGTTATGATATGTATATGGTTGTGTTATGGTCTATGTTACGGATTAGCCTCAAGGAATAGCTATGTCATTTCTGCAAACTAAACTGACTAAACTGCAAGCTATTAGAAGGTAGGGCCAGTGCCACTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTAGTAGTGACAGGGTTTCATCATATTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCACCTCACCTCAGCCTCCCAAAGAGCTAGGATTACAGGCTTGTGCCACCACACCAGTCCTTTATTTGAAAGAAAAAAAAAAAAAAGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGATGGATTGCTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCCTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCCAGGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGAGCCATTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCAGTCTCAAAAAAACAAAAAAATTAAAAAGTAGGCAGTGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCAAAGGCGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTGCGACCAGCCTGGACAACGTAGTGACATACTATCTCAAAAAAGAAAGAAAATACAAAAAATAAAAATAAAGCAAGAAGAAGAAAACCACCCAAAGGTATTAGCTGCTCTGGGTGGACCCCTCTGGTCACCACCATCCACCTATACTCTTAAGTCAATTCAATGTTCACACAACACACAGGACACATTTGTGATTCAGGGCGTCTTCGCCAGCTGTTACCTATGGTAAGAACTGCATGGTTCACTCCCTTACCTTCTTCAAGGCTTTATTCAATTGCCACTTTCTCAGTGATCTTCCCTGATCACTCAATTTAAAACTGCCCTCCTGCCCTCCTGACACCCTTCACCCAGTCTTTTTTCCACGGCACTTACTACTTTCTTTTTATTTATTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCACTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAATACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTTTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACGGCTCCCGGCCGGTACTTACTACTTTCGAACACGATTTCATGAATTACCTGAGGCTTATTGCCCGACTCCCCGCACTAGCTTGGAAGCTCCACGAGGGCAGGGAGTTTCATCTGTTCACCGATGGATCCCCAGTCCCTAACCCAAAAGCCCCAGCACGTCTCTTCCTACCCGCCCCGGCCTCCTGGCTCGGTCTTCCCGGGACACATCGCCCTTCCCAACACACGCGGTCACCGCGATCCACAGACCCCGTCCCCCGCCCGCCACGTGATTCCTTCTCCAGCCTCTCAGAGGTCGCAGACCAGACCTCTCCGGGCACGTCCCTCCCCGACGCGTCGCCGGGCTGCGCTGGAGCCGCTCACCGTCCGGGTCCTTCTCGTGGTAGCAGTGGTAGTTGCACTCCACCTCCATGTTCTCCAAAAAGGACTTGACCTGCTCCTCATCCTGGAAGTCCACCATGCCGGCCATGGTTCGCGCCGGCCCAAAGACGGTCACGTGAGCCGGCGGAGGGGGCGGGGCGGGGCGTGGGGCTGACGCCGACGCCAACCGCGGCGCTCTCCCGGGATCCCGGGGCGAGCCAAGCGAGCCTGTGCTTCCCAGCAGCCATCGCGCCGTTAAGGGCGCTGGCAGCCACGCTTCCAGGGCTACCGCCTTCCTGAAACTGGGGGCTGTCTCTCTGCAGCACCTTACCTATGCTCGCTTTGTAGCCTTAGTGATTTTCCACCTGCAGTCATTTATCTATGTATAATCCCTAAGCGCCTACTGTGTGCCTCACCAGTGCATTGTTCTAGGGATATGACAGCTAGGAATATGGTCCCTGCCTTCAAAGAACTTGGAGTTCAATAGGAAGACATTCGCTTATCCATTCAGCAAGCATTTAGAGGAGCTTCTATATGTGCCAGGTGTAGCTGGACAAAGTGCAGTGAGCAGTCTGATTCATCTGTCTTCTTCCCAGACCTGTCTTGGCCACCAACATGAATTACCTAAGCAATGAATGGCTATGGGAGATGTTGACTGGCACACAGTAGCAGTGAAGGGTGTAGCAACGTCACTGTTATAACACCTAGTACTCAAACAGTGCTGAACTTTGTTCCAGGCTCTAAATGCTTTATATGAATTAACTCATTTAATTCTCATTATATATCATGTCACTGTAAAAACACTCACAGTGACACTGTGGGTAGGTATTATTATTATCCCCATTCTACAGATAAGAAAACTAAAGTACAGAGAAATTAAGTAGTTTGTCCAAGGTCACACAGTAAGTGAGGGAGTTGGTATGCAATAATAATTTTTTTTAAAAAAATAAAAGAATGAATGAGGCCGGGCGCGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACCTGGTGAAACTCTGTCTCTACTAACAATACAAAATTAGCAGGGGTCTCTACTAAAAATACAAAATTACAGGGAGCACACCTGTAATCCTAGCTCTTTGGGAGGCTCAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAAATTGTGCCATTGCATTCCAGCCTGGGCGACAAGAGCGAAAAAGAATGAATGAGGTAGAAAAGGAACATGTCAAGGAGATGGGGAGGAGGAGAGGAAATTTACCTACATTTTGCTTTGTTTTCCTGCTCCTGTTCCTGCTAAGAATCATCAGTTCCATAAAGCTTAGATGGAAAGTTCTCCTAAGACAGCCACTTCCTATTCGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGTTCTTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAATAGCGCGGTCTCAGCTTACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGCTTACAGGTGCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCTGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCTGACTTCCCATTCATCTTTGAATTCCATCCAGCCCTACTTTTGAATTCTCAATGGAGCTAAATCCATGGCTTCCCATCGCCTATAACAATGCTTTCCAAATGGCTCCATTATTAAGCTATCCCCAATGGCAGCAAAGAATGGACTATTTCCAACCACTTATTTATTGGAAGGCAGCCAATAATGTCTGAAATCCCAGTTTTATTTTTTAAATTCATAGGATTTTACATTCATTTCCCCATAATACATCTTTCATAGGATAACAGAAGATTGCCTTTTCTCCCCCAAGCCTTTGAGTAAAATTGACATTCCAGGCAATATACCACATTTACCTGTGGTTTCTTATACCCTGATCACCTTAGGGGACTCCTCAGTACACATGGCCCAGGATGGGAATCCTTGAACTTTGGTTTGAGGTC
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CTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTTTAATCATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGTCCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCCAACCCCAGGTTCTTTTCAAGCCATCATACTGCAGAGCAACTCTGTGTCATGACTATGTTATGATATGTATATGGTTGTGTTATGGTCTATGTTACGGATTAGCCTCAAGGAATAGCTATGTCATTTCTGCAAACTAAACTGACTAAACTGCAAGCTATTAGAAGGTAGGGCCAGTGCCACTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTAGTAGTGACAGGGTTTCATCATATTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCACCTCACCTCAGCCTCCCAAAGAGCTAGGATTACAGGCTTGTGCCACCACACCAGTCCTTTATTTGAAAGAAAAAAAAAAAAAAGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGATGGATTGCTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCCTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCCAGGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGAGCCATTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCAGTCTCAAAAAAACAAAAAAATTAAAAAGTAGGCAGTGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCAAAGGCGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTGCGACCAGCCTGGACAACGTAGTGACATACTATCTCAAAAAAGAAAGAAAATACAAAAAATAAAAATAAAGCAAGAAGAAGAAAACCACCCAAAGGTATTAGCTGCTCTGGGTGGACCCCTCTGGTCACCACCATCCACCTATACTCTTAAGTCAATTCAATGTTCACACAACACACAGGACACATTTGTGATTCAGGGCGTCTTCGCCAGCTGTTACCTATGGTAAGAACTGCATGGTTCACTCCCTTACCTTCTTCAAGGCTTTATTCAATTGCCACTTTCTCAGTGATCTTCCCTGATCACTCAATTTAAAACTGCCCTCCTGCCCTCCTGACACCCTTCACCCAGTCTTTTTTCCACGGCACTTACTACTTTCTTTTTATTTATTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCACTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAATACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTTTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACGGCTCCCGGCCGGTACTTACTACTTTCGAACACGATTTCATGAATTACCTGAGGCTTATTGCCCGACTCCCCGCACTAGCTTGGAAGCTCCACGAGGGCAGGGAGTTTCATCTGTTCACCGATGGATCCCCAGTCCCTAACCCAAAAGCCCCAGCACGTCTCTTCCTACCCGCCCCGGCCTCCTGGCTCGGTCTTCCCGGGACACATCGCCCTTCCCAACACACGCGGTCACCGCGATCCACAGACCCCGTCCCCCGCCCGCCACGTGATTCCTTCTCCAGCCTCTCAGAGGTCGCAGACCAGACCTCTCCGGGCACGTCCCTCCCCGACGCGTCGCCGGGCTGCGCTGGAGCCGCTCACCGTCCGGGTCCTTCTCGTGGTAGCAGTGGTAGTTGCACTCCACCTCCATGTTCTCCAAAAAGGACTTGACCTGCTCCTCATCCTGGAAGCCCACCATGCCGGCCATGGTTCGCGCCGGCCCAAAGACGGTCACGTGAGCCGGCGGAGGGGGCGGGGCGGGGCGTGGGGCTGACGCCGACGCCAACCGCGGCGCTCTCCCGGGATCCCGGGGCGAGCCAAGCGAGCCTGTGCTTCCCAGCAGCCATCGCGCCGTTAAGGGCGCTGGCAGCCACGCTTCCAGGGCTACCGCCTTCCTGAAACTGGGGGCTGTCTCTCTGCAGCACCTTACCTATGCTCGCTTTGTAGCCTTAGTGATTTTCCACCTGCAGTCATTTATCTATGTATAATCCCTAAGCGCCTACTGTGTGCCTCACCAGTGCATTGTTCTAGGGATATGACAGCTAGGAATATGGTCCCTGCCTTCAAAGAACTTGGAGTTCAATAGGAAGACATTCGCTTATCCATTCAGCAAGCATTTAGAGGAGCTTCTATATGTGCCAGGTGTAGCTGGACAAAGTGCAGTGAGCAGTCTGATTCATCTGTCTTCTTCCCAGACCTGTCTTGGCCACCAACATGAATTACCTAAGCAATGAATGGCTATGGGAGATGTTGACTGGCACACAGTAGCAGTGAAGGGTGTAGCAACGTCACTGTTATAACACCTAGTACTCAAACAGTGCTGAACTTTGTTCCAGGCTCTAAATGCTTTATATGAATTAACTCATTTAATTCTCATTATATATCATGTCACTGTAAAAACACTCACAGTGACACTGTGGGTAGGTATTATTATTATCCCCATTCTACAGATAAGAAAACTAAAGTACAGAGAAATTAAGTAGTTTGTCCAAGGTCACACAGTAAGTGAGGGAGTTGGTATGCAATAATAATTTTTTTTAAAAAAATAAAAGAATGAATGAGGCCGGGCGCGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACCTGGTGAAACTCTGTCTCTACTAACAATACAAAATTAGCAGGGGTCTCTACTAAAAATACAAAATTACAGGGAGCACACCTGTAATCCTAGCTCTTTGGGAGGCTCAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAAATTGTGCCATTGCATTCCAGCCTGGGCGACAAGAGCGAAAAAGAATGAATGAGGTAGAAAAGGAACATGTCAAGGAGATGGGGAGGAGGAGAGGAAATTTACCTACATTTTGCTTTGTTTTCCTGCTCCTGTTCCTGCTAAGAATCATCAGTTCCATAAAGCTTAGATGGAAAGTTCTCCTAAGACAGCCACTTCCTATTCGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGTTCTTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAATAGCGCGGTCTCAGCTTACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGCTTACAGGTGCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCTGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCTGACTTCCCATTCATCTTTGAATTCCATCCAGCCCTACTTTTGAATTCTCAATGGAGCTAAATCCATGGCTTCCCATCGCCTATAACAATGCTTTCCAAATGGCTCCATTATTAAGCTATCCCCAATGGCAGCAAAGAATGGACTATTTCCAACCACTTATTTATTGGAAGGCAGCCAATAATGTCTGAAATCCCAGTTTTATTTTTTAAATTCATAGGATTTTACATTCATTTCCCCATAATACATCTTTCATAGGATAACAGAAGATTGCCTTTTCTCCCCCAAGCCTTTGAGTAAAATTGACATTCCAGGCAATATACCACATTTACCTGTGGTTTCTTATACCCTGATCACCTTAGGGGACTCCTCAGTACACATGGCCCAGGATGGGAATCCTTGAACTTTGGTTTGAGGTC
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Task1_train_903
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The variant affects gene CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902), which is on Chromosome 1. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, neonatal form
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCCCAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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Task1_train_904
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Given this context: Chromosome 1, gene CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, myopathic form
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCCCAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCACAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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Task1_train_905
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Given this variant in gene CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902) on Chromosome 1, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, severe infantile form
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCCCAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCACAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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Task1_train_906
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Given a variant located on Chromosome 1 and affecting CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 4
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCCCAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCACAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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Task1_train_907
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Given this variant in gene CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902) on Chromosome 1, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, myopathic form
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCCCAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCACAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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Task1_train_908
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A variant was discovered in gene CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902), Chromosome 1. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, severe infantile form
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCCCAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCACAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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Task1_train_909
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Here is a variant affecting CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 4
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCCCAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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ATGGGAGCTGGAGAAGTAGGTAGGGGTCAGAATTCAGAAGGCCTTGGACACCAGCCTAAAGGCTTAGAGTTGCTCCCATTGGCCATGCACTCACCAAAGGTGTTCACGTCCCTCTTTTGGCTGTTAGATTGGATGGGCTCAATCTTTTGGCCCTCTGTCTCTAGAATAGAGCCGCTGCTTTTCTACTGGGCCCACTATTTCTTCCTGGTCCTCTGATCCCCTTAGCACTACACAGATCTCGATATTTGCCTCGGGTATCAAGGCTCTGAAAATGATCAGGATTTAGAGGAGATGGCTCATTTTCAGAAAGAGTTTTATATTCTCCCTCTGGCCTTATACACTACAGGCAAATGGCACCGATGTTTTGGAGTTGGGCCAGTTGGGCCTTTTCTCCCCTCAAGAGAGGAGGATTCGATATTCAGTGTTTCTGAATTTCATGCTTAGTTCTTAAGCCATTTCCCATTTGCCCTAAGAAATAAGAGCTGGCAGCAAGCTGCGCTGTTTTTTTCTAAACGGGAAATGGGTTAAGCATTTGTGATCACCACTGAATGAGTGCCAGAGCTGGTTAGTGATCTTCCTGTTCAATCCGAGGTCACCTAACTAGATAACAAAGAGCTGAAACTAAAAGTCCGGTCTCCTGACTCCCAATCCAGTACTCTTTCTGGTGTGCTCCAGCTTCTGGCTCTGCTTAGCCAATTATGGAACAGACAGAATGTACTTGGCTGCCCCAAACGGCTAAAGGGCAGTTCTGTTCCCAAAATGGAATTCTGTTGTGCCTCAAGCTAGGCAGCATAATTGTGTGTCTTTTGGTAACTCCCTGTCTTCTTCTGTAAAATGGGAGTAGAGCCTACTTAATCCTGCAGCTACTTCTAAGATCAGGGATTGGGGCGTGGTGGGCTGTTCTGCAGCTGTTTTGTGATGGATGAGGGATGATAGATCTATGTTCAAGTAGCGGAATCTTAGAGTCAGGAGTTGGAAGGAATCTTGGAGGTGGTCTGTGGTGACAGGAAGCCTCTTCCAATAGACTGAACACGGAAGACTTCCTAGAGCCGGAGGACAAGGGTTTCTTTCCTCTTAGCAGTGAGCTTCTTGTTTTTGGAAATGCTCAAGCCAAGAATGGATGTTCAGGCAGAGGGGATTCCGCTCGGAAGGGGCTTTCTGCACTGAAGTGGTGGCCAGCGGGAAACTCCAGGTTTCCAACTCCTGCACAAATCCTTTCTAATATCCATCCACTCAGGTGAGCTGGCAGGGCAGTAGCTGTGCAGGGTTCAGGGTCATTATATGTCAATGACCTTCAGCACGGATTACTAACAACAGTAACATCCGTTACCGTTTACTGCTTTCCTATTAAGCACCATGCACTGTGCATAACATGTTATCTTTATCTCATATCTAGAATTTTGGGAGGTACTTTGAATCATTACGATCTATCTACTTCTTAGGTGAGGAAATAGAGGTTTAAAATTTAGTCCACAGTCTCGCAAGGATGGAGCCTGGATCAAATTTTGGGTTATCAGATTCCAATCACGTTTCTTAGCTTTTCTTTTTTTTTTCCAACTCCAGTTTCTGTCTTGCTCCAAAAAAGGGGAAGGAGCGGCTGCGGCGCTCGGTTTCCCGCCTCCTAGGGAAGGGAAGGGAGACGAGCAGCGCGGAGGCTGGGGCCCCCTTCCGGGCGGGGCCTACTAGTGGGCGGGGCCTGTCAGTGAGCGGCCCCTGCCCGGAAGGAGCCAGTCCGGGGCGGAGCCGATGGCCTTACAGGGGCCGGAAGTGGCCTGCGGGCGGAGAAGTGCCTCAGGAGTCCTGACGCAGTGTCTTGGGCGCTAACGGCGGCGGCGGCCTTGTGTTTAGACTCCAGAACTCCCCACTTGCCGCGTTCTCGCCGCCGCAGGCTCCCGGGACGATGGTGCCCCGCCTGCTGCTGCGCGCCTGGCCCCGGGGCCCCGCGGTTGGTCCGGGAGCCCCCAGTCGGCCCCTCAGCGCCGGCTCCGGGCCCGGCCAGTACCTGCAGCGCAGCATCGTGCCCACCATGCACTACCAGGACAGCCTGCACAGGTGAGCCTGGCCTCCGGGTCCCCGCCGCCCGCCGCCGTCCCAGGATCGGCCCCAACCTGACTGCAGTCACTCATGACTCCTCTAGTGAACCCGTTTCCGCCCCCAAGCCCCTACCATGGAGGCTGCCACAGCCCCTAATCTGGAAGTCTTGGGACTTTTCACAATCTCCTAGCACAGGAACCTCAGAACCCTCAAATTCTCTTCCAGAACCCCTCGATGCTATCTCAGATTCTCCATCTTGAACGCTTCTCAGATTCCCTCTCCTTTAACCTAACTTCCAGCCAGCTATCCTGAGTCCTCTTCTCCCTGAAAAATGCCAGACCTGCATATTTCCAGCGCCGCTGTAATCCCTCGACTATGGTGTCTCCTGAAGTACTTTAATGACTGCCTCACATTCCTACCCGGAATATGGGTAGGCTGATTCCTAATACATCATGGTTACCATTCCTTAACTTCTCCCAGCACCGCCTTCACCCCTGTCACTCAGGACCCTCAGCCCCACCTCCCATTTCTCCAGTACTCTGTTCTTTCACCCCCCATGAGCCCCCACAAGCACAGCCCTGAAGTGTTCACCCTTGTCCTCAACTGACCCTCCCCCATGTTTTTAAATCTTTAATCTCCTAAATCCAGTGTTCACCCGGAAACCTTTCACTCTCTCCAAGCCCTCCTCAACAGGTTCCTCCCCTCAAAATATCCTTCCTCACCCACAGTACCCCTTGTAAGTGCAGCTCACCCTCACAGAATTCTAGACACCACCCTCAGTACCCCATCCACACTCCATCATACTCAGATCCAGGGTCCACCCAAATTTCTCTTCTCCTCCTCACCACTGGCTACCCTGCCTTCGAAACACTTCACCCAGAATCGACTTCCCCTCTGAAAAGAGCCCTAGTAAATCCTCTTCCCCTTCCCTCCCCCAGTACTTTCTTAAATCCAGCTTCCAGTTCTTCCAGCCTTCGAACTCCGCTTTCGTCTGAGTTGCCAGATCTCCTTCTTCAATATTAGAAATTTTCTTCACCCTCTAAACCAAACCTAAACTAACTTCTAACTTACTGAGTGAGTAACTCAGTTCCTGGAGCCAAGTTCAAAATTTGTCTCAAAGACCCTTCTCACCTTATTTCTCACCAAACTGCCCTCAGGGATTCCCCACACTCCAAGAGCTAGAGGCCAGGCTTCTTCCCCATGTGTGGAACATTGTGTCACAGGCCTCACCCGAGCTGCTGGGTTGTTTTTCTCTGCATCTGGGACCACTTAACCCAACGTCATCACTACATACCCTCACCCTCTCAGGAGGATCGAGTGATTCTTGTGAAATTACATTTTGTGCAAACATCTAAGACATGAAAATGAGATTATCTACACGTGGCAGGAGGGAGGAAGAAAAAGGGGCTTTGTGCCTGTGGCATAAGCCTGGTACATGCTTCCACCCTGTCAACCTGTGTGTATGAGCTGAGCCAGTATATGGGTGAAAGGTGAGGACTGACAGAACCTGTCTTCACTTGCCAAGTTCAGAGTCAGATGGTCACTGACTTTCAGGCAGGCCTGGGCCCCACCCAGGTTTAAGATCAGAGGGATTTTCTGCACTTTAGAATTGGAAAGCTGGAAAGAATATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGC
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Task1_train_910
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The following genetic variant occurs in CPT2, LOC129930561 (carnitine palmitoyltransferase 2| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 902) on Chromosome 1. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyltransferase II deficiency
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Task1_train_911
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Here is a variant affecting CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyltransferase II deficiency
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ATTCAAGATTATTTATTCCAACCCCATCCATAGCACAGTCTGTAGGAATCTGGAGGTACCAATTCAAACTCCAGTTCAAATAGTACCACTAGTCACCTACGCATAACCTTAAGCAACCAACCTCCCCCAGACCTCCATTACCTTATTTGTAAATTGGGAGTTAGATGAGAGATGAGATTCCTTCTGTCGCTCAGATTCTAGACTGGTAAAATGTATAATCTTTCACACTCACTCATTGATGTCACACTTGGTGAAAAGCCCTGACTTTGAGGTCTGGTAGAATGTAGTTGCAGATTCTGGATCTGCAAGTCTTTAGCTATAATTTGGGGCAATTCTGTTCACTTCATTGAGCCACAGTTTTATTTTGGTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCGGGTTCAAAGGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAAGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAATCTCCTGACCTCAAGTGATCTGCTCTTGGCCTCCCATCTGGGACCACAGGCATGCACCATCATGCCTGGCTGATTTTTTGTATCTTTTATAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCCAGCTTCACTCCAGAAATTTTTAAGTAGGACTTTTTTAAATCAAATTGCCATTGTCTCTAATCTAGAATTTTGTTTAAAAGGAAGAAGGTAAACTTTCATGAATATTCCTACTGTAATAAAACTAAATCTTAAACATATGTAGGCAACTGGAATTATGAGGTAGCTGAGATAGTATTTGGAATTTTTCTGAGTAAGTCAGTGAATGTAAGGGGATCTGTGGTGTTAAAGTGTTGTAAATGGGTACTTAGTGCAGTCTAAGTCCATAATGGCAGTAAATAATTGATTTATTTTTGTCATATTATGGATAAACATGCATTACAAATAAACTGATGAACCACAGTATATCTTATATTAGGCTTTTAAACTGCTTTATGTATCATGTTTCAGTTTTCCTAAATGACTGATACATTTCAGTATTTTGCATATCAGTGTTAATTTTGAGTTGGTAGAGGCAGCCTAACAAACTCTGATTGTTTTGCTATTAGGGGATATTTCCTTCAATAAAACCAATGAATTGAAAGAGAAAATACACCTCACTTTACTGTCCATGTGTTTTCATTTCACAATAAGCCAGTAACTTCATCACCATAGCCATCTTTGGGAATCACTAGTAGACAGAATGATAAGTAGGCAAATTGCTGTTCCTGTTATTTAAGCACAGGGACTATTTGGTTCTTCCTAATGGCGTTCCTGGTATCTGGGCATGGCTCACTGGTCGATTCCTACCTTTTAGTGACTGTAGCCCCCATATATGGCTGGCCCTTGGACAGATCTGTGTTTCACTCTTATATAATTATTTGTTGTAAAATGCAGAAGAAAATTTAAAAAATAGAACCTTTTCATTTTATCCTAGGGGAGAAAAATGCAGTTGTTCAAACTAAGGGTAGAATTAAATCAGGGCCAATACAGTGTTAGCACAGGTGTTATCATTGTGACCAGAAAACAGGAATTCTTGGGGCAGCTTCTGCTTCCCCATTTTGAATCTATTATTGTTATTTAAAATAATTATATTTGTATTTTACTTAAAGATTTAGTTGTTATTTTACTTAAAAGTAGAGTTACCATTGATATACTTGGCATTAGTAAACCCATTGATTCTGATTTGTCAGTCGCTTCTGATTATTGGTTTTGGGGGAGGAAATTAATGATCTAGTAATCAGTTCATTAGCTTGTAAAGCTAATTAACCTCTTCCATATACTGTCAGCCTTACACTGACCCTGCTTTCTCCCCAGGCTGCCTATTCCCAAACTTGAAGACACCATTAGGAGATACCTCAGTGCACAGAAGCCTCTCTTGAATGATGGCCAGTTCAGGTAAACACTGAGAACCTTGGGTGAGCATAGTTGGGGTGGTTCAAGACAGGCTGGCAAGTAGTGGTGGACCAAGCTTCAGGGAATGTCTGTGACGTGGCTGGGTCTCCAGGAACCCAGAACCTAGTTGTACATCTGCAAGTTCAGGAAATAGATTTTCATTCATGAAGGACTGACCAAGCCCCGAGAGTTCCTCTAAACAGGCTCAACAGGAGATAGTTTATAAGCCAGAATGCCAAATGTGTACTTTCCCTTAGCAGGTGTACCTGGGAGGCTCGCTGGTCCTGGTCATTTATAGAGAGCATGTACCCTTGGAAGGGAGGTCCATTGAGGAGACCATACGGCAGACCAGAAGTCTGCATCGTGAGCATGTTTATTGAGTTGGATAGCATGCCTCCAAAATTTATGCCCTTTTTCATGAAATTTAGTATATGATCTTATTTGGAATTAGGGTTGTGGCAGATGTAATTAGTTAAGATGAGGTCCTACTGGAGTATTGTGGGTCCTTAATTAAATATGACTGGTGTCCTTGTAAGAAGACACAGAGACAGCGGTGTGAGGACACAGGCAGAGATTGTGTCCTCTGCCTGTGTCAACAAGCCAAGGCATGCCAGGGATTGCTGGCAACACCAGAATCTAAGAGAAAGCCATGCAACAGATTCTTCCCCAGTCTTCAGAGAAGATATAGTCCTACTGACACCTGGATTTTGTCCTTAAAGCTTCCAGAACTGTGAGAGAATAAATTTCTGTTGTTTTCAGCCACCCAGTTTGTGGTGTTTTGTTATAGCAGTCCTAGGAAGCAAATACAGCATGGAATTGGAAAATAATATCAAATATTGTCAAAAAGTGGATTGCATTAAGCTCTTATAGCCTAGTGTAGTACTCTTTTTCCATAATGGAAATTTTTCTGTACAGGTAACTGGCATTGTTGTTGGAATCACAGAACTCTTCACTGGACAGTGATGGAGAAGCAGATGAATTATCCATAATCTAGGCCTCTGTTTTCAAATATTTGTTATTAGTCATTTAAAGTTTCTCTTGATATGGTAATAGCTACCAGTTATTGAGTATTATGTTTTAGGATATTCTAAATCCTTAGCTTTATAAATATTTTTAATCTTGTAAAGTGGTATTATTATCCATTTTACACATCAAGAAACCGAGACTCAGATCAAGTAACTTATCCAAGATCACACAGTTTGAAAAGCAACAGAGCTAGGATTCAGACTTAACTTCTGTTGACTCCAGAGCTTGTGTCCTTTTCTCCATGCCAAACTGCCTCCTAGGATATGGATTATTTTGTGAGATGTTGATTGATTTTCCTAATCATTCATTTTAAGAAGGTAGTCTAGATTATCAATTTTAGATTGATTCCTGTTCTGGTTAGAGGTACTTTCTGATCTCATTCCAGGTTTTAGGGCTATGCTGTTGGGGACCCAAAACTCTATTATGAGTTCCTCGCCATGAACCTAAAAATCATGTATTCCCTACCATGGTTTGATTTTGTCTTTTCTTGAATGTTTTAGGAAAACAGAACAATTTTGCAAGAGTTTTGAAAATGGGATTGGAAAAGAACTGCATGAGCAGCTGGTTGCTCTGGACAAACAGAATAAACATACAAGCTACATTTCGGGTAGGTAGGCTGGGCTGTGGGTATGATTTCTCCCAGAGCCCTCCATAATGAAAAGTAAGGCATATTCTCTCCTGTTTTGGTCTCAGAGATATTTTTGGTGAGACCAGCAAATGAAGTAACGTCTCATCCTCCCTTCCTGAGGTAAATTAAGGCTGAGTGTGTTCCTCCTCTACTGAGGTGTTGACTTGAGCCCATGCTCAAGAATGATGGCCAGCCTTCTCTGTAGATGGGATTGAGGCAGAACCTAATCAATGGTCCTGTCTGAAAAGGATGCAGGATTAAGTCCTATGTCCTATATCATTCTGGGTCCTTCACTGTCAGACAGAACTGTCCTCTCCAGCCTCTTCTCTCACCACCCACCCTGACATACTT
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Task1_train_912
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, neonatal form
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Task1_train_913
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Here is a genetic alteration in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 4
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TTTGCTAAAGGGGGGTCAGAGGCATGAATTTATGTCTTCTTTCATCAAATATATCTTATCCACCAGTACTTTTCTCTCACCATTTTAGTGCATTGCGTTATGTTTTAATTATTTGCCTCCTTCACCAGAGTTTTTCAGAATCAAAGACCATGTCCTATTCCTCTCTAAATCCCCTGGACCAAGGCCTGGCACAGCACTGATTCTCAAGGGATGGAATGAGTGGATGGACCAACAAATGAGTAACAGAGAAATCTGCATCTATTAATCCTTTTCCCAGTGCTATACATATGAACATTATTTGCCTGAATGATAGTCCTTATTTATAGAGTTTATTCATGTTTACTAATCCCAGCAGGAACTTTCCCTGACATATTTTCTGATAAAATATTGCTTCTGGAATTTTTACAGGTAAAACATCTATAGGAACTCAGAGGGCTAGTCTGAGTGATCCATGCACTGATATTTATAATAGCTTTTTTAGTACTTTCTAAACAGGGAGTGTACAAATGTACACTGTACATAGAAGGACAATGAAGACGTTCCCCCCTTATCGGGGAGCAATCAAGTATGATTGTTGCCCCTGAAAGGAGATGAAGCAAGAGAAACCTAAAGAGATGGGGTGGGAATTAACTATTCTGTTCCAGCATGAATGCAAGTGGAGTGTTACCATATTTTATTCCTTTAAACCAAGAAAGGAAACAGAAGAGGAAGAAAAAGCAATTAATAAACATTAGGAAAATGCAAACCAAATCTGCAATGCTATACTACTTTACACCTACCAGAATATCTCCACGCCACAAGACATGTAACAAGTGCTGCTGAGGATGTGGAAAAATTGGAACCCTCACAGACAGCTCGTGGGAATGGTGCAGCCACTTTGGAAAACATCCTGGCAGTTCCTCAAAGGTTAAACAGAGACTTACCATGTGATAGTAGTTCCACTCCTAGCTATGTCCATACAAAAACATGTATAAGAATGTTCATAACAACATAATTCTTAATAGCTAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTAAGAGGCTGAGGTGAGAGGATTACTTGAGGCCAGGAGCTTGAAACCAGCCTGAGCAACATAATAAGACCCCATCTCTACCAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCTGGTGGTGTGCATCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGGTTCAAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATACCACTGCAATCCAGCCTGGATGATAGAAATCCTGTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAGGCAATGTAATTCATAATAAAGAGTGGAAACAGTTCAAATGTCCATTACCTGATGAGTGGATAAACAAAATATAGTATATCCATATAATGGAACATTGTTCAGCGCTAAGAAGAAATGAAGAACTTAAATGCTACAACATGGATGAACCTTAAAAACATTATTAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATCCAAAAATTATCTGGGCATGGTGGAGGACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTCAATCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCAGCACTGTTCTCCAGCCTGGGCGACAGGAGCGAGCCTCCGTCCCAAAAAAACAAAACAAAAACATTATTGTAAGTGATAGAAGCTAAATGCAAAACACCATATATTGTATGACCCCATTTGTATGTCTTGAATTATTGCAGAGCAAAAACATTCAGGGAATTCTTCTCTCTGGAGGTTGATGCCATTTCCTTTGTCTATGCTTGAATTTTTTTTCTTCTTCAAATTTTATTTTTAGGGACAGCATTAACATTTTATGTTATTTTTTTCTTTTTATTTTTTAGGACCCTGGTTTGATATGTACCTATCTGCTCGAGACTCCGTTGTTCTGAACTTTAATCCATTTATGGCTTTCAATCCTGACCCAAAATCTGAGTATAATGACCAGCTCACCCGGGCAACCAACATGACTGTTTCTGCCATCCGGTTTCTGAAGACACTCCGGGCTGGCCTTCTGGAGCCAGAAGTGTTCCACTTGAACCCTGCAAAAAGTGACACTATCACCTTCAAGAGACTCATACGCTTTGTGCCTTCCTCTCTGTCCTGGTATGGGGCCTACCTGGTCAATGCGTATCCCCTGGATATGTCCCAGTATTTTCGGCTTTTCAACTCAACTCGTTTACCCAAACCCAGTCGGGATGAACTCTTCACTGATGACAAGGCCAGACACCTCCTGGTCCTAAGGAAAGGAAATTTTTATATCTTTGATGTCCTGGATCAAGATGGGAACATTGTGAGCCCCTCGGAAATCCAGGCACATCTGAAGTACATTCTCTCAGACAGCAGCCCCGCCCCCGAGTTTCCCCTGGCATACCTGACCAGTGAGAACCGAGACATCTGGGCAGAGCTCAGGCAGAAGCTGATGAGTAGTGGCAATGAGGAGAGCCTGAGGAAAGTGGACTCGGCAGTGTTCTGTCTCTGCCTAGATGACTTCCCCATTAAGGACCTTGTCCACTTGTCCCACAATATGCTGCATGGGGATGGCACAAACCGCTGGTTTGATAAATCCTTTAACCTCATTATCGCCAAGGATGGCTCTACTGCCGTCCACTTTGAGCACTCTTGGGGTGATGGTGTGGCAGTGCTCAGATTTTTTAATGAAGTATTTAAAGACAGCACTCAGACCCCTGCCGTCACTCCACAGAGCCAGCCAGCTACCACTGACTCTACTGTCACGGTGCAGAAACTCAACTTCGAGCTGACTGATGCCTTAAAGACTGGCATCACAGCTGCTAAGGAAAAGTTTGATGCCACCATGAAAACCCTCACTATTGACTGCGTCCAGTTTCAGAGAGGAGGCAAAGAATTCCTGAAGAAGCAAAAGCTGAGCCCTGACGCAGTTGCCCAGCTGGCATTCCAGATGGCCTTCCTGCGGCAGTACGGGCAGACAGTGGCCACCTACGAGTCCTGTAGCACTGCCGCATTCAAGCACGGCCGCACTGAGACCATCCGCCCGGCCTCCGTCTATACAAAGAGGTGCTCTGAGGCCTTTGTCAGGGAGCCCTCCAGGCACAGTGCTGGTGAGCTTCAGCAGATGATGGTTGAGTGCTCCAAGTACCATGGCCAGCTGACCAAAGAAGCAGCAATGGGTGAGGCAGGGGTGGGGAGCATGCCCTTGGGTCTTGTCCTCAGTGCTTGGGTAAGCAAGCCTAAATCATTCTACTCCAAATCTGATTTCTACCCGTTCACTAGGTTTAATCCATCGCCAACTCCCCAAATTTTTCTTTTCTACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC
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Task1_train_914
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Located on Chromosome 1, this mutation impacts CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, severe infantile form
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Task1_train_915
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This sequence variant lies in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, myopathic form
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TTTGCTAAAGGGGGGTCAGAGGCATGAATTTATGTCTTCTTTCATCAAATATATCTTATCCACCAGTACTTTTCTCTCACCATTTTAGTGCATTGCGTTATGTTTTAATTATTTGCCTCCTTCACCAGAGTTTTTCAGAATCAAAGACCATGTCCTATTCCTCTCTAAATCCCCTGGACCAAGGCCTGGCACAGCACTGATTCTCAAGGGATGGAATGAGTGGATGGACCAACAAATGAGTAACAGAGAAATCTGCATCTATTAATCCTTTTCCCAGTGCTATACATATGAACATTATTTGCCTGAATGATAGTCCTTATTTATAGAGTTTATTCATGTTTACTAATCCCAGCAGGAACTTTCCCTGACATATTTTCTGATAAAATATTGCTTCTGGAATTTTTACAGGTAAAACATCTATAGGAACTCAGAGGGCTAGTCTGAGTGATCCATGCACTGATATTTATAATAGCTTTTTTAGTACTTTCTAAACAGGGAGTGTACAAATGTACACTGTACATAGAAGGACAATGAAGACGTTCCCCCCTTATCGGGGAGCAATCAAGTATGATTGTTGCCCCTGAAAGGAGATGAAGCAAGAGAAACCTAAAGAGATGGGGTGGGAATTAACTATTCTGTTCCAGCATGAATGCAAGTGGAGTGTTACCATATTTTATTCCTTTAAACCAAGAAAGGAAACAGAAGAGGAAGAAAAAGCAATTAATAAACATTAGGAAAATGCAAACCAAATCTGCAATGCTATACTACTTTACACCTACCAGAATATCTCCACGCCACAAGACATGTAACAAGTGCTGCTGAGGATGTGGAAAAATTGGAACCCTCACAGACAGCTCGTGGGAATGGTGCAGCCACTTTGGAAAACATCCTGGCAGTTCCTCAAAGGTTAAACAGAGACTTACCATGTGATAGTAGTTCCACTCCTAGCTATGTCCATACAAAAACATGTATAAGAATGTTCATAACAACATAATTCTTAATAGCTAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTAAGAGGCTGAGGTGAGAGGATTACTTGAGGCCAGGAGCTTGAAACCAGCCTGAGCAACATAATAAGACCCCATCTCTACCAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCTGGTGGTGTGCATCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGGTTCAAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATACCACTGCAATCCAGCCTGGATGATAGAAATCCTGTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAGGCAATGTAATTCATAATAAAGAGTGGAAACAGTTCAAATGTCCATTACCTGATGAGTGGATAAACAAAATATAGTATATCCATATAATGGAACATTGTTCAGCGCTAAGAAGAAATGAAGAACTTAAATGCTACAACATGGATGAACCTTAAAAACATTATTAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATCCAAAAATTATCTGGGCATGGTGGAGGACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTCAATCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCAGCACTGTTCTCCAGCCTGGGCGACAGGAGCGAGCCTCCGTCCCAAAAAAACAAAACAAAAACATTATTGTAAGTGATAGAAGCTAAATGCAAAACACCATATATTGTATGACCCCATTTGTATGTCTTGAATTATTGCAGAGCAAAAACATTCAGGGAATTCTTCTCTCTGGAGGTTGATGCCATTTCCTTTGTCTATGCTTGAATTTTTTTTCTTCTTCAAATTTTATTTTTAGGGACAGCATTAACATTTTATGTTATTTTTTTCTTTTTATTTTTTAGGACCCTGGTTTGATATGTACCTATCTGCTCGAGACTCCGTTGTTCTGAACTTTAATCCATTTATGGCTTTCAATCCTGACCCAAAATCTGAGTATAATGACCAGCTCACCCGGGCAACCAACATGACTGTTTCTGCCATCCGGTTTCTGAAGACACTCCGGGCTGGCCTTCTGGAGCCAGAAGTGTTCCACTTGAACCCTGCAAAAAGTGACACTATCACCTTCAAGAGACTCATACGCTTTGTGCCTTCCTCTCTGTCCTGGTATGGGGCCTACCTGGTCAATGCGTATCCCCTGGATATGTCCCAGTATTTTCGGCTTTTCAACTCAACTCGTTTACCCAAACCCAGTCGGGATGAACTCTTCACTGATGACAAGGCCAGACACCTCCTGGTCCTAAGGAAAGGAAATTTTTATATCTTTGATGTCCTGGATCAAGATGGGAACATTGTGAGCCCCTCGGAAATCCAGGCACATCTGAAGTACATTCTCTCAGACAGCAGCCCCGCCCCCGAGTTTCCCCTGGCATACCTGACCAGTGAGAACCGAGACATCTGGGCAGAGCTCAGGCAGAAGCTGATGAGTAGTGGCAATGAGGAGAGCCTGAGGAAAGTGGACTCGGCAGTGTTCTGTCTCTGCCTAGATGACTTCCCCATTAAGGACCTTGTCCACTTGTCCCACAATATGCTGCATGGGGATGGCACAAACCGCTGGTTTGATAAATCCTTTAACCTCATTATCGCCAAGGATGGCTCTACTGCCGTCCACTTTGAGCACTCTTGGGGTGATGGTGTGGCAGTGCTCAGATTTTTTAATGAAGTATTTAAAGACAGCACTCAGACCCCTGCCGTCACTCCACAGAGCCAGCCAGCTACCACTGACTCTACTGTCACGGTGCAGAAACTCAACTTCGAGCTGACTGATGCCTTAAAGACTGGCATCACAGCTGCTAAGGAAAAGTTTGATGCCACCATGAAAACCCTCACTATTGACTGCGTCCAGTTTCAGAGAGGAGGCAAAGAATTCCTGAAGAAGCAAAAGCTGAGCCCTGACGCAGTTGCCCAGCTGGCATTCCAGATGGCCTTCCTGCGGCAGTACGGGCAGACAGTGGCCACCTACGAGTCCTGTAGCACTGCCGCATTCAAGCACGGCCGCACTGAGACCATCCGCCCGGCCTCCGTCTATACAAAGAGGTGCTCTGAGGCCTTTGTCAGGGAGCCCTCCAGGCACAGTGCTGGTGAGCTTCAGCAGATGATGGTTGAGTGCTCCAAGTACCATGGCCAGCTGACCAAAGAAGCAGCAATGGGTGAGGCAGGGGTGGGGAGCATGCCCTTGGGTCTTGTCCTCAGTGCTTGGGTAAGCAAGCCTAAATCATTCTACTCCAAATCTGATTTCTACCCGTTCACTAGGTTTAATCCATCGCCAACTCCCCAAATTTTTCTTTTCTACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC
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Task1_train_916
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This mutation is located in gene CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
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Pathogenic; Encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 4
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Task1_train_917
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A mutation found in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyltransferase II deficiency
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TTTGCTAAAGGGGGGTCAGAGGCATGAATTTATGTCTTCTTTCATCAAATATATCTTATCCACCAGTACTTTTCTCTCACCATTTTAGTGCATTGCGTTATGTTTTAATTATTTGCCTCCTTCACCAGAGTTTTTCAGAATCAAAGACCATGTCCTATTCCTCTCTAAATCCCCTGGACCAAGGCCTGGCACAGCACTGATTCTCAAGGGATGGAATGAGTGGATGGACCAACAAATGAGTAACAGAGAAATCTGCATCTATTAATCCTTTTCCCAGTGCTATACATATGAACATTATTTGCCTGAATGATAGTCCTTATTTATAGAGTTTATTCATGTTTACTAATCCCAGCAGGAACTTTCCCTGACATATTTTCTGATAAAATATTGCTTCTGGAATTTTTACAGGTAAAACATCTATAGGAACTCAGAGGGCTAGTCTGAGTGATCCATGCACTGATATTTATAATAGCTTTTTTAGTACTTTCTAAACAGGGAGTGTACAAATGTACACTGTACATAGAAGGACAATGAAGACGTTCCCCCCTTATCGGGGAGCAATCAAGTATGATTGTTGCCCCTGAAAGGAGATGAAGCAAGAGAAACCTAAAGAGATGGGGTGGGAATTAACTATTCTGTTCCAGCATGAATGCAAGTGGAGTGTTACCATATTTTATTCCTTTAAACCAAGAAAGGAAACAGAAGAGGAAGAAAAAGCAATTAATAAACATTAGGAAAATGCAAACCAAATCTGCAATGCTATACTACTTTACACCTACCAGAATATCTCCACGCCACAAGACATGTAACAAGTGCTGCTGAGGATGTGGAAAAATTGGAACCCTCACAGACAGCTCGTGGGAATGGTGCAGCCACTTTGGAAAACATCCTGGCAGTTCCTCAAAGGTTAAACAGAGACTTACCATGTGATAGTAGTTCCACTCCTAGCTATGTCCATACAAAAACATGTATAAGAATGTTCATAACAACATAATTCTTAATAGCTAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTAAGAGGCTGAGGTGAGAGGATTACTTGAGGCCAGGAGCTTGAAACCAGCCTGAGCAACATAATAAGACCCCATCTCTACCAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCTGGTGGTGTGCATCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGGTTCAAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATACCACTGCAATCCAGCCTGGATGATAGAAATCCTGTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAGGCAATGTAATTCATAATAAAGAGTGGAAACAGTTCAAATGTCCATTACCTGATGAGTGGATAAACAAAATATAGTATATCCATATAATGGAACATTGTTCAGCGCTAAGAAGAAATGAAGAACTTAAATGCTACAACATGGATGAACCTTAAAAACATTATTAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATCCAAAAATTATCTGGGCATGGTGGAGGACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTCAATCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCAGCACTGTTCTCCAGCCTGGGCGACAGGAGCGAGCCTCCGTCCCAAAAAAACAAAACAAAAACATTATTGTAAGTGATAGAAGCTAAATGCAAAACACCATATATTGTATGACCCCATTTGTATGTCTTGAATTATTGCAGAGCAAAAACATTCAGGGAATTCTTCTCTCTGGAGGTTGATGCCATTTCCTTTGTCTATGCTTGAATTTTTTTTCTTCTTCAAATTTTATTTTTAGGGACAGCATTAACATTTTATGTTATTTTTTTCTTTTTATTTTTTAGGACCCTGGTTTGATATGTACCTATCTGCTCGAGACTCCGTTGTTCTGAACTTTAATCCATTTATGGCTTTCAATCCTGACCCAAAATCTGAGTATAATGACCAGCTCACCCGGGCAACCAACATGACTGTTTCTGCCATCCGGTTTCTGAAGACACTCCGGGCTGGCCTTCTGGAGCCAGAAGTGTTCCACTTGAACCCTGCAAAAAGTGACACTATCACCTTCAAGAGACTCATACGCTTTGTGCCTTCCTCTCTGTCCTGGTATGGGGCCTACCTGGTCAATGCGTATCCCCTGGATATGTCCCAGTATTTTCGGCTTTTCAACTCAACTCGTTTACCCAAACCCAGTCGGGATGAACTCTTCACTGATGACAAGGCCAGACACCTCCTGGTCCTAAGGAAAGGAAATTTTTATATCTTTGATGTCCTGGATCAAGATGGGAACATTGTGAGCCCCTCGGAAATCCAGGCACATCTGAAGTACATTCTCTCAGACAGCAGCCCCGCCCCCGAGTTTCCCCTGGCATACCTGACCAGTGAGAACCGAGACATCTGGGCAGAGCTCAGGCAGAAGCTGATGAGTAGTGGCAATGAGGAGAGCCTGAGGAAAGTGGACTCGGCAGTGTTCTGTCTCTGCCTAGATGACTTCCCCATTAAGGACCTTGTCCACTTGTCCCACAATATGCTGCATGGGGATGGCACAAACCGCTGGTTTGATAAATCCTTTAACCTCATTATCGCCAAGGATGGCTCTACTGCCGTCCACTTTGAGCACTCTTGGGGTGATGGTGTGGCAGTGCTCAGATTTTTTAATGAAGTATTTAAAGACAGCACTCAGACCCCTGCCGTCACTCCACAGAGCCAGCCAGCTACCACTGACTCTACTGTCACGGTGCAGAAACTCAACTTCGAGCTGACTGATGCCTTAAAGACTGGCATCACAGCTGCTAAGGAAAAGTTTGATGCCACCATGAAAACCCTCACTATTGACTGCGTCCAGTTTCAGAGAGGAGGCAAAGAATTCCTGAAGAAGCAAAAGCTGAGCCCTGACGCAGTTGCCCAGCTGGCATTCCAGATGGCCTTCCTGCGGCAGTACGGGCAGACAGTGGCCACCTACGAGTCCTGTAGCACTGCCGCATTCAAGCACGGCCGCACTGAGACCATCCGCCCGGCCTCCGTCTATACAAAGAGGTGCTCTGAGGCCTTTGTCAGGGAGCCCTCCAGGCACAGTGCTGGTGAGCTTCAGCAGATGATGGTTGAGTGCTCCAAGTACCATGGCCAGCTGACCAAAGAAGCAGCAATGGGTGAGGCAGGGGTGGGGAGCATGCCCTTGGGTCTTGTCCTCAGTGCTTGGGTAAGCAAGCCTAAATCATTCTACTCCAAATCTGATTTCTACCCGTTCACTAGGTTTAATCCATCGCCAACTCCCCAAATTTTTCTTTTCTACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC
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Task1_train_918
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This alteration occurs within gene CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) located on Chromosome 1. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, severe infantile form
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Task1_train_919
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Consider this mutation in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyltransferase II deficiency
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GGCACAGCACTGATTCTCAAGGGATGGAATGAGTGGATGGACCAACAAATGAGTAACAGAGAAATCTGCATCTATTAATCCTTTTCCCAGTGCTATACATATGAACATTATTTGCCTGAATGATAGTCCTTATTTATAGAGTTTATTCATGTTTACTAATCCCAGCAGGAACTTTCCCTGACATATTTTCTGATAAAATATTGCTTCTGGAATTTTTACAGGTAAAACATCTATAGGAACTCAGAGGGCTAGTCTGAGTGATCCATGCACTGATATTTATAATAGCTTTTTTAGTACTTTCTAAACAGGGAGTGTACAAATGTACACTGTACATAGAAGGACAATGAAGACGTTCCCCCCTTATCGGGGAGCAATCAAGTATGATTGTTGCCCCTGAAAGGAGATGAAGCAAGAGAAACCTAAAGAGATGGGGTGGGAATTAACTATTCTGTTCCAGCATGAATGCAAGTGGAGTGTTACCATATTTTATTCCTTTAAACCAAGAAAGGAAACAGAAGAGGAAGAAAAAGCAATTAATAAACATTAGGAAAATGCAAACCAAATCTGCAATGCTATACTACTTTACACCTACCAGAATATCTCCACGCCACAAGACATGTAACAAGTGCTGCTGAGGATGTGGAAAAATTGGAACCCTCACAGACAGCTCGTGGGAATGGTGCAGCCACTTTGGAAAACATCCTGGCAGTTCCTCAAAGGTTAAACAGAGACTTACCATGTGATAGTAGTTCCACTCCTAGCTATGTCCATACAAAAACATGTATAAGAATGTTCATAACAACATAATTCTTAATAGCTAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTAAGAGGCTGAGGTGAGAGGATTACTTGAGGCCAGGAGCTTGAAACCAGCCTGAGCAACATAATAAGACCCCATCTCTACCAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCTGGTGGTGTGCATCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGGTTCAAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATACCACTGCAATCCAGCCTGGATGATAGAAATCCTGTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAGGCAATGTAATTCATAATAAAGAGTGGAAACAGTTCAAATGTCCATTACCTGATGAGTGGATAAACAAAATATAGTATATCCATATAATGGAACATTGTTCAGCGCTAAGAAGAAATGAAGAACTTAAATGCTACAACATGGATGAACCTTAAAAACATTATTAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATCCAAAAATTATCTGGGCATGGTGGAGGACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTCAATCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCAGCACTGTTCTCCAGCCTGGGCGACAGGAGCGAGCCTCCGTCCCAAAAAAACAAAACAAAAACATTATTGTAAGTGATAGAAGCTAAATGCAAAACACCATATATTGTATGACCCCATTTGTATGTCTTGAATTATTGCAGAGCAAAAACATTCAGGGAATTCTTCTCTCTGGAGGTTGATGCCATTTCCTTTGTCTATGCTTGAATTTTTTTTCTTCTTCAAATTTTATTTTTAGGGACAGCATTAACATTTTATGTTATTTTTTTCTTTTTATTTTTTAGGACCCTGGTTTGATATGTACCTATCTGCTCGAGACTCCGTTGTTCTGAACTTTAATCCATTTATGGCTTTCAATCCTGACCCAAAATCTGAGTATAATGACCAGCTCACCCGGGCAACCAACATGACTGTTTCTGCCATCCGGTTTCTGAAGACACTCCGGGCTGGCCTTCTGGAGCCAGAAGTGTTCCACTTGAACCCTGCAAAAAGTGACACTATCACCTTCAAGAGACTCATACGCTTTGTGCCTTCCTCTCTGTCCTGGTATGGGGCCTACCTGGTCAATGCGTATCCCCTGGATATGTCCCAGTATTTTCGGCTTTTCAACTCAACTCGTTTACCCAAACCCAGTCGGGATGAACTCTTCACTGATGACAAGGCCAGACACCTCCTGGTCCTAAGGAAAGGAAATTTTTATATCTTTGATGTCCTGGATCAAGATGGGAACATTGTGAGCCCCTCGGAAATCCAGGCACATCTGAAGTACATTCTCTCAGACAGCAGCCCCGCCCCCGAGTTTCCCCTGGCATACCTGACCAGTGAGAACCGAGACATCTGGGCAGAGCTCAGGCAGAAGCTGATGAGTAGTGGCAATGAGGAGAGCCTGAGGAAAGTGGACTCGGCAGTGTTCTGTCTCTGCCTAGATGACTTCCCCATTAAGGACCTTGTCCACTTGTCCCACAATATGCTGCATGGGGATGGCACAAACCGCTGGTTTGATAAATCCTTTAACCTCATTATCGCCAAGGATGGCTCTACTGCCGTCCACTTTGAGCACTCTTGGGGTGATGGTGTGGCAGTGCTCAGATTTTTTAATGAAGTATTTAAAGACAGCACTCAGACCCCTGCCGTCACTCCACAGAGCCAGCCAGCTACCACTGACTCTACTGTCACGGTGCAGAAACTCAACTTCGAGCTGACTGATGCCTTAAAGACTGGCATCACAGCTGCTAAGGAAAAGTTTGATGCCACCATGAAAACCCTCACTATTGACTGCGTCCAGTTTCAGAGAGGAGGCAAAGAATTCCTGAAGAAGCAAAAGCTGAGCCCTGACGCAGTTGCCCAGCTGGCATTCCAGATGGCCTTCCTGCGGCAGTACGGGCAGACAGTGGCCACCTACGAGTCCTGTAGCACTGCCGCATTCAAGCACGGCCGCACTGAGACCATCCGCCCGGCCTCCGTCTATACAAAGAGGTGCTCTGAGGCCTTTGTCAGGGAGCCCTCCAGGCACAGTGCTGGTGAGCTTCAGCAGATGATGGTTGAGTGCTCCAAGTACCATGGCCAGCTGACCAAAGAAGCAGCAATGGGTGAGGCAGGGGTGGGGAGCATGCCCTTGGGTCTTGTCCTCAGTGCTTGGGTAAGCAAGCCTAAATCATTCTACTCCAAATCTGATTTCTACCCGTTCACTAGGTTTAATCCATCGCCAACTCCCCAAATTTTTCTTTTCTACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGG
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Task1_train_920
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This gene mutation involves CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyltransferase II deficiency
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Task1_train_921
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A genetic alteration is present in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyltransferase II deficiency
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GGGTAAGCAAGCCTAAATCATTCTACTCCAAATCTGATTTCTACCCGTTCACTAGGTTTAATCCATCGCCAACTCCCCAAATTTTTCTTTTCTACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCCGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTT
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Task1_train_922
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Mutation context: Chromosome 1, Gene CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 4
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ACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCCGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTTCAAGGCTTGAGCACAAGGCTTTTCTATCTGCAGGGTAGTAATATGTCCAGTAATACAGACTATTTCTTGTTCTTCATGGTAGTTAGGTGCAGT
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Task1_train_923
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The gene CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2), on Chromosome 1, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, neonatal form
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ACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCCGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTTCAAGGCTTGAGCACAAGGCTTTTCTATCTGCAGGGTAGTAATATGTCCAGTAATACAGACTATTTCTTGTTCTTCATGGTAGTTAGGTGCAGT
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ACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCTGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTTCAAGGCTTGAGCACAAGGCTTTTCTATCTGCAGGGTAGTAATATGTCCAGTAATACAGACTATTTCTTGTTCTTCATGGTAGTTAGGTGCAGT
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Task1_train_924
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The following genetic variant occurs in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, myopathic form
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Task1_train_925
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A genetic alteration is present in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, severe infantile form
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ACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCCGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTTCAAGGCTTGAGCACAAGGCTTTTCTATCTGCAGGGTAGTAATATGTCCAGTAATACAGACTATTTCTTGTTCTTCATGGTAGTTAGGTGCAGT
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Task1_train_926
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The gene CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Encephalopathy, acute, infection-induced, susceptibility to, 4
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ACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCCGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTTCAAGGCTTGAGCACAAGGCTTTTCTATCTGCAGGGTAGTAATATGTCCAGTAATACAGACTATTTCTTGTTCTTCATGGTAGTTAGGTGCAGT
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Task1_train_927
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A mutation found in CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2) on Chromosome 1 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Carnitine palmitoyltransferase II deficiency
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ACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCCGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTTCAAGGCTTGAGCACAAGGCTTTTCTATCTGCAGGGTAGTAATATGTCCAGTAATACAGACTATTTCTTGTTCTTCATGGTAGTTAGGTGCAGT
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ACCCTAGCAGTCTGAACAGCCACACTAGCCACTAGGGATCAGAATGTTCTTGCCTCCTAAGCAGGGGTGGGGAAATGCATGTGTCTTTGTCCTCATTTAAGGTCACTTTCAGCTGTGACGCATTAATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAAGAGTTTCCCTCCGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGGGATAATAGGCACCCGCCACTACACCTGGCTAGTTTTTGCATTTTTAGTAAAGAAGGGGTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCCTCTCAGCCTCCCAAAGTTCTAGGAATACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTTTTTTTTTTTGGAGACACGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAACCTCAACTTCCTTGGCTCAAACAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTGATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACTACAGGCTTATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTCAATAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTACCCGCCTCACCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTAAGCCACCATGCCGGGCCTAATTTTTAAAATTTTTTGTAGAGATGAGGTCCCACTGTATTGCCCAAGGTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGCACTAGGATTATAGGCATGCACCACTGCACCCAACCTTTTTCTATTACTGATTGGTTATCAGACTCACTTTTGAAAATTTAGGATTTCTAAACTTACGGCCCCACTAGCTTCACCTCAGTTGTAATGTGTCTGCTCTCTGTAAACAGGTTATCTCAGAAGCTCTTCTCAATTGTCATCCGTCATTACCTTTTTTTGATAAAATTCAAGACCTGGAAAGGACCTGGAGGGTCATAGTTGTCCTTTCATGTTGCTATGAAGTGCTGGAAGTGAAAGGGACCTCCAAGACATTCTAATCTTCTCTTCCTCCATTTTATAGGGAGAAAACCAAGCCACTGGCCCCGTTACACAGCAAGTTAGTAGTAAGACTGAGATTCGAACCCTGGTCAAACAGACTTTCCATTTTGTTCCACTGACTCAATCTTCTCTTTTACACTTGAATCAGACTTTTAGTTTTATTGTAGTTTTTGAGTCCATAGCTGTCTTCCTGTACTGTCTTGACTCTTTGACTAAACTGATTTCACATCTTTAAAATTATGCTTTCCTTTTAGGCTCATTTTTAGCTCAGCTGTTGACAGCTATTTTTAAATGTAACATGACATAATATATTTCCTAAATAATTTAAAATAATCTAGCTTGAGCTGCTCTGAAGGTTAGTCAGTTGGTGGTGTGCATAGAGGTAGAGCCTTCCCCCACTCTCAAGGATGCTGTGAGGGGTATTCCTACCATGTGGTGAGTTGGGAGGTTTTCCTGAGGTCCTTTTCCATCCTGAGACTCTGGTTTTCCATTTTGTTTCTCACAGGCCAGGGCTTTGACCGACACTTGTTTGCTCTGCGGCATCTGGCAGCAGCCAAAGGGATCATCTTGCCTGAGCTCTACCTGGACCCTGCATACGGGCAGATAAACCACAATGTCCTGTCCACGAGCACACTGAGCAGCCCAGCAGTGAACCTTGGGGGCTTTGCCCCTGTGGTCTCTGATGGCTTTGGTGTTGGGTATGCTGTTCATGACAACTGGATAGGCTGCAATGTCTCTTCCTACCCAGGCTGCAATGCCCGGGAGTTTCTCCAATGTGTGGAGAAGGCCTTAGAAGACATGTTTGATGCCTTAGAAGGCAAATCCATCAAAAGTTAACTTCTGGGCAGATGAAAAGCTACCATCACTTCCTCATCATGAAAACTGGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAACTGGGGCCTGTGTAGCCAGTGGGTGCTATTCTGTGAAACTAATCATAAGCTGCCTAGGCAGCCAGCTACAGGCTTGAGCTTTAAATTCATGGTTTTAAAGCTAAACGTAATTTCCACTTGGGACTAGATCACAACTGAAGATAACAAGAGATTTAAGTTTTAAGGGCATTTAATCAGGAGGAAAGGTTTGGAAAACTAACTCAGGTGTATTTATTGTTTAAGCAGAAATAAAGTTTAATTTTTGCTTGAAGATGGTTCTTAATTTCTTTTAACCTAATTCCTAATCCTCACAAAGATCTTTCCAACAGCAAGTTCAGTAAGTTCAGGTAACAGTACGTCACCATTGGCTTCTGGCTCATTGAGTGATGGTGGGATCGCGGTTTCATCTCTGTAAACTTGCCCTTGACTGGGGAGATACCATCTCCTTAAAAATACTCTTCATTTTCCTAAGGAGTGAACTGCTGCTGCACGAATTCTTATTTGTGGAGGGAGTAGCTGCCTCCTTACTTCACCTTCATGCACCAGTGCAGCGTGAACAGGGGCTTTATTGATGGGGCTTGGGAAGCTGTAATAAAGTCCAGCATGCAGATTGTGAAGGTTTCGTATAGCCACCAGGAGACAAGGGTCAAAGGAACGAGCCTCTGTGGGCTCTGCTGCTTAGAGTACTTTGTCCTTTCTCAGTTCTTAAGGGCAACTGGGAAGGAAGAGGGATCAGCACTTCACAAACTGGTGGGTGACCTCATAGATTCCCACAGACTCCTGGGCCTTTTCATCATAGTCAGTCCAGTCCTGGGAAACAAAATGGCATTGTTAGCCTCACAACGCAGAATGCAGCCATGTGGAGAGCAGAAAACTGGGACTTAAAAGGCCCAGCTCAGGCTCTGACTCAAATAATCATGAACATGTATGACCCTGAACAGAGCCAGATAGCTCAGGCCTGAATTCTAGCTCTTTCAGTTGTATGACTGTGGGCAAATCACTTAACTTCTCTGAGTCCCTTCTCCGAGTCCTGTCTTCTATTTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGGACAATGGAGTTCATATTGAATGTTGAAAGAATCAAATGAGGTAACACATTTAAAAGCACTCAGCAGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATTTCAGGTCAGGGGTCCGAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACCCGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATAGCCAGGAATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGACATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTGTCTCAAAAAATACATAAAATAAAATAAAAGCACTCAGCATAGTGAGTGCCTGGCACATGTAAGAGCTCAGTAGATGCTAGCTGCTGTTATTAGGTGCTGAGCAAATGAAATGAAGTTTTTGTCCTTCCTTCAAGGCTTGAGCACAAGGCTTTTCTATCTGCAGGGTAGTAATATGTCCAGTAATACAGACTATTTCTTGTTCTTCATGGTAGTTAGGTGCAGT
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Task1_train_928
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Consider a variant on Chromosome 1 in gene CPT2 (carnitine palmitoyltransferase 2). Determine its clinical classification and disease relevance.
