|
|
|
AMINO_ACID_1TO3 = { |
|
'A': 'ALA', 'R': 'ARG', 'N': 'ASN', 'D': 'ASP', 'C': 'CYS', |
|
'Q': 'GLN', 'E': 'GLU', 'G': 'GLY', 'H': 'HIS', 'I': 'ILE', |
|
'L': 'LEU', 'K': 'LYS', 'M': 'MET', 'F': 'PHE', 'P': 'PRO', |
|
'S': 'SER', 'T': 'THR', 'W': 'TRP', 'Y': 'TYR', 'V': 'VAL' |
|
} |
|
|
|
AMINO_ACID_3TO1 = { |
|
'ALA': 'A', 'ARG': 'R', 'ASN': 'N', 'ASP': 'D', 'CYS': 'C', |
|
'GLN': 'Q', 'GLU': 'E', 'GLY': 'G', 'HIS': 'H', 'ILE': 'I', |
|
'LEU': 'L', 'LYS': 'K', 'MET': 'M', 'PHE': 'F', 'PRO': 'P', |
|
'SER': 'S', 'THR': 'T', 'TRP': 'W', 'TYR': 'Y', 'VAL': 'V' |
|
} |
|
|
|
MAX_ASA = { |
|
'ALA': 129.0, |
|
'ARG': 274.0, |
|
'ASN': 195.0, |
|
'ASP': 193.0, |
|
'CYS': 167.0, |
|
'GLN': 223.0, |
|
'GLU': 225.0, |
|
'GLY': 104.0, |
|
'HIS': 224.0, |
|
'ILE': 197.0, |
|
'LEU': 201.0, |
|
'LYS': 236.0, |
|
'MET': 224.0, |
|
'PHE': 240.0, |
|
'PRO': 159.0, |
|
'SER': 155.0, |
|
'THR': 172.0, |
|
'TRP': 285.0, |
|
'TYR': 263.0, |
|
'VAL': 174.0, |
|
} |