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Pathogenic; Carnitine palmitoyl transferase II deficiency, severe infantile form
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Task1_train_929
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Mutation context: Chromosome 1, Gene DIO1 (iodothyronine deiodinase 1). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Thyroid hormone metabolism, abnormal, 2
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ACACGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTACACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGGCTCTGTCTCAAAAATAAATAAATAAAGAGTGACACATGGTGGGGAAAATCAGCCCTGATTACTTTAAGAAGTTGGGGGCTGGGCATGGTGGCTCATTCCCATAATCCCAGCATTTTGAGAGATCAAGGAAGGAGGATTGTTTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAAGGAGAAGCTATAACAGTCACAAAATTTGCCGGGTTTGGGTGGCACTCCTGTAGTCCTAACTACTCTGGCTGAGGTGAGAGGATGGCTTGAGCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATCACACCACTGCCCTCCAGCCTGGTGACAGAGGAAGGAAACCCCGTCTCAATTATTTAAAAAAAAAAAGGTCTTGGGTGTATTTTAAAACACTTCCCAACTCTGAGCTCTATGATTCTTCTTTCAGTTTCTCCAATGAGCCATGCTGTCTCTGGCTTCTGGGCCTTTGGCCATGTGGTTCCTTCCACCAGGACACTATCCCCACTTTAGCCAGCTGACTGCTTGCCGTCTTTCTGGTTTCAGCATAGAAATCACTTCCTCAGTGAAGTCCTCTTGACTTCTCTAACCAGAATTAGCTTCCCCTTCTCCCTGCTCTCGTAGCCCACGCACACCCTCCGCCTCTGGACTTCATTTAGGAAATGGTAGTTTTTTGTTTACTTGTCTATTCCCCGCACTAGACCATGACTTCCTTGAGAGAAGAGGGTGTTTTATTTGTCACTCTATGCCCAGTGCTAAGGGGAGTTGCAGGCCCCAGGTTTTGTTAGAAATGGTCCCATTTCTGTCTCTGCCCTGGGAGGTTTGAGATCCATATCCCCTGGGGAGGGCTCTGACTACAGAAATAGTCAACCACCAGCTAGAAGCCATGATTGGGGGCCGGGTGCGGTGGCTCGAGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCCAAGGCGGGTAGGTCATCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGTTGAGGCAGGATAACTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCTCCAGCAACAACAACAAAAAACCATGGATGTTTGTTGGGAAAACAAAGATCTTTGTTGGGAAAAACATCTTTCATTAGTAAAAGAAGAGTTTGTGTATAAAGAATAACTAATAGCCAAATCTACTGACTTGTGAGAGAGCATCTAACAGGTTCTCTTTAAGTGTGGTCTTTTTAAGTACTTGTTTTTTAAAAAATTAATCAGAGGGAGAATTTAAGATGTGGAATCTACCAATCCAAGAATCTCTCAAAAGCTCAGGCAAAGAATTGGAAATGATAATGATTAAAACAGACCTTTGTGCACCTGGTTAGGAATTTTCTATCTCATGACAGAAAGGCAAACATCTTCTGACCTGACTCCTTCCCCTGACCCGGGGTTGGCTGCTCCTACCCTGCACCTTCATTCAGCTCCGCCCAGTGTTGCCTGGCTGCAGCCTCTCTGCCCATAGAACTCAGAGCTTACTCTGGCTTTGCCGAGATGGGGCTGCCCCAGCCAGGGCTGTGGCTGAAGAGGCTCTGGGTGCTCTTGGAGGTGGCTGTGCATGTGGTCGTGGGTAAAGTGCTTCTGATATTGTTTCCAGACAGAGTCAAGCGGAACATCCTGGCCATGGGCGAGAAGACGGGTATGACCAGGAACCCCCATTTCAGCCACGACAACTGGATACCAACCTTTTTCAGCACCCAGTATTTCTGGTTCGTCTTGAAGGTCCGTTGGCAGCGACTAGAGGACACGACTGAGCTAGGGGGTCTGGCCCCAAACTGCCCGGTGGTCCGCCTCTCAGGACAGAGGTGCAACATTTGGGAGTTTATGCAAGGTCAGGAGGCTGCCACACACTTGAGGGGTGCTTGAAATAGCAGTGGTAGAGGGGGATGAAGAGATGGGTTGGAAAGTCCTGAATTCTCCTACTACTTTTGCTGCTCCTTTTGGACCTTCTTGTCCTCTTCCTGCTTCCTGAAACTAGAACTTCTTGTGGATTGTTTCTCTAAGTAACATCACCACCTTCCCAGGCACTCAAATCACAAACCATCCAGTCTGGCATTTCAGCCCCTGGAACACTGCTCTTACTGTACAGGCTGATCTGCCTGGGCTGCTCTTTGCCCACCTCTCTGCCTGGTTAACTCTTGTTCAATCTTCAGACTGTTGCTCAATGACGCTTCTTTCGAGAAGCCAAGCCCAACTCTCCCATACTAGGCTACCCTCTCTCATCTGCCTGCTTAACATCCTAAACTTTTCTTTATTACACCTGTCGCGGTTTGTAATTATGTACGGCTGGCTAGGATTCATGTCTGCTTCCCTCACTAGTCTGCAAACTCAATGCAGGTCGAGACCATTGCTCTCACCCACTATTACACCCATGCCTGATGGTGGCACATGGTAGCTGCTCAGTAAATACTTGTTAAAGAGCTCTCGGCTGGGCGTGATGGTTCACGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGATTGAGGCTGGCAGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCCGGTGGCGGAGATTGCAGTGAGTCAAGATTGTGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACGCTGTCACAAATTTAAAAAAGTCTCAGTTTTCTCTCTCTAACTCCATCCACTCCCCAGTCCAGGAAAACCAGTTTCGTCGACTTGAGTTCTTGACCGTTCCAGTTTTCTCTTTTTTGTCCTCCCAGCTTCTCTTCCTGCCAGAACTTCCTTCTCCCCGACTTGCCCACTCAGCCAGCCCAGCTTGTGAATGGCTGCCAGATTGCTCTTCTCTGAGTACATACCAGCTCAACCACTTTCAGCAGCTCCCCTCTGCATTTAGGATGAAGCCCAGGCTCAGCCTTGGATTCCAGGTCCTCCCTGGTCAGGCTCTAGCTTTTCTTCTCAATTCTACCTCTGAGCTCCCCGCCACACTCATTTCTTTCGGACAAACTGTTGGGCCTTGTACATCTCTTGTACTTTCCCTTGTCTTTGCCTTTGCTGACATCGGCTGGTCAAGAATGCCCTTCCCCTCTCCATCGTCGTCTATATCCCCCTCATTCATGTGGGTCCAGCTCTCCTGACACCTTGTCCTCCATGAAGCCACCTCAGCTTCCTACAGCTAGGCATGTGCTCTCTCCCTTCGGCTCATGGCTCTCTGTCTGCACCTCTCCTTGGACACTGCTGCTTCCTGCTCAGCACCTGGTACCTAAGCACAAGTCTTATTTCCCTGCCCAGTGGAGAGCCTCAGGAGAGGGTGTGTGTCTGATTTATCTCTGGATTCCTCAGCATGCTCGGCCCAGGGCCTAGATGCAGCAGGTAGAGAAGGCACCTGAGGCAGTTGGTTTATTCCGTGTTTTTCTTGTTTTTCTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTACTGCCCACGCTGGAGTGTAGGGGTATGATCACGACTCACTGCATCCTCGATTTACCAGGCTCAAGCCATCCTCCCACCTTAGCCTCCTTAGTACCTGGGACAACAAGTGCACACCACAATGCTCGGCTAATTTTTGCATTTTTTGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGACTCAAGTGATCCACCCACTTCGGCCTTCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTATCCTGTGTTTTTGAAAGAAT
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Task1_train_930
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Consider this mutation in DIO1 (iodothyronine deiodinase 1) on Chromosome 1. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; Thyroid hormone metabolism, abnormal, 2
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Task1_train_931
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This mutation occurs in DHCR24 (24-dehydrocholesterol reductase) on Chromosome 1. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Desmosterolosis
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Task1_train_932
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A mutation in DHCR24 (24-dehydrocholesterol reductase), located on Chromosome 1, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; Desmosterolosis
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Task1_train_933
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Here’s a variant in BSND (barttin CLCNK type accessory subunit beta) located on Chromosome 1. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Bartter disease type 4A
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TCACCGGGTCCGAGCCCAGCCGCTGACCCCGGGGGAAGCGCCTTGCTCAGCGCCGGGCGGCCCACGAGGCCCTGCAGGACCGCGGCTGCGGAGACCGTTCCCGCCACCCGCCTGGGCTCCAGGGCCAGACGGGCTGAGGTCCCTCTGGGCCTCCGTCTCCTTTCCAGGGAGGGGCACCGGCTAGGTAACACGGCACTCGCCCTTTCCCTTCTCTGAGCCTGTAGTAGATGATGATAATAATGTTTCCGTGGAAGGTCCTGCTTTGTTAATAGTCACAGATTACAAAGTACTTGCCTTTTCCCACTCCCCTTATGTCCCTTCCCTGTACAAAACCTGGGAGGTGGCCTAATACCTATCCCCAATCTGCAGTTGACAAAACTCTAGCCCGGAGCAGAGCCACCTGCCTGAGCTCACCCTGAGAACCAGACCTGGACATGACCTGATAACTCAGCCCTTTCCTGCCCCTCAGCCATCGCTCAGCCAGGGCCCCTGAGCTCCCTCCAGGACCTCCTCTGCGAACTGTCAAGTGCACCTGGACTCTGAGGGCTGGCGATGGTGGGTGTGAGGAAGGAGAAACCCCTGTTGGAAAAAGGGCCTATGAGAAGGACGTCTAGTTAGAGGGGCAGCTGTGAGCACAGGTGTGGGGTTAGGGAACAAGGGCAGCCCTGCTGGCAGGAGGGGAGAAGGTGATGACCGCCAACAGGAAATCCCCAAGCCCAGCAAGTCAGGGAGCCCATTGAAAGCCTTTTATCCTGCATCGGCGATTTAACCCCATGTAAACGCCAAGTGAACATTCTCTTGTAGAGACCGATGGTCCTCATTTTCCTGTAATCCTGTAAAGGAATCTGATTTCTTCCATCAGCCTGTCCCTAGGACTAAAATGCCTCATTAGTGTTATTCTTAGGAAGGCATCTTCCTAGATCAGGCTGCAAGGAAATGGAGGAAGTGACTGTCAGTCACTCACACCCTGCAGGGGCACTAATTCCGAGAGCCTTAGGGGTGGGTGGGGAGCAGTTCATTGAAAGCCCAACTGGGTGGTGCATAGCGTGTGAATGTGAAGGGGATGGAGGAACCCAAGGAGGCCAGGCCTGGAGACAGCACCAAATCTGGGAGGTACATTATTATTCCCATTTTACAGAGGAGGAAACTGAGGTAACCTGATCATGACCACACTGCCCCACAGTAGAGGAGCCAGAATCCAAACCCAGGCAGCCTGCCTTGCCACCAGAGCCACGCTTTTCACCCTCAAGCTGCAGTTAAGAAGTATCACGCCGTGGCTAGGCCCACGGCCTCTGGCTTCACATCCCACTAGCTCTGCCATCTTTAGCTGTGTGACCTTGGGCAAGTTACTTGTCTGTGCCCGAGGGTCCTCTGTAAAGTGGGGATAGTAGTAGCTGCTTCACTGGGTTCCCTTCAATGAGTTAATAGCTGTAACATGTTTAGAATGGTGCCCTGCACATAGTCACCAGCCAGTACATATGGGCCATTATTCCTGAACCCTGGATAGGCACATGTCCTTGAAGAGTGTAGAATTCTTCAGGATTCTGAAATGCCAGCCTGTGGGATCCTGGAATCCTCCAATAGCATTCTAACAGCTCTCAGCTGCAGAACTGTACCCTGTTTTCTAGAGCTGGAAGGTGTGAGGCTGCCTGTCCACCCAGCTCAACCCCACAGTAGGCAAATGAGGTGATGTCAAAGCCTTGGCTGGGGCCCAGCCCCGGTAACCTCCCACTCTCCCTCCCCTGTGTGCTCCCTCGCTCAGATTCACACACACACTCCAGGCCAGCCGGGCCCAGAGGGAAGGTGAGAGGGCAAGGAGTAAAGGTGGCTGGGTGTGGGTCCGTTGAAGCGAGCCGCCTCCAGCCCTGTTGAACTGGTGGGCCCAGGGACTGGAGCGGGATTGAAAGGGATCTTGCTCTCCCTTGAAGCCTTGAGTTGCAGCGATTTCAGTGTCTTCTCTCCCTGTGTAAGCCTGTCTCGGTGTTTAGGCTGAACTACAGCCACCCCCTCTCCCGGGGGTGTGCAGGCCAGGGACTGGCCAGGCAGCCATGGCTGACGAGAAGACCTTCCGGATCGGCTTCATTGTGCTGGGGCTTTTCCTGCTGGCCCTCGGTACGTTCCTCATGAGCCATGATCGGCCCCAGGTCTACGGCACCTTCTATGCCATGGGCAGCGTCATGGTGATCGGGGGCATCATCTGGAGCATGTGCCAGTGCTACCCCAAGGTAGGTGGTAGTGGGGCTGGGTGGGGCCAGGTCAGCTGGGGCCAGGAGGGCTGGACACTGTGCCTGTATGCCATGCCTCACCCCCTATCCTTTAGTTGTCTTTTCATTCTTCTCATTTTGACTCGGTCTTCTCTCTGCTCTCCTGAGCGTCTGTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCCTTAGCCTAAGGGTTGATCAGAAGGCCCCTGGATCTGGAGCCCTGAGCCGGAAGCTATGGTATAGACACAGCAAACACAACACACCATGTGCTTGAAACAAAAGCTAATGAGCGCTGACCCCCTGCCAGGCACTCCTGCGTTCAGGGTGCAGTTCAGCCCTCATCCTAAGCCTTTTGGTGCTTTCTGTAGTTCCACCTTCTGAGCCTTTCTGAGGTCCAGAAAGAGAGGCTGCACAGCTAACGAGCAAGGTTTGGAGCTCAGATGCGTGTGACTTACACGTCACCCTTCACCTTGGGTCTTCTACCTCTGGGTCCCAGAGCGACTGAGAGCTCCAGGGTAGGTCAGGTCTAACCTTGGTGGCATGCACTGGGCAGTATCCTTTAGAGTCTTCATGTATTCTCAGCCTTATGTGTAATTTAGTGATGGGAAGAGCACTGGTTTGGGAGTCCTGAGTTCTAGTTCAAGTCCTGTTCCAAACTCTCTATGACCTTTGTCTTTCTGAGCCTCATTTTTTTCATCTGCAAATGAGATCCCTGCCCCTATTTTCCACAGAGCTTCACAGGGTCATTATAAAGATCAGAGAAGAGATAAGATATAGGAATATTTTGTAAACTGTAAGGTGTTATTTATAGATGAAGGGCTACCACTGTTACCCATACTGATCCTCCCAACAGCTCTGTGGAATGGAAATGCCAGGAGTTGCGAATCTTCAATGCCTAGAGAGGCTGGGTGACTTCCAAGGTCACACAGCTGGTCAGGTACAGACCCAGGGAGAAAAGGAGGGAAATAGGGACTCTAACTTGGGCTCTGTCTCTTACTGCCTGGGAGACTTTGCTCAAGCCCCTTTCCTCTCTGAGCCTCAGTTTCCTCATTTGTACACTGTGTGAGTTAGGAGGGGGGGGTGGGAAAGGGGGTATATCTGGGGGCCCTGCTGGACCTAATATCTAGGGCTCCAGGTCCAGGCAGTCCTCAGCAACCCCCACACCTCCTCTCCTCCCACCTGGGTGGCTGTGCTCAGGGTTTCAGGGAAGAAGGGGGATGGCTCCCTGGGGCCTGGGCCGGCTCTCCCCAGCCCTGCCCCCTCCACGGGCCAACCCTGGGCTGTCATTCTGTTCAGTGCTGGAGCGGTCTGGGCTGGTTTGTAGTCATTTAGCAGGCAGTTTACAGTCAACTTGCCTCTGTCTGTGCAATTCCTTGAGCAGAGGTCACTGGGAGAAGTCCTTGGGGCCAAAGCCACTCATGTCACCACTGCTATTATAATCCTTCTCCCAGTGAGGAGGCTGGACCCTGGGGGACAGCAGAGGGATGGCAGAGGTGTGGAGAGGAGCATCCTTCCTGCCCCCGCTCTTAAATAGAGCTGGCTCTGGGATGGTTGGTAGGCTGATGGGAGTGACGGTAGAGGGGAGGGGAGGGGAGGAGGGAATATTGCTGGGTATTAATGAGTAACTGTTGATAGATTCATGGGTTCACGTGCTGTGGAGGCAGCGTGGTGGGCTGAAAATGGCACATGTTGTGGCAACCTCCAGGCCCAGATTCAAATCCCTGCTCCTTCATGTCCCACTTCTGTGACCTTGGCAGAAAGAGTCCCTCCCCCTCAGCTCTGAGCCTTGTACGGCTGATTGGGAGAACACAGTGGGATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
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Task1_train_934
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The following genetic variant occurs in BSND (barttin CLCNK type accessory subunit beta) on Chromosome 1. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
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Pathogenic; Bartter disease type 4A
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CTGACCCCGGGGGAAGCGCCTTGCTCAGCGCCGGGCGGCCCACGAGGCCCTGCAGGACCGCGGCTGCGGAGACCGTTCCCGCCACCCGCCTGGGCTCCAGGGCCAGACGGGCTGAGGTCCCTCTGGGCCTCCGTCTCCTTTCCAGGGAGGGGCACCGGCTAGGTAACACGGCACTCGCCCTTTCCCTTCTCTGAGCCTGTAGTAGATGATGATAATAATGTTTCCGTGGAAGGTCCTGCTTTGTTAATAGTCACAGATTACAAAGTACTTGCCTTTTCCCACTCCCCTTATGTCCCTTCCCTGTACAAAACCTGGGAGGTGGCCTAATACCTATCCCCAATCTGCAGTTGACAAAACTCTAGCCCGGAGCAGAGCCACCTGCCTGAGCTCACCCTGAGAACCAGACCTGGACATGACCTGATAACTCAGCCCTTTCCTGCCCCTCAGCCATCGCTCAGCCAGGGCCCCTGAGCTCCCTCCAGGACCTCCTCTGCGAACTGTCAAGTGCACCTGGACTCTGAGGGCTGGCGATGGTGGGTGTGAGGAAGGAGAAACCCCTGTTGGAAAAAGGGCCTATGAGAAGGACGTCTAGTTAGAGGGGCAGCTGTGAGCACAGGTGTGGGGTTAGGGAACAAGGGCAGCCCTGCTGGCAGGAGGGGAGAAGGTGATGACCGCCAACAGGAAATCCCCAAGCCCAGCAAGTCAGGGAGCCCATTGAAAGCCTTTTATCCTGCATCGGCGATTTAACCCCATGTAAACGCCAAGTGAACATTCTCTTGTAGAGACCGATGGTCCTCATTTTCCTGTAATCCTGTAAAGGAATCTGATTTCTTCCATCAGCCTGTCCCTAGGACTAAAATGCCTCATTAGTGTTATTCTTAGGAAGGCATCTTCCTAGATCAGGCTGCAAGGAAATGGAGGAAGTGACTGTCAGTCACTCACACCCTGCAGGGGCACTAATTCCGAGAGCCTTAGGGGTGGGTGGGGAGCAGTTCATTGAAAGCCCAACTGGGTGGTGCATAGCGTGTGAATGTGAAGGGGATGGAGGAACCCAAGGAGGCCAGGCCTGGAGACAGCACCAAATCTGGGAGGTACATTATTATTCCCATTTTACAGAGGAGGAAACTGAGGTAACCTGATCATGACCACACTGCCCCACAGTAGAGGAGCCAGAATCCAAACCCAGGCAGCCTGCCTTGCCACCAGAGCCACGCTTTTCACCCTCAAGCTGCAGTTAAGAAGTATCACGCCGTGGCTAGGCCCACGGCCTCTGGCTTCACATCCCACTAGCTCTGCCATCTTTAGCTGTGTGACCTTGGGCAAGTTACTTGTCTGTGCCCGAGGGTCCTCTGTAAAGTGGGGATAGTAGTAGCTGCTTCACTGGGTTCCCTTCAATGAGTTAATAGCTGTAACATGTTTAGAATGGTGCCCTGCACATAGTCACCAGCCAGTACATATGGGCCATTATTCCTGAACCCTGGATAGGCACATGTCCTTGAAGAGTGTAGAATTCTTCAGGATTCTGAAATGCCAGCCTGTGGGATCCTGGAATCCTCCAATAGCATTCTAACAGCTCTCAGCTGCAGAACTGTACCCTGTTTTCTAGAGCTGGAAGGTGTGAGGCTGCCTGTCCACCCAGCTCAACCCCACAGTAGGCAAATGAGGTGATGTCAAAGCCTTGGCTGGGGCCCAGCCCCGGTAACCTCCCACTCTCCCTCCCCTGTGTGCTCCCTCGCTCAGATTCACACACACACTCCAGGCCAGCCGGGCCCAGAGGGAAGGTGAGAGGGCAAGGAGTAAAGGTGGCTGGGTGTGGGTCCGTTGAAGCGAGCCGCCTCCAGCCCTGTTGAACTGGTGGGCCCAGGGACTGGAGCGGGATTGAAAGGGATCTTGCTCTCCCTTGAAGCCTTGAGTTGCAGCGATTTCAGTGTCTTCTCTCCCTGTGTAAGCCTGTCTCGGTGTTTAGGCTGAACTACAGCCACCCCCTCTCCCGGGGGTGTGCAGGCCAGGGACTGGCCAGGCAGCCATGGCTGACGAGAAGACCTTCCTGATCGGCTTCATTGTGCTGGGGCTTTTCCTGCTGGCCCTCGGTACGTTCCTCATGAGCCATGATCGGCCCCAGGTCTACGGCACCTTCTATGCCATGGGCAGCGTCATGGTGATCGGGGGCATCATCTGGAGCATGTGCCAGTGCTACCCCAAGGTAGGTGGTAGTGGGGCTGGGTGGGGCCAGGTCAGCTGGGGCCAGGAGGGCTGGACACTGTGCCTGTATGCCATGCCTCACCCCCTATCCTTTAGTTGTCTTTTCATTCTTCTCATTTTGACTCGGTCTTCTCTCTGCTCTCCTGAGCGTCTGTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCCTTAGCCTAAGGGTTGATCAGAAGGCCCCTGGATCTGGAGCCCTGAGCCGGAAGCTATGGTATAGACACAGCAAACACAACACACCATGTGCTTGAAACAAAAGCTAATGAGCGCTGACCCCCTGCCAGGCACTCCTGCGTTCAGGGTGCAGTTCAGCCCTCATCCTAAGCCTTTTGGTGCTTTCTGTAGTTCCACCTTCTGAGCCTTTCTGAGGTCCAGAAAGAGAGGCTGCACAGCTAACGAGCAAGGTTTGGAGCTCAGATGCGTGTGACTTACACGTCACCCTTCACCTTGGGTCTTCTACCTCTGGGTCCCAGAGCGACTGAGAGCTCCAGGGTAGGTCAGGTCTAACCTTGGTGGCATGCACTGGGCAGTATCCTTTAGAGTCTTCATGTATTCTCAGCCTTATGTGTAATTTAGTGATGGGAAGAGCACTGGTTTGGGAGTCCTGAGTTCTAGTTCAAGTCCTGTTCCAAACTCTCTATGACCTTTGTCTTTCTGAGCCTCATTTTTTTCATCTGCAAATGAGATCCCTGCCCCTATTTTCCACAGAGCTTCACAGGGTCATTATAAAGATCAGAGAAGAGATAAGATATAGGAATATTTTGTAAACTGTAAGGTGTTATTTATAGATGAAGGGCTACCACTGTTACCCATACTGATCCTCCCAACAGCTCTGTGGAATGGAAATGCCAGGAGTTGCGAATCTTCAATGCCTAGAGAGGCTGGGTGACTTCCAAGGTCACACAGCTGGTCAGGTACAGACCCAGGGAGAAAAGGAGGGAAATAGGGACTCTAACTTGGGCTCTGTCTCTTACTGCCTGGGAGACTTTGCTCAAGCCCCTTTCCTCTCTGAGCCTCAGTTTCCTCATTTGTACACTGTGTGAGTTAGGAGGGGGGGGTGGGAAAGGGGGTATATCTGGGGGCCCTGCTGGACCTAATATCTAGGGCTCCAGGTCCAGGCAGTCCTCAGCAACCCCCACACCTCCTCTCCTCCCACCTGGGTGGCTGTGCTCAGGGTTTCAGGGAAGAAGGGGGATGGCTCCCTGGGGCCTGGGCCGGCTCTCCCCAGCCCTGCCCCCTCCACGGGCCAACCCTGGGCTGTCATTCTGTTCAGTGCTGGAGCGGTCTGGGCTGGTTTGTAGTCATTTAGCAGGCAGTTTACAGTCAACTTGCCTCTGTCTGTGCAATTCCTTGAGCAGAGGTCACTGGGAGAAGTCCTTGGGGCCAAAGCCACTCATGTCACCACTGCTATTATAATCCTTCTCCCAGTGAGGAGGCTGGACCCTGGGGGACAGCAGAGGGATGGCAGAGGTGTGGAGAGGAGCATCCTTCCTGCCCCCGCTCTTAAATAGAGCTGGCTCTGGGATGGTTGGTAGGCTGATGGGAGTGACGGTAGAGGGGAGGGGAGGGGAGGAGGGAATATTGCTGGGTATTAATGAGTAACTGTTGATAGATTCATGGGTTCACGTGCTGTGGAGGCAGCGTGGTGGGCTGAAAATGGCACATGTTGTGGCAACCTCCAGGCCCAGATTCAAATCCCTGCTCCTTCATGTCCCACTTCTGTGACCTTGGCAGAAAGAGTCCCTCCCCCTCAGCTCTGAGCCTTGTACGGCTGATTGGGAGAACACAGTGGGATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGGAGACC
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Task1_train_935
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Located on Chromosome 1, this mutation impacts BSND (barttin CLCNK type accessory subunit beta). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; Bartter syndrome
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CCCGGGGGAAGCGCCTTGCTCAGCGCCGGGCGGCCCACGAGGCCCTGCAGGACCGCGGCTGCGGAGACCGTTCCCGCCACCCGCCTGGGCTCCAGGGCCAGACGGGCTGAGGTCCCTCTGGGCCTCCGTCTCCTTTCCAGGGAGGGGCACCGGCTAGGTAACACGGCACTCGCCCTTTCCCTTCTCTGAGCCTGTAGTAGATGATGATAATAATGTTTCCGTGGAAGGTCCTGCTTTGTTAATAGTCACAGATTACAAAGTACTTGCCTTTTCCCACTCCCCTTATGTCCCTTCCCTGTACAAAACCTGGGAGGTGGCCTAATACCTATCCCCAATCTGCAGTTGACAAAACTCTAGCCCGGAGCAGAGCCACCTGCCTGAGCTCACCCTGAGAACCAGACCTGGACATGACCTGATAACTCAGCCCTTTCCTGCCCCTCAGCCATCGCTCAGCCAGGGCCCCTGAGCTCCCTCCAGGACCTCCTCTGCGAACTGTCAAGTGCACCTGGACTCTGAGGGCTGGCGATGGTGGGTGTGAGGAAGGAGAAACCCCTGTTGGAAAAAGGGCCTATGAGAAGGACGTCTAGTTAGAGGGGCAGCTGTGAGCACAGGTGTGGGGTTAGGGAACAAGGGCAGCCCTGCTGGCAGGAGGGGAGAAGGTGATGACCGCCAACAGGAAATCCCCAAGCCCAGCAAGTCAGGGAGCCCATTGAAAGCCTTTTATCCTGCATCGGCGATTTAACCCCATGTAAACGCCAAGTGAACATTCTCTTGTAGAGACCGATGGTCCTCATTTTCCTGTAATCCTGTAAAGGAATCTGATTTCTTCCATCAGCCTGTCCCTAGGACTAAAATGCCTCATTAGTGTTATTCTTAGGAAGGCATCTTCCTAGATCAGGCTGCAAGGAAATGGAGGAAGTGACTGTCAGTCACTCACACCCTGCAGGGGCACTAATTCCGAGAGCCTTAGGGGTGGGTGGGGAGCAGTTCATTGAAAGCCCAACTGGGTGGTGCATAGCGTGTGAATGTGAAGGGGATGGAGGAACCCAAGGAGGCCAGGCCTGGAGACAGCACCAAATCTGGGAGGTACATTATTATTCCCATTTTACAGAGGAGGAAACTGAGGTAACCTGATCATGACCACACTGCCCCACAGTAGAGGAGCCAGAATCCAAACCCAGGCAGCCTGCCTTGCCACCAGAGCCACGCTTTTCACCCTCAAGCTGCAGTTAAGAAGTATCACGCCGTGGCTAGGCCCACGGCCTCTGGCTTCACATCCCACTAGCTCTGCCATCTTTAGCTGTGTGACCTTGGGCAAGTTACTTGTCTGTGCCCGAGGGTCCTCTGTAAAGTGGGGATAGTAGTAGCTGCTTCACTGGGTTCCCTTCAATGAGTTAATAGCTGTAACATGTTTAGAATGGTGCCCTGCACATAGTCACCAGCCAGTACATATGGGCCATTATTCCTGAACCCTGGATAGGCACATGTCCTTGAAGAGTGTAGAATTCTTCAGGATTCTGAAATGCCAGCCTGTGGGATCCTGGAATCCTCCAATAGCATTCTAACAGCTCTCAGCTGCAGAACTGTACCCTGTTTTCTAGAGCTGGAAGGTGTGAGGCTGCCTGTCCACCCAGCTCAACCCCACAGTAGGCAAATGAGGTGATGTCAAAGCCTTGGCTGGGGCCCAGCCCCGGTAACCTCCCACTCTCCCTCCCCTGTGTGCTCCCTCGCTCAGATTCACACACACACTCCAGGCCAGCCGGGCCCAGAGGGAAGGTGAGAGGGCAAGGAGTAAAGGTGGCTGGGTGTGGGTCCGTTGAAGCGAGCCGCCTCCAGCCCTGTTGAACTGGTGGGCCCAGGGACTGGAGCGGGATTGAAAGGGATCTTGCTCTCCCTTGAAGCCTTGAGTTGCAGCGATTTCAGTGTCTTCTCTCCCTGTGTAAGCCTGTCTCGGTGTTTAGGCTGAACTACAGCCACCCCCTCTCCCGGGGGTGTGCAGGCCAGGGACTGGCCAGGCAGCCATGGCTGACGAGAAGACCTTCCGGATCGGCTTCATTGTGCTGGGGCTTTTCCTGCTGGCCCTCGGTACGTTCCTCATGAGCCATGATCGGCCCCAGGTCTACGGCACCTTCTATGCCATGGGCAGCGTCATGGTGATCGGGGGCATCATCTGGAGCATGTGCCAGTGCTACCCCAAGGTAGGTGGTAGTGGGGCTGGGTGGGGCCAGGTCAGCTGGGGCCAGGAGGGCTGGACACTGTGCCTGTATGCCATGCCTCACCCCCTATCCTTTAGTTGTCTTTTCATTCTTCTCATTTTGACTCGGTCTTCTCTCTGCTCTCCTGAGCGTCTGTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCCTTAGCCTAAGGGTTGATCAGAAGGCCCCTGGATCTGGAGCCCTGAGCCGGAAGCTATGGTATAGACACAGCAAACACAACACACCATGTGCTTGAAACAAAAGCTAATGAGCGCTGACCCCCTGCCAGGCACTCCTGCGTTCAGGGTGCAGTTCAGCCCTCATCCTAAGCCTTTTGGTGCTTTCTGTAGTTCCACCTTCTGAGCCTTTCTGAGGTCCAGAAAGAGAGGCTGCACAGCTAACGAGCAAGGTTTGGAGCTCAGATGCGTGTGACTTACACGTCACCCTTCACCTTGGGTCTTCTACCTCTGGGTCCCAGAGCGACTGAGAGCTCCAGGGTAGGTCAGGTCTAACCTTGGTGGCATGCACTGGGCAGTATCCTTTAGAGTCTTCATGTATTCTCAGCCTTATGTGTAATTTAGTGATGGGAAGAGCACTGGTTTGGGAGTCCTGAGTTCTAGTTCAAGTCCTGTTCCAAACTCTCTATGACCTTTGTCTTTCTGAGCCTCATTTTTTTCATCTGCAAATGAGATCCCTGCCCCTATTTTCCACAGAGCTTCACAGGGTCATTATAAAGATCAGAGAAGAGATAAGATATAGGAATATTTTGTAAACTGTAAGGTGTTATTTATAGATGAAGGGCTACCACTGTTACCCATACTGATCCTCCCAACAGCTCTGTGGAATGGAAATGCCAGGAGTTGCGAATCTTCAATGCCTAGAGAGGCTGGGTGACTTCCAAGGTCACACAGCTGGTCAGGTACAGACCCAGGGAGAAAAGGAGGGAAATAGGGACTCTAACTTGGGCTCTGTCTCTTACTGCCTGGGAGACTTTGCTCAAGCCCCTTTCCTCTCTGAGCCTCAGTTTCCTCATTTGTACACTGTGTGAGTTAGGAGGGGGGGGTGGGAAAGGGGGTATATCTGGGGGCCCTGCTGGACCTAATATCTAGGGCTCCAGGTCCAGGCAGTCCTCAGCAACCCCCACACCTCCTCTCCTCCCACCTGGGTGGCTGTGCTCAGGGTTTCAGGGAAGAAGGGGGATGGCTCCCTGGGGCCTGGGCCGGCTCTCCCCAGCCCTGCCCCCTCCACGGGCCAACCCTGGGCTGTCATTCTGTTCAGTGCTGGAGCGGTCTGGGCTGGTTTGTAGTCATTTAGCAGGCAGTTTACAGTCAACTTGCCTCTGTCTGTGCAATTCCTTGAGCAGAGGTCACTGGGAGAAGTCCTTGGGGCCAAAGCCACTCATGTCACCACTGCTATTATAATCCTTCTCCCAGTGAGGAGGCTGGACCCTGGGGGACAGCAGAGGGATGGCAGAGGTGTGGAGAGGAGCATCCTTCCTGCCCCCGCTCTTAAATAGAGCTGGCTCTGGGATGGTTGGTAGGCTGATGGGAGTGACGGTAGAGGGGAGGGGAGGGGAGGAGGGAATATTGCTGGGTATTAATGAGTAACTGTTGATAGATTCATGGGTTCACGTGCTGTGGAGGCAGCGTGGTGGGCTGAAAATGGCACATGTTGTGGCAACCTCCAGGCCCAGATTCAAATCCCTGCTCCTTCATGTCCCACTTCTGTGACCTTGGCAGAAAGAGTCCCTCCCCCTCAGCTCTGAGCCTTGTACGGCTGATTGGGAGAACACAGTGGGATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGGAGACCTGGCA
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Task1_train_936
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A genetic alteration is present in BSND (barttin CLCNK type accessory subunit beta) on Chromosome 1. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Hearing loss, autosomal recessive
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GTCCCTCTGGGCCTCCGTCTCCTTTCCAGGGAGGGGCACCGGCTAGGTAACACGGCACTCGCCCTTTCCCTTCTCTGAGCCTGTAGTAGATGATGATAATAATGTTTCCGTGGAAGGTCCTGCTTTGTTAATAGTCACAGATTACAAAGTACTTGCCTTTTCCCACTCCCCTTATGTCCCTTCCCTGTACAAAACCTGGGAGGTGGCCTAATACCTATCCCCAATCTGCAGTTGACAAAACTCTAGCCCGGAGCAGAGCCACCTGCCTGAGCTCACCCTGAGAACCAGACCTGGACATGACCTGATAACTCAGCCCTTTCCTGCCCCTCAGCCATCGCTCAGCCAGGGCCCCTGAGCTCCCTCCAGGACCTCCTCTGCGAACTGTCAAGTGCACCTGGACTCTGAGGGCTGGCGATGGTGGGTGTGAGGAAGGAGAAACCCCTGTTGGAAAAAGGGCCTATGAGAAGGACGTCTAGTTAGAGGGGCAGCTGTGAGCACAGGTGTGGGGTTAGGGAACAAGGGCAGCCCTGCTGGCAGGAGGGGAGAAGGTGATGACCGCCAACAGGAAATCCCCAAGCCCAGCAAGTCAGGGAGCCCATTGAAAGCCTTTTATCCTGCATCGGCGATTTAACCCCATGTAAACGCCAAGTGAACATTCTCTTGTAGAGACCGATGGTCCTCATTTTCCTGTAATCCTGTAAAGGAATCTGATTTCTTCCATCAGCCTGTCCCTAGGACTAAAATGCCTCATTAGTGTTATTCTTAGGAAGGCATCTTCCTAGATCAGGCTGCAAGGAAATGGAGGAAGTGACTGTCAGTCACTCACACCCTGCAGGGGCACTAATTCCGAGAGCCTTAGGGGTGGGTGGGGAGCAGTTCATTGAAAGCCCAACTGGGTGGTGCATAGCGTGTGAATGTGAAGGGGATGGAGGAACCCAAGGAGGCCAGGCCTGGAGACAGCACCAAATCTGGGAGGTACATTATTATTCCCATTTTACAGAGGAGGAAACTGAGGTAACCTGATCATGACCACACTGCCCCACAGTAGAGGAGCCAGAATCCAAACCCAGGCAGCCTGCCTTGCCACCAGAGCCACGCTTTTCACCCTCAAGCTGCAGTTAAGAAGTATCACGCCGTGGCTAGGCCCACGGCCTCTGGCTTCACATCCCACTAGCTCTGCCATCTTTAGCTGTGTGACCTTGGGCAAGTTACTTGTCTGTGCCCGAGGGTCCTCTGTAAAGTGGGGATAGTAGTAGCTGCTTCACTGGGTTCCCTTCAATGAGTTAATAGCTGTAACATGTTTAGAATGGTGCCCTGCACATAGTCACCAGCCAGTACATATGGGCCATTATTCCTGAACCCTGGATAGGCACATGTCCTTGAAGAGTGTAGAATTCTTCAGGATTCTGAAATGCCAGCCTGTGGGATCCTGGAATCCTCCAATAGCATTCTAACAGCTCTCAGCTGCAGAACTGTACCCTGTTTTCTAGAGCTGGAAGGTGTGAGGCTGCCTGTCCACCCAGCTCAACCCCACAGTAGGCAAATGAGGTGATGTCAAAGCCTTGGCTGGGGCCCAGCCCCGGTAACCTCCCACTCTCCCTCCCCTGTGTGCTCCCTCGCTCAGATTCACACACACACTCCAGGCCAGCCGGGCCCAGAGGGAAGGTGAGAGGGCAAGGAGTAAAGGTGGCTGGGTGTGGGTCCGTTGAAGCGAGCCGCCTCCAGCCCTGTTGAACTGGTGGGCCCAGGGACTGGAGCGGGATTGAAAGGGATCTTGCTCTCCCTTGAAGCCTTGAGTTGCAGCGATTTCAGTGTCTTCTCTCCCTGTGTAAGCCTGTCTCGGTGTTTAGGCTGAACTACAGCCACCCCCTCTCCCGGGGGTGTGCAGGCCAGGGACTGGCCAGGCAGCCATGGCTGACGAGAAGACCTTCCGGATCGGCTTCATTGTGCTGGGGCTTTTCCTGCTGGCCCTCGGTACGTTCCTCATGAGCCATGATCGGCCCCAGGTCTACGGCACCTTCTATGCCATGGGCAGCGTCATGGTGATCAGGGGCATCATCTGGAGCATGTGCCAGTGCTACCCCAAGGTAGGTGGTAGTGGGGCTGGGTGGGGCCAGGTCAGCTGGGGCCAGGAGGGCTGGACACTGTGCCTGTATGCCATGCCTCACCCCCTATCCTTTAGTTGTCTTTTCATTCTTCTCATTTTGACTCGGTCTTCTCTCTGCTCTCCTGAGCGTCTGTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCCTTAGCCTAAGGGTTGATCAGAAGGCCCCTGGATCTGGAGCCCTGAGCCGGAAGCTATGGTATAGACACAGCAAACACAACACACCATGTGCTTGAAACAAAAGCTAATGAGCGCTGACCCCCTGCCAGGCACTCCTGCGTTCAGGGTGCAGTTCAGCCCTCATCCTAAGCCTTTTGGTGCTTTCTGTAGTTCCACCTTCTGAGCCTTTCTGAGGTCCAGAAAGAGAGGCTGCACAGCTAACGAGCAAGGTTTGGAGCTCAGATGCGTGTGACTTACACGTCACCCTTCACCTTGGGTCTTCTACCTCTGGGTCCCAGAGCGACTGAGAGCTCCAGGGTAGGTCAGGTCTAACCTTGGTGGCATGCACTGGGCAGTATCCTTTAGAGTCTTCATGTATTCTCAGCCTTATGTGTAATTTAGTGATGGGAAGAGCACTGGTTTGGGAGTCCTGAGTTCTAGTTCAAGTCCTGTTCCAAACTCTCTATGACCTTTGTCTTTCTGAGCCTCATTTTTTTCATCTGCAAATGAGATCCCTGCCCCTATTTTCCACAGAGCTTCACAGGGTCATTATAAAGATCAGAGAAGAGATAAGATATAGGAATATTTTGTAAACTGTAAGGTGTTATTTATAGATGAAGGGCTACCACTGTTACCCATACTGATCCTCCCAACAGCTCTGTGGAATGGAAATGCCAGGAGTTGCGAATCTTCAATGCCTAGAGAGGCTGGGTGACTTCCAAGGTCACACAGCTGGTCAGGTACAGACCCAGGGAGAAAAGGAGGGAAATAGGGACTCTAACTTGGGCTCTGTCTCTTACTGCCTGGGAGACTTTGCTCAAGCCCCTTTCCTCTCTGAGCCTCAGTTTCCTCATTTGTACACTGTGTGAGTTAGGAGGGGGGGGTGGGAAAGGGGGTATATCTGGGGGCCCTGCTGGACCTAATATCTAGGGCTCCAGGTCCAGGCAGTCCTCAGCAACCCCCACACCTCCTCTCCTCCCACCTGGGTGGCTGTGCTCAGGGTTTCAGGGAAGAAGGGGGATGGCTCCCTGGGGCCTGGGCCGGCTCTCCCCAGCCCTGCCCCCTCCACGGGCCAACCCTGGGCTGTCATTCTGTTCAGTGCTGGAGCGGTCTGGGCTGGTTTGTAGTCATTTAGCAGGCAGTTTACAGTCAACTTGCCTCTGTCTGTGCAATTCCTTGAGCAGAGGTCACTGGGAGAAGTCCTTGGGGCCAAAGCCACTCATGTCACCACTGCTATTATAATCCTTCTCCCAGTGAGGAGGCTGGACCCTGGGGGACAGCAGAGGGATGGCAGAGGTGTGGAGAGGAGCATCCTTCCTGCCCCCGCTCTTAAATAGAGCTGGCTCTGGGATGGTTGGTAGGCTGATGGGAGTGACGGTAGAGGGGAGGGGAGGGGAGGAGGGAATATTGCTGGGTATTAATGAGTAACTGTTGATAGATTCATGGGTTCACGTGCTGTGGAGGCAGCGTGGTGGGCTGAAAATGGCACATGTTGTGGCAACCTCCAGGCCCAGATTCAAATCCCTGCTCCTTCATGTCCCACTTCTGTGACCTTGGCAGAAAGAGTCCCTCCCCCTCAGCTCTGAGCCTTGTACGGCTGATTGGGAGAACACAGTGGGATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGGAGACCTGGCATCACACCTGCCATGGAACATATGTGAAGGCATTGTTCTTAGGATTGAGGATTGGTATTTGCGGCACTGGGTGGGCCTCTGCATGAGTGCAGGTGTGTGTGAGTGTGTGTTT
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Task1_train_937
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This gene mutation involves BSND (barttin CLCNK type accessory subunit beta) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Bartter disease type 4A
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GTCCCTCTGGGCCTCCGTCTCCTTTCCAGGGAGGGGCACCGGCTAGGTAACACGGCACTCGCCCTTTCCCTTCTCTGAGCCTGTAGTAGATGATGATAATAATGTTTCCGTGGAAGGTCCTGCTTTGTTAATAGTCACAGATTACAAAGTACTTGCCTTTTCCCACTCCCCTTATGTCCCTTCCCTGTACAAAACCTGGGAGGTGGCCTAATACCTATCCCCAATCTGCAGTTGACAAAACTCTAGCCCGGAGCAGAGCCACCTGCCTGAGCTCACCCTGAGAACCAGACCTGGACATGACCTGATAACTCAGCCCTTTCCTGCCCCTCAGCCATCGCTCAGCCAGGGCCCCTGAGCTCCCTCCAGGACCTCCTCTGCGAACTGTCAAGTGCACCTGGACTCTGAGGGCTGGCGATGGTGGGTGTGAGGAAGGAGAAACCCCTGTTGGAAAAAGGGCCTATGAGAAGGACGTCTAGTTAGAGGGGCAGCTGTGAGCACAGGTGTGGGGTTAGGGAACAAGGGCAGCCCTGCTGGCAGGAGGGGAGAAGGTGATGACCGCCAACAGGAAATCCCCAAGCCCAGCAAGTCAGGGAGCCCATTGAAAGCCTTTTATCCTGCATCGGCGATTTAACCCCATGTAAACGCCAAGTGAACATTCTCTTGTAGAGACCGATGGTCCTCATTTTCCTGTAATCCTGTAAAGGAATCTGATTTCTTCCATCAGCCTGTCCCTAGGACTAAAATGCCTCATTAGTGTTATTCTTAGGAAGGCATCTTCCTAGATCAGGCTGCAAGGAAATGGAGGAAGTGACTGTCAGTCACTCACACCCTGCAGGGGCACTAATTCCGAGAGCCTTAGGGGTGGGTGGGGAGCAGTTCATTGAAAGCCCAACTGGGTGGTGCATAGCGTGTGAATGTGAAGGGGATGGAGGAACCCAAGGAGGCCAGGCCTGGAGACAGCACCAAATCTGGGAGGTACATTATTATTCCCATTTTACAGAGGAGGAAACTGAGGTAACCTGATCATGACCACACTGCCCCACAGTAGAGGAGCCAGAATCCAAACCCAGGCAGCCTGCCTTGCCACCAGAGCCACGCTTTTCACCCTCAAGCTGCAGTTAAGAAGTATCACGCCGTGGCTAGGCCCACGGCCTCTGGCTTCACATCCCACTAGCTCTGCCATCTTTAGCTGTGTGACCTTGGGCAAGTTACTTGTCTGTGCCCGAGGGTCCTCTGTAAAGTGGGGATAGTAGTAGCTGCTTCACTGGGTTCCCTTCAATGAGTTAATAGCTGTAACATGTTTAGAATGGTGCCCTGCACATAGTCACCAGCCAGTACATATGGGCCATTATTCCTGAACCCTGGATAGGCACATGTCCTTGAAGAGTGTAGAATTCTTCAGGATTCTGAAATGCCAGCCTGTGGGATCCTGGAATCCTCCAATAGCATTCTAACAGCTCTCAGCTGCAGAACTGTACCCTGTTTTCTAGAGCTGGAAGGTGTGAGGCTGCCTGTCCACCCAGCTCAACCCCACAGTAGGCAAATGAGGTGATGTCAAAGCCTTGGCTGGGGCCCAGCCCCGGTAACCTCCCACTCTCCCTCCCCTGTGTGCTCCCTCGCTCAGATTCACACACACACTCCAGGCCAGCCGGGCCCAGAGGGAAGGTGAGAGGGCAAGGAGTAAAGGTGGCTGGGTGTGGGTCCGTTGAAGCGAGCCGCCTCCAGCCCTGTTGAACTGGTGGGCCCAGGGACTGGAGCGGGATTGAAAGGGATCTTGCTCTCCCTTGAAGCCTTGAGTTGCAGCGATTTCAGTGTCTTCTCTCCCTGTGTAAGCCTGTCTCGGTGTTTAGGCTGAACTACAGCCACCCCCTCTCCCGGGGGTGTGCAGGCCAGGGACTGGCCAGGCAGCCATGGCTGACGAGAAGACCTTCCGGATCGGCTTCATTGTGCTGGGGCTTTTCCTGCTGGCCCTCGGTACGTTCCTCATGAGCCATGATCGGCCCCAGGTCTACGGCACCTTCTATGCCATGGGCAGCGTCATGGTGATCGGGGGCATCATCTGGAGCATGTGCCAGTGCTACCCCAAGGTAGGTGGTAGTGGGGCTGGGTGGGGCCAGGTCAGCTGGGGCCAGGAGGGCTGGACACTGTGCCTGTATGCCATGCCTCACCCCCTATCCTTTAGTTGTCTTTTCATTCTTCTCATTTTGACTCGGTCTTCTCTCTGCTCTCCTGAGCGTCTGTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCCTTAGCCTAAGGGTTGATCAGAAGGCCCCTGGATCTGGAGCCCTGAGCCGGAAGCTATGGTATAGACACAGCAAACACAACACACCATGTGCTTGAAACAAAAGCTAATGAGCGCTGACCCCCTGCCAGGCACTCCTGCGTTCAGGGTGCAGTTCAGCCCTCATCCTAAGCCTTTTGGTGCTTTCTGTAGTTCCACCTTCTGAGCCTTTCTGAGGTCCAGAAAGAGAGGCTGCACAGCTAACGAGCAAGGTTTGGAGCTCAGATGCGTGTGACTTACACGTCACCCTTCACCTTGGGTCTTCTACCTCTGGGTCCCAGAGCGACTGAGAGCTCCAGGGTAGGTCAGGTCTAACCTTGGTGGCATGCACTGGGCAGTATCCTTTAGAGTCTTCATGTATTCTCAGCCTTATGTGTAATTTAGTGATGGGAAGAGCACTGGTTTGGGAGTCCTGAGTTCTAGTTCAAGTCCTGTTCCAAACTCTCTATGACCTTTGTCTTTCTGAGCCTCATTTTTTTCATCTGCAAATGAGATCCCTGCCCCTATTTTCCACAGAGCTTCACAGGGTCATTATAAAGATCAGAGAAGAGATAAGATATAGGAATATTTTGTAAACTGTAAGGTGTTATTTATAGATGAAGGGCTACCACTGTTACCCATACTGATCCTCCCAACAGCTCTGTGGAATGGAAATGCCAGGAGTTGCGAATCTTCAATGCCTAGAGAGGCTGGGTGACTTCCAAGGTCACACAGCTGGTCAGGTACAGACCCAGGGAGAAAAGGAGGGAAATAGGGACTCTAACTTGGGCTCTGTCTCTTACTGCCTGGGAGACTTTGCTCAAGCCCCTTTCCTCTCTGAGCCTCAGTTTCCTCATTTGTACACTGTGTGAGTTAGGAGGGGGGGGTGGGAAAGGGGGTATATCTGGGGGCCCTGCTGGACCTAATATCTAGGGCTCCAGGTCCAGGCAGTCCTCAGCAACCCCCACACCTCCTCTCCTCCCACCTGGGTGGCTGTGCTCAGGGTTTCAGGGAAGAAGGGGGATGGCTCCCTGGGGCCTGGGCCGGCTCTCCCCAGCCCTGCCCCCTCCACGGGCCAACCCTGGGCTGTCATTCTGTTCAGTGCTGGAGCGGTCTGGGCTGGTTTGTAGTCATTTAGCAGGCAGTTTACAGTCAACTTGCCTCTGTCTGTGCAATTCCTTGAGCAGAGGTCACTGGGAGAAGTCCTTGGGGCCAAAGCCACTCATGTCACCACTGCTATTATAATCCTTCTCCCAGTGAGGAGGCTGGACCCTGGGGGACAGCAGAGGGATGGCAGAGGTGTGGAGAGGAGCATCCTTCCTGCCCCCGCTCTTAAATAGAGCTGGCTCTGGGATGGTTGGTAGGCTGATGGGAGTGACGGTAGAGGGGAGGGGAGGGGAGGAGGGAATATTGCTGGGTATTAATGAGTAACTGTTGATAGATTCATGGGTTCACGTGCTGTGGAGGCAGCGTGGTGGGCTGAAAATGGCACATGTTGTGGCAACCTCCAGGCCCAGATTCAAATCCCTGCTCCTTCATGTCCCACTTCTGTGACCTTGGCAGAAAGAGTCCCTCCCCCTCAGCTCTGAGCCTTGTACGGCTGATTGGGAGAACACAGTGGGATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGGAGACCTGGCATCACACCTGCCATGGAACATATGTGAAGGCATTGTTCTTAGGATTGAGGATTGGTATTTGCGGCACTGGGTGGGCCTCTGCATGAGTGCAGGTGTGTGTGAGTGTGTGTTT
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GTCCCTCTGGGCCTCCGTCTCCTTTCCAGGGAGGGGCACCGGCTAGGTAACACGGCACTCGCCCTTTCCCTTCTCTGAGCCTGTAGTAGATGATGATAATAATGTTTCCGTGGAAGGTCCTGCTTTGTTAATAGTCACAGATTACAAAGTACTTGCCTTTTCCCACTCCCCTTATGTCCCTTCCCTGTACAAAACCTGGGAGGTGGCCTAATACCTATCCCCAATCTGCAGTTGACAAAACTCTAGCCCGGAGCAGAGCCACCTGCCTGAGCTCACCCTGAGAACCAGACCTGGACATGACCTGATAACTCAGCCCTTTCCTGCCCCTCAGCCATCGCTCAGCCAGGGCCCCTGAGCTCCCTCCAGGACCTCCTCTGCGAACTGTCAAGTGCACCTGGACTCTGAGGGCTGGCGATGGTGGGTGTGAGGAAGGAGAAACCCCTGTTGGAAAAAGGGCCTATGAGAAGGACGTCTAGTTAGAGGGGCAGCTGTGAGCACAGGTGTGGGGTTAGGGAACAAGGGCAGCCCTGCTGGCAGGAGGGGAGAAGGTGATGACCGCCAACAGGAAATCCCCAAGCCCAGCAAGTCAGGGAGCCCATTGAAAGCCTTTTATCCTGCATCGGCGATTTAACCCCATGTAAACGCCAAGTGAACATTCTCTTGTAGAGACCGATGGTCCTCATTTTCCTGTAATCCTGTAAAGGAATCTGATTTCTTCCATCAGCCTGTCCCTAGGACTAAAATGCCTCATTAGTGTTATTCTTAGGAAGGCATCTTCCTAGATCAGGCTGCAAGGAAATGGAGGAAGTGACTGTCAGTCACTCACACCCTGCAGGGGCACTAATTCCGAGAGCCTTAGGGGTGGGTGGGGAGCAGTTCATTGAAAGCCCAACTGGGTGGTGCATAGCGTGTGAATGTGAAGGGGATGGAGGAACCCAAGGAGGCCAGGCCTGGAGACAGCACCAAATCTGGGAGGTACATTATTATTCCCATTTTACAGAGGAGGAAACTGAGGTAACCTGATCATGACCACACTGCCCCACAGTAGAGGAGCCAGAATCCAAACCCAGGCAGCCTGCCTTGCCACCAGAGCCACGCTTTTCACCCTCAAGCTGCAGTTAAGAAGTATCACGCCGTGGCTAGGCCCACGGCCTCTGGCTTCACATCCCACTAGCTCTGCCATCTTTAGCTGTGTGACCTTGGGCAAGTTACTTGTCTGTGCCCGAGGGTCCTCTGTAAAGTGGGGATAGTAGTAGCTGCTTCACTGGGTTCCCTTCAATGAGTTAATAGCTGTAACATGTTTAGAATGGTGCCCTGCACATAGTCACCAGCCAGTACATATGGGCCATTATTCCTGAACCCTGGATAGGCACATGTCCTTGAAGAGTGTAGAATTCTTCAGGATTCTGAAATGCCAGCCTGTGGGATCCTGGAATCCTCCAATAGCATTCTAACAGCTCTCAGCTGCAGAACTGTACCCTGTTTTCTAGAGCTGGAAGGTGTGAGGCTGCCTGTCCACCCAGCTCAACCCCACAGTAGGCAAATGAGGTGATGTCAAAGCCTTGGCTGGGGCCCAGCCCCGGTAACCTCCCACTCTCCCTCCCCTGTGTGCTCCCTCGCTCAGATTCACACACACACTCCAGGCCAGCCGGGCCCAGAGGGAAGGTGAGAGGGCAAGGAGTAAAGGTGGCTGGGTGTGGGTCCGTTGAAGCGAGCCGCCTCCAGCCCTGTTGAACTGGTGGGCCCAGGGACTGGAGCGGGATTGAAAGGGATCTTGCTCTCCCTTGAAGCCTTGAGTTGCAGCGATTTCAGTGTCTTCTCTCCCTGTGTAAGCCTGTCTCGGTGTTTAGGCTGAACTACAGCCACCCCCTCTCCCGGGGGTGTGCAGGCCAGGGACTGGCCAGGCAGCCATGGCTGACGAGAAGACCTTCCGGATCGGCTTCATTGTGCTGGGGCTTTTCCTGCTGGCCCTCGGTACGTTCCTCATGAGCCATGATCGGCCCCAGGTCTACGGCACCTTCTATGCCATGGGCAGCGTCATGGTGATCAGGGGCATCATCTGGAGCATGTGCCAGTGCTACCCCAAGGTAGGTGGTAGTGGGGCTGGGTGGGGCCAGGTCAGCTGGGGCCAGGAGGGCTGGACACTGTGCCTGTATGCCATGCCTCACCCCCTATCCTTTAGTTGTCTTTTCATTCTTCTCATTTTGACTCGGTCTTCTCTCTGCTCTCCTGAGCGTCTGTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCCTTAGCCTAAGGGTTGATCAGAAGGCCCCTGGATCTGGAGCCCTGAGCCGGAAGCTATGGTATAGACACAGCAAACACAACACACCATGTGCTTGAAACAAAAGCTAATGAGCGCTGACCCCCTGCCAGGCACTCCTGCGTTCAGGGTGCAGTTCAGCCCTCATCCTAAGCCTTTTGGTGCTTTCTGTAGTTCCACCTTCTGAGCCTTTCTGAGGTCCAGAAAGAGAGGCTGCACAGCTAACGAGCAAGGTTTGGAGCTCAGATGCGTGTGACTTACACGTCACCCTTCACCTTGGGTCTTCTACCTCTGGGTCCCAGAGCGACTGAGAGCTCCAGGGTAGGTCAGGTCTAACCTTGGTGGCATGCACTGGGCAGTATCCTTTAGAGTCTTCATGTATTCTCAGCCTTATGTGTAATTTAGTGATGGGAAGAGCACTGGTTTGGGAGTCCTGAGTTCTAGTTCAAGTCCTGTTCCAAACTCTCTATGACCTTTGTCTTTCTGAGCCTCATTTTTTTCATCTGCAAATGAGATCCCTGCCCCTATTTTCCACAGAGCTTCACAGGGTCATTATAAAGATCAGAGAAGAGATAAGATATAGGAATATTTTGTAAACTGTAAGGTGTTATTTATAGATGAAGGGCTACCACTGTTACCCATACTGATCCTCCCAACAGCTCTGTGGAATGGAAATGCCAGGAGTTGCGAATCTTCAATGCCTAGAGAGGCTGGGTGACTTCCAAGGTCACACAGCTGGTCAGGTACAGACCCAGGGAGAAAAGGAGGGAAATAGGGACTCTAACTTGGGCTCTGTCTCTTACTGCCTGGGAGACTTTGCTCAAGCCCCTTTCCTCTCTGAGCCTCAGTTTCCTCATTTGTACACTGTGTGAGTTAGGAGGGGGGGGTGGGAAAGGGGGTATATCTGGGGGCCCTGCTGGACCTAATATCTAGGGCTCCAGGTCCAGGCAGTCCTCAGCAACCCCCACACCTCCTCTCCTCCCACCTGGGTGGCTGTGCTCAGGGTTTCAGGGAAGAAGGGGGATGGCTCCCTGGGGCCTGGGCCGGCTCTCCCCAGCCCTGCCCCCTCCACGGGCCAACCCTGGGCTGTCATTCTGTTCAGTGCTGGAGCGGTCTGGGCTGGTTTGTAGTCATTTAGCAGGCAGTTTACAGTCAACTTGCCTCTGTCTGTGCAATTCCTTGAGCAGAGGTCACTGGGAGAAGTCCTTGGGGCCAAAGCCACTCATGTCACCACTGCTATTATAATCCTTCTCCCAGTGAGGAGGCTGGACCCTGGGGGACAGCAGAGGGATGGCAGAGGTGTGGAGAGGAGCATCCTTCCTGCCCCCGCTCTTAAATAGAGCTGGCTCTGGGATGGTTGGTAGGCTGATGGGAGTGACGGTAGAGGGGAGGGGAGGGGAGGAGGGAATATTGCTGGGTATTAATGAGTAACTGTTGATAGATTCATGGGTTCACGTGCTGTGGAGGCAGCGTGGTGGGCTGAAAATGGCACATGTTGTGGCAACCTCCAGGCCCAGATTCAAATCCCTGCTCCTTCATGTCCCACTTCTGTGACCTTGGCAGAAAGAGTCCCTCCCCCTCAGCTCTGAGCCTTGTACGGCTGATTGGGAGAACACAGTGGGATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGGAGACCTGGCATCACACCTGCCATGGAACATATGTGAAGGCATTGTTCTTAGGATTGAGGATTGGTATTTGCGGCACTGGGTGGGCCTCTGCATGAGTGCAGGTGTGTGTGAGTGTGTGTTT
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Task1_train_938
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A variant was discovered in gene BSND (barttin CLCNK type accessory subunit beta), Chromosome 1. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
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Pathogenic; Bartter syndrome type 4
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Task1_train_939
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Mutation context: Chromosome 1, Gene PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; not specified
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AAAAGGATGGGTGTTGACCCAGAAAGCACTTGTGGTGGAGGGGAGGCCCCAGAAGAGGCTTCTGACTTACCCTGATTGCTGGTACCTCTCAGGGGAGCTGGCTGCTTATTTGCTGGCCAGGGTGTGGGGGAACCCATTTGAGAAGAGGGAGAAGGTGACACAATTCCTTTGGGCAACTTATGGGAGGGGTAATTGGTGAGGGATGAAAGCCCTGCCAAGTGGCAGGAGGCCCAGCTGGGGCTGCCCCTCATAAGAGTGCAGTGGAGGATATGGGATGAGAAGTGACTGCCCCTCTGGTTCCATCTGTCGCAGAGCCCAGGGTGCTTCCTTCCTCCCCCACCTCCCTCAGAACACACCCACTGCATGCTGGACAGCAGCCCCCTTCCTGGGCCTGGGGACATCCATGTCCCTCTGTGCACAGGCTTCATCATTCTCTGGGTGCACGGTAACGACCCCGGTAGGTGAGAGGCCAAGGTCCCAAAGGGGAGCAGCAGGGAAAGTTAGCTCCCATCTATTCTTGCTCCAGGGGAGGCCTTTGATGAGGAAGCTGCCAAAAGCACATTGCAAATACAATTCCAATTACAGGCAACAGGAAGGAGAACCACCTCTGCCACCTCTGTCAGCAAACCATGAGCTCCTACTCTGTGCTGCGATGGCGGGCTCGATGGGGATAACTCTGACCTTACCTCATGGAGTCACTGTCAACCCACTGGTTGCACTGTCTTTGTGCACTGGCTCTCTGGAGTGAGGTCTTTGCAAACAAAGTGGAAAGAGCATCAACTTTGGACTCCAGCACCTAGATTCAGAGCAGGCCATTTCACTCGGAATCTGCTGTGCATCTGCAAGGGAGGATCATAAATTCGCCTTTGTTTCTTCCCAGTATCGACAGCCCTTCCAGAAAGAGCAAGCCTCATGTCATGCCACATGTACAATCTGAGGCCAGGAGCTCTCTTTCCCCTTTTCATCCTCCTGCCTGGTACACAATAGGTGTTTACTGGATGCTTGTCCAGTTGATTTCTTGAACATGGTGTGTAAAAGGAATCTTTGCAAATTGAATCTTCTGGAAAGCTGAGCTTGTGCCTACCATAGAATTCTGAATGTACCTATATGACGTCTTTGCAAACTTAAAACCTGAATCTTTGTAGTATAAATCCCTTGAAATGCATGTAGGCTGGACATCAAAAGCAAGCAATCTCTTCAAGGAGCAGCTAGTTGGTAAGGTCAGTGTGCAGGGTGCATAAAGGGCAGAGGCCGGAGGGGGTCCAGGCTAAGTTTAGAAGGCTGCCAGGTTAAGGCCAGTGGAAAGAATTCGGTGGGCAGCGAGGAGTCCACAGTAGGATTGATTCAGAAGTCTCACTGGTCAGCAGGAGACAAGGTGGACCCAGGAAACACTGAAAAGGTGGGCCCGGCAGAACTTGGAGTCTGGCATCCCACGCAGGGTGAGAGGCGGGAGAGGAGGAGCCCCTAGGGCGCCGGCCTGCCTTCCAGCCCAGTTAGGATTTGGGAGTTTTTTCTTCCCTCTGCGCGTAATCTGACGCTGTTTGGGGAGGGCGAGGCCGAAACCTGATCCTCCAGTCCGGGGGTTCCGTTAATGTTTAATCAGATAGGATCGTCCGATGGGGCTCTGGTGGCGTGATCTGCGCGCCCCAGGCGTCAAGCACCCACACCCTAGAAGGTTTCCGCAGCGACGTCGAGGCGCTCATGGTTGCAGGCGGGCGCCGCCGTTCAGTTCAGGGTCTGAGCCTGGAGGAGTGAGCCAGGCAGTGAGACTGGCTCGGGCGGGCCGGGACGCGTCGTTGCAGCAGCGGCTCCCAGCTCCCAGCCAGGATTCCGCGCGCCCCTTCACGCGCCCTGCTCCTGAACTTCAGCTCCTGCACAGTCCTCCCCACCGCAAGGCTCAAGGCGCCGCCGGCGTGGACCGCGCACGGCCTCTAGGTCTCCTCGCCAGGACAGCAACCTCTCCCCTGGCCCTCATGGGCACCGTCAGCTCCAGGCGGTCCTGGTGGCCGCTGCCACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGGGTCCCGCGGGCGCCCGTGCGCAGGAGGACGAGGACGGCGACTACGAGGAGCTGGTGCTAGCCTTGCGTTCCGAGGAGGACGGCCTGGCCGAAGCACCCGAGCACGGAACCACAGCCACCTTCCACCGCTGCGCCAAGGTGCGGGTGTAGGGATGGGAGGCCGGGGCGAACCCGCAGCCGGGACGGTGCGGTGCTGTTTCCTCTCGGGCCTCAGTTTCCCCCCATGTAAGAGAGGAAGTGGAGTGCAGGTCGCCGAGGGCTCTTCGCTTGGCACGATCTTGGGGACTGCAGGCAAGGCGGCGGGGGAGGACGGGTAGTGGGGAGCACGGTGGAGAGCGGGGACGGCCGGCTCTTTGGGGACTTGCTGGGGCGTGCGGCTGCGCTATTCAGTGGGAAGGTTCGCGGGGTTGGGAGACCCGGAGGCCGAGGAAGGGCGAGCAGAGCACTGCCAGGATATCCTGCCCAGATTTCCCAGTTTCTGCCTCGCCGCGGCACAGGTGGGTGAAGGAGTGAATGCCTGGAACGTACTGGGAACTGCACCAGGCACAGAGAAAGCGGGCTTGCCATTATAGTGGGTTCCGATTTGGTTTGGAAAACATGGGCAGCGGAGGGTGGAGGGCCTGGAGAGAAGGCCCTACCCGAGACAGGGGCGGGGTGGGAAGGACGGCAGATGCTGGGAGCACGAGGCAATTTCTTTATGACACAGAACTCATGCTCTAGTATTCCATCTGTTTCAGCCGAAGAAAAGAACCAGCTGAAGGGGCAGGGGAGAAGGGGCGGAGGTATTCTCGAGGCCCATTGGCGTCCTTTAGGACTCAGGCAGGGAAGGGCCCTTGGTGCTCTGGAGCCGGAGGTGGTGCGCCTGGTACTGGGACCCCGGAGCTGAGCCCGGCGCCTCAGCCCACCTGGCTGTCTGCCGACCGTGTGCGGGGCGAGTTTGCTCAACAACTCTGCCAGCTTCTGGCCCTCAGGCTGTGGGAAGCTTCTTCCCGGGGCGAGACCACTAGCTTTTTCTAAGTATTACCAGCCCAGGACTTGGCTGAGGTTCTGTGTCCCCCAGCTTGGAGTCAGATGTGGGGTTGAATCTTGGCTTCCTCTCACTAGCTGTGGTGCTTGACAAGTCACTTATCCTTGAGCCTCCATTGCCTAATCTTTAAAAGGGAGGTGACAATCGTCCCTACGGCTCAGTGGCAGCAGATGGGGAGATGAAGGGAAAGTTCTGTTGACCATGAGTGAACTTACAATGCAAGCCCCGGGGGGATCACTTGCAGTTTTGTCCCTGTCTGCAGTGTGACCTGTTGGTGACATTGTCTTTGCTCCAAACCACAGCTCCTGGGGCAGAGGGGAAAATTCTGCCACTCACAGCTGCCTGCCCACGCTTCTGTCTGAGTGTGCTGGGTGGCAGGATGGCAAGTCCTTACTCAGCTCAGTATAGCCCTCTTCCTTGTTCCCTGAGCCTTTGACTTTCTCGAGGGATGTTGTGGGGTTGTGGCCAGGATAAGAAAGGGCATTTCAAGTTACCACTGCTCCAAAACAACTGTTCTGGAAATAGTGAGTACCCCATCCTGAGAGGTGAGTAAGCAGAGGCTGTATGACCACCTGAACCAAGCCCTTGAGGATGTTTCTTCTCTGGTGGAAGTTTGGAACAGGAGCCTCCTCAAGTTCATTTATTCATTCATTCAATGGTTATTTTGTGGGAATCGAATTTAGAATGAAAATATTTTTTGGCAAGCAGAAAATAATTTTTAGACCAATCCTTTTCTTTTAGTCATGAGAAACTGAGGCCCAGAGAGAGGAGGTCACCCCAGGTGCATTAGAACTGGGTTTCCAGAACTGACACTCCACTGCACAGAGTACTCTCCCAATTCATTCAATTTTTATTTAGCGGAAGGCATTTTCAGATGGGTCTTTGAAGCATTAGTAGGAGTTCAGCGATGATGGTGTCATGAGAATTTTATTCTAGGATTAGGAGGTACCATGAACAAAGATACAGAGCTGGGAAAACCAGAGGTGGAAGATAAGGAGCACATGTCCACAGTTCTTTTTCTTTTTTT
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Task1_train_940
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_941
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Chromosome 1 houses a mutation in gene PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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ACTTACCCTGATTGCTGGTACCTCTCAGGGGAGCTGGCTGCTTATTTGCTGGCCAGGGTGTGGGGGAACCCATTTGAGAAGAGGGAGAAGGTGACACAATTCCTTTGGGCAACTTATGGGAGGGGTAATTGGTGAGGGATGAAAGCCCTGCCAAGTGGCAGGAGGCCCAGCTGGGGCTGCCCCTCATAAGAGTGCAGTGGAGGATATGGGATGAGAAGTGACTGCCCCTCTGGTTCCATCTGTCGCAGAGCCCAGGGTGCTTCCTTCCTCCCCCACCTCCCTCAGAACACACCCACTGCATGCTGGACAGCAGCCCCCTTCCTGGGCCTGGGGACATCCATGTCCCTCTGTGCACAGGCTTCATCATTCTCTGGGTGCACGGTAACGACCCCGGTAGGTGAGAGGCCAAGGTCCCAAAGGGGAGCAGCAGGGAAAGTTAGCTCCCATCTATTCTTGCTCCAGGGGAGGCCTTTGATGAGGAAGCTGCCAAAAGCACATTGCAAATACAATTCCAATTACAGGCAACAGGAAGGAGAACCACCTCTGCCACCTCTGTCAGCAAACCATGAGCTCCTACTCTGTGCTGCGATGGCGGGCTCGATGGGGATAACTCTGACCTTACCTCATGGAGTCACTGTCAACCCACTGGTTGCACTGTCTTTGTGCACTGGCTCTCTGGAGTGAGGTCTTTGCAAACAAAGTGGAAAGAGCATCAACTTTGGACTCCAGCACCTAGATTCAGAGCAGGCCATTTCACTCGGAATCTGCTGTGCATCTGCAAGGGAGGATCATAAATTCGCCTTTGTTTCTTCCCAGTATCGACAGCCCTTCCAGAAAGAGCAAGCCTCATGTCATGCCACATGTACAATCTGAGGCCAGGAGCTCTCTTTCCCCTTTTCATCCTCCTGCCTGGTACACAATAGGTGTTTACTGGATGCTTGTCCAGTTGATTTCTTGAACATGGTGTGTAAAAGGAATCTTTGCAAATTGAATCTTCTGGAAAGCTGAGCTTGTGCCTACCATAGAATTCTGAATGTACCTATATGACGTCTTTGCAAACTTAAAACCTGAATCTTTGTAGTATAAATCCCTTGAAATGCATGTAGGCTGGACATCAAAAGCAAGCAATCTCTTCAAGGAGCAGCTAGTTGGTAAGGTCAGTGTGCAGGGTGCATAAAGGGCAGAGGCCGGAGGGGGTCCAGGCTAAGTTTAGAAGGCTGCCAGGTTAAGGCCAGTGGAAAGAATTCGGTGGGCAGCGAGGAGTCCACAGTAGGATTGATTCAGAAGTCTCACTGGTCAGCAGGAGACAAGGTGGACCCAGGAAACACTGAAAAGGTGGGCCCGGCAGAACTTGGAGTCTGGCATCCCACGCAGGGTGAGAGGCGGGAGAGGAGGAGCCCCTAGGGCGCCGGCCTGCCTTCCAGCCCAGTTAGGATTTGGGAGTTTTTTCTTCCCTCTGCGCGTAATCTGACGCTGTTTGGGGAGGGCGAGGCCGAAACCTGATCCTCCAGTCCGGGGGTTCCGTTAATGTTTAATCAGATAGGATCGTCCGATGGGGCTCTGGTGGCGTGATCTGCGCGCCCCAGGCGTCAAGCACCCACACCCTAGAAGGTTTCCGCAGCGACGTCGAGGCGCTCATGGTTGCAGGCGGGCGCCGCCGTTCAGTTCAGGGTCTGAGCCTGGAGGAGTGAGCCAGGCAGTGAGACTGGCTCGGGCGGGCCGGGACGCGTCGTTGCAGCAGCGGCTCCCAGCTCCCAGCCAGGATTCCGCGCGCCCCTTCACGCGCCCTGCTCCTGAACTTCAGCTCCTGCACAGTCCTCCCCACCGCAAGGCTCAAGGCGCCGCCGGCGTGGACCGCGCACGGCCTCTAGGTCTCCTCGCCAGGACAGCAACCTCTCCCCTGGCCCTCATGGGCACCGTCAGCTCCAGGCGGTCCTGGTGGCCGCTGCCACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGGGTCCCGCGGGCGCCCGTGCGCAGGAGGACGAGGACGGCGACTACGAGGAGCTGGTGCTAGCCTTGCGTTCCGAGGAGGACGGCCTGGCCGAAGCACCCGAGCACGGAACCACAGCCACCTTCCACCGCTGCGCCAAGGTGCGGGTGTAGGGATGGGAGGCCGGGGCGAACCCGCAGCCGGGACGGTGCGGTGCTGTTTCCTCTCGGGCCTCAGTTTCCCCCCATGTAAGAGAGGAAGTGGAGTGCAGGTCGCCGAGGGCTCTTCGCTTGGCACGATCTTGGGGACTGCAGGCAAGGCGGCGGGGGAGGACGGGTAGTGGGGAGCACGGTGGAGAGCGGGGACGGCCGGCTCTTTGGGGACTTGCTGGGGCGTGCGGCTGCGCTATTCAGTGGGAAGGTTCGCGGGGTTGGGAGACCCGGAGGCCGAGGAAGGGCGAGCAGAGCACTGCCAGGATATCCTGCCCAGATTTCCCAGTTTCTGCCTCGCCGCGGCACAGGTGGGTGAAGGAGTGAATGCCTGGAACGTACTGGGAACTGCACCAGGCACAGAGAAAGCGGGCTTGCCATTATAGTGGGTTCCGATTTGGTTTGGAAAACATGGGCAGCGGAGGGTGGAGGGCCTGGAGAGAAGGCCCTACCCGAGACAGGGGCGGGGTGGGAAGGACGGCAGATGCTGGGAGCACGAGGCAATTTCTTTATGACACAGAACTCATGCTCTAGTATTCCATCTGTTTCAGCCGAAGAAAAGAACCAGCTGAAGGGGCAGGGGAGAAGGGGCGGAGGTATTCTCGAGGCCCATTGGCGTCCTTTAGGACTCAGGCAGGGAAGGGCCCTTGGTGCTCTGGAGCCGGAGGTGGTGCGCCTGGTACTGGGACCCCGGAGCTGAGCCCGGCGCCTCAGCCCACCTGGCTGTCTGCCGACCGTGTGCGGGGCGAGTTTGCTCAACAACTCTGCCAGCTTCTGGCCCTCAGGCTGTGGGAAGCTTCTTCCCGGGGCGAGACCACTAGCTTTTTCTAAGTATTACCAGCCCAGGACTTGGCTGAGGTTCTGTGTCCCCCAGCTTGGAGTCAGATGTGGGGTTGAATCTTGGCTTCCTCTCACTAGCTGTGGTGCTTGACAAGTCACTTATCCTTGAGCCTCCATTGCCTAATCTTTAAAAGGGAGGTGACAATCGTCCCTACGGCTCAGTGGCAGCAGATGGGGAGATGAAGGGAAAGTTCTGTTGACCATGAGTGAACTTACAATGCAAGCCCCGGGGGGATCACTTGCAGTTTTGTCCCTGTCTGCAGTGTGACCTGTTGGTGACATTGTCTTTGCTCCAAACCACAGCTCCTGGGGCAGAGGGGAAAATTCTGCCACTCACAGCTGCCTGCCCACGCTTCTGTCTGAGTGTGCTGGGTGGCAGGATGGCAAGTCCTTACTCAGCTCAGTATAGCCCTCTTCCTTGTTCCCTGAGCCTTTGACTTTCTCGAGGGATGTTGTGGGGTTGTGGCCAGGATAAGAAAGGGCATTTCAAGTTACCACTGCTCCAAAACAACTGTTCTGGAAATAGTGAGTACCCCATCCTGAGAGGTGAGTAAGCAGAGGCTGTATGACCACCTGAACCAAGCCCTTGAGGATGTTTCTTCTCTGGTGGAAGTTTGGAACAGGAGCCTCCTCAAGTTCATTTATTCATTCATTCAATGGTTATTTTGTGGGAATCGAATTTAGAATGAAAATATTTTTTGGCAAGCAGAAAATAATTTTTAGACCAATCCTTTTCTTTTAGTCATGAGAAACTGAGGCCCAGAGAGAGGAGGTCACCCCAGGTGCATTAGAACTGGGTTTCCAGAACTGACACTCCACTGCACAGAGTACTCTCCCAATTCATTCAATTTTTATTTAGCGGAAGGCATTTTCAGATGGGTCTTTGAAGCATTAGTAGGAGTTCAGCGATGATGGTGTCATGAGAATTTTATTCTAGGATTAGGAGGTACCATGAACAAAGATACAGAGCTGGGAAAACCAGAGGTGGAAGATAAGGAGCACATGTCCACAGTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTCAGCTCACTG
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ACTTACCCTGATTGCTGGTACCTCTCAGGGGAGCTGGCTGCTTATTTGCTGGCCAGGGTGTGGGGGAACCCATTTGAGAAGAGGGAGAAGGTGACACAATTCCTTTGGGCAACTTATGGGAGGGGTAATTGGTGAGGGATGAAAGCCCTGCCAAGTGGCAGGAGGCCCAGCTGGGGCTGCCCCTCATAAGAGTGCAGTGGAGGATATGGGATGAGAAGTGACTGCCCCTCTGGTTCCATCTGTCGCAGAGCCCAGGGTGCTTCCTTCCTCCCCCACCTCCCTCAGAACACACCCACTGCATGCTGGACAGCAGCCCCCTTCCTGGGCCTGGGGACATCCATGTCCCTCTGTGCACAGGCTTCATCATTCTCTGGGTGCACGGTAACGACCCCGGTAGGTGAGAGGCCAAGGTCCCAAAGGGGAGCAGCAGGGAAAGTTAGCTCCCATCTATTCTTGCTCCAGGGGAGGCCTTTGATGAGGAAGCTGCCAAAAGCACATTGCAAATACAATTCCAATTACAGGCAACAGGAAGGAGAACCACCTCTGCCACCTCTGTCAGCAAACCATGAGCTCCTACTCTGTGCTGCGATGGCGGGCTCGATGGGGATAACTCTGACCTTACCTCATGGAGTCACTGTCAACCCACTGGTTGCACTGTCTTTGTGCACTGGCTCTCTGGAGTGAGGTCTTTGCAAACAAAGTGGAAAGAGCATCAACTTTGGACTCCAGCACCTAGATTCAGAGCAGGCCATTTCACTCGGAATCTGCTGTGCATCTGCAAGGGAGGATCATAAATTCGCCTTTGTTTCTTCCCAGTATCGACAGCCCTTCCAGAAAGAGCAAGCCTCATGTCATGCCACATGTACAATCTGAGGCCAGGAGCTCTCTTTCCCCTTTTCATCCTCCTGCCTGGTACACAATAGGTGTTTACTGGATGCTTGTCCAGTTGATTTCTTGAACATGGTGTGTAAAAGGAATCTTTGCAAATTGAATCTTCTGGAAAGCTGAGCTTGTGCCTACCATAGAATTCTGAATGTACCTATATGACGTCTTTGCAAACTTAAAACCTGAATCTTTGTAGTATAAATCCCTTGAAATGCATGTAGGCTGGACATCAAAAGCAAGCAATCTCTTCAAGGAGCAGCTAGTTGGTAAGGTCAGTGTGCAGGGTGCATAAAGGGCAGAGGCCGGAGGGGGTCCAGGCTAAGTTTAGAAGGCTGCCAGGTTAAGGCCAGTGGAAAGAATTCGGTGGGCAGCGAGGAGTCCACAGTAGGATTGATTCAGAAGTCTCACTGGTCAGCAGGAGACAAGGTGGACCCAGGAAACACTGAAAAGGTGGGCCCGGCAGAACTTGGAGTCTGGCATCCCACGCAGGGTGAGAGGCGGGAGAGGAGGAGCCCCTAGGGCGCCGGCCTGCCTTCCAGCCCAGTTAGGATTTGGGAGTTTTTTCTTCCCTCTGCGCGTAATCTGACGCTGTTTGGGGAGGGCGAGGCCGAAACCTGATCCTCCAGTCCGGGGGTTCCGTTAATGTTTAATCAGATAGGATCGTCCGATGGGGCTCTGGTGGCGTGATCTGCGCGCCCCAGGCGTCAAGCACCCACACCCTAGAAGGTTTCCGCAGCGACGTCGAGGCGCTCATGGTTGCAGGCGGGCGCCGCCGTTCAGTTCAGGGTCTGAGCCTGGAGGAGTGAGCCAGGCAGTGAGACTGGCTCGGGCGGGCCGGGACGCGTCGTTGCAGCAGCGGCTCCCAGCTCCCAGCCAGGATTCCGCGCGCCCCTTCACGCGCCCTGCTCCTGAACTTCAGCTCCTGCACAGTCCTCCCCACCGCAAGGCTCAAGGCGCCGCCGGCGTGGACCGCGCACGGCCTCTAGGTCTCCTCGCCAGGACAGCAACCTCTCCCCTGGCCCTCATGGGCACCGTCAGCTCCAGGCGGTCCTGGTGGCCGCTGCCACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGGGTCCCGCGGGCGCCCGTGCGCAGGAGGACGAGGACGGCGACTACGAGGAGCTGGTGCTAGCCTTGCGTTGCGAGGAGGACGGCCTGGCCGAAGCACCCGAGCACGGAACCACAGCCACCTTCCACCGCTGCGCCAAGGTGCGGGTGTAGGGATGGGAGGCCGGGGCGAACCCGCAGCCGGGACGGTGCGGTGCTGTTTCCTCTCGGGCCTCAGTTTCCCCCCATGTAAGAGAGGAAGTGGAGTGCAGGTCGCCGAGGGCTCTTCGCTTGGCACGATCTTGGGGACTGCAGGCAAGGCGGCGGGGGAGGACGGGTAGTGGGGAGCACGGTGGAGAGCGGGGACGGCCGGCTCTTTGGGGACTTGCTGGGGCGTGCGGCTGCGCTATTCAGTGGGAAGGTTCGCGGGGTTGGGAGACCCGGAGGCCGAGGAAGGGCGAGCAGAGCACTGCCAGGATATCCTGCCCAGATTTCCCAGTTTCTGCCTCGCCGCGGCACAGGTGGGTGAAGGAGTGAATGCCTGGAACGTACTGGGAACTGCACCAGGCACAGAGAAAGCGGGCTTGCCATTATAGTGGGTTCCGATTTGGTTTGGAAAACATGGGCAGCGGAGGGTGGAGGGCCTGGAGAGAAGGCCCTACCCGAGACAGGGGCGGGGTGGGAAGGACGGCAGATGCTGGGAGCACGAGGCAATTTCTTTATGACACAGAACTCATGCTCTAGTATTCCATCTGTTTCAGCCGAAGAAAAGAACCAGCTGAAGGGGCAGGGGAGAAGGGGCGGAGGTATTCTCGAGGCCCATTGGCGTCCTTTAGGACTCAGGCAGGGAAGGGCCCTTGGTGCTCTGGAGCCGGAGGTGGTGCGCCTGGTACTGGGACCCCGGAGCTGAGCCCGGCGCCTCAGCCCACCTGGCTGTCTGCCGACCGTGTGCGGGGCGAGTTTGCTCAACAACTCTGCCAGCTTCTGGCCCTCAGGCTGTGGGAAGCTTCTTCCCGGGGCGAGACCACTAGCTTTTTCTAAGTATTACCAGCCCAGGACTTGGCTGAGGTTCTGTGTCCCCCAGCTTGGAGTCAGATGTGGGGTTGAATCTTGGCTTCCTCTCACTAGCTGTGGTGCTTGACAAGTCACTTATCCTTGAGCCTCCATTGCCTAATCTTTAAAAGGGAGGTGACAATCGTCCCTACGGCTCAGTGGCAGCAGATGGGGAGATGAAGGGAAAGTTCTGTTGACCATGAGTGAACTTACAATGCAAGCCCCGGGGGGATCACTTGCAGTTTTGTCCCTGTCTGCAGTGTGACCTGTTGGTGACATTGTCTTTGCTCCAAACCACAGCTCCTGGGGCAGAGGGGAAAATTCTGCCACTCACAGCTGCCTGCCCACGCTTCTGTCTGAGTGTGCTGGGTGGCAGGATGGCAAGTCCTTACTCAGCTCAGTATAGCCCTCTTCCTTGTTCCCTGAGCCTTTGACTTTCTCGAGGGATGTTGTGGGGTTGTGGCCAGGATAAGAAAGGGCATTTCAAGTTACCACTGCTCCAAAACAACTGTTCTGGAAATAGTGAGTACCCCATCCTGAGAGGTGAGTAAGCAGAGGCTGTATGACCACCTGAACCAAGCCCTTGAGGATGTTTCTTCTCTGGTGGAAGTTTGGAACAGGAGCCTCCTCAAGTTCATTTATTCATTCATTCAATGGTTATTTTGTGGGAATCGAATTTAGAATGAAAATATTTTTTGGCAAGCAGAAAATAATTTTTAGACCAATCCTTTTCTTTTAGTCATGAGAAACTGAGGCCCAGAGAGAGGAGGTCACCCCAGGTGCATTAGAACTGGGTTTCCAGAACTGACACTCCACTGCACAGAGTACTCTCCCAATTCATTCAATTTTTATTTAGCGGAAGGCATTTTCAGATGGGTCTTTGAAGCATTAGTAGGAGTTCAGCGATGATGGTGTCATGAGAATTTTATTCTAGGATTAGGAGGTACCATGAACAAAGATACAGAGCTGGGAAAACCAGAGGTGGAAGATAAGGAGCACATGTCCACAGTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTCAGCTCACTG
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Task1_train_942
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This genomic variant is located on Chromosome 1, within the PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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Task1_train_943
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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ACCAGAGGTGGAAGATAAGGAGCACATGTCCACAGTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACATCTGTCTCCCGGGTTCAAGTGGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGAAGCTGGGATTACAGGTACCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCACGTTGGCCAGGCTAGTCGCAAACTCCTGACCTCCTCAGTGGATCCGAGGAGGTGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTCGAATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCTGGCCTCCACAGTTCTTTATCCACCGTCTGAAATGTAAAATGTTACGAAAACCAAAAGTTTTTTTTGTGATTTATTTGATGGTAGCACCTGACGTGAACTGACATGAGATTATTTTTAATTTAGTTGTGTGAATATGCATATTCATATATTTTGCTGCATAGATTACAGTATGCAGCTCCAGATTCTTCCAAGCAGACTCTGATTGCCCATTACTGCCTTTCTAAAATCCAAACAAGTTCTGAGGTTCAAAACCGTTTTGGCCCTAAGGCTTTGGGTAAAGGGGGTGGACTCTGTTCTACTCTGACTGGAGTCCAAGATGCATATATACAGAGATATGGGTGATGGGGCTGCAAGGTAGGTTGAGGTAGGGGCCAAGGAGGAGCATGGAGTTTGGACTTGATTCATGAGGCTGTGGGGAGCCAGTGAAGGTTCTTAAGCAGGTATGTCTGCCTGAGAGCAGTTGGAGCAGACAAGAGCTAAAAACCAAACAAATCACCATAGATAGTGGCTGCTATAATTTGTTTGTCCCCTCCAAATCTCATGTGGAAATTTGGTCCTCAGTGTTGGAAGTGGGGCCTAATGGGAGGTGTTTGGGTCATGGGGGAGGAACCCCTGTGAAAGGCTTGGTGCCGTCCTTGTGATAATGAGTAAGTTCTCCCGCTATGATTTCCCTTGAAGGCTGATTATTAAAAAGAGCTTGGCACCTCCCTCTCTTCTCTCTTGCTTCTTCTCTTGCCATGTGATTGATCTCTGCACATGTAGGCTCCCCTTCACCTTCTGCCATCAGTGAAAGCAGCTTAAGGCCCTCACCAGAAGCAGATGCTGGTGCCATGCTTCCTGGAGAGCTTGCAGAATCATGAGCTGAATAAATCCCTTTTCCTTGTAAATTACTCACCTTCAGGTATTCCTTTATATAGCAACACAAAAGGACTAAGACAGTGGCCTTGACTTTTCTCTCTCTTTAAGAAGTGTTGCCTTTGCTCACTTAGTCATCCCTTCTGCCTGCATTTGTAGAGCATCTGGATGGGAGATTTATATAACCGTCACTCTTGACTTTCCCAGCAGGCCTATGTCATAGGTACTGTGGTCTCTACAATACAGCAGAGGTATCTGAGGCTCCGAGAGGTTGAGTGACTTGCTCATGGCTGCACAACCAGTAAATATTGGAGCTGGAATTCAGGTCCACGGTTTCCTGGCTCCAAAGCCCATGATTTTTTCCCTCAATTTATTCTGACTGGGGCATGGGGGAGGGGGTGGCCTTTGGGCAGGGCCACCAGGAGCGACCAGGCCCGTAGAGAGCTGGGTGCAGGTACAGAGGAAAACCTGTTGTCGAGTGTGGCCCGTAGTTCCCATTTTTGCCTGAATGGCACATTTGAAAGTGTTATATAACCATGTGAATAATAATAGTTGGCCTATATGAGTTCTTTAATTTGCTTTTTGGTCCGCATTTGGTAACTTCTTTATCATCTACTATACTCTGTTGTGTCTCTTTTGTTGTAATTTGTAAGTAGGGGTGAGATAAAGTACACCTAGGGTTTGCTGGGTTTCTTCCATGTCATCATGTTCCTCCTTGCATGGGGCCAGGATCCGTGGAGGTTGCCTGGCACCTACGTGGTGGTGCTGAAGGAGGAGACCCACCTCTCGCAGTCAGAGCGCACTGCCCGCCGCCTGCAGGCCCAGGCTGCCCGCCGGGGATACCTCACCAAGATCCTGCATGTCTTCCATGGCCTTCTTCCTGGCTTCCTGGTGAAGATGAGTGGCGACCTGCTGGAGCTGGTGAGCCACCCTTTTTGGGAATGGCACTTCCTGATAGGGCTGGGCCACTGCATATACACTGGGGACTGTGCTTAGTAGGCCCATTGCTGAAAATCAGAAGGGGACAGCAAGTATGTATTGAGCACTTATCGGGTACCAAGCACAGTAACTACTGGCTTTCTGTATAGAATTCCCTTTAAGCCTGGCCATGCCCCAGTGGTACGTCTATCTTCATTTGAAAGACGAGGAGACTGAAGTTCAGAGGGGACCACACAGACAGCTAGGGGTAGAGCCTGGATCAAACCCATTGGTCTGCCTGCCAGCCATTCTTGTGCCAATGCATCTGCTGCCTACGGAAACCTGTAGGGACAAGGCCCTGGGATGTTCAGTGGAGCCTGAGTCATTTTATAAAAAAGCATGACTCTAGGGTCCAAAATTCCTTTGAAGCTGTTGCTATCCAGAGTGAAGTCCCTTCTTTAGGACAGGGTGGCCCTCCTCCCTCCTGGATGTCACATCTTCGGTGGAGGGGCAGAAAGGGGACTGGGTATTCTCCTCACCCTGGCCCTAGTGCTTCAAATCTTAAAAAAACGTTTTTATTTGTGCTTCTGCACCACCTTCTAGCCCACCTCGTTTCCTGGCCTCTAACTTGATGAGAGCGTGTGTCATTTTCACACTGATTCTCCACATGGCAGGCGGTGCTTCTTAGCCTCCTGCAGACAGTGAGGCCCCACGGTCTTGTCCAAGGTCACACAGCGTGTAATGGGCAGGGTCAGAGTCTGGAGTCTGGACCTGGGTCTCCTAGCTGCACTGCACTGCTGCCCCATGGGTTAATCAGCTCAGCATACCGTGGCTGAACAGCTACCTCATACCAAGGCCTGTGGCGCCATGACAGGGATTGACAGGGTCCCTGCCTTGGAAACCCGTAGTCTAAGTAGAGGAGACTGACAAGTCAATGCCTTCCATCAGTCTGCTCAACACACGTTTACCAAGTGCCTACTGTGTGCTGCAGAGGCGAAGATGACACAGCTCAGGCCTTTCCCTTGAGCTTACAGTTCAGGAGGAGAGACTGACCAGTGACTGCCAGTACAGTTGACTATGGGACAATGTGCTCAGCCTTGGGGAGAGACGAAGAAGGTACCCGTATAGCACCAGATGACAGGCACGAGCCCCACAGGCCAGGGCAGCTGCTCAGAGGAGAGTAGGCCAAGCAGAAGGCAAACAGAAGGCTGCAGGCATTTGCCATCGAGAGCTGGACTTCAAACTGGGCATCATACCAGCCTGGGTTCGAGTCCTGCCCAGCCCCTTATTGGCTGTCTAACCCTGAGCAAATCCCTTCACCTCTCTGAGCCTCATTCCTCTATCTGTAAACCAGTTATAATAATTGGAACATTCATTTAAGGACTAAATGAGGTCGTGAAGCATTCAGCAGATGCTAGGTACGGAAACTCGCTGAAGTGGGGGCAGGTTAAGAAGCCTCTGGGGATACGAAGGCATCCAGGGACTAGTTGTGGCAGGAGGCTGTTACCACTTAGGTCTGAAGGGTAAGGAGAGGGAATAGCTTTCCCTCTGCCCAGTTGGAGCCGGTGGCATGGAGGAGAGGCTGCCTGTGGGGAATCACCCGAGGGTTCACCGCTGCCATGCGCAGGGAGTCAGGAGGTAGGGAGGGAGTGGGGCAGATGCACACCATTTTTTTTTTTTTTTGAGACTCTGTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATATCTGCACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCTCGACCTCAGGTGATCCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGCTCCCA
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Task1_train_944
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A variant affecting Chromosome 1, within the gene PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, autosomal dominant, 3
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Task1_train_945
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Here is a genetic alteration in PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) on Chromosome 1. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, autosomal dominant, 3
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TAGGGTGGCGAGCACTGTTTGGTCTCCAGATGTCTTCAGGTCGGAGCTCACAGCGCTCTCAGCCACCCCTTCCCAGTGTAGCACCGGGCACATGGTAGATGCCTATTGATGAGTGAAAGCTCCTAACACACTCAGAGAGCAAGGACTCCGCCTCATCCCACAGCCTGGGAGGAGAGGCAGACTGCCAAGGACCTGCTCAGCATGCTACAGAAGAAACCAAAGTGCCCACGGGACTGATCAGTGGAGCTTCCTGCCGAGACTGGAGGCCTTAGGGCAGGGTAGACAGTGTGTGTGCAGGCTGGGGACTCACAGTTCGGACTGTGCCCAGACCTACTAGCATAGTGGGTGGGTGGGAGGATGCGGGACTGGGGGCCGACCTTGCCTGAAATTCATGTGGGATCTCAGAGCAGCCACTGAATTGCTCTGTAGGGGGCTAAATAGTGGCCCCCACAGATACACACACCCAGACAGAGCCTGTGAGCCAGACCTTATTTGGAGAAAAGGTCTTTGTAGATGTAATTAAGCATCTCAAGATGGCATCATCTGGATTATGCGGTGGGCTGTAAGTCCTGTGATGTGTCTTTATGAGAGAAAGGCAGAGGGAGATTTGACACACACAGGAGGGGCCACGTGGAGACAGAGGTGGAGATTGGAGAAATGTGGCCACAAGCCAGGGAACACCAGCAGCCACCAGAAGCCGGAAGACGTGAGGCAGGGTTCTTCCCAGAGCCTTCGCTGCTGAGTCTGGGAATTTGTGACCGAAGCCATAAGAAGTGGGTACACGCCCTGAGCCTCCCACACTTGCTCACCTGTCCTGAGATGAGAATCTCTACTCTGCAGCATATTTGGAGGATCACTGCGGGGGCCACAGAGGTGCTGTTCAGATGGCACTTCAGAAGACTCAGGAGACCCTGGGGCAGGAGCAGTTTGACTGACAGCCCAGAGGGCTGCCCTCTGATTCCACCTGAGGCCCTGCTTTTCCTGGCTGCAGGGGTTCCAGGGCCAGGCCATTTCCGCTGGCGCAGGACTCTGCTAGCAGCAACCTGCCTGAAGTCTTCCTTTGGCCTGGCTGAGAGTTTCTGAGACCTGCGCTGGAGCGGAGGTGCTTCCTTCCTTGCTTCCTTTCTTCCTCTCTCCCTTCTCCATCCAGCAGGCTGGACCTGCCTGGCATCTGTGAGCTCTCCCTACTTTCTCCTATACCCTAACCTTTGTCCTGCATGGGCGACTCCCCCAGTGAGTCTCTTGCAGCTTTTACCCCAGTGCCTGCTTCTTGGAGAATCCAAACTGATCCAGTTAGGGATGATAAAGTGTAGGGTAGGCGCTCGGTGACTGTTTTCTCTGAGGTTGTGACTCGTGTGAGGCAGAAGCAGTCCCCGTGAGCCCTCCTGGTATCTTGTGGAGTGGAGAACGCTTGGACCTGGAGCCAGGAGGCCCAGACATACATCCTGTCCGAGCTGCAGCTTCCTGTCTCTAAAATGAGCCGGCCAGCGCAGGTGGCCAGACATCACTGTTATTCTCCTTTGAGTCTTTAAATCTTGTTGTCTTTCTTGCAGACTCGGTGAGCTGTGAAAGGCTATAATAGGGGCTTTATTTTACACTTTGATACTATTTTTTGAACATTCATATTATTGTTAGATATTGATATTCATATGAAGGAGCAGGATGACTTGGGTCCTTCTTGGCAGTAGCATTGCCAGCTGATGGCCTTGGACAGTTACCTGCCCTCTCTAGGCCTCCCTTTCCTTGTCTATGAAATACATTATAGAATAGGATGTAGTGTGTGAGGATTTTTTGGAGGTTAAACGAGTGAATATATTTAAGGCGCTTTCACCAGTGCCTGGGATGTGCTCTGTAGTTTCTGTGTGTTAACTATAAGGTTGACTTTATGCTCATTCCCTCCTCTCCCACAAATGTCGCCTTGGAAAGACGGAGGCAGCCTGGTGGAGGTGTATCTCCTAGACACCAGCATACAGAGTGACCACCGGGAAATCGAGGGCAGGGTCATGGTCACCGACTTCGAGAATGTGCCCGAGGAGGACGGGACCCGCTTCCACAGACAGGTAAGCACGGCCGTCTGATGGGAGGGCTGCCTCTGCCCATATCCCCATCCTGGAGGTGGGTGGGGACTGCCACCCCAGAGCGTTGCAGCTGTACTCCTGGGTTGCACCCCCCCCAGCTGTCACTGTCCCCTCCCTGCCATCAGTTGTGGGAAGGGCGTTCATCCATCCAGCCACCTGCTGATTTGTTATAGGGTGGAGGGGGGGTCTTTCTCATGTGGTCCTTGTGTTCGTCGAGCAGGCCAGCAAGTGTGACAGTCATGGCACCCACCTGGCAGGGGTGGTCAGCGGCCGGGATGCCGGCGTGGCCAAGGGTGCCAGCATGCGCAGCCTGCGCGTGCTCAACTGCCAAGGGAAGGGCACGGTTAGCGGCACCCTCATAGGTAAGTGATGGCCCCAGACGCTGGTCTCTCTCCATCTGGACCTGGCCTGGGAGGTGGCTTGGGCTGGGCCCAGGGAGAGCTAATGTCTCCTAACCAAGAATGCTGTGGCAGCCTCTGCCGCAGAGCCAGAGAACCAGAGTGCCAAGGCTGGCAGGGTTCCCAGTGGCCACGAGTGCAGATGAAGAAACCCAGGCCCCAAGAGGGTCATGCAGGTAGCCCAGGGAGTTCAGCCTTGACCCTGGGTCAATGACCTTTCCACAGTTCCACACTGCTCCCCTTTTAAAATCCGGTGATGTCTTTATGTCTTTTGTTATGTTATCTTCAATGTGGAGGGACTCGAGGTGATCTAAGCAAACTTTTTCTATCTTCTGCTTGCATACCTCTGAGACCAGGGGACTCACTCACTTGCATGACTGGGCCCTGCAGGTCACACTGGCCAGGCAGATGTGGTGGAGGAACTGGCAGAGGACTTTTTCTAGACTGTGACTACATTTAGTCCACCCAGCGGCCCCCCTATGAAGTCCAGTTGAGAACTAGGACTCTGGGGGCCGGTGGACAGAGAAGAGGGAGGGTTCTCTCCCTTACTGACTTCCTTCTGTGGCCAGACATTGAGCAAGGCCTCTGTACAGCATGTCCTGGGGCTGGCCTTGCCGTAGCTGCTAAATAGTTGACGAAACCAGTCCAGAGAGGGGAGGTGACTGCCAGGGTCGCACAGCTCAAGCTGGGGAACTCGCTGGGAAAACTGTCAGCTCTGGGCAGCAGCTTGACTTCCACTGTAAGCCCCAGCCCCCAGGGTCAAACACTGGCTCTGGTGCTGGCAGAGGCAGCCCACTAGCCTGTTTCAAAGGCTGAGAAGGCCCAGGAGTCTGCCCTGTGCTCCACCAGTTCTGCCCTGAGACTTTCCTACAGAGTACAGGTTTTGATGTTCAGTTTTAAAGGCAAGAATCAATAACCTTCTGCCCCATCAGGTGACCCCTTGTGCCTGTCCCACCCCTTTATTGACTGACCTCGGCTCAGTCAGGTCAGTTCCTGAAGGTCAGTGTGTGGAGGGGAGGCTGTTCTTTCCCAGAAAGGCCTTCCCCAGGCCTGGTGCTCTGGCCTCTGGAGGACTTCCTGGAGAAGTCCCTTCTTTGGGGTCCCAGTCAGTGTATGGGAAGCCCTTATTGCATGACCTGGCACGGGGCAGGGGCTCAACAGTCACTATTGCCTTCCTTGCCACTGCCATTTCCTCCTCTGTAAGCAGGTGATTGTGTGTCCAGTCTGAGCACAGAGATAAGCACACAGCAGGTGCTTAATAACTAGCAGCTGTAGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGTTCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGGGTGTCTGTATCCCAGCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCAATCCAGCCTGAGTGATAGAGCGAGATTCCATCTCAAAAATAAATAAGTAAATAACTAGCAGCTGTAAATGTGGCTGTTGTTCTTCACCTCCACACTCAG
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Task1_train_946
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A mutation found in PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) on Chromosome 1 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_947
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A variant on Chromosome 1 in gene PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, autosomal dominant, 3
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ATAAGGTTATTGTGAGGATCCCCTGAGTTCGTATATTCAGACGCTTAGACAGAGCCAGGCACAGAGAAGGGCCCGGGGTTGGCTAGTTTGATTGCTGGTGTAATTGCTAATATCTTCCAGTTTGTATTGGTCAAGGTTCTGCAGAGAAGCAGAACCAGTAGGATGTATATATTAAGAGTTTCAAGCTCATGTGACCGTGCGGGCTGGCAAGTCTGAAATCCGCAGGGCAGGCCAGGCAGGCTGGCAATTCCTGCAGAATTTGATGTTGCAATACTGAGTCCTAAGGCAGTCCTGGGGCAGAATTCCTTCTTCCCTGGGAGGCCTCAGTCTGTTCTCTTAAGGCCTTCAACTGATTAAATGAGGCCTGCCCAAGTTATAGAGAGTAACCTGCCTTACTCCGTCTTCTGATTTAAATGTTAGTCACATCTAAAAAATATTTTCGCAGCAGCATTTCCACTGGCTTTTGACCAAACATCAGGCCACAAAGTTGATCCCCAAAATTAACCATCACTCTGTGCCTGTAAGGGAGGGGCTGGGAAAGGGGAGCAGGTCTCCCCAAGGGGTGACCTTGGCTTTGTTCCTCCCAGGCCTGGAGTTTATTCGGAAAAGCCAGCTGGTCCAGCCTGTGGGGCCACTGGTGGTGCTGCTGCCCCTGGCGGGTGGGTACAGCCGCGTCCTCAACGCCGCCTGCCAGCGCCTGGCGAGGGCTGGGGTCGTGCTGGTCACCGCTGCCGGCAACTTCCGGGACGATGCCTGCCTCTACTCCCCAGCCTCAGCTCCCGAGGTAGGTGCTGGGGCTGCTGCCCCAAGGCGCGGGTAGGGGGCGGAGGGCGGAGGGCGGAGGGAGGGCGGGCGGGCAGGCGGGCTTCTTGTGGCACGTGGGCTTCTTGTGGCACGTTCCTGGAGGCCGAACCCTTCTGGCTTTGGAAGGAGTCGTCAGAGACCCCCGCCATGCGGGAGGCTGGGGAGGAAGGGGCTCGAAACCTCCATCATCGCAGAGTCTGAATAGCAGTGGCCCCGCCATGCGCCCACGTAGCGGCGCCTACGTAGCCACGCCCCCACACCCCGTCCTGGCCACTCTCCCTCCTGAAGGTCTTCTGGTACCCGCCCCCTCCCCATCTCCATCCCCAGGCCCTGCGTCCTCTGCCCAATACTCTTTGGGCCTCCCTGTTGTCCAGCTCTCTCCGCGGCTCCATGACTGACAACTTGAGCAAGGCTAATGTGAATGGGAGCGGTTGAGGGCTCAGACCTCTCACCCGAGGAACATCCACAGAGTGTGCCGCATGCCCGGTGCAGTGTGGCTGCGGGGACACAGACACGGAGCCTCGGCCCTGAGGAGCTGGGGGGCAGTGACCGTCCCTCCTCTGACCCACCACTCCTCCAGTGTCAGGACACTGCGGGTATCTAGGGGAAGGAATCTTGTTCCACTTCAAGTCTGGAACTTCAAGTCTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGCGCGTTGGGGGTGGGGGTTGCAGAGCAGATGCGTACCTGACAGCGGTAACCTAGGTCCCCCCTGGCCTATCAAGGCTTCCCTGGCGGCCGAATTTAAAGGCATCAAGCAAACAAAGCCCAACACATCTCTGCCTTGTCCTCTCAGTTTCCCCCCGTGGCACTTAGAACCACTTGATACACCGAATAGTTTCCTATCTCCCCCACTAGGATGTAAACTCCACAGGGGCATTGGGAATGCTGCCTGGCTATGGTAGGGACAGAGGGGAGCACCAGGGCGGGGCAGGGGTGCCAGAGTTCTGCCTGGGCAGTCAGATTTTCCTTAGGAGGGGACATTTGAGTGGGACCCAAACAGGTGTATAGCAGTTGTCCAGCCCAGCTGGCAAGGCCTGAGTCTGCCTCTGCAACCCCTCTCTTGGGCTCCTTTCTCTGCCACCCACCTCCTCACCTTTCCAGGTCATCACAGTTGGGGCCACCAATGCCCAAGACCAGCCGGTGACCCTGGGGACTTTGGGGACCAACTTTGGCCGCTGTGTGGACCTCTTTGCCCCAGGGGAGGACATCATTGGTGCCTCCAGCGACTGCAGCACCTGCTTTGTGTCACAGAGTGGGACATCACAGGCTGCTGCCCACGTGGCTGGTAAGTCACCACCCCACTGCCTCGGCCACCGTGATGCTAACAGCCCCTTTGGCAGTCAGGGTCTGTGCCGGGACCTCCAGTGCCAGGCTCTGTGCAGGGGGACCAGAGATGAAGTAGGCCTGATGGTGCCTTCAAGGACACTCAGTCTGATGAGGGAGGCGAGTGCACAGAGGAAACACGAGGTCAGGGCTGTATTAGAGGGAGCCCAGAGGAGGCACCTGCCCAGCCCGAGGGTCAGAGAAGGCATCTTGGAGGAGGGACATTTGATCGGGAGCTTGATGGATGAATAGGAGTTCACCTGGCCGATAAGACAGCAACTACCAAGGCTTAGAGGTGTGAGAGGAGGCTGTCTTACCTCACTGAGTAAGGACTGCAGGCGGCTTACCTTCGAGAAGAGAGCTTAGTGTCTGTGTGCACGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGCACTGGCAGGAGTCCCCTGCTGGGGCAGGAGGGCCGGGCCATCACCATCTTTCACCATTCACCCCTGCACCAGGCATTGCAGCCATGATGCTGTCTGCCGAGCCGGAGCTCACCCTGGCCGAGTTGAGGCAGAGACTGATCCACTTCTCTGCCAAAGATGTCATCAATGAGGCCTGGTTCCCTGAGGACCAGCGGGTACTGACCCCCAACCTGGTGGCCGCCCTGCCCCCCAGCACCCATGGGGCAGGTAAGCAGGATGGCAGGGTGGGCAAGTCCAGGCTGGGGCTTGGGAGGTCTGTGTGACCTTGACAGTCTCTCCCTTCTCCCTTGTCTGTGTAAGGAGGATGACGCCACCTTAAATAGGATTAAATGAGAATGGGGCTCTGAAAGGGCTGTGCAATATTTTCATAACGTGTTTTTATAGAGACAGTTGAGTATGTTCTTTAAGCCCTCCTCTCTCCTACCATGAACTAAAGATTTCTGTGGAGGTCCCCTCACTCCCAGCACCCCCTCCTCATCCCAGGCCCTTTTTGCAGGTTGGCAGCTGTTTTGCAGGACTGTATGGTCAGCACACTCGGGGCCTACACGGATGGCCACAGCCGTCGCCCGCTGCGCCCCAGATGAGGAGCTGCTGAGCTGCTCCAGTTTCTCCAGGAGTGGGAAGCGGCGGGGCGAGCGCATGGAGGTGACTGTACCCCTCCTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCTGGGCCCTCAGGGACCCCCAGCAAGCCCCTCCATCCTCCAGACTCCAGCTCTTCTGTAAGCTTACAGGGCTGGCCAGACCAGGAGTGGGGCACTCCTCACTTCACGCGGCTGGGGGCTGCTGGAGAGAGCCACAGCGGGAAGGGTTTCCTAGAGGCTGCAGGACAGTGCTGGATGGATTTTCAATGCTCACCTGGGTGTGAGCGTGCGGCAGGGCCGCGTGAGGGTCAGCGATCTGCTACTCTGGACTCAGCCATCTCTAGGCCCCTCTCACTCAGGTGCTCCATGGTTCTGGGAGCTGAGAAATCTCAAACCAGCAAAAAAGTGGAATTGATGTTGATGCTACAGGATAGTGCACAGATGCCATCTGGTTGCAGCATTTTGGTGGAAGGGCAGTGCCCAGCTAGGAGAGTGAGGAGGGGCAGGCATTTCTGGCTTGAGGAGATGGGGTCTTAATGCTCGTGTGAGAGGCAGAGTGGGTGGAGTGGAGCTGGCTGGATCCTTGCTTTGGCCTCCTGGATTTCTCTCTATCTCCATTTTGAAACCACTCTGTGTTTGGAAGAACTTTTGAGTATTCAGAGCTGCCCACTGGCAGAACAGTCTTCCTTGGGCAGGAGTGAGCTCCTTGTCCCCAGAAGGCTGGGTCTGGCTGGCCCCTGGCAGGGACACTGATGAGGGTGCTTGAGTTGATCCTGTCTAGTCCCTTTCTGTGTTTTCAAAGCCCATTCTAAAGCAGATTCCCATTTCCGTCTTTGACTCTAAGGCCCAAGGGGGCAAGC
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Task1_train_948
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A variant on Chromosome 1 in gene PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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Task1_train_949
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Here’s a variant in PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) located on Chromosome 1. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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CCAGGCACAGAGAAGGGCCCGGGGTTGGCTAGTTTGATTGCTGGTGTAATTGCTAATATCTTCCAGTTTGTATTGGTCAAGGTTCTGCAGAGAAGCAGAACCAGTAGGATGTATATATTAAGAGTTTCAAGCTCATGTGACCGTGCGGGCTGGCAAGTCTGAAATCCGCAGGGCAGGCCAGGCAGGCTGGCAATTCCTGCAGAATTTGATGTTGCAATACTGAGTCCTAAGGCAGTCCTGGGGCAGAATTCCTTCTTCCCTGGGAGGCCTCAGTCTGTTCTCTTAAGGCCTTCAACTGATTAAATGAGGCCTGCCCAAGTTATAGAGAGTAACCTGCCTTACTCCGTCTTCTGATTTAAATGTTAGTCACATCTAAAAAATATTTTCGCAGCAGCATTTCCACTGGCTTTTGACCAAACATCAGGCCACAAAGTTGATCCCCAAAATTAACCATCACTCTGTGCCTGTAAGGGAGGGGCTGGGAAAGGGGAGCAGGTCTCCCCAAGGGGTGACCTTGGCTTTGTTCCTCCCAGGCCTGGAGTTTATTCGGAAAAGCCAGCTGGTCCAGCCTGTGGGGCCACTGGTGGTGCTGCTGCCCCTGGCGGGTGGGTACAGCCGCGTCCTCAACGCCGCCTGCCAGCGCCTGGCGAGGGCTGGGGTCGTGCTGGTCACCGCTGCCGGCAACTTCCGGGACGATGCCTGCCTCTACTCCCCAGCCTCAGCTCCCGAGGTAGGTGCTGGGGCTGCTGCCCCAAGGCGCGGGTAGGGGGCGGAGGGCGGAGGGCGGAGGGAGGGCGGGCGGGCAGGCGGGCTTCTTGTGGCACGTGGGCTTCTTGTGGCACGTTCCTGGAGGCCGAACCCTTCTGGCTTTGGAAGGAGTCGTCAGAGACCCCCGCCATGCGGGAGGCTGGGGAGGAAGGGGCTCGAAACCTCCATCATCGCAGAGTCTGAATAGCAGTGGCCCCGCCATGCGCCCACGTAGCGGCGCCTACGTAGCCACGCCCCCACACCCCGTCCTGGCCACTCTCCCTCCTGAAGGTCTTCTGGTACCCGCCCCCTCCCCATCTCCATCCCCAGGCCCTGCGTCCTCTGCCCAATACTCTTTGGGCCTCCCTGTTGTCCAGCTCTCTCCGCGGCTCCATGACTGACAACTTGAGCAAGGCTAATGTGAATGGGAGCGGTTGAGGGCTCAGACCTCTCACCCGAGGAACATCCACAGAGTGTGCCGCATGCCCGGTGCAGTGTGGCTGCGGGGACACAGACACGGAGCCTCGGCCCTGAGGAGCTGGGGGGCAGTGACCGTCCCTCCTCTGACCCACCACTCCTCCAGTGTCAGGACACTGCGGGTATCTAGGGGAAGGAATCTTGTTCCACTTCAAGTCTGGAACTTCAAGTCTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGCGCGTTGGGGGTGGGGGTTGCAGAGCAGATGCGTACCTGACAGCGGTAACCTAGGTCCCCCCTGGCCTATCAAGGCTTCCCTGGCGGCCGAATTTAAAGGCATCAAGCAAACAAAGCCCAACACATCTCTGCCTTGTCCTCTCAGTTTCCCCCCGTGGCACTTAGAACCACTTGATACACCGAATAGTTTCCTATCTCCCCCACTAGGATGTAAACTCCACAGGGGCATTGGGAATGCTGCCTGGCTATGGTAGGGACAGAGGGGAGCACCAGGGCGGGGCAGGGGTGCCAGAGTTCTGCCTGGGCAGTCAGATTTTCCTTAGGAGGGGACATTTGAGTGGGACCCAAACAGGTGTATAGCAGTTGTCCAGCCCAGCTGGCAAGGCCTGAGTCTGCCTCTGCAACCCCTCTCTTGGGCTCCTTTCTCTGCCACCCACCTCCTCACCTTTCCAGGTCATCACAGTTGGGGCCACCAATGCCCAAGACCAGCCGGTGACCCTGGGGACTTTGGGGACCAACTTTGGCCGCTGTGTGGACCTCTTTGCCCCAGGGGAGGACATCATTGGTGCCTCCAGCGACTGCAGCACCTGCTTTGTGTCACAGAGTGGGACATCACAGGCTGCTGCCCACGTGGCTGGTAAGTCACCACCCCACTGCCTCGGCCACCGTGATGCTAACAGCCCCTTTGGCAGTCAGGGTCTGTGCCGGGACCTCCAGTGCCAGGCTCTGTGCAGGGGGACCAGAGATGAAGTAGGCCTGATGGTGCCTTCAAGGACACTCAGTCTGATGAGGGAGGCGAGTGCACAGAGGAAACACGAGGTCAGGGCTGTATTAGAGGGAGCCCAGAGGAGGCACCTGCCCAGCCCGAGGGTCAGAGAAGGCATCTTGGAGGAGGGACATTTGATCGGGAGCTTGATGGATGAATAGGAGTTCACCTGGCCGATAAGACAGCAACTACCAAGGCTTAGAGGTGTGAGAGGAGGCTGTCTTACCTCACTGAGTAAGGACTGCAGGCGGCTTACCTTCGAGAAGAGAGCTTAGTGTCTGTGTGCACGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGCACTGGCAGGAGTCCCCTGCTGGGGCAGGAGGGCCGGGCCATCACCATCTTTCACCATTCACCCCTGCACCAGGCATTGCAGCCATGATGCTGTCTGCCGAGCCGGAGCTCACCCTGGCCGAGTTGAGGCAGAGACTGATCCACTTCTCTGCCAAAGATGTCATCAATGAGGCCTGGTTCCCTGAGGACCAGCGGGTACTGACCCCCAACCTGGTGGCCGCCCTGCCCCCCAGCACCCATGGGGCAGGTAAGCAGGATGGCAGGGTGGGCAAGTCCAGGCTGGGGCTTGGGAGGTCTGTGTGACCTTGACAGTCTCTCCCTTCTCCCTTGTCTGTGTAAGGAGGATGACGCCACCTTAAATAGGATTAAATGAGAATGGGGCTCTGAAAGGGCTGTGCAATATTTTCATAACGTGTTTTTATAGAGACAGTTGAGTATGTTCTTTAAGCCCTCCTCTCTCCTACCATGAACTAAAGATTTCTGTGGAGGTCCCCTCACTCCCAGCACCCCCTCCTCATCCCAGGCCCTTTTTGCAGGTTGGCAGCTGTTTTGCAGGACTGTATGGTCAGCACACTCGGGGCCTACACGGATGGCCACAGCCGTCGCCCGCTGCGCCCCAGATGAGGAGCTGCTGAGCTGCTCCAGTTTCTCCAGGAGTGGGAAGCGGCGGGGCGAGCGCATGGAGGTGACTGTACCCCTCCTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCTGGGCCCTCAGGGACCCCCAGCAAGCCCCTCCATCCTCCAGACTCCAGCTCTTCTGTAAGCTTACAGGGCTGGCCAGACCAGGAGTGGGGCACTCCTCACTTCACGCGGCTGGGGGCTGCTGGAGAGAGCCACAGCGGGAAGGGTTTCCTAGAGGCTGCAGGACAGTGCTGGATGGATTTTCAATGCTCACCTGGGTGTGAGCGTGCGGCAGGGCCGCGTGAGGGTCAGCGATCTGCTACTCTGGACTCAGCCATCTCTAGGCCCCTCTCACTCAGGTGCTCCATGGTTCTGGGAGCTGAGAAATCTCAAACCAGCAAAAAAGTGGAATTGATGTTGATGCTACAGGATAGTGCACAGATGCCATCTGGTTGCAGCATTTTGGTGGAAGGGCAGTGCCCAGCTAGGAGAGTGAGGAGGGGCAGGCATTTCTGGCTTGAGGAGATGGGGTCTTAATGCTCGTGTGAGAGGCAGAGTGGGTGGAGTGGAGCTGGCTGGATCCTTGCTTTGGCCTCCTGGATTTCTCTCTATCTCCATTTTGAAACCACTCTGTGTTTGGAAGAACTTTTGAGTATTCAGAGCTGCCCACTGGCAGAACAGTCTTCCTTGGGCAGGAGTGAGCTCCTTGTCCCCAGAAGGCTGGGTCTGGCTGGCCCCTGGCAGGGACACTGATGAGGGTGCTTGAGTTGATCCTGTCTAGTCCCTTTCTGTGTTTTCAAAGCCCATTCTAAAGCAGATTCCCATTTCCGTCTTTGACTCTAAGGCCCAAGGGGGCAAGCTGGTCTGCCGGGCCCACAACGCTTTTGGGGGTGAGGGTGTCTACGCCATTGCCA
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Task1_train_950
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This is a variant in PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9), located on Chromosome 1. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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GTCTTCTGGTACCCGCCCCCTCCCCATCTCCATCCCCAGGCCCTGCGTCCTCTGCCCAATACTCTTTGGGCCTCCCTGTTGTCCAGCTCTCTCCGCGGCTCCATGACTGACAACTTGAGCAAGGCTAATGTGAATGGGAGCGGTTGAGGGCTCAGACCTCTCACCCGAGGAACATCCACAGAGTGTGCCGCATGCCCGGTGCAGTGTGGCTGCGGGGACACAGACACGGAGCCTCGGCCCTGAGGAGCTGGGGGGCAGTGACCGTCCCTCCTCTGACCCACCACTCCTCCAGTGTCAGGACACTGCGGGTATCTAGGGGAAGGAATCTTGTTCCACTTCAAGTCTGGAACTTCAAGTCTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGCGCGTTGGGGGTGGGGGTTGCAGAGCAGATGCGTACCTGACAGCGGTAACCTAGGTCCCCCCTGGCCTATCAAGGCTTCCCTGGCGGCCGAATTTAAAGGCATCAAGCAAACAAAGCCCAACACATCTCTGCCTTGTCCTCTCAGTTTCCCCCCGTGGCACTTAGAACCACTTGATACACCGAATAGTTTCCTATCTCCCCCACTAGGATGTAAACTCCACAGGGGCATTGGGAATGCTGCCTGGCTATGGTAGGGACAGAGGGGAGCACCAGGGCGGGGCAGGGGTGCCAGAGTTCTGCCTGGGCAGTCAGATTTTCCTTAGGAGGGGACATTTGAGTGGGACCCAAACAGGTGTATAGCAGTTGTCCAGCCCAGCTGGCAAGGCCTGAGTCTGCCTCTGCAACCCCTCTCTTGGGCTCCTTTCTCTGCCACCCACCTCCTCACCTTTCCAGGTCATCACAGTTGGGGCCACCAATGCCCAAGACCAGCCGGTGACCCTGGGGACTTTGGGGACCAACTTTGGCCGCTGTGTGGACCTCTTTGCCCCAGGGGAGGACATCATTGGTGCCTCCAGCGACTGCAGCACCTGCTTTGTGTCACAGAGTGGGACATCACAGGCTGCTGCCCACGTGGCTGGTAAGTCACCACCCCACTGCCTCGGCCACCGTGATGCTAACAGCCCCTTTGGCAGTCAGGGTCTGTGCCGGGACCTCCAGTGCCAGGCTCTGTGCAGGGGGACCAGAGATGAAGTAGGCCTGATGGTGCCTTCAAGGACACTCAGTCTGATGAGGGAGGCGAGTGCACAGAGGAAACACGAGGTCAGGGCTGTATTAGAGGGAGCCCAGAGGAGGCACCTGCCCAGCCCGAGGGTCAGAGAAGGCATCTTGGAGGAGGGACATTTGATCGGGAGCTTGATGGATGAATAGGAGTTCACCTGGCCGATAAGACAGCAACTACCAAGGCTTAGAGGTGTGAGAGGAGGCTGTCTTACCTCACTGAGTAAGGACTGCAGGCGGCTTACCTTCGAGAAGAGAGCTTAGTGTCTGTGTGCACGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGCACTGGCAGGAGTCCCCTGCTGGGGCAGGAGGGCCGGGCCATCACCATCTTTCACCATTCACCCCTGCACCAGGCATTGCAGCCATGATGCTGTCTGCCGAGCCGGAGCTCACCCTGGCCGAGTTGAGGCAGAGACTGATCCACTTCTCTGCCAAAGATGTCATCAATGAGGCCTGGTTCCCTGAGGACCAGCGGGTACTGACCCCCAACCTGGTGGCCGCCCTGCCCCCCAGCACCCATGGGGCAGGTAAGCAGGATGGCAGGGTGGGCAAGTCCAGGCTGGGGCTTGGGAGGTCTGTGTGACCTTGACAGTCTCTCCCTTCTCCCTTGTCTGTGTAAGGAGGATGACGCCACCTTAAATAGGATTAAATGAGAATGGGGCTCTGAAAGGGCTGTGCAATATTTTCATAACGTGTTTTTATAGAGACAGTTGAGTATGTTCTTTAAGCCCTCCTCTCTCCTACCATGAACTAAAGATTTCTGTGGAGGTCCCCTCACTCCCAGCACCCCCTCCTCATCCCAGGCCCTTTTTGCAGGTTGGCAGCTGTTTTGCAGGACTGTATGGTCAGCACACTCGGGGCCTACACGGATGGCCACAGCCGTCGCCCGCTGCGCCCCAGATGAGGAGCTGCTGAGCTGCTCCAGTTTCTCCAGGAGTGGGAAGCGGCGGGGCGAGCGCATGGAGGTGACTGTACCCCTCCTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCTGGGCCCTCAGGGACCCCCAGCAAGCCCCTCCATCCTCCAGACTCCAGCTCTTCTGTAAGCTTACAGGGCTGGCCAGACCAGGAGTGGGGCACTCCTCACTTCACGCGGCTGGGGGCTGCTGGAGAGAGCCACAGCGGGAAGGGTTTCCTAGAGGCTGCAGGACAGTGCTGGATGGATTTTCAATGCTCACCTGGGTGTGAGCGTGCGGCAGGGCCGCGTGAGGGTCAGCGATCTGCTACTCTGGACTCAGCCATCTCTAGGCCCCTCTCACTCAGGTGCTCCATGGTTCTGGGAGCTGAGAAATCTCAAACCAGCAAAAAAGTGGAATTGATGTTGATGCTACAGGATAGTGCACAGATGCCATCTGGTTGCAGCATTTTGGTGGAAGGGCAGTGCCCAGCTAGGAGAGTGAGGAGGGGCAGGCATTTCTGGCTTGAGGAGATGGGGTCTTAATGCTCGTGTGAGAGGCAGAGTGGGTGGAGTGGAGCTGGCTGGATCCTTGCTTTGGCCTCCTGGATTTCTCTCTATCTCCATTTTGAAACCACTCTGTGTTTGGAAGAACTTTTGAGTATTCAGAGCTGCCCACTGGCAGAACAGTCTTCCTTGGGCAGGAGTGAGCTCCTTGTCCCCAGAAGGCTGGGTCTGGCTGGCCCCTGGCAGGGACACTGATGAGGGTGCTTGAGTTGATCCTGTCTAGTCCCTTTCTGTGTTTTCAAAGCCCATTCTAAAGCAGATTCCCATTTCCGTCTTTGACTCTAAGGCCCAAGGGGGCAAGCTGGTCTGCCGGGCCCACAACGCTTTTGGGGGTGAGGGTGTCTACGCCATTGCCAGGTGCTGCCTGCTACCCCAGGCCAACTGCAGCGTCCACACAGCTCCACCAGCTGAGGCCAGCATGGGGACCCGTGTCCACTGCCACCAACAGGGCCACGTCCTCACAGGTAGGAGGCTGGGCTTGCCCTGGGGTGAGGAGGGGTCTCTTTCTCCTTATGCACCCACTGCCCGCGAGGCTTGGTCCTCACAAGTGTGATCCATGAGACTCAAGCCTGACTTGCAGTTCCATACTCTGGTTCTGCCACTTCCATGCCCTTTGAGCCTGGGCAGGTGACCTTACTTCTCCTCATCTCAGCTTCCTCCTCCATAAGAGGGAAAAAGGTATTACCTGCCTCATTGTGTTGCAAGGAGATGGGCAGCATCTAGGGCACTGGCCTGGAGTATCGCAGGTGCTTTGCCTAAGGTGGTGCAGTCCAGGAGAGGCAGCTCCAGAGAGAGGCCCCCGGCTGGGGCTGAAAGGAGGGCAGACCTCGGTTTGAATTTCACCCTGCCGCTCTATAGCTGTGTGACTTGGGCAAATTACTTAACATCTCTGTATGAGGAAATGATGAGTGCTAAGCACTTAGCTTAGTGCCGGGACAATATAAATTCTAGCTATCGTTACTATTGTTTTCATCACCCGTTGCTTTAAAATCCAGCCTCTGGTATAGGCAACTATTGACGGGCTACCCTGTGTCGAAAACATGCCCAGGCAGGTAGCAGGAAGTCACAGATGGGGACCTCTTGGGGCATCAAGGGATGGTGCCCTGAGGCTGAGCTGTTCTGGTTGGGTGGAGCATGAGAGGTCTGGGAAGACAGTGGGACTCCAGCCTGGAATAAGAGGCTCAGAGTTGATTCTCGTCTGAGCACGTCCAGGGGAACCACTGAGGGTTTGGGAACAGGAGAGTGAGGGTGAGAACCTGGTTCTGGGCACAGCAGGCTGGCATGTAGGATGGATGTTCAGGAAAGATGAGCATAGTCAGGTGGCTGGTGCCCTTGTCCAGGGGAGAGGCTCCGTCAGGTTCAGGGGTCCTGGCTTGGAGGGAAGTCCGCCATGC
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GTCTTCTGGTACCCGCCCCCTCCCCATCTCCATCCCCAGGCCCTGCGTCCTCTGCCCAATACTCTTTGGGCCTCCCTGTTGTCCAGCTCTCTCCGCGGCTCCATGACTGACAACTTGAGCAAGGCTAATGTGAATGGGAGCGGTTGAGGGCTCAGACCTCTCACCCGAGGAACATCCACAGAGTGTGCCGCATGCCCGGTGCAGTGTGGCTGCGGGGACACAGACACGGAGCCTCGGCCCTGAGGAGCTGGGGGGCAGTGACCGTCCCTCCTCTGACCCACCACTCCTCCAGTGTCAGGACACTGCGGGTATCTAGGGGAAGGAATCTTGTTCCACTTCAAGTCTGGAACTTCAAGTCTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGCGCGTTGGGGGTGGGGGTTGCAGAGCAGATGCGTACCTGACAGCGGTAACCTAGGTCCCCCCTGGCCTATCAAGGCTTCCCTGGCGGCCGAATTTAAAGGCATCAAGCAAACAAAGCCCAACACATCTCTGCCTTGTCCTCTCAGTTTCCCCCCGTGGCACTTAGAACCACTTGATACACCGAATAGTTTCCTATCTCCCCCACTAGGATGTAAACTCCACAGGGGCATTGGGAATGCTGCCTGGCTATGGTAGGGACAGAGGGGAGCACCAGGGCGGGGCAGGGGTGCCAGAGTTCTGCCTGGGCAGTCAGATTTTCCTTAGGAGGGGACATTTGAGTGGGACCCAAACAGGTGTATAGCAGTTGTCCAGCCCAGCTGGCAAGGCCTGAGTCTGCCTCTGCAACCCCTCTCTTGGGCTCCTTTCTCTGCCACCCACCTCCTCACCTTTCCAGGTCATCACAGTTGGGGCCACCAATGCCCAAGACCAGCCGGTGACCCTGGGGACTTTGGGGACCAACTTTGGCCGCTGTGTGGACCTCTTTGCCCCAGGGGAGGACATCATTGGTGCCTCCAGCGACTGCAGCACCTGCTTTGTGTCACAGAGTGGGACATCACAGGCTGCTGCCCACGTGGCTGGTAAGTCACCACCCCACTGCCTCGGCCACCGTGATGCTAACAGCCCCTTTGGCAGTCAGGGTCTGTGCCGGGACCTCCAGTGCCAGGCTCTGTGCAGGGGGACCAGAGATGAAGTAGGCCTGATGGTGCCTTCAAGGACACTCAGTCTGATGAGGGAGGCGAGTGCACAGAGGAAACACGAGGTCAGGGCTGTATTAGAGGGAGCCCAGAGGAGGCACCTGCCCAGCCCGAGGGTCAGAGAAGGCATCTTGGAGGAGGGACATTTGATCGGGAGCTTGATGGATGAATAGGAGTTCACCTGGCCGATAAGACAGCAACTACCAAGGCTTAGAGGTGTGAGAGGAGGCTGTCTTACCTCACTGAGTAAGGACTGCAGGCGGCTTACCTTCGAGAAGAGAGCTTAGTGTCTGTGTGCACGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGCACTGGCAGGAGTCCCCTGCTGGGGCAGGAGGGCCGGGCCATCACCATCTTTCACCATTCACCCCTGCACCAGGCATTGCAGCCATGATGCTGTCTGCCGAGCCGGAGCTCACCCTGGCCGAGTTGAGGCAGAGACTGATCCACTTCTCTGCCAAAGATGTCATCAATGAGGCCTGGTTCCCTGAGGACCAGCGGGTACTGACCCCCAACCTGGTGGCCGCCCTGCCCCCCAGCACCCATGGGGCAGGTAAGCAGGATGGCAGGGTGGGCAAGTCCAGGCTGGGGCTTGGGAGGTCTGTGTGACCTTGACAGTCTCTCCCTTCTCCCTTGTCTGTGTAAGGAGGATGACGCCACCTTAAATAGGATTAAATGAGAATGGGGCTCTGAAAGGGCTGTGCAATATTTTCATAACGTGTTTTTATAGAGACAGTTGAGTATGTTCTTTAAGCCCTCCTCTCTCCTACCATGAACTAAAGATTTCTGTGGAGGTCCCCTCACTCCCAGCACCCCCTCCTCATCCCAGGCCCTTTTTGCAGGTTGGCAGCTGTTTTGCAGGACTGTATGGTCAGCACACTCGGGGCCTGCACGGATGGCCACAGCCGTCGCCCGCTGCGCCCCAGATGAGGAGCTGCTGAGCTGCTCCAGTTTCTCCAGGAGTGGGAAGCGGCGGGGCGAGCGCATGGAGGTGACTGTACCCCTCCTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCTGGGCCCTCAGGGACCCCCAGCAAGCCCCTCCATCCTCCAGACTCCAGCTCTTCTGTAAGCTTACAGGGCTGGCCAGACCAGGAGTGGGGCACTCCTCACTTCACGCGGCTGGGGGCTGCTGGAGAGAGCCACAGCGGGAAGGGTTTCCTAGAGGCTGCAGGACAGTGCTGGATGGATTTTCAATGCTCACCTGGGTGTGAGCGTGCGGCAGGGCCGCGTGAGGGTCAGCGATCTGCTACTCTGGACTCAGCCATCTCTAGGCCCCTCTCACTCAGGTGCTCCATGGTTCTGGGAGCTGAGAAATCTCAAACCAGCAAAAAAGTGGAATTGATGTTGATGCTACAGGATAGTGCACAGATGCCATCTGGTTGCAGCATTTTGGTGGAAGGGCAGTGCCCAGCTAGGAGAGTGAGGAGGGGCAGGCATTTCTGGCTTGAGGAGATGGGGTCTTAATGCTCGTGTGAGAGGCAGAGTGGGTGGAGTGGAGCTGGCTGGATCCTTGCTTTGGCCTCCTGGATTTCTCTCTATCTCCATTTTGAAACCACTCTGTGTTTGGAAGAACTTTTGAGTATTCAGAGCTGCCCACTGGCAGAACAGTCTTCCTTGGGCAGGAGTGAGCTCCTTGTCCCCAGAAGGCTGGGTCTGGCTGGCCCCTGGCAGGGACACTGATGAGGGTGCTTGAGTTGATCCTGTCTAGTCCCTTTCTGTGTTTTCAAAGCCCATTCTAAAGCAGATTCCCATTTCCGTCTTTGACTCTAAGGCCCAAGGGGGCAAGCTGGTCTGCCGGGCCCACAACGCTTTTGGGGGTGAGGGTGTCTACGCCATTGCCAGGTGCTGCCTGCTACCCCAGGCCAACTGCAGCGTCCACACAGCTCCACCAGCTGAGGCCAGCATGGGGACCCGTGTCCACTGCCACCAACAGGGCCACGTCCTCACAGGTAGGAGGCTGGGCTTGCCCTGGGGTGAGGAGGGGTCTCTTTCTCCTTATGCACCCACTGCCCGCGAGGCTTGGTCCTCACAAGTGTGATCCATGAGACTCAAGCCTGACTTGCAGTTCCATACTCTGGTTCTGCCACTTCCATGCCCTTTGAGCCTGGGCAGGTGACCTTACTTCTCCTCATCTCAGCTTCCTCCTCCATAAGAGGGAAAAAGGTATTACCTGCCTCATTGTGTTGCAAGGAGATGGGCAGCATCTAGGGCACTGGCCTGGAGTATCGCAGGTGCTTTGCCTAAGGTGGTGCAGTCCAGGAGAGGCAGCTCCAGAGAGAGGCCCCCGGCTGGGGCTGAAAGGAGGGCAGACCTCGGTTTGAATTTCACCCTGCCGCTCTATAGCTGTGTGACTTGGGCAAATTACTTAACATCTCTGTATGAGGAAATGATGAGTGCTAAGCACTTAGCTTAGTGCCGGGACAATATAAATTCTAGCTATCGTTACTATTGTTTTCATCACCCGTTGCTTTAAAATCCAGCCTCTGGTATAGGCAACTATTGACGGGCTACCCTGTGTCGAAAACATGCCCAGGCAGGTAGCAGGAAGTCACAGATGGGGACCTCTTGGGGCATCAAGGGATGGTGCCCTGAGGCTGAGCTGTTCTGGTTGGGTGGAGCATGAGAGGTCTGGGAAGACAGTGGGACTCCAGCCTGGAATAAGAGGCTCAGAGTTGATTCTCGTCTGAGCACGTCCAGGGGAACCACTGAGGGTTTGGGAACAGGAGAGTGAGGGTGAGAACCTGGTTCTGGGCACAGCAGGCTGGCATGTAGGATGGATGTTCAGGAAAGATGAGCATAGTCAGGTGGCTGGTGCCCTTGTCCAGGGGAGAGGCTCCGTCAGGTTCAGGGGTCCTGGCTTGGAGGGAAGTCCGCCATGC
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Task1_train_951
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Gene PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) on Chromosome 1 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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TACCCGCCCCCTCCCCATCTCCATCCCCAGGCCCTGCGTCCTCTGCCCAATACTCTTTGGGCCTCCCTGTTGTCCAGCTCTCTCCGCGGCTCCATGACTGACAACTTGAGCAAGGCTAATGTGAATGGGAGCGGTTGAGGGCTCAGACCTCTCACCCGAGGAACATCCACAGAGTGTGCCGCATGCCCGGTGCAGTGTGGCTGCGGGGACACAGACACGGAGCCTCGGCCCTGAGGAGCTGGGGGGCAGTGACCGTCCCTCCTCTGACCCACCACTCCTCCAGTGTCAGGACACTGCGGGTATCTAGGGGAAGGAATCTTGTTCCACTTCAAGTCTGGAACTTCAAGTCTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGCGCGTTGGGGGTGGGGGTTGCAGAGCAGATGCGTACCTGACAGCGGTAACCTAGGTCCCCCCTGGCCTATCAAGGCTTCCCTGGCGGCCGAATTTAAAGGCATCAAGCAAACAAAGCCCAACACATCTCTGCCTTGTCCTCTCAGTTTCCCCCCGTGGCACTTAGAACCACTTGATACACCGAATAGTTTCCTATCTCCCCCACTAGGATGTAAACTCCACAGGGGCATTGGGAATGCTGCCTGGCTATGGTAGGGACAGAGGGGAGCACCAGGGCGGGGCAGGGGTGCCAGAGTTCTGCCTGGGCAGTCAGATTTTCCTTAGGAGGGGACATTTGAGTGGGACCCAAACAGGTGTATAGCAGTTGTCCAGCCCAGCTGGCAAGGCCTGAGTCTGCCTCTGCAACCCCTCTCTTGGGCTCCTTTCTCTGCCACCCACCTCCTCACCTTTCCAGGTCATCACAGTTGGGGCCACCAATGCCCAAGACCAGCCGGTGACCCTGGGGACTTTGGGGACCAACTTTGGCCGCTGTGTGGACCTCTTTGCCCCAGGGGAGGACATCATTGGTGCCTCCAGCGACTGCAGCACCTGCTTTGTGTCACAGAGTGGGACATCACAGGCTGCTGCCCACGTGGCTGGTAAGTCACCACCCCACTGCCTCGGCCACCGTGATGCTAACAGCCCCTTTGGCAGTCAGGGTCTGTGCCGGGACCTCCAGTGCCAGGCTCTGTGCAGGGGGACCAGAGATGAAGTAGGCCTGATGGTGCCTTCAAGGACACTCAGTCTGATGAGGGAGGCGAGTGCACAGAGGAAACACGAGGTCAGGGCTGTATTAGAGGGAGCCCAGAGGAGGCACCTGCCCAGCCCGAGGGTCAGAGAAGGCATCTTGGAGGAGGGACATTTGATCGGGAGCTTGATGGATGAATAGGAGTTCACCTGGCCGATAAGACAGCAACTACCAAGGCTTAGAGGTGTGAGAGGAGGCTGTCTTACCTCACTGAGTAAGGACTGCAGGCGGCTTACCTTCGAGAAGAGAGCTTAGTGTCTGTGTGCACGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGCACTGGCAGGAGTCCCCTGCTGGGGCAGGAGGGCCGGGCCATCACCATCTTTCACCATTCACCCCTGCACCAGGCATTGCAGCCATGATGCTGTCTGCCGAGCCGGAGCTCACCCTGGCCGAGTTGAGGCAGAGACTGATCCACTTCTCTGCCAAAGATGTCATCAATGAGGCCTGGTTCCCTGAGGACCAGCGGGTACTGACCCCCAACCTGGTGGCCGCCCTGCCCCCCAGCACCCATGGGGCAGGTAAGCAGGATGGCAGGGTGGGCAAGTCCAGGCTGGGGCTTGGGAGGTCTGTGTGACCTTGACAGTCTCTCCCTTCTCCCTTGTCTGTGTAAGGAGGATGACGCCACCTTAAATAGGATTAAATGAGAATGGGGCTCTGAAAGGGCTGTGCAATATTTTCATAACGTGTTTTTATAGAGACAGTTGAGTATGTTCTTTAAGCCCTCCTCTCTCCTACCATGAACTAAAGATTTCTGTGGAGGTCCCCTCACTCCCAGCACCCCCTCCTCATCCCAGGCCCTTTTTGCAGGTTGGCAGCTGTTTTGCAGGACTGTATGGTCAGCACACTCGGGGCCTACACGGATGGCCACAGCCGTCGCCCGCTGCGCCCCAGATGAGGAGCTGCTGAGCTGCTCCAGTTTCTCCAGGAGTGGGAAGCGGCGGGGCGAGCGCATGGAGGTGACTGTACCCCTCCTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCTGGGCCCTCAGGGACCCCCAGCAAGCCCCTCCATCCTCCAGACTCCAGCTCTTCTGTAAGCTTACAGGGCTGGCCAGACCAGGAGTGGGGCACTCCTCACTTCACGCGGCTGGGGGCTGCTGGAGAGAGCCACAGCGGGAAGGGTTTCCTAGAGGCTGCAGGACAGTGCTGGATGGATTTTCAATGCTCACCTGGGTGTGAGCGTGCGGCAGGGCCGCGTGAGGGTCAGCGATCTGCTACTCTGGACTCAGCCATCTCTAGGCCCCTCTCACTCAGGTGCTCCATGGTTCTGGGAGCTGAGAAATCTCAAACCAGCAAAAAAGTGGAATTGATGTTGATGCTACAGGATAGTGCACAGATGCCATCTGGTTGCAGCATTTTGGTGGAAGGGCAGTGCCCAGCTAGGAGAGTGAGGAGGGGCAGGCATTTCTGGCTTGAGGAGATGGGGTCTTAATGCTCGTGTGAGAGGCAGAGTGGGTGGAGTGGAGCTGGCTGGATCCTTGCTTTGGCCTCCTGGATTTCTCTCTATCTCCATTTTGAAACCACTCTGTGTTTGGAAGAACTTTTGAGTATTCAGAGCTGCCCACTGGCAGAACAGTCTTCCTTGGGCAGGAGTGAGCTCCTTGTCCCCAGAAGGCTGGGTCTGGCTGGCCCCTGGCAGGGACACTGATGAGGGTGCTTGAGTTGATCCTGTCTAGTCCCTTTCTGTGTTTTCAAAGCCCATTCTAAAGCAGATTCCCATTTCCGTCTTTGACTCTAAGGCCCAAGGGGGCAAGCTGGTCTGCCGGGCCCACAACGCTTTTGGGGGTGAGGGTGTCTACGCCATTGCCAGGTGCTGCCTGCTACCCCAGGCCAACTGCAGCGTCCACACAGCTCCACCAGCTGAGGCCAGCATGGGGACCCGTGTCCACTGCCACCAACAGGGCCACGTCCTCACAGGTAGGAGGCTGGGCTTGCCCTGGGGTGAGGAGGGGTCTCTTTCTCCTTATGCACCCACTGCCCGCGAGGCTTGGTCCTCACAAGTGTGATCCATGAGACTCAAGCCTGACTTGCAGTTCCATACTCTGGTTCTGCCACTTCCATGCCCTTTGAGCCTGGGCAGGTGACCTTACTTCTCCTCATCTCAGCTTCCTCCTCCATAAGAGGGAAAAAGGTATTACCTGCCTCATTGTGTTGCAAGGAGATGGGCAGCATCTAGGGCACTGGCCTGGAGTATCGCAGGTGCTTTGCCTAAGGTGGTGCAGTCCAGGAGAGGCAGCTCCAGAGAGAGGCCCCCGGCTGGGGCTGAAAGGAGGGCAGACCTCGGTTTGAATTTCACCCTGCCGCTCTATAGCTGTGTGACTTGGGCAAATTACTTAACATCTCTGTATGAGGAAATGATGAGTGCTAAGCACTTAGCTTAGTGCCGGGACAATATAAATTCTAGCTATCGTTACTATTGTTTTCATCACCCGTTGCTTTAAAATCCAGCCTCTGGTATAGGCAACTATTGACGGGCTACCCTGTGTCGAAAACATGCCCAGGCAGGTAGCAGGAAGTCACAGATGGGGACCTCTTGGGGCATCAAGGGATGGTGCCCTGAGGCTGAGCTGTTCTGGTTGGGTGGAGCATGAGAGGTCTGGGAAGACAGTGGGACTCCAGCCTGGAATAAGAGGCTCAGAGTTGATTCTCGTCTGAGCACGTCCAGGGGAACCACTGAGGGTTTGGGAACAGGAGAGTGAGGGTGAGAACCTGGTTCTGGGCACAGCAGGCTGGCATGTAGGATGGATGTTCAGGAAAGATGAGCATAGTCAGGTGGCTGGTGCCCTTGTCCAGGGGAGAGGCTCCGTCAGGTTCAGGGGTCCTGGCTTGGAGGGAAGTCCGCCATGCTCTAATCAC
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TACCCGCCCCCTCCCCATCTCCATCCCCAGGCCCTGCGTCCTCTGCCCAATACTCTTTGGGCCTCCCTGTTGTCCAGCTCTCTCCGCGGCTCCATGACTGACAACTTGAGCAAGGCTAATGTGAATGGGAGCGGTTGAGGGCTCAGACCTCTCACCCGAGGAACATCCACAGAGTGTGCCGCATGCCCGGTGCAGTGTGGCTGCGGGGACACAGACACGGAGCCTCGGCCCTGAGGAGCTGGGGGGCAGTGACCGTCCCTCCTCTGACCCACCACTCCTCCAGTGTCAGGACACTGCGGGTATCTAGGGGAAGGAATCTTGTTCCACTTCAAGTCTGGAACTTCAAGTCTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGCGCGTTGGGGGTGGGGGTTGCAGAGCAGATGCGTACCTGACAGCGGTAACCTAGGTCCCCCCTGGCCTATCAAGGCTTCCCTGGCGGCCGAATTTAAAGGCATCAAGCAAACAAAGCCCAACACATCTCTGCCTTGTCCTCTCAGTTTCCCCCCGTGGCACTTAGAACCACTTGATACACCGAATAGTTTCCTATCTCCCCCACTAGGATGTAAACTCCACAGGGGCATTGGGAATGCTGCCTGGCTATGGTAGGGACAGAGGGGAGCACCAGGGCGGGGCAGGGGTGCCAGAGTTCTGCCTGGGCAGTCAGATTTTCCTTAGGAGGGGACATTTGAGTGGGACCCAAACAGGTGTATAGCAGTTGTCCAGCCCAGCTGGCAAGGCCTGAGTCTGCCTCTGCAACCCCTCTCTTGGGCTCCTTTCTCTGCCACCCACCTCCTCACCTTTCCAGGTCATCACAGTTGGGGCCACCAATGCCCAAGACCAGCCGGTGACCCTGGGGACTTTGGGGACCAACTTTGGCCGCTGTGTGGACCTCTTTGCCCCAGGGGAGGACATCATTGGTGCCTCCAGCGACTGCAGCACCTGCTTTGTGTCACAGAGTGGGACATCACAGGCTGCTGCCCACGTGGCTGGTAAGTCACCACCCCACTGCCTCGGCCACCGTGATGCTAACAGCCCCTTTGGCAGTCAGGGTCTGTGCCGGGACCTCCAGTGCCAGGCTCTGTGCAGGGGGACCAGAGATGAAGTAGGCCTGATGGTGCCTTCAAGGACACTCAGTCTGATGAGGGAGGCGAGTGCACAGAGGAAACACGAGGTCAGGGCTGTATTAGAGGGAGCCCAGAGGAGGCACCTGCCCAGCCCGAGGGTCAGAGAAGGCATCTTGGAGGAGGGACATTTGATCGGGAGCTTGATGGATGAATAGGAGTTCACCTGGCCGATAAGACAGCAACTACCAAGGCTTAGAGGTGTGAGAGGAGGCTGTCTTACCTCACTGAGTAAGGACTGCAGGCGGCTTACCTTCGAGAAGAGAGCTTAGTGTCTGTGTGCACGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGCACTGGCAGGAGTCCCCTGCTGGGGCAGGAGGGCCGGGCCATCACCATCTTTCACCATTCACCCCTGCACCAGGCATTGCAGCCATGATGCTGTCTGCCGAGCCGGAGCTCACCCTGGCCGAGTTGAGGCAGAGACTGATCCACTTCTCTGCCAAAGATGTCATCAATGAGGCCTGGTTCCCTGAGGACCAGCGGGTACTGACCCCCAACCTGGTGGCCGCCCTGCCCCCCAGCACCCATGGGGCAGGTAAGCAGGATGGCAGGGTGGGCAAGTCCAGGCTGGGGCTTGGGAGGTCTGTGTGACCTTGACAGTCTCTCCCTTCTCCCTTGTCTGTGTAAGGAGGATGACGCCACCTTAAATAGGATTAAATGAGAATGGGGCTCTGAAAGGGCTGTGCAATATTTTCATAACGTGTTTTTATAGAGACAGTTGAGTATGTTCTTTAAGCCCTCCTCTCTCCTACCATGAACTAAAGATTTCTGTGGAGGTCCCCTCACTCCCAGCACCCCCTCCTCATCCCAGGCCCTTTTTGCAGGTTGGCAGCTGTTTTGCAGGACTGTATGGTCAGCACACTCGGGGCCTACACGGATGTCCACAGCCGTCGCCCGCTGCGCCCCAGATGAGGAGCTGCTGAGCTGCTCCAGTTTCTCCAGGAGTGGGAAGCGGCGGGGCGAGCGCATGGAGGTGACTGTACCCCTCCTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCTGGGCCCTCAGGGACCCCCAGCAAGCCCCTCCATCCTCCAGACTCCAGCTCTTCTGTAAGCTTACAGGGCTGGCCAGACCAGGAGTGGGGCACTCCTCACTTCACGCGGCTGGGGGCTGCTGGAGAGAGCCACAGCGGGAAGGGTTTCCTAGAGGCTGCAGGACAGTGCTGGATGGATTTTCAATGCTCACCTGGGTGTGAGCGTGCGGCAGGGCCGCGTGAGGGTCAGCGATCTGCTACTCTGGACTCAGCCATCTCTAGGCCCCTCTCACTCAGGTGCTCCATGGTTCTGGGAGCTGAGAAATCTCAAACCAGCAAAAAAGTGGAATTGATGTTGATGCTACAGGATAGTGCACAGATGCCATCTGGTTGCAGCATTTTGGTGGAAGGGCAGTGCCCAGCTAGGAGAGTGAGGAGGGGCAGGCATTTCTGGCTTGAGGAGATGGGGTCTTAATGCTCGTGTGAGAGGCAGAGTGGGTGGAGTGGAGCTGGCTGGATCCTTGCTTTGGCCTCCTGGATTTCTCTCTATCTCCATTTTGAAACCACTCTGTGTTTGGAAGAACTTTTGAGTATTCAGAGCTGCCCACTGGCAGAACAGTCTTCCTTGGGCAGGAGTGAGCTCCTTGTCCCCAGAAGGCTGGGTCTGGCTGGCCCCTGGCAGGGACACTGATGAGGGTGCTTGAGTTGATCCTGTCTAGTCCCTTTCTGTGTTTTCAAAGCCCATTCTAAAGCAGATTCCCATTTCCGTCTTTGACTCTAAGGCCCAAGGGGGCAAGCTGGTCTGCCGGGCCCACAACGCTTTTGGGGGTGAGGGTGTCTACGCCATTGCCAGGTGCTGCCTGCTACCCCAGGCCAACTGCAGCGTCCACACAGCTCCACCAGCTGAGGCCAGCATGGGGACCCGTGTCCACTGCCACCAACAGGGCCACGTCCTCACAGGTAGGAGGCTGGGCTTGCCCTGGGGTGAGGAGGGGTCTCTTTCTCCTTATGCACCCACTGCCCGCGAGGCTTGGTCCTCACAAGTGTGATCCATGAGACTCAAGCCTGACTTGCAGTTCCATACTCTGGTTCTGCCACTTCCATGCCCTTTGAGCCTGGGCAGGTGACCTTACTTCTCCTCATCTCAGCTTCCTCCTCCATAAGAGGGAAAAAGGTATTACCTGCCTCATTGTGTTGCAAGGAGATGGGCAGCATCTAGGGCACTGGCCTGGAGTATCGCAGGTGCTTTGCCTAAGGTGGTGCAGTCCAGGAGAGGCAGCTCCAGAGAGAGGCCCCCGGCTGGGGCTGAAAGGAGGGCAGACCTCGGTTTGAATTTCACCCTGCCGCTCTATAGCTGTGTGACTTGGGCAAATTACTTAACATCTCTGTATGAGGAAATGATGAGTGCTAAGCACTTAGCTTAGTGCCGGGACAATATAAATTCTAGCTATCGTTACTATTGTTTTCATCACCCGTTGCTTTAAAATCCAGCCTCTGGTATAGGCAACTATTGACGGGCTACCCTGTGTCGAAAACATGCCCAGGCAGGTAGCAGGAAGTCACAGATGGGGACCTCTTGGGGCATCAAGGGATGGTGCCCTGAGGCTGAGCTGTTCTGGTTGGGTGGAGCATGAGAGGTCTGGGAAGACAGTGGGACTCCAGCCTGGAATAAGAGGCTCAGAGTTGATTCTCGTCTGAGCACGTCCAGGGGAACCACTGAGGGTTTGGGAACAGGAGAGTGAGGGTGAGAACCTGGTTCTGGGCACAGCAGGCTGGCATGTAGGATGGATGTTCAGGAAAGATGAGCATAGTCAGGTGGCTGGTGCCCTTGTCCAGGGGAGAGGCTCCGTCAGGTTCAGGGGTCCTGGCTTGGAGGGAAGTCCGCCATGCTCTAATCAC
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Task1_train_952
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Here is a genetic alteration in PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) on Chromosome 1. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Hypercholesterolemia, familial, 1
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GCCACAGGGAGGCCAGCATCCACGCTTCCTGCTGCCATGCCCCAGGTCTGGAATGCAAAGTCAAGGAGCATGGAATCCCGGCCCCTCAGGAGCAGGTGAAGAGGCCCGTGAGGCCGGGTGGGTGGGGTGCTGCGTGTCTCTCCTGCACAGCTTTTCTGTGTCAGTTTGTGCCACCACCATACCGCCATGCATCAGGGTGGCGGTTTGCCAGGTAGATGCTGTGGGCAGCTTCCGCCATTGTGTGGACAGCATGTATATGTGTCTCTGTGTGGCTGGGTCTGTTTTTGCTTTTGTCCAGATCAGTAAGGTTTGCTACCTGGGTACCCCACTCCACTTGGAGTAGAATGTGCATAAATATGGCATAAAGAAATGCAATATGCATGCATTTATTGATTGATCTATTTTTTTCTGAGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAATTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTGGTCTCAGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTATAGGCATGAGCCGCTGCACCTGGCCTCTCTGATCTATTTAACAAACCTGCTGGGAGGGTCTCAGGGTCAGGAGCAGCACTGGGCTCTGAGGACACAGAGCTCACTCAGCCGTGACCCAGAGGGGGTGCCTGAGCTGCATGCTGAAGGTTGTTAGCATGACCAGCAAGGCAAGAAAAGGCCCTGCCGAGATTAGCAAGGCATGTGCCAAGCCCTGGAATGTGACAGCCGGGCCTTCTAGAAACCTGAGTGTATAACTCTCCTTAAAAGCCAGTAGGAGCTCCTCAAAAGGCAGCCCTAAGGAGTCCACTCTTAAATGAACTCAGAGTCAGTTTTAAAATGCAAGTCTGTGTTGATTCTGGTCTGGATGGTGCATTCCTCGAGAGCAAAAGACAGTCTTGGTCTTGGATCCACTTGCCCTGGGTACACTGAGGGCTGCTAGGTTCCAGGTGCTCTTCCTGGCACTGGGGAGGGATACAGGCCCAAGAGACATGCTGTTCTCCCTCCTGGAGCATCTATTTTAGTGGAGGAAGACAGAAAACAAACCATTAATATAGAGTACTGAAAAGATGCGATGGAGAAAACTATAGCAAGGAAGGGAATGGGGTGGGAGAGAGGTCAGGAGAGGTCTCGCTGACAAGGTGGACGAAACAGGCCATGAGGCAGAGAACATGTTCCAGGCAAAGCAAAGGCCCCCAGGTGGGGATGTGCAGGGAGTACCAGGAAACCAGAGAGGTGGGAATAGTTATGAGATGGGGGGTGCCTCAGAGGGGACAGGGCCAAGTCAGGTGAGACCTGAGGGTCACAGTCAGCAGTGAGCTGGGGCCATGCAGGGGTCTGGCCTCAGAGGAGTGTGGTCTGGCCTGGATCTGAACCTCTCACTGTGGCCTAGCTGCTGAGCTGAGAAGAGATGACAAGGACCTTGGGCAGAAGCAGGGAGACTGGAGGGAGGCGGTGGAGGGTCCAGGCGTTGGGGCGGGGCTCAGGCTGGAGTCTGAAGGGAGCCTGCAGGCCTGGTGGGTGGATGTGGGTGGGAGAGGGGGAGGATGGCACCAAGGCTCGGGCCCCTGGACAGATGGAGTTGCCATTAAGTGGGATGGGGCAGGCTATGGGGCCATCAGTTTCAGAGGGATGAGTTTGGCACTGGCATGGTAGGCATCTGTCTATCTCCACGGCCCTCAAACCAGGCATGAAGCAGGAGCTCACGTGTTTGGTCAGCCATGGTGCAGAACCGCCTGGGTGGGAGGTGCGGGGTGGGAGATACACGGTTGTGTCCCAAATGGGCTCTGAGCCAGCGAGGGCCGTCTGCACTTTGGCCTCACAGAAGGATGTCGGAGGGAGAAATGAAGTGTGGGTGGGGGTCCCGGGCCACGCTAGACATGTGCTTTCTTTTCCTCGGGCTCTGGCAGGTGACCGTGGCCTGCGAGGAGGGCTGGACCCTGACTGGCTGCAGTGCCCTCCCTGGGACCTCCCACGTCCTGGGGGCCTACGCCGTAGACAACACGTGTGTAGTCAGGAGCCGGGACGTCAGCACTACAGGCAGCACCAGCGAAGGGGCCGTGACAGCCGTTGCCATCTGCTGCCGGAGCCGGCACCTGGCGCAGGCCTCCCAGGAGCTCCAGTGACAGCCCCATCCCAGGATGGGTGTCTGGGGAGGGTCAAGGGCTGGGGCTGAGCTTTAAAATGGTTCCGACTTGTCCCTCTCTCAGCCCTCCATGGCCTGGCACGAGGGGATGGGGATGCTTCCGCCTTTCCGGGGCTGCTGGCCTGGCCCTTGAGTGGGGCAGCCTCCTTGCCTGGAACTCACTCACTCTGGGTGCCTCCTCCCCAGGTGGAGGTGCCAGGAAGCTCCCTCCCTCACTGTGGGGCATTTCACCATTCAAACAGGTCGAGCTGTGCTCGGGTGCTGCCAGCTGCTCCCAATGTGCCGATGTCCGTGGGCAGAATGACTTTTATTGAGCTCTTGTTCCGTGCCAGGCATTCAATCCTCAGGTCTCCACCAAGGAGGCAGGATTCTTCCCATGGATAGGGGAGGGGGCGGTAGGGGCTGCAGGGACAAACATCGTTGGGGGGTGAGTGTGAAAGGTGCTGATGGCCCTCATCTCCAGCTAACTGTGGAGAAGCCCCTGGGGGCTCCCTGATTAATGGAGGCTTAGCTTTCTGGATGGCATCTAGCCAGAGGCTGGAGACAGGTGCGCCCCTGGTGGTCACAGGCTGTGCCTTGGTTTCCTGAGCCACCTTTACTCTGCTCTATGCCAGGCTGTGCTAGCAACACCCAAAGGTGGCCTGCGGGGAGCCATCACCTAGGACTGACTCGGCAGTGTGCAGTGGTGCATGCACTGTCTCAGCCAACCCGCTCCACTACCCGGCAGGGTACACATTCGCACCCCTACTTCACAGAGGAAGAAACCTGGAACCAGAGGGGGCGTGCCTGCCAAGCTCACACAGCAGGAACTGAGCCAGAAACGCAGATTGGGCTGGCTCTGAAGCCAAGCCTCTTCTTACTTCACCCGGCTGGGCTCCTCATTTTTACGGGTAACAGTGAGGCTGGGAAGGGGAACACAGACCAGGAAGCTCGGTGAGTGATGGCAGAACGATGCCTGCAGGCATGGAACTTTTTCCGTTATCACCCAGGCCTGATTCACTGGCCTGGCGGAGATGCTTCTAAGGCATGGTCGGGGGAGAGGGCCAACAACTGTCCCTCCTTGAGCACCAGCCCCACCCAAGCAAGCAGACATTTATCTTTTGGGTCTGTCCTCTCTGTTGCCTTTTTACAGCCAACTTTTCTAGACCTGTTTTGCTTTTGTAACTTGAAGATATTTATTCTGGGTTTTGTAGCATTTTTATTAATATGGTGACTTTTTAAAATAAAAACAAACAAACGTTGTCCTAACTCTTGCATAGACTTGACTGCCTAGGGTGATGCCTTGCTTATACTAGGAACTGGGTAAGTTTGTTGAATAGTTGAGTAAGCCAAGTATTTGATGAGTACTTTTATCTTGAGTACAAGTATTGGGCAAGTACTGGTGATGTGAACTTACTCCTTGTGCCTATCCTAGGAATGAAATGAATGTCTTCCTGCAGCTCCCCTGACCACCCTGACAGTCAAAGTGCCTCCTCCTTGGTGACAGGTGCCCTACAGCACTCTAGATGCTCTGTTGTCCTGACCTCCCAATGCCCTTTTCATTCTTTTCTCCCCAGTACCTGGCACACAGCCTGGCCCGAGTATTTACGGAATAAGTTACAGTGCCAGATGCTTCTGTAATGAGCCAGTGCTAAGTCCATGGCTTTTTTCATGATTTAAAATTCAGAACAGTCTCAGATTGGGTGCAATGGCTCACACCTGTAATCTCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGTGTTTAGGAATTCAAGACCCTGGGCAACAGTGAGACCCCGTCTCTATAAAAAAATTTAAAAGATTAGCGAGGTGTGGTAGCACATGCCTGTGGTCCCGGCTACTCAGGAGGCTGATATGGGAGGCTTGCTTGAGCTGGGAGGCTGAGGGTGCAGTGAGCTGTAATTACATCATCACTGCACTGCAGCCTGGGTTACAGAGTGCATAATGA
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Task1_train_953
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Chromosome 1 houses a mutation in gene TACSTD2 (tumor associated calcium signal transducer 2). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Gelatinous droplike corneal dystrophy
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TAGGTAAAACATATCTTTAAAGCACATTAATAGTAAAAATCCCTGGGTGCAGTGGCTCACACCTATGATACCAGCACTTTGGGAGGCCGACGCAGGTGGATCACCTGAGGGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCATCTCTACTAAAAATGCAAAAATTAGTTGGGCATAGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGCTCACTCCACTGCCCTGCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAATATATGTAATAAGTAAAAGTCTTAGGAAAACAGCCTGTGCACACCCAGCAAAAGTGTAGGGCCCACTGCAGACTGGCTCTAATTATGTGGGAAAGTCGTTTAATCTTAGAGCCACAACGCTTTGAGATTAAGTGATTTGCTCAAAGGCTAAATGGAAATAGTACCACTTATTTCAAAGTAGGGCTGGGATTCAAAGGAGGTACAGCTCTTGAACTAGAGTTTTCTGTCTCCATTGGTGATAAGCCTTGTTTAGAGATGACCAAAGACTGGCACTCTTTTTCATAAAAGCAGCTAGTTTTAGCTTCCTCCCTCAAGCTCACCCTCCTGCAGTTTGAAGGAAGTTTCCAAATAATCTTATTTAGAAAGAATAGCATTTACACTGGCCAGTTAGGATATCTTAGGACACACCAGAGTAGCAACATGAAACACCCACTTCTGGGGGAAAAAAAAGTGTTATAATTTGAAATAAAAAAAAAATACAAGTCTTGGGAAATTAGAGACCAATGTGATAGAAATCTGGAGGGACTTTTCACAAATGCCGACTTCTGGTTTGTGCCTTTCCCATATTTTATTAAATTCGTGTTTTATTTTAAAAAATTACAGCAACATTATCAAAGACAACATATGTACAAACATTTTACAAAAAAGAACATTACCAATATCAGTGGCAGTAAGGGCAAGCTGAAGAATAAATAGACTGAGTTTCCGGGCAATGTCTGTCCTCAAAGACATCCAAACTGCGTTCAGGCAGCTGAAACAGGCTTCTTTCCCAGTGACAAGCATATGTGGTCAGTAATACAAACGATGGTAAATGAGGCTACTACATAGGCCCAGTTAACAAACTCCTCTTCTCCTCGGGTAGGCCATGATACAAGTGGAACTCATCAAATAATTTAAACCCAAGGCGATAACAACGCTATTTCCCATCTAAACTCATTTAAGCCTTCACAATGTCGCAATGGATTCAGTTACTTGCAAACGATCCCGGGTTGTCATACAGATACTTGTTTTTTACACATAACGCTATGCCATCCCTTCCTTCACTGCCCCAGTCAGGTTTCCTGTTGTTGGACCGAAAGGGGATACATTTTAGAAATGCTTCCTTCAAGACAGAAGTGAGAAAGAAAGGAGACCCTGAGGCCAGGATCTATTAAACCTGGTGTGTGCGCAAAAGGGAGGGGGAAGGCAGGAATTTGAAAGGATAAACGTCTCCTTTGCGCCGAGGAATCAGGAAGCGTGACTCACTTGGGTCTGGGACGATACCGAAATCCGGTACCCCACCCCATCCCCTGCCCCGCCGGGTACCTACAAGCTCGGTTCCTTTCTCAACTCCCCCAGTTCCTTGATCTCCACCTTCTTGTACTTCCCCGACTTTCTCCGGTTGGTGATCACCAGGACGGCCATGCCGGCGACGAGGGCCACCACGACCACCACGATGACGGCGATGAGGCCGGCGGTGAGGCGCTTCATGGAGAACTTCGGGGGAATCTCGTCCAGGTAATAGATGAGCGTGCGCTCCACCTGCAGGGGTTCTCCGCGCACGCGCAAGTCCAGGCCGCCGCGGCCCTGGAATAGAGACTCGCCCTTGATGTCCCTCTCGAAGTAGTAGGCGGCATCGCCGATATCCACGTCACCGGCGGCCTTCTGAGACGTGTTCTGCCGCAGCTCGATCTGGATGGTGGGCTGCTCGTAGTGCACGGCCGCCACGAACTTGGGGTGCAGCCGATAGCGCTCGCGGAAGAGCCGCCTCAGCTCGGCGTCCAGGTCTGAGTGGTTGAAGGCGCCGGCGGTGGGGCGGTGGCGCAGGTCAATGAGGATGTGGTGGGTGCGCACCAGCTCATCGCAGCGTAGGCTCAGGTCGCCCTTGTCCGTGCGGCGCACGCCCACCGAGTTCACGCACCAGCACACCGACGTCTGGTTGCACTGGCGCGCCTTGAAGCGGCCCTCGGGGTCGCAGTCGGGGTCGTAGAGGCCATCGTTGTCCACGAGCGCGTGCTCACTCGGCCGCACCAGCGTGCGGGCGTTCTTGGGGGCGCTCATGCGCGCCTTGAGCAGCAGACACTTGGAGGTCAGCGTGGAGCAGTCGACCGCCATGCCCGAGCCCAGCGCGCGGCACTGGCAGCGGCCGCCGGGGCCGTCGGGGCTGCACACGGTCATCTTGTTGGTGGGACACGTGCAGTTGTCCTGCGCGGCCGTGTGGCCGGTCACCGCCGCCAGCACCAGCAGCAGCAGCGGCAGCCGCAGCGGTGGCGGCGCGAGGCCGGGGCCCCGAGCCATGGTGGGGCGGAGGAACGCGGACCGGACGCGGGCGGATGAGGCGCGGGGACTCGTCGGGGCTCGGGCTCCGGCGTCTGGGATGGTCTGCAGGCGTCTGCCGCCCGGCCGCTCCCTCCGGCTCTTATACTCTACCCGACCTGCCCGGCTGGTTCCACCACCGACCGTCCCCACTGGTATTTGGGTGACACATCCCGCCCCCCTCCCCGTCCCACGGAAGGCCAAGCCGGCCCTGCGCCGCCCGCGATAGGATCAGAACAGGGAAGCTGCTCCCGCCTCCTCCGGACCGAAAGCCGGGAAGGGGAGAACCGATACTCACCTGTAGGCTTCTGGGGACCCGCCCTCGGCGCGGCCTCCTGCTACAGACCTGGCGCGTCTGGGCCGCTCTCCCGGCAGAAAGTCTAAAGAGTTTCATTGCAAAGTGTGGCTCGCGACTGTCGCGCTCTCCTCTATACGCGACTCCCTTTTCGTTCTTTCCCAGCCCCAGCCCTCCCTTAATTTCTCTCACTCCCTCTCTTCTTTGTCCAGTTCTCACAGTAGCACACGTTTATATAGTTTACAGTTCACAAACATTATCTCATCCTAACACCAGTCCTGACAGGTAGGGACTATCAGACCCGTTTTATAGGTGGTACTGATGAGGCTTAAAGACCTGAAGTCACACTGCTATCAACTTCCTCATATTTCTGAGAGGGGTCTTTGGCACCCTGCCTAGGAGTGATGAGACCTTAAATAAAGTGTTTGTGGACACGAAGTGACACAGAATCTGAAGGGAAGTTAGGGAAGCAGTTCTGTTACTCACCATATCAAGGGTAAAACACAGGTATCCTGGTGTCCAGAGGGTTAAAAGTTCTGTTAAACACTAATTTTCTGTACCTCACACAAGCGCACACACACAGGCACACACGCACATAATATTTATTTGTGCACTGGCTATAAAGAGACAAACAGGAACAAATTCTTAAAGAGCCAGCAAGACTGTAAAGAGTTTTTTGTACAATTTGATTCTAACACAGCAAATCGTTGCTTTTCTTTTCCTGTATCCCACGTAAGTAGCTGAACCATGTAAATAATGAAAGAATGGAGCCTGTGAGAAATTGCTTGTCTGCCACTGTGTGGCTAGTTTCATGGCATACAGGGGTTGCAATCTCTTTTTGAGTCATTGAGAAAGTCTAGAGTTTCAAAGCTGTGGTAAAATTAACAATAATTAGCAAGCTATAATTATTCCCAGGTCCTCCATCAAAGCACATTTTATATGTTCAGCATTTAATGTGCACCACCAGTCGTGCAAGGGTGTTGTTTAGCAGATGAAAGCCAGCTGGGCCTCTGTCCCATTAATTTTCACGCAATTCCTGAGGCAGGAAGATTGAAATATATTCTGCCTTGACAGACAGAGGAAGCAGAGACATGTGAGGGACAATTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCCCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCT
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Task1_train_954
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Consider this mutation in TACSTD2 (tumor associated calcium signal transducer 2) on Chromosome 1. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; Gelatinous droplike corneal dystrophy
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Task1_train_955
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A variant found in Chromosome 1 affects TACSTD2 (tumor associated calcium signal transducer 2). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; Gelatinous droplike corneal dystrophy
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CTCCATTGGTGATAAGCCTTGTTTAGAGATGACCAAAGACTGGCACTCTTTTTCATAAAAGCAGCTAGTTTTAGCTTCCTCCCTCAAGCTCACCCTCCTGCAGTTTGAAGGAAGTTTCCAAATAATCTTATTTAGAAAGAATAGCATTTACACTGGCCAGTTAGGATATCTTAGGACACACCAGAGTAGCAACATGAAACACCCACTTCTGGGGGAAAAAAAAGTGTTATAATTTGAAATAAAAAAAAAATACAAGTCTTGGGAAATTAGAGACCAATGTGATAGAAATCTGGAGGGACTTTTCACAAATGCCGACTTCTGGTTTGTGCCTTTCCCATATTTTATTAAATTCGTGTTTTATTTTAAAAAATTACAGCAACATTATCAAAGACAACATATGTACAAACATTTTACAAAAAAGAACATTACCAATATCAGTGGCAGTAAGGGCAAGCTGAAGAATAAATAGACTGAGTTTCCGGGCAATGTCTGTCCTCAAAGACATCCAAACTGCGTTCAGGCAGCTGAAACAGGCTTCTTTCCCAGTGACAAGCATATGTGGTCAGTAATACAAACGATGGTAAATGAGGCTACTACATAGGCCCAGTTAACAAACTCCTCTTCTCCTCGGGTAGGCCATGATACAAGTGGAACTCATCAAATAATTTAAACCCAAGGCGATAACAACGCTATTTCCCATCTAAACTCATTTAAGCCTTCACAATGTCGCAATGGATTCAGTTACTTGCAAACGATCCCGGGTTGTCATACAGATACTTGTTTTTTACACATAACGCTATGCCATCCCTTCCTTCACTGCCCCAGTCAGGTTTCCTGTTGTTGGACCGAAAGGGGATACATTTTAGAAATGCTTCCTTCAAGACAGAAGTGAGAAAGAAAGGAGACCCTGAGGCCAGGATCTATTAAACCTGGTGTGTGCGCAAAAGGGAGGGGGAAGGCAGGAATTTGAAAGGATAAACGTCTCCTTTGCGCCGAGGAATCAGGAAGCGTGACTCACTTGGGTCTGGGACGATACCGAAATCCGGTACCCCACCCCATCCCCTGCCCCGCCGGGTACCTACAAGCTCGGTTCCTTTCTCAACTCCCCCAGTTCCTTGATCTCCACCTTCTTGTACTTCCCCGACTTTCTCCGGTTGGTGATCACCAGGACGGCCATGCCGGCGACGAGGGCCACCACGACCACCACGATGACGGCGATGAGGCCGGCGGTGAGGCGCTTCATGGAGAACTTCGGGGGAATCTCGTCCAGGTAATAGATGAGCGTGCGCTCCACCTGCAGGGGTTCTCCGCGCACGCGCAAGTCCAGGCCGCCGCGGCCCTGGAATAGAGACTCGCCCTTGATGTCCCTCTCGAAGTAGTAGGCGGCATCGCCGATATCCACGTCACCGGCGGCCTTCTGAGACGTGTTCTGCCGCAGCTCGATCTGGATGGTGGGCTGCTCGTAGTGCACGGCCGCCACGAACTTGGGGTGCAGCCGATAGCGCTCGCGGAAGAGCCGCCTCAGCTCGGCGTCCAGGTCTGAGTGGTTGAAGGCGCCGGCGGTGGGGCGGTGGCGCAGGTCAATGAGGATGTGGTGGGTGCGCACCAGCTCATCGCAGCGTAGGCTCAGGTCGCCCTTGTCCGTGCGGCGCACGCCCACCGAGTTCACGCACCAGCACACCGACGTCTGGTTGCACTGGCGCGCCTTGAAGCGGCCCTCGGGGTCGCAGTCGGGGTCGTAGAGGCCATCGTTGTCCACGAGCGCGTGCTCACTCGGCCGCACCAGCGTGCGGGCGTTCTTGGGGGCGCTCATGCGCGCCTTGAGCAGCAGACACTTGGAGGTCAGCGTGGAGCAGTCGACCGCCATGCCCGAGCCCAGCGCGCGGCACTGGCAGCGGCCGCCGGGGCCGTCGGGGCTGCACACGGTCATCTTGTTGGTGGGACACGTGCAGTTGTCCTGCGCGGCCGTGTGGCCGGTCACCGCCGCCAGCACCAGCAGCAGCAGCGGCAGCCGCAGCGGTGGCGGCGCGAGGCCGGGGCCCCGAGCCATGGTGGGGCGGAGGAACGCGGACCGGACGCGGGCGGATGAGGCGCGGGGACTCGTCGGGGCTCGGGCTCCGGCGTCTGGGATGGTCTGCAGGCGTCTGCCGCCCGGCCGCTCCCTCCGGCTCTTATACTCTACCCGACCTGCCCGGCTGGTTCCACCACCGACCGTCCCCACTGGTATTTGGGTGACACATCCCGCCCCCCTCCCCGTCCCACGGAAGGCCAAGCCGGCCCTGCGCCGCCCGCGATAGGATCAGAACAGGGAAGCTGCTCCCGCCTCCTCCGGACCGAAAGCCGGGAAGGGGAGAACCGATACTCACCTGTAGGCTTCTGGGGACCCGCCCTCGGCGCGGCCTCCTGCTACAGACCTGGCGCGTCTGGGCCGCTCTCCCGGCAGAAAGTCTAAAGAGTTTCATTGCAAAGTGTGGCTCGCGACTGTCGCGCTCTCCTCTATACGCGACTCCCTTTTCGTTCTTTCCCAGCCCCAGCCCTCCCTTAATTTCTCTCACTCCCTCTCTTCTTTGTCCAGTTCTCACAGTAGCACACGTTTATATAGTTTACAGTTCACAAACATTATCTCATCCTAACACCAGTCCTGACAGGTAGGGACTATCAGACCCGTTTTATAGGTGGTACTGATGAGGCTTAAAGACCTGAAGTCACACTGCTATCAACTTCCTCATATTTCTGAGAGGGGTCTTTGGCACCCTGCCTAGGAGTGATGAGACCTTAAATAAAGTGTTTGTGGACACGAAGTGACACAGAATCTGAAGGGAAGTTAGGGAAGCAGTTCTGTTACTCACCATATCAAGGGTAAAACACAGGTATCCTGGTGTCCAGAGGGTTAAAAGTTCTGTTAAACACTAATTTTCTGTACCTCACACAAGCGCACACACACAGGCACACACGCACATAATATTTATTTGTGCACTGGCTATAAAGAGACAAACAGGAACAAATTCTTAAAGAGCCAGCAAGACTGTAAAGAGTTTTTTGTACAATTTGATTCTAACACAGCAAATCGTTGCTTTTCTTTTCCTGTATCCCACGTAAGTAGCTGAACCATGTAAATAATGAAAGAATGGAGCCTGTGAGAAATTGCTTGTCTGCCACTGTGTGGCTAGTTTCATGGCATACAGGGGTTGCAATCTCTTTTTGAGTCATTGAGAAAGTCTAGAGTTTCAAAGCTGTGGTAAAATTAACAATAATTAGCAAGCTATAATTATTCCCAGGTCCTCCATCAAAGCACATTTTATATGTTCAGCATTTAATGTGCACCACCAGTCGTGCAAGGGTGTTGTTTAGCAGATGAAAGCCAGCTGGGCCTCTGTCCCATTAATTTTCACGCAATTCCTGAGGCAGGAAGATTGAAATATATTCTGCCTTGACAGACAGAGGAAGCAGAGACATGTGAGGGACAATTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCCCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCGCCGCCCAGGTTCAAGCAAGTCTCCCGCGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCAAGCCTGGCTAATTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCGGCGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAACTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCATGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAAGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGGTGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCGTGAGGGACAATTTCTTATCCACAAACATGAGGAATTGTGGGATAGTCCTCTGC
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CTCCATTGGTGATAAGCCTTGTTTAGAGATGACCAAAGACTGGCACTCTTTTTCATAAAAGCAGCTAGTTTTAGCTTCCTCCCTCAAGCTCACCCTCCTGCAGTTTGAAGGAAGTTTCCAAATAATCTTATTTAGAAAGAATAGCATTTACACTGGCCAGTTAGGATATCTTAGGACACACCAGAGTAGCAACATGAAACACCCACTTCTGGGGGAAAAAAAAGTGTTATAATTTGAAATAAAAAAAAAATACAAGTCTTGGGAAATTAGAGACCAATGTGATAGAAATCTGGAGGGACTTTTCACAAATGCCGACTTCTGGTTTGTGCCTTTCCCATATTTTATTAAATTCGTGTTTTATTTTAAAAAATTACAGCAACATTATCAAAGACAACATATGTACAAACATTTTACAAAAAAGAACATTACCAATATCAGTGGCAGTAAGGGCAAGCTGAAGAATAAATAGACTGAGTTTCCGGGCAATGTCTGTCCTCAAAGACATCCAAACTGCGTTCAGGCAGCTGAAACAGGCTTCTTTCCCAGTGACAAGCATATGTGGTCAGTAATACAAACGATGGTAAATGAGGCTACTACATAGGCCCAGTTAACAAACTCCTCTTCTCCTCGGGTAGGCCATGATACAAGTGGAACTCATCAAATAATTTAAACCCAAGGCGATAACAACGCTATTTCCCATCTAAACTCATTTAAGCCTTCACAATGTCGCAATGGATTCAGTTACTTGCAAACGATCCCGGGTTGTCATACAGATACTTGTTTTTTACACATAACGCTATGCCATCCCTTCCTTCACTGCCCCAGTCAGGTTTCCTGTTGTTGGACCGAAAGGGGATACATTTTAGAAATGCTTCCTTCAAGACAGAAGTGAGAAAGAAAGGAGACCCTGAGGCCAGGATCTATTAAACCTGGTGTGTGCGCAAAAGGGAGGGGGAAGGCAGGAATTTGAAAGGATAAACGTCTCCTTTGCGCCGAGGAATCAGGAAGCGTGACTCACTTGGGTCTGGGACGATACCGAAATCCGGTACCCCACCCCATCCCCTGCCCCGCCGGGTACCTACAAGCTCGGTTCCTTTCTCAACTCCCCCAGTTCCTTGATCTCCACCTTCTTGTACTTCCCCGACTTTCTCCGGTTGGTGATCACCAGGACGGCCATGCCGGCGACGAGGGCCACCACGACCACCACGATGACGGCGATGAGGCCGGCGGTGAGGCGCTTCATGGAGAACTTCGGGGGAATCTCGTCCAGGTAATAGATGAGCGTGCGCTCCACCTGCAGGGGTTCTCCGCGCACGCGCAAGTCCAGGCCGCCGCGGCCCTGGAATAGAGACTCGCCCTTGATGTCCCTCTCGAAGTAGTAGGCGGCATCGCCGATATCCACGTCACCGGCGGCCTTCTGAGACGTGTTCTGCCGCAGCTCGATCTGGATGGTGGGCTGCTCGTAGTGCACGGCCGCCACGAACTTGGGGTGCAGCCGATAGCGCTCGCGGAAGAGCCGCCTCAGCTCGGCGTCCAGGTCTGAGTGGTTGAAGGCGCCGGCGGTGGGGCGGTGGCGCAGGTCAATGAGGATGTGGTGGGTGCGCACCAGCTCATCGCAGCGTAGGCTCAGGTCGCCCTTGTCCGTGCGGCGCACGCCCACCGAGTTCACGCACCAGCACACCGACGTCTGGTTGCACTGGCGCGCCTTGAAGCGGCCCTCGGGGTCGCAGTCGGGGTCGTAGAGGCCATCGTTGTCCACGAGCGCGTGCTCACTCGGCCGCACCAGCGTGCGGGCGTTCTTGGGGGCGCTCATGCGCGCCTTGAGCAGCAGACACTTGGAGGTCAGCGTGGAGCAGTCGACCGCCATGCCCGAGCCCAGCGCGCGGCACTGGCAGCGGCCGCCGGGGCCGTCGGGGCTGCACACGGTCATCTTGTTGGTGGGACACGTGCAGTTGTCCTGCGCGGCCGTGTGGCCGGTCACCGCCGCCAGCACCAGCAGCAGCAGCGGCAGCCGCAGCGGTGGCGGCGCGAGGCCGGGGCCCCGAGCCCTGGTGGGGCGGAGGAACGCGGACCGGACGCGGGCGGATGAGGCGCGGGGACTCGTCGGGGCTCGGGCTCCGGCGTCTGGGATGGTCTGCAGGCGTCTGCCGCCCGGCCGCTCCCTCCGGCTCTTATACTCTACCCGACCTGCCCGGCTGGTTCCACCACCGACCGTCCCCACTGGTATTTGGGTGACACATCCCGCCCCCCTCCCCGTCCCACGGAAGGCCAAGCCGGCCCTGCGCCGCCCGCGATAGGATCAGAACAGGGAAGCTGCTCCCGCCTCCTCCGGACCGAAAGCCGGGAAGGGGAGAACCGATACTCACCTGTAGGCTTCTGGGGACCCGCCCTCGGCGCGGCCTCCTGCTACAGACCTGGCGCGTCTGGGCCGCTCTCCCGGCAGAAAGTCTAAAGAGTTTCATTGCAAAGTGTGGCTCGCGACTGTCGCGCTCTCCTCTATACGCGACTCCCTTTTCGTTCTTTCCCAGCCCCAGCCCTCCCTTAATTTCTCTCACTCCCTCTCTTCTTTGTCCAGTTCTCACAGTAGCACACGTTTATATAGTTTACAGTTCACAAACATTATCTCATCCTAACACCAGTCCTGACAGGTAGGGACTATCAGACCCGTTTTATAGGTGGTACTGATGAGGCTTAAAGACCTGAAGTCACACTGCTATCAACTTCCTCATATTTCTGAGAGGGGTCTTTGGCACCCTGCCTAGGAGTGATGAGACCTTAAATAAAGTGTTTGTGGACACGAAGTGACACAGAATCTGAAGGGAAGTTAGGGAAGCAGTTCTGTTACTCACCATATCAAGGGTAAAACACAGGTATCCTGGTGTCCAGAGGGTTAAAAGTTCTGTTAAACACTAATTTTCTGTACCTCACACAAGCGCACACACACAGGCACACACGCACATAATATTTATTTGTGCACTGGCTATAAAGAGACAAACAGGAACAAATTCTTAAAGAGCCAGCAAGACTGTAAAGAGTTTTTTGTACAATTTGATTCTAACACAGCAAATCGTTGCTTTTCTTTTCCTGTATCCCACGTAAGTAGCTGAACCATGTAAATAATGAAAGAATGGAGCCTGTGAGAAATTGCTTGTCTGCCACTGTGTGGCTAGTTTCATGGCATACAGGGGTTGCAATCTCTTTTTGAGTCATTGAGAAAGTCTAGAGTTTCAAAGCTGTGGTAAAATTAACAATAATTAGCAAGCTATAATTATTCCCAGGTCCTCCATCAAAGCACATTTTATATGTTCAGCATTTAATGTGCACCACCAGTCGTGCAAGGGTGTTGTTTAGCAGATGAAAGCCAGCTGGGCCTCTGTCCCATTAATTTTCACGCAATTCCTGAGGCAGGAAGATTGAAATATATTCTGCCTTGACAGACAGAGGAAGCAGAGACATGTGAGGGACAATTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCCCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCGCCGCCCAGGTTCAAGCAAGTCTCCCGCGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCAAGCCTGGCTAATTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCGGCGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAACTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCATGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAAGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGGTGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCGTGAGGGACAATTTCTTATCCACAAACATGAGGAATTGTGGGATAGTCCTCTGC
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Task1_train_956
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A mutation found in MYSM1 (Myb like, SWIRM and MPN domains 1) on Chromosome 1 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Bone marrow failure syndrome 4
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Task1_train_957
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The gene NFIA (nuclear factor I A) on Chromosome 1 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; not provided
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AGATTTCCAAGGATGTTCAGGAGGGAGGGTGGGAGAGAGAATGGTTCTTGAGCATTCGGGAATTATTTTGGCAATAAAGTAACTAAAGTACAAGCATAAAATAACTTTAGACAGATGCAGAATTATTTCAGAGGTTCTCTTTTGCTCTTTCTCCAGTACAGTATTTCCTGCCCCTTGCTTTGAAAAGAAGTCTGAATGAGAGTGGCCTTAACACATCACTCACCCTCACTTGTTAACACATCACTTACCCTCACTTTCCTACAGGAATGTCCCCTCTTTAGAGACTCTCTGGTTATGTCACCTCCACCGAAGGGCAGATTCCCCTGTGTGCCAGTGTCTTTCAACATGATACCTACCTCTTTCCTTTTGGAATTTTGAGAAGGGTTGTCAAATGCAGCATTTTGCAAACCATCATGAGGAAGAGAAGTAAAATAAGGGATGGGGGCTTAGAAGAGGCAGGTAGGCTTTCCCCCCTCCGAGAGAGGAGAGCCTAGAGAGAAAATATGAGGTTAAAAAAAAAAAACTGGAAAAGCAGGCTTACTGGCAACTTGCCAAACCCTAAAAACCACCCCCCTCTTTTCTGCCAAAACAATACTTTAGCAAACCTAAAATAATTGCAGGAAGCTCTTTTCCATTTTAAGAACTATTACCTGGGGGAGGGAAAAAAGGGATTCTTAAAAGGCACCCTTCCAGAGGTGTCCCAGAAACTGGGACGGTAATGATAGCCTATGTCCAGTTCTGGGCACGCGTTTGTGGATCAGAATATCTCCCTTCCCTAAGGGGACATCCCTTTCACATATTTTTTTCCTCCTAAAAAGTAAAAGATGTCACAGCTAAACCACTGTTGTTTCTGAACGTGATAGAACTTTTTCTATGGCGTCTGTGTTCAAACCCACTAGTTTCACAGTCCTGGGAGGGATAACGCTCATTAATCTCCGCCTTCTTTTCTCCAGACCCCCGCCCCCCAAATCCGGTGAATCTTCTGTGGGCACTGATTCCTCACCACCCCCGCTTCTGAATGCCACAGGACCGAAGCTGCACAAAGTTTGCAGGATTGTGTGCATAATTACCTCTGCCGACGAATCTATTCCCACAGAAAGCTTCGCTGGAGAGATTACAATGCTTTGAGCCTTACCGCATTTCAGTGGGGGAAAAAAAGTTACCTAGGAGGTCTGATTTTTCAAAGAAATTTGCATACATGCAAATGTGCCGCCCGGCCTCCTCCTCGGTTCTCTACGTGCCCACGCGGTGGCCCGGGGGGTGCGGGGCAACCTGGCAAAGTTGCCCAAGTCCTCCACCGAGGTCCGCGGAGGTCTGCAGCGGGGGTGGGGGGATGGGGACGAGGAAAAGTAGTTTTGTTTGCTTAAGCACATCCTGTGGCAGCCTATAGCTGCCCGGGAGTACAGACTGTAACTGCTCCTCACTGCGTTACCCAGTAATGCGCTGATCGGGGGAGGGGGCGGGGGGGCCGGGGAGCGAGCGGGAGAGCGAGCAAGCGAGCGAGCAAGGAGCGAGCCACGGAGAGAGCCGGGGAGCGAGCGAGCCAGCCTGCGAGCGCGAGCGGCCGCGGAGGCTCGGGACCCGGCTGGCCGCGCGGCGCCGCAGCCGCCCCCTCCCCCACACCCCCTCCCCCCCGCGGCGGCGGCGCGAGCGGGCGGCGGCTGTGCGGTGCGGTGCAGAGCGGAGGCGGAGGCGGGCGCGCGGGCAGCTCGCGGGCACCCGGCCGGGCCGGCGCGGGAGCGGGAAAGGGTGCGCTATGCCTTTAACACCCGCGTACAGTAGGCATGTATAGTGGAGTGTAGGGAAACTCTAGGCGGGGTTAAAGTTCAGCTCATGGAGCGGCAATAGCGCTGGCTGGCTGGCTGCAGTTGAGCCGACTTGGAAATGTGAACGCAAGAAGCAGGCTTGATTTTTTTTTCTCCCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCTCCCTCTTTCTCCTCTCTCACCCACACTCACGCACACCTCCAAACCGCACACCCAGACGCACACGCATACCCCAGCGCCCGGCAGTTATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGTAAGCCGCGGCGTGGATGCGGAGGGCTTGGGGGCCGGGGCGCCGGGGGCAGGGCTGGGGCTGGGTGGGGGGCACCGGGGCCGTCGCTCCGGCCGGGCCCAGGGCGTGCGTCTCGGTGTGTGTCTGTGTCTGCGCGTGTTTCTGTGTGTGTGCGCGCGTGTGCCCGCGGGTGGGGGGGGGGATCCCGCTTAAAGAAAGTAACTTTGTTTCCATGCGGGTGCATTCCTCTTGCACGGCCATTTGTGTGGGCACATGGCTAATGGCGCCCTCTTATTAATGCGTTAATTAATATCGGGGCGACGGACTGCGGAACAGCAGTGTTTTCGGACACCCCGCACGTGTTTCGGCGGGGTTGCAGTCCATGACACGCAGAAATCTGGCTCAGCGTTTCTGCTGCCGGGAGCAGGGATTCCGTAGTGCCGCAGCGCCCGGGGAGGGGGCCGCCGACGGAGCCCACCGCTCACCCCGCACGCTCGGGCCGGCTGCAGTCCTCGGGTGCGGGGAGACCTCGGGTGCCTGCGCCCAACGGCCCGCTCCCCGCAGCCTGCGCTGCCGCAGCCCCCCGCCGTCTTCCCGAACTCTTACTTTTGTTTATTGTTTGTCAGCCTTCGGGGTCCGGCCGCGGAAAGGACGCGGGCTCCCGTCCCGGCCCCGGCCCGGACAGCGCCCCTCGGACGCGGGCAGGCTGCGGCTAGCCCTCGGCTGAGCGGGGCTACGTGGACGCGCGTTCCCCCGCGCCGGCCGGGTGGAGCCTGCGTCCTCGCCGCGCGCCGGTGGCCCGTTGGCTCTCCCGGAGTGAAAGTTTCGGGGCCGAGACGAGCCCACGTTGTGCAGGGCGCCGAACGCCGGAGGCCGCGGGCCGCGGGCCGGGTAGCGCCGGGCAGAGTTGGGCTCCTAGCCGGGAGCCGGAGCGGCGGCCCGGGCCGGACACGGCTCCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCACCACCACCACCGCCACCGCGCGACTCCGGCCGCTCCGCGCGCAGGACGGGGGCAACTTTTCCCCTCCGACTCAACTCAGAGCATGGGGCTCTTGCGCCCCACCGCCTCTCCTTTCCGTGCCCCCCTGTCCATTCCTCCCTTGTCTACCCACCCCCAGGCAAAATATTGCTACTTCGAGACTTCAAATCCGGTCCCCTTTGAATATGTTATTTGTTTTCCTTGACTAAAAGGCTTGAAGTCAAAGTGGTTTTGCGCTATTTTTTTTTTAAGCGTGAGATTTCATACTGCTTTGGTACATTAGGATCTGACCATTAATCACCTACATGAAGTTATATGCTTCACATAAAATGTTTATTCACCTCTCCCTTAAAAAACCTACCACTTCTTGCCTTCATTTAGTAGGAGATAACGGTTTAACCGGAATAGTTTCTGGAAGGCTAAAAAGTATCAGTAGTTTTCGCTCTCCTCTCTAGATTCTGGATTTATTTCCCACATGACATCCCTTCTTATTGCAATATCTAACAGTAATAATACCGGGTATTTGATCTCAGAAGACTCTTAAACGCATCTTTTATGTTGAAATGGTCTGTTTGGGATTTAGGCCTAGCATTAATAATGGATAGCAGTTACTTTTAGTTACTGTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTCCTAACAAACTTCCAAAGTTCCTATTTTAGTAACTTGTGGAAGTATGGAATGAAACTTTTCCAACCACTTCTGGCAAGGTTCACAATTGCATATGGATAAGATGCAAAGTGTAAGATAATTTGAATGAATTACGGACTATAGTGAAAATGCTGAGATTCGAAGGCTGAAGTTCTAGCTGGCAGAAGTTTGCAACACACAGAACTTGTAGATAATATCAGCGAGCTGCAATAAAGGGAAAGGACCCTAACAGATACATTAGTGTCTTCTCAATTGAGCTCTGAAAAGATAAATTTATATTTGGGAATGGTGCATATATGAGGGCACCTGTATATCCATGCAGGCCTAGGGCACAGTCAGGTATTTAACAAAGTTGGCCTCTGTTGGTTCATGAGGTATTATGACA
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Task1_train_958
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A variant affecting Chromosome 1, within the gene ANGPTL3, DOCK7 (angiopoietin like 3| dedicator of cytokinesis 7), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Familial hypobetalipoproteinemia 2
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Task1_train_959
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The variant affects gene ALG6 (ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase), which is on Chromosome 1. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; ALG6-congenital disorder of glycosylation 1C
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TGATTACTTTTAGGATTATAAGCCAGAAAAAACATTTTCTTTTTCTTAGTTTTGTAATTTTTTTCAGTTTGGTATGTTTTAAAAGAAGCCATTGTGTTAAAACTTTTTAAATGTAAGATTTTTGTTATTTTGTTTTTGTTAATCATGCTTTGAATTCTTATTGTATACTTCTGAGAGTTTTAAGAACATTTCCCATTATAATTGTTTTAAAAGTATTTTCCTTTCAATCATGTTTGCCTGAATTATATCTCAATATAAATCTATAATTGAGGTAACTGATAGCATGAATACTGGTGCATGTATAGCAGCAAAAGGATTTATATTTAATTTTTCAGGTATTGAGTGCCTTCTCATATGCCAGGTCCTCCTCTAGGTACTGGCATGTAAAGGAATGACAGATGACATCCCTGCTCTCTTACTTGGGGCCTTCCATGCTAGTGGCAGGAGAGGGACAATAAACAAGATAAATCCATTAACAAGAAAGCATCTGGGAGTAATGAGTGCTATGAAGAAAGTAGTGTTGGCCGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGGCGTCGTGGTTCATGCCTGTAATCCTAGCTACTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCGGCGAGTGGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGTAGTGTTATGTGAAAAGAGAGCTGATGGAATGAGGTTAGGGGACACTTAGATTGAGTAAAGGAAACCTTTCTAGAGAAGGTTTCTATAGTTTAGGGTTTTTCTGAGTAGCTTTATTATTAAATATTAAATTTAATAATTTAATATTTAATAAATTATTAAATTATTAAATAATAATATTTATAAATATTAAATATTAAAATAGTATTTGAGCCAAGAAGTGAATGACCAACCAGAAGGAGCCAATCACAAGAAGATCTGGGCCCTGACTTGATAGAATCATATTTTTCCTTAAGGCAGGAACACATTTGGCAAAAGGAGATGAATGAAGTGGCTGCTGTAAAATGAGTGAGGGAGATACAAGAGATGAGTTGGAAGGGAAGGCAGGAACCAGATCTTGTAGGCATTGGGATTTTTTTCTAAGTATAATAGGAAGCTATTGGAGGATTTTAAACAGGAAAATTACATGATCTGATATGGTAGCTGTTTGGAGAATGGACTATCAGGAGGCAGGAGTGTTACCAATTAGGAGATTATTGCACTACTACAAAGATGGAGGGTGGCTTAGACCACTCCTCTGCCACCCTTAGCAGAGGGGAATGGAGAGAAGTGGATGGATATTGTATTTAGGAGGTGCTGTAGATAGCATTTGCTGATGGGTTAGATGTGTAGCATGGATAAGATTCAAGGTTTTTGCTTGAGCAACTGGATAGTTATCCATATCTAATTTGCAGAATATAAACTTCTCAAAATAGATAATTTTTTTTAAACTCTAAATAGCACATTATTAATTTATAAAACATTAATATATTTTATTGAAGTGCATGTTTTAAAACACCAAAATAGATTTGTTTTGCCGGTTTTAGATTCTGACCTTCTTGTCTTTCATGGTTTTAAATTTAAGTTGTCTGAGATTCCAGGGGAGGATGAATGTATGATTGTTGTGTCTGAGGTATTTACTAGTTCTGTTTATTAATAACTGAGTTATGATGAACTTAGATGGTTAAATAAAGCTTTATAATCATTGTTTTTTGAAAAAATATGTCAATTTTTTAATTTGATTAAAATATGCATACTAGTGTTGTTTGTATTTTACTTCTAAATAGAGCTTTAATAAACTTTCAACTTTCATTTGAAATGATTTTTATTTAGATTCTATAATTAACTTGATATGCTATTTCACAAGTTGTTATATCTCATTTCCCCCCCTTTTTTCTTAAAGGTTAGCTGTGCGCTATCATTCTTTTTATTTTCTTTCCAAGTACATGAAAAATCCATTCTCTTGGTGTCACTGTAAGTAGAAACATTTGAAATATGTGTTTATTTGTTTATAATATAACTTTATAATTTACATACAAATATACATTTGAATGCAAAACAAAACTACACAAATGTTATATCTTTGCATAAAATGATTTCATAGTCAGGTTTTTTTCCAGAATTTTTGATTTTCTTTATAAAGTGTATTTTAAACTGAAAAATTTTGGTAGAATGTTATTGACATAATAGTAATTTCTTCCTGTTCCTTCACTTATATTTTCTACATGCTAATAAAAAATATATCCTTCAAAGAGGTTTTCATCAGATTGGAGCCTGTTTGTCATCTTTGCTTTTTCATTTCATTCATTTCCACATCTATTCGGTAGCCTTCTTCTTTCCATTTACTTCCATGGGGTCTTTTGTATGTTGCCTTCTTTCTCTTTTTTTGCCACAAGCTTAGTTTAGGCCCTATTGGCAATCTGTAACCAGACTACTTTGTTTTAGAAGCATTAAATTTTTTTCCTGATGTTCATAGAAAGCAGTGGATGACAGCTGGGAGTATGATATCCTAATATTAAAATAGTATTCACATAGAACCCTTTGGAATACTGAAATCCTCCTCTAGGTCAATCCCAACCCACTACTGCTCTACCCCTCACCCTATGTTCACTAGGATCCTGTGGAAGATACATGTACAGAATGACCAATGACAAATGGCAGGCAGTATTGCTTTTATTAGGTGGAGCTTTGGACTAAAACCTTCGTGCAGAGCTGGGCTGGCCTGTGTGGAAGGCTTCTTGGCTCTAAATAAAACAGTCTCATATCATTGTAGACTGGGAAGACTGCTTAATGCCATCCTCTGAGGCCCAAACCTGAGTTAGAGCTTACCACTATTGTATGAGGCTAGGCTGACCCTACACAAATCACTGGTACCAGGGGATGAAACTGTGGAGAGGCATTACTTTCAAACATGTATTAATATATTTCCCCAGAATTTATACTCATAGAAAGGCAGCTCATTCAGGACCTATAATCTGACCAGATTAGTTCTCAGACACTGAACTTCTAGGGGTTCATTTTTTACAAATGCACCTAGATTATTTGTAACAGTGCATGGCTTTAATCTATTTTTGGTAAATGGTTTTACAGTTTGCATTAAAAGTTCCTTTTGGGCTGGACCTGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGACACCATCCTGACTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGACTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTAAATAAAAGTTCCTTTTGACCTGGTCCCAGCTAATCATATCATTAAACAAATATTTCATTCAGTAAATATTTATTGAGTGCCTTCTATTTATCAGGCACTGTTTTGTGCACATGGGATATATTCCAGACAAAAATCCCTGCCTTCTTAGCTATCATTCTTAAAGATAGACACTTATTAAAAAAAAAAAAGAAGTGAGTGTGTTAGAAGGTAATAAATACCATGATGGAGAAATAAAACAGAGCAAGAGTAATTAGGAGTACTGGAGGATGGGATGCAGGTAGCGGTTGCAATTTTATTTTATTTTATTATTATTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAAGCTGGAGTGCAATAGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCTAGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGATACTGGAGAGTTTGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTATACTGTTGGTGGGAGTGTATATTAGTTCAACCATTGTGGAAGATAGTGTGGTGATGCCTCAAGGA
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Task1_train_960
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A variant found in Chromosome 1 affects ALG6 (ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; ALG6-related disorder
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Task1_train_961
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This genomic variant is located on Chromosome 1, within the ALG6 (ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; ALG6-congenital disorder of glycosylation 1C
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GAGGAACCAGCAAAGATGTCTAAGAATTAACTGGGTGAGATAGGAGAACCAGAAGAGTATGATGTCATGGAAGCCAAGTGAACGAAGTGTTTCAGTGAGAGGAGAGTGATTTCAAATGCTAATGAGAGAATCAAGTAAGGCAGTAAGAACTGACCATGGGATTTACTACACTGGAGGTCATTATGGATGTTTGACTATAGCAGTTTCATCGTGATTAGGGTGAAAGCCCAATTGGTATGGGTTCACTAGTGAATGGGATGAAGACTGGACACAGCATGTTTATAGGCAACTGTTTTGGGAAACAAGTGTAAATAGGAGCAGACAAATGGGGTAATAGTTGGAGCAAGAGAGGGTTTTTGTTCTGTTTAACACTGACTCAAGATCGTGGTATTATGACATTTCAACCAGTCCCATATTTCTTAAGTTTGAAACTTTTATTTTAAAGATTTCATTCCAGATGTTTGCACTTCCCACTAAGGTTGCCTCAGGAATTTTTCCTTTAACGACACTGGCAGCCTTTGTTTGTATCTGCTTGTAAGCTTTCTTGGCGCCTATCCTCGCTTTTCCATTTGGAATGATCACTGCATTACTCTCTATTTAGATCTTACCAATACTGTCATAATGTAGCCAGCAGTTAAGGCATCCTTTAGGGTTCTGTGTCCCACCCACTTCATGGAAGTCACTACTGTTTCTCACTGCTTTCTACATTTATTTATACTGCTTTTGTATACCTGTGTACTGTGCTAGGGATAAAATGAGTAAGATCTTGCTGGTCTTTGTCTTAAAGGAGCTCACAGTCTAGAGTCACAGTCTGTCCAGTACGGTAGCCACTAGACATATATATAAATTTAAACTTATTAAATTTAAATAAAAATTCTGTTCCTCAGTCACAGTAAGTACATTTCAAATGCCCAATAGCCACATGTGGTTAGCAGCTACTATACTGGAGTGCAGACAAAACATTTTCATTACTGCAGGAAGTTCTATTGTATAGCACATTGGCCTAGAGAAGACCACACTAACTGATGACCACACAACTACAATAAATGTGCTAATTATTTTTACTACTCAGCTTGGTATTTAAGCCAGTGTGACTTTGTGATTTTATTTAACATTCCCCTCAGTAGATGGAAAACTCTTTGAGGCCAGAGGACCTCATTTTCTTTCATGTGCCTTCGTGTGCTTTACTCATTGAAAGCATTTAGCGAATATGAAATGTAATTTTCCATTTGCCATGGAAAACTTTTTCACAGATGGGTTCTCAAGGTTAGCTTAGAATTTTAAAAATTGATACAGAATAGATGTATATATTTTGGGGGTATATGTGATAATTTGATTCATTTATTCATTCATGTAATGCATGAAGATCAAATCGGGGTAACTGGGCTATTTATTACCTTAAAAATATGTCTTTATGCTAGGAACATTCAACTTATTATTTTCTAGCTATTTTAAAATGTACATTAATGTTAACTATATTCAGCCTACTGACCTGCCAAACACTAGGTTTTATTTCTTCTAGCTACCTATACATTTGTACCCATTAGCTTAGAATTTTATATCCTGTTGGACCCCAGGGGATGTTATAAATTTAACCCTGACTAGCATTAATATTTGTCCCAGATACCTTTGTTCAGTGCCTTGGTGGTAGGAAGTATAAGAAGACAGGGGTCCTCAGGTTTTGGCTACACATGGGAATCACTTGGAGAGCTTTAAAAAGTACTGAGGCCTGATTTAATTGGTCTGGGGTGTGATGTGGGCATTGAGATTTTAAAAACTCCTCATATGATTCTAATAGGAAGTCAAAGTTGAGATACACCAGAATAAATTAGACCCTCAACCCTCACCTTTAATTCTGCTCATTTAATAGCTACAAGTCAATGTTTCCAGCACATTTAAATTTCACCTTTTATACTACTCAGTAATCCTTTTTTTCCTTGCAGTTTCTTATCTCAGTCATCACTATGGTGCTTCTGACGTTGATGACTGTCACACTGGATCCTCCTCAGAAACTACCGGACTTGTTTTCTGTATTGGTGTGTTTTGTATCTTGCTTGAACTTCCTGTTCTTCTTGGTATACTTTAACATTATTATTATGTGGGATTCCAAAAGTGGAAGAAATCAGAAGAAAATCAGCTAGCTGTATTCCTAAACAAATTGTTTCCTAAACAAATGTGAAAATGTGAACAGTGCTGAAAGGTTTTGTGAACTTTTTGCTATGTATAAATGAAATTACCATTTTGAGAACCATGGAACCACAGGAAAGGAAATGGTGAAAAGTCATTGTTGTCTACACAAAATAAATGTATATGGAGACCAAAGACCAATGGAGGCTTGTCTAAGTACTGCTTGGCCAAAACATGTGGTTTTATTATTCACAGCTATTCAAGTGGGGAAAAAAGAGAAACATGTCCTTAATCCCATTGTTTACTCAGGAAATGCACTTTTTAAATGTCTTTAAAAAACTGAGAAATATTTCTTGATATTTGCTTTGTCTAAACCTACTTCCTTCATCAGACCATATAGTGAGCTTCATGGGAGAATTGAGCCCCTTCTTTTTAATGGAAATCACTAATTTTGGTATTCAAACTTACATTTTAGAATGCAAGTAGTGTGTATTTCACTGTTTAGAAGTCATATCTTAGGGAATTAAATTTGTGATAATCTTTTTAATTACTGAGAAGGCAATTTAAACTGCTTGAAGTTTGAATATGCCTTATTACACATGCAAATTTGATTGTTTTAACAAGGCAAATAAACCATAATCTTATTTATTTCCAAGAATGCATATTTTAATACAATTAAAAATGAATTTTCCTGAATTTAAATGTAAGCTTTAACTTAACTTTAAGTGGTTTGAGTGAAGTCTTCTAAATTACACATAATCACTGGTTCTAAACTTCCAGAACCATTCTGTTTAATTAAACATTATATTATATATATATTATTATTGACATGGTTCAGGGTTACCACTGCCAGAGCATTGATTCATGTTAACTTCATCCTATTAATACTGTATCACCCTGTATTAGCAGAAGCCAATATTTATTATAGTATTCAACTGGTAAAAATAATACATGATATCCATGTTGCAGTTTCTCATATAAAGATATGTTTTCTTTAGCCTCTGTAATAAAGATAATCATTTTCCCATCAACATTTTTTAAGGAATATATTTCTTCTTTCATAAGATAGCCATTAAACTATATTAAGTGGTGGTATATTTTAATATAGTGCAAATCAAACCACATACAAAAAAAAACTGGTTCTAGACACGGACAGTCACAGGCTGATATAAGAAGGTATGTGTTTCTAAGTCTGGTAAAGGAAGTGGGTTTAGACAAAGCAAAAATCTAGAAAGGTTTCTTTCTCAAAGCAAATGTGCATAAAGACTCAAAGGGCAGGTCAACGCAGAATAGCAGCCTTGAATCACTGCCGAATCAGCAAGAACATTGCTGTCCATGGTCACCATCTGTAATCACTGTGCCCAAATGTCAGCATCTTGGCTGGCTGGTGTAGCTTTATTTTTAAAAATATTTTTTGTAATAGTACACTTGTGTTTAACATAGAATGTTGACTTAGATAAATGATGAGGAAGTTATAAATAATTGGAGTAGCATAACTTTATTATTTGGAAATAAAAGTATTATGTACATATATTAGTAAAATGAAATGCACCTGATTCAAGGTATCATCTAGGTAAATTCTGTAAGGTACCATATAGGTAAATTCTTAAATCATTTTTCAGATGATTTAATCTAATCATACTGAGTTGCACTATAGTTTTTATAGAGACTTGTAGCAGTTATCTTATAAGTATCCCTCGTATCTATTAAAAACCGGTTTAAGAGTTTATATTGAACTTAGAGGGATTAGGTTCCAAAATACCAAAACAAAATACCAGAAACAGAGGCCAGGCACAGCGGTCTGTATTTGAGAGGCTGACACAGGATGATCGCTTGAGACCAGTGAGACACCATCTCAAAAAAAAGCAAAATATCAAAAATATCCAGTGATGAATTATCACAGAAGTAGGCAAGGTCCAAAGCATTTCTCTTAGCTAAACTCAGGGCTATAGGGATGTTTTCATATAAA
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Task1_train_962
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Gene LOC129930668, PGM1 (ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 1127| phosphoglucomutase 1), found on Chromosome 1, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
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Pathogenic; PGM1-congenital disorder of glycosylation
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Task1_train_963
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Given this variant in gene PGM1 (phosphoglucomutase 1) on Chromosome 1, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; PGM1-congenital disorder of glycosylation
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CCTGTATCAGATCGAGAGCAATATTCCTGAGGGTGATTCCCAAGAAAGAGCCTGATCTGGAAGGGGAGTTCTTCCACCAGATGTACCTCTTCTTGGGCTCAAGAGAGAAGCTACCTTGCTTCTATCTCTCAACTTTCCTTCTTACTCTTACCCCTGGCATAATCCCCTCAGCCTGGAACCATTGCAAATCTCACCATAAGGAATGGTAGAATTAAGGGGTGACATGGGTGGTGTAGCTTAATATCACCAGCCTCTCCTTCCACACCAAATACAATCTATATAAAAATTGGTATGCTTGGTGTGTAAATACAACTCGACAAGCCACCCCTAAACCCCTCCTATGGACATTCTGGAACTGCCCGAACATAGGCTTTTATTCTCATCACAACCACACCTGGAAACTGCTGGAAGGTGAAATGTCACTGTGTTGAGTCAGGACGTTTCAATACTTTCCCCCACCATGGCCGCTAATGTGCTGTGTGGCCTTGTCGTGTCATCTACGCCAGTGTCTGCCATAGTACCTTTCCATTAATGCTTGTTATTATTGCTGCTGGATGGAGGCAAGAATGAATGAATGGGCAGGATCATGATAACTCTGGACCTCAGCTTCTTCATGTTTGCAGTGGTACTTGGGAAGAGCAAATGTGGGAATGGATCAAAAGTACCATGGGATGTAGAAAGCACTCTGTAGCTCAGTAACAATCATCGGTTTTGATTTCACACTATCTGCAGGTTCCTGTAGTCTAAAAAGCAGCCTACTGACAGCATCCACCCTGGTGGTTACCATTTCCTGGGGAAGGCAGGATATAACCAATATATTAGGGGAGCTACAACAAAAATTGTTCGGAGATTGACATATGAGAGCCAAGAGGTAACTGAAGGGAACCAGGTGCTCCTTGGGAGGTGGTTGGTAGTGGAGTGGTTGACGGTTTTCAATGGGCTATGGAAGGGTGGCAGAGCCAACAGTCCCAGAGAAACTCTCCCCAGGGAATCCAGGTATCTCACGGACATTTTCAACACTAGAAACACATCTTCCACCATCAAGTTGTTTCTTCAATCATGTTTATCTTGGGTGAAGCAAAAAGAAATAACAAATGGAAAATGTAAAAAAATCCCTGTTTTTTAAGAGGAACTGACAGCACCTCAACCTTCTTTTCCAACTTGAGTCATGTTGAAACAGATATAAATTACTGTCATTTTAGCAAAAAAGATTTAGGAGCAGTACTGATACCATCTGTAAGAGATATGGGAAGGTAAGTTAAGAATGCAACAGAAGTCCCATCTGTCGCCCTTTCATGTAGGTCATTCTGACTGGTTTACTCAGGAATAACTCCAGCATTCTTGTCTTAGGCCCAGGAGGTAACCCAGGTACACTGTAACAGAAGTAGGTGTGTCTTGCTTTGAGGAAACCCACTATATGAAAAAGCCAAGCTTGACTGGAAAGATAAATTGATGAGTCATTTTTCAATAATCTTGATATAAAATTTGCCCTTTTTACTTTAAAAAAGCCTTCTCTTTGGGTAGAATCCCTTTAATTAGCTAAACCTTTTCTTTTCTCCCGTTGTGGATTGAAAGTATGATTGAATTGGATAAAAATGTGGGTTTTCTCATATTCTTTCAATGCATCCAAATTGTGGCCCCGATCTGGAAAGGCTCTTTTTAATATGCTGTGTTTTCATGCTGGAGCCTTACAGTGCACACAGACCACACACTTCTAAAACTACAAAGTCCCGAAAACCATCTGAAGGAATTTGTTCAACATTGCTGATTCTATTTCAGTAATATGGTGGAGACATCCAAGCTGCAGATTTTTATTAAATAAAATCTTTTCTTGTCCAACAGATTATTACTATTATTTTTTTGTCCATCTGCCTGTTGTCTTGGTGTTGTTTCTGAGCGGTGACTCTGGATGTATTGATGTTAAAGAGTGTGTTCTGGATTTCTTCTCCTAGATCGGTCGCTTGGTTATCGGACAGAATGGAATCCTCTCCACCCCTGCTGTATCCTGCATCATTAGAAAAATCAAAGCCATTGGTGGGATCATTCTGACAGCCAGTCACAACCCAGGGGGCCCCAATGGAGATTTTGGAATCAAATTCAATATTTCTAATGGAGGTGAGTTTGCTGTCATTTTGAGGACAGGTAAGTTTACATTCAGTAGGACAAATCAATACCTGGAGCCTTGGGAGACCAGGGTTTTGGTTCTGATCCTTTGCAGGGGGTAGGGAGGTGCTCTTTGCTTCCTTTCAGTGACAGTGAAATGCTTCTCATTTGACTGTACCTGAATATGAAGAGCCATGCGCAAATCTTCCTTAACATGATATTTTCTTTTAGAAAAATCCTGCTACTTTGCTGACTGAATGATGAAATGGTAGATGTGCTAGTGAAGAGGAACTGATGAGCTTTGGATTCTTTGTATTTCCATGTGAGCTGCACGAAGTAACCCACTGTTTGCTGTTTGGTTTCCAGGTCCTGCTCCAGAAGCAATAACTGATAAAATTTTCCAAATCAGCAAGACAATTGAAGAATATGCAGTTTGCCCTGACCTGAAAGTAGACCTTGGTGTTCTGGGAAAGCAGCAGTTTGACTTGGAAAATAAGTTCAAACCCTTCACAGGCATGTTTACTTTCCTCCTCTTTCTGCCCACTCCTATTTCCAAGTTGAGCGATTTTCCTTTCAACGTTTTAGTAGAGGGTCTTCAGCTTTGGAAAGATTTCCGTGAGTGCTCTGTAAGCTTTGCAAGTGTTAGTTAATTAACAAGTCTGGAATTAGGTTTGGGAGACCAGAGACCTGGGCTCCCTGGGCCCTGCCAGGGATCAGCTGCATGACATCGAGTAAGTCATTTCCAGCACTCTAGGCCTCAGTTTTCATGCCTTGACTAGAAGACCTGCAGGATTACATTCATAGTTAACTTTTATTGACCTCTTGCTACATGCCAAGGTCTTTACACGTGTTAATCCATTTTATTCTCACAGTAGATCTGTCAGGGCAGCACTGTCAGCATTCACTATTATAGATGAGGAAACAAAGGCTGAGAGAGATTAAGTAACAGGCTCAAGGTCACAGTCAGTGAATGGCAAAACGAAGATTTCAACTCAGGTTTGAATGATTCGCAAGACTACACTTTCCATTTTAGTTTTCCTCATTCAGTAAAATCAATCAGACTATTTTGGGGGGACCAAATTGCAACTCCCTACATAGGCAGCTGTGGCTAACATTTTGTTGTTGAATTATTGTAATAATTGACAGAATAAATATTTATAAAAGTATTCAGATTAATAAAATGAGGATGAGATGATTGGCAATGAACTTGCATTTTGACTTTGCCCTAACATGTTTTCTTTCTTCTGGATTGCAACTTTATGGAATGCATTTTATTAGTCATTTAGTTCCTGGCTAAAGGATGGATTGCATTTTTTTGTTTGAACCTACTCAGGGAGAGCTGACAATTGCATCCTAACAAAGATAAAGTGACACTTTGGTCATCTCGAAGACATTCTTGAGGTTCAGAAGATTCCAGTAGGGAGTTTCTTAAATTCTTCATATTTTGAAAATGTTCAGAACCCCTGAATATCCAGCAGTTTTGAAAATGTTCAGAAGCCTTGAACATCCAACAAGAACAACAATACTAAGTTCTTATATTTATATAAGTTTTATTTTTGTTTTATTCCTTAAGCAGTACCTGTGAAAAGTGATTCATTAAAAAATTTCATTTTCCACTTAGTACCATTAAGTCTTGATGACAATGGACTTGGAAAAAGAAAAGGAAAGAAAAGTGGGGATTACATTTTCTACTCTCTATAACACCAAAACACACCTCTCAAGATGACGAATGGGGAAGCACTGTGGTGGCATAGCAGAATTTATACAACCTCTGTTGAAAATCCCCTGTGTGCCTCATCCAAGCTGTGTGGGCAAGTTTCTTAACCCTTCACACGTCGAGTTTCCTCATCTATCAAATAGGACTAATAACATTTACCTCTCAGGAAAATTGTTAGTATTGGGTAAGGATTGGTAGTATTAGATAGTATCGGATATCACTTAACAGCCGTATTATTGGAGCTGTTCAATAATTGTCCTTTTAAAATAGCAATAG
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Task1_train_964
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A mutation on Chromosome 1 affecting PGM1 (phosphoglucomutase 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; PGM1-congenital disorder of glycosylation
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Task1_train_965
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A variant was discovered in gene PGM1 (phosphoglucomutase 1), Chromosome 1. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
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Pathogenic; PGM1-congenital disorder of glycosylation
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TGGTGGCACATGCCTGTAATCGCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTAGCTTGAATCCGGAAGGCGGAAGTTGTAGTGAGCGGAGATCACACCACTGCCCCCCAGCCTGGGCGACAAAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAACAAAAAATCCCTAAAAAACTAACTCCTGCCAGGCCAACAAAATGAGAGTTGGAATTTCAAGTATTCTCTTTGGGGTTGGAAGAAGGCATAATTTGACTAGGTATAAAGAAAGGTTTCCTGGAAGAAGTGGCATCCAACTCAGTTCTTATGAAAGAAAGATCTAGAGTGATGAAAAATCAAGCAATGGTCATTCTCATGGAGTCGGTGGCTGTGGCAAAGGCATGAAGGCTTAAAAATGGATGTCACATTAGGGAAACGAGAGGCCTGGGCTGGCTGGATAATGGGGCATGTGAGGAGGGCATTGGGTAAGAGGAGCTTCTCCGGAAGAAGACTACTTTTCTCCAGGTCTTTTGGCTGTTCCTCTAATGCTTTCGTTTCTATATCCCTCACAGCCCTGGCTGCCTTGACCTCATTCTGTGGTGTGTCAGTAACCTGCTTAATAGGTGATGCCTCATAGGACACATTTATTCTACAGTGTTATGACCTCTGGGGCATGTACTGTATTGGGATTAGTACCATCCTTGATGAAAATACTCTCTCAGCATTTCAGAGATGCGTGTTCTTGGTAGTTATATAAAATGTCACTGTAAACATATGTAACTGGCTTCTCCTGTTGTTTGTTTTTGGTGGTGGGTTTTTTATTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCGAAGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCAGGCCTGGCAAATCTTTGTGTATGCATGTGTGTGTCTGTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCACCATGTTGGCTGGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGTGATCTGTCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGAAATTACAGGTGTGAGCCACCGTACCTGGCCTGTTTGTGTTTTTTTAATCAGTTTGTCAGCTAGCTTGTCATAATATAAAGATAACAGCTCTGAATCCCAATTCCCACTTTTCCTAGCCATGTAAGTTTGGGCAAATGTCTTTACCTCAGAACACCAACATTCCAATGTATCTGTAAACTGCAGGTGATAATCATAATATAAACATTTATAACATATCTGCCAGGTACTATTCTCAGTACTTCATAGCTATTAACTCATTTAATCCTTACATCAATCCTGTTAAGTAGTTAGCATTACTACCCTCATTTTGCAGATGGAAGAGACTGAGGCACAGAGAGTTTAAATAACTTTCCCAAAATTATTATACAGCCAATGACTGGCAGAGCTGGGATTTGAACCCAGACACTCTGATTCCAGAGTCCAGGCTCTTAAGCTCTAAGCTGTACAACCTTCTGAGCTTTTCTGAAGGACTGAATGGGAAAGCACAGGTATACCGCAGGGCCTTTATAATGGTTGGTTTCCTTTCCTTTCCCCACTCTGCCCTTCATGAACTGGCCCCACCTTTTCCAACATAATCTCTCATTGTTCCTTTTTAGAGAACATTCTTCTCCAGTCAGGCGTATCTCTCCACTAGTCCCTGAACACATTTCACACATTCCTGTTGTTTCTCATGCCATTCTTCTCCCCAGAATGCATCCACCTCACCCCTGAATCCTCACATACTTTAAGGAGTTTTATTTTCTGATTCTGCATACATTTATTCCATGCTGTATATAGTTGTGGGACCGTATGTAAAGAAGATCCTCTGTGAAGAACTCGGTGCCCCTGCGAACTCGGCAGTTAACTGCGTTCCTCTGGAGGACTTTGGAGGCCACCACCCTGACCCCAACCTCACCTATGCAGCTGACCTGGTGGAGACCATGAAGTCAGGAGAGCATGATTTTGGGGCTGCCTTTGATGGAGATGGGGTGGGTATAAGTGCATTTAAGTGAACTCTGGTGCAGGCCAGGCCTGATCCTGCAGATGGGGAAAAAAGTGGGCTGCTTCTGCCAGACCCAGGGAATAACTGTTAAGGATCCCTCATTCTGACCCGAGGTCAGAACTAAATTATTAGAAGCCCCTCTTGAACAGGAATAGGAGTCATTGAAATGAAACCCACACATTTAATTTCAGACATCCATACTTGCTAACAATGGCACGATGATTAGGTTCTGATTATGATAGAATGACTGGTATTTCCTGAGCTGGGTGAGTTCTAGATGCCTGTCTTAAGGTGGGTTTCTGCTCTCAACCAGCAGCTGGCTACTTATTTAATCTCTGGACAAGATTTTGGTCTTATAATACACCCATTCATTCATTCACATGAGCTGAATATTGAAGCTGTAATTTCATTGCCTATATGAAGATGATATTGAGAGAATTAACATTTTAATCATTCTCTACCATTAAAATGTTTAGAAATAAGCTGTTTTATTTACAAGGGTGACTATGTACCAGACAAGGAAGAGATGTGTCTTAGGTTTATATCCCTGGTATCTCACTGATGGTAGGCACTGTATACATTTACTTAGTTGAAAATATATTTTTGTTGTTGCTAGTGTTACCATTAGCTAGAATCCACTGTTTCCTGAAAAATGATTTTTCCCTTATCAAAATGTTGGGAAATTAAAGGGGTTCCAGCAGACATTATTCTGTAGTACATCTTTGTGATGAGTGCATTCTGGGAGTGTTTTTTGGCCACCCTCCCAGTTACTGTGGTACACAGACTGTGGTACACAGTTTACCCAGTAGACCTACCAAACTATGTAAACAGCCAATATTTCTTCTCTCATTGCATTTTCCCCTCCCCTGGGAAAAAGATGATTGGTTCCAGAGTCTGAAAAAAGTCTAGGAGGTTAAAGTTAGCTGGCCTCTGGAGGGAGAACAGAGGACTCAGCTCAAAAGGAGGTTGTGCTTGGACTTTAATTGAAAACAGTTTTAACTTTTTGGCATGGAGGTGCCTTCGGCCCAATGGTACTGTATAAACTCATTGAAAATAAAACCCAGTGTTAAAAATGCAGTATGGAAAGGAGATCAATTTCAAATTTTATAGTTTTACATTTTATAAAACCCCCATGAAAGATAGTTTGATTTCTTATAGTTTGATTAAAAGGTCTTTCTTTGATCCTCTCTTCTCCCCAAGGATCGAAACATGATTCTGGGCAAGCATGGGTTCTTTGTGAACCCTTCAGACTCTGTGGCTGTCATTGCTGCCAACATCTTCAGCATTCCGTATTTCCAGCAGACTGGGGTCCGCGGCTTTGCACGGAGCATGCCCACGAGTGGTGCTCTGGACCGGTAGGTGTCTCCATTCCCTTGGCCTTCCTGTCTTAGGTCGTCCCAGTCTTCACCATACCCTTCACTGTGCCTGGAACACGTGTCCTTCCCTTTCAGCATGGGCATCTGATGCATAGAGTGTGCTGAGCGATTCTTGTGTGAGGGGATGGTTGGCTTTTTCTGGATTCAATGCCCCTCTCCGCACTCCCTTGGCACCCTGGGCCTCCTCCTCCTGGCACTTACCACACTGTGTTCTAGTAGCTGTTTTCTTGATGGGCTGCCCTGCTAGACTGTATACTTCTGCAGAGAAAGGACTGTTTTGTTCACCATCTGGACTCTGCCTGACCATAGCGTGCCTGGCACATAGTAGGACAAACACACACACACACATACACGTATAATTTTTTAAAGTTAATGAATAGTTGAGTGTTAATGAATAACAATGGAAGTACTCAAGACATCATTCTGGAGGATCACTTTTCTTTTGCAGTGTGCACAGAGTGTGGGTGAAAGAGCAGTTTGAAGTAATTTTAGAGTTTCAACGACTGGATCGCTCTTGCCCACACAAACACAGTGAATGTTTATATATCACTTCATTGTACAAAGGCTTTGA
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Task1_train_966
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An alteration has been detected in PGM1 (phosphoglucomutase 1) on Chromosome 1. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; PGM1-congenital disorder of glycosylation
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Task1_train_967
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Here’s a variant in PGM1 (phosphoglucomutase 1) located on Chromosome 1. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Congenital disorder of glycosylation
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CGCAGCACATGAGTGGCACCCCACCTAACACAGCAGTACCTGGCAAGACGCCACAGTTTAGGACCTGGAGCATCTCTAGATGTGGACAGAATTGTTAGTGCTTCCCTTACTGTGTGCCGGGTACCCTAGGCTGCAGGCTGGGTCAGGCTTTCTCCTGGCTTCTCATGAACACTTACGCACCAGGGTTCTCTCACCTCTGCTTCTGTTGCCTGTTGTCACAGAGTAAACTCATCTCTCACAATTCATAATAGAATAAAGAGCAGGATGAAGATTCTGTTACAACCTCCCAGTTTACTTTTTTCCAATTGACCCAGATTTTTGGCCTGGTCCTTGTCAAGGCATCTCATAGGGTTTGGAAGGGCCGGGCCGTGGGATTTACTGGAGGCTTCCCTCTGGGGAGCAGGCAGTGAATGGATGGATGGGCCACAGCAACCCTCAGTGCCTGGAGTCTCCCCTCCTCAACTTCTAGCACAAGTGGTTTCTCATCCTTGTGCCTGTTTGCCATTTGTGAGAACTTGGGGTCCAGTTTGGATGATTGTAAATTATGCCTGAGATAATTAGAAGAGAGACCTGTGGTTGAGGAAGAAAGGGGTGTAGAAAAGGAGTGGAGCTGAGGGATGGCAGAGTGGGACAGAAGTTTGTGTCATTAAGCCTTCAGAGACAGAAGGGAAGTCAAGGAAAAGTAAATCCCAGCTCTGCAGTGCCTCTGGCATCTGCCAGGAGGGAGAAGAGGTGTAAAGGTGTGTATAGGAGACAGTGGCCTAAGCTCGAGAGCTGCCCTCTGTGCTGTAAAGAAAGCAGCTGCCCCACTTTCTGTAATCAGAAAATCCAAGCATTTTGATGTGAGACCAGATAGGAGGGAAAAATATGATCCAACATATATAGATAGAACATCTGCAATCTAGTGAAAAGAATTTTAGAGGCTTCAAGTTGAAGCTGTGAAGAAAGGAGACCAACCCTGGTGTGTTCCTAGAAAGCAAGAAATGGTCAGTGAAAATGGACCGTATCCTTCCCATAGTGACTAACTGTGGCATATCCTCTGTGTATTTCATCTACTGTCTTCACTAATCAGTGCTAATGAATGGCACCATTAAACACCAGATGGGGATTGGTGACGAACAGCAGGTGAAGAGCAGCATCTTTTTGGTCAGTCTTTGGTGTTATGCAAGGTTCTCCTTTTTACAGAGGATGGATAGACTCATAAAGACTGAAGAGTCCTCAGGCAACTTCTGTCCCAGCCTTCTTCCCTCAGGTTGGGAAATATCTACCCCAGAGTTCCCACACATTTTTCCCCAAGTGAGAAGATAATTGATGTCCAGAGATACCGCTGGGGAGGAAAAAGAGAGGGCAGCAGAGAGAAGGATGGGCTTGGCACTTCACACGGACCTCGCTTTGGGTCCATCAGGGATTGGCAGGAGATTGGCCACTGGCTCCTGCTTGTTAGGTTGGGAATAGCCAGTCTCTGCCATTTGGGACCTCTGACTTCCTGTTCTCTTTTGAGGACCTTTGCTAGTGGTTTGTAAGAGTCCTTCCCCTCATCTGCCTGAAACCTCTTCAGCTCTGGTTTCAGCCCCTTTGGTCCATGTTTCCCTCTTGATCTGGGGGCTGAATTTTTGCATCTAGCAGCTTTATGTGCTTCATTATTAAGCTTCAAACTGGAATGGTTAGTCCATAAATCACAGGGAAGTGGGGAGAGGAGGGAAGCCCTCACATCACCCAGCATCACTGAGGTCAGGTCTCCCCTGACCCTGGAAATGCTTCTCCCACCGTAGCTAAGCCCCCATCAGCTGGATGCAGAGAGGGTGACGGAAGGCAGGCTCACAAGGTGCAGCTGCTGCCATTTATCAAGGATTTAACCCTCCAATGAACAAGTATGGATGAAATTACATCCCCAAATAGACCCCTCATAATTTGCCAGCCTTCAGTCTCCCAGCATTTGGGGAAAAAAATCTCTGCTTATCTTTTCCAGGGCTTGCGCCTCATTTTCACAGATGGTTCTCGAATCGTCTTCCGACTGAGCGGCACTGGGAGTGCCGGGGCCACCATTCGGCTGTACATCGATAGCTATGAGAAGGACGTTGCCAAGATTAACCAGGACCCCCAGGTAACGCCCAGCCCTGTGCCCTGGTTAGTTCTTTCTGTTCAAGGGAATGATAGTTTCCCATTGAGCCTGTGTTTCAATGCCCATTTCTCAAATGACTCAACAAGGTACCAGCTGTGCTTACTTTCTTCCATGTTTCTTTCTCCATGTCAACATTATAGATAATAATTATAATAATAAAAATAGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACCTGAGCCCAGGAGGTCAAGCCTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTTCAGCCTGAGCAAGAGTGAGACCTTATATCAAAAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAATTTTCTGAGCATTTATGGTTTGCCAGGCTGTGTTGTAAGCCCATTATGAAAATATACTCATTTAATTCTCAAATAACTTAGACTGTTATTCTCCCTGCTACAGATAAGGAAACTGAGGCACAGAAAAGTTAAGCAACAGTTAATAGGTTTACATGCCTAGTAAGGATAATGAATCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACATCCACCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCAGCTACCTGAGTAGCTCGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCTCTGCTCATTTCCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTAGGGAGGAGGTCTTAGTACATTGCCTAGGCTGGTCTTGAATTCCTAGCCTCAAGTAATCCTCCTACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATATGTGTGAGCCACTGCACCCAACCCAGGATAATTGGTCTTTAAATCAGCCCCTCATCTGGTGTTCTGCTCTGTCTGCAGCATTTTGTTGCTTTGTTTGGTCTGATCACCTGCTTGGGCAGAACACACCACTGGGTCTTAGATTTGGTGGGGGCAGGGAGAGGCAGTTTCATGTGTCTTCACAGAACAGTCTGCAGACCTGCAGCTTGGTAAGCTGGGTTCCTCAGCCATTCCCCCAAAAGTCTTCAGAAGTATATCAGAGTAAGGAGGGACTCTGGGAGCAAAGGGTGGGACAGTGAACTTGAAGGACAACCCCCAAAAATGGAGGAGCCAAGGGGAAGCAGTGAAGGACAGGACAGTTTCTTTAAGTGTTTTTCACAATCCTTATCTCAACCAGAGCTCCATAGCTTAAAAAAAAGTTGGGGAAGTGTTGTGGTATATTAGCCCCTTCTTGGTGATTCACAGCATACAATGCAATGCACCATAAAGGCTCCAAGATTTCGGACATGGTGGCCTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAAGATCACTTGAGCGTAGGAGTTCTGGGCTATAGTGTGCTATGCCTGTCGGGTGTCTGCACTAAGTTTGGCATCAATATGGTACCTCCCGAGAGGGGAACCACCAGGTTGCATAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAAGTTGGAAACAGAGCAGGTCAAAACTCCCATGCCGATGAGTAGTGGGATTGCACCTGTGAATACCCACTGCGCTTCAGCCTGGTGACATAGCAAGACCCCATCTCTAAAAAAAGAAAAGGAAAGAAAAAAAGAGGGTGCTGAGAAGACTTGCAGTAAAGGTGCCTGTTTACATAGCATTTGCTGAAGGACATTTCTCCAAAGAAAACATACAAATGGCCAACAGGCGTATGAAAAGGTGGTCCACATCACTAATCATCAGGGAAATGAAAATCAAAACCACAATGAGCTGTCACCTCACACCTGTTAGGATGGCTGTTCTCAAAAAGACAAAAGATAACAAGTGTTGGGAAGGATGTGGAGAAAAGGGAACCATCAGACACTATTGGTGGGAATATAAATTGGTATAGCTATTTTGGAATAACCAAAATATGGAGGTTCCTCAAAAAGTTAAAAATATTTTAGTACTAATATACGATCCAGTAATCCCTCTTCTGGGTATATATTCAGAGGAACTGA
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Task1_train_968
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The gene PGM1 (phosphoglucomutase 1), on Chromosome 1, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; PGM1-congenital disorder of glycosylation
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AGCACATGAGTGGCACCCCACCTAACACAGCAGTACCTGGCAAGACGCCACAGTTTAGGACCTGGAGCATCTCTAGATGTGGACAGAATTGTTAGTGCTTCCCTTACTGTGTGCCGGGTACCCTAGGCTGCAGGCTGGGTCAGGCTTTCTCCTGGCTTCTCATGAACACTTACGCACCAGGGTTCTCTCACCTCTGCTTCTGTTGCCTGTTGTCACAGAGTAAACTCATCTCTCACAATTCATAATAGAATAAAGAGCAGGATGAAGATTCTGTTACAACCTCCCAGTTTACTTTTTTCCAATTGACCCAGATTTTTGGCCTGGTCCTTGTCAAGGCATCTCATAGGGTTTGGAAGGGCCGGGCCGTGGGATTTACTGGAGGCTTCCCTCTGGGGAGCAGGCAGTGAATGGATGGATGGGCCACAGCAACCCTCAGTGCCTGGAGTCTCCCCTCCTCAACTTCTAGCACAAGTGGTTTCTCATCCTTGTGCCTGTTTGCCATTTGTGAGAACTTGGGGTCCAGTTTGGATGATTGTAAATTATGCCTGAGATAATTAGAAGAGAGACCTGTGGTTGAGGAAGAAAGGGGTGTAGAAAAGGAGTGGAGCTGAGGGATGGCAGAGTGGGACAGAAGTTTGTGTCATTAAGCCTTCAGAGACAGAAGGGAAGTCAAGGAAAAGTAAATCCCAGCTCTGCAGTGCCTCTGGCATCTGCCAGGAGGGAGAAGAGGTGTAAAGGTGTGTATAGGAGACAGTGGCCTAAGCTCGAGAGCTGCCCTCTGTGCTGTAAAGAAAGCAGCTGCCCCACTTTCTGTAATCAGAAAATCCAAGCATTTTGATGTGAGACCAGATAGGAGGGAAAAATATGATCCAACATATATAGATAGAACATCTGCAATCTAGTGAAAAGAATTTTAGAGGCTTCAAGTTGAAGCTGTGAAGAAAGGAGACCAACCCTGGTGTGTTCCTAGAAAGCAAGAAATGGTCAGTGAAAATGGACCGTATCCTTCCCATAGTGACTAACTGTGGCATATCCTCTGTGTATTTCATCTACTGTCTTCACTAATCAGTGCTAATGAATGGCACCATTAAACACCAGATGGGGATTGGTGACGAACAGCAGGTGAAGAGCAGCATCTTTTTGGTCAGTCTTTGGTGTTATGCAAGGTTCTCCTTTTTACAGAGGATGGATAGACTCATAAAGACTGAAGAGTCCTCAGGCAACTTCTGTCCCAGCCTTCTTCCCTCAGGTTGGGAAATATCTACCCCAGAGTTCCCACACATTTTTCCCCAAGTGAGAAGATAATTGATGTCCAGAGATACCGCTGGGGAGGAAAAAGAGAGGGCAGCAGAGAGAAGGATGGGCTTGGCACTTCACACGGACCTCGCTTTGGGTCCATCAGGGATTGGCAGGAGATTGGCCACTGGCTCCTGCTTGTTAGGTTGGGAATAGCCAGTCTCTGCCATTTGGGACCTCTGACTTCCTGTTCTCTTTTGAGGACCTTTGCTAGTGGTTTGTAAGAGTCCTTCCCCTCATCTGCCTGAAACCTCTTCAGCTCTGGTTTCAGCCCCTTTGGTCCATGTTTCCCTCTTGATCTGGGGGCTGAATTTTTGCATCTAGCAGCTTTATGTGCTTCATTATTAAGCTTCAAACTGGAATGGTTAGTCCATAAATCACAGGGAAGTGGGGAGAGGAGGGAAGCCCTCACATCACCCAGCATCACTGAGGTCAGGTCTCCCCTGACCCTGGAAATGCTTCTCCCACCGTAGCTAAGCCCCCATCAGCTGGATGCAGAGAGGGTGACGGAAGGCAGGCTCACAAGGTGCAGCTGCTGCCATTTATCAAGGATTTAACCCTCCAATGAACAAGTATGGATGAAATTACATCCCCAAATAGACCCCTCATAATTTGCCAGCCTTCAGTCTCCCAGCATTTGGGGAAAAAAATCTCTGCTTATCTTTTCCAGGGCTTGCGCCTCATTTTCACAGATGGTTCTCGAATCGTCTTCCGACTGAGCGGCACTGGGAGTGCCGGGGCCACCATTCGGCTGTACATCGATAGCTATGAGAAGGACGTTGCCAAGATTAACCAGGACCCCCAGGTAACGCCCAGCCCTGTGCCCTGGTTAGTTCTTTCTGTTCAAGGGAATGATAGTTTCCCATTGAGCCTGTGTTTCAATGCCCATTTCTCAAATGACTCAACAAGGTACCAGCTGTGCTTACTTTCTTCCATGTTTCTTTCTCCATGTCAACATTATAGATAATAATTATAATAATAAAAATAGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACCTGAGCCCAGGAGGTCAAGCCTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTTCAGCCTGAGCAAGAGTGAGACCTTATATCAAAAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAATTTTCTGAGCATTTATGGTTTGCCAGGCTGTGTTGTAAGCCCATTATGAAAATATACTCATTTAATTCTCAAATAACTTAGACTGTTATTCTCCCTGCTACAGATAAGGAAACTGAGGCACAGAAAAGTTAAGCAACAGTTAATAGGTTTACATGCCTAGTAAGGATAATGAATCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACATCCACCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCAGCTACCTGAGTAGCTCGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCTCTGCTCATTTCCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTAGGGAGGAGGTCTTAGTACATTGCCTAGGCTGGTCTTGAATTCCTAGCCTCAAGTAATCCTCCTACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATATGTGTGAGCCACTGCACCCAACCCAGGATAATTGGTCTTTAAATCAGCCCCTCATCTGGTGTTCTGCTCTGTCTGCAGCATTTTGTTGCTTTGTTTGGTCTGATCACCTGCTTGGGCAGAACACACCACTGGGTCTTAGATTTGGTGGGGGCAGGGAGAGGCAGTTTCATGTGTCTTCACAGAACAGTCTGCAGACCTGCAGCTTGGTAAGCTGGGTTCCTCAGCCATTCCCCCAAAAGTCTTCAGAAGTATATCAGAGTAAGGAGGGACTCTGGGAGCAAAGGGTGGGACAGTGAACTTGAAGGACAACCCCCAAAAATGGAGGAGCCAAGGGGAAGCAGTGAAGGACAGGACAGTTTCTTTAAGTGTTTTTCACAATCCTTATCTCAACCAGAGCTCCATAGCTTAAAAAAAAGTTGGGGAAGTGTTGTGGTATATTAGCCCCTTCTTGGTGATTCACAGCATACAATGCAATGCACCATAAAGGCTCCAAGATTTCGGACATGGTGGCCTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAAGATCACTTGAGCGTAGGAGTTCTGGGCTATAGTGTGCTATGCCTGTCGGGTGTCTGCACTAAGTTTGGCATCAATATGGTACCTCCCGAGAGGGGAACCACCAGGTTGCATAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAAGTTGGAAACAGAGCAGGTCAAAACTCCCATGCCGATGAGTAGTGGGATTGCACCTGTGAATACCCACTGCGCTTCAGCCTGGTGACATAGCAAGACCCCATCTCTAAAAAAAGAAAAGGAAAGAAAAAAAGAGGGTGCTGAGAAGACTTGCAGTAAAGGTGCCTGTTTACATAGCATTTGCTGAAGGACATTTCTCCAAAGAAAACATACAAATGGCCAACAGGCGTATGAAAAGGTGGTCCACATCACTAATCATCAGGGAAATGAAAATCAAAACCACAATGAGCTGTCACCTCACACCTGTTAGGATGGCTGTTCTCAAAAAGACAAAAGATAACAAGTGTTGGGAAGGATGTGGAGAAAAGGGAACCATCAGACACTATTGGTGGGAATATAAATTGGTATAGCTATTTTGGAATAACCAAAATATGGAGGTTCCTCAAAAAGTTAAAAATATTTTAGTACTAATATACGATCCAGTAATCCCTCTTCTGGGTATATATTCAGAGGAACTGAAAT
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AGCACATGAGTGGCACCCCACCTAACACAGCAGTACCTGGCAAGACGCCACAGTTTAGGACCTGGAGCATCTCTAGATGTGGACAGAATTGTTAGTGCTTCCCTTACTGTGTGCCGGGTACCCTAGGCTGCAGGCTGGGTCAGGCTTTCTCCTGGCTTCTCATGAACACTTACGCACCAGGGTTCTCTCACCTCTGCTTCTGTTGCCTGTTGTCACAGAGTAAACTCATCTCTCACAATTCATAATAGAATAAAGAGCAGGATGAAGATTCTGTTACAACCTCCCAGTTTACTTTTTTCCAATTGACCCAGATTTTTGGCCTGGTCCTTGTCAAGGCATCTCATAGGGTTTGGAAGGGCCGGGCCGTGGGATTTACTGGAGGCTTCCCTCTGGGGAGCAGGCAGTGAATGGATGGATGGGCCACAGCAACCCTCAGTGCCTGGAGTCTCCCCTCCTCAACTTCTAGCACAAGTGGTTTCTCATCCTTGTGCCTGTTTGCCATTTGTGAGAACTTGGGGTCCAGTTTGGATGATTGTAAATTATGCCTGAGATAATTAGAAGAGAGACCTGTGGTTGAGGAAGAAAGGGGTGTAGAAAAGGAGTGGAGCTGAGGGATGGCAGAGTGGGACAGAAGTTTGTGTCATTAAGCCTTCAGAGACAGAAGGGAAGTCAAGGAAAAGTAAATCCCAGCTCTGCAGTGCCTCTGGCATCTGCCAGGAGGGAGAAGAGGTGTAAAGGTGTGTATAGGAGACAGTGGCCTAAGCTCGAGAGCTGCCCTCTGTGCTGTAAAGAAAGCAGCTGCCCCACTTTCTGTAATCAGAAAATCCAAGCATTTTGATGTGAGACCAGATAGGAGGGAAAAATATGATCCAACATATATAGATAGAACATCTGCAATCTAGTGAAAAGAATTTTAGAGGCTTCAAGTTGAAGCTGTGAAGAAAGGAGACCAACCCTGGTGTGTTCCTAGAAAGCAAGAAATGGTCAGTGAAAATGGACCGTATCCTTCCCATAGTGACTAACTGTGGCATATCCTCTGTGTATTTCATCTACTGTCTTCACTAATCAGTGCTAATGAATGGCACCATTAAACACCAGATGGGGATTGGTGACGAACAGCAGGTGAAGAGCAGCATCTTTTTGGTCAGTCTTTGGTGTTATGCAAGGTTCTCCTTTTTACAGAGGATGGATAGACTCATAAAGACTGAAGAGTCCTCAGGCAACTTCTGTCCCAGCCTTCTTCCCTCAGGTTGGGAAATATCTACCCCAGAGTTCCCACACATTTTTCCCCAAGTGAGAAGATAATTGATGTCCAGAGATACCGCTGGGGAGGAAAAAGAGAGGGCAGCAGAGAGAAGGATGGGCTTGGCACTTCACACGGACCTCGCTTTGGGTCCATCAGGGATTGGCAGGAGATTGGCCACTGGCTCCTGCTTGTTAGGTTGGGAATAGCCAGTCTCTGCCATTTGGGACCTCTGACTTCCTGTTCTCTTTTGAGGACCTTTGCTAGTGGTTTGTAAGAGTCCTTCCCCTCATCTGCCTGAAACCTCTTCAGCTCTGGTTTCAGCCCCTTTGGTCCATGTTTCCCTCTTGATCTGGGGGCTGAATTTTTGCATCTAGCAGCTTTATGTGCTTCATTATTAAGCTTCAAACTGGAATGGTTAGTCCATAAATCACAGGGAAGTGGGGAGAGGAGGGAAGCCCTCACATCACCCAGCATCACTGAGGTCAGGTCTCCCCTGACCCTGGAAATGCTTCTCCCACCGTAGCTAAGCCCCCATCAGCTGGATGCAGAGAGGGTGACGGAAGGCAGGCTCACAAGGTGCAGCTGCTGCCATTTATCAAGGATTTAACCCTCCAATGAACAAGTATGGATGAAATTACATCCCCAAATAGACCCCTCATAATTTGCCAGCCTTCAGTCTCCCAGCATTTGGGGAAAAAAATCTCTGCTTATCTTTTCCAGGGCTTGCGCCTCATTTTCACAGATGGTTCTCGAATCGTCTTCCGACTGAGCGGCACTGGGAGTGCCGGGGCCACCATTCGGCCGTACATCGATAGCTATGAGAAGGACGTTGCCAAGATTAACCAGGACCCCCAGGTAACGCCCAGCCCTGTGCCCTGGTTAGTTCTTTCTGTTCAAGGGAATGATAGTTTCCCATTGAGCCTGTGTTTCAATGCCCATTTCTCAAATGACTCAACAAGGTACCAGCTGTGCTTACTTTCTTCCATGTTTCTTTCTCCATGTCAACATTATAGATAATAATTATAATAATAAAAATAGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACCTGAGCCCAGGAGGTCAAGCCTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTTCAGCCTGAGCAAGAGTGAGACCTTATATCAAAAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAATTTTCTGAGCATTTATGGTTTGCCAGGCTGTGTTGTAAGCCCATTATGAAAATATACTCATTTAATTCTCAAATAACTTAGACTGTTATTCTCCCTGCTACAGATAAGGAAACTGAGGCACAGAAAAGTTAAGCAACAGTTAATAGGTTTACATGCCTAGTAAGGATAATGAATCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACATCCACCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCAGCTACCTGAGTAGCTCGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCTCTGCTCATTTCCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTAGGGAGGAGGTCTTAGTACATTGCCTAGGCTGGTCTTGAATTCCTAGCCTCAAGTAATCCTCCTACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATATGTGTGAGCCACTGCACCCAACCCAGGATAATTGGTCTTTAAATCAGCCCCTCATCTGGTGTTCTGCTCTGTCTGCAGCATTTTGTTGCTTTGTTTGGTCTGATCACCTGCTTGGGCAGAACACACCACTGGGTCTTAGATTTGGTGGGGGCAGGGAGAGGCAGTTTCATGTGTCTTCACAGAACAGTCTGCAGACCTGCAGCTTGGTAAGCTGGGTTCCTCAGCCATTCCCCCAAAAGTCTTCAGAAGTATATCAGAGTAAGGAGGGACTCTGGGAGCAAAGGGTGGGACAGTGAACTTGAAGGACAACCCCCAAAAATGGAGGAGCCAAGGGGAAGCAGTGAAGGACAGGACAGTTTCTTTAAGTGTTTTTCACAATCCTTATCTCAACCAGAGCTCCATAGCTTAAAAAAAAGTTGGGGAAGTGTTGTGGTATATTAGCCCCTTCTTGGTGATTCACAGCATACAATGCAATGCACCATAAAGGCTCCAAGATTTCGGACATGGTGGCCTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAAGATCACTTGAGCGTAGGAGTTCTGGGCTATAGTGTGCTATGCCTGTCGGGTGTCTGCACTAAGTTTGGCATCAATATGGTACCTCCCGAGAGGGGAACCACCAGGTTGCATAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAAGTTGGAAACAGAGCAGGTCAAAACTCCCATGCCGATGAGTAGTGGGATTGCACCTGTGAATACCCACTGCGCTTCAGCCTGGTGACATAGCAAGACCCCATCTCTAAAAAAAGAAAAGGAAAGAAAAAAAGAGGGTGCTGAGAAGACTTGCAGTAAAGGTGCCTGTTTACATAGCATTTGCTGAAGGACATTTCTCCAAAGAAAACATACAAATGGCCAACAGGCGTATGAAAAGGTGGTCCACATCACTAATCATCAGGGAAATGAAAATCAAAACCACAATGAGCTGTCACCTCACACCTGTTAGGATGGCTGTTCTCAAAAAGACAAAAGATAACAAGTGTTGGGAAGGATGTGGAGAAAAGGGAACCATCAGACACTATTGGTGGGAATATAAATTGGTATAGCTATTTTGGAATAACCAAAATATGGAGGTTCCTCAAAAAGTTAAAAATATTTTAGTACTAATATACGATCCAGTAATCCCTCTTCTGGGTATATATTCAGAGGAACTGAAAT
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Task1_train_969
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The gene ROR1 (receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1) on Chromosome 1 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Hearing loss, autosomal recessive 108
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CCCACTTGCGAAGACCTAGGGATATACGTTGGTATGAAGGGCAGTGCTTCCAATAAGATTTCCCTTGAAATCTCGTTGTGAGGACAAAATACATGCATAAAAAGAACAGAAACATCAAGTTGATAATAATAACAAAAAGTTAAATAGTACTTACCATGGGCCAGACATAGGTCTGAGTGCTTTACAAACTTTAACTCATAGGTCTGAGTGCTTTACAAACATTAACTCATTAAAAGTTTGCAATAACATGGTAAGTACAATTATTATCATCCCATTTTATAGATGAAGGAATTGAGGCAAAAGTTAAATGTTGTATCTGGGGTCACACAGCTGGTAAGTGGAGAAGGCAGGATTCCAACTCAGACTGGCTATGGAGGCCACTTGTGTAACCAGCCACCACACTGCTTTGTGTATGTGGTGGCATTCACAGTAAAGGCAAAAGAGTCTAGCAAAGAAATGACCATAGTGGTCAGGGAAGGTTTTGCGGGAAGTGGGGCCTGAAACAGGCTTTTTAGAAAACAAAGGATTTAATCAATGGAGAAGACCGCATTTCAGACCTTCCCATCTCTATTGTGAGTACTTCAGAAGGACAATCTTTTGTTTTGGTTTCTCTTTTAGCACAATAAATATTCGAAGAATGGCAGAACATTGGAGGAACAAAAGTATTAGGCAAGAATGTAAATGGTTTCAGGAGTGGACATTGAGAAAACCTATTTAACTAAAGTGATGCCATCACACAGAGAAGTAGCAAGGGATCATGTCAGGAAAGTGAGTTAGGACCAGATTACAAATGCTCTGAGTACCAGGCTGTAGCCTCTGTGGTAGTGCTTCTGACACCCTAATCTTCACAGAAACCACTGGGGTCTTGTTAAATGCACATGCAGATTCAGTAGGTCTGAGGTGGGCCCAAGAGTCTGCATTTGCAGTAAGTTTGGGTGATGCTGATGTTGCTGGTCCCCAGACCACAGTTTGAGTACCAAGACTCTAGACAACAGCAAAAAACCATTTTGTGGCTGGGTTGAGGGAAAGGGATAGGGTAGTGATGGAAAGTTGTCTATGGCACCTCCCCTGAGTTGCAGCCAACGATTTGAAAGATATATAGACCTACAATATTTTATTGAATTTGTTTATAGAACCTTTTTCTATATGCCCCGTCCCTCCTTTCGGATGCAAAGCTGTCTTGCCTGAAGATATGTTTTAAACCACGTTTTTCCTCTCTTTCATACAGAGCAAGGCTAAAGAGCTACCTCTTTCTGCTGTACGCTTTATGGAAGAATTGGGTGAGTGTGCCTTTGGAAAAATCTATAAAGGCCATCTCTATCTCCCAGGCATGGACCATGCTCAGCTGGTTGCTATCAAGACCTTGAAAGACTATAACAACCCCCAGCAATGGACGGAATTTCAACAAGAAGCCTCCCTAATGGCAGAACTGCACCACCCCAATATTGTCTGCCTTCTAGGTGCCGTCACTCAGGAACAACCTGTGTGCATGCTTTTTGAGTATATTAATCAGGGGGATCTCCATGAGTTCCTCATCATGAGATCCCCACACTCTGATGTTGGCTGCAGCAGTGATGAAGATGGGACTGTGAAATCCAGCCTGGACCACGGAGATTTTCTGCACATTGCAATTCAGATTGCAGCTGGCATGGAATACCTGTCTAGTCACTTCTTTGTCCACAAGGACCTTGCAGCTCGCAATATTTTAATCGGAGAGCAACTTCATGTAAAGATTTCAGACTTGGGGCTTTCCAGAGAAATTTACTCCGCTGATTACTACAGGGTCCAGAGTAAGTCCTTGCTGCCCATTCGCTGGATGCCCCCTGAAGCCATCATGTATGGCAAATTCTCTTCTGATTCAGATATCTGGTCCTTTGGGGTTGTCTTGTGGGAGATTTTCAGTTTTGGACTCCAGCCATATTATGGATTCAGTAACCAGGAAGTGATTGAGATGGTGAGAAAACGGCAGCTCTTACCATGCTCTGAAGACTGCCCACCCAGAATGTACAGCCTCATGACAGAGTGCTGGAATGAGATTCCTTCTAGGAGACCAAGATTTAAAGATATTCACGTCCGGCTTCGGTCCTGGGAGGGACTCTCAAGTCACACAAGCTCTACTACTCCTTCAGGGGGAAATGCCACCACACAGACAACCTCCCTCAGTGCCAGCCCAGTGAGTAATCTCAGTAACCCCAGATATCCTAATTACATGTTCCCGAGCCAGGGTATTACACCACAGGGCCAGATTGCTGGTTTCATTGGCCCGCCAATACCTCAGAACCAGCGATTCATTCCCATCAATGGATACCCAATACCTCCTGGATATGCAGCGTTTCCAGCTGCCCACTACCAGCCAACAGGTCCTCCCAGAGTGATTCAGCACTGCCCACCTCCCAAGAGTCGGTCCCCAAGCAGTGCCAGTGGGTCGACTAGCACTGGCCATGTGACTAGCTTGCCCTCATCAGGATCCAATCAGGAAGCAAATATTCCTTTACTACCACACATGTCAATTCCAAATCATCCTGGTGGAATGGGTATCACCGTTTTTGGCAACAAATCTCAAAAACCCTACAAAATTGACTCAAAGCAAGCATCTTTACTAGGAGACGCCAATATTCATGGACACACCGAATCTATGATTTCTGCAGAACTGTAAAATGCACAACTTTTGTAAATGTGGTATACAGGACAAACTAGACGGCCGTAGAAAAGATTTATATTCAAATGTTTTTATTAAAGTAAGGTTCTCATTTAGCAGACATCGCAACAAGTACCTTCTGTGAAGTTTCACTGTGTCTTACCAAGCAGGACAGACACTCGGCCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCAAACAAAAACATTGTGGGATGTGCACTCCATTGGAGTGCATGACATGGCATTGGGATTGGAACATGTGGTTTCGAGCACTGAAAGCTGCAAACCAGTGAAGAGGAAAAGAACCTTGTGATTAAATATAAAACCAAAAGTCAAATGGTGCTTTGTGTTTTAGCCTTCAGTCACCATGACTGGTCTCTCCCCCAGATGTATATATACCATAGCATTTGTCTACCTGCTGTCTTTTCTTCAGGACAGATGTTCAGGAATTATATTGATTGAATTTAGACTCTGTGCATGTTCTTATGGAAATGATGTTCAGAATCCATGAAGAAACTTCAGGCCAAATTTGAAACCCTGGAGGGAAATGAGCCATAAGGGAAGTATAACAAGCCCTGAAGCCTTTTATGTCGTTGTGCTTCTTTGGGAAGGTGTAGAGTGTGCCTTTTTGTGAATCCTCCTCTGATCATGAGGGTCTTTCCCACAGTTTCTCACAGTGTGTTTACACTGCCCTTGGAATAACACAGCGCATCAGACCATAAGAAGGCTAGATGTGGATGCTAGAATTGATTGTTGGTTGATAGTTCTCTTTGCTGGATTAGGAATGAGGCGCCAAAGGAAGCACAGCCAGGAAAATGGCCCCACAGCCTAGATCAGCATCTGTGGGAAAGGAAAAAGGGTTCCCATGGGGACAGCCCCCATAGGAGTTTTCTGGAACCAGTAACACTGAAAAATAAGTGTGTGGCTACAGATGAGCACGCCCACCCCTTGCAACTCCCTGTTTACAAGTTGTCCGAGGCATTGGAGTGCTTATGGTCAATGGGCTCTAGGGAAGTAGGAAACTCCATCATGATACAAATGTCTAGTAATTTTAAAGTTTCTTTCCCTTTTTTTCTGTGCTGGAAATGTTCACAGATTTGATTCCCGCCCCAAGAATTACAACAATGTATTCATACAGTCAGTTGGAATCCAAAGGCAATTAATTCTATTTTGCAAAATATGATGGTCTTCCTAAAAAACAAGTACTGAGTTCTCATTTCAAAAGTTACCAAGAACTGAATTCTTTAAACTAGCAAACCGAAGTAACATGACCATTTTTGCCTTAGTGGGAGGTTTCAAATGTGCAGCTCATGGCATTTACCTGCCGACCATCTTTTGCCAAGTTTAGAATTCTTATGCGTTTCAAGTTCTATATAGAAAGTAATTTTACTTTTGATTTTTCTCTTGTTAAAAAAAAACTCCTTTATTCTAAGAACAA
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CCCACTTGCGAAGACCTAGGGATATACGTTGGTATGAAGGGCAGTGCTTCCAATAAGATTTCCCTTGAAATCTCGTTGTGAGGACAAAATACATGCATAAAAAGAACAGAAACATCAAGTTGATAATAATAACAAAAAGTTAAATAGTACTTACCATGGGCCAGACATAGGTCTGAGTGCTTTACAAACTTTAACTCATAGGTCTGAGTGCTTTACAAACATTAACTCATTAAAAGTTTGCAATAACATGGTAAGTACAATTATTATCATCCCATTTTATAGATGAAGGAATTGAGGCAAAAGTTAAATGTTGTATCTGGGGTCACACAGCTGGTAAGTGGAGAAGGCAGGATTCCAACTCAGACTGGCTATGGAGGCCACTTGTGTAACCAGCCACCACACTGCTTTGTGTATGTGGTGGCATTCACAGTAAAGGCAAAAGAGTCTAGCAAAGAAATGACCATAGTGGTCAGGGAAGGTTTTGCGGGAAGTGGGGCCTGAAACAGGCTTTTTAGAAAACAAAGGATTTAATCAATGGAGAAGACCGCATTTCAGACCTTCCCATCTCTATTGTGAGTACTTCAGAAGGACAATCTTTTGTTTTGGTTTCTCTTTTAGCACAATAAATATTCGAAGAATGGCAGAACATTGGAGGAACAAAAGTATTAGGCAAGAATGTAAATGGTTTCAGGAGTGGACATTGAGAAAACCTATTTAACTAAAGTGATGCCATCACACAGAGAAGTAGCAAGGGATCATGTCAGGAAAGTGAGTTAGGACCAGATTACAAATGCTCTGAGTACCAGGCTGTAGCCTCTGTGGTAGTGCTTCTGACACCCTAATCTTCACAGAAACCACTGGGGTCTTGTTAAATGCACATGCAGATTCAGTAGGTCTGAGGTGGGCCCAAGAGTCTGCATTTGCAGTAAGTTTGGGTGATGCTGATGTTGCTGGTCCCCAGACCACAGTTTGAGTACCAAGACTCTAGACAACAGCAAAAAACCATTTTGTGGCTGGGTTGAGGGAAAGGGATAGGGTAGTGATGGAAAGTTGTCTATGGCACCTCCCCTGAGTTGCAGCCAACGATTTGAAAGATATATAGACCTACAATATTTTATTGAATTTGTTTATAGAACCTTTTTCTATATGCCCCGTCCCTCCTTTCGGATGCAAAGCTGTCTTGCCTGAAGATATGTTTTAAACCACGTTTTTCCTCTCTTTCATACAGAGCAAGGCTAAAGAGCTACCTCTTTCTGCTGTACGCTTTATGGAAGAATTGGGTGAGTGTGCCTTTGGAAAAATCTATAAAGGCCATCTCTATCTCCCAGGCATGGACCATGCTCAGCTGGTTGCTATCAAGACCTTGAAAGACTATAACAACCCCCAGCAATGGACGGAATTTCAACAAGAAGCCTCCCTAATGGCAGAACTGCACCACCCCAATATTGTCTGCCTTCTAGGTGCCGTCACTCAGGAACAACCTGTGTGCATGCTTTTTGAGTATATTAATCAGGGGGATCTCCATGAGTTCCTCATCATGAGATCCCCACACTCTGATGTTGGCTGCAGCAGTGATGAAGATGGGACTGTGAAATCCAGCCTGGACCACGGAGATTTTCTGCACATTGCAATTCAGATTGCAGCTGGCATGGAATACCTGTCTAGTCACTTCTTTGTCCACAAGGACCTTGCAGCTCGCAATATTTTAATCGGAGAGCAACTTCATGTAAAGATTTCAGACTTGGGGCTTTCCAGAGAAATTTACTCCGCTGATTACTACAGGGTCCAGAGTAAGTCCTTGCTGCCCATTCGCTGGATGCCCCCTGAAGCCATCATGTATGGCAAATTCTCTTCTGATTCAGATATCTGGTCCTTTGGGGTTGTCTTGTGGGAGATTTTCAGTTTTGGACTCCAGCCATATTATGGATTCAGTAACCAGGAAGTGATTGAGATGGTGAGAAAACGGCAGCTCTTACCATGCTCTGAAGACTGCCCACCCAGAATGTACAGCCTCATGACAGAGTGCTGGAATGAGATTCCTTCTAGGACACCAAGATTTAAAGATATTCACGTCCGGCTTCGGTCCTGGGAGGGACTCTCAAGTCACACAAGCTCTACTACTCCTTCAGGGGGAAATGCCACCACACAGACAACCTCCCTCAGTGCCAGCCCAGTGAGTAATCTCAGTAACCCCAGATATCCTAATTACATGTTCCCGAGCCAGGGTATTACACCACAGGGCCAGATTGCTGGTTTCATTGGCCCGCCAATACCTCAGAACCAGCGATTCATTCCCATCAATGGATACCCAATACCTCCTGGATATGCAGCGTTTCCAGCTGCCCACTACCAGCCAACAGGTCCTCCCAGAGTGATTCAGCACTGCCCACCTCCCAAGAGTCGGTCCCCAAGCAGTGCCAGTGGGTCGACTAGCACTGGCCATGTGACTAGCTTGCCCTCATCAGGATCCAATCAGGAAGCAAATATTCCTTTACTACCACACATGTCAATTCCAAATCATCCTGGTGGAATGGGTATCACCGTTTTTGGCAACAAATCTCAAAAACCCTACAAAATTGACTCAAAGCAAGCATCTTTACTAGGAGACGCCAATATTCATGGACACACCGAATCTATGATTTCTGCAGAACTGTAAAATGCACAACTTTTGTAAATGTGGTATACAGGACAAACTAGACGGCCGTAGAAAAGATTTATATTCAAATGTTTTTATTAAAGTAAGGTTCTCATTTAGCAGACATCGCAACAAGTACCTTCTGTGAAGTTTCACTGTGTCTTACCAAGCAGGACAGACACTCGGCCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCAAACAAAAACATTGTGGGATGTGCACTCCATTGGAGTGCATGACATGGCATTGGGATTGGAACATGTGGTTTCGAGCACTGAAAGCTGCAAACCAGTGAAGAGGAAAAGAACCTTGTGATTAAATATAAAACCAAAAGTCAAATGGTGCTTTGTGTTTTAGCCTTCAGTCACCATGACTGGTCTCTCCCCCAGATGTATATATACCATAGCATTTGTCTACCTGCTGTCTTTTCTTCAGGACAGATGTTCAGGAATTATATTGATTGAATTTAGACTCTGTGCATGTTCTTATGGAAATGATGTTCAGAATCCATGAAGAAACTTCAGGCCAAATTTGAAACCCTGGAGGGAAATGAGCCATAAGGGAAGTATAACAAGCCCTGAAGCCTTTTATGTCGTTGTGCTTCTTTGGGAAGGTGTAGAGTGTGCCTTTTTGTGAATCCTCCTCTGATCATGAGGGTCTTTCCCACAGTTTCTCACAGTGTGTTTACACTGCCCTTGGAATAACACAGCGCATCAGACCATAAGAAGGCTAGATGTGGATGCTAGAATTGATTGTTGGTTGATAGTTCTCTTTGCTGGATTAGGAATGAGGCGCCAAAGGAAGCACAGCCAGGAAAATGGCCCCACAGCCTAGATCAGCATCTGTGGGAAAGGAAAAAGGGTTCCCATGGGGACAGCCCCCATAGGAGTTTTCTGGAACCAGTAACACTGAAAAATAAGTGTGTGGCTACAGATGAGCACGCCCACCCCTTGCAACTCCCTGTTTACAAGTTGTCCGAGGCATTGGAGTGCTTATGGTCAATGGGCTCTAGGGAAGTAGGAAACTCCATCATGATACAAATGTCTAGTAATTTTAAAGTTTCTTTCCCTTTTTTTCTGTGCTGGAAATGTTCACAGATTTGATTCCCGCCCCAAGAATTACAACAATGTATTCATACAGTCAGTTGGAATCCAAAGGCAATTAATTCTATTTTGCAAAATATGATGGTCTTCCTAAAAAACAAGTACTGAGTTCTCATTTCAAAAGTTACCAAGAACTGAATTCTTTAAACTAGCAAACCGAAGTAACATGACCATTTTTGCCTTAGTGGGAGGTTTCAAATGTGCAGCTCATGGCATTTACCTGCCGACCATCTTTTGCCAAGTTTAGAATTCTTATGCGTTTCAAGTTCTATATAGAAAGTAATTTTACTTTTGATTTTTCTCTTGTTAAAAAAAAACTCCTTTATTCTAAGAACAA
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Task1_train_970
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A variant has been detected on Chromosome 1 in JAK1 (Janus kinase 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
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Pathogenic; Autoinflammation, immune dysregulation, and eosinophilia
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GGGCTACCTGAGTCTCAGTTACCTGATCTGTCAAATGAGGGTAATGACACCATCCTACCTAATTTGCAGGGCTCTTAGGGTGACACTTTCAGGTATTCTTTCTGGAATTCTTACCGTTGTTATTTTAGCCTAACTCCCTACCATACCCTAAGGCCCTCAAGGGAAGGCAAGGCCTGTATCTTATTTTATAGTGAACCTCCAGCTTTTCCCAAGCTTGATGCCTGATACACAATAGGAACTCCATACGTATTTGTGTGGTAATTTTGCTGAATAACAGGCACTTAAAATCTCAGATAAATAATACTATAACATCTATCGAGCTTGTACTGCATGCCTGTCACTCTATATGCATTATTTAATCTTCACAACAACCCTACAAGTAGTTACTGATTATCCCCATTTTATAGATGATGAAACTGAGGCTCACGGAAGTTCAGTTACATTTGTGAGGTCACACACCCAGTAGGCCCGTGAAGAGATTCAAACCCATGCCCATCTCTTCCCACAGTGCCAGGCTTCCGACAACTCCTGGGAAGCCCACGAGCACCTGAAAGCCCTCACTTGCCTCACGCCCCGGGAAACACCTGCTCACCTCAATCAGCGTCTTGTCTTTCAAGGGGATCTCGCCATTGTAGCAGATTTCCCAGAGCGTGGTTCCAAAGCTCCACTTGTCAGCAGCCACACTCAGGTTCTTGGAGTCCTCAACACACTCAGGAGCAATCCATGGGATTCGTTCAATGCATTCTGGAAGACAACAGACACACTGATGGAGCAGTTTCTGGGATCTCCTAGGGATTCAATTACTGTCACTGCAGCCAGAACAGTGAGCCAATGAAGGAACTACTTCAAGCAGTGTGCCCAAACATGGCCCATGGCCACATAGGCCCTGTGCGGGGGGCCTGCAGGCGTGCAGCCCTCCAAGCCACCACCAGCACTTCTGATACATCAGTCTGGGTCACAGCCAGCAGATGGGTCCCTGCCTCCAAGCTCCCCAGGAGGGTCGTGTGAAGCCAGGCTTCTGAAGCCCTGGCCTTAGGATCAGCAAAACATCCCAGGGTGGGGGCCATCACCCAGGGCAGGAGGACGAACGGGGGCTCGTTCAAGGACTTAAGAGAAGGCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAATGACTCTCTAAAAGGAGACCAACCCCAGCCCAGCCCTTCTCTCTGCTGACTTGCCCCTGACTCGGGGTGGGGCCAGAGGGAAGAGAGGGGAGACACACCTTGCCTAGACAGCACCGTAATGGGGATGCCGGGGTCACTGAGCTTGATGAATGGGCCACACTCACTGTCGATGCCCTCACGGGCCAGGAGGAGGTTTTTAGTACACACATTTCCATGGACCAGGTCTTTATCCTCCTGCAGAGTAAAAAGGTCAAGTTTAGCCAAGCTGCTCCTTCCCGCATTCTATTTCCAACCCTGGTCCCTCAGGTCATCTCTTCCTACCCCCAGCTACAGCCAGATCTGGACAGCCTGGCCCTGCTGCCAATCATCTGTGTGACTTAGGCACATCACAGGTGCCCCTTGGCTCCAGCTCCCTCATCACTGAATGTGGCTAAATAGTGGCACGTATCTCATTGGGCTTCGTGAGCATGATACTGATTAGAATCTGTGAAACGCCTGAACAGCTGACCCATGGTGAGCACTCCACACGTCAGCTACTAGATGCTGGCAGTTCACTCATTCACTCAACACGTACTGCACTGCTTTCAGCCTTGCCATCCATATGCTGCAGTATGCAAGTCGGCCCTCTGACGTGCTAACATTTCCCACTAAACAGAACTCATGTGAGCACAGGGAACGGCCCCAAACGACCATCTTCAGTAAGCACCAGGCACACCTTTGTTCAACCACAGAGCCCTGGCCCCATGGAACCCAAGGACAGGCCCCTCTAGCTGCTTGGCTAGCACCTCCTTCCTGCCACCCCTCCCAGGACACTCTGGTTTCTGGTGGGACCATTATGGACATCAGGACATTCTCACCAAGTAGCTCAGGGCACTGGCCAGCTGTTTGGCAACTTTGAATTTCCATGGTGTGGTAAGGACATCGCTTTTCCGGTGCATGAAGAGATCCAGAGGACCCCCTTCCACAAACTCTTCCACCATGATATCTGTAGGCATAAAAATAGCCATGTCTGGAACCTGGTCTGTGGCACGGTCCTCTCCTTCATCCCCTTACGACAGTCCACTTCAGTGGACACTACTCGGCCTCAGAGTACACAGATATCCTTGGGGGGTGCAATGGTGCAGGGGCTTCAGAGCTGGAAAGGCCAAGTTCAACCCCAAGCTCTTCTTCTAAACGGTGGCACTGAGCAAGTGACACTTCTCTGAGCCTCAATTCCCTCATCTGTAATAACAGATGGCGGCTAAATGTCACAAGGCCTGGAAAGCCTTGGCGGAGGGCCTGACACAGAGAACAAGGGCTCTGGGAACAACCGCCACCACTGCTGCTGTTCTACAACACACTGTGATGCAGAGGTCAGGCCGCTCACACGGCAAAACTTCCCTCTCAACAGGACTCCTGTGTGAGTACACGGAACAGCTCACATTGTTGGATTCCACAGGGAAGAAGTCACTTGGGGTTAAAAAAAAAATCGCTCTTCTTCCAAACTTACATGTCAGGAACTCAGAGGCCAAGGCCACCCCTCCATCTCAGTGTGCAGCAGCAGCCCAAGGGCCCACCGGCTCAGTGGCTTGACAACCAAGAAAGGGCCAAGCCTGCCTGTGGTTAAAATGGAAGCCAGTCCATTCGAGGAGCCAGCGTCTTGCTGCTTGTGGGGTGCGCTCACCTCGCTCACCTGCCCAGAGCTCCTTGGGCCTGACTCTTGTGGCCTTGACCTCATTTCACTCACCTCAGCCTCCCAGGTCTAGCACAGTGTAGGGTTCTTGGCCAGCGTTGACAAGAAAACATTACACAAATGAATGAAAAGCAATTGGTTTTAGTTCCACCTCCACTATTAACTTAAGCAAATGACCTGCTCAGTCCCTCAATCTCCTCAACTGCAAAAAGAAAGGCAAGAAGCCTGGGCAACGTGAGGGTGGGAAGAGCCTCCACCATCTCCACAGCACCCAAGCTCCCCAGCCAGGCCACCCACCCCTTTGAAAGAGAACACACTTACTCTCCACGTCGCGGACACAGACGCCATAGAGGTACACGATGTGTTTGTGGGAGACCTGTCTCATCATGCTGGCTGCCTCGAAGAAGGCCTGTGGGCGAGCAGGACATAGGAATGTCTCAGGCCAGCCTCCAGGGGGCTGCTCCCCAGGGGCTCTGTTGAGGGGAAAGCCAGTGGACCCAGGAAAGCTCACCACTGTCGCCACCCCAGGCCCTGAACATCAATCCTCTGGCCTTGGCTGTCCAGAGGCACTGCCAAGCCTTGTTCTCTGGGCCAACCTGGCAGGGATGTGAGGTTTATTTAGAAAACCTAACAGGATGCAGAGCAGGGCTGGTGGGAGAAGCTGGCTAAGAATTTTCCCACTGGATACTCATGCCCACCTCTCTCTCTTCCTTTCAGCTCTGGGAAATACCCATATTTAGCACTATGCTGGAACAAAGGGGAAATGAAGGCAGCCGATCTCTGCTCAAGATTTGACTGTGTCACTCTAATAGTCTGTAGAATCCTGGGTGAGTCCTTTTACTCCTCTGGGCTTTCGTTTTCCAGACTGTGTGGTGAGAGCCATGGACTGTATCAGGAACTTTGAACCATTTGGCCAGAGTCCTAGGGCTCCACAGCACAGCCACCTGGACCTGTCCTTAGGAAAGGTGGGGGTTGGGGGTGGAAGGGAGGGCACAGGCTGAGTGTGAGGAGCTGTTCAACCCACCTCACTTACTCTACATGCAGGGTCCACTAAGATCATATGTGGAGAAAAAAATTCTGAGTAAAAGGCAAGTTTGAAAACCACTGGGCCACAAGAAGGGCAAGGGTTCTTCTCAACCCATTGTGTTCCACTGGCTCCAGAAACGGGAGAGGGGAGGGGAGGAGTTCAGAGGAAGACACTTGCCAGGGAAATATCCCTGTGGCTGGGGTCTAAGACTTT
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GGGCTACCTGAGTCTCAGTTACCTGATCTGTCAAATGAGGGTAATGACACCATCCTACCTAATTTGCAGGGCTCTTAGGGTGACACTTTCAGGTATTCTTTCTGGAATTCTTACCGTTGTTATTTTAGCCTAACTCCCTACCATACCCTAAGGCCCTCAAGGGAAGGCAAGGCCTGTATCTTATTTTATAGTGAACCTCCAGCTTTTCCCAAGCTTGATGCCTGATACACAATAGGAACTCCATACGTATTTGTGTGGTAATTTTGCTGAATAACAGGCACTTAAAATCTCAGATAAATAATACTATAACATCTATCGAGCTTGTACTGCATGCCTGTCACTCTATATGCATTATTTAATCTTCACAACAACCCTACAAGTAGTTACTGATTATCCCCATTTTATAGATGATGAAACTGAGGCTCACGGAAGTTCAGTTACATTTGTGAGGTCACACACCCAGTAGGCCCGTGAAGAGATTCAAACCCATGCCCATCTCTTCCCACAGTGCCAGGCTTCCGACAACTCCTGGGAAGCCCACGAGCACCTGAAAGCCCTCACTTGCCTCACGCCCCGGGAAACACCTGCTCACCTCAATCAGCGTCTTGTCTTTCAAGGGGATCTCGCCATTGTAGCAGATTTCCCAGAGCGTGGTTCCAAAGCTCCACTTGTCAGCAGCCACACTCAGGTTCTTGGAGTCCTCAACACACTCAGGAGCAATCCATGGGATTCGTTCAATGCATTCTGGAAGACAACAGACACACTGATGGAGCAGTTTCTGGGATCTCCTAGGGATTCAATTACTGTCACTGCAGCCAGAACAGTGAGCCAATGAAGGAACTACTTCAAGCAGTGTGCCCAAACATGGCCCATGGCCACATAGGCCCTGTGCGGGGGGCCTGCAGGCGTGCAGCCCTCCAAGCCACCACCAGCACTTCTGATACATCAGTCTGGGTCACAGCCAGCAGATGGGTCCCTGCCTCCAAGCTCCCCAGGAGGGTCGTGTGAAGCCAGGCTTCTGAAGCCCTGGCCTTAGGATCAGCAAAACATCCCAGGGTGGGGGCCATCACCCAGGGCAGGAGGACGAACGGGGGCTCGTTCAAGGACTTAAGAGAAGGCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAATGACTCTCTAAAAGGAGACCAACCCCAGCCCAGCCCTTCTCTCTGCTGACTTGCCCCTGACTCGGGGTGGGGCCAGAGGGAAGAGAGGGGAGACACACCTTGCCTAGACAGCACCGTAATGGGGATGCCGGGGTCACTGAGCTTGATGAATGGGCCACACTCACTGTCGATGCCCTCACGGGCCAGGAGGAGGTTTTTAGTACACACATTTCCATGGACCAGGTCTTTATCCTCCTGCAGAGTAAAAAGGTCAAGTTTAGCCAAGCTGCTCCTTCCCGCATTCTATTTCCAACCCTGGTCCCTCAGGTCATCTCTTCCTACCCCCAGCTACAGCCAGATCTGGACAGCCTGGCCCTGCTGCCAATCATCTGTGTGACTTAGGCACATCACAGGTGCCCCTTGGCTCCAGCTCCCTCATCACTGAATGTGGCTAAATAGTGGCACGTATCTCATTGGGCTTCGTGAGCATGATACTGATTAGAATCTGTGAAACGCCTGAACAGCTGACCCATGGTGAGCACTCCACACGTCAGCTACTAGATGCTGGCAGTTCACTCATTCACTCAACACGTACTGCACTGCTTTCAGCCTTGCCATCCATATGCTGCAGTATGCAAGTCGGCCCTCTGACGTGCTAACATTTCCCACTAAACAGAACTCATGTGAGCACAGGGAACGGCCCCAAACGACCATCTTCAGTAAGCACCAGGCACACCTTTGTTCAACCACAGAGCCCTGGCCCCATGGAACCCAAGGACAGGCCCCTCTAGCTGCTTGGCTAGCACCTCCTTCCTGCCACCCCTCCCAGGACACTCTGGTTTCTGGTGGGACCATTATGGACATCAGGACATTCTCACCAAGTAGATCAGGGCACTGGCCAGCTGTTTGGCAACTTTGAATTTCCATGGTGTGGTAAGGACATCGCTTTTCCGGTGCATGAAGAGATCCAGAGGACCCCCTTCCACAAACTCTTCCACCATGATATCTGTAGGCATAAAAATAGCCATGTCTGGAACCTGGTCTGTGGCACGGTCCTCTCCTTCATCCCCTTACGACAGTCCACTTCAGTGGACACTACTCGGCCTCAGAGTACACAGATATCCTTGGGGGGTGCAATGGTGCAGGGGCTTCAGAGCTGGAAAGGCCAAGTTCAACCCCAAGCTCTTCTTCTAAACGGTGGCACTGAGCAAGTGACACTTCTCTGAGCCTCAATTCCCTCATCTGTAATAACAGATGGCGGCTAAATGTCACAAGGCCTGGAAAGCCTTGGCGGAGGGCCTGACACAGAGAACAAGGGCTCTGGGAACAACCGCCACCACTGCTGCTGTTCTACAACACACTGTGATGCAGAGGTCAGGCCGCTCACACGGCAAAACTTCCCTCTCAACAGGACTCCTGTGTGAGTACACGGAACAGCTCACATTGTTGGATTCCACAGGGAAGAAGTCACTTGGGGTTAAAAAAAAAATCGCTCTTCTTCCAAACTTACATGTCAGGAACTCAGAGGCCAAGGCCACCCCTCCATCTCAGTGTGCAGCAGCAGCCCAAGGGCCCACCGGCTCAGTGGCTTGACAACCAAGAAAGGGCCAAGCCTGCCTGTGGTTAAAATGGAAGCCAGTCCATTCGAGGAGCCAGCGTCTTGCTGCTTGTGGGGTGCGCTCACCTCGCTCACCTGCCCAGAGCTCCTTGGGCCTGACTCTTGTGGCCTTGACCTCATTTCACTCACCTCAGCCTCCCAGGTCTAGCACAGTGTAGGGTTCTTGGCCAGCGTTGACAAGAAAACATTACACAAATGAATGAAAAGCAATTGGTTTTAGTTCCACCTCCACTATTAACTTAAGCAAATGACCTGCTCAGTCCCTCAATCTCCTCAACTGCAAAAAGAAAGGCAAGAAGCCTGGGCAACGTGAGGGTGGGAAGAGCCTCCACCATCTCCACAGCACCCAAGCTCCCCAGCCAGGCCACCCACCCCTTTGAAAGAGAACACACTTACTCTCCACGTCGCGGACACAGACGCCATAGAGGTACACGATGTGTTTGTGGGAGACCTGTCTCATCATGCTGGCTGCCTCGAAGAAGGCCTGTGGGCGAGCAGGACATAGGAATGTCTCAGGCCAGCCTCCAGGGGGCTGCTCCCCAGGGGCTCTGTTGAGGGGAAAGCCAGTGGACCCAGGAAAGCTCACCACTGTCGCCACCCCAGGCCCTGAACATCAATCCTCTGGCCTTGGCTGTCCAGAGGCACTGCCAAGCCTTGTTCTCTGGGCCAACCTGGCAGGGATGTGAGGTTTATTTAGAAAACCTAACAGGATGCAGAGCAGGGCTGGTGGGAGAAGCTGGCTAAGAATTTTCCCACTGGATACTCATGCCCACCTCTCTCTCTTCCTTTCAGCTCTGGGAAATACCCATATTTAGCACTATGCTGGAACAAAGGGGAAATGAAGGCAGCCGATCTCTGCTCAAGATTTGACTGTGTCACTCTAATAGTCTGTAGAATCCTGGGTGAGTCCTTTTACTCCTCTGGGCTTTCGTTTTCCAGACTGTGTGGTGAGAGCCATGGACTGTATCAGGAACTTTGAACCATTTGGCCAGAGTCCTAGGGCTCCACAGCACAGCCACCTGGACCTGTCCTTAGGAAAGGTGGGGGTTGGGGGTGGAAGGGAGGGCACAGGCTGAGTGTGAGGAGCTGTTCAACCCACCTCACTTACTCTACATGCAGGGTCCACTAAGATCATATGTGGAGAAAAAAATTCTGAGTAAAAGGCAAGTTTGAAAACCACTGGGCCACAAGAAGGGCAAGGGTTCTTCTCAACCCATTGTGTTCCACTGGCTCCAGAAACGGGAGAGGGGAGGGGAGGAGTTCAGAGGAAGACACTTGCCAGGGAAATATCCCTGTGGCTGGGGTCTAAGACTTT
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Task1_train_971
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Given this variant in gene LOC126805749, JAK1 (BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr1:65312286-65313485| Janus kinase 1) on Chromosome 1, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Autoinflammation, immune dysregulation, and eosinophilia
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GAGATCCAGAGGACCCCCTTCCACAAACTCTTCCACCATGATATCTGTAGGCATAAAAATAGCCATGTCTGGAACCTGGTCTGTGGCACGGTCCTCTCCTTCATCCCCTTACGACAGTCCACTTCAGTGGACACTACTCGGCCTCAGAGTACACAGATATCCTTGGGGGGTGCAATGGTGCAGGGGCTTCAGAGCTGGAAAGGCCAAGTTCAACCCCAAGCTCTTCTTCTAAACGGTGGCACTGAGCAAGTGACACTTCTCTGAGCCTCAATTCCCTCATCTGTAATAACAGATGGCGGCTAAATGTCACAAGGCCTGGAAAGCCTTGGCGGAGGGCCTGACACAGAGAACAAGGGCTCTGGGAACAACCGCCACCACTGCTGCTGTTCTACAACACACTGTGATGCAGAGGTCAGGCCGCTCACACGGCAAAACTTCCCTCTCAACAGGACTCCTGTGTGAGTACACGGAACAGCTCACATTGTTGGATTCCACAGGGAAGAAGTCACTTGGGGTTAAAAAAAAAATCGCTCTTCTTCCAAACTTACATGTCAGGAACTCAGAGGCCAAGGCCACCCCTCCATCTCAGTGTGCAGCAGCAGCCCAAGGGCCCACCGGCTCAGTGGCTTGACAACCAAGAAAGGGCCAAGCCTGCCTGTGGTTAAAATGGAAGCCAGTCCATTCGAGGAGCCAGCGTCTTGCTGCTTGTGGGGTGCGCTCACCTCGCTCACCTGCCCAGAGCTCCTTGGGCCTGACTCTTGTGGCCTTGACCTCATTTCACTCACCTCAGCCTCCCAGGTCTAGCACAGTGTAGGGTTCTTGGCCAGCGTTGACAAGAAAACATTACACAAATGAATGAAAAGCAATTGGTTTTAGTTCCACCTCCACTATTAACTTAAGCAAATGACCTGCTCAGTCCCTCAATCTCCTCAACTGCAAAAAGAAAGGCAAGAAGCCTGGGCAACGTGAGGGTGGGAAGAGCCTCCACCATCTCCACAGCACCCAAGCTCCCCAGCCAGGCCACCCACCCCTTTGAAAGAGAACACACTTACTCTCCACGTCGCGGACACAGACGCCATAGAGGTACACGATGTGTTTGTGGGAGACCTGTCTCATCATGCTGGCTGCCTCGAAGAAGGCCTGTGGGCGAGCAGGACATAGGAATGTCTCAGGCCAGCCTCCAGGGGGCTGCTCCCCAGGGGCTCTGTTGAGGGGAAAGCCAGTGGACCCAGGAAAGCTCACCACTGTCGCCACCCCAGGCCCTGAACATCAATCCTCTGGCCTTGGCTGTCCAGAGGCACTGCCAAGCCTTGTTCTCTGGGCCAACCTGGCAGGGATGTGAGGTTTATTTAGAAAACCTAACAGGATGCAGAGCAGGGCTGGTGGGAGAAGCTGGCTAAGAATTTTCCCACTGGATACTCATGCCCACCTCTCTCTCTTCCTTTCAGCTCTGGGAAATACCCATATTTAGCACTATGCTGGAACAAAGGGGAAATGAAGGCAGCCGATCTCTGCTCAAGATTTGACTGTGTCACTCTAATAGTCTGTAGAATCCTGGGTGAGTCCTTTTACTCCTCTGGGCTTTCGTTTTCCAGACTGTGTGGTGAGAGCCATGGACTGTATCAGGAACTTTGAACCATTTGGCCAGAGTCCTAGGGCTCCACAGCACAGCCACCTGGACCTGTCCTTAGGAAAGGTGGGGGTTGGGGGTGGAAGGGAGGGCACAGGCTGAGTGTGAGGAGCTGTTCAACCCACCTCACTTACTCTACATGCAGGGTCCACTAAGATCATATGTGGAGAAAAAAATTCTGAGTAAAAGGCAAGTTTGAAAACCACTGGGCCACAAGAAGGGCAAGGGTTCTTCTCAACCCATTGTGTTCCACTGGCTCCAGAAACGGGAGAGGGGAGGGGAGGAGTTCAGAGGAAGACACTTGCCAGGGAAATATCCCTGTGGCTGGGGTCTAAGACTTTGAGGATCACTTTTATCTTCTTCTCTTCAGAAGTTCCTTCGTCATCCTTGTAATCCATCAGGGTCCCAGAATAGATGTGTGTTCTCGTGCCTCTCCCAAGGTGCTCGCCCTGAGGGAAGAAGCAGAAGGCTGGGTGACCTCTCTGTGCCCTGAAGTGATGGACCGTCTGGGAATGGGTCCTCAATGGGAACATGGACTATCAATGGGATGGGGCAAAGGCAAGAGGGCTCCCTGCCCCAGCTCGTGGTCCCCAGGCCTCCAGAGAAAACAACAAGCTATTTGGCCAAACACAGTGGTGACATTTGCTGGGCCCCAGGAGACAGTCCTCCTACTCCCTAAACGGCTCCTTGCTTTCTACCCCTAGGAACAGCCTTTGGCCAAAACACAGTCCTAACATGTCAGGACACTGCAAACAGGGCCATCAACAGCCAGCCACATGGGTCCCACCCCAGGCCTCCAGAGAAGACTCAAGAGAGGAGCCCCCAGGCAGCTCCTCTACTCACAGGCTGTGCTACCCTGTGAAGAGGCTTGCAAATCCCAGCTCTACTACCCGCTGGCCATGTGACATGGGGGCAATCTCTGCCCACTTTCTGCAAATGGAGGTAATAATGGTACTGACCTCATAGGGCTGTGGTAAGAATCAAACCAGGAAACAGGGATGGAGGCTCCTGGTACAGACTCAGGCACACGGGGGGATGCGTAGAAACCCATCTGGTGGATCCATGTGTTATCTGAAGCCCTCTGGCACAGGTAGGCACAGTTTCTCACACTGGAACCATCTGTTTCCCATCCATTTATCCAGTGTGTGTGCTCATGTGTGTGCATGCACGCTAGGATTTAAAATTAGTGGTGCAAAGTACACCTGCATTTGCCCTGGCAACCTCACAGAGGAGATGGCAATGTGAAGATGAAGGTGGAGCCTGGGGTGATGTGTCCTGGATTTCCTGACATGTGAAAGGGAACAATACCCCCAGATGAGTGGCAGGAGGACTGAATGAGATGATCCGTGCAAAGCCCTAGCCATACCATGATCTATTTCTGAGGACCCTTCCAGTTCAAGTTGCAATAATTCTGCTTTTAAAATTCTTAATATTTGGAAATCGAAATGGGATTCACGAAACTTAGGCAATGTCAAGTTGTTGACATTAGCACCACAAAACTTGTAAACTGAAGATCCATTATTCTATTATTTGAGGACCCCCTGGAAATGCAGAAAAGGGACTGTCACTGATACCTAGGGAATCAGTCTTATCCCCCATAGGAACATACACCATTGTTAATCAGGTATATTAATTTGCACAAATGCCACCATTTGTTATCTGTCAGAGCCGAATGGCGATGCATCCACCCTGTCTGCTGTATCCTGGCAAGGTCTTTGGCTATTCATTAAAGCTGCATCTGTCATGAAGTGATCCATCAAGGTTATGGGAAGCTGTATTCCCAGAACATCCCGTAAAAGCCATATGCTTTCAGAATAATTGCTCTTCCCGTGGCCAAGTCATGACACCATGCTGTCAGGATTCTGCAGGGACCCACAAAGGCCCATATGGCCCACTTCATCCTCCTCTGATGCTGTTCCCTCCACCTTGCCTAGCTACTTGAGTTCATCCTCCAGGAGGAGACCCTGATTTTTTTTTTTCCCCAGACAGGGTCTCGCTCTAACACCTGGCGGGAGTGCAGCAGCACAATCATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGCCTTATGCAATCCTTCCAACTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGCTGCTTACCACTACACGCAGCTCATTTTTTCATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATCTCATTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTTGGCCTCTCAAAGCGCTGGGACGACAGGTGTGAGCCACTGTGTGAGCCGCTGTGCCTGGTCTGGGACTCTGCTTTGATACCGCTTCCCCCAGGAAGCTATCTCCGTCCTCTCAAGATTAGGTCCACATCCTGCTGTACTTCCCTACTTTGGAACTTGACTCTTGCTAACGTGATTACCCCCTCAAAATAGACAGGAGCCTGCTGAAGCAGCAATCGTGCCTCGCACGTGTAATGCTTGATCTCTGT
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GAGATCCAGAGGACCCCCTTCCACAAACTCTTCCACCATGATATCTGTAGGCATAAAAATAGCCATGTCTGGAACCTGGTCTGTGGCACGGTCCTCTCCTTCATCCCCTTACGACAGTCCACTTCAGTGGACACTACTCGGCCTCAGAGTACACAGATATCCTTGGGGGGTGCAATGGTGCAGGGGCTTCAGAGCTGGAAAGGCCAAGTTCAACCCCAAGCTCTTCTTCTAAACGGTGGCACTGAGCAAGTGACACTTCTCTGAGCCTCAATTCCCTCATCTGTAATAACAGATGGCGGCTAAATGTCACAAGGCCTGGAAAGCCTTGGCGGAGGGCCTGACACAGAGAACAAGGGCTCTGGGAACAACCGCCACCACTGCTGCTGTTCTACAACACACTGTGATGCAGAGGTCAGGCCGCTCACACGGCAAAACTTCCCTCTCAACAGGACTCCTGTGTGAGTACACGGAACAGCTCACATTGTTGGATTCCACAGGGAAGAAGTCACTTGGGGTTAAAAAAAAAATCGCTCTTCTTCCAAACTTACATGTCAGGAACTCAGAGGCCAAGGCCACCCCTCCATCTCAGTGTGCAGCAGCAGCCCAAGGGCCCACCGGCTCAGTGGCTTGACAACCAAGAAAGGGCCAAGCCTGCCTGTGGTTAAAATGGAAGCCAGTCCATTCGAGGAGCCAGCGTCTTGCTGCTTGTGGGGTGCGCTCACCTCGCTCACCTGCCCAGAGCTCCTTGGGCCTGACTCTTGTGGCCTTGACCTCATTTCACTCACCTCAGCCTCCCAGGTCTAGCACAGTGTAGGGTTCTTGGCCAGCGTTGACAAGAAAACATTACACAAATGAATGAAAAGCAATTGGTTTTAGTTCCACCTCCACTATTAACTTAAGCAAATGACCTGCTCAGTCCCTCAATCTCCTCAACTGCAAAAAGAAAGGCAAGAAGCCTGGGCAACGTGAGGGTGGGAAGAGCCTCCACCATCTCCACAGCACCCAAGCTCCCCAGCCAGGCCACCCACCCCTTTGAAAGAGAACACACTTACTCTCCACGTCGCGGACACAGACGCCATAGAGGTACACGATGTGTTTGTGGGAGACCTGTCTCATCATGCTGGCTGCCTCGAAGAAGGCCTGTGGGCGAGCAGGACATAGGAATGTCTCAGGCCAGCCTCCAGGGGGCTGCTCCCCAGGGGCTCTGTTGAGGGGAAAGCCAGTGGACCCAGGAAAGCTCACCACTGTCGCCACCCCAGGCCCTGAACATCAATCCTCTGGCCTTGGCTGTCCAGAGGCACTGCCAAGCCTTGTTCTCTGGGCCAACCTGGCAGGGATGTGAGGTTTATTTAGAAAACCTAACAGGATGCAGAGCAGGGCTGGTGGGAGAAGCTGGCTAAGAATTTTCCCACTGGATACTCATGCCCACCTCTCTCTCTTCCTTTCAGCTCTGGGAAATACCCATATTTAGCACTATGCTGGAACAAAGGGGAAATGAAGGCAGCCGATCTCTGCTCAAGATTTGACTGTGTCACTCTAATAGTCTGTAGAATCCTGGGTGAGTCCTTTTACTCCTCTGGGCTTTCGTTTTCCAGACTGTGTGGTGAGAGCCATGGACTGTATCAGGAACTTTGAACCATTTGGCCAGAGTCCTAGGGCTCCACAGCACAGCCACCTGGACCTGTCCTTAGGAAAGGTGGGGGTTGGGGGTGGAAGGGAGGGCACAGGCTGAGTGTGAGGAGCTGTTCAACCCACCTCACTTACTCTACATGCAGGGTCCACTAAGATCATATGTGGAGAAAAAAATTCTGAGTAAAAGGCAAGTTTGAAAACCACTGGGCCACAAGAAGGGCAAGGGTTCTTCTCAACCCATTGTGTTCCACTGGCTCCAGAAACGGGAGAGGGGAGGGGAGGAGTTCAGAGGAAGACACTTGCCAGGGAAATATCCCTGTGGCTGGGGTCTAAGACTTTGAGGATCACTTTTATCTTCTTCTCTTCAGAAGTTCCTTCGTCATCCTTGTAATCCATCAGGGTCCCAGAATAGATGTCTGTTCTCGTGCCTCTCCCAAGGTGCTCGCCCTGAGGGAAGAAGCAGAAGGCTGGGTGACCTCTCTGTGCCCTGAAGTGATGGACCGTCTGGGAATGGGTCCTCAATGGGAACATGGACTATCAATGGGATGGGGCAAAGGCAAGAGGGCTCCCTGCCCCAGCTCGTGGTCCCCAGGCCTCCAGAGAAAACAACAAGCTATTTGGCCAAACACAGTGGTGACATTTGCTGGGCCCCAGGAGACAGTCCTCCTACTCCCTAAACGGCTCCTTGCTTTCTACCCCTAGGAACAGCCTTTGGCCAAAACACAGTCCTAACATGTCAGGACACTGCAAACAGGGCCATCAACAGCCAGCCACATGGGTCCCACCCCAGGCCTCCAGAGAAGACTCAAGAGAGGAGCCCCCAGGCAGCTCCTCTACTCACAGGCTGTGCTACCCTGTGAAGAGGCTTGCAAATCCCAGCTCTACTACCCGCTGGCCATGTGACATGGGGGCAATCTCTGCCCACTTTCTGCAAATGGAGGTAATAATGGTACTGACCTCATAGGGCTGTGGTAAGAATCAAACCAGGAAACAGGGATGGAGGCTCCTGGTACAGACTCAGGCACACGGGGGGATGCGTAGAAACCCATCTGGTGGATCCATGTGTTATCTGAAGCCCTCTGGCACAGGTAGGCACAGTTTCTCACACTGGAACCATCTGTTTCCCATCCATTTATCCAGTGTGTGTGCTCATGTGTGTGCATGCACGCTAGGATTTAAAATTAGTGGTGCAAAGTACACCTGCATTTGCCCTGGCAACCTCACAGAGGAGATGGCAATGTGAAGATGAAGGTGGAGCCTGGGGTGATGTGTCCTGGATTTCCTGACATGTGAAAGGGAACAATACCCCCAGATGAGTGGCAGGAGGACTGAATGAGATGATCCGTGCAAAGCCCTAGCCATACCATGATCTATTTCTGAGGACCCTTCCAGTTCAAGTTGCAATAATTCTGCTTTTAAAATTCTTAATATTTGGAAATCGAAATGGGATTCACGAAACTTAGGCAATGTCAAGTTGTTGACATTAGCACCACAAAACTTGTAAACTGAAGATCCATTATTCTATTATTTGAGGACCCCCTGGAAATGCAGAAAAGGGACTGTCACTGATACCTAGGGAATCAGTCTTATCCCCCATAGGAACATACACCATTGTTAATCAGGTATATTAATTTGCACAAATGCCACCATTTGTTATCTGTCAGAGCCGAATGGCGATGCATCCACCCTGTCTGCTGTATCCTGGCAAGGTCTTTGGCTATTCATTAAAGCTGCATCTGTCATGAAGTGATCCATCAAGGTTATGGGAAGCTGTATTCCCAGAACATCCCGTAAAAGCCATATGCTTTCAGAATAATTGCTCTTCCCGTGGCCAAGTCATGACACCATGCTGTCAGGATTCTGCAGGGACCCACAAAGGCCCATATGGCCCACTTCATCCTCCTCTGATGCTGTTCCCTCCACCTTGCCTAGCTACTTGAGTTCATCCTCCAGGAGGAGACCCTGATTTTTTTTTTTCCCCAGACAGGGTCTCGCTCTAACACCTGGCGGGAGTGCAGCAGCACAATCATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGCCTTATGCAATCCTTCCAACTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGCTGCTTACCACTACACGCAGCTCATTTTTTCATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATCTCATTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTTGGCCTCTCAAAGCGCTGGGACGACAGGTGTGAGCCACTGTGTGAGCCGCTGTGCCTGGTCTGGGACTCTGCTTTGATACCGCTTCCCCCAGGAAGCTATCTCCGTCCTCTCAAGATTAGGTCCACATCCTGCTGTACTTCCCTACTTTGGAACTTGACTCTTGCTAACGTGATTACCCCCTCAAAATAGACAGGAGCCTGCTGAAGCAGCAATCGTGCCTCGCACGTGTAATGCTTGATCTCTGT
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Task1_train_972
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This mutation occurs in DNAJC6 (DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6) on Chromosome 1. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Parkinson disease 19B, early-onset
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Task1_train_973
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This sequence variant lies in LEPR (leptin receptor) on Chromosome 1. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; Obesity due to leptin receptor gene deficiency
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AATAATTATTGAGCACTACATGGTTTAATCTCAGATACTTTCTATTCATGTCTTAGTCAAAATGATTACTTTTTTCTATGTGTCTTTTTAATATCCTAACAGAATTTATTTATGTGATAACTGCGTTTAACTTGTCATATCCAATTACTCCTTGGAGATTTAAGTTGTCTTGCATGCCACCAAATTCAACCTATGACTACTTCCTTTTGCCTGCTGGACTCTCAAAGAATACTTCAAATTCGAATGGACATTATGAGACAGCTGTTGAACCTAAGTTTAATTCAAGTGGTACTCACTTTTCTAACTTATCCAAAACAACTTTCCACTGTTGCTTTCGGAGTGAGCAAGATAGAAACTGCTCCTTATGTGCAGACAACATTGAAGGAAAGACATTTGTTTCAACAGTAAATTCTTTAGTTTTTCAACAAATAGGTAAGCATTAGCTATGTTTTAAATGTATTGAACAATGTTTTTTAATTCTTTGATACCTGTATGAAATAGATGTCTTATGGCTATGATTTTAACATACATAATCATTTTTATATGGATAATAAAATTAGGATTCATTATGTGAACAAACTAATAAATAATTTCCAAATTATCTTGTATCCCATAAAAATATAATGAGGGAATTATTTTACTTTTAAGTACATTCCTTGTAGTCTTCTAAATTTGCTTTGAAATAGAAAAACACACCTTATTTTTGTTAAATGTATAAAATATCAAATGACTGATAATATTGTTGAATTGGTTAAATTTTAAAATATTCATGAATAATAATAATTCTTCAGGCAAGGAATATCTCTGAAAGAATATACGTTTTAAAGATGGGTTTTTCAGAAAGAATAGCTAATGGATGCTGGGCTTAACACCTAGGTGATGTGATGATCTGTGTAACAAACTGCTATGGTACATGTTTACCTATTTAACTAACCTGCACATCCTGCACATGTACCCCTGAACTAAAAATAAAAGTTGGAAAAACAAAAAAAGAAAAGAAAAAAATTCTTTTTTTTTGTTTAAGTATAATGCATACTGATTGTAGCTAGTGTAGTTAAAAATTCTGCATCTGGAAATATAAACAACAAAATTATCCCAAGTCTTTTGGAAAAGCTAGGAAGAGTGGAGTCAATTGACTCATCCATGTAGAGAGACCTCCAGTATGAAAATACAGGCATATCTTTTCCTCCCTTAAAAGCGTGATGATTGGGTTTTCACATGTATGAGTGAGATGTGCCTCCCTCAGACCTTGTTATGATGTTGGCACATTACCTGTCTAATGTTAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTGGGCACAGTGGCTTAACTGCCTGCAATCCTAGCATTTAGGAGGCCTAGGCGGGCGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTAGAGACCAGCCTGGGCAACATAATGAAACCCCATCTCTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAACTGGGCATGGTGGTGCATGCCTCTAGTCCCATCTACTTAGGAGACTGAGGTGGGAAGATTGCTTGAGAGATGGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCACATGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACCCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAAGAAAAGTGAGAACTGAGCTAGGTGAGTTTTGAGCTCTTTTGTCCTATTTAAGTGGTTTGAAATTAAAGAAAATTTGAGAAGCAATAATTGAATTTAATTCTATTACTTTAGAAAAAAGGAAACTGAGGGCCAGAGGGACTAAGTGATGGGCAAACGCATGCCACTAGTTAAAGCTTGTTCTTTTTCTCTCAGAATAGGCAATGGAAGTTGTATCAGAACACTGGTAAATTTGATTTAGCTCTTCTCTTTCACTGAGTTGTTCAGATGGTTTTTGAGATTTCATGTAGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTCAGATGCAAACTGGAACATACAGTGCTGGCTAAAAGGAGACTTAAAATTATTCATCTGTTATGTGGAGTCATTATTTAAGAATCTATTCAGGAATTATAACTATAAGGTCCATCTTTTATATGTTCTGTAAGTACCAAATAATTAATTTGGCATTTCTAATACACAGTTTTTTTAAAAGAGCTTTCATATACGGAAGTAGATTATAAACCTCTTGCATCCCTACATTTCCTATTATATGTTTTATTTTTTAATATAGCATTCTGCTCTGTTAGGTTTCCTCTTTTCTCCTCCTGCTAATTGAGGTAGCAAGACAGTCAGGTTTAGGGTCACGATTGTCAGGTCCATGAGTATACCAAATGTTCAGTTCAAGTTCAGGTTCTAGCTCACACTGAGGTCCGAAGGGAGTGGGTGGATGGGCAATAGCTGAACGAACACTCTGGGGGCCTTAAACAGGTGAAACGTAGTTTTATTCAGCAGCTCTCTATCAGCAGCTTACTCAAACTAGGTCTCTCATTAGCAGCTCTCTTAGCAGCAGCTTTCTCTCACTGTCTGCTCTGTTTTGACTGCTTGGGCCAGCTGCTCCTATGCACAGCTGCACGGCTGGCTCTCTCTTGCCTTCAGGGTCAGCAGCTTAACTCTTTCTCTCTCTGGGCATGAACATGAACCATGCTGTGCCATGTTGTGCCATGCTGAGCCATGCCCTGGCTCCCCTCGTCAGAGCAAGACTGACAGCTCTGGTACTCTCTCTCTGGGTACAAGAGCGCCTGTACAAGAACATCTGTAGAGTGTCAGCAGGGCAATTATACCTTTTACAGACAACAGTGGCATATGGCCAAGGGATGGCCTTCCCATGTTATGGCTACATGGCTGTGATAACAGATGGAGTTATATGCCTGCGCACTACTCGCTGAGTCATGCAGGCCTGGACATCTGCCTTGGCCTGATTCTTGACCGAAGCACATCCATGTACCTTACAAAGATATTGCAGGTATAGGTGGGCATGTAGTCTGAAAGAAGAGTGAACTCAGTTCAGGAGTGCTAGATATTTGAGTGGAAAAGGAAAAAAGGTGCGTTTTATATTTCTTTTTCAGATGATTTTTCGTATTCGATCTCTTTATAAACTTAAAAATATGGGTGGCTAATATTTGTGCTAGAAAGAGAACAAAGATATTGTTTTCAAATAGCCATATACTTATAACTCAAACAGCGAATATGTCATTAAGTTTTCTAATTACTCTAGTGATGATATACACCATTTTTATGTCAATTTTAACTCTTTAAAATTCTTTCTCATTAATTCTTCTATTTGATGCTTAAAGTCTCGCTTCCTTCAGTTCTGCAGTTATTGAGATAATACCGTTGAGGAGCAATGTGCTAGAAACTGTCCCTATACAAATGAATAGAGACAGAAAGTAAAGCGGGGCTGAGAGGAGGGGGAATTGGGGAGTTACTGTTTAATGGATATAAAGTTTCAATTTGGGAAAATGAAAAATGTTCTGGAGTTGGGGAGTGGTGATGGTTGCATAATAACGTGAATGTATTTCATGTCATTGCACTGTACACTTAAAATGGTTGAAATGTTAAATTTTATATACATTTTATTACAGTAAAAATTTAAAAAGAAACTTAAAGACATGTAAAAAAGGATGAATGGTTACGATCACTGTCCTTTAGGTGCTCAAAGGCTAGCAGTTGGGACCTGTATGTACAGAGTTTCAGTTTAAGTGGTTACCGATATGTATTTGGTAGGTACATAATGTCATGGGAGCCCATCATTGTTGTGAGATCTTAGATGGGGGTTATCTAGTTAAGCTGGTGAGAGAAGAGAGGAGGAAAGGTTTCCTAAGGAAGTAGATAGCTGAGTTGAGTCATTAGAGATAAATAAGAGCTAATGAGAAAATATGTGGGCAGTATAGTGTTGGGAAGAGATCAGTATCACCTGGAACCTTGTTAGAAATTTAAATTTGCATGCTAAATGACGAGTTAATGGTTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAAAAAATTTAAATTTGCTAGCTCACCCCTGTGAATAAAAAATTAGGGGGGGTGGAGCTCAT
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Task1_train_974
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Gene SLC35D1 (solute carrier family 35 member D1) on Chromosome 1 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
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Pathogenic; Schneckenbecken dysplasia
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ACATCAAAATGAGGGGTAAAAAAACAAAAACAAAAAACTCCTCTTTCTCTTCAAAGAAAAGAGCATAAACTATAAACTAAAACCTTTGGCACCACTTTCATTATTTAGTAGTAATAGAAGCTTTCTGGTCCTTTCATTTTTTTCCAGAATCAATAACAATGTGTTAAATATTTGACATTCAAGTACAATTTTAAGAATACATTATATTAACCTCACTAGTAAAATAAAGTTATCCATACTTCAGTTTCTTTGTGCTGAACAGTCCCGTGATTTGGTTCCCAAAATATAGTAGAGGTAGTGGAAACGTCTAGAAAATTTAAAAAGGGATAACAAAACTCAATAATAAAGATAGCTAAAACAAGGTCCTTTCAAACAGAAACAATTTTGTTTATATGATCAAAATTTTTTCCACTTAAAACGTAAAATTAGTTATCATACACAATTTTGACACCCAAACACCCAAACAAAACTTATGCTTGGATAAACAACATTACTATAGCAGAAAGAAAGGGAGGAAGGCAGGGAGAAAAGACAGAAATATGAATATGATCAATGTGAGACAGAAACATCATTTGCTGTAAAATATGATAATGTATTAGAGCCCATGGCTCTATTGTCAGCAGAAAAAGTAAAGGCATTTCATCTTCGTTTGGAGTCAAGCAGAGGCAGACAGTATAAAATAAGCCCAAAGAATAATGAATGCAGGATACACTGGCTAGATTAGATGGATAGAGAAACTGCAAAACTATTGTACTCTCAACAAGTGTGCATTAATTAAAAACAGAAGAATATTCCTAGGTTATTTTTTCTCTTAAGTTTAAAGAGACTGTAGGCCTTCTTTGACACATATTACTACTTTTATTCTTTACATTCATTATAACCACTCTAGACTGGGCAATTTTGAGGCTGCAATTTTTAAATACGCAAGGCACTGATAAAATATGTTAATACATACTGACTTCATTTCACAAAATAAAGTATCGCTTTTCTTCTTTTACCTTTCGAGGTACATTTCTGTCAAGGTCAGGAAACTTGACTACTCTGAGCGCCTTTCCCACCCAGAGAACTGCCACTGTGGCCACCATCTGTAAACAAGAGAACACAGATTCACTGTTCTACACATAAAGACACACACAGAAGTTCTAACAACATAAACCACGTAATGGTGAGGATTCCAACTAACCTGGCCAAGTCCAACACATAGTGAGGAGGGAAATCTACAAAAAGGGCAAAGAAAAAAACAAGATCAGAACAAACCTAACTTAGCTCCGTGAATTCAATTTGCACATCGGCAACGTTAATAAGGCATTCCGATACAAGCCACATCAACGTCCGCCCCTAAATCAAACAAAAATCTTGGGAGAAAACTCTCTGCCTGTTGGTTGTCAGTCCACCCCGCTGATGTAGCCTCGGGCGGCCGCTTGTCCCATCTTGTCCGAGTCTACAGTTTCAGTCCGCTGCCTGCAAAGGATTTCTCAAGGCAGTGCAGATACAGATCTCTGCAACGATTTCACACACCTTAAAAAAAAAAACAACCAACTTCTGCCTCTGGGTCCCAGTGTTAGCAAGGGAATAATTGTCTGCTGGGTTGAGGATGCGTACGTCCCCAGAGGCTGTCAGCGGGTGCAGGGGACACTGAAGCCCCGGCCCCCTGTCCAGGCTGCGGAGGAGGGAGGCTTCCCTCGCTCTCCTCCCTGATCGACAGGCATAACGGCTCAAAAGTCACCAAGCAAATCACTTTGCTCCATCTCTCTGAAGGGCAGGGTTTTCGGGGCGGTGCGCCCAGGGCATGGCAGGCGAGCCCCAAATGTGCCGGGCCGGCCGGAGCTCCGCGCAGGGAGCGGACCCCTGCCACAGGCCCGCTCGCCAGGCCGGCTCCGCTGCCCGGGCCGCGCGCGTCAGCCGCCCGCCCTCCCCAGCTCCCGCCCAACTTTGTTCGGCTTTAACTTTGGCAGTCAAAGTCCAGGGAGCCGGCGCCGCGCCGCCGCCGCCGCCCGCTCCTCCTCCGCGGCCTGGGCCGCCGCCGCCTCGGCCCTACCTGTAATTGGTGAGCACGCTCTTATTCACCACCACGATCAGGAAGGAGCTCACGCCGTAAAAGCCGGCGGCCAGCAGCTTCAGAAACACGGTCAGCGTTTCGGCCGACGCCATCCCCAGCTCCTCCTCATCTCGGAGTGTGGAGGATTTCGCGGGGGCTTCTCCTTTAACCCGAGCATGCTGACGTCTATGAACTTCCGCCATGGCTGCCGCAGCAGCGGTGGCCTGGCGGCGGGGCCTAGCGGCTCGGGGGCCTGCAGCGGCAGCTCCCAGGGGACTCCAGGAGTTGGGGACCGCAGACTAGGCCAGCTGCGCGCTCGCCGCCTCGACTCCCCGCTTGGCCGCCGCCTGTCCCCGCCCAGGGGCAGGGACGCCGGGGTTCACACCCCTGGAGACTTTGCTCGGGCATTGTGCAACGCGGGGTCAGAGAGTAGGGCCGCGCCGGGCTTAGCCTGGGCAGGGGTTGGAGAGAGCCTGGAGAAGGGGCAGTGGCGACCCCCCTGCCCGAGGCGGATAAGGAGAAGCCAGGGGAACTACATCGAGACACCAGAGCGCCGGGCGACAAACCACAGACTCCGGGTGACAGTCGCCCTGCGCCTGCGCACGAGCACGCGCTGGGTCTCTCCGCGGGGCGCGTACCTGGGGCGTGGGGAGTCTGGTGGCAGAGGGGCTGGAAGGCCGTATTCTCCGGATAACTGCCGCAACTAAGTGCAGACCCTCCTCCCCTCTGTTACAGGTGGCCGGCCAAGTAGTTACAGTACACTGCGTCTAGACTAATTCTGAATGCTCTTTTAGTCTCTCTTGCAGGGGGTAAAAACCCTTCAAAAGTATCAGATGTGGATCAACAGTAAACACTCAACGAAAATTTCATTCCGCAATGCCTCAGGCTTCTTACATTTTCTGAACCCAGAAAACACCAAACAATACTTTTCAGATTGAGAAGTTTCGTTTGTTTGTTTTAAGAAAAATGTTGACATATCCCAAAAAGTAGCAAGATAAGCAGCTTGGGGATTGGGGAAAGCACAAGGTGTTTGGAGCCTAAAAGACTTGATTTCCAATTGTAGGATTCCTAGAAATGACGACCCCCCCCCCCCCCACCAACACACTCACTCCTTATTGTGTGTCTTGGACCAATTAGATGACCTCCCTGAACCTGATCTCTGTGGATGTGTAGCTAGCAAAGAGCTAGTTTTCGGTAAATGGTAGTCATTATTGTATAACAGAAGCAAATCATTATGATCGGTTTAAGCAAAGAAATTACGTATTGAACTTTAATAGATTAGGAAAGAAGAACTTTGAATTATTTTTCTAAGTGCTTGGTCTGTATCTTTTTAAATTTCTTTTTTTTTTTTTTCTTATTTTTATATTTTGGTAAACCAGGTATAGTGGTTCACACCTGTAATACCAGCACTTTGGGAGCAGGTGGAATGCCTGAGCCCGGGAGTTTGAGACCATGCTGGGCAACAAAGTGAGACCCTCTCTCTACAAGAAAATAAAAAAATTAGCCAGATGTGGTGGCGCACGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGCTGCAATGAGCTATGATCATACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGCACAAGACCATCTTAAAGAAAGAAATAAATTGTGGCAAAATATACAAAGTATAAAATTTATCATTTTAACCCTTTTTGAGTATGCAATTGCATGGCATTAACTGCATTCACATCGTTTTGCAGCCATCATCACTAATCCATCTTTAGAACTTTTTCACCATCCCAAAGTGAAACTCTTTCCCCTTTAAACAATCACTCCCTGTTTCCCTACTTCCTTCCCTCTCTGCTGTTAACCAGTGTTCTACTTTCTGTCTCTGTGAATTTGACTACTCTAGGTACCTCATATAAGTGGAATCATGTAGTATTTGTCCTTTCGTGATGAACTTACTTCATTAACGTAATGTCTTCAAGGTTCAGCCACGTTGTAGCATATGTTAGAATGTCCTCCCTTTTTAAGGCTGAATAATATTAAATTATATGTGTAT
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ACATCAAAATGAGGGGTAAAAAAACAAAAACAAAAAACTCCTCTTTCTCTTCAAAGAAAAGAGCATAAACTATAAACTAAAACCTTTGGCACCACTTTCATTATTTAGTAGTAATAGAAGCTTTCTGGTCCTTTCATTTTTTTCCAGAATCAATAACAATGTGTTAAATATTTGACATTCAAGTACAATTTTAAGAATACATTATATTAACCTCACTAGTAAAATAAAGTTATCCATACTTCAGTTTCTTTGTGCTGAACAGTCCCGTGATTTGGTTCCCAAAATATAGTAGAGGTAGTGGAAACGTCTAGAAAATTTAAAAAGGGATAACAAAACTCAATAATAAAGATAGCTAAAACAAGGTCCTTTCAAACAGAAACAATTTTGTTTATATGATCAAAATTTTTTCCACTTAAAACGTAAAATTAGTTATCATACACAATTTTGACACCCAAACACCCAAACAAAACTTATGCTTGGATAAACAACATTACTATAGCAGAAAGAAAGGGAGGAAGGCAGGGAGAAAAGACAGAAATATGAATATGATCAATGTGAGACAGAAACATCATTTGCTGTAAAATATGATAATGTATTAGAGCCCATGGCTCTATTGTCAGCAGAAAAAGTAAAGGCATTTCATCTTCGTTTGGAGTCAAGCAGAGGCAGACAGTATAAAATAAGCCCAAAGAATAATGAATGCAGGATACACTGGCTAGATTAGATGGATAGAGAAACTGCAAAACTATTGTACTCTCAACAAGTGTGCATTAATTAAAAACAGAAGAATATTCCTAGGTTATTTTTTCTCTTAAGTTTAAAGAGACTGTAGGCCTTCTTTGACACATATTACTACTTTTATTCTTTACATTCATTATAACCACTCTAGACTGGGCAATTTTGAGGCTGCAATTTTTAAATACGCAAGGCACTGATAAAATATGTTAATACATACTGACTTCATTTCACAAAATAAAGTATCGCTTTTCTTCTTTTACCTTTCGAGGTACATTTCTGTCAAGGTCAGGAAACTTGACTACTCTGAGCGCCTTTCCCACCCAGAGAACTGCCACTGTGGCCACCATCTGTAAACAAGAGAACACAGATTCACTGTTCTACACATAAAGACACACACAGAAGTTCTAACAACATAAACCACGTAATGGTGAGGATTCCAACTAACCTGGCCAAGTCCAACACATAGTGAGGAGGGAAATCTACAAAAAGGGCAAAGAAAAAAACAAGATCAGAACAAACCTAACTTAGCTCCGTGAATTCAATTTGCACATCGGCAACGTTAATAAGGCATTCCGATACAAGCCACATCAACGTCCGCCCCTAAATCAAACAAAAATCTTGGGAGAAAACTCTCTGCCTGTTGGTTGTCAGTCCACCCCGCTGATGTAGCCTCGGGCGGCCGCTTGTCCCATCTTGTCCGAGTCTACAGTTTCAGTCCGCTGCCTGCAAAGGATTTCTCAAGGCAGTGCAGATACAGATCTCTGCAACGATTTCACACACCTTAAAAAAAAAAACAACCAACTTCTGCCTCTGGGTCCCAGTGTTAGCAAGGGAATAATTGTCTGCTGGGTTGAGGATGCGTACGTCCCCAGAGGCTGTCAGCGGGTGCAGGGGACACTGAAGCCCCGGCCCCCTGTCCAGGCTGCGGAGGAGGGAGGCTTCCCTCGCTCTCCTCCCTGATCGACAGGCATAACGGCTCAAAAGTCACCAAGCAAATCACTTTGCTCCATCTCTCTGAAGGGCAGGGTTTTCGGGGCGGTGCGCCCAGGGCATGGCAGGCGAGCCCCAAATGTGCCGGGCCGGCCGGAGCTCCGCGCAGGGAGCGGACCCCTGCCACAGGCCCGCTCGCCAGGCCGGCTCCGCTGCCCGGGCCGCGCGCGTCAGCCGCCCGCCCTCCCCAGCTCCCGCCCAACTTTGTTCGGCTTTAACTTTGGCAGTCAAAGTCCAGGGAGCCGGCGCCGCGCCGCCGCCGCCGCCCGCTCCTCCTCCGCGGCCTGGGCCGCCGCCGCCTCGGCCCTACCTGTAATTGGGGAGCACGCTCTTATTCACCACCACGATCAGGAAGGAGCTCACGCCGTAAAAGCCGGCGGCCAGCAGCTTCAGAAACACGGTCAGCGTTTCGGCCGACGCCATCCCCAGCTCCTCCTCATCTCGGAGTGTGGAGGATTTCGCGGGGGCTTCTCCTTTAACCCGAGCATGCTGACGTCTATGAACTTCCGCCATGGCTGCCGCAGCAGCGGTGGCCTGGCGGCGGGGCCTAGCGGCTCGGGGGCCTGCAGCGGCAGCTCCCAGGGGACTCCAGGAGTTGGGGACCGCAGACTAGGCCAGCTGCGCGCTCGCCGCCTCGACTCCCCGCTTGGCCGCCGCCTGTCCCCGCCCAGGGGCAGGGACGCCGGGGTTCACACCCCTGGAGACTTTGCTCGGGCATTGTGCAACGCGGGGTCAGAGAGTAGGGCCGCGCCGGGCTTAGCCTGGGCAGGGGTTGGAGAGAGCCTGGAGAAGGGGCAGTGGCGACCCCCCTGCCCGAGGCGGATAAGGAGAAGCCAGGGGAACTACATCGAGACACCAGAGCGCCGGGCGACAAACCACAGACTCCGGGTGACAGTCGCCCTGCGCCTGCGCACGAGCACGCGCTGGGTCTCTCCGCGGGGCGCGTACCTGGGGCGTGGGGAGTCTGGTGGCAGAGGGGCTGGAAGGCCGTATTCTCCGGATAACTGCCGCAACTAAGTGCAGACCCTCCTCCCCTCTGTTACAGGTGGCCGGCCAAGTAGTTACAGTACACTGCGTCTAGACTAATTCTGAATGCTCTTTTAGTCTCTCTTGCAGGGGGTAAAAACCCTTCAAAAGTATCAGATGTGGATCAACAGTAAACACTCAACGAAAATTTCATTCCGCAATGCCTCAGGCTTCTTACATTTTCTGAACCCAGAAAACACCAAACAATACTTTTCAGATTGAGAAGTTTCGTTTGTTTGTTTTAAGAAAAATGTTGACATATCCCAAAAAGTAGCAAGATAAGCAGCTTGGGGATTGGGGAAAGCACAAGGTGTTTGGAGCCTAAAAGACTTGATTTCCAATTGTAGGATTCCTAGAAATGACGACCCCCCCCCCCCCCACCAACACACTCACTCCTTATTGTGTGTCTTGGACCAATTAGATGACCTCCCTGAACCTGATCTCTGTGGATGTGTAGCTAGCAAAGAGCTAGTTTTCGGTAAATGGTAGTCATTATTGTATAACAGAAGCAAATCATTATGATCGGTTTAAGCAAAGAAATTACGTATTGAACTTTAATAGATTAGGAAAGAAGAACTTTGAATTATTTTTCTAAGTGCTTGGTCTGTATCTTTTTAAATTTCTTTTTTTTTTTTTTCTTATTTTTATATTTTGGTAAACCAGGTATAGTGGTTCACACCTGTAATACCAGCACTTTGGGAGCAGGTGGAATGCCTGAGCCCGGGAGTTTGAGACCATGCTGGGCAACAAAGTGAGACCCTCTCTCTACAAGAAAATAAAAAAATTAGCCAGATGTGGTGGCGCACGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGCTGCAATGAGCTATGATCATACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGCACAAGACCATCTTAAAGAAAGAAATAAATTGTGGCAAAATATACAAAGTATAAAATTTATCATTTTAACCCTTTTTGAGTATGCAATTGCATGGCATTAACTGCATTCACATCGTTTTGCAGCCATCATCACTAATCCATCTTTAGAACTTTTTCACCATCCCAAAGTGAAACTCTTTCCCCTTTAAACAATCACTCCCTGTTTCCCTACTTCCTTCCCTCTCTGCTGTTAACCAGTGTTCTACTTTCTGTCTCTGTGAATTTGACTACTCTAGGTACCTCATATAAGTGGAATCATGTAGTATTTGTCCTTTCGTGATGAACTTACTTCATTAACGTAATGTCTTCAAGGTTCAGCCACGTTGTAGCATATGTTAGAATGTCCTCCCTTTTTAAGGCTGAATAATATTAAATTATATGTGTAT
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Task1_train_975
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The following genetic variant occurs in GNG12-AS1, WLS (GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1| Wnt ligand secretion mediator) on Chromosome 1. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
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Pathogenic; WLS syndrome
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TGGAAGCCCACTGCTTGACAGGCTGAATGCTCCCATTTTCCACATGTACAGTAAAAACACCGAGTGGTGTTTTTACTAGAAATGGAAAGGAAGAAGGCTGCCTAGCTCACAAGCCTTCTAGCAAAACAGTCAGTCAAACCAAAGTTGGGCAGGGGGTAGGTAAGTAAATATTCTGTATTCTCACCTCAGACCAGAGATGGGCTTGAAACTGATTGTAACATGTCTACTCCAAAGAGGTCAAGGGGTGAGGGAAACTCATGTCCAGCATGCTCTCGCATGGACATGGCAAATACAGGATGAAGACAGACAGTGGCTGAGACCACTCCACGTCCCTTGACCCCCAGCACAGATGCCTTCCTCTCCTGCTCCACTTCATCTCATCTCTCAAGTAACTACCCCCCTCCCTTCTCCCCACAAGATCACTGAAGGCTAATCTAGAACTCTTACTTCTAAGCATTAATTCACTCAATATTTTAAAAGTATCCTAAAGAACTGGTCCTTGCCCTGAAGGAGTCGATGATCCAGCAGGAGCATAAAGGCACAGATGACTCATCTTCCACCTCTACACAATAAATGTCATGTGGAAAGTAGACTCATGATCCCCTAGGCATATTCCTTAGGACAACAGTTTCAAGAGATACACTGCCTAAAGAAAGGGTGCCAGGGCCAAATGATCTAATAATTCTGGAAAATGCTGTTACCACCCCCCGCTTTGTAAAGACTGACAGTACAAATTAATGTACTAAAGGCATTAACATGTATTGCAGTGAAAAGCCTTATTAGTGCTGATCAACTCAATCATTCTCAAGCATGTTTGACTACCTAAATTTATCAACATTTCATGGAGACAATATTCCATTGAATGTCATTTGCTGGATTCTAATTGGGGTGATTGGGAATAGGTGTTAAAGAAGATGCTGCATTTTGACTGGGCCCAAAAGATGAGTAGAGTTTCATTAGTCCCAGATGGAGGCAGAATGTGCAATCCACTCATGCAACACACACTCACTGAGTACTTCCTAAAGGTGAGGCCAACCCTTGGCTCTGGGGGGCTGCTACCCTGGTTTCCACTGCAAGGCAGAGTGAAAGGCACTAGAGCACTGATTTGAGAAAGGGCTTCCTATGTTTGGGGAATAGCAAATGCATGGCTAGAGTAAAGCAGGTGTAAAAAGAGACAGAATGAGGAATAAGGCTGAACCAAACAGAAAAAGCATCTATTAGATCAGTTGTTTATCAGGCCACCTGTTACCTGTTAACAGCACTGGCCTAGACAGTGTTAATCATTTCTGTCTGCTGTGGCTAGTGAAGAAACCCTGAGCAAGATCTTCCCTTCTCTAGGCCTCAGTTTCTTTATCTATAAAATGACTGGATTCTCTAAGGCTACTTGCAGCATCCATGTCTCAGTGTTCTGTGATTATAAGATATAAAAAGGCAGCAGCACATACCAGCACTAAAGGACAGGAAGAACTGGGGACAGGAGAATAGCTATTGGTTTAGACATACATCGAAAAATCACCTTGAAGAAAAATGAGCAGAAGAAAAATGAAGCCTATTCCATCTTCAGCTCTCAGGGCCCAGACTCCCTCCACCTGATATCTTAGGATTCTGCTTCTCAAATGGGAAGAATAAACATGGCATAGTTTCCAACAGTCAATTGTGCTCAAAAATGTAAAGAAGAAAATTTGACTCTTGTTCTAAAATCAAGACATATTTTAGACTTAGCATGCAATATTCTCAATGTATTTTAGAGATTTAAAAATGAGGACTTAAAGAAAGATCTGGCTTGTGTGGGCTTTTTGTCTTATGGGTGAGTCCCCTGGGTGCTCATTCACCGTCTCCCAGTGTGAGGAGTATACTTGGAGGGAAAGTTTCACTGGGCATCTCAGAGCTTTAGCCATTTAAATCTTGTAAAGACAGAAGCCTATTTATCCTGACTTAAGCTGTTCTAAAGAGACAGAAACTCACCATTGGACTGGTCTTCTCCATAGTTTTTATGGGATGGTGCATACAAGAACATCAGAGCAAAGACATACAGATTCCACATCCCATAGATGCCTGTGAAAAAGGCACTGTTCACTTGGACTGTGACGCCGCCCCATTTCCAATGGCCTTCCGTTACCTGCGGAGAAAGGATGGTGATATTCAATTGAAACAGAGAAGAAACAGAAGAAACATAACACCAATAAAGGAACCAACCAACATGAAAACCAAGTCTCTTCTACATGTGGGAAACATGAAGGGCCATGTAAGACTCCATCTTTTAATCTGAATCATTTCGGTGTAAATTAAGGTCAACTGAAGGTTCTCTAGCTTTCTGTCAGGCACAGTCAGTGGTCCTTACCTTGCCCACAGATTAGTATCACCTGGGGAGTGTCTCTTCCTAAAAACAGCAATTCATTGCTATCCCTAAGTTAAACAAACTGTGTTTGAGCCCATCACTTATTCACAATTATAATTCCTCCTCTGCTGTCTGTCTTCCCAGCTAGATGTCAATTCCCTGCAGGCAGAGACCAGTTCTCTGCTGCCATGTCTTTAAGGCCTGATGCACCATAGATTAATTCAAATCCAGTGTCTACCACTCACTCGGCTTAATGTAAGACAAGATGAAGACTCCAGACTTCAGAACTTCAGTGTCCGTAAGTGTAACATAAAAGCTTGCAGGTTATCGAAGAGAATTAAGTAAAAATATTTCTAGAACCTGCCTGGCAGGTACTCAGTAAATATTAGTTATTTCTATAACATCCCTTGAAGTAAGCCACTCATGAAAATAATTATGAAGCTTTCATATGCTTCAAAATTCTGCAAGAGATGTTTTGAAGCTGCTTTTGTCTGTGTTAATGATTTGGTAATTGTCTTAAGGGCTGCCTAAAGATATATGGATTACACTAAGAACTGTCAACAGAGCTGCTGAGCTAAGTGACTAATTTGTGCCAGCTCTGAGACAAATGAAATGATTTTGACCACTTCTGCTTACTACGGGACACTTAAAATGGAAATAGAAGAAAGTATTGGGTAAATATTCCTTTGACAGCTGAATGAGGCTGCGTTGTATAAACTTTCTCTAGGAATCACTTTTAAATTGTAAGATGGCAGGCTAGATTGAAATGTTAAGAACTTTAACAAGCAGGTGGATTTCATTGCCTGTTTATGATACAGTGGGTCTGTGTTCATTATCTTCTGTATAATCCATAACCCACTTGGGGCCCTAGGCCAAATTAAGGTCTAAGTATAGGTATTTTTTTCTGAAAGACCAGGAGTGTCAGTTAACCACATTAGCCAATTATAGACTTAGCAGTTTTAGTTTGGCCTTGGTGATACATAATTCTTCACTTTTTGTGACTCATAAACAAACCACTATTATGAACTCTTATTTATTTTGGAAAATAATGCATTTTATATAAAATGCCCAGAAGTGTTTTCTGGCAAAGATGGATTTCATAACCATTACTAATTTTAGGACAATGTACCAGCATTCAAGCTACTTAGGACTTCTTAGAAATGTCTCCAAATGTCGCTCTTCTTTAAGTGCAGAATATACTAACTTTATAAAAACTATATTACTTAGAGCATCTTATGATGATTTTTATTGCATATAATGGAAAGGAAAAGAAAGCATTAAGATAGTTTCCAGAAATACAGGTACCTGCTGTCATAACACAGAGAACTCTTCTGTATGTGATTAAGGAGGGGAGGCTAGGCTGTCACGCATCCTAGCTGCAAGAGAGAATATGGCAATATGGCAGCTCTTCTACTCTGTTAAGGCAGTGGACCCTTCAGCTCAGGGAAGGGCCAGTAAGAGACCCTATTCCTGCGACAGAAGCTGGAAATACTCAATATTGACAATTTTAGTGACATTGATTCTTGCTAGGATTGACATGACTGACCCATCTAAGGAAACACCAACCTATGTGCCTTGCACACAGTGGTGCTCGATAGACATATGTTGAATGAACAGAGGTAAAGTACAGGTATGTGTAGGGACTCCAGGACAAATACATGGAGGTAGAAAGTGGAGATGGAAAGAACCACTCTTAAAAGTACTTGATTGAAAAGTAAAGACAAAGTATTGCAGTCCACAAGTCATAATAATTGAATT
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TGGAAGCCCACTGCTTGACAGGCTGAATGCTCCCATTTTCCACATGTACAGTAAAAACACCGAGTGGTGTTTTTACTAGAAATGGAAAGGAAGAAGGCTGCCTAGCTCACAAGCCTTCTAGCAAAACAGTCAGTCAAACCAAAGTTGGGCAGGGGGTAGGTAAGTAAATATTCTGTATTCTCACCTCAGACCAGAGATGGGCTTGAAACTGATTGTAACATGTCTACTCCAAAGAGGTCAAGGGGTGAGGGAAACTCATGTCCAGCATGCTCTCGCATGGACATGGCAAATACAGGATGAAGACAGACAGTGGCTGAGACCACTCCACGTCCCTTGACCCCCAGCACAGATGCCTTCCTCTCCTGCTCCACTTCATCTCATCTCTCAAGTAACTACCCCCCTCCCTTCTCCCCACAAGATCACTGAAGGCTAATCTAGAACTCTTACTTCTAAGCATTAATTCACTCAATATTTTAAAAGTATCCTAAAGAACTGGTCCTTGCCCTGAAGGAGTCGATGATCCAGCAGGAGCATAAAGGCACAGATGACTCATCTTCCACCTCTACACAATAAATGTCATGTGGAAAGTAGACTCATGATCCCCTAGGCATATTCCTTAGGACAACAGTTTCAAGAGATACACTGCCTAAAGAAAGGGTGCCAGGGCCAAATGATCTAATAATTCTGGAAAATGCTGTTACCACCCCCCGCTTTGTAAAGACTGACAGTACAAATTAATGTACTAAAGGCATTAACATGTATTGCAGTGAAAAGCCTTATTAGTGCTGATCAACTCAATCATTCTCAAGCATGTTTGACTACCTAAATTTATCAACATTTCATGGAGACAATATTCCATTGAATGTCATTTGCTGGATTCTAATTGGGGTGATTGGGAATAGGTGTTAAAGAAGATGCTGCATTTTGACTGGGCCCAAAAGATGAGTAGAGTTTCATTAGTCCCAGATGGAGGCAGAATGTGCAATCCACTCATGCAACACACACTCACTGAGTACTTCCTAAAGGTGAGGCCAACCCTTGGCTCTGGGGGGCTGCTACCCTGGTTTCCACTGCAAGGCAGAGTGAAAGGCACTAGAGCACTGATTTGAGAAAGGGCTTCCTATGTTTGGGGAATAGCAAATGCATGGCTAGAGTAAAGCAGGTGTAAAAAGAGACAGAATGAGGAATAAGGCTGAACCAAACAGAAAAAGCATCTATTAGATCAGTTGTTTATCAGGCCACCTGTTACCTGTTAACAGCACTGGCCTAGACAGTGTTAATCATTTCTGTCTGCTGTGGCTAGTGAAGAAACCCTGAGCAAGATCTTCCCTTCTCTAGGCCTCAGTTTCTTTATCTATAAAATGACTGGATTCTCTAAGGCTACTTGCAGCATCCATGTCTCAGTGTTCTGTGATTATAAGATATAAAAAGGCAGCAGCACATACCAGCACTAAAGGACAGGAAGAACTGGGGACAGGAGAATAGCTATTGGTTTAGACATACATCGAAAAATCACCTTGAAGAAAAATGAGCAGAAGAAAAATGAAGCCTATTCCATCTTCAGCTCTCAGGGCCCAGACTCCCTCCACCTGATATCTTAGGATTCTGCTTCTCAAATGGGAAGAATAAACATGGCATAGTTTCCAACAGTCAATTGTGCTCAAAAATGTAAAGAAGAAAATTTGACTCTTGTTCTAAAATCAAGACATATTTTAGACTTAGCATGCAATATTCTCAATGTATTTTAGAGATTTAAAAATGAGGACTTAAAGAAAGATCTGGCTTGTGTGGGCTTTTTGTCTTATGGGTGAGTCCCCTGGGTGCTCATTCACCGTCTCCCAGTGTGAGGAGTATACTTGGAGGGAAAGTTTCACTGGGCATCTCAGAGCTTTAGCCATTTAAATCTTGTAAAGACAGAAGCCTATTTATCCTGACTTAAGCTGTTCTAAAGAGACAGAAACTCACCATTGGACTGGTCTTCTCCATAGTTTTTATGGGATGGTGCATACAAGAACATCAGAGCAAAGACATACAGATTCCACATCCCACAGATGCCTGTGAAAAAGGCACTGTTCACTTGGACTGTGACGCCGCCCCATTTCCAATGGCCTTCCGTTACCTGCGGAGAAAGGATGGTGATATTCAATTGAAACAGAGAAGAAACAGAAGAAACATAACACCAATAAAGGAACCAACCAACATGAAAACCAAGTCTCTTCTACATGTGGGAAACATGAAGGGCCATGTAAGACTCCATCTTTTAATCTGAATCATTTCGGTGTAAATTAAGGTCAACTGAAGGTTCTCTAGCTTTCTGTCAGGCACAGTCAGTGGTCCTTACCTTGCCCACAGATTAGTATCACCTGGGGAGTGTCTCTTCCTAAAAACAGCAATTCATTGCTATCCCTAAGTTAAACAAACTGTGTTTGAGCCCATCACTTATTCACAATTATAATTCCTCCTCTGCTGTCTGTCTTCCCAGCTAGATGTCAATTCCCTGCAGGCAGAGACCAGTTCTCTGCTGCCATGTCTTTAAGGCCTGATGCACCATAGATTAATTCAAATCCAGTGTCTACCACTCACTCGGCTTAATGTAAGACAAGATGAAGACTCCAGACTTCAGAACTTCAGTGTCCGTAAGTGTAACATAAAAGCTTGCAGGTTATCGAAGAGAATTAAGTAAAAATATTTCTAGAACCTGCCTGGCAGGTACTCAGTAAATATTAGTTATTTCTATAACATCCCTTGAAGTAAGCCACTCATGAAAATAATTATGAAGCTTTCATATGCTTCAAAATTCTGCAAGAGATGTTTTGAAGCTGCTTTTGTCTGTGTTAATGATTTGGTAATTGTCTTAAGGGCTGCCTAAAGATATATGGATTACACTAAGAACTGTCAACAGAGCTGCTGAGCTAAGTGACTAATTTGTGCCAGCTCTGAGACAAATGAAATGATTTTGACCACTTCTGCTTACTACGGGACACTTAAAATGGAAATAGAAGAAAGTATTGGGTAAATATTCCTTTGACAGCTGAATGAGGCTGCGTTGTATAAACTTTCTCTAGGAATCACTTTTAAATTGTAAGATGGCAGGCTAGATTGAAATGTTAAGAACTTTAACAAGCAGGTGGATTTCATTGCCTGTTTATGATACAGTGGGTCTGTGTTCATTATCTTCTGTATAATCCATAACCCACTTGGGGCCCTAGGCCAAATTAAGGTCTAAGTATAGGTATTTTTTTCTGAAAGACCAGGAGTGTCAGTTAACCACATTAGCCAATTATAGACTTAGCAGTTTTAGTTTGGCCTTGGTGATACATAATTCTTCACTTTTTGTGACTCATAAACAAACCACTATTATGAACTCTTATTTATTTTGGAAAATAATGCATTTTATATAAAATGCCCAGAAGTGTTTTCTGGCAAAGATGGATTTCATAACCATTACTAATTTTAGGACAATGTACCAGCATTCAAGCTACTTAGGACTTCTTAGAAATGTCTCCAAATGTCGCTCTTCTTTAAGTGCAGAATATACTAACTTTATAAAAACTATATTACTTAGAGCATCTTATGATGATTTTTATTGCATATAATGGAAAGGAAAAGAAAGCATTAAGATAGTTTCCAGAAATACAGGTACCTGCTGTCATAACACAGAGAACTCTTCTGTATGTGATTAAGGAGGGGAGGCTAGGCTGTCACGCATCCTAGCTGCAAGAGAGAATATGGCAATATGGCAGCTCTTCTACTCTGTTAAGGCAGTGGACCCTTCAGCTCAGGGAAGGGCCAGTAAGAGACCCTATTCCTGCGACAGAAGCTGGAAATACTCAATATTGACAATTTTAGTGACATTGATTCTTGCTAGGATTGACATGACTGACCCATCTAAGGAAACACCAACCTATGTGCCTTGCACACAGTGGTGCTCGATAGACATATGTTGAATGAACAGAGGTAAAGTACAGGTATGTGTAGGGACTCCAGGACAAATACATGGAGGTAGAAAGTGGAGATGGAAAGAACCACTCTTAAAAGTACTTGATTGAAAAGTAAAGACAAAGTATTGCAGTCCACAAGTCATAATAATTGAATT
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Task1_train_976
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Consider this mutation in GNG12-AS1, WLS (GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1| Wnt ligand secretion mediator) on Chromosome 1. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; WLS syndrome
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Task1_train_977
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The variant affects gene GNG12-AS1, WLS (GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1| Wnt ligand secretion mediator), which is on Chromosome 1. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; Zaki syndrome
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ATTAGATATCATAGTCTAGCAAGCTAGGATAACAATTCCTGCCCTACTTACCTCGTAGGATTTTTGTGATGCTCAAATGAATAATAGATACATTAGATTTAAACAGTACTTCCCACCCTTCAAAACAAGTTATGAATATTTTAAAATGATTGTTATTGAGATTTTCAAGTATAGCAAAATGTTGAGTTTTGGAAATAACCAGTGAAAAGACAAGATGCTATCAAAGAGACTTTTGAATTACATTTCATATTTAAGTGGCAATATAATTATTACAAGGAATAGCTGATGGACTGTATAAGGATCTATGTTAATGCTAGATAAAAATGGAATCAAATTTATGCTTGTTAGTGTTGTGCTACACGGCTTGATAAGTTTTTCTCATAAGTAAATAAAATATGTGCCCTTCAATCTGGCTGTAGGCTTTTAATTTATTTGGAAACTTTTATCTCCTACAAGGTTTTACGGAAAGAGAAAATTTAGTCCATTTGGCCAGGTGATATCAAGACCCAGAAAAATATGGCTTGACCAGCTGTCCAGAATTATGGCCTCTCTCCTCCTTTCCTCAGTGGCTCTATTGAATTTCTGTGCAGGGTAGAGGGATCTCTGCAGAGACATTCTCACCTTGACATCTCAGGGTCCACTTACCTGACTAACGATGAAGAAGATGACAGTCATGGCAGCGCAGGCCAAGGTGATAAGCATGAGGAACTTGAACCTAAAAATTAGCCCCTATTAGAAAAGAAAGAGTAGTTTAATACTCCATCAGCTACCAATCCTTTTCTCACTATGTAAATCTATAAAAAGCTTAATTTTAAAGAAATCTGTAAAACCAAATCCCTAAGAATGACAGTAAAATAGTTTCCCATAGTAATATTTCTTCTGCAGAGGTGAGTGTGGCTGAAAATTTCTTGGGCCAAGTATTTCCTATGTTCTTATCACTCATAAAGCAGCGATACGAGAGCCTGGGAAATTATATTCACAACACGTCGTGAGGCTGCTAATTTCCCTGCTAAGCTGGTTATGCTTCTCTGCAAGGGTTCAAAGTTACCAAATCCAAGTTTTCTGTGGTTGTAATAAAATTCTGCTCCAGTGAACAAAAAGAAATGTGCATATTAATCAACATGAAGTGGATTTGGTTGAATTTTCTCATGTCACTCCAGCTCTGGAGACAGGCAAGCCTTAGAAAGTGCCTGTGGTTTCCTAAGAGCAGGATTTAAGAGAACCTGTGTTTCAGAGAGGGAGGCCTATTATTCAGGGGCTCTTCTGTGCAGATCTACTGCATATAAAAACTCTGAGGTTCTGTAGTTTCTGCTTCTCTTTTCATACAGGAATTAGGCTTGTTTCTCCAAGGACAGCCACTTAGGCATGAACCCAGGGGATCCCTGATAAATCAAGGATGTGTTGCTTGCATTGGGGATTTGAGGATGTTAAGTGTTTCTCTTGAATGAGGAACATAATCTATAAACAGAGATTACTGAACTCTGTCTGAGCATCTGCTGGATATTTTAGGGGAATGTGGCCTGTTAAGAGTCTGGAAATCAGATCACGTGGGCTAAACCCTGTTTAATTACAGGACAGGGTTGATTCTGGGACAGAACTTTGACTAAAGCCTCATCCCAACAAAATCCCAATTATGCCATAGTCCAATCTCCCAGCTAGTATGTAACCTACATTCCATCACCAAGCTGAAGAACCGGCTGAACAAGTTTATTCATTACTGAAAATGGAAACACATTTGTACCACAGAAAACACCAAGATTTAGGCCAGCTAGATGCTTCTCAGAGTAAGATTTGGCCTCTAATTTTGCCCAGAGATCCTACATGAGAATCTCTCAATTTGTATTTCAAAGTAAAGGCTTTCTATCTCCAGGGTGTGTGTGTTTACACATCAAGTGGAAAGATCAAGCAAGCACCAGTTCCAGAACGAGCCAAGAAATCTGCCCACCTCATAGTGTAGCCGCCGGACTTTGCTCATAGCTGGCAGGCTGGACTGCTTCCCACTGATGTTCCGAAACACCTGAAATACCATGAAGCATAGAAACAGGAAGTAGAGGCAGAGGCAGATTCCAGCCACGATGATGAAGGCCATCTGGTCGTGTCCAGTAAAGGAAACAACGGGCTAGCCAAGGCCAAGTTGAGCCGGGTCCAGGCCCTTCTCCCCAGGTCTGTTGGCAATACTTGTTTTGTCTCCAAATATGTAGAAAATTTTCAAGGGGATAAAATATTAAAACCTGATATTCTAATGCCAATGATAGGTTTCTTGACACATTAGTACCACAGAGGGAGGTGTTCAATATTGCTTTCTAAACCAAGTAAGAAAAGAAATGGTGTCTTGCTTGTTAGAAATGAAGAATCTAGGCCCTACCCTAGACCTAATGAATCAGAATCTACCTTTTAACCAGGTCCCCAGGAGATCCGTATACACAATAAATTTGAGAAGCACTAATAAACCATATATTCGTCACTATGGATCAGATGAAAAACCACAGTAAAATCACCAGAAGGGTTCAAATGTAGATCCCCAGGTCCCTCCCTAGATATATGGAATCAGATATTCCAGGGCTAGGACATCAAGTATGACTATGTTTGGGAACCACTGGGCTAGTCCTTGGAGTTTTATAAGAATGCGATTGAGATACTCTGGCATAATTGAAGAGGAGATACGTGGGGGCTCAGTGCAGGGGACCTGGGCATGGGCTTGAAAGTCTTAAAGTGAAACCAGGGATGAAGGACTATTTGCAATCTTCTGTCACCACAGAAAATCTTGTCCAACAGAATGGGGATTCAAGGACACATGGCACAGGTGGGAGTCTGGGTTGCTGCCAGTATACTTGAGACCCACTAGGGAGACTGACCTGCCAATTAGAGCCAGTCTGAGAACCACCAAGTCTTAGGATAGCGTGAGCTGCCTTGGAAGGCAGATGACCTGATTCCAACCCCTTTCTGCTACAACTTTGCCCAAATTGCCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTTGCTTTTGTTGCCCGGGCTGAAGTGCGATGGCACAATCTTGGCTCACCACAACCTCCTCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGGATAAGCCACCACACCTGGCCCAAATTGTCTATTTTTAAAAGCATTTAATAAGTATGAACTTGGCGTGCATATTTCATTAAATAATATAATATCTAATGCAGTTTCTCCTTCTTTCCTATAATGAACATCATCCTGGAATGAAGGGAATATAGTTATTTTCTGCAGGACTTGAAATTTTACTCACTCCATCCTATCTACAAAATTAAAAAAGTTGAACTAGATTTAACATTAGAAACATTCTTCTTGTTGTGCAGCTAACATTTGGTGGGGGCATAACAGAGGAAGGGTAGAGCTTCTCTCTCATCTTTGAGGAAATGATACTACTGATTTAGTTTGCTCACAATGTTCTTGTGACACTGAGAAACCAATATAAACATCATGGCAAGACAAAGGATATTCCCTAGCACGTGGCAAGATATGAGCCATCAAGGAAGAATACAACCCAAGCCTTTCTCTCCACTCCAGAGCAGAGTCTTTTTCTCCCAAGATCATTTCACATACTATTCCGGAAGATAAAATATTTAAATCCAGCATCCTAAAAGGGATAAGCTAAGACTGTCACTTCTGCTTCATGAAGATGACTTAGAGTTTATGCCAACCAACCAGAAGCCTTGGCGACTTCTCTGGAACTAATCACCTTAGCCTTATCTCCACTTGGTCTCAGGAATAAATAGCAGCAGTGTGATTTGCCAGCACACCAAGGTCACTTAAGAAGTCTCACACATAGGTGGTTTCAGAAACAGGCTCTTCCACAGGGGCCCAGAGATGAACCTCCATGGCTCCAGGGAAAAGCTAGTCATGCTTCAGTCTGCAGGAAACAGTGTATAACAGATAATTCAGACAGGCTGCAGTAAGCCTAGCAACTCGGATCCCTCTGCTGTGAGGATAGGCTGTGACCTTCTCATTTTGCCTGCTCTCACCCAGGCTTGAAAGCAAGCAGTAATTCTTCTTATTATTAGCCTTAATTGTGCTGTTATGATTGGCCTGAG
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Task1_train_978
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Given this variant in gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Leber congenital amaurosis 2
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Task1_train_979
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The gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65), on Chromosome 1, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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CAATTGAGTTATTTTTCTGAAAACAGATTTTCTTTTGTATAGATGGGACATAATTCTCTAGATCGCTCAGAGGAGTAGGTGTTTCCTAGAAAGTCCGAATTTACGAGTTAATCTCTCCCACATAACTTAAATATCTCTTATTCTAATTTAAGTTTTTAAAGCTTATATTCTATCTTGCACTTGAAAAGTAGCTCCTAAGTCTCCTTGCTCTAATTGTAGTGATAATTGTAATTGAGAATGCCAATGATGGTGAAATGGTATTAGCCAAATGTTATCGTAGATTTGCCTCTTTCCTTTCTTCACACATTGGTGATCTCTAAAGGGGATCGTACAGCAGGAGGAGATATGGTCACCTTGAATTGTGAGACTTGCTTCATAAAAAATGAATGGGAAGAAGCCAGGGAATCATTGATTGGCAAGGGTAGGAAGTGGAATTGTAGGAATTTTTTTTTTTAATTTGAAGACATTAAGTCTAAAACTTAGTAATTTTTCAGTAATTAATTTTCTACATTTTTTAAAAAATAGAAAAATAGTTTTCTTTGTGGAATTCTGTTCATATATCATGTCTAGAGACAGGAACCAATGGATTGATATTTATCTACAGTGACATATTCCATGCAGTTCCCTGGCATTCTCTTTCTGTTTTGAGATTTTTAGTTCTATCTAGTAATTACTGATGGAAAAATAATGATTACATAAAAAAAATCTACAGGAATAGAAAAGAAGAAAAAGACCAGTACCCAAATCTTAAGAGCAGTTGAACTTAGATGAGCTCTGTATGATTTTACTTTACAATTTCTACTTTTTTGTATTTTTAGTTATTCTTTGAAAAGTATGCTTTACTGAGTATTTGTAATTTAAAAAATGAGTTTCCATCTTATCTAAATAAAGATCAAATGGATACATCAGGTACCCTGGTCAGTCTGTTCCTTCAACCTATTTTTACCTAGTCAAACACCATGCTGATCATCTTAGGTATCATGATCTGTAATGCTTTCAAGCATAAAACAGATACTAGAATTAAGATATAAAACATTATTTTTGTCAATATTTATTTTTAAACAATCTCTGGAAGAAAAGAAATTTAAAAACAAAAGGCTTAAAATGTATTAATACCTCAATGTTAATAATTTAATATTTTTCCCAAGTGATTGCACAATGCTTAAATACAATTAAACAAAAAAGATGCAATAAAGTATAATCCTGCAACATTATCCCATAATCTGATTTTAGTAAATATTACATTTTTAAGCATTTTATGCTGTTTTTTTAAATATAGTCACTACTATATGTACTTGCTTTTATGTTACATAAGCTTTTAATATATAACTTAATCTCTGAGATGTTATTTGGTTGAGAGGCCTCAGTTGATTAAACACAGATTTTCTTATTATAAAATCAGAAATAATAGTACTTGCTTGTAATAAACGGAAAGGTTAACATTCATAAGATTCATAATCTTTGAGCAGTTACGTATACGCAAAATAATTACTGTAATTAATCTTAGATGATAGTCCCTGGTTTGAGAAAAAGTTTGGTTTGACATTTAGTAATTAAGCCTTATTGCATGATACTTCCTTGACTCAGCAAAGCCACATATAATATAAATCAAGTGTAGAGGACTTTGGTTTTTAAATGTTAAAAATATAATTGGAGCAGATAGGTACCTAAAATATGCTCTTATAATAGGAATTAAAAGCCATTTAGTAAGTCCACATTCATTTCCTATTTGATTGCTAAATATTTAAGAGTTTTTCAGTTATGGCCTGTCTCACAGAGGAAGTATGATTATCTAAATACGTACTTTTTTTTTTAAATAAAGGAATTGCTTGCTCAACTCAGTGCTTTCTGTAAAACATTGCAAAATTGTGCGCATCTGCAAGTTAAAACCATGACATATAGCAGGCTAAAATTGAACAGAATTTGATTGCAGACCTGAAGCTGATTTTCTCAGTTTTGCTACCAAAAACATATCTTGCTGGAGTATGCTCAAGATTTTTTGAACAGTCCATGAAAGGTGACAGGGATGTTAATCTCCACTTCAGCCCGGGCAACTTCACTTAAGTCCTTGGCATTCAGAATCAGGAGATAAGCAGGCTTTTGTCCTGCTCCTGGGCTCACCACCACACTCAGAACTACACCTGTTTATCAGAAGTAAATTAGGCAATATTGAGTTTTTAAAAGCCCAAGCTATAGATTGAATGTCATTGAAATAATATAGGAGGTATTACATTGACAAATATAGAAAACCATATGACCTGACTTCTTTTTCTGACTCTTGTACCACCTGGCATGAGACCACCTAAAGAGGTCTTTTAAACTCTTTATGTACCCTACCTACACTGTAAGCTCTAAGAAGGGAGAGTCTTGTCTGTCTTGCTCACTGCTATATCTCAATATTCTATGACAATGACTACAGCGTAGTAGGTACTCATTAAATACTCACTGAATAAATGGATCTGTTCTTATCTGTAACATACAAATATAGCACCTGCTGTACATACTGTAAAAACTGTGATGATCACATGAAAAGTGTGTATTAAAAGACTTTGAAAGCAGTAAGATATATCATATGTATGGTTTCTAAGATCGATCTGGAAGCTGACTTCCTTCGAACAAAATGAGAACAAATCTTTTACAGCTTCGACTGGATATATAAAATCATTTAGTGTGAAATGGCTCCACAATTCTTTATCTCATTTCTCTTAGTTTTCCATATTTTAATCCCATAGAGTGTAATCTATCTCCCTGTCCCAGCTGAGAAGCAGTTAACTAACACTGCTGATTTGTAATTTGAGTTGCTGTATCTGAGTTGCTGGTGTGGCTCTGGGTCTTTTTTCAAGCCCTAGCTTACCGAAAGAACAAATGAAAACTATTCACAGACCTGCCTTCTCATTCTCTTGTATCTGCTATAATACTTAGCTTCCCTTCTTAGAATTGCTATTTTTTTAGAAATATGTCTTCGTCAGGGAAGGCAAAAACCTGGAATTCATGTTGCCATTTTTTCTTCCTTCTCTCCCTCATCTAGAGCAGACATTGATGCTCCATCGTGACACCAAATGGTGCTTTGACATTTTTTTCTACTGGTAATCAACAAGACCTGATCAAAAGATGAAAATTCTTTTCAAATAGTTTTAATTCTTCAGTACTGCTCTATTTATAGTATTAAGGATCGTTTTTGAGTATTACGGAATAATCAACCTTACTCCTTTCCTAACGAACTAACATACAGAACTGCAGTAAGAAGAGTATTCAGACACAACAATTGCTTTCATTACCATCATCTTCTTCCAAGGCATCTGGGTGAGAAACAAAGATGGGTTCTGATGGGTATGAATCAGGCTCTTGCCAAACCCAAGTTTCTTTAGTTTTGACATTCAGCTTACAGAGCTGTTTGTGAGAAAGAAAAATCAATCAAGCAATCAGTCAATATGCTTTACTTGACTAGCATATACTCAAAGCACTGTTCAAATATTAGTAAGAAGGATTAATTACCCTATCTGGAACAAAGTGATTCAAGCCAAGTCCATACGCATATGTGTAAGGTTTCCCACAATACTTCTGGTAATTGATTTGAGGAAACTCAAATGCTACGAAATAGAGCACATGCTTAGGAAAACTCTTAATCTCTTTGAAAGAAACATTTGTTCACTCCCGTGTGAAGTTTTCTCTAGATCATCTCACCTTGACGAGGCCCTGAAAAGAGAACTTCAGGCTCCAGCCAGATAGTCTCGTCACTGCACAGAATTGCAGTGGCAGTTGTATTGGGGAGCGTGACTAAATTCTTGCCTGTGTCAGCCTAGGAGAGAAGATAACAGAAACCTCAGTGAGCAGGAAAGAATTCAAACAGCCAGAAATGCAGAGTTCTTAAGTCTTGGCTCCTAAGTTCTTTTTTAGGTCAACATGCAGGGAGGAACTGCAGGAAGCTATAGATGAGGGACCCTGGGACGCGACTGGGCAAGCTATCTGTGCCTGTGTCAGTCACTGGCTATGTATCACTGGGAAAGTCACATAACCTCTTAGGCCATCAATTTTCTCTTCAGTAAAATGAGACCATCCTTGAAGAAAATTTAGGGCTCCAAAGAAAGGCCTCTGA
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Task1_train_980
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An alteration has been detected in RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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Task1_train_981
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The gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65), on Chromosome 1, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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ACTACTATATGTACTTGCTTTTATGTTACATAAGCTTTTAATATATAACTTAATCTCTGAGATGTTATTTGGTTGAGAGGCCTCAGTTGATTAAACACAGATTTTCTTATTATAAAATCAGAAATAATAGTACTTGCTTGTAATAAACGGAAAGGTTAACATTCATAAGATTCATAATCTTTGAGCAGTTACGTATACGCAAAATAATTACTGTAATTAATCTTAGATGATAGTCCCTGGTTTGAGAAAAAGTTTGGTTTGACATTTAGTAATTAAGCCTTATTGCATGATACTTCCTTGACTCAGCAAAGCCACATATAATATAAATCAAGTGTAGAGGACTTTGGTTTTTAAATGTTAAAAATATAATTGGAGCAGATAGGTACCTAAAATATGCTCTTATAATAGGAATTAAAAGCCATTTAGTAAGTCCACATTCATTTCCTATTTGATTGCTAAATATTTAAGAGTTTTTCAGTTATGGCCTGTCTCACAGAGGAAGTATGATTATCTAAATACGTACTTTTTTTTTTAAATAAAGGAATTGCTTGCTCAACTCAGTGCTTTCTGTAAAACATTGCAAAATTGTGCGCATCTGCAAGTTAAAACCATGACATATAGCAGGCTAAAATTGAACAGAATTTGATTGCAGACCTGAAGCTGATTTTCTCAGTTTTGCTACCAAAAACATATCTTGCTGGAGTATGCTCAAGATTTTTTGAACAGTCCATGAAAGGTGACAGGGATGTTAATCTCCACTTCAGCCCGGGCAACTTCACTTAAGTCCTTGGCATTCAGAATCAGGAGATAAGCAGGCTTTTGTCCTGCTCCTGGGCTCACCACCACACTCAGAACTACACCTGTTTATCAGAAGTAAATTAGGCAATATTGAGTTTTTAAAAGCCCAAGCTATAGATTGAATGTCATTGAAATAATATAGGAGGTATTACATTGACAAATATAGAAAACCATATGACCTGACTTCTTTTTCTGACTCTTGTACCACCTGGCATGAGACCACCTAAAGAGGTCTTTTAAACTCTTTATGTACCCTACCTACACTGTAAGCTCTAAGAAGGGAGAGTCTTGTCTGTCTTGCTCACTGCTATATCTCAATATTCTATGACAATGACTACAGCGTAGTAGGTACTCATTAAATACTCACTGAATAAATGGATCTGTTCTTATCTGTAACATACAAATATAGCACCTGCTGTACATACTGTAAAAACTGTGATGATCACATGAAAAGTGTGTATTAAAAGACTTTGAAAGCAGTAAGATATATCATATGTATGGTTTCTAAGATCGATCTGGAAGCTGACTTCCTTCGAACAAAATGAGAACAAATCTTTTACAGCTTCGACTGGATATATAAAATCATTTAGTGTGAAATGGCTCCACAATTCTTTATCTCATTTCTCTTAGTTTTCCATATTTTAATCCCATAGAGTGTAATCTATCTCCCTGTCCCAGCTGAGAAGCAGTTAACTAACACTGCTGATTTGTAATTTGAGTTGCTGTATCTGAGTTGCTGGTGTGGCTCTGGGTCTTTTTTCAAGCCCTAGCTTACCGAAAGAACAAATGAAAACTATTCACAGACCTGCCTTCTCATTCTCTTGTATCTGCTATAATACTTAGCTTCCCTTCTTAGAATTGCTATTTTTTTAGAAATATGTCTTCGTCAGGGAAGGCAAAAACCTGGAATTCATGTTGCCATTTTTTCTTCCTTCTCTCCCTCATCTAGAGCAGACATTGATGCTCCATCGTGACACCAAATGGTGCTTTGACATTTTTTTCTACTGGTAATCAACAAGACCTGATCAAAAGATGAAAATTCTTTTCAAATAGTTTTAATTCTTCAGTACTGCTCTATTTATAGTATTAAGGATCGTTTTTGAGTATTACGGAATAATCAACCTTACTCCTTTCCTAACGAACTAACATACAGAACTGCAGTAAGAAGAGTATTCAGACACAACAATTGCTTTCATTACCATCATCTTCTTCCAAGGCATCTGGGTGAGAAACAAAGATGGGTTCTGATGGGTATGAATCAGGCTCTTGCCAAACCCAAGTTTCTTTAGTTTTGACATTCAGCTTACAGAGCTGTTTGTGAGAAAGAAAAATCAATCAAGCAATCAGTCAATATGCTTTACTTGACTAGCATATACTCAAAGCACTGTTCAAATATTAGTAAGAAGGATTAATTACCCTATCTGGAACAAAGTGATTCAAGCCAAGTCCATACGCATATGTGTAAGGTTTCCCACAATACTTCTGGTAATTGATTTGAGGAAACTCAAATGCTACGAAATAGAGCACATGCTTAGGAAAACTCTTAATCTCTTTGAAAGAAACATTTGTTCACTCCCGTGTGAAGTTTTCTCTAGATCATCTCACCTTGACGAGGCCCTGAAAAGAGAACTTCAGGCTCCAGCCAGATAGTCTCGTCACTGCACAGAATTGCAGTGGCAGTTGTATTGGGGAGCGTGACTAAATTCTTGCCTGTGTCAGCCTAGGAGAGAAGATAACAGAAACCTCAGTGAGCAGGAAAGAATTCAAACAGCCAGAAATGCAGAGTTCTTAAGTCTTGGCTCCTAAGTTCTTTTTTAGGTCAACATGCAGGGAGGAACTGCAGGAAGCTATAGATGAGGGACCCTGGGACGCGACTGGGCAAGCTATCTGTGCCTGTGTCAGTCACTGGCTATGTATCACTGGGAAAGTCACATAACCTCTTAGGCCATCAATTTTCTCTTCAGTAAAATGAGACCATCCTTGAAGAAAATTTAGGGCTCCAAAGAAAGGCCTCTGAAAAACAAAAAAACAAAAACCAAACAAAAATCTCAAAACCAATAATAATAATAATTAATGTTTTTCTGCAGAACAACAAAGACTTCGACTGCCTGAGGGATGAAAGAATGTATATTTCGTTCACACGTAGAATATGTTTTGATTTTGCTTGAAAAAAAAAATCCTTACAGTTATGTTGACAAAAAGAAAAAAAAAAAACGCTGGACCATATGTTTCCTAAGATCTCTTGTCACACACACATGATTTTTCTGATTATTTTATGAAATACCATGAGATTTTTCTAACATATCTACTTATTAATAATTTCATCAAATACTTGATTACATATTTTATTCTAGACTCTATTCTTGGCATTCAGGATGTTTTGGAGAGTGAAGTCCCTGTCCTCATGAAGCCTACATTCTAGTTCAAGGAGATATACAATAAATATAATTAATAAATTTTATAATATACCACAAATGTGGGGGAAAAATAGAATAGAGGAAAAAAGATCAGAAACGTGAAGGGTAAGCGGTTAAAATTTGAATAGATGGTTCGGGTAGGTCTCTTTGAACAGGTGGCAGAGGAGACAAAACTCTTAGAAGATGAGAGAATTAGCAATGCAGATATCTGGGGAAGAGTGTTCACGCTAAGAGAACAAATTGTGCAAAGGCCTGAGGGAGGAGGATGCTGAGTGTGTTTGAGGAGCATCAAAGAGTCCAGTGTGGATTCTATCAACTGAGCTAGGGGAGAGAATAAGAAAGGAAGGTGGGGAGGTCACGAGCCAGGCTGTACAAAGCCTCGTAGGTCATTATGAGGACTTGATCTTTCTCTGTGAGTGAGTGATGGGAAGCCATTGGAGGGTTTTCAGCACAGGAGTGAGATGCTATGATTTATTTTTAGGGTAGCCTTGTTAGTAGGGAGGATCCAAGAGTGGAATCAGGGAAACCAGTTTGTCTTGTAGTAGTCTAGTTGAAAGAAAACAATGGTTCACACTAGGCCAGTAGCATTGCAGTCAGTGAGAAGTGGAAGAAGTGGAGGACAGAGTCAAGAAGATTTCCTGTTAAATAGGATATGGGACGAGGAAGAGGCATGAAAGTAAGAGAGGCATCAAGCATAACACCAAGGTGTTTGACCTGTACAATGTTGATGTCACAACAAAGATAGGAACTACAGGTGGAGTAAATTTTTGGTGGGGGAAGATGAGAAGTTCAAGTCTTGTCTTATTAGACTTGAGATGTCTATTGGGCATCCAAATGCAGATGTGGAGCTGGCGCTAGCAGGTAAGAACCTTGAGTTTAAG
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Task1_train_982
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An alteration has been detected in RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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Task1_train_983
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This variant impacts the gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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Task1_train_984
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Mutation context: Chromosome 1, Gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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Task1_train_985
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Mutation context: Chromosome 1, Gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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TGCTCAACTACATGTCAGTGATATGCTTCTTAAGGGGAAAGCAAAAATCCTTAAGGTACCCAGATTGATCTCTCTCCATGATCTTTCTTTGGAGCTCCAGATCCATGTACAGCAGCTGCCTATGGAATGCTTTGCTAAGATTGCTAGTGGGTACTTTCAAATTACATCTATAAAGTAAAATTTATTCTTTTTTCTACAAGCTAGCTCCTGTTACTTCTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGATGGAATTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTGTGTTTTTAGTAAAGATGAGGTTTCTCCATGTTGGTAAGGCTGGTCTTGAACTCCCAACCTCGGGTGATGCACCCGCCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCCAGCTCCTCTTACTTCTATGTTTTCAGTTCAGTGAATTATACCATCATTCACTCAACTGCTCAGGATGGAAATCTTGAAGTCATCCTGAACTCCTTCCTCTCCCTTACCCCTCACATGTAATTAGATACCAACTGCTGTTGATTTTGCTGCCTAAATATTTCTCAGCTTTGCATCTTCATCTCTCAGTCACCATTTTCTTAACTCAACTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGA
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TGCTCAACTACATGTCAGTGATATGCTTCTTAAGGGGAAAGCAAAAATCCTTAAGGTACCCAGATTGATCTCTCTCCATGATCTTTCTTTGGAGCTCCAGATCCATGTACAGCAGCTGCCTATGGAATGCTTTGCTAAGATTGCTAGTGGGTACTTTCAAATTACATCTATAAAGTAAAATTTATTCTTTTTTCTACAAGCTAGCTCCTGTTACTTCTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGATGGAATTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTGTGTTTTTAGTAAAGATGAGGTTTCTCCATGTTGGTAAGGCTGGTCTTGAACTCCCAACCTCGGGTGATGCACCCGCCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCCAGCTCCTCTTACTTCTATGTTTTCAGTTCAGTGAATTATACCATCATTCACTCAACTGCTCAGGATGGAAATCTTGAAGTCATCCTGAACTCCTTCCTCTCCCTTACCCCTCACATGTAATTAGATACCAACTGCTGTTGATTTTGCTGCCTAAATATTTCTCAGCTTTGCATCTTCATCTCTCAGTCACCATTTTCTTAACTCAACTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACATAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGA
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Task1_train_986
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This sequence variant lies in RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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GTGATATGCTTCTTAAGGGGAAAGCAAAAATCCTTAAGGTACCCAGATTGATCTCTCTCCATGATCTTTCTTTGGAGCTCCAGATCCATGTACAGCAGCTGCCTATGGAATGCTTTGCTAAGATTGCTAGTGGGTACTTTCAAATTACATCTATAAAGTAAAATTTATTCTTTTTTCTACAAGCTAGCTCCTGTTACTTCTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGATGGAATTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTGTGTTTTTAGTAAAGATGAGGTTTCTCCATGTTGGTAAGGCTGGTCTTGAACTCCCAACCTCGGGTGATGCACCCGCCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCCAGCTCCTCTTACTTCTATGTTTTCAGTTCAGTGAATTATACCATCATTCACTCAACTGCTCAGGATGGAAATCTTGAAGTCATCCTGAACTCCTTCCTCTCCCTTACCCCTCACATGTAATTAGATACCAACTGCTGTTGATTTTGCTGCCTAAATATTTCTCAGCTTTGCATCTTCATCTCTCAGTCACCATTTTCTTAACTCAACTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATGAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAA
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Task1_train_987
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Chromosome 1 houses a mutation in gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Retinitis pigmentosa 20
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CTGTTGATTTTGCTGCCTAAATATTTCTCAGCTTTGCATCTTCATCTCTCAGTCACCATTTTCTTAACTCAACTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCA
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CTGTTGATTTTGCTGCCTAAATATTTCTCAGCTTTGCATCTTCATCTCTCAGTCACCATTTTCTTAACTCAACTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGTAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCA
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Task1_train_988
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Leber congenital amaurosis 2
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CTGTTGATTTTGCTGCCTAAATATTTCTCAGCTTTGCATCTTCATCTCTCAGTCACCATTTTCTTAACTCAACTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCA
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CTGTTGATTTTGCTGCCTAAATATTTCTCAGCTTTGCATCTTCATCTCTCAGTCACCATTTTCTTAACTCAACTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGTAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCA
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Task1_train_989
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A variant on Chromosome 1 in gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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CTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCAACCTACGGAAGTAAAGTGAATGTCCTCCAGTTGAGAGAAGGAAGATACATTATACCTTTGTCCCTAGGTCTG
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CTACTTATTCCCTTTTATTTGCCTCATTGCATTAATCCTGTAATAGGGCTTCTAGCCTCTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAATTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCAACCTACGGAAGTAAAGTGAATGTCCTCCAGTTGAGAGAAGGAAGATACATTATACCTTTGTCCCTAGGTCTG
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Task1_train_990
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A variant found in Chromosome 1 affects RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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CTGCTCTAGACTCTCCACTTTCCAGTCTGTCTTCCATGATGCTGCCAGAGTAACTTTCTGAATCACAGATCTAATCATGTCCTAAAATACACTTAAAATACACATTTAAAATACTTAAATGGCTCCCTATATTTATATAACACTCAAAGGCTTATATAGCCCATTACAATATTGCTCCAACCTATCTTTCCAGTCTCTCTGCCCAAAACCCATCTCCCCTACACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAAACTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCAACCTACGGAAGTAAAGTGAATGTCCTCCAGTTGAGAGAAGGAAGATACATTATACCTTTGTCCCTAGGTCTGAGGTCATCACTACCCCTTGAACTCTCATCCTAAGTGCACTTCTCTTTCTTCCCATCTC
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Task1_train_991
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This alteration in RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
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Pathogenic; Leber congenital amaurosis 2
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ACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCAACCTACGGAAGTAAAGTGAATGTCCTCCAGTTGAGAGAAGGAAGATACATTATACCTTTGTCCCTAGGTCTGAGGTCATCACTACCCCTTGAACTCTCATCCTAAGTGCACTTCTCTTTCTTCCCATCTCTCTGGATTCTACCCTCTTTCACCTTGAGTTCCCACCTTCATGCAGAACATAATGCCCCCTCATGTGTCTGAATCTGGAGTTACCTGTGACATCTCTTTATTTGATGTATACCATACAGTGCTCTGGTTAGTTACTTTTCTTTTAGCATATGCAGATTGACCTGAAACCATAAGTTTGAGTCCTCAGACTTCTTTATACTCTTATTATTGTATTAGATTTAAT
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Task1_train_992
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This gene mutation involves RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Retinitis pigmentosa 20
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Task1_train_993
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A variant was discovered on Chromosome 1, affecting RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Leber congenital amaurosis 2
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ACCCCTAAATAAACCAAACTCAGCAACTACTTCATATTTATAGATGAAATCTTGCATTTTTAACTCCTCCTTGCCTTTATAGACGCCCCTTTGCCTGTCTGTAACACTCAACCTCAACCTTCTCCCTCTTTCTCATTCTTCATAGAGCTTACAAACTTGCTTAAGAGCAGTGGTGTTTGGTTCTAAATTGAGTTTATTTTCTACTACACCATATCTAAGCCTTTGGTACAAAGTTTTACATTCCATGTAGCTGTTTTAATAACCCCTTTTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCAACCTACGGAAGTAAAGTGAATGTCCTCCAGTTGAGAGAAGGAAGATACATTATACCTTTGTCCCTAGGTCTGAGGTCATCACTACCCCTTGAACTCTCATCCTAAGTGCACTTCTCTTTCTTCCCATCTCTCTGGATTCTACCCTCTTTCACCTTGAGTTCCCACCTTCATGCAGAACATAATGCCCCCTCATGTGTCTGAATCTGGAGTTACCTGTGACATCTCTTTATTTGATGTATACCATACAGTGCTCTGGTTAGTTACTTTTCTTTTAGCATATGCAGATTGACCTGAAACCATAAGTTTGAGTCCTCAGACTTCTTTATACTCTTATTATTGTATTAGATTTAAT
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Task1_train_994
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This mutation is located in gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
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Pathogenic; Retinitis pigmentosa
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Task1_train_995
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Mutation context: Chromosome 1, Gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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TTGTGCAACCAGGGAGCAAATAGATATAAAAGAAAGCATATATTCACATACCTATATGTGAGAATTATATTTTATTGATTTTGACTGGTATTTCCATCACACTACAAATTCTAGATGTTACTCTGGTTATTCTAAAAAGACAGTCTCTAAATACAGGGAAGAAAAAGTAGAAATAAAGAGATGACTGTCTATTGTTAGTAATGATTTTTAACCTCTAGTGATATTTTTCAGAAGATTTATAGAAAACCAAAATAATGAACTGGTTTCCCTACAAGAGTACTTTTTGATGCTTCATCTCTCCAGAACTTCAAATTATTTAAACTATTTATATTATTGATAAAGTATCATAGGAATCAGTGGATCTGCACTATTCACCGAGGAAGTATATTTTAAAGACAATTTTGTAAATACAAGAACGGCAGATTTAGAATTTAAAAACCTGGTTCTTATCCTGGCTCTGCTGCAGTTGCTTTTGCTAAGTCACAGTACTCTTCTGAGCTTTAGTTTCATTTGTAAAATGAAGGAAGTTTAATTAGCCTATTTTTAAAGCTCCTTCTAGCTCTCAAATTTCAAGACTTTATGTATAAACATGAGGCAGGAGGACAATTCCTGAGAGAGATGAAACATTCTGGTTAAATCTGAAATCTACAGAGAAGCAGGTTACCTTGTCAATATTCAAAGGAAGTACATATCTCCTAACTTCAGGTTGGGGAGCCTTTCTGGCATTTTTTTTCACCTCTTCCCAGTTCTCACGTAAATTGGCTAAATATAAGTAATTATAAACAAACTCAAATCTGCAAAAATAAAAAGTCAAACATGAGCACAGGCAATGACAAATAATTTTAGAGAGATGATTCTTGCCTTTTTAAGCACAAGTGCCTGCCTGTTCTTTATTCCACAACCCAGAAACTGCTATTGAGCCAGGTGTATCAGAGCCATTTCCTCCCGCCCACACAGGATGAAAATAAAGCAACCTGCTTAATGGATTTGTTTAAGTAACAGCAGCCTTGAGATACTTTCTGTTCTGTCTTCCTGTCACCATTCTGTTTGTGTCCTTAGGTGCTGTTGTCTTCTTAGTGATTTGGCTAGTCTGAAAAACGCATGTCTTTTTCTCCCTTCGCAGAGAAGATGGGGCTCAAGTTTCCCCAGGGATTTTGTCAACTTTAAGTTCACCTCTCAGGTCACAGAATCTTTTGTTTTCAGGTGGGGTTCATGGACCCGATTAGTTTTCAATCATTAATCATAGTTTTGATGTTCAGATTACCTAAACTTCCTACTGCTTTTCCAATTACATTTTTGACTCTCACATAACTCTTGCTGTTTTAGATGTGATTCAGATTGAGTGCAGCAGCTCTGTAAAAACCCCGTAATTTCCAGGAACAATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCAACCTACGGAAGTAAAGTGAATGTCCTCCAGTTGAGAGAAGGAAGATACATTATACCTTTGTCCCTAGGTCTGAGGTCATCACTACCCCTTGAACTCTCATCCTAAGTGCACTTCTCTTTCTTCCCATCTCTCTGGATTCTACCCTCTTTCACCTTGAGTTCCCACCTTCATGCAGAACATAATGCCCCCTCATGTGTCTGAATCTGGAGTTACCTGTGACATCTCTTTATTTGATGTATACCATACAGTGCTCTGGTTAGTTACTTTTCTTTTAGCATATGCAGATTGACCTGAAACCATAAGTTTGAGTCCTCAGACTTCTTTATACTCTTATTATTGTATTAGATTTAATTGTATAAGATTGCTAACATTTAATAATTGCTGATTTCCAAAAATGTCAATTTCGTATGGTACTATGTAAATACCAACTATATGTCTTGCACATGGTACTGTATGAGTTTGGAACTGAAAGGGACTTCAAGCTTCATCTAGTATAGAAAGTCTTAATTTAAATAGACTTTAGGAGAACCATGGATCTCTTTTAATTAAATATAAACATTTCTGGCAAAAGCATACAGCATTTAATTCAATTTTATGTCTCATAAGAAGTTTAGAACTAC
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Task1_train_996
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This gene mutation involves RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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Task1_train_997
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Gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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AATGGGAGGTGTCCCATTTGTCCAGTGTCCTTTCTTACCCTTTCCAGCAGCAGAGATCCACAATCAGAAACCCATTGTCTTCATAGGTGTTGATGTGATGGAAGAGGTTGAAAGGAGAAGTTCTGTATTTATTATTGAGGTACTTTTTCCTTTTTTTGTCAGCAATATGAAGCCAAACCTTGAAAAATGAGGAAAATATTTTGATGCATTTAAAAAGGAAAAAAGTGTACATTATTAAACACATCTTCTTCAGAATCACAAACTTGACAAATATATCTAAGACTTACCCCCATGGTTTCATTGGACTCAAAACAATCCATGTAGTTGGCTCCCCAAAGACTCCATGAAGAAAGGAACTTGAACAGGTTAATTTTGACTGGTGTCTCCACAAAAACGATATAGTTGGGAGTCAGACCAAAACTGTTCAGAAACACAAATGGGCTTGTGAATGAAAGGGCTGATTCTCAAGCCACAGACAAATTTGTATATATGTGGTATGCTCAGTTACAAGAATCAACAGTGCCTACATGAAATTAATTATGTTTAAATTTAGTTTTCTGCAAAAAAATATTGTGATCAGGATTGGTATCAAAGGTAGGCAAAGCAAATCTTTAAACTTGAGTTTTCCTGAAGATTCATAGCAGGCCTTCAAGTTACCTATGAACGTAAGATGGCTTGAATCGGTCACTGCAGGGGAATTGTACAACGATCTCTGACTTGCTTATTGGATCTTCCTTGTCTGAAATAAAGTGGTTTTAAAAGGCTTTGGAAGAGCCTCTTATTTTTTTTTTAATACAAAGCATTTAGAACAGCTTATACAGGCAAAGAAACACATTTTGATTGTTTTAGAGGGGTTATTTTCATTTTCTCCATCATTTGCACTTCTTAGTGAAATTTCATGTGAAGCTGCAAAATCACCCAGGAAAATCCAAATAGCAGCAGATTTGGAAACGTGCACTCAAATAGGGTTGTGGCAAGTGGAGTGTAGTGGAGTCACATCTTGCAATAGCTGGAGGTGGGTTTTAAGTCAGGGGAGTAGGGAAGAAACCTCAGAATGGTCAAAATGCCTTTTGCAACATCTTAAGATGCCCAAAGGATATAGTTTAGATGGGTTTGTGTCAATAGCCCTGTACAGTAATTCTTATGCACATTAAAATTTACTCACTAGTAAGTGAATGGTCCTCAAACTTTAGTGTGCATCAGAATCACATAAAGAGTTTCTTAAAATACTGATTGCAGGCTCCACTCCCAAAATTTCTCATTCAGTCTGCCCAGGACAAGGCTCAAGATTTGTATTTCTAACAGTTTCCTAGGTGATGGTCTTGGTCCAAGGACTACACTTTGAGAACTGTACTAAATAATACTAAACAAAAATCTGTATACATTCAAATAATTCCATCATCAAGGTGGTGAACAATGAACCTGGCAATAAATGAAGAATGAATGGAGAATTCTAGGGTACACTCTTTTTGCTGTAGTTCTTTTTCTATAGTACTTCTATGAGATAACAGATTTGTTTGTAGTTTTGGGAATTAAGCGCAACATATTTAGTACACTCTCATATATGTATGTATGCTATTATGCACACATACATGCTTATTTAATTTAATTTTGCCTAGCACATGAATAAGTGCTCAATAAATGTTTGCTAAGTTTGAATCCTAATTGTATATGATCAAATCCATATATATATATGTACTACATTTTTAATATTCTAGAAGAGAACTTGGACACTTGCTTTCTATATTTTCAAGTCGTCATCCTTTGATATGATGCCCTTGGGCATTAGGCCCCTTATAGGGTAGGGATGAGGGCAGTACTTCTGAAGTCTGAGAGTAATTTAACTATGCACAAAATGCTATTCTGACATTCTTATCTTTCTCACAATACAGTAACTTTCTCACAATATAGACACTTATTTTCAGAAGAGGACAGATTGGTAAACTCACCTGCTTGCAGTGGTGGGATCTTTACAATGTTGTAGGCAATTGAAAAATTTTTTCCAAAGCAATTACCAATATTGTAAACGGTTCCATCATTTTCAATGTGGGGGTGAGCAGTGGCCCCATTGACAGAGACATAGTTGCAAAGATCAACCTACGGAAGTAAAGTGAATGTCCTCCAGTTGAGAGAAGGAAGATACATTATACCTTTGTCCCTAGGTCTGAGGTCATCACTACCCCTTGAACTCTCATCCTAAGTGCACTTCTCTTTCTTCCCATCTCTCTGGATTCTACCCTCTTTCACCTTGAGTTCCCACCTTCATGCAGAACATAATGCCCCCTCATGTGTCTGAATCTGGAGTTACCTGTGACATCTCTTTATTTGATGTATACCATACAGTGCTCTGGTTAGTTACTTTTCTTTTAGCATATGCAGATTGACCTGAAACCATAAGTTTGAGTCCTCAGACTTCTTTATACTCTTATTATTGTATTAGATTTAATTGTATAAGATTGCTAACATTTAATAATTGCTGATTTCCAAAAATGTCAATTTCGTATGGTACTATGTAAATACCAACTATATGTCTTGCACATGGTACTGTATGAGTTTGGAACTGAAAGGGACTTCAAGCTTCATCTAGTATAGAAAGTCTTAATTTAAATAGACTTTAGGAGAACCATGGATCTCTTTTAATTAAATATAAACATTTCTGGCAAAAGCATACAGCATTTAATTCAATTTTATGTCTCATAAGAAGTTTAGAACTACAAATGTAACACAAATCTCTGTTTGCAGAAGGATAAATTGGGGTTCCAGAGAGATCAAGTGTCTTGTTTAAGGATAAAGAGCTAGATAAATCAGCACTAGATTTCCACCTGGGACCTACTTGGTAAAGAGTTATTGAATGAATAATTACTGGAATATATATTTATCTAACCAAAATTATTTCCAATTAATTAGGGAGATTTTTTTAAAGCATAGGACATTTTAGCAACCTTATTTAAATAATAGGCAAGATATTCATTTATTCAGTCAATCATTTATCAAATACTCTGAGCTTTCACTATGTGCCAGGCACTGTATCAGGGCTCAGGAGAGAGAAGATCTTTGCTTTCAAGAACTTCATTCTAGACCCGTGCTGTTCTATTAATACAGGACCACTAATTTTTAGATAGAACTTCAAATTCAGCTCCTCAGTCACATTAGCCACATTTCAAGTGCTTAATAACACCAGGATAGCACAGTTATAGAGCATTTCCATTATTGCAGAAAGTTCTATTGGACAGCCCTGCATTAGACCAATAAGCCGGTGTAAAGCACTGTGAGTGTGCAATGGCATCGTAGAGAAGCGCCATCTAGCCCAGACTGAGGGATGAGGCAGTTTTCCTGAGAAACATGACTCCAACTAATGTTTGAAAGGTGCGTGGAGTTAGCCAAGTGGAGCAGGATGACAGTGTATTCCAGGGAGTGGGAATCCTAATGTAAATGCATAGACTTGTGAAATAATGTGTGCTGTTTGGCCATTACTAGTCATTTAACCTGGCTGCCATGAAGGGCATGCGTAGAGGAGGCGAAATAAGAGTGGGCCAGCCACAAAGACCTTCGCTTGGACTTTATTTGGGAAGTTATGGATTCCCTAGGTGGAGTAATACTTTCATATTTATATTTTAAAAAATTGCTACTGCTGCCTTAAATAAATTGTATTTAAGGGAATCAGGCTGGAGGCAAAGGCACTGGTTAATAACAGTAAACAATCAAAAATTTCACATTTTTAAAATTACATTTTACAGTGCTAGTAACAGTGGAACCTGACTCCTAATAAAGTCTATTCTGCAGCCATACCATAGCTTCTATATTTCTAATTAAAATATCATGTAATTGTAATACAGATTCCCTATCAAAGTCAAATGAATGATTTAGAAACTCAGCTTTTGTTCTTCTCTAAAGGAGCTACACACACACTTGTATATGGTTACACACACACAACATAAACAAGAAAGAGCTATGGGGAGTGTATGTTAAGACATAGTAAATAGTCTGTTGAGAATTATAGATCAGCTTGTGCTATTGAGACTCAATGTTGAGACTATTTTTTTTCTTCTTATTTTTACCAGTACTGCATTTGTGGTTCTGGCTTTTAGTTTCACCT
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Task1_train_998
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A variant on Chromosome 1 in gene RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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Task1_train_999
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Here is a variant affecting RPE65 (retinoid isomerohydrolase RPE65) on Chromosome 1. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; RPE65-related recessive retinopathy
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ATTGTATTTAAGGGAATCAGGCTGGAGGCAAAGGCACTGGTTAATAACAGTAAACAATCAAAAATTTCACATTTTTAAAATTACATTTTACAGTGCTAGTAACAGTGGAACCTGACTCCTAATAAAGTCTATTCTGCAGCCATACCATAGCTTCTATATTTCTAATTAAAATATCATGTAATTGTAATACAGATTCCCTATCAAAGTCAAATGAATGATTTAGAAACTCAGCTTTTGTTCTTCTCTAAAGGAGCTACACACACACTTGTATATGGTTACACACACACAACATAAACAAGAAAGAGCTATGGGGAGTGTATGTTAAGACATAGTAAATAGTCTGTTGAGAATTATAGATCAGCTTGTGCTATTGAGACTCAATGTTGAGACTATTTTTTTTCTTCTTATTTTTACCAGTACTGCATTTGTGGTTCTGGCTTTTAGTTTCACCTCTTGGTCTCCCAGCTATACTGTATCTCTTTTGCCTTCCCGTACAGCCCACACATGGCTCCCCAAATAAACATCTGAAAATATAGCCCTACTCATACTACTTCTTTGAGCAAAAACTTTCAGTAGCTTCCCATTAGCTAAACAACATATTCCAAATGTATAGCCAATTATTCAAGCTTTTAATTTCATCCTACCCTGTGTCTCAATATTCCCCTTGACATTAACTACTCTAGGCAACTAGTTCTCAACTGGGAGTGTTATTGCCCCCTAGGGGAAGATACGGAAATGTCAGGAGCGTTTTGGGTTTGTATAATGATTGAAAACATGACTGGTGTTTAGTGGATGAGGCCAGGGATGCCAAACCTCTCCCATGTGTGGGACGTCTCCATGATGATGAGTCACCCCCTGCCTAATGTCATACTAATACCTCCACTGAGAAATGCTGCAAGTCTAGTCCAAGGAGATTATTCTCCAGTTTTCATGAACACCTTCTACCTCCATGCTTTTGATCGCTTTACCCCCTCCATCTAGCATATCCTTTCTCTAAATTCACTGAAATCATCCCTCTCTTTTAACTTCCAGCCCAAAGCCTTTCCCTTTAAGCCTTCTTTCACCTGTCCCACCTTGCATTGCCAACTACTTCCAGAAGTAATTCCTTTCGTATTTATGCTTTCTTAAAAGATTTTCCTTCTTAAAAGACTCGTCATATTCTTTGTCCTATTACAGTTACATATTTGATTTCTCCACCTAGACATTAAGTCACCTGAAGACAAGAACAATGCCTTGTAAATAGGTGTATCTTAGTAAATATTGGTTCAAAATGTGTATCTAAGGACTGCTGCATTGAGATTCCCTAAGTTCTCCATAAAATTTGTCACTTCCAAATATTGCTGAAATTTTGTTCTATGCTATTTCATTCAAGATATAGCTTTATTTCTAATAAGAAGTATCTATAAGAAGGGGCAAATTAGTGCAACATACTTGCCTAGAACCATAAATAGCATGATTTTCAGTATCAGTAGCTATAATTTTTTGAGCACCCAGTATTTACCAGGTTCATGCTAGCTTATAAAAGCTATGAAAGGCAGGGACCATGTTACCCTACTCATTGATCTATCCCTTGCATCTAGCATAAATTCTGAATATGGAAAGCACTTGATAAGTATTTGTGTCATGAATGAATGAATGAATATGTTAGGCATTTTATATGGGTTCTCTCCAATCCATGTAAGTGTTTAAAATTTTAGAGATGAAGAAACAATGTTTGTCCTATGTCAAATAGCTAGTCATTGTTGACAATGCTAGGATTTGAAACTTAATGTGGCTCTCATGTTCTTTTCACCAAATTACACCAATTGCAGGAAAGCATCATAGACAGAGGCAATCAGTGCAGTCCATTTGGAGCTTGGAATGGTCATTCTGTGTGTCCTCATCAAGTTAGAATCATACATTCGCAGCATGAATAATTTATGTTGAATTAATTTTAAGTTCCAAATTCTAAATTCCTGAACATCACCTAGCACTGTGTCCCACCTGCTTAATTGTCTCCAAGGTCTCTGGATTAATCTTTGTAATAAAGTTGGTCTCTGTGCAAGCGTAGTAATCTTCCCCCACTGGGTAGACATTAACAAGGGCATTGTCAGTAACCTCTACTCCTCGAAAGTAAGAAAAAAACCTGTAGAAACAAATGAATTTTTCAGTCCAGTAATTTTCAAGCCATGAGAGAAAAAGGGCTAATATAAAATGTCTTGAGTAACATTCAGTTTGGGTTCAGTAACCTGGAAAATATATTCTTGCAGGGATCTGGGAAAGCACAGGTGCCAAATTCTGTTATGACGATCCTTTTCTCAGTCATTGCCCGTACGTAAGCATCAGTGCGGATGAACCTGAAGGACATTGAAACATAGGGAAGAGTATAGACAGGAGCAATCCGTACAGCCCATGTGGAGCTTAGAATGGCCATTCTATGTGTCCTCATCAAGTCACAATCATAAATGCACAACATGAAGAATAAAGGGTTTTATTAGCTCACTTTCTTGGGGTGACCAAGCAGGGCAGACACAATGTCCCTTGAGTTTACGTTTTTATCTTTTAAACCTCACAGATGAGGAAATTGAGGTTCAGAGGAGTTAAGTGATTGGCATATGTGGCCAAGCTGGGTTAGAATCCTAGTTGGCCAGAGCAGGACAACATGAACTTTCTATATCACACCATGCAGCCCTGGGGGAAGTTCACATAGGACCCCCACCCCCATCACCTATAACCTATCAACCTAAACTTACTGGGAAAATTCCGGACATGGTGTGCTGAATTATATTCTTCTCAATCTCCCTCTGTTACTTTTATGTTTTTCTTCAATTTTAACATTTATTTTGTTTTAAAAATTAAGTATTCTTGAATTCCATCTCTTGCCTAGACAGGTCTGCTAAACCATATCTTAGAGTAGACAGCATACTTTGCCCAGGATTTCTGATATGGAGAGCCAGTTAAAATCTGATTTTGTACTTTTAATTAATTAATTAATTAATTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCTATACTCTTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTACCACCACGCCCGGCTAATTTTTCTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGGCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCACCCACACCCGGTCGCACTTTTATGAAGAAGAAAGAGTACCCTGCTCTGTCGAAGGTATAGGAAGCTTTATCTGAACTCCACAGTAAGCTCTTATGGCTACATTTCTGCTTGACATCATCCGTTTCTCTTCTATTATCATGCAAGTTGTCCTGCTTCAAGTCCCCTTTCACTTTTTCTTTACAGGTCTTTTCAAAATGCCTGAAATCTGTGGTGATCAACAAAGCCACTAATAGGCTTGAACACGAAAGCAGAAGACAAAGTATTTGTTAATACTTCATTAATGGGGGTTTCCTGGAATGATGATTTAGGGCTTCAAGGCTTTTTAGCAATAATCTCTTGTTTTCAGAAAACTTCTCTTTCTGGTAGCACTATGACATGTTTCATCCTTCACTACTTTGTGGCAGCCCCCGACCCCTTTCCCAGTGGCCTTTCCAATTTTATAAAAAGAAAAAGGAATCAAGATGGCCAATGGTTTAATAATAATAACAAGCATCACAATAGCTATTATTATGAAGTGCTTTGTGTGTGCTAGACACTGCGCTCTCATTTAATGCTTGTAATGAATATATAAGGTAGATTCTATTATTTCTCCCATTTTACTAATTATAAAACCAAGAATTGGAGGTCAACATCTTGCCAAGGTTACCCTCCTAGGCAAGTCATGTCTGTTGAATACAGGGTTTAAAGCCACTCATGTTGGACCCCAAAGCCCTAGGCTTTAGCTTCTCCTTTATTCCATGATAATGTTCCCTCGTATCCATGCAGACACACTGGCCCAGGTACATTGTGAGAAGAAAGTGGGTATATAGGTTGCCTCCTGAGTTCAGAGGTGAAAACTCA
